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長(zhǎng)鏈非編碼RNA在急性髓細(xì)胞白血病發(fā)生發(fā)展中的作用及其機(jī)制研究進(jìn)展

2018-03-19 05:58黃涵英孫京男劉相良李薇
山東醫(yī)藥 2018年35期
關(guān)鍵詞:復(fù)合物白血病染色體

黃涵英,孫京男,劉相良,李薇

(吉林大學(xué)第一醫(yī)院,長(zhǎng)春130021)

長(zhǎng)鏈非編碼RNA (long non-coding RNA, lncRNA)是指一類長(zhǎng)度超過200個(gè)核苷酸且不編碼蛋白質(zhì)的RNA分子的總稱。該RNA有以下不同分類方式[1]:根據(jù)lncRNA在基因組上的方向可將其分為正向型、反向型、雙向型;根據(jù)lncRNA在基因組上的位置可分為內(nèi)含子型、基因間型、嵌合型;根據(jù)lncRNA的分子機(jī)制可將其分為信號(hào)分子、誘餌分子、引導(dǎo)分子、骨架分子及復(fù)合分子。與編碼蛋白質(zhì)的信使RNA(即mRNA)相比,lncRNA更多是具有細(xì)胞特異性的低水平表達(dá)[2],說明lncRNA可能主要發(fā)揮調(diào)控作用。進(jìn)一步的研究[3]發(fā)現(xiàn),lncRNA在細(xì)胞功能和基因調(diào)控中起著重要的作用,尤其與腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān);在惡性血液疾病中,lncRNA不僅與淋巴瘤密切相關(guān),還與白血病密切相關(guān)。急性髓細(xì)胞白血病(acute myeloid leukemia,AML)是一類具有多種遺傳變異的髓系造血干/祖細(xì)胞克隆性疾病,其發(fā)病機(jī)制仍不完全清楚。近年來,隨著二代基因測(cè)序技術(shù)的高速發(fā)展,越來越多的lncRNA被發(fā)現(xiàn)與AML的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),而且已經(jīng)證實(shí)一小部分lncRNA與惡性血液病有決定性的聯(lián)系。深入研究lncRNA在AML的發(fā)生發(fā)展中的調(diào)節(jié)作用,對(duì)于AML的靶向治療將具有重要意義?,F(xiàn)將有關(guān)lncRNA在AML發(fā)生發(fā)展中的作用及作用機(jī)制研究進(jìn)展情況綜述如下。

1 機(jī)體lncRNA的作用及其機(jī)制

lncRNA可以作為信號(hào)分子、誘餌分子、引導(dǎo)分子和骨架分子,參與機(jī)體的各種生物過程。首先,作為信號(hào)分子,lncRNA可以反應(yīng)染色體的功能狀態(tài)。lncRNA通過結(jié)合靶向位點(diǎn),導(dǎo)致染色體的活性發(fā)生變化,引起表型改變。例如,X染色體中單等位基因特異轉(zhuǎn)錄本(Xist)的失活[4,5],是通過將多梳家族蛋白2復(fù)合物募集到Xist啟動(dòng)子區(qū)域,lncRNA Xist轉(zhuǎn)錄物高度特異性地從X染色體去活化中心(Xic)轉(zhuǎn)錄,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物順著X染色體覆蓋基因表達(dá)區(qū)域,導(dǎo)致染色體基因表達(dá)的抑制。另外,反義lncRNA Tsix是Xist的抑制因子,而X染色體失活過程積累的lncRNA Jpx是Xist的激活子。這些參與其中的lncRNA不僅說明了染色體劑量補(bǔ)償效應(yīng),還反映X染色體失活的沉默狀態(tài)。第二,lncRNA作為誘餌分子,可以正向或負(fù)向調(diào)節(jié)靶基因的轉(zhuǎn)錄。在生物過程中,lncRNA與某些分子相似,競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合靶向位點(diǎn),導(dǎo)致靶基因的轉(zhuǎn)錄活性異常,影響機(jī)體的生理代謝。這種作用方式也被稱為競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA(即ce-RNA)。第三,作為引導(dǎo)分子,lncRNA可以與蛋白質(zhì)或DNA結(jié)合,從而指導(dǎo)結(jié)合復(fù)合物順式或反式靶向調(diào)節(jié)靶基因的表達(dá)。這種引導(dǎo)作用通常利用lncRNA特異性的空間構(gòu)象,不僅與染色質(zhì)局部區(qū)域的變化相關(guān),而且與染色質(zhì)的遠(yuǎn)端結(jié)構(gòu)相關(guān)[6]。第四,lncRNA也可以作為多種底物結(jié)合復(fù)合物的骨架。除了傳統(tǒng)的蛋白質(zhì)能夠?yàn)槎喾N復(fù)合物的形成過程提供平臺(tái)以外,lncRNA也能為功能性復(fù)合物的形成提供中心平臺(tái),這對(duì)許多生物信號(hào)的傳遞、分子間作用以及信號(hào)本身的特異性和動(dòng)力學(xué)的精確調(diào)節(jié)具有重要意義。需要強(qiáng)調(diào)的是,許多l(xiāng)ncRNA是一個(gè)復(fù)合性功能分子,其發(fā)揮作用可能同時(shí)存在多種分子機(jī)制。例如,Xist可以是信號(hào)分子,也可以是指導(dǎo)附近基因表達(dá)的引導(dǎo)分子。lncRNA HOTAIR更是多功能的復(fù)合分子。lncRNA可以是信號(hào)分子,也可以是調(diào)節(jié)遠(yuǎn)處基因的引導(dǎo)分子,更是復(fù)合物結(jié)合的骨架平臺(tái)。

