別闖南,王 權(quán),白雪瑞,凌 嬌,李恭賀,蔣 蔚
(1. 廣西大學(xué),南寧530005;2. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海獸醫(yī)研究所,上海 200241)
檢測(cè)創(chuàng)傷弧菌兩種毒力基因的環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)方法的建立
別闖南1,王 權(quán)2,白雪瑞2,凌 嬌2,李恭賀1,蔣 蔚2
(1. 廣西大學(xué),南寧530005;2. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海獸醫(yī)研究所,上海 200241)
為建立快速檢測(cè)致病性創(chuàng)傷弧菌兩種毒素的環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(loop-mediated isothermal ampli fi cation,LAMP)方法,分別以創(chuàng)傷弧菌溶血素A基因(hemolysin gene A,HA)和多重毒素(repeats in toxin,RTX)毒力基因的保守序列作為靶序列設(shè)計(jì)內(nèi)、外引物。通過(guò)肉眼觀察白色沉淀初步判斷檢測(cè)結(jié)果,通過(guò)瓊脂糖電泳最終確定檢測(cè)結(jié)果。LAMP檢測(cè)創(chuàng)傷弧菌的兩種基因的靈敏度都達(dá)到10 CFU/mL。特異性結(jié)果表明致病性創(chuàng)傷弧菌的結(jié)果為陽(yáng)性,而其他幾種常見(jiàn)弧菌和食源菌檢測(cè)結(jié)果為陰性。在人工模擬樣品檢測(cè)中,LAMP結(jié)果顯示,采用水煮法提取DNA,從樣品處理到報(bào)告結(jié)果耗時(shí)1.5 h,魚(yú)肉中創(chuàng)傷弧菌的檢出限為1×102CFU/g(RTX)和1×104CFU/ g(HA);采用同樣方法提取 DNA進(jìn)行普通PCR,其檢出限為1×103CFU/g(RTX)和1×104CFU/ g(HA),耗時(shí)4 h。結(jié)果表明,本研究建立的LAMP方法檢測(cè)創(chuàng)傷弧菌兩種毒力基因時(shí)具有靈敏度高、特異性強(qiáng)、方法簡(jiǎn)便等優(yōu)點(diǎn),適用于食品和養(yǎng)殖業(yè)中的現(xiàn)場(chǎng)快速檢測(cè)。
環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增;溶血素A基因;多重毒素;創(chuàng)傷弧菌
創(chuàng)傷弧菌(Vibrio vulnificus)是19世紀(jì)70年代發(fā)現(xiàn)并分離鑒定的一種嗜鹽性革蘭性陰性菌,菌體短小,呈稍彎曲的逗點(diǎn)狀,是弧菌中的一種低度嗜鹽菌,并且具有很高的致病性,多存在于近海、河口和水生生物中[1]。創(chuàng)傷弧菌可從牡蠣等海產(chǎn)品中分離得到,通過(guò)食入生的海產(chǎn)品,或通過(guò)人體表面?zhèn)诨蛘呤怯斡菊咄萄屎K?,?chuàng)傷弧菌可進(jìn)入人體內(nèi)繁殖,并且在極短的時(shí)間內(nèi)出現(xiàn)敗血癥和蜂窩組織炎、出血性大瘡,一旦出現(xiàn)敗血癥,具有很高的致死率,在海產(chǎn)品食源性疾病中,占據(jù)較高的比重[2]。美國(guó)佛羅里達(dá)海濱爆發(fā)“吃人肉細(xì)菌”,致死率超過(guò)30%,引起人們的極大關(guān)注,而所謂的“吃人肉細(xì)菌”就是創(chuàng)傷弧菌[3,4]。感染創(chuàng)傷弧菌后,會(huì)引發(fā)嘔吐、發(fā)燒、腹瀉、低血壓、腫脹和疼痛等癥狀,尤其容易創(chuàng)口感染,一旦感染創(chuàng)傷弧菌,患者體表傷口附近的肌肉組織將被細(xì)菌“殺死和吃掉”,免疫系統(tǒng)功能低下的人(如肝腎功能不全者)最容易感染這種致命的細(xì)菌,創(chuàng)傷弧菌嚴(yán)重影響人們的身體健康[5]。目前,對(duì)創(chuàng)傷弧菌的檢測(cè)方法主要有直接病原分離培養(yǎng)、ELISA、PCR 法、熒光定量 PCR法等[6]。
