国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

巴西橡膠樹6個(gè)PP2C家族基因成員分子信息學(xué)與抗旱功能分析

2017-11-10 01:47:18李曉娜肖厚貞陸燕茜
植物研究 2017年5期
關(guān)鍵詞:亞族芽接橡膠樹

張 冬 李曉娜 肖厚貞 陸燕茜 張 宇* 王 萌

(1.海南省熱帶生物資源可持續(xù)利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,海南大學(xué)熱帶農(nóng)林學(xué)院,???570228; 2.中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技信息研究所,???570228; 3.海南大學(xué)材料與化工學(xué)院,海口 570228)

巴西橡膠樹6個(gè)PP2C家族基因成員分子信息學(xué)與抗旱功能分析

張 冬1李曉娜2肖厚貞3陸燕茜1張 宇1*王 萌1

(1.海南省熱帶生物資源可持續(xù)利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,海南大學(xué)熱帶農(nóng)林學(xué)院,海口 570228;2.中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技信息研究所,???570228;3.海南大學(xué)材料與化工學(xué)院,???570228)

PP2C是一類絲氨酸/蘇氨酸殘基蛋白磷酸酶,在高等植物ABA信號(hào)途徑中起著重要的作用。為闡明巴西橡膠樹中PP2C基因的結(jié)構(gòu)與功能,本研究通過生物信息學(xué)方法,從橡膠樹轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中鑒定并獲得6個(gè)PP2C家族基因,均含有PP2CD、F1和F2亞族。通過qRT-PCR技術(shù)對(duì)6個(gè)PP2C家族基因進(jìn)行了干旱處理下的差異表達(dá)分析,發(fā)現(xiàn)6個(gè)基因都不同程度上響應(yīng)橡膠樹干旱脅迫。本研究為探究PP2C基因在橡膠樹抗干旱反應(yīng)機(jī)制提供了理論依據(jù)。

巴西橡膠樹;PP2C基因;生物信息學(xué);表達(dá)分析;干旱

巴西橡膠樹(HeveabrasiliensisMull.Arg.)原產(chǎn)于亞馬遜森林,是一種優(yōu)質(zhì)天然橡膠資源。作為“工業(yè)原料和戰(zhàn)略物資”[1],天然橡膠在國(guó)民經(jīng)濟(jì)發(fā)展中起重要作用。在中國(guó),巴西橡膠樹主要栽植于海南等地,自海南省種植橡膠樹以來,承擔(dān)生產(chǎn)天然橡膠的主要任務(wù),為中國(guó)的經(jīng)濟(jì)建設(shè)和社會(huì)發(fā)展作出顯著貢獻(xiàn)[2]。但是長(zhǎng)期的適應(yīng)過程使其形成了怕強(qiáng)風(fēng)干旱和低溫的生長(zhǎng)習(xí)性,每年11月至次年4月為海南的旱季,即使是雨季,因降水時(shí)空分布不均,也會(huì)導(dǎo)致夏旱和秋旱,一些年份甚至全年干旱[3~4]。干旱是限制我國(guó)橡膠發(fā)展的主要原因之一,大量的實(shí)驗(yàn)表明,干旱脅迫抑制橡膠樹可溶性蛋白合成和光合生理[5],導(dǎo)致次生根數(shù)量減少。當(dāng)植膠區(qū)面臨干旱威脅時(shí),橡膠樹葉片形態(tài)結(jié)構(gòu)發(fā)生變化,膠樹生長(zhǎng)遲緩[6],膠產(chǎn)量下降[7],引發(fā)死皮病蟲害,嚴(yán)重時(shí)致死[8]。干旱對(duì)我國(guó)的天然橡膠產(chǎn)業(yè)發(fā)展有著巨大的威脅,影響宏觀經(jīng)濟(jì),所以,研究橡膠樹抗旱機(jī)制對(duì)橡膠產(chǎn)業(yè)以及經(jīng)濟(jì)發(fā)展意義重大。然而橡膠樹干旱脅迫的應(yīng)答機(jī)制尚不清楚,目前已在擬南芥[9]、番茄[10]、黃花蒿[11]和玉米[12]等植物中發(fā)現(xiàn)了PP2C基因響應(yīng)干旱脅迫,筆者推測(cè)PP2C基因在橡膠樹抗旱過程中也存在作用。

