靳松 黃愛(ài)軍 林昆 彭建強(qiáng) 李亞杰 鄒學(xué)農(nóng)
骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞(MSC)是一類來(lái)源于骨髓的具有多向分化潛能的干細(xì)胞,具有自我更新、組織再生和抗炎修復(fù)等功能。研究表明,MSC經(jīng)誘導(dǎo)分化后性別決定區(qū)Y框蛋白9(Sox9)、Ⅱ型膠原及缺氧誘導(dǎo)因子-1α(HIF-1α)的表達(dá)水平上調(diào),提示其具有轉(zhuǎn)化為類髓核細(xì)胞的潛能[1]。MSC移植修復(fù)椎間盤(pán)退變疾病的重要機(jī)制是,在椎間盤(pán)微環(huán)境中MSC向類髓核細(xì)胞分化并增加基質(zhì)大分子的合成。MSC來(lái)源廣泛、體外培養(yǎng)可誘導(dǎo)類髓核細(xì)胞分化,是一種非常有前景的可應(yīng)用于臨床治療椎間盤(pán)退變疾病的種子細(xì)胞。微小RNA(miR)是一類含有18~24個(gè)核苷酸的非編碼RNA,通過(guò)與靶基因mRNA 3’端非翻譯區(qū)(3’UTR)的互補(bǔ)序列以堿基配對(duì)方式執(zhí)行降解靶基因或抑制其翻譯的功能,參與調(diào)控MSC分化過(guò)程中的多種生物學(xué)過(guò)程[2-4]。本研究通過(guò)在線軟件預(yù)測(cè)miR-124的靶基因,發(fā)現(xiàn)活化T細(xì)胞核因子c1(NFATc1)是其中一個(gè)潛在靶點(diǎn)。NFAT家族是一類具有廣泛生理功能的轉(zhuǎn)錄因子,在成軟骨分化過(guò)程中,NFATc1能促進(jìn)軟骨基因表達(dá)[5]。NFATc1廣泛參與MSC生長(zhǎng)、分化的生物學(xué)過(guò)程,特別是在成軟骨過(guò)程中有基因調(diào)控的功能[6]。由此推測(cè),miR-124可能通過(guò)靶向調(diào)控NFATc1表達(dá)促進(jìn)人MSC向軟骨細(xì)胞分化。本研究采用成軟骨分化誘導(dǎo)培養(yǎng)體系誘導(dǎo)C3H10T1/2細(xì)胞向成軟骨細(xì)胞分化,并探究miR-124在此過(guò)程是否通過(guò)調(diào)控NFATc1靶基因發(fā)揮生物學(xué)作用。
間充質(zhì)干細(xì)胞株C3H10T1/2細(xì)胞系(中山大學(xué)骨科研究所提供);高糖型DMEM培養(yǎng)基、10%胎牛血清購(gòu)自美國(guó)HyClone公司;谷氨酰胺購(gòu)自美國(guó)Gibco公司;胰酶、0.02%乙二胺四乙酸(EDTA)、抗壞血酸、青霉素鏈霉素雙抗、β-甘油磷酸鈉、地塞米松購(gòu)自美國(guó)Sigma公司; pmiR-RB-REPORTTM質(zhì)粒載體、ribo FECTTMCP轉(zhuǎn)染試劑盒購(gòu)自廣州銳博生物科技有限公司;LipofectamineTM2000轉(zhuǎn)染試劑盒及Trizol購(gòu)于美國(guó)Invitrogen公司。Spe I、Hind Ⅲ、T4 DNA連接酶和SYBR Premix ExTaqTM定量PCR試劑均為大連寶生物公司產(chǎn)品。實(shí)時(shí)定量PCR miR檢測(cè)試劑盒購(gòu)自廣州天根生物公司。miR-124模擬物(mimics)及抑制物(inhibitors)為美國(guó)Ambion公司產(chǎn)品。定點(diǎn)突變?cè)噭┖匈?gòu)自美國(guó)Stratagene公司。雙熒光素酶活性檢測(cè)試劑盒購(gòu)自美國(guó)Promega公司。Smad4抗體和GAPDH抗體購(gòu)自美國(guó)CST公司。NFATc1小干擾RNA(siRNA)由美國(guó)Invitorgen公司合成,引物合成及測(cè)序由深圳達(dá)生生物科技公司完成。
1.細(xì)胞培養(yǎng)與軟骨誘導(dǎo)分化
