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貉細小病毒SD1607株的分離鑒定及VP2基因序列分析

2018-04-18 02:13蔣依倩扈榮良張英海張迎志張國軍
中國獸醫(yī)雜志 2018年1期
關鍵詞:細小引物病毒

齊 宇 , 蔣依倩, 扈榮良, 管 巖, 張英海, 張迎志, 張國軍

(1.吉林和元生物工程股份有限公司 , 吉林 松原 138000 ; 2.軍事醫(yī)學科學院軍事獸醫(yī)研究所 , 吉林 長春 130112 ;3.山東省諸城市畜牧局 , 山東 諸城 262200 ; 4.河北省樂亭縣畜牧局 , 河北 唐山 063600)

貉(N.procyonoides),屬于食肉目、犬科動物,其皮張具有針毛長、底絨豐厚,保溫力強等特點,是我國重要的毛皮動物養(yǎng)殖種類之一。近年來,由于貉皮在國際毛皮市場中價格不斷上漲,我國貉養(yǎng)殖數量也隨之增加。據統計,2014-2015年我國貉養(yǎng)殖存欄總量均高達2 500萬只以上[1],其毛制品大量出口,為養(yǎng)殖者帶來豐厚的經濟效益。然而隨著養(yǎng)殖規(guī)模和養(yǎng)殖密度的擴大,各類傳染病的感染和傳播的風險也相應增加。

本試驗從山東某貉養(yǎng)殖場疑似患細小病毒性腸炎的貉腸道中成功分離出1株RDPV,并對其VP2基因進行了序列分析,為貉細小病毒性腸炎的流行病學調查奠定基礎,同時對了解貉細小病毒病的抗原變異情況及其防控具有積極意義。

1 材料與方法

1.1 病料采集及處理 采自山東諸城某貉養(yǎng)殖場疑似患細小病毒性腸炎死亡的貉子腸道組織。加入3倍體積生理鹽水充分研磨制成組織勻漿,反復凍融3次,10 000 r/min離心5 min,取上清加入等體積氯仿混勻,室溫作用30 min,10 000 r/min (4 ℃)離心20 min取上層水相,過濾除菌,-80 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2 細胞株及試劑 貓腎細胞(F81)。ExTaqDNA聚合酶、pMD18-T載體、BamHI、XhoI和DH5α感受態(tài)細胞,均購自上海寶生物有限公司;DNA提取試劑盒、膠回收試劑盒,均購自康寧公司。

1.3 病毒培養(yǎng) 采用同步接毒的方式,按照體積比1∶10同步接入病料處理液,細胞培養(yǎng)箱中靜置培養(yǎng),并設置正常細胞對照,逐日觀察細胞病變(CPE)情況。若有CPE出現則初步判為陽性,并在細胞病變達到80%以上時收毒。

1.4 PCR鑒定 出現CPE后,將病毒繼續(xù)培養(yǎng)至第5代,取細胞培養(yǎng)物反復凍融2次為樣品,按照DNA提取試劑盒說明書提取基因組。參照周云朵等[3]建立的肉食獸細小病毒檢測方法進行PCR檢測。

1.5 病毒的形態(tài)學觀察 將病毒液經10 000 r/min (4 ℃)離心10 min,取上清液加入0.5%磷鎢酸溶液染色,用電鏡觀察其形態(tài)學特征。

1.6 病毒組織細胞半數感染量TCID50測定 CPV陽性第5代細胞培養(yǎng)物反復凍融后取上清液依次做10倍稀釋,分別接種于F81細胞96孔培養(yǎng)板中,每個稀釋度做8個重復,0.1 mL/孔,設正常細胞為對照組,觀察至120 h,記錄病變孔數目,按Reed-Muench法計算病毒的TCID50。

1.7 VP2引物合成 參考GenBank中已發(fā)表的貉源細小病毒VP2全基因序列,利用Primer Premier 5.0軟件設計1對引物,VP2-F:5′-CGGGATCCATGAGTGATGGAGCAGTTCAA-3′, VP2-R:5′-CCGCTCGAGTTAATATAATTTTCTAGGTGCT-3′。其中上游引物引入BamHI 酶切位點,下游引物引入XhoI 酶切位點。引物由吉林省庫美生物科技有限公司合成。