PP2C(PP2C-typeproteinphosphatase)是一類單體絲氨酸/蘇氨酸殘基蛋白磷酸酶[13~14],其活性依賴于Mg2+或Mn2+等離子,進(jìn)化保守[15],廣泛存在于古細(xì)菌、細(xì)菌、真菌、植物和動(dòng)物中[16]。相較于其他生物,植物中PP2C類蛋白數(shù)量最大[17]。大部分植物PP2C蛋白包含3個(gè)基序,1個(gè)具有保守催化結(jié)構(gòu)域的C末端,1個(gè)具有功能各異的膜定位信號(hào)序列延伸區(qū)的N端,還有1個(gè)類似受體激酶互作結(jié)構(gòu)域[18]。研究發(fā)現(xiàn),擬南芥中有80個(gè)PP2C基因,水稻中90個(gè)[9],二穗短柄草中86個(gè)[16]。擬南芥的80個(gè)PP2C候選基因被分為13個(gè)亞類:A-D、Ea、Eb、F1、F2、G-J亞族[9]。其中,A亞族調(diào)控脫落酸(abscisic acid,ABA)信號(hào)途徑,胡楊PeHAB1基因[19]、擬南芥ABI1,ABI2和AtPP2CA基因?qū)儆贏亞族[20],是ABA信號(hào)途徑中的調(diào)控基因[21~22],ABA誘導(dǎo)PYL-PP2C相互作用,激活SnRK2蛋白激酶,從而調(diào)控下游轉(zhuǎn)錄因子促使基因表達(dá)。B亞族在蛋白激酶MAPK途徑起作用,擬南芥中B亞族PP2C基因AP2C1,在病原體應(yīng)激、受到機(jī)械傷害后,影響MPK4或MPK6基因,抑制MAPK活性[23]。苜蓿中B亞族PP2C(MP2C)受逆境脅迫誘導(dǎo),是MAPK途徑中的負(fù)調(diào)控因子[24~25]。C亞族與花器官發(fā)育有關(guān)[26],而關(guān)于PP2C基因其他亞族的研究并不多。

本研究利用生物信息學(xué)和分子生物學(xué)手段,鑒定橡膠樹6個(gè)PP2C家族基因,并分析其在干旱處理下的差異表達(dá),以期為探究PP2C家族基因參與干旱脅迫分子機(jī)制提供理論依據(jù),為培育抗旱橡膠樹品種提供候選基因。

1 材料與方法

1.1 材料與處理

巴西橡膠樹(HeveabrasiliensisMull.Arg)品種‘熱研7-33-97’芽接苗由海南大學(xué)熱帶農(nóng)林學(xué)院儋州校區(qū)種植基地提供。

選取兩組長(zhǎng)勢(shì)一致的同齡橡膠芽接苗,一組對(duì)照,一組實(shí)驗(yàn),每組3個(gè)重復(fù)。干旱處理采用方法如下:對(duì)兩組苗持續(xù)10 d飽和澆水后,實(shí)驗(yàn)組做斷水處理,對(duì)照組正常澆水,持續(xù)觀測(cè)橡膠樹表型變化直至葉片干枯,在第0、1、3、6、9 d采取同一時(shí)段的實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組橡膠芽接苗葉片,所有采集的樣品迅速保存于液氮中備用。

1.2 巴西橡膠樹生物信息學(xué)分析

1.2.1 巴西橡膠樹6個(gè)PP2C基因家族成員的鑒定

PP2C基因家族成員序列來源于橡膠樹轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫。使用NCBI ORF Finder(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html)看基因的開放閱讀框(ORF)是否完整,預(yù)測(cè)基因的氨基酸序列。利用SWTSS-PROT數(shù)據(jù)庫中ExPASyProteomics Sever(http://expasy.org/)對(duì)PP2C蛋白氨基酸序列進(jìn)行分子量、等電點(diǎn)的預(yù)測(cè);通過NCBI Conserved Domains數(shù)據(jù)庫(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi)和Pfam database(http://pfam.xfam.org/)在線分析其保守結(jié)構(gòu)域。在MEME的Multiple Em for Motif Elicitation(http://meme-suite.org/)分析保守元件。NCBI在線BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)分析HbPP2Cs與其他物種間的相似序列。通過DNAman 6.0軟件分析了橡膠樹與其他物種的PP2C氨基酸序列。

1.2.2 巴西橡膠樹6個(gè)PP2C基因家族成員分類

從擬南芥信息資源(TAIR)數(shù)據(jù)庫(http://www.arabidopsis.org/)下載擬南芥全序列,導(dǎo)入本地PowerBlast,對(duì)比找出橡膠樹PP2C基因同源性最高的擬南芥基因;利用NCBI Basic Local Alignment Search Tool(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)找出與橡膠樹PP2C基因同源性最高的水稻(OryzasativaL.)基因,分析比對(duì)它們的氨基酸序列。ClustalX(1.83)程序多重序列比對(duì)擬南芥、水稻PP2C基因和橡膠樹6個(gè)PP2C基因,對(duì)比結(jié)果利用軟件MEGA6構(gòu)建鄰接法(Neighbor-Joining,NJ)進(jìn)化樹,bootstrap值設(shè)置為1 000。