以離心法進(jìn)行軟骨微團(tuán)的構(gòu)建,具體操作步驟參照文獻(xiàn)[7]進(jìn)行。小鼠C3H10T1/2細(xì)胞株經(jīng)復(fù)蘇后室溫離心收集沉淀,用含10%胎牛血清的高糖型DMEM培養(yǎng)液混懸于37℃、5%CO2靜置培養(yǎng),待細(xì)胞融合至80%~90%,在胰酶消化下進(jìn)行傳代,每3 d更換培養(yǎng)液1次。將培養(yǎng)的C3H10T1/2細(xì)胞分為對(duì)照組與成軟骨誘導(dǎo)組,分別加入含2%胎牛血清的DMEM和軟骨誘導(dǎo)液誘導(dǎo)培養(yǎng)。每3 d換液1 次,于第0、7、10、14日收集細(xì)胞微球進(jìn)行基因表達(dá)檢測(cè)。
2.雙熒光素酶報(bào)告基因構(gòu)建及檢測(cè)
使用在線靶基因預(yù)測(cè)軟件(PicTar、TargetScan、miRanda、miRDB),預(yù)測(cè)NFATc1 mRNA的3’UTR上173~185 nt為miR-124的結(jié)合位點(diǎn)(GCACTTT)。人工合成NFATc1 mRNA 3’UTR 區(qū)的靶點(diǎn)野生型序列(Wt)以及定點(diǎn)突變的突變序列(Mut, GCACTTT→CGTGAAA); XhoⅠ及NotⅠ雙酶切pmiR-RB-REPORTTM 質(zhì)粒,再將Wt和Mut基因片段分別克隆到酶切后的pmiR-RBREPORTTM載體中,構(gòu)建重組質(zhì)粒pNFATc1-Wt或pNFATc1-Mut;基因測(cè)序確認(rèn)重組質(zhì)粒載體構(gòu)建成功。按照試劑盒說(shuō)明書(shū)突變NFATc1 3’UTR上miR-124結(jié)合位點(diǎn),構(gòu)建突變型pGL3-Mut-NFATc1真核表達(dá)載體。
取培養(yǎng)的C3H10T1/2細(xì)胞,根據(jù)轉(zhuǎn)染質(zhì)粒的不同分為4組:①pNFATc1-Wt質(zhì)粒對(duì)照組,為轉(zhuǎn)染pNFATc1-Wt質(zhì)粒及miR-124 mimics對(duì)照;②pNFATc1-Wt質(zhì)粒實(shí)驗(yàn)組,為轉(zhuǎn)染pNFATc1-Wt質(zhì)粒和miR-124 inhibitors;③pNFATc1-Mut質(zhì)粒對(duì)照組,為轉(zhuǎn)染pNFATc1-Mut質(zhì)粒與miR-124 mimics對(duì)照;④pNFATc1-Mut質(zhì)粒實(shí)驗(yàn)組,為轉(zhuǎn)染pNFATc1-Mut質(zhì)粒與miR-124 inhibitors。各組轉(zhuǎn)染24 h后收集細(xì)胞,用雙熒光素酶報(bào)告基因系統(tǒng)檢測(cè)各組細(xì)胞的熒光素酶活性。每組實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次,結(jié)果取平均值。另外,將NFATc1的3’UTR用XhoI/NotI點(diǎn)雙酶切,插入到psiCHECKTM-2質(zhì)粒中復(fù)制,與此相關(guān)的NFATc1 3’UTR片段被融合到熒光素酶中,并被轉(zhuǎn)移到C3H10T1/2細(xì)胞,根據(jù)轉(zhuǎn)染質(zhì)粒分為不轉(zhuǎn)染對(duì)照組(空白對(duì)照組)、miR-124 mimics組、miR-124 inhibitors組、pNFATc1-Wt質(zhì)?;騪NFATc1-Mut組(正常對(duì)照組)、pNFATc1-Wt質(zhì)?;騪NFATc1-Mut質(zhì)粒加miR-124 inhibitors組(正常對(duì)照inhibitors組),分析miR-124對(duì)NFATc1熒光素酶活性的影響。
3.實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè)
