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基于DNA條形碼技術(shù)的防風(fēng)藥材市場(chǎng)調(diào)查研究

2018-04-21 07:00羅丹丹方海蘭段寶忠
大理大學(xué)學(xué)報(bào) 2018年2期
關(guān)鍵詞:偽品竹葉防風(fēng)

羅丹丹,方海蘭,李 楊,段寶忠

(大理大學(xué)藥學(xué)與化學(xué)學(xué)院,云南大理 671000)

防風(fēng)為常用中藥,來源于傘形科防風(fēng)屬植物防風(fēng) Saposhnikovia divaricata(Turcz.)Schischk.的根,具有祛風(fēng)解表,勝濕止痛,止痙功效〔1〕。各地常將川防風(fēng)Ligusticum brachylobum Franch.、竹葉防風(fēng)Seseli mairei H.Wolff、松葉防風(fēng)S.yunnanense Franch.以及同科多種植物如杏葉防風(fēng)Pimpinella candolleana Wight&Arn.、石 防 風(fēng) Peucedanum terebinthaceum(Fisch.ex Trevir.)Ledeb.、葛縷子 Carum carvi L.等作為防風(fēng)混偽品使用〔2-5〕,由于這些藥材均來源于傘形科,其根部特征與防風(fēng)較為相似,采用傳統(tǒng)的性狀和顯微鑒別等方法難以鑒別〔6-8〕,對(duì)臨床用藥安全造成極大威脅。

DNA條形碼(DNA barcoding)技術(shù)是分子鑒定的最新發(fā)展,即通過比較一段通用DNA片段,對(duì)物種進(jìn)行快速、準(zhǔn)確的識(shí)別和鑒定〔9〕。陳士林等對(duì)大量樣本的研究表明,ITS2序列是鑒定藥用植物及其混偽品的理想條形碼〔10〕。該技術(shù)已廣泛用于重樓〔11〕、臭牡丹〔12〕、艾葉〔13〕、何首烏〔14〕等多種中藥材的混偽品鑒別研究,并取得了良好的效果。目前已有學(xué)者采用ITS2條形碼對(duì)防風(fēng)及其偽品中華前胡和杏葉防風(fēng)等開展了鑒別研究,結(jié)果表明DNA條形碼技術(shù)可有效鑒別防風(fēng)及其混偽品〔15〕,但未見該技術(shù)用于竹葉防風(fēng)、松葉防風(fēng)等常見偽品的分子鑒別研究。鑒于此,本研究在建立防風(fēng)及其常見混偽品的參照DNA條形碼數(shù)據(jù)庫(kù)的基礎(chǔ)上,對(duì)來源于市場(chǎng)的28批標(biāo)簽為防風(fēng)的藥材進(jìn)行了研究,以期為DNA條形碼技術(shù)在藥品檢驗(yàn)和市場(chǎng)監(jiān)管領(lǐng)域的應(yīng)用提供參考。

1 儀器與材料

1.1 儀器PCR儀(2720,Applied Biosystems,USA);1-14K型高速冷凍離心機(jī)(Sigma公司);植物組織研磨儀(Retsch MM400);NanoDrop 2000∕2000C分光光度計(jì)(Thermo Fisher Scientific公司);各種量程的微量移液器(Eppendorf)。

1.2 材料本研究采集包括防風(fēng)Saposhnikovia divaricata、竹葉防風(fēng)Seseli mairei、杏葉防風(fēng)Pimpinella candolleana及華山前胡Peucedanum ledebourielloides等4個(gè)物種8份植物樣本,經(jīng)大理大學(xué)段寶忠副教授鑒定,并從GenBank下載防風(fēng)常見偽品的ITS2序列16條,含上述8個(gè)物種共24條ITS2序列用于構(gòu)建防風(fēng)及其混偽品的標(biāo)準(zhǔn)條形碼數(shù)據(jù)庫(kù)。見表1。28批標(biāo)簽為防風(fēng)的藥材(HSM-01~28)收集于市場(chǎng)或委托藥商購(gòu)于市場(chǎng),其基原不詳。見表2。

表1 防風(fēng)及其習(xí)用品ITS2序列信息表

表2 市場(chǎng)收集藥材樣品表

2 方法

2.1 DNA提取植物樣本葉片采用硅膠進(jìn)行干燥,取30 mg,市場(chǎng)購(gòu)買藥材切碎,取40 mg。用植物組織研磨儀(Retsch MM400,Germany)研磨2 min。總DNA提取在植物組織提取試劑盒(Tiangen Biotech Co.,China)的操作規(guī)程基礎(chǔ)上進(jìn)行了改進(jìn)。研磨后,使用核分離緩沖液(100 mmol∕L Tris-HCl,pH 8.0;20 mmol∕L EDTA,pH 8.0;0.3 mmol∕L NaCl;2%PVP40;2%β-巰基乙醇)抽提2次;水浴溫度為54℃,水浴時(shí)間6 h;水浴后,使用氯仿-異戊醇(24∶1)抽提2次。其他操作均按試劑盒規(guī)程。

2.2 PCR擴(kuò)增及測(cè)序ITS2序列的反應(yīng)條件,擴(kuò)增引物,以及擴(kuò)增程序參照文獻(xiàn)進(jìn)行〔16〕。引物由上海生工生物工程股份有限公司合成,有條帶的PCR產(chǎn)物送上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司進(jìn)行雙向測(cè)序。