1.3 實(shí)驗(yàn)方法

1.3.1 總RNA提取和cDNA合成

用天根的多糖多酚植物總RNA提取試劑盒提取橡膠芽接苗葉片總RNA,Thermo公司的RevertAidTM第一鏈cDNA合成試劑盒進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄。

1.3.2 實(shí)時(shí)熒光定量qRT-PCR分析

使用Primer 6.0設(shè)計(jì)6個(gè)PP2C基因?qū)崟r(shí)熒光定量PCR的特異性引物,以巴西橡膠樹Actin為內(nèi)參基因,分析各基因相對(duì)表達(dá)量。設(shè)計(jì)的引物見表1。

表1橡膠樹6個(gè)PP2C基因qRT-PCR引物序列

Table1PrimerssequenceofsixPP2CgenesinRubbertreeforqRT-PCR

基因名稱Genename正向引物Forwardprimer反向引物ReverseprimerHbPP2C7GATAAGGCACTCGTCTTCTTCAATGTCAAGGTCCATAGGTHbPP2C10GACATACAAGACACCATCATAGGACACCAGGATAACGATAGTHbPP2C11AACCTCCAGCATCTTCAATCCTAGAGTGGTAGCCAGTAGAHbPP2C16TTCCGCAACTGACAATACTCCGATGAGGCTGTTACTGHbPP2C42CTCTTGTGTCTGAGTTATGGACTGAATAGCAGCAATGTCTCHbPP2C46CCTCTACATTGCTAACCTTGGCCACATTATGCTCTGATGHbACTINGATGTGGATATCAGGAAGGACATACTGCTTGGAGCAAGA

1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析

基因表達(dá)的數(shù)據(jù)是3次生物重復(fù)和3次技術(shù)重復(fù)的平均值±標(biāo)準(zhǔn)誤差。利用SAS 9.1.3軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,單因素方差分析和Duncan檢驗(yàn)分析不同處理之間的差異顯著性。使用Origin2015和Adobe Photoshop CS5繪圖。

2 結(jié)果與分析

2.1 巴西橡膠樹6個(gè)PP2C基因的生物信息學(xué)分析

利用生物信息學(xué)方法,從橡膠樹轉(zhuǎn)錄組中鑒定獲得6個(gè)具有完整ORF的候選PP2C基因家族成員,分別是CL10879.Contig2、CL224.Contig3、CL4996.Contig1、CL10902.Contig1、CL2659.Contig3和CL10104.Contig2。根據(jù)與擬南芥同源性將橡膠樹6個(gè)PP2C基因分別命名為HbPP2C7、HbPP2C10-11、HbPP2C16、HbPP2C42和HbPP2C46。NCBI Consered Domains和Pfam database的分析結(jié)果顯示,6個(gè)橡膠樹PP2C家族基因均含有PP2C保守結(jié)構(gòu)域(圖2B)。利用ExPASy在線分析得出,這6個(gè)HbPP2C基因家族成員中,蛋白質(zhì)編碼最長(zhǎng)的545 aa,最短的241 aa,等電位范圍從4.71~8.7(表2)。

表2 橡膠樹6個(gè)PP2C家族基因信息

使用NCBI的在線BLAST分析核酸序列得出,HbPP2C7與蓖麻(RicinuscommunisL.,XM_002514049.2)相似性83%,麻風(fēng)樹(JatrophacurcasL.,XM_012221592.1)相似性86%;HbPP2C10與麻風(fēng)樹XM_012212487.1相似性81%,蓖麻XM_002513878.2相似性86%;HbPP2C11與麻風(fēng)樹XM_012210755.1相似性90%,蓖麻XM_015719900.1相似性89%;HbPP2C16與蓖麻XM_002521322.2相似性83%,麻風(fēng)樹XM_012213539.1相似性88%;HbPP2C42與麻風(fēng)樹XM_012228710.1相似性86%,蓖麻XM_015719271.1相似性83%;HbPP2C46與蓖麻XM_015726275.1相似性89%,麻風(fēng)樹XM_012233075.1相似性89%。橡膠樹PP2C基因與蓖麻和麻風(fēng)樹等物種的相似性較高。將橡膠樹6個(gè)PP2C基因的氨基酸序列與水稻、擬南芥、蓖麻和麻風(fēng)樹中部分PP2C基因?qū)Ρ?圖1),發(fā)現(xiàn)PP2C家族成員絕大多數(shù)含有高度保守的PP2C結(jié)構(gòu)域,證明6個(gè)HbPP2C基因是PP2C基因家族成員。

圖1 橡膠樹PP2C基因與其他植物PP2C基因蛋白序列多重比對(duì)Fig.1 Multiple protein sequence alignment of Rubber tree PP2Cs with other PP2C proteins