在成軟骨誘導(dǎo)分化第0、7、10、14日收集C3H10T1/2細(xì)胞微球,按RNA提取試劑盒說(shuō)明書(shū)提取總RNA,并檢測(cè)總RNA的含量及純度,再按照逆轉(zhuǎn)錄試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄,合成模板DNA第一鏈,實(shí)時(shí)定量PCR擴(kuò)增目的基因,引物序列見(jiàn)表1。反應(yīng)條件為95℃10 min,95℃15 s,60℃ 30 s,72℃ 20 s,40個(gè)循環(huán),內(nèi)參為18 s。一步加A法逆轉(zhuǎn)錄miR,反應(yīng)條件為95℃ 30 s,95℃ 3 s,60℃ 30 s,40個(gè)循環(huán),內(nèi)參為U6。上下游引物序列分別為5’-CTCGCTTCGGCAGCACA-3’和5’-AACGCTTCACGAATTTGCGT-3’,使用2-ΔΔCt法計(jì)算基因相對(duì)表達(dá)量。每組實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次,結(jié)果取平均值。記錄軟骨分化的相關(guān)標(biāo)志基因Aggrecan、Ⅱ型膠原蛋白(Col2a1)和Ⅹ型膠原蛋白(Col10a1)及Sox9 mRNA表達(dá)水平。另外,取成軟骨誘導(dǎo)7 d的C3H10T1/2細(xì)胞轉(zhuǎn)染pNFATc1-Wt質(zhì)粒(Control組)、pNFATc1-Wt質(zhì)粒及miR-124 mimics(miR-124組)、經(jīng)siRNA干預(yù)的pNFATc1-Wt質(zhì)粒(si-NFATc1組),按前述方法檢測(cè)NFATc1 mRNA表達(dá)水平。此外,取成軟骨誘導(dǎo)7 d的C3H10T1/2細(xì)胞,轉(zhuǎn)染miR-124 mimics和(或)pNFATc1-Wt質(zhì)粒,轉(zhuǎn)染成功后分別加入miR-124 mimics 0、50、100 nmol/L miR-124 mimics或inhibitors培養(yǎng)24 h,用前述同樣方法分析各組NFATc1和miR-124 mRNA表達(dá)水平。
4.蛋白免疫印跡法檢測(cè)
提取各組細(xì)胞的總蛋白,測(cè)定蛋白濃度,加4倍SDS上樣緩沖液8 μl和二硫蘇糖醇2 μl混勻沸水浴5 min后作十二烷基硫酸鈉聚丙烯酰胺SDS-PAGE凝膠電泳電泳,用電轉(zhuǎn)印儀(100 V電壓)電泳將凝膠上的蛋白轉(zhuǎn)印至聚偏氟乙烯(PVDF)膜。將蛋白Marker剪下,避光保存,余下膜用5%脫脂牛奶室溫封閉1 h,TBST緩沖液洗滌3次后,一抗4℃孵育過(guò)夜,TBST緩沖液再次洗滌3次,加入二抗室溫孵育2 h,同前洗滌。按體積比1∶1混合ECL試劑盒中A液和B液,混合液鋪在膜表面,凝膠成像系統(tǒng)曝光,Quantity one軟件分析結(jié)果。
表1 PCR引物序列
成軟骨誘導(dǎo)組中,在成軟骨誘導(dǎo)分化第7、10、14日的軟骨分化相關(guān)基因Aggrecan mRNA表達(dá)水平均逐漸升高(與誘導(dǎo)前比較,t分別為30.274、
46.132、160.752,P均<0.001);Col2a1 mRNA相對(duì)表達(dá)量在第7、10日升高(與誘導(dǎo)前比較,t分別為10.246、67.202、45.311,P均<0.001),第14日稍下降(與誘導(dǎo)前比較,t=53.244、P<0.001;與第10日比較,t=2.376、P>0.05);Col10a1第7、10日增加緩慢(與誘導(dǎo)前比較,P均>0.05),但第14日大幅上調(diào)(與誘導(dǎo)前比較,t=330.784,P<0.001)。軟骨分化后, 軟骨化基因表達(dá)逐漸穩(wěn)步增加,但并未達(dá)到峰值;Sox 9和NFATc1 mRNA表達(dá)水平隨著軟骨分化進(jìn)展而增加(與對(duì)照組0 d及10 d時(shí)比較,t分別為65.266、80.232,P均<0.001),見(jiàn)圖1A~D。蛋白免疫印跡法顯示,成軟骨誘導(dǎo)組Col2a1、Sox 9和NFATc1蛋白呈逐漸增強(qiáng)表達(dá),表明軟骨發(fā)生的進(jìn)展,而肥厚性標(biāo)記Col10a1蛋白顯示較穩(wěn)定表達(dá)(圖1E)。
