何汝雯 ,張小川 ,何仕雯 ,溫小蓮 ,童大躍 ,莫秋華 ,3,張茲鈞
(1.廣東科登法醫(yī)物證司法鑒定所,廣東 珠海 519000;2.中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院法醫(yī)系,廣東 廣州 510080;3.珠海國(guó)際旅行衛(wèi)生保健中心,廣東 珠海 519000)
夫妻二人因女兒移民,要求進(jìn)行親子鑒定,以確定他們之間的親生關(guān)系。
采集三人的指血到無菌濾紙上。先用人類STRtyper-21G擴(kuò)增熒光檢測(cè)試劑盒(寧波海爾施基因科技有限公司)進(jìn)行D3S1358等20個(gè)基因座檢測(cè),發(fā)現(xiàn)女兒與母親之間在TPOX和D2S1338基因座上不符合孟德爾遺傳規(guī)律,按照司法部頒布的《親權(quán)鑒定技術(shù)規(guī)范》(SF/Z JD0105001-2016)的方法計(jì)算這些基因座的父權(quán)指數(shù)(paternity index,PI),累積父權(quán)指數(shù)為1.5615×102,需增加檢測(cè)基因座來達(dá)到判斷要求。
隨后采用人類STRtyper-10G擴(kuò)增熒光檢測(cè)試劑盒(珠??频巧锕こ逃邢薰荆┖蚐TRtyper-23comp常染色體補(bǔ)充位點(diǎn)試劑盒(寧波海爾施基因科技有限公司),增加了20個(gè)基因座進(jìn)行檢測(cè),又發(fā)現(xiàn)女兒與母親之間在D2S1772和D2S441基因座上不符合孟德爾遺傳規(guī)律。綜上所述,40個(gè)基因座累積父權(quán)指數(shù)為1.7990×105,除去4個(gè)不符合孟德爾遺傳規(guī)律的基因座,余36個(gè)STR基因座累積父權(quán)指數(shù)為5.179 5×1020??梢耘袛酁橹С执嬖谟H生關(guān)系。雖然以上40個(gè)基因座檢測(cè)結(jié)果能夠支持親生關(guān)系,但4個(gè)不符合孟德爾遺傳規(guī)律的基因座均出現(xiàn)在2號(hào)染色體上。為了弄清母女之間不符合孟德爾遺傳規(guī)律的原因,再增加了12個(gè)X-STR基因座及12個(gè)2號(hào)染色體上的STR基因座進(jìn)行檢測(cè)。12個(gè)STR基因座用6%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳分析產(chǎn)物,500V電泳1h左右。銀染顯色,對(duì)12個(gè)STR基因座擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行分析。將女兒的血樣送到廣州金域醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)中心進(jìn)行染色體核型分析。
為了進(jìn)一步澄清每個(gè)基因座中父、母、女等位基因之間的序列差異,用T-Vector pMDTM19(Simple)試劑盒(大連寶生物工程有限公司)將每個(gè)等位基因片段進(jìn)行克隆,并送到上海鉑尚生物技術(shù)有限公司進(jìn)行Sanger雙脫氧鏈終止法測(cè)序分析。
用人類STRtyper-21G擴(kuò)增熒光檢測(cè)試劑盒等共檢測(cè)了40個(gè)常染色體基因座,發(fā)現(xiàn)母女在TPOX、D2S1338、D2S1772和D2S441基因座上不符合孟德爾遺傳規(guī)律(表1)。增加12個(gè)X-STR基因座進(jìn)行檢測(cè),母女之間未發(fā)現(xiàn)不符合孟德爾遺傳規(guī)律的基因座(表2)。對(duì)新設(shè)計(jì)的12對(duì)2號(hào)染色體上的STR基因座引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增(圖1)。女兒的染色體數(shù)目或結(jié)構(gòu)未發(fā)現(xiàn)異常,排除了母源部分基因片段缺失的可能性。表3顯示,16個(gè)基因座涵蓋了2號(hào)染色體上各個(gè)區(qū)段,說明女兒的等位基因全部為純合子,而且全部能從父親的等位基因中找到來源,其中11個(gè)基因座(TPOX、D2S1338、D2S1772、D2S441、D2S429、D2S1399、D2S1387、D2S1790、D2S434、D2S1391 和 D2S1788)的等位基因可以肯定是父親遺傳的,從母親的等位基因中找不到來源。