圖2 6個(gè)橡膠樹PP2C基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹(A)、保守結(jié)構(gòu)域(B)和保守元件(C)分析Fig.2 Phylogenetic tree(A),conserved domains(B) and conserved motifs(C) of 6 Rubber tree PP2Cs

圖3 6個(gè)橡膠樹PP2C基因的保守元件模型Fig.3 The conserved motif logoof the 6 Rubber tree PP2Cs

2.2巴西橡膠樹6個(gè)PP2C基因的系統(tǒng)進(jìn)化分析與分類

為探究6個(gè)橡膠樹PP2C基因蛋白系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系,本研究構(gòu)建了6個(gè)橡膠樹PP2C基因的系統(tǒng)進(jìn)化發(fā)育樹(圖2A),6個(gè)PP2C基因在進(jìn)化發(fā)育樹中形成3個(gè)分支。為了進(jìn)一步確定橡膠樹PP2C基因基因間的關(guān)系,用MEME軟件構(gòu)建了保守元件結(jié)構(gòu)圖(圖2C)。可看出6個(gè)PP2C基因具有11個(gè)保守元件,這導(dǎo)致功能的多樣性。盡管橡膠樹PP2C基因的蛋白長(zhǎng)度有241~545個(gè)氨基酸,但MEME保守元件結(jié)構(gòu)圖表明,聚類在一起的橡膠樹PP2C基因擁有相同蛋白基序位置。同時(shí),從橡膠樹PP2C基因的保守元件模型(圖3)可看出,橡膠樹PP2C基因的進(jìn)化是保守的。

將巴西橡膠樹6個(gè)PP2C基因在NCBI在線BLAST,同時(shí)與擬南芥全序列進(jìn)行本地PowerBlast,結(jié)果表明,HbPP2Cs分別與擬南芥中的AtPP2C10、16、79、11、42、7同源性最高,與水稻中的OsPP2C41、6、60、10、60、6同源性最高。將HbPP2Cs與擬南芥和水稻中同源性最高的基因進(jìn)行進(jìn)化樹構(gòu)建,根據(jù)擬南芥和水稻PP2C基因的分類,HbPP2Cs可被分為4個(gè)亞族:A、D、F1、F2亞族(圖4)。HbPP2C7和HbPP2C16屬于A亞族,HbPP2C42和HbPP2C46屬于D亞族,HbPP2C10屬于F1亞族,HbPP2C11屬于F2亞族。

2.3巴西橡膠樹6個(gè)PP2C基因在干旱處理下的表達(dá)分析

干旱處理橡膠樹芽接苗后,葉片表型變化如圖5。橡膠樹芽接苗在第6 d時(shí)表現(xiàn)出受害癥狀,葉片變黃;在干旱處理第9 d時(shí),葉片完全枯萎。所以,本研究取對(duì)照組與干旱處理下0、1、3、6和9 d的橡膠樹芽接苗葉片,分析巴西橡膠樹6個(gè)PP2C基因在干旱處理下的表達(dá)量變化情況。

圖4 巴西橡膠樹、擬南芥和水稻PP2C基因進(jìn)化關(guān)系Fig.4 Phylogenetic relationship of Hevea brasiliensis,Arabidopsis and Oryza sativa PP2C genes

圖5 干旱對(duì)橡膠樹葉片影響的表型圖Fig.5 The phenotypic map of rubber tree after non-irrigation treatment

圖6 橡膠樹葉片中HbPP2Cs基因在干旱條件下的表達(dá)分析Fig.6 Expression analysis of HbPP2Cs in H.brasiliensis leaves after non-irrigation treatment

巴西橡膠樹芽接苗葉片在干旱處理下表達(dá)量變化情況如圖6,巴西橡膠樹6個(gè)PP2C基因在干旱處理1~3 d下調(diào),第6 d時(shí)上調(diào)。HbPP2C7是PP2C家族A亞族基因,在干旱處理6 d后的表達(dá)較顯著,干旱處理9 d時(shí)顯著上調(diào)表達(dá),是對(duì)照處理的12倍,而其他五個(gè)基因均呈下調(diào)表達(dá),HbPP2C10、11、16下調(diào)表達(dá)較顯著。橡膠樹6個(gè)PP2C基因在干旱處理6 d時(shí)都顯著上調(diào),其表達(dá)量變化情況說明這6個(gè)基因都不同程度地參與了橡膠樹干旱脅迫響應(yīng)機(jī)制。由此說明,HbPP2Cs是橡膠樹干旱脅迫應(yīng)答的較為關(guān)鍵的上游基因。