通過(guò)Targetscan和miRanda等在線軟件分析,發(fā)現(xiàn)NFATc1是miR-124的潛在靶基因之一, NFATc1 mRNA的3’UTR與miR-124的種子區(qū)存在理論上的互補(bǔ)堿基配對(duì)序列(圖2A)。轉(zhuǎn)染NFATc1 Wt質(zhì)粒的對(duì)照組熒光素酶活性低于實(shí)驗(yàn)組(t=3.837,P<0.05);轉(zhuǎn)染NFATc1 Mut質(zhì)粒的實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組間熒光素酶活性比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);轉(zhuǎn)染NFATc1 Wt質(zhì)粒的實(shí)驗(yàn)組NFATc1蛋白表達(dá)水平高于對(duì)照組(圖2B),表明miR-124直接作用于NFATc1。
圖1 C3H10T1/2誘導(dǎo)成軟骨分化的相關(guān)基因表達(dá)水平變化
miR-124組與si-NFATc1組的NFATc1 mRNA表達(dá)水平均低于Control組(LSD-t分別為5.642、4.338,P均<0.01),miR-124組與si-NFATc1組的NFATc1 mRNA表達(dá)水平接近(P>0.05);蛋白免疫印跡檢測(cè)結(jié)果與實(shí)時(shí)定量PCR結(jié)果基本一致(圖2C),表明miR-124能在C3H10T1/2軟骨分化的過(guò)程中靶向調(diào)控NFATc1表達(dá)。
圖2 miR-124 通過(guò)靶向NFATc1促進(jìn)C3H10T1/2細(xì)胞軟骨分化
A:互補(bǔ)堿基配對(duì)序列;B:NFATc1 熒光素酶活性檢測(cè)結(jié)果和NFATc1蛋白表達(dá);C:miR-124抑制NFAc1 mRNA和蛋白表達(dá);與共轉(zhuǎn)染NFATc1 Wt質(zhì)粒的對(duì)照組熒光素酶活性比較,*P<0.01;與Control組比較,#P<0.01
與未加入miR124 mimics相比,100 nmol/L的miR-124 mimics加入C3H10T1/2細(xì)胞后,miR-124 mRNA表達(dá)水平約增加60倍,而NFATc1 mRNA表達(dá)水平約降低60%(圖3A)。當(dāng)100 nmol/L miR-124 inhibitors加入C3H10T1/2細(xì)胞時(shí),與未加入時(shí)相比,miR-124 mRNA表達(dá)水平減少了大約60%,而NFATc1增加了大約1倍(圖3B)。轉(zhuǎn)染NFATc1-Wt質(zhì)粒的miR-124 mimics組NFATc1熒光素酶活性低于其他4組(F=8.256,LSD-t分別為5.436、7.442、3.433、6.282,P均<0.05),轉(zhuǎn)染NFATc1-Mut質(zhì)粒的miR-124 mimics組NFATc1熒光素酶活性與其他4組相近(P均>0.05),表明miR-124可作為NFATc1的抑制劑(圖3C)。
C3H10T1/2細(xì)胞系是一種小鼠胚胎源性間充質(zhì)干細(xì)胞,具有多向分化潛能,轉(zhuǎn)染效率高且穩(wěn)定,易獲得大量轉(zhuǎn)染成功的活細(xì)胞,現(xiàn)已廣泛用于研究MSC分化潛能的實(shí)驗(yàn)中[8]。miR作為一類重要的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控因子,在MSC的分化過(guò)程中參與調(diào)控細(xì)胞的多種生物學(xué)過(guò)程[9-10]。