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辣椒始花節(jié)位研究進(jìn)展

2018-08-03 01:34:28袁欣捷周坤華張鴻燕陳學(xué)軍
關(guān)鍵詞:分生組織節(jié)位突變體

袁欣捷,方 榮,周坤華,張鴻燕,陳學(xué)軍

(江西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院 蔬菜花卉研究所,江西 南昌 330200)

辣椒屬(Capsicumspp.)約有30多個(gè)物種,原產(chǎn)于美洲熱帶地區(qū),為一年生或多年生植物,其中C.annuum、C.baccatum、C.chinense、C.frutescens、C.pubescens在6 000年前被當(dāng)?shù)厝笋Z化栽培[1],后逐漸在世界各地廣泛種植,成為世界性重要經(jīng)濟(jì)作物。

辣椒植株為合軸分枝結(jié)構(gòu),主莖生長(zhǎng)到一定時(shí)候停止生長(zhǎng),其頂端分生組織轉(zhuǎn)化為花序分生組織,花序分生組織在適宜的內(nèi)在條件和外在環(huán)境(如日照長(zhǎng)度和溫度)下發(fā)育為單生花,開花標(biāo)志著主莖生長(zhǎng)的終止,由側(cè)生分生組織生長(zhǎng)發(fā)育為新枝,不久新枝又停止生長(zhǎng),繼續(xù)由新枝頂端的側(cè)生分生組織代替頂端分生組織生長(zhǎng),不斷重復(fù)形成合軸分枝[2]。辣椒的合軸單元包括兩片對(duì)向葉和一個(gè)單生花[3]。開花作為辣椒生活史中的重要事件,協(xié)調(diào)著外界環(huán)境與植物的生命周期。開花意味著植物從營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)階段轉(zhuǎn)換到生殖生長(zhǎng)階段。植物在適宜的時(shí)間開花才能產(chǎn)生具有生活力的種子,使世代得以延續(xù)。因此,開花時(shí)間是作物的一個(gè)主要適應(yīng)性特征,在作物馴化及適應(yīng)新氣候環(huán)境過程中起重要作用[4],同時(shí)也是辣椒傳統(tǒng)育種中最重要的目標(biāo)性狀之一。

辣椒第一朵花的著生節(jié)位稱為始花節(jié)位,一般以主莖上從子葉到第一朵花之間的真葉(節(jié)位)數(shù)來度量,人們常常以始花節(jié)位來衡量辣椒開花的時(shí)間[3,5-6]。始花節(jié)位低的辣椒品種往往開花坐果早,在春茬種植中能適度規(guī)避雨水和病害,降低農(nóng)藥使用量,增加早期產(chǎn)量[7],在秋茬種植中規(guī)避后期低溫環(huán)境,減少設(shè)施栽培能耗,提高產(chǎn)量[8];始花節(jié)位高的辣椒品種開花坐果晚,能避開上市旺季,滿足市場(chǎng)多樣化需求。因此,研究辣椒始花節(jié)位具有重要理論和實(shí)踐意義。本文對(duì)國(guó)內(nèi)外辣椒始花節(jié)位的研究進(jìn)行了綜述,以期為深入開展相關(guān)研究,促進(jìn)辣椒熟性遺傳改良提供有益參考。雖然影響開花時(shí)間但對(duì)始花節(jié)位無明顯改變的QTLs/基因在辣椒生長(zhǎng)發(fā)育中也具有重要意義,但不在本文綜述范圍內(nèi),上述情況多由營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)速率的改變?cè)斐蒣9]。

1 辣椒始花節(jié)位的遺傳定位

始花節(jié)位作為辣椒的重要熟性性狀一直備受研究者的關(guān)注。前期的遺傳定位研究發(fā)現(xiàn),自然變異中辣椒始花節(jié)位受少數(shù)主效基因和部分微效基因控制,同時(shí)也受溫度和光照等環(huán)境影響,為數(shù)量性狀[5-6,10-11]。Barchi等[10]用Yolo Wonder×CM334的297株重組自交系群體檢測(cè)到4個(gè)始花節(jié)位QTLs(quantitative trait loci),能解釋25%的表型變異。Mimura等[5]基于種內(nèi)雙單倍體群體構(gòu)建了包含15個(gè)連鎖群全長(zhǎng)1 213 cM的遺傳圖譜,并將始花節(jié)位QTL定位于LG8的標(biāo)記CAMS606附近。Tan等[6]利用種間作圖群體鑒定了一個(gè)主效QTL和5個(gè)微效QTLs,能解釋2.09%~51.63%的表型變異,并將主效位點(diǎn)Nle2.2定位到標(biāo)記EPMS677和CIDHjw2_6間約2.76 Mb物理距離內(nèi),Nle2.2位點(diǎn)與宗洪霞[12]利用茄門甜椒C.annuum和野生灌木辣椒C.frutescen種間群體檢測(cè)到的ffn22.1位點(diǎn)在同一個(gè)染色體區(qū)域?;谇捌谘芯胯b定出一些與始花節(jié)位相關(guān)分子標(biāo)記(表1),其應(yīng)用將有助于辣椒熟性的分子標(biāo)記輔助育種。前期研究者應(yīng)用不同群體在不同的染色體上鑒定出眾多始花節(jié)位QTLs(表1),說明辣椒對(duì)始花節(jié)位的調(diào)控涉及多基因協(xié)作的復(fù)雜生理過程。這一過程所涉及的基因及其調(diào)控始花節(jié)位的分子機(jī)制與相互關(guān)系已有初步研究結(jié)果,后續(xù)研究有望更全面地揭示辣椒調(diào)控始花節(jié)位的奧秘。