表1 40個(gè)常染色體STR基因座中4個(gè)不符合遺傳規(guī)律的基因分型結(jié)果及父權(quán)指數(shù)
表2 12個(gè)X-STR基因座等位基因分型結(jié)果
用Sanger法對(duì)上述所有等位基因片段進(jìn)行序列分析,在原有基礎(chǔ)上又發(fā)現(xiàn)D2S1327和D2S2960完全與父親的序列相同,與母親的序列有所差異(表4)。剩下的 3 個(gè)基因座(D2S2952、D2S2961、D2S1360)中雖可從母親的結(jié)果中找到女兒的等位基因,但其父親也有相同的等位基因。
表3 2號(hào)染色體上16個(gè)STR基因座的位置
圖1 2號(hào)染色體上12個(gè)STR基因座PCR擴(kuò)增銀染檢測(cè)結(jié)果
表4 2號(hào)染色體上16個(gè)STR基因座的Sanger測(cè)序結(jié)果
STR等位基因分型是目前公認(rèn)的親子鑒定方法,但由于遺傳的原因,分型過程中可觀察到STR基因突變的現(xiàn)象,而表現(xiàn)出不符合孟德爾遺傳規(guī)律的情況[1-3]。本案發(fā)現(xiàn)1例4個(gè)STR基因座上女兒的等位基因中找不到母親的來源,而且都在2號(hào)染色體上,因此高度懷疑是單親二倍體遺傳[4]。
通過染色體核型分析,未發(fā)現(xiàn)女兒的染色體數(shù)目或結(jié)構(gòu)異常,排除了母源部分基因片段缺失的可能性。對(duì)涵蓋了2號(hào)染色體上不同區(qū)段的16個(gè)STR基因座用熒光或銀染法進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果顯示女兒的等位基因全部為純合子,而且全部能從父親的等位基因中找到來源,其中 11 個(gè)基因座(TPOX、D2S1338、D2S1772、D2S441、D2S429、D2S1399、D2S1387、D2S1790、D2S434、D2S1391和D2S1788)的等位基因可以肯定是父親遺傳的,從母親的等位基因中找不到來源。用Sanger法對(duì)上述所有等位基因片段進(jìn)行序列分析,在原有基礎(chǔ)上又發(fā)現(xiàn)D2S1327和D2S2960完全與父親的序列相同,與母親的序列有所差異。剩下的3個(gè)基因座(D2S2952、D2S2961、D2S1360)中雖可從母親的結(jié)果中找到女兒的等位基因,但其父親也有相同的等位基因。因此,推斷這3個(gè)基因座的等位基因很可能是由父親傳給女兒的,而不是來源于母親。從上述結(jié)果可以看出,在16個(gè)2號(hào)染色體基因座中沒有一個(gè)能肯定是母親遺傳的,而且這16個(gè)基因座涵蓋了2號(hào)染色體上不同區(qū)段(圖3),基本上能代表整個(gè)2號(hào)染色體的基因類型。由此分析女兒的2號(hào)染色體屬于父系單親二倍體遺傳,母親沒有將2號(hào)染色體的基因遺傳給女兒。因此,在本案中4個(gè)不符合遺傳規(guī)律的STR檢測(cè)結(jié)果不屬于親子鑒定中常見的等位基因變異,而是2號(hào)染色體單親二倍體遺傳變異[5-8]。所以筆者認(rèn)為,TPOX、D2S1338、D2S1772 和 D2S441 這 4個(gè) STR基因座的檢測(cè)結(jié)果不應(yīng)該納入PI計(jì)算,而其余36個(gè)STR基因座的累積父權(quán)指數(shù)5.1795×1020才是更準(zhǔn)確的結(jié)果。
迄今為止,雖然單親二倍體遺傳變異的報(bào)道不是很多見,但在親子鑒定中仍需引起重視,以免造成誤判。特別是出現(xiàn)同一染色體上多基因座不符合孟德爾遺傳規(guī)律,而且突變步驟多(≥3)的案例時(shí),更應(yīng)引起高度重視。