環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是日本學(xué)者Notomi建立的一種適用于基層診斷的恒溫核酸擴(kuò)增技術(shù)[7,8]。因其具有操作簡(jiǎn)單,對(duì)儀器設(shè)備要求低,高特異性、高靈敏度的優(yōu)勢(shì)[9,10],短短十年多,LAMP就在國(guó)內(nèi)外各種細(xì)菌、病毒、寄生蟲(chóng)等病原體檢測(cè)、食品的安全檢查及進(jìn)出口快速診斷中取得廣泛引用,并得到各界的廣泛認(rèn)可[11]。近幾年,LAMP也逐漸被應(yīng)用到水產(chǎn)品弧菌的檢測(cè)中,主要是對(duì)副溶血弧菌、霍亂弧菌的檢測(cè),而對(duì)創(chuàng)傷弧菌的應(yīng)用報(bào)道較少。
本研究利用創(chuàng)傷弧菌(ATCC27562)溶血素A基因(hemolysin gene A,HA)和多重毒素(repeats in toxin,RTX)毒力基因的保守序列作為靶序列,分別設(shè)計(jì)內(nèi)、外引物,建立了LAMP檢測(cè)方法。利用一臺(tái)水浴鍋或恒溫箱就能實(shí)現(xiàn)對(duì)創(chuàng)傷弧菌的檢測(cè),結(jié)果只需通過(guò)肉眼觀察是否形成白色渾濁即可快速判斷。
1.1 材料
1.1.1 主要儀器和試劑 DK-8D型電熱恒溫水槽(購(gòu)自上海精宏實(shí)驗(yàn)室設(shè)備公司;PCR儀(Eppendorf AG22331)購(gòu)自德國(guó)Eppendorf公司;核酸電泳儀(DYY-6D型)購(gòu)自北京六一儀器廠;凝膠成像系統(tǒng)(Gel DocTM EZ Imager)購(gòu)自美國(guó)Bio-Rad公司;離心機(jī)(H1650-W型)購(gòu)自長(zhǎng)沙湘儀離心機(jī)儀器公司;蛋白胨、酵母提取物購(gòu)自xoid公司;細(xì)菌DNA提取試劑盒購(gòu)自上海天根公司;DNA Marker購(gòu)自大連寶生物公司;2×PCR Taq Mix購(gòu)自廣東東盛生物科技有限公司;其余試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純。
1.1.2 菌株 創(chuàng)傷弧菌ATCC27562和副溶血弧菌ATCC17802購(gòu)自美國(guó)菌種保藏中心(American type culture collection,ATCC);副溶血弧菌、溶藻弧菌、擬態(tài)弧菌、沙門(mén)氏菌、大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、腸球菌和豬鏈球菌購(gòu)自中國(guó)醫(yī)學(xué)微生物菌種保藏管理中心;霍亂弧菌1304由疾控中心惠贈(zèng)。
1.1.3 樣品 經(jīng)國(guó)標(biāo)法檢測(cè)為創(chuàng)傷弧菌陰性的對(duì)蝦和貝類(lèi)購(gòu)自當(dāng)?shù)剞r(nóng)貿(mào)市場(chǎng)。
1.2 方法
1.2.1 引物設(shè)計(jì) 在GenBank上獲得創(chuàng)傷弧菌ATCC27562的HA基因和RTX毒力基因序列,分別利用DNAstar軟件分析其保守區(qū)域,再根據(jù)引物設(shè)計(jì)原則,用Primer Explorer V4(http://primerexplorer.jp/elamp4.0.0/index.html)軟件分析并設(shè)計(jì)4條引物,分別是外引物F3、B3,內(nèi)引物FIP(F1+F2)、BIP(B1+B2)。HA的擴(kuò)增位置為93~311區(qū)域,共218 bp目的基因片斷;RTX的擴(kuò)增位置為216~430區(qū)域,共214 bp目的基因片斷。引物的名稱(chēng)和具體序列見(jiàn)表1和表2。每條引物在基因組中具體的位置如圖1所示。引物均由上海英濰捷基貿(mào)易有限公司合成。
表1 HA基因的LAMP 引物Table 1 LAMP primers of HA gene
表2 RTX基因的LAMP 引物Table 2 LAMP primers of RTX gene
圖1 用于檢測(cè)HA和RTX的LAMP引物設(shè)計(jì)Fig.1 Design of the LAMP primers for HA and RTX detection