1.8 VP2基因PCR擴增與克隆質粒構建 提取的病毒基因組為模板,按照常規(guī)方法進行PCR反應,反應條件為:94 ℃ 5 min,94 ℃ 30 s,56 ℃ 45 s,72 ℃ 90 s,30個循環(huán),72 ℃延伸10 min。取3 μL PCR產物在1%瓊脂糖凝膠上進行電泳檢測。按照膠回收試劑盒說明書方法回收VP2基因PCR產物,并與克隆載體pMD18-T連接,轉化至DH5α感受態(tài)細胞,培養(yǎng)過夜后,挑取單菌落擴大培養(yǎng)。提取質粒DNA,利用BamHI 和XhoI限制性內切酶進行雙酶切鑒定,陽性重組質粒送往吉林省庫美生物科技有限公司測序。

2 結果

2.1 病毒分離結果 正常細胞邊緣清晰,形態(tài)統一(圖1A);接種病毒后的F81細胞,在第72 h開始出現細胞圓縮、腫脹、聚集成團,邊緣細胞形態(tài)細長,細胞間隙變大,呈抽絲拉網樣病變(圖1B)。

2.2 PCR鑒定結果 利用肉食獸細小病毒通用引物對分離株病毒進行PCR擴增,得到與預期片段大小相符的目的條帶(圖2)。

圖2 腸道組織PCR特異性引物擴增結果

2.3 病毒形態(tài)觀察結果 病毒經磷鎢酸染色后,通過透射電鏡觀察可見到典型的細小病毒病毒粒子,直徑約20 nm,呈圓形或卵圓形,將病毒命名為RDPV-SD1607株。

2.4 毒力測定結果 按照Reed-Muench法計算RDPV-SD1607株分離毒的TCID50為1.0×10-4.5/mL。

2.5 VP2基因序列測定與遺傳進化分析 提取RDPV-SD1607株基因組,進行VP2全基因的PCR擴增,經克隆、酶切鑒定(圖3)后送往吉林省庫美生物科技有限公司測序,并對序列結果進行整理拼接,得到RDPV-SD1607株VP2全基因序列,長度為1 755 bp。與GenBank中肉食獸細小病毒核苷酸相似性在97.44%~99.49%。將RDPV-SD1607與其他24株不同來源的肉食獸細小病毒VP2基因序列進行分析,繪制系統進化樹(圖4)。

圖3 重組質粒pMD18T-VP2 PCR及酶切鑒定

3 討論

貉細小病毒屬于細小病毒科,細小病毒屬成員。病毒粒子無囊膜,不含糖和脂類,結構堅實緊密,因此該病毒對外界理化因素具有非常強大的抵抗力,可在自然界長期存活并廣泛傳播。雖然細小病毒是DNA病毒,但它卻與RNA病毒類似,基因突變率特別高,許多新的亞型不斷被發(fā)現[5]。1894年我國首次報道了貉細小病毒性腸炎,但直到1988年才首次分離到貉細小病毒[6]。2009年,閆喜軍等[7]從遼寧、河北省地區(qū)分離到6株CPV-2型貉細小病毒。同年,劉雙翼等[8]從大慶地區(qū)分離到8株CPV-2 c型貉源細小病毒。

細小病毒屬成員核衣殼蛋白結構相似,均由VP1、VP2、VP3構成。其中VP2蛋白是細小病毒衣殼蛋白的重要組成成分,幾乎包含了病毒所有的中和抗原表位[9]。VP2蛋白關鍵位點氨基酸的改變可以引起細小病毒的抗原特性、細胞嗜性及宿主范圍發(fā)生變化。研究表明,細小病毒在不同pH值緩沖液中的血凝性與VP2蛋白323位氨基酸殘基相關。當FPLV的VP2蛋白323位殘基為Asn時,在pH值高達7.5時仍表現出血凝性;而當CPV的323位殘基為Asp時,只能在pH值6.6以下才能表現出血凝性[10]。VP2蛋白第300位氨基酸殘基則是影響CPV感染宿主細胞的關鍵位點。2015年,Andrew等[11]發(fā)現,從浣熊體內分離的CPV變異株不能感染犬細胞,而當其VP2蛋白300位氨基酸殘基由Asn變?yōu)锳la時就能有效地結合犬細胞表面的TfR,從而感染犬細胞。雖然肉食獸細小病毒屬各成員間親緣關系較近,抗體具有交叉保護性,但即使是與RDPV親緣關系最近的CPV-2相比,VP2蛋白中部分氨基酸仍有差異,這些差異對RDPV的抗原特性的影響,仍有待進一步研究。