2 lncRNA在AML發(fā)生發(fā)展中的作用及其機(jī)制

與AML發(fā)生發(fā)展相關(guān)的lncRNA主要有H19、HOTAIRM1、PVT1、MEG3、 Gas5、IRAIN、HOTAIR等,在AML發(fā)生發(fā)展過程中它們分別通過不同的作用機(jī)制發(fā)揮了不同的作用。

2.1 H19維持造血干細(xì)胞的靜息狀態(tài) 印記基因H19是第一個(gè)被發(fā)現(xiàn)的lncRNA,其位于染色體11p15.5,全長(zhǎng)2 300 bp,富含于胚胎胎肝,胎兒出生后表達(dá)下降。H19介導(dǎo)成人造血干細(xì)胞維持靜息狀態(tài)。在胚胎的發(fā)生過程中,H19由母系等位基因轉(zhuǎn)錄,調(diào)節(jié)生長(zhǎng)發(fā)育。H19在長(zhǎng)期造血干細(xì)胞中保持活性,在短期造血干細(xì)胞和多能干細(xì)胞中表達(dá)逐漸減少[7],敲除親本等位基因中的H19基因后造血干細(xì)胞保持靜息的能力下降(即造血干細(xì)胞活化和增殖增強(qiáng)),但再生能力受損。這種維持染色體靜息狀態(tài)的作用機(jī)制是在轉(zhuǎn)錄水平和轉(zhuǎn)錄后水平激活I(lǐng)GF2-IGF1R通路,即通過上調(diào)母系IGF2表達(dá)和增加IGF1R翻譯來增強(qiáng)信號(hào)傳導(dǎo)。由此推測(cè),隨著H19增加或減少,將影響造血干細(xì)胞的活性,影響造血功能,從而引發(fā)AML。

2.2 HOTAIRM1促進(jìn)早幼粒細(xì)胞的髓系分化 lncRNA HOTAIRM1是髓細(xì)胞系特異性長(zhǎng)鏈非編碼轉(zhuǎn)錄物,由染色體7p15的HOXA1和HOXA2基因之間的基因座轉(zhuǎn)錄,調(diào)控髓樣分化基因(如CD11b和CD18),而敲除HOTAIRM1使全反式維甲酸誘導(dǎo)的髓系分化受到阻礙。有學(xué)者[8]指出,在基因表達(dá)水平,HOTAIRM1調(diào)節(jié)由整合素控制的細(xì)胞周期進(jìn)程,進(jìn)而調(diào)控髓細(xì)胞成熟。一項(xiàng)研究[9]發(fā)現(xiàn),在粒細(xì)胞分化過程中,轉(zhuǎn)錄因子PU.1可通過與HOTAIRM1的調(diào)節(jié)區(qū)域結(jié)合而直接激活HOTAIRM1的表達(dá),而PU.1表達(dá)減少可導(dǎo)致HOTAIRM1表達(dá)減少??梢?,PU.1基因功能的缺陷可能會(huì)促進(jìn)AML的發(fā)生。HOTAIRM1來源于HOXA簇,進(jìn)而調(diào)控HOXA簇中的相鄰基因,表明該lncRNA通過調(diào)節(jié)HOXA基因座相鄰基因的表觀遺傳狀態(tài)來調(diào)節(jié)髓細(xì)胞[10]。另一項(xiàng)研究[11]發(fā)現(xiàn),在AML初診斷時(shí),HOTAIRM1的表達(dá)水平可以提供更多相關(guān)的預(yù)后信息。