1.2.2 細(xì)菌的培養(yǎng)及DNA的提取 創(chuàng)傷弧菌接種于新鮮3%NaCl的LB培養(yǎng)基中,37℃、200 r/min培養(yǎng)12 h,調(diào)節(jié)菌液濃度并測(cè)OD600值。當(dāng)OD600為0.2時(shí),用無(wú)菌生理鹽水進(jìn)行10倍梯度稀釋至10-9,然后分別快速涂3%NaCl的LB固體平板, 測(cè)定其活菌數(shù)平均為1.0×108CFU/mL;同時(shí)從每個(gè)稀釋度的菌液中取1 mL用水煮法提基因組DNA,作為L(zhǎng)AMP和PCR靈敏度檢測(cè)的模板。水煮法提DNA步驟:取1 mL菌液于EP管中,10 800×g離心2 min,棄上清;加100 μL滅菌水,充分混勻;-20℃冰浴45 min,沸水浴10 min,再冰浴10 min;最后8000×g離心4 min,收集上清,保存于-20℃?zhèn)溆?;試劑盒法(用于人工布菌試?yàn)):按照試劑盒使用說(shuō)明書(shū)提取,保存于-20℃?zhèn)溆谩?/p>
1.2.3 LAMP反應(yīng)體系 根據(jù)韓先干等[11]研究LAMP的基礎(chǔ)上進(jìn)行優(yōu)化,總體系25 μL:dNTP(2.5 mmol/L;Tiangen)4 μL、10× ThermoPol buffer 2.5 μL、內(nèi)引物(FIP和BIP,10 mmol/L)各4 μL、外引物(F3和B3,10 mmol/L)各1 μL、betaine(5 mmol/L;Sigma,St. Louis,MO)5.5 μL、2 μLDNA模板,經(jīng)94℃,5 min,再冰激20 s后加入1 μL(8 U)的BstDNA聚合酶(M0275;New England Biolabs,Boston,MA),最后將反應(yīng)管置于63℃水浴鍋內(nèi),作用60 min,同時(shí)以無(wú)菌水為模板作為陰性對(duì)照。取出反應(yīng)管,10 000×g離心2 min,目測(cè)反應(yīng)管中液體渾濁度變化,判斷是否發(fā)生反應(yīng),同時(shí)取5 μL進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳驗(yàn)證。
1.2.4 LAMP特異性和靈敏度試驗(yàn) 將實(shí)驗(yàn)室保存的創(chuàng)傷弧菌和9種非創(chuàng)傷弧菌(沙門(mén)氏菌、大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、腸球菌、豬鏈球菌、霍亂弧菌、溶藻弧菌、擬態(tài)弧菌、副溶血弧菌)復(fù)蘇后,調(diào)節(jié)菌液OD600值達(dá)0.2時(shí),水煮法分別提其DNA,進(jìn)行HA和RTX的LAMP特異性檢測(cè)。按照1.2.2方法中的水煮法提取DNA并進(jìn)行HA和RTX的LAMP靈敏度檢測(cè)。
1.2.5 PCR法檢測(cè) 用表1和表2中的外引物(F3和B3)進(jìn)行普通PCR,并與LAMP檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行比較。PCR總體系25 μL:2×PCR反應(yīng)緩沖液12.5 μL、外引物(F3/ B3,10 mmol/L)各1μL、ddH2O 9.5 μL、模板DNA 1 μL。反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性3 min;94℃變性45 s,55℃退火55 s,72℃延伸90 s,進(jìn)行30個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min。
1.2.6 人工布菌試驗(yàn) 在當(dāng)?shù)剞r(nóng)貿(mào)市場(chǎng)采集對(duì)蝦和貝類(lèi),無(wú)菌剪碎并混合,取2 g肉糜加3%NaCl溶液至2 mL并研磨至勻漿,用試劑盒提取其基因組,按1.2.4中HA和RTX的兩條外引物(F3和B3)進(jìn)行常規(guī)PCR。檢測(cè)結(jié)果顯示沒(méi)有目的片段,即該對(duì)蝦和貝類(lèi)體內(nèi)無(wú)創(chuàng)傷弧菌。將對(duì)蝦和貝類(lèi)無(wú)菌條件下制備成1 mL含1 g肉糜的勻漿液8份,加入已倍比稀釋的創(chuàng)傷弧菌, 混勻并用3%NaCl溶液進(jìn)行10倍系列稀釋至10-8,終濃度為每克肉糜中108~101CFU,分別用試劑盒提取其基因組。作為模擬樣品進(jìn)行LAMP和PCR靈敏度檢測(cè),分析其最低檢測(cè)限。
2.1 LAMP 反應(yīng)的肉眼可視結(jié)果 檢測(cè)HA的反應(yīng)結(jié)果如圖1A中所示,管1未發(fā)生LAMP反應(yīng),無(wú)白色沉淀產(chǎn)生;管2發(fā)生LAMP反應(yīng),產(chǎn)生明顯的白色沉淀。檢測(cè)RTX的反應(yīng)結(jié)果如圖1B中所示,管1未發(fā)生LAMP反應(yīng),無(wú)白色沉淀;管2發(fā)生LAMP反應(yīng),并產(chǎn)生明顯的白色沉淀。
