郝久程 賈 鑫 穆曉紅 張恒慶
(遼寧師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,大連 116081)
大連地區(qū)島嶼與大陸玉竹種群遺傳多樣性的ISSR分析
郝久程 賈 鑫 穆曉紅 張恒慶*
(遼寧師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,大連 116081)
選取大連地區(qū)大陸與海島共有植物玉竹為研究對(duì)象,采用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)來(lái)自5個(gè)海島和4個(gè)大陸種群的262個(gè)玉竹個(gè)體進(jìn)行遺傳多樣性的比較和分析。從10個(gè)篩選出的ISSR引物擴(kuò)增得到120個(gè)位點(diǎn)信息,其中多態(tài)性條帶百分率為91.67%,Nei’s基因多樣性指數(shù)(h)為0.346 0,Shannon信息指數(shù)(I)為0.510 8。其遺傳分化系數(shù)(Gst)為0.117 4,基因流(Nm)為3.758 5。研究結(jié)果表明玉竹天然種群的遺傳多樣性較為豐富,種群間基因交流較為頻繁,遺傳距離與地理距離具有一定的相關(guān)性。通過(guò)海島與大陸種群遺傳多樣性的比對(duì)發(fā)現(xiàn),海島種群的遺傳多樣性略高于大陸種群,表明在孤立的生境和更為復(fù)雜的選擇壓力下,海島玉竹種群可能會(huì)積累更多的遺傳變異從而形成較高的遺傳多樣性水平。本文研究結(jié)果將為進(jìn)一步探討隔離生境中天然植物種群遺傳進(jìn)化規(guī)律提供證據(jù)。
ISSR-PCR;玉竹;遺傳多樣性;遺傳結(jié)構(gòu)
玉竹(Polygonatumodoratum)是百合科(Liliaceae)黃精屬(Polygonatum)多年生草本植物。野生玉竹生于涼爽、濕潤(rùn)、無(wú)積水、土壤肥沃的林下或山野陰坡地,宜溫暖濕潤(rùn)氣候,喜陰濕環(