2.3 PVT1抑制早幼粒細(xì)胞的髓系分化 lncRNA PVT1 位于染色體8q24上,與致癌基因c-myc共享位置。PVT1可促進(jìn)急性早幼粒細(xì)胞白血病中白血病細(xì)胞的增殖[12],也就是說,PVT1抑制粒細(xì)胞分化,導(dǎo)致疾病發(fā)生。PVT1的致癌活性與髓細(xì)胞組織增生(myelocytomatosis,MYC)密切相關(guān),MYC的過度表達(dá)可誘導(dǎo)癌細(xì)胞過度增殖。在大約10%的AML患者中可以觀察到,PVT1的表達(dá)需要高表達(dá)水平的MYC蛋白,而后者處于染色體8q24.21擴(kuò)增的人類癌細(xì)胞中;而相對(duì)地,PVT1通過直接作用使MYC免受降解[13]。另外,PVT1也作為間接調(diào)控MYC的microRNA前體,來源于PVT1基因座外顯子1b位點(diǎn)的Hsa-miR-1204已被證實(shí)能夠提高M(jìn)YC的表達(dá)水平[14]。PVT1和MYC的共擴(kuò)增作用結(jié)果提示了lncRNA的拷貝數(shù)與AML發(fā)生發(fā)展有一定關(guān)系。

2.4 MEG3抑制白血病細(xì)胞的發(fā)生發(fā)展 lncRNA MEG3 是一類新發(fā)現(xiàn)的腫瘤抑制因子,在多種腫瘤形成發(fā)展中有重要調(diào)控作用。MRG3位于染色體14q32.3上,其長(zhǎng)度約為1 600 bp,可表達(dá)于正常組織,例如腦、垂體、胎盤、腎上腺、胰腺和卵巢等。但在AML細(xì)胞中,MEG3表達(dá)普遍下調(diào),且其啟動(dòng)子的高甲基化是AML預(yù)后不良的標(biāo)志??梢?,MEG3的失活可能是由于其啟動(dòng)子的甲基化所致。姚紅霞等[15]發(fā)現(xiàn),AML細(xì)胞中MEG3的啟動(dòng)子高甲基化可能是因?yàn)門ET2活性減低所致。最新研究[16]表明,MEG3抑制AML的發(fā)生,而TET2失調(diào)的WT1-MEG3軸明顯促進(jìn)AML的發(fā)生。另外,microRNA-22也可以調(diào)控MEG3在AML中的表達(dá)[17]。MEG3的這些作用機(jī)制為AML的診斷提供了新思路,也為AML潛在的治療措施提供了依據(jù)。

2.5 Gas5促進(jìn)白血病細(xì)胞的增殖 lncRNA Gas5位于染色體1q25,長(zhǎng)約630 bp,是“誘餌分子”機(jī)制的典型例子,與白血病細(xì)胞系增殖有關(guān)。因?yàn)镚as5具有類似于糖皮質(zhì)激素受體(GR)的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域的發(fā)夾結(jié)構(gòu),故Gas5可以作為“糖皮質(zhì)激素反應(yīng)元件(GRE)”與DNA的GRE競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合,通過調(diào)節(jié)GR的轉(zhuǎn)錄活性來影響機(jī)體饑餓期間的細(xì)胞活力和代謝活性。因競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源性RNA的作用機(jī)制,Gas5可保護(hù)白血病細(xì)胞免受化療藥物的凋亡[18]。這一發(fā)現(xiàn)提示,針對(duì)具有Gas5高表達(dá)的AML患者,可應(yīng)用與其競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合的靶向藥物,抑制白血病細(xì)胞的增殖。