圖1 創(chuàng)傷弧菌LAMP方法結(jié)果觀察Fig.1 Visual observation of ampli fi cation products for Vibrio vulnif i cus by LAMP method
2.2 LAMP和 PCR檢測(cè)創(chuàng)傷弧菌靈敏度的比較 LAMP檢測(cè)RTX基因時(shí),菌液稀釋至10-6(101CFU/mL)時(shí)出現(xiàn)明顯條帶,而稀釋至10-7(100CFU/mL)時(shí)未出現(xiàn)明顯條帶,即檢測(cè)創(chuàng)傷弧菌RTX基因的靈敏度達(dá)10 CFU/mL ;LAMP檢測(cè)HA基因時(shí),菌液稀釋至10-6(101CFU/mL)時(shí)出現(xiàn)明顯條帶,而稀釋至10-7(100CFU/mL)時(shí)未出現(xiàn)明顯條帶,即檢測(cè)創(chuàng)傷弧菌HA基因的靈敏度達(dá)10 CFU/mL,相應(yīng)的沉淀如圖2中A、B所示。常規(guī)PCR檢測(cè)RTX基因時(shí),菌液稀釋至10-6(10 CFU/mL)時(shí)未出現(xiàn)明顯條帶,即檢測(cè)創(chuàng)傷弧菌RTX基因的靈敏度達(dá)102CFU/mL;檢測(cè)HA基因時(shí),菌液稀釋至10-6(10 CFU/mL)時(shí)未出現(xiàn)明顯條帶,即檢測(cè)創(chuàng)傷弧菌HA基因的靈敏度達(dá)102CFU/mL(圖3中A、B、C、D)。
圖2 LAMP檢測(cè)基因組的渾濁度觀察Fig.2 Turbidity observation of LAMP method for genomic DNA
2.3 LAMP檢測(cè)創(chuàng)傷弧菌特異性試驗(yàn) 按照1.2.2中的水煮法提取DNA,進(jìn)行RTX和HA的LAMP特異性檢測(cè),結(jié)果分別如圖4中A、B所示,除了創(chuàng)傷弧菌,9種其他細(xì)菌如沙門(mén)氏菌、大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、腸球菌、豬鏈球菌、霍亂弧菌、溶藻弧菌、擬態(tài)弧菌、副溶血弧菌均未檢測(cè)到條帶,說(shuō)明建立的LAMP檢測(cè)方法具有很好的特異性。
2.4 LAMP和PCR檢測(cè)人工污染食品樣品中創(chuàng)傷弧菌的檢出限比較 人工污染對(duì)蝦和貝類(lèi)的創(chuàng)傷弧菌的濃度為108~101CFU/g,按1.2.5方法處理樣品提取DNA,分別進(jìn)行LAMP和常規(guī)PCR檢測(cè)RTX的檢出限試驗(yàn)。對(duì)蝦貝類(lèi)勻漿液加入創(chuàng)傷弧菌后進(jìn)行10倍系列稀釋?zhuān)琇AMP方法在其稀釋至10-6倍(102CFU/g)時(shí)能出現(xiàn)條帶,而稀釋到10-7倍 (101CFU/g )時(shí)不能檢測(cè)到創(chuàng)傷弧菌,不出現(xiàn)條帶,所以LAMP檢測(cè)RTX基因的最低檢測(cè)限為102CFU/g;PCR方法在勻漿液稀釋到10-5倍(103CFU/g)時(shí)能出現(xiàn)條帶,而稀釋到10-6倍(102CFU/g)時(shí)不能檢測(cè)到創(chuàng)傷弧菌,不出現(xiàn)沉淀, 所以PCR檢測(cè)RTX基因的檢測(cè)限為103CFU/g。
圖3 LAMP靈敏度檢測(cè)結(jié)果Fig.3 The results of sensitivity test of LAMP
圖4 LAMP特異性試驗(yàn)結(jié)果Fig.4 The results of speci fi city test of LAMP
A:LAMP對(duì)基因組RTX特異性檢測(cè)結(jié)果; B:LAMP對(duì)HA特異性檢測(cè)結(jié)果; 1:DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)(DL15 000); 2:創(chuàng)傷弧菌; 3:沙門(mén)氏菌; 4:大腸桿菌; 5:金黃色葡萄球菌; 6:腸球菌; 7:豬鏈球菌; 8:霍亂弧菌; 9:溶藻弧菌; 10:擬態(tài)弧菌; 11:副溶血弧菌