3 討論

本研究在橡膠樹轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中找出并鑒定了6個(gè)具有完整ORF的PP2C基因家族成員,分析蛋白質(zhì)序列得出,PP2C蛋白C端含有保守的蛋白磷酸酶,橡膠樹6個(gè)PP2C基因家族成員都有PP2C保守結(jié)構(gòu)域。分析其保守域模型發(fā)現(xiàn),橡膠樹6個(gè)PP2C基因有相對(duì)較高的保守性。將橡膠樹6個(gè)PP2C基因在線BLAST分析發(fā)現(xiàn),橡膠樹PP2C基因與蓖麻、麻風(fēng)樹同源性較高。將橡膠樹6個(gè)PP2C基因聚類分析,形成3個(gè)分支,在分析保守元件時(shí)發(fā)現(xiàn)橡膠樹這各個(gè)分支下的基因具有相同的蛋白基序結(jié)構(gòu)和位置,而不同分支的PP2C基因保守元件差異顯著。說明PP2C基因家族種類繁多,結(jié)構(gòu)特征、理化性質(zhì)較特殊,橡膠樹中PP2C基因具有多樣性。使用本地PowerBlast對(duì)橡膠樹、水稻和擬南芥進(jìn)行PP2C基因同源性分析,找出水稻和擬南芥中與橡膠樹同源性最高的PP2C基因,與橡膠樹6個(gè)PP2C基因進(jìn)一步構(gòu)建進(jìn)化樹。根據(jù)擬南芥和水稻中PP2C基因的分類,將橡膠樹6個(gè)PP2C基因分為4個(gè)亞族:A、D、F1和F2亞族。以上結(jié)果為進(jìn)一步驗(yàn)證PP2C基因家族功能提供依據(jù)。

干旱脅迫影響植物表型,改變植物生理[27],是限制作物產(chǎn)量的最普遍環(huán)境因素[28~29]。橡膠樹的生長(zhǎng)情況及膠乳產(chǎn)量也受干旱因素制約[30],解決干旱脅迫對(duì)橡膠樹的危害對(duì)橡膠產(chǎn)業(yè)經(jīng)濟(jì)發(fā)展有著至關(guān)重要的作用。植物對(duì)干旱脅迫的響應(yīng)受不同分子及信號(hào)通路調(diào)控[31],隨著分子生物學(xué)的發(fā)展,研究抗干旱等逆境相關(guān)基因的分子表達(dá)調(diào)控機(jī)制已成為培育橡膠樹抗干旱品種的基礎(chǔ)手段。PP2C是植物中最大的蛋白磷酸酶家族,作為重要的信號(hào)分子調(diào)控植物逆境信號(hào)途徑[32~33]。在擬南芥和煙草等植物中研究發(fā)現(xiàn),PP2C酶催化可逆磷酸化作用,反作用于特定蛋白激酶,從而調(diào)節(jié)ABA信號(hào)通路[34~35],充當(dāng)負(fù)調(diào)控因子加速植物發(fā)育和增強(qiáng)植物對(duì)脅迫的耐受性[36]。大量研究發(fā)現(xiàn),PP2C基因調(diào)控干旱脅迫。二穗短柄草PP2C基因家族成員中絕大多數(shù)受干旱處理上調(diào)[16];干旱脅迫條件下,玉米ZmPP2Ca基因在耐旱自交系中下調(diào)表達(dá),在不耐旱自交系中上調(diào)表達(dá)[37]。非洲冰草的PP2C基因家族中Mpc5和Mpc8由干旱條件誘導(dǎo),但其他Mpcs受干旱脅迫下調(diào)[38];山楊樹A亞族四個(gè)PtPP2Cs均響應(yīng)干旱、寒冷和高鹽脅迫,在干旱處理下的表達(dá)量最高[19]。為探究PP2C基因在橡膠樹抗旱機(jī)制中的作用與機(jī)理,本研究利用qRT-PCR技術(shù)分析了橡膠樹PP2C基因在干旱處理下的表達(dá)情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn):干旱處理橡膠樹芽接苗后,橡膠樹芽接苗在處理前期(1~3 d)無明顯變化,此階段巴西橡膠樹中6個(gè)PP2C基因的表達(dá)量不變;干旱處理第6 d時(shí)橡膠樹芽接苗表現(xiàn)出受害癥狀,葉片變黃,同時(shí)巴西橡膠樹中6個(gè)PP2C基因均上調(diào)表達(dá);干旱處理第9 d時(shí),橡膠芽接苗葉片完全枯萎,此間,A亞族HbPP2C7基因的表達(dá)量顯著上調(diào),其余5個(gè)PP2C基因下調(diào)表達(dá)。同家族不同基因可能存在不同的應(yīng)答機(jī)制,所以基因差異表達(dá)結(jié)果不盡相同。推測(cè)橡膠樹PP2C基因響應(yīng)干旱脅迫,A亞族HbPP2C7基因更具研究?jī)r(jià)值,而PP2C基因?qū)ο鹉z樹逆境分子調(diào)控機(jī)制及與其他基因間的協(xié)同作用仍有待深入探究。

1.高偉,韋家少,何鵬,等.巴西橡膠樹水解酶基因克隆與表達(dá)分析[J].中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào),2013,29(19):9-13.