已有研究發(fā)現(xiàn),miR在調(diào)控MSC或前體細(xì)胞成軟骨、成骨及成脂的分化過(guò)程中發(fā)揮重要生物學(xué)功能[11]。miR-124能抑制MSC向軟骨分化[12]。上述研究證實(shí),miR可通過(guò)抑制靶基因的表達(dá)參與MSC分化的調(diào)控。然而其中的分子機(jī)制和調(diào)控的靶基因尚不清楚。本課題組前期實(shí)驗(yàn)首先誘導(dǎo)的C3H10T1/2細(xì)胞向軟骨的定向分化,在此過(guò)程中發(fā)現(xiàn)miR-124表達(dá)逐漸下調(diào),提示其在MSC軟骨分化中可能具有重要的調(diào)控作用;然后通過(guò)生物信息學(xué)分析預(yù)測(cè)出miR-124潛在的其中一個(gè)靶基因NFATc1。本研究亦顯示,軟骨分化后NFATc1和軟骨化相關(guān)基因及蛋白表達(dá)逐漸穩(wěn)步增加。
圖3 干擾NFATc1或過(guò)表達(dá)miR-124時(shí)C3H10T1/2的NFATc1表達(dá)水平變化
與其他4組比較,*P<0.05
本研究將NFATc1 3’-UTR克隆入熒光素酶報(bào)告載體并且與miR-124共轉(zhuǎn)染C3H10T1/2細(xì)胞,結(jié)果顯示miR-124抑制NFATc1 mRNA的3’UTR熒光素酶活性,發(fā)現(xiàn)其特異性與NFATc1 mRNA的3’UTR相結(jié)合。然而在生理狀態(tài)下,靶基因3’UTR序列中的miR結(jié)合位點(diǎn)有可能由于mRNA的構(gòu)象而被掩蓋,導(dǎo)致該miR無(wú)法發(fā)揮抑制靶基因表達(dá)的功能。因此進(jìn)一步檢測(cè)該miR與NFATc1 3’UTR的結(jié)合能力及其對(duì)NFAc1表達(dá)的抑制作用,結(jié)果表明miR-124能抑制軟骨分化過(guò)程中的NFATc1 mRNA及蛋白表達(dá),并且其強(qiáng)度與NFATc1 siRNA干擾NFATc1內(nèi)源性表達(dá)一致,證明了miR-124直接靶向調(diào)控NFATc1表達(dá)。通過(guò)功能研究siRNA干擾NFATc1表達(dá)能抑制MSC的成軟骨化,它能部分模擬miR-124調(diào)控MSC軟骨分化的功能。另外,蛋白免疫印跡檢測(cè)結(jié)果也顯示轉(zhuǎn)染miR-124 mimics后,NFATc1的蛋白相對(duì)表達(dá)量比對(duì)照組明顯下調(diào);相反,轉(zhuǎn)染miR-124 inhibitor后NFATc1的蛋白相對(duì)表達(dá)量與對(duì)照組比較則上調(diào),表明在C3H10T1/2細(xì)胞成骨分化過(guò)程中miR-124通過(guò)調(diào)控靶基因NFATc1介導(dǎo)MSC向軟骨方向分化。
綜上所述,本研究運(yùn)用生物信息學(xué)方法對(duì)miR-124和NFATc1基因的靶向配對(duì)關(guān)系進(jìn)行預(yù)測(cè),發(fā)現(xiàn)兩者靶向配對(duì)良好,采用熒光素酶報(bào)告系統(tǒng)、實(shí)時(shí)定量PCR及蛋白免疫印跡法發(fā)現(xiàn)miR-124可靶向抑制NFATc1的表達(dá)而負(fù)向調(diào)控C3H10T1/2細(xì)胞成軟骨分化。鑒于NFATc1是鈣形成信號(hào)通路中的重要轉(zhuǎn)導(dǎo)因子之一,因此miR-124調(diào)控成軟骨分化的作用機(jī)制可能是通過(guò)抑制NFATc1的表達(dá),因此阻礙其下游信號(hào)通路的激活,進(jìn)而抑制MSC的成軟骨分化。
[1] Almalki SG, Agrawal DK. Key transcription factors in the differentiation of mesenchymal stem cells. Differentiation,2016,92(1-2):41-51.