A:The results of LAMP speci fi city test for genomic RTX; B:The results of LAMP speci fi city test for genomic HA; 1:DNA Marker(DL15 000); 2:Vibrio vulnif i cus; 3:Salmonella; 4:Escherichia coli; 5:Staphylococcus aureus; 6:Enterococcus; 7:Streptococcus suis; 8:Vibrio cholera; 9:Vibrio alginolyticus; 10:Vibrio mimicus; 11:Vibrio parahemolyticus
以同樣的方法分別檢測(cè)LAMP和常規(guī)PCR對(duì)HA的檢出限。LAMP方法在對(duì)蝦貝類(lèi)勻漿液稀釋到10-4倍(104CFU/g)時(shí)能出現(xiàn)條帶,而稀釋到10-5倍(103CFU/g)時(shí)不能檢測(cè)到創(chuàng)傷弧菌,不出現(xiàn)條帶,所以LAMP檢測(cè)HA基因的檢測(cè)限為104CFU/g;PCR方法在對(duì)蝦貝類(lèi)勻漿液稀釋到10-4倍(1.0×104CFU/g)時(shí)能出現(xiàn)條帶,而稀釋到10-5倍(103CFU/g)時(shí)不能檢測(cè)到創(chuàng)傷弧菌, 不出現(xiàn)沉淀,所以PCR檢測(cè)HA基因的檢測(cè)限為104CFU/g 。
創(chuàng)傷弧菌廣泛分布于海洋及海產(chǎn)品中,患病者一般誤食或經(jīng)傷口感染,臨床病癥主要表現(xiàn)為胃腸炎及傷口化膿壞死性病變,易引發(fā)敗血癥[13-15],故成為全球重要的海洋致病細(xì)菌,與副溶血弧菌、霍亂弧菌并列為造成人類(lèi)致病的三大弧菌。隨著人們對(duì)海產(chǎn)品需求的提高及海上運(yùn)動(dòng)的追求,接觸并感染創(chuàng)傷弧菌的病例越來(lái)越多。1996~2010年,美國(guó)累計(jì)報(bào)道1600余例,病死率達(dá)30%[16]。2003~2010年臺(tái)灣地區(qū)報(bào)道近100例,病死率高達(dá)60%[17]。
目前用于檢測(cè)創(chuàng)傷弧菌的方法有鑒定培養(yǎng)基、形態(tài)學(xué)等方法。這些傳統(tǒng)方法雖然不需要昂貴的儀器,但是耗時(shí)長(zhǎng)、特異性和靈敏性太差[17]。熒光定量PCR檢測(cè)、常規(guī)PCR檢測(cè)和ELISA檢測(cè)雖然特異性和敏感性強(qiáng),但是需要專(zhuān)業(yè)人員操作,需要的設(shè)備儀器比較昂貴,因此不利于在基層檢測(cè)進(jìn)行推廣。為了人們食用海產(chǎn)品的安全性,需要建立一種快捷、簡(jiǎn)便、實(shí)用性強(qiáng)的方法來(lái)滿足檢測(cè)需求。
圖5 LAMP和PCR方法對(duì)人工污染食品中創(chuàng)傷孤菌的靈敏度檢測(cè)結(jié)果Fig.5 The sensitivity of LAMP and PCR methods for the detection of isolated bacteria in arti fi cially contaminated food
LAMP是一種恒溫的核酸擴(kuò)增技術(shù),不但具有較好的特異性和靈敏度[18],而且不需要十分昂貴的設(shè)備儀器,也不需要專(zhuān)業(yè)的技術(shù)人員進(jìn)行操作,通過(guò)眼睛即可直接觀察結(jié)果。LAMP最大的優(yōu)點(diǎn)在于檢測(cè)時(shí)間短,能夠大大地降低檢測(cè)時(shí)間和成本[19]。本研究以創(chuàng)傷弧菌(ATCC27562)HA基因和RTX毒力基因的保守序列作為靶序列,分別設(shè)計(jì)內(nèi)、外引物,建立快速檢測(cè)創(chuàng)傷弧菌的方法,并將兩段基因的檢測(cè)結(jié)果與普通PCR檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行比較,結(jié)果顯示其靈敏度不低于普通PCR檢測(cè),同時(shí)比PCR耗時(shí)短。特異性檢測(cè)結(jié)果顯示建立的LAMP具有很高的特異性,并且可以直觀地通過(guò)眼睛觀察沉淀達(dá)到檢測(cè)的結(jié)果。目的菌DNA通過(guò)水煮法即可獲得,避免了購(gòu)買(mǎi)DNA提取試劑盒,進(jìn)一步降低了檢測(cè)成本。