Gao W,Wei G S,He P,et al.Cloning and Expression Analysis of Hydrolase Gene fromHeveabrasiliensisMuell.Arg[J].Chinese Agricultural Science Bulletin,2013,29(19):9-13.

2.鐘勇.海南橡膠種植業(yè)發(fā)展前景分析[J].熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué),2016,36(8):69-75.

Zhong Y.Development Prospects of Rubber Industry in Hainan Province[J].Chinese Journal of Tropical Agriculture,2016,36(8):69-75.

3.李春鸞,陳麗英,鄭亞娜天.海南島暴雨統(tǒng)計(jì)分析[J].氣象研究與應(yīng)用,2008,29:57-58.

Li C Y,Chen L Y,Zheng Y N.Statistical analysis of Rainstorm in Hainan Island[J].Journal of Meteorological Research and Application,2008,29:57-58.

4.李海亮,戴聲佩,胡盛紅,等.海南島農(nóng)業(yè)干旱綜合監(jiān)測(cè)研究[J].中山大學(xué)學(xué)報(bào):自然科學(xué)版,2012,51(6):126-130.

Li H L,Dai S P,Hu S H,et al.Study on Agricultural Drought Comprehensive Monitoring in Hainan Island Based on MODIS Data and Meteorological Data[J].Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Sunyatsenii,2012,51(6):126-130.

5.Kumagai T O,Mudd R G,Giambelluca T W,et al.How do rubber(Heveabrasiliensis) plantations behave under seasonal water stress in northeastern Thailand and central Cambodia?[J].Agricultural and Forest Meteorology,2015,213:10-22.

6.Li Y W,Lan G Y,Xia Y J.Rubber trees demonstrate a clear retranslocation under seasonal drought and coldstresses[J].Frontiers in Plant Science,2016,7(e69357):1907.

7.林秀琴,袁坤,王真輝,等.干旱脅迫下橡膠樹葉片差異表達(dá)蛋白的鑒定與功能解析[J].熱帶作物學(xué)報(bào),2009,30(12):1782-1788.

Lin X Q,Yuan K,Wang Z H,et al.Identification and Functional Analysis of DIfferentially Expressed Proteins inHeveabrasiliensisLeaves during Drought Stress[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2009,30(12):1782-1788.

8.Wang L F.Physiological and molecular responses to drought stress in rubber tree(HeveabrasiliensisMuell.Arg.)[J].Plant Physiol and Biochemistry,2014,83(2):243-249.

9.Xue T T,Wang D,Zhang S Z,et al.Genome-wide and expression analysis of protein phosphatase 2C in rice and arabidopsis[J].BMC Genomics,2008,9(1):550.

10.Landi S,Nurcato R,De Lillo A,et al.Glucose-6-phosphate dehydrogenase plays a central role in the response of tomato(Solanumlycopersicum) plants to short and long-term drought[J].Plant Physiology and Biochemistry,2016,105:79-89.

11.Zhang F Y,Fu X Q,Lü Z Y,et al.Type 2C phosphatase 1 ofArtemisiaannuaL. is a negative regulator of ABA signaling[J].BioMed Research International,2014,2014:521794.

12.Wei K F,Pan S.Maize protein phosphatase gene family:identification and molecular characterization[J].BMC Genomics,2014,15(1):773.

13.Stern A,Privman E,Rasis M,et al.Evolution of the metazoan protein phosphatase 2C superfamily[J].Journal of Molecular Evolution,2007,64(1):61-70.

14.Xing Y N,Xu Y H,Chen Y,et al.Structure of protein phosphatase 2A core enzyme bound to tumor-inducing toxins[J].Cell,2006,127(2):341-353.

15.Fuchs S,Grill E,Meskiene I,et al.Type 2C protein phosphatases in plants[J].FEBS Journal,2013,280(2):681-693.

16.Cao J M,Jiang M,Li P,et al.Genome-wide identification and evolutionary analyses of thePP2Cgene family with their expression profiling in response to multiple stresses inBrachypodiumdistachyon[J].BMC Genomics,2016,17(1):175.

17.阮海華,徐朗萊.2C類蛋白磷酸酶的結(jié)構(gòu)與功能研究進(jìn)展[J].南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2007,30(1):136-141.