2.6 IRAIN抑制白血病細(xì)胞的發(fā)生 lncRNA IRAIN 位于IGF1R基因區(qū)內(nèi),5′端起始點(diǎn)位于IGF1R內(nèi)含子1中,跨越IGF1R啟動(dòng)子區(qū)域,全長(zhǎng)5 366 bp,與IGF1R編碼方向相反,為IGF1R的反義lncRNA。研究[6]發(fā)現(xiàn),IRAIN在低危組AML患者中表達(dá)上調(diào),在高危組AML患者中表達(dá)下調(diào);與此同時(shí),IGFR1在高危組白血病患者中具有高表達(dá)趨勢(shì)。在AML細(xì)胞中,IGF1R表達(dá)增高及蘇素化水平升高,與AML細(xì)胞增殖有關(guān);抑制IGF1R賴氨酸1100及1025蘇素化,可抑制AML細(xì)胞的存活[19]。IRAIN可作為抑癌基因,通過調(diào)節(jié)IGF1R空間結(jié)構(gòu),形成啟動(dòng)子及增強(qiáng)子內(nèi)環(huán),表觀水平上調(diào)控IGF1R表達(dá)及功能。

2.7 HOTAIR促進(jìn)白血病細(xì)胞的增殖 作為骨架分子,lncRNA HOTAIR位于染色體12的HOXC 基因簇內(nèi),其5′末端的300個(gè)核苷酸序列與多梳抑制復(fù)合物2 (PRC2)相互作用,使組蛋白H3賴氨酸27甲基化,導(dǎo)致HOXC 基因抑制;同時(shí),由其3′末端的700個(gè)核苷酸結(jié)構(gòu)域與LSD1/CoREST/REST復(fù)合物結(jié)合,使組蛋白H3賴氨酸4去甲基化,導(dǎo)致HOXC 基因表達(dá)。HOTAIR是PRC2和LSD1/CoREST/REST之間的連接支架和橋梁。在AML細(xì)胞凋亡中,HOTAIR的敲除可抑制AML細(xì)胞的生長(zhǎng)和克隆的形成,并誘導(dǎo)AML細(xì)胞的凋亡[20]。近年來多項(xiàng)研究[21,22]也表明,HOTAIR的表達(dá)高低與AML的臨床表現(xiàn)及預(yù)后分層有明確相關(guān)性。然而,也有人[23]證實(shí)HOTAIR的表達(dá)水平在AML患者和健康個(gè)體之間沒有顯著差異。這表明目前HOTAIR還不是AML診斷及分層的可靠標(biāo)志物,需要在進(jìn)一步研究中證實(shí),或許與HOTAIR的骨架作用機(jī)制有關(guān)聯(lián)。

2.8 其他lncRNA 對(duì)AML的作用 除了上述lncRNA,人們還發(fā)現(xiàn)了其他與AML相關(guān)的lncRNA,如NEAT1的低表達(dá)可能促進(jìn)早幼粒細(xì)胞的髓系分化[24],UCA1的沉默明顯抑制了AML細(xì)胞的增殖[25],RUNXOR在AML患者中表達(dá)上調(diào)并可能促進(jìn)AML的發(fā)生發(fā)展[26], CCDC26通過調(diào)節(jié)KIT的表達(dá)調(diào)節(jié)白血病細(xì)胞的生長(zhǎng)[27]。

總之,多種lncRNA 在AML的發(fā)生發(fā)展過程中發(fā)揮了重要的調(diào)節(jié)作用,但其作用機(jī)制尚未完全明確,lncRNA與其他分子的相互作用仍是謎底。對(duì)lncRNA在AML的發(fā)生發(fā)展過程作用機(jī)制的進(jìn)一步研究,將為AML的診斷、危險(xiǎn)分層及預(yù)后提供更多信息,也會(huì)為AML的靶向治療奠定基礎(chǔ)。

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