本研究建立的LAMP檢測(cè)具有簡(jiǎn)便、省時(shí)、特異性高、靈敏度好、判斷結(jié)果簡(jiǎn)便、成本低等優(yōu)點(diǎn),有利于在基層進(jìn)行推廣應(yīng)用。通過(guò)進(jìn)一步的研究摸索,LAMP可成為檢測(cè)海產(chǎn)品安全的一種常規(guī)方法。
[1]Han F F,Wang F,Ge B. Detecting potentially virulentVibrio vulnificusstrains in raw oysters by quantitative loop-mediated isothermal amplification[J]. Appl Environ Microbiol, 2011, 77(8): 2589-2595.
[2]Surasilp T, Longyant S, Rukpratanporn S,et al. Rapid and sensitive detection ofVibrio vulnificusby loop-mediated isothermal amplification combined with lateral flow dipstick targeted torpoSgene[J]. Mol Cell Probes, 2011,25(4): 158-163.
[3]Han F F,Ge B. Quantitative detection ofVibrio vulnificusin raw oysters by real-time loop-mediated isothermal amplification[J]. Int J Food Microbiol, 2010, 142(1-2):60-66.
[4]Ren C H,Hu C Q,Luo P,et al. Sensitive and rapid identification ofVibrio vulnificusby loop-mediated isothermal amplification[J]. Microbiol Res, 2008, 164(5):514-521.
[5]Han F F,Ge B. Evaluation of a loop-mediated isothermal amplification assay for detectingVibrio vulnificusin raw oysters[J]. Foodborne Pathog Dis, 2008, 5(3): 311-320.
[6]Nemoto J,Kojima T, Kusaba K,et al. Rapid detection ofVibrio vulnificususing a loop-mediated isothermal amplification method[J]. Kansenshogaku Zasshi, 2008,82(5): 407-413.
[7]Fall J, Chakraborty G, Kono T,et al. Establishment of loop-mediated isothermal amplification method (LAMP)for the detection ofVibrionigripulchritudoin shrimp[J].FEMS Microbiol Lett, 2008, 288(2): 171-177.
[8]孫敏. 創(chuàng)傷弧菌LAMP檢測(cè)方法的建立6[A]//中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì). 動(dòng)物檢疫學(xué)分會(huì)2010年學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C]. 中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì), 2010, 5: 12-17.
[9]徐義剛, 李蘇龍, 楊君宏, 等. 水產(chǎn)品中創(chuàng)傷弧菌DNA環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增快速檢測(cè)方法的建立及初步應(yīng)用[J]. 中國(guó)生物工程雜志, 2010(6): 96-102.
[10]張靜, 施慧, 謝建軍, 等. 利用LAMP法快速檢測(cè)致病性哈維氏弧菌[J]. 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào), 2010, 19(5): 601-607.