2 基于辣椒突變體發(fā)掘的始花節(jié)位調(diào)控基因

辣椒始花節(jié)位相關(guān)基因的研究起步較晚,目前已克隆的基因多為基于辣椒EMS(ethyl methanesulfonate)突變體發(fā)掘的,基于自然變異發(fā)掘的基因十分有限。Ilan Paran研究團(tuán)隊(duì)用EMS誘變辣椒材料Capsicumannuumcv. Maor(其野生型始花節(jié)位為10.3±1.0),篩選誘變后的M2家系,找到一些與始花節(jié)位相關(guān)的基因。其中多為促進(jìn)開花的基因,如激活花分生組織決定基因Ca-ANANTHA(Ca-AN)所必需的CapsicumannuumS(CaS)基因突變后,辣椒始花節(jié)位增加到(21.3±1.1),CaS基因控制辣椒分生組織的終止,促進(jìn)莖尖和合軸分枝的生殖轉(zhuǎn)變,為花形成所需[2];抑制莖分生組織營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)的辣椒CaJOINTLESS(CaJ)基因突變體,始花節(jié)位增至(17.0±0.6)[2,17],該MADS-box基因能促進(jìn)花序分生組織早熟以維持辣椒單生花的形成,促進(jìn)主莖和合軸分枝開花;CaBLIND(CaBL)基因調(diào)控辣椒腋生分生組織的起始及開花轉(zhuǎn)變,該基因突變體E-2580的始花節(jié)位變?yōu)?14.0±1.6),原本連續(xù)的合軸生長(zhǎng)變?yōu)樵诮K止前重復(fù)一或兩次,并常常在伸長(zhǎng)的節(jié)間額外長(zhǎng)出一不帶腋芽的葉片[18]。Ilan Paran研究團(tuán)隊(duì)也找到少數(shù)抑制開花的基因,如FALSIFLORA(FA)基因在營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)階段抑制開花,其相應(yīng)辣椒突變體提前開花,始花節(jié)位降為(8.6±0.5),合軸單元節(jié)間變短,合軸發(fā)育中的葉片生長(zhǎng)受到抑制,形成緊湊的植株結(jié)構(gòu)和成簇生長(zhǎng)的花果[2-3];此外,辣椒E-62突變體始花節(jié)位由野生型材料的(8.6±0.5)降至突變型材料的(4.0±0),相應(yīng)候選基因?yàn)锳PETALA2轉(zhuǎn)錄因子家族的CaAP2基因,該基因據(jù)推測(cè)是辣椒開花主要阻遏基因,同時(shí)影響植株莖和果實(shí)大小[19]。

表1 不同研究中檢測(cè)到的始花節(jié)位QTLs

在辣椒中發(fā)現(xiàn)的早花突變體少于晚花突變體,原因可能是選育的優(yōu)良系中(如Maor)開花抑制相關(guān)基因在長(zhǎng)期育種過程中被人們舍棄,這種情況在番茄中也存在[19-20]。另一個(gè)原因可能是自然界中某些引起早花的變異會(huì)帶來多種負(fù)面影響,從而使早花變異的基因數(shù)量有限,比如開花抑制因子EMF1和EMF2中發(fā)生變異能引起極早花現(xiàn)象,但是突變體種子產(chǎn)量急劇下降[21],這種突變體在自然界生存具有劣勢(shì),容易被淘汰。