Ruan H H,Xu L L.Progress in the structure and function of PP2C type protein phosphatases[J].Journal of Nanjing Agricultural University,2007,30(1):136-141.

18.胡曉麗,李德全.植物蛋白磷酸酶2C(PP2C)及其在信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中的作用[J].植物生理學(xué)通訊,2007,43(3):407-412.

Hu X L,Li D Q.Protein Phosphatase 2C in Plants and Its Functions of Signal Transduction[J].Plant Physiology Communications,2007,43(3):407-412.

19.Chen J H,Zhang D Z,Zhang C,et al.A putative PP2C-encoding gene negatively regulates ABA Signaling inPopuluseuphratica[J].PLoS One,2015,10(10):e0139466.

20.Cui M H,Yoo K S,Hyoung S,et al.An Arabidopsis R2R3-MYB transcription factor,AtMYB20,negatively regulates type 2C serine/threonine protein phosphatases to enhance salt tolerance[J].FEBS Letters,2013,587(12):1773-1778.

21.Leung J,Merlot S,Giraudat J.The Arabidopsis ABSCISIC ACID-INSENSITIVE2(ABI2) and ABI1genes encode homologous protein phosphatases 2C involved in abscisic acid signal transduction[J].The Plant Cell,1997,9(5):759-771.

22.Gosti F,Beaudoin N,Serizet C,et al.ABI1 protein phosphatase 2C is a negative regulator of abscisic acid signaling[J].The Plant Cell,1999,11(10):1897-1909.

23.Schweighofer A,Kazanaviciute V,Scheikl E,et al.The PP2C-type phosphatase AP2C1,which negatively regulates MPK4 and MPK6,modulates innate immunity,jasmonic acid,and ethylene levels inArabidopsis[J].The Plant Cell,2007,19(7):2213-2224.

24.Meskiene I,Baudouin E,Schweighofer A,et al.Stress-induced protein phosphatase 2C is a negative regulator of a mitogen-activated protein kinase[J].Journal of Biological Chemistry,2003,278(21):18945-18952.

25.郭鵬,張士剛,邢鑫,等.歐美楊PdPP2C基因的克隆與功能分析[J].北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2015,37(2):100-106.

Guo P,Zhang S G,Xing X,et al.Cloning and Function analysis ofPdPP2CfromPopululusdeltoises[J].Journal of Beijing Forestry University,2015,37(2):100-106.

26.閔東紅,薛飛洋,馬亞男,等.谷子PP2C基因家族的特性[J].作物學(xué)報(bào),2013,39(12):2135-2144.

Min D H,Xue F Y,Ma Y N,et al.Characteristics ofPP2CGene Family inFoxtailMillet(Setariaitalica)[J].Acta Agronomica Sinica,2013,39(12):2135-2144.

27.Vurukonda S S K P,Vardharajula S,Shrivastava M,et al.Enhancement of drought stress tolerance in crops by plant growth promoting rhizobacteria[J].Microbiological Research,2016,184:13-24.

28.Basu S,Ramegowda V,Kumar A,et al.Plant adaptation to drought stress[J].F1000Research,2016,5:1554.

29.Chaves M M,Pereira J S,Maroco J,et al.How plants cope with water stress in the field? Photosynthesis and growth[J].Annals of Botany,2002,89(7):907-916.

30.李國(guó)堯,王權(quán)寶,李玉英,等.橡膠樹產(chǎn)膠量影響因素[J].生態(tài)學(xué)雜志,2014,33(2):510-517.

Li G Y,Wang Q B,Li Y Y,et al.A Review of Influencing Factors on Latex,Yeild ofHeveabrasiliensis[J].Chinese Journal of Ecology,2014,33(2):510-517.

31.Xu Z Z,Zhou G S,Shimizu H.Plant responses to drought and rewatering[J].Plant Signaling & Behavior,2010,5(6):649-654.

32.Rodriguez P L.Protein phosphatase 2C(PP2C) function in high plants[J].Plant Molecular Biology,1998,38(6):919-927.

33.Moorhead G B G,Trinkle-mulcahy L,Ulke-lemée A.Emerging roles of nuclear protein phosphatases[J].Nature Reviews Molecular Cell Biology,2007,8(3):234-244.

34.Bhalothia P,Sangwan C,Alok A,et al.PP2C-like promoter and its deletion variants are induced by ABA but not by MeJA and SA inArabidopsisthaliana[J].Frontiers in Plant Science,2016,7:547.

35.Thomashow M F.Plant cold acclimation:freezing tolerance genes and regulatory mechanisms[J].Annual Review of Plant Physiology and Plant Molecular Biology,1999,50:571-599.

36.T?htiharju S,Palva T.Antisense inhibition of protein phosphatase 2C accelerates cold acclimation inArabidopsisthaliana[J].Plant Journal for Cell & Molecular Biology,2001,26(4):461-470.