[11]王耀煥, 王瑞娜, 周前進(jìn), 等. 環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增聯(lián)合橫向流動(dòng)試紙條快速檢測(cè)創(chuàng)傷弧菌檢測(cè)方法的建立[J]. 生物技術(shù)通報(bào), 2014(6): 81-87.
[12]薛超波, 許鎮(zhèn)堅(jiān), 黃朱梁, 等. 環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)檢測(cè)創(chuàng)傷弧菌方法的建立與應(yīng)用[J]. 食品科學(xué), 2012, 33(20):262-264.
[13]李桂滿, 侯敏, 顏軍, 等. 環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)檢測(cè)副溶血性弧菌的優(yōu)勢(shì)[J]. 職業(yè)與健康, 2013, 29(5): 573-574+579.
[14]薛超波, 黃朱梁, 孫瑛, 等. 海產(chǎn)品中創(chuàng)傷弧菌實(shí)時(shí)濁度LAMP檢測(cè)方法的建立[J]. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào), 2013,35(11): 912-915.
[15]張麗娜, 王明義, 楊小蕾, 等. 海洋創(chuàng)傷弧菌LAMP快速診斷方法的建立與評(píng)價(jià)[J]. 國(guó)際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志, 2016,37(5): 577-579+582.
[16]周順, 高志鑫, 張敏. 創(chuàng)傷弧菌和副溶血弧菌雙重LAMP檢測(cè)方法的建立及初步應(yīng)用[J]. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào), 2016,36(11): 1875-1881.
[17]S Zhou,Z X Gao, M Zhang,et al. Development of a quadruplex loop-mediated isothermal amplification assay for field detection of four Vibrio species associated with fish disease[J]. Springer Plus, 2016, 5(1): 1104.
[18]Zhou Q J,Wang L, Chen J,et al. Development and evaluation of a real-time fluorogenic loop-mediated isothermal amplification assay integrated on a microfluidic disc chip (on-chip LAMP) for rapid and simultaneous detection of ten pathogenic bacteria in aquatic animals[J]. J Microbiol Methods, 2014, 104: 26-35.
[19]Jones J L,Hara-Kudo Y, Krantz J A,et al. Comparison of molecular detection methods forVibrio parahaemolyticusandVibrio vulnificus[J]. Food Microbiol, 2012, 30(1):105-111.
ESTABLISHMENT OF LOOP MEDIATED ISOTHERMAL AMPLIFICATION FOR DETECTION OF TWO VIRULENT GENES OF VIBRIO VULNIFICUS
BIE Chuang-nan1, WANG Quan2, BAI Xue-rui2, LING Jiao2, LI Gong-he1, JIANG Wei2
(1.Guangxi University,Nanning530005, China; 2.Shanghai Veterinary Research Institute, CAAS, Shanghai 200241,China)
In the present study, we developed and validated a loop-mediated isothermal ampli fi cation (LAMP) assay for detection of two toxins genes of Vibrio vulnif i cus. The inner and outer primers of LAMP were designed based on the conserved sequences of V. vulnif i cus hemolysin gene A (HA) and repeats-in-toxin (RTX) virulent gene. The detection method was preliminary evaluated by formation of the white deposition and con fi rmed through agarose gel electrophoresis. The sensitivity of this detection method was 10 CFU/mL for two LAMP genes of V. vulnif i cus. This method showed good speci fi city to V. vulnif i cus as it did not react with any other bacterial species. The bacterial DNA was extracted by water-boiling method and it took 1.5 h from sample processing to obtaining results. The detection limits were 102CFU/g for RTX and 104CFU/g for HA. On the contrast, the detection limit of common PCR method was 103CFU/g for RTX and 104CFU/g for HA and it took 4 h to complete test. This LAMP method may be used for on-site diagnostics of V. vulnif i cus in the food and agricultural industries.
Loop-mediated isothermal ampli fi cation; hemolysin gene A; repeats-in-toxin; Vibrio vulnif i cus
S852.613
A
1674-6422(2017)06-0048-07
2017-04-11
上海市科學(xué)技術(shù)委員會(huì)科研計(jì)劃項(xiàng)目(17140900400)
別闖男,男,碩士,主要從事病原微生物的防控技術(shù)研究
蔣蔚,E-mail:jiangwei@shvri.ac.cn;李恭賀,E-mail:ligonghe@163.com