3 辣椒始花節(jié)位調(diào)控基因功能的保守性與多樣性

人們?cè)谶z傳定位中發(fā)現(xiàn)辣椒屬內(nèi)不同物種間,辣椒與茄科其他作物(如番茄、茄子)間發(fā)掘的重要農(nóng)藝性狀QTLs間具有良好共線性,說明不同種屬可能通過相同機(jī)制控制植物生長(zhǎng)發(fā)育[10]。研究也證實(shí)一些辣椒始花節(jié)位調(diào)控基因在其他作物中具有類似功能。比如辣椒CaJ基因與其番茄直系同源基因JOINTLESS(J)對(duì)開花都有促進(jìn)作用,同時(shí)影響合軸分枝發(fā)育,并對(duì)FA基因有上位作用[17,22];CaS基因及其番茄直系同源基因COMPOUNDINFLORESCENCE(S)[23]和牽牛花EVERGREEN(EVG)基因[24]都在分生組織成熟中起作用;辣椒CaBL基因與其番茄直系同源基因BLIND(BL)和擬南芥直系同源基因RAX都具有調(diào)控腋生分生組織早期發(fā)育的作用[18]。

雖然在不同的植物中許多控制開花和始花節(jié)位的基因都相同,但有的基因會(huì)進(jìn)化出物種特異性功能,甚至在不同作物中作用相反。例如辣椒CaJ基因與番茄J基因除對(duì)開花有促進(jìn)作用外,還分別進(jìn)化出各自的特異功能,CaJ基因維持單生花形成并影響始花節(jié)位,J基因參與花梗離區(qū)發(fā)育但對(duì)始花節(jié)位沒有顯著影響[17,22];辣椒CaJ基因是一個(gè)主要開花促進(jìn)因子,其擬南芥直系同源基因SVP(SHORTVEGETATIVEPHASE)則是主要開花抑制因子,SVP通過抑制開花整合子SUPPERSSOROFWOEREXPRESSIONOFCO1(SOC1)和FLOWERINGLOCUST(FT)基因抑制開花[17,25-26];擬南芥中與SVP基因同源性最高的AGL24基因功能與SVP相反,它能通過激活SOC1基因促進(jìn)開花[27-28];CaS基因在辣椒中為花形成所需,但其番茄直系同源基因S發(fā)生突變并不影響番茄花形成[2];辣椒(C.annuum)中CaBL基因具有調(diào)控腋生分生組織起始的作用,而擬南芥中與CaBL基因最相近的RAX3基因?qū)σ秆啃纬蓻]有影響[29-30],甚至在同為辣椒屬的C.frutescens中,只有少數(shù)Cabl突變體腋芽形成受到抑制,這可能是因?yàn)镃.frutescens中存在其他功能冗余相關(guān)基因彌補(bǔ)了Cabl基因突變對(duì)腋芽形成的影響[18]。

4 辣椒始花節(jié)位調(diào)控基因之間的關(guān)系

目前從辣椒突變體著手展開的研究已揭示CaS、CaJ、CaBL、FA和CaAP2等基因參與調(diào)控辣椒始花節(jié)位。為了研究CaS基因與CaJ、FA和E-62基因間關(guān)系,Cohen等[2]用Cas基因突變的雜合單株和相應(yīng)基因突變體為親本構(gòu)建F2群體,利用標(biāo)記輔助選擇從中得到雙突變體CasCaj、Casfa和CasE-62(CaAP2):發(fā)現(xiàn)CasCaj和CasE-62雙突變體都和Cas單突變體一樣沒有花,說明在花形成方面Cas上位Caj和E-62;CasCaj雙突變體很晚才開始合軸生長(zhǎng),始花節(jié)位高達(dá)(61.5±1.5),而Cas和Caj單突變體的始花節(jié)位分別為(21.3±1.1)和(17±0.6),CasE-62雙突變體始花節(jié)位介于Cas和E-62(CaAP2)單突變體之間,說明在起始合軸生長(zhǎng)方面Cas與Caj基因具有正向協(xié)同作用,與E-62具有加性效應(yīng)。用相同的方法構(gòu)建Cajfa雙突變體,該突變體表型類似于Caj單突變體,始花節(jié)位為17,無花簇形成,說明在頂端分生組織、合軸分生組織和花分生組織發(fā)育方面Caj上位fa;通過qRT-PCR檢測(cè)野生型、Caj突變體、fa突變體、Cajfa雙突變體中CaJ和FA基因的表達(dá)量,也證實(shí)FA抑制CaJ[17]。雙突變體Cablfa同時(shí)具有Cabl和fa單突變體的表型,即擁有大花瓣、合軸生長(zhǎng)提前終止,此加性現(xiàn)象說明FA和CaBL在合軸生長(zhǎng)調(diào)控中獨(dú)立起作用;而雙突變體如Cabl突變體一樣腋芽形成受到抑制,說明在側(cè)分枝方面CaBL上位FA[18]。