[3] Zhang Z, Kang Y, Zhang Z, Zhang H, Duan X, Liu J, Li X, Liao W.Expression of microRNAs during chondrogenesis of human adipose-derived stem cells.Osteoarthritis Cartilage,2012,20(12):1638-1646.
[4] 田南南,楊建新,陳曉蘭.miR-10b介導(dǎo)乳腺癌轉(zhuǎn)移的機(jī)制與靶向治療.新醫(yī)學(xué),2013,44(1):8-10.
[5] Lin SS, Tzeng BH, Lee KR, Smith RJ, Campbell KP, Chen CC.Cav3.2 T-type calcium channel is required for the NFAT-dependent Sox9 expression in tracheal cartilage.Proc Natl Acad Sci U S A,2014,111(19):E1990-E1998.
[6] Sitara D, Aliprantis AO.Transcriptional regulation of bone and joint remodeling by NFAT.Immunol Rev,2010,233(1):286-300.
[7] Ray P, Chapman SC.Cytoskeletal reorganization drives mesenchymal condensation and regulates downstream molecular signaling.PLoS One,2015,10(8):e0134702.
[8] Zou F, Xu JC, Wu GH, Zhou LL, Wa QD, Peng JQ, Zou XN.Effects of oncostatin M on cell proliferation and osteogenic differentiation in C3H10T1/2.J Musculoskelet Neuronal Interact,2016,16(4):377-385.
[9] Zhou X, Wang J, Sun H, Qi Y, Xu W, Luo D, Jin X, Li C, Chen W, Lin Z, Li F, Zhang R, Li G.MicroRNA-99a regulates early chondrogenic differentiation of rat mesenchymal stem cells by targeting the BMPR2 gene.Cell Tissue Res,2016,366(1):143-153.
[10] Hou C, Yang Z, Kang Y, Zhang Z, Fu M, He A, Zhang Z, Liao W.MiR-193b regulates early chondrogenesis by inhibiting the TGF-beta2 signaling pathway.FEBS Lett,2015,589(9):1040-1047.
[11] Laine SK, Alm JJ, Virtanen SP, Aro HT, Laitala-Leinonen TK.MicroRNAs miR-96, miR-124, and miR-199a regulate gene expression in human bone marrow-derived mesenchymal stem cells.J Cell Biochem,2012,113(8):2687-2695.
[12] Mondanizadeh M, Arefian E, Mosayebi G, Saidijam M, Khansarinejad B, Hashemi SM.MicroRNA-124 regulates neuronal differentiation of mesenchymal stem cells by targeting Sp1mRNA.J Cell Biochem,2015,116(6):943-953.