37.何亮,李富華,沙莉娜,等.玉米2C型絲氨酸/蘇氨酸蛋白磷酸酶(PP2C)活性與耐旱性的關(guān)系[J].作物學(xué)報(bào),2008,34(5):899-903.

He L,Li F H,Sha Li Na,et al.Activity of Serine/Threonine Protein Phosphatase Type-2C(PP2C) and Its Relationships to Drought Tolerance in Maize[J].Acta Agronomica Sinica,2008,34(5):899-903.

38.Miyazaki S,Koga R,Bohnert H J,et al.Tissue- and environmental response-specific expression of 10 PP2C transcripts inMesembryanthemumcrystallinum[J].Molecular and General Genetics MGG,1999,261(2):307-316.

The National Natural Science Fund(31660187,31660204);The earmarker fund for China Agriculture Research System(CARS-34-BC1);Innovative research project of Hainan graduate students(Hys2016-25)

introduction:ZHANG Dong(1992—),female,master,molecular botany research.

date:2017-04-20

BioinformaticsandDroughtToleranceofPP2CGeneFamilyMembersinHeveabrasiliensisMuell.Arg.

ZHANG Dong1LI Xiao-Na2XIAO Hou-Zhen3LU Yan-Xi1ZHANG Yu1*WANG Meng1

(1.Hainan Key Laboratory for Sustainable Utilization of Tropical Bioresource,Institute of Tropical Agriculture and Forestry,Hainan University,Haikou 570228;2.Institute of Scientific and Technical Information Catas,Haikou 570228;3.College of Materials and Chemical Engineering,Hainan Univeersity,Haikou 570228)

PP2Csare a group of monomeric serine/threonine protein phosphatases, which play an important role in ABA signaling pathway in higher plants. In order to elucidate the structure and function ofPP2Cgene in rubber tree,we used a bioinformatics approach to get sixPP2Cgenes members from rubber tree transcription database, sixHbPP2Csall contain PP2C conserved domains.By sequence alignment and phylogenetic analysis,sixHbPP2Cswere divided into four subfamilies: subfamily A, D, F1 and F2. Different expression analysis of sixPP2Cfamily genes under drought stress by qRT-PCR showed that they all response to drought stress in varying degrees.Our study provides a theoretical basis for exploring the mechanism ofPP2Cgenes in drought resistance of rubber tree.

HeveabrasiliensisMuell.Arg.;PP2Cgenes;bioinformatics;expression analysis;drought

國(guó)家自然科學(xué)基金(31660187,31660204);現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)資金資助(CARS-34-BC1);海南省研究生創(chuàng)新科研課題(Hys2016-25)

張冬(1992—),女,碩士研究生,主要從事分子植物學(xué)研究。

* 通信作者:E-mail:yuzhang_rain@hainu.edu.cn

2017-04-20

* Corresponding author:E-mail:yuzhang_rain@hainu.edu.cn

S794.1

A

10.7525/j.issn.1673-5102.2017.05.013

猜你喜歡
亞族芽接橡膠樹
二穗短柄草CYP72A亞族成員表達(dá)分析及亞細(xì)胞定位
巴迪可降解膜和芽接質(zhì)量對(duì)橡膠樹嫁接苗成活率及苗木生長(zhǎng)的影響
橡膠樹寒害減災(zāi)技術(shù)研究
中國(guó)熱科院突破橡膠樹死皮康復(fù)技術(shù)難關(guān)
苦蕎蛋白磷酸酶2C家族的鑒定及表達(dá)分析
橡膠樹小苗芽接不同葉蓬的芽片質(zhì)量和芽接效果比較分析
土壤與作物(2021年2期)2021-06-01 08:18:02
辣椒HD-Zip基因家族鑒定、系統(tǒng)進(jìn)化及表達(dá)分析
盆栽蘋果一株多果的嫁接方法
核桃夏季芽接育苗技術(shù)
Ataxonomic study of the Subtribe Lathrobiina(Coleoptera,Staphylinidae) in Shanghai
乐陵市| 交城县| 满洲里市| 呼玛县| 镶黄旗| 安平县| 安仁县| 玛纳斯县| 宿州市| 修武县| 木里| 黑河市| 新密市| 衡东县| 丹江口市| 沂水县| 新巴尔虎左旗| 罗江县| 廉江市| 长宁区| 西安市| 宁乡县| 灵石县| 璧山县| 望江县| 南江县| 德安县| 蒙自县| 闵行区| 宜丰县| 平罗县| 大名县| 宜城市| 大关县| 德江县| 兴安盟| 密山市| 临汾市| 昭觉县| 诸暨市| 隆德县|