5 展望

辣椒是茄科重要經(jīng)濟(jì)作物,開花時(shí)間是辣椒品種改良的主要目標(biāo)性狀之一[8]。因辣椒始花節(jié)位常被用來衡量辣椒開花的時(shí)間[3,5-6],所以一直備受科研人員和遺傳育種學(xué)者的關(guān)注。早期人們定位了一些辣椒始花節(jié)位QTLs,并開發(fā)了一些連鎖分子標(biāo)記[5-6,10,12,14-16],多為傳統(tǒng)分子標(biāo)記,如擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)、限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)和簡(jiǎn)單重復(fù)序列(simple sequence repeat,SSR),數(shù)量有限且與相關(guān)基因遺傳距離較遠(yuǎn),大多不能有效用于育種材料的分子標(biāo)記輔助選擇。隨著近年測(cè)序技術(shù)升級(jí)和測(cè)序成本降低,利用第二代或第三代測(cè)序技術(shù)能快速開發(fā)高通量分子標(biāo)記[31-33]。其中單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)標(biāo)記具有共顯性、密度高、分布廣、遺傳穩(wěn)定、檢測(cè)快速、省時(shí)省力等特點(diǎn),已在水稻、玉米、大豆、黃瓜等作物中得到有效應(yīng)用[34-38]。相關(guān)技術(shù)方法在辣椒中也顯現(xiàn)出優(yōu)勢(shì),如Han等[39]通過對(duì)親本C.annuum‘Perennial’、C.annuum‘Dempsey’及其120株重組自交系進(jìn)行重測(cè)序,構(gòu)建了重組單元(bin)均距0.53 cM的遺傳圖譜,并檢測(cè)到86個(gè)重要QTLs。后期利用相關(guān)技術(shù)開展辣椒核心種質(zhì)資源始花節(jié)位表型和基因型鑒定,挖掘與辣椒始花節(jié)位表型多樣性相關(guān)等位基因分子標(biāo)記,將加速分子標(biāo)記輔助育種步伐,幫助育種學(xué)者在分子聚合育種過程中快速選擇適宜的始花節(jié)位材料。

在模式植物擬南芥中,約180個(gè)基因被報(bào)道參與調(diào)控開花時(shí)間,它們形成復(fù)雜的開花調(diào)控網(wǎng)絡(luò)[40]。外界環(huán)境和內(nèi)在因素主要通過春化途徑、自主途徑、光依賴途徑、赤霉素途徑、環(huán)境溫度途徑和年齡途徑調(diào)控開花時(shí)間[40-41]。這些途徑匯聚于少數(shù)開花整合因子,如FT基因[42]、LEAFY(LFY)基因[43]和SOC1基因[44]等,這些開花整合因子與過渡到開花的時(shí)間密切相關(guān)。茄科作物番茄中也鑒定了一些影響開花時(shí)間和始花節(jié)位的基因,其中ANANTHA(AN)基因抑制開花,an突變體始花節(jié)位降低,S、FA、SINGLEFLOWERTRUSS(SFT)和UNIFLORA(UF)等基因促進(jìn)開花,相應(yīng)突變體始花節(jié)位升高[9,45-48]。辣椒中開花時(shí)間相關(guān)研究多以始花節(jié)位為考量重點(diǎn)[3,5-6],目前已基于辣椒突變體發(fā)掘了若干對(duì)始花節(jié)位有調(diào)控作用的基因,這些基因的功能除了調(diào)控辣椒始花節(jié)位,往往還兼具其他功能(比如影響果實(shí)大小、參與花形成、影響合軸單元的節(jié)間長(zhǎng)短等),其同源基因在不同物種中功能可能保守,也可能發(fā)生特異性分化甚至作用相反。辣椒種質(zhì)資源中始花節(jié)位變異豐富,目前,對(duì)自然變異中始花節(jié)位多樣性背后調(diào)控機(jī)制還不清楚,環(huán)境因素如溫度和光照通過怎樣的內(nèi)源途徑影響始花節(jié)位也未見報(bào)道,辣椒開花調(diào)控途徑相關(guān)研究與模式植物相比嚴(yán)重滯后。

今后繼續(xù)運(yùn)用相關(guān)突變體挖掘辣椒始花節(jié)位調(diào)控基因,可完善辣椒始花節(jié)位調(diào)控網(wǎng)絡(luò);也可通過模式植物中已知的開花基因來預(yù)測(cè)辣椒中始花節(jié)位調(diào)控基因并加以驗(yàn)證;此外,隨著辣椒全基因組測(cè)序的完成[49-50]及測(cè)序技術(shù)的日益成熟,利用全基因組關(guān)聯(lián)分析[51]、QTL-Seq[52]、BSR-seq[53]等方法有利于快速挖掘辣椒中與始花節(jié)位多樣性有關(guān)的等位基因,可望更為全面地闡述自然變異中辣椒始花節(jié)位調(diào)控的分子機(jī)制。

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