2.3 數(shù)據(jù)處理所得的測(cè)序峰圖利用CodonCode Aligner Version 5.1.5(CodonCode Co.,USA)進(jìn)行組裝拼接?;陔[馬爾夫模型的HMMer注釋方法將所得序列及GenBank序列,除去5.8S和28S區(qū),獲得ITS2序列。采用MEGA 6.0(Molecular Evolutionary Genetics Analysis)構(gòu) 建 NJ(Neighbor-Joining)樹,Kimura 2-Parameter(K2P)法計(jì)算遺傳距離。

3 結(jié)果

3.1 DNA提取與PCR擴(kuò)增效率PCR擴(kuò)增效率及測(cè)序成功率是評(píng)價(jià)DNA條形碼序列的兩個(gè)重要指標(biāo)。本研究中,所提取的36份樣品DNA(包括8份植物樣本和28份藥材樣本),經(jīng)NanoDrop 2000測(cè)定,A260∕A280值為1.8 ~ 2.0之間,樣品DNA濃度為100~300 ng∕μL。表明改進(jìn)后的提取方法所提取的DNA質(zhì)量較好。PCR擴(kuò)增效率及測(cè)序成功率均為100%。

3.2 參考樣本ITS2序列遺傳距離用于構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)庫(kù)的24條ITS2序列(8條植物樣本序列,16條GenBank下載序列)長(zhǎng)度范圍為221~229 bp,GC含量為51.80%~59.26%。防風(fēng)種內(nèi)5個(gè)樣本間的K2P遺傳距離為0.000,防風(fēng)與其他物種間的K2P距離范圍為0.037~0.307。防風(fēng)種內(nèi)遺傳距離小于種間遺傳距離,表明ITS2序列可用于防風(fēng)及其混偽品的鑒別。

3.3 市場(chǎng)藥材鑒定分析將28批標(biāo)簽為防風(fēng)的藥材(編號(hào)HSM-01~28),分別在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)(https:∕∕www.ncbi.nlm.nih.gov∕)、中藥材DNA條形碼鑒定系統(tǒng)(TCM-DBS,http:∕∕.tcmbarcode.cn∕china∕)進(jìn)行相似性搜索,DNA條形碼比對(duì)結(jié)果見表3。從表3可看出,28批藥材樣品分屬于5個(gè)物種,其中有10份藥材為防風(fēng),占35.71%;8份與竹葉防風(fēng)具有高度相似性,占28.57%;6份與華山前胡相似,占21.43%;3份與杏葉防風(fēng)相似,占10.71%;1份為傘形科其他物種。

表3 市售標(biāo)簽為防風(fēng)的藥材BLAST及TCM-DBS鑒定結(jié)果

3.4 市場(chǎng)藥材NJ樹分析將市場(chǎng)28個(gè)藥材樣品的ITS2序列與24條參考DNA條形碼,構(gòu)建NJ樹。見圖1。從圖1可看出,樣品HSM-02~04、06~12與正品防風(fēng)S.divaricata聚為一支;樣品HSM-01、05、20~24、26與竹葉防風(fēng) S.mairei聚為一支;樣品HSM-13~18與華山前胡 P.ledebourielloides聚為一支;樣品HSM-19和HSM-27~28與杏葉防風(fēng)P.candolleana聚為一支。僅HSM-25未與參考序列庫(kù)內(nèi)的物種聚為一支,BLAST結(jié)果為白花前胡P.praeruptorum或紅前胡P.rubricaule。

4 討論與結(jié)論

藥材基原物種的準(zhǔn)確鑒定是避免混偽品混淆使用的關(guān)鍵。傳統(tǒng)的性狀和顯微鑒定方法主要依靠形態(tài)特征進(jìn)行鑒定,這類方法主觀性強(qiáng),同時(shí)對(duì)鑒定者的專業(yè)水平要求高。隨著當(dāng)前傳統(tǒng)鑒定專業(yè)人才的匱乏,藥材外觀相似或同物異名對(duì)市場(chǎng)藥材監(jiān)管部門提出了挑戰(zhàn)。DNA條形碼是一種分子鑒定技術(shù),其不受環(huán)境因素、樣品形態(tài)和材料部位的限制,已成為中藥原植物和藥材鑒定的有效手段〔9〕,其操作簡(jiǎn)單,可實(shí)現(xiàn)鑒定結(jié)果的客觀和自動(dòng)化,有效緩解了中藥材鑒定人才缺乏的現(xiàn)狀。

圖1 基于ITS2序列構(gòu)建的防風(fēng)市場(chǎng)藥材NJ樹

本研究采用ITS2條形碼鑒定防風(fēng)常見混偽品〔17-18〕,建立了防風(fēng)及其混偽品的參考DNA標(biāo)準(zhǔn)條形碼數(shù)據(jù)庫(kù),并利用該數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)市場(chǎng)收集的28批標(biāo)簽為“防風(fēng)”的藥材進(jìn)行了鑒定和驗(yàn)證。結(jié)果表明ITS2序列可有效鑒別已知混偽品。DNA鑒定結(jié)果表明,市售防風(fēng)藥材來源復(fù)雜,在調(diào)查的28批防風(fēng)藥材中,僅有10批為正品防風(fēng)S.divaricata,其余藥材植物基原可能有竹葉防風(fēng)S.mairei,華山前胡P.ledebourielloides,白花前胡P.praeruptorum、杏葉防風(fēng)P.candolleana等多種,這些藥材性味功效與防風(fēng)差異較大〔19〕,對(duì)防風(fēng)臨床用藥的安全和有效造成了極大威脅。上述DNA條形碼的鑒定結(jié)果與前人的研究結(jié)果基本一致〔3〕,表明DNA條形碼可作為中草藥來源鑒定和市場(chǎng)混偽品檢測(cè)的有效工具。

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