本試驗從貉腸道中成功分離出一株RDPV并對其VP2全基因序列進行了測序及分析,且與國內外發(fā)表的犬細小病毒分離株、犬細小病毒疫苗株、貉細小病毒分離株、浣熊細小病毒分離株、水貂細小分離株、貓細小病毒分離株、狐細小病毒分離株進行了同源性比較。結果發(fā)現, RDPV-SD1607的VP2基因片段長度為1 775 bp,與FPLV和MEV相比,該分離株VP2基因與CPV具有更高的同源性,核苷酸同源性均在99.0%以上,且與RDPV-HB3(GenBank登陸號為GU392240)分離株的同源性最高,達99.49%。系統進化樹結果表明, RDPV-SD1607位于細小病毒CPV-2亞型和CPV-2a亞型聚類分支之間,推測其可能正處于CPV-2亞型向CPV-2a亞型進化的中間狀態(tài),或是CPV適應貉而形成的新毒株。將該分離株與9個參考毒株VP2蛋白的關鍵位點的氨基酸[12-13]進行比較分析,結果發(fā)現與RDPV-HB3、CPV-Cv、CPV-Vac 1株關鍵位點氨基酸一致,判定該分離株屬于CPV-2型。推測可能是由于多數養(yǎng)殖場對犬使用犬細小病毒弱毒疫苗(CPV-2型)進行免疫,免疫后的犬持續(xù)排毒,CPV-2弱毒株在易感動物間傳播過程中毒力返強,身為CPV-2易感動物的貉,因接觸了含細小病毒的糞便而感染發(fā)病。

參考文獻:

[1] 佚名. 中國貂、狐、貉存欄數量統計報告(2015)[J]. 特種經濟動植物, 2016, 19(1):18-19.

[2] 呼延良澔, 錢愛東, 張海玲,等. 貉細小病毒HLJ11-1株的分離鑒定及VP2基因序列分析[J]. 黑龍江畜牧獸醫(yī), 2014(17):11-16.

[3] 周云朵, 康真玉, 陳月平,等. 犬細小病毒的分離鑒定與生物學特性分析[J]. 畜牧獸醫(yī)學報, 2011, 42(10):1 402-1 408.

[4] 殷震. 動物病毒學[M].北京: 科學出版社, 1997.

[5] Veijalainen P. Characterization of biological and antigenic properties of raccoon dog and blue fox parvoviruses: a monoclonal antibody study[J]. Veterinary Microbiology, 1988, 16(3):219-230.

[6] 夏咸柱, 葉俊華. 犬用細小病毒自然弱毒株的分離、鑒定和免疫研究[J]. 中國預防獸醫(yī)學報, 1989,21(6):6-9.

[7] 閆喜軍, 張蕾, 柴秀麗. 我國狐、貉體內發(fā)現2型犬細小病毒[J]. 特產研究, 2010, 32(1):79-79.

[8] 劉雙翼, 余麗蕓, 侯喜林,等. 貉源細小病毒的分離鑒定[J]. 中國獸醫(yī)科學, 2009, 39(3):214-218.

[9] Cavalli A, Martella V C,Camero M,etal.Evaluation of the Antigenic Relationships among Canine Parvovirus Type 2 Variants[J].Clinical & Vaccine zmmunology,2008,15(3):534-539.

[10] 康洪濤. 貉細小病毒分離鑒定及免疫原性研究[D].北京: 中國農業(yè)科學院, 2012.

[11] Allison A B, Organtini L J, Zhang S,etal. Single mutations in the VP2 300 loop region of the three-fold spike of the carnivore parvovirus capsid can determine host range[J]. Journal of Virology, 2016,90(2).

[12] Shackelton L A, Parrish C R, Truyen U,etal. High rate of viral evolution associated with the emergence of carnivore parvovirus[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2005, 102(2):379-384.

[13] 邱薇, 范泉水, 李作生,等. 犬細小病毒VP2基因的比較及分型研究[J]. 動物醫(yī)學進展, 2005, 26(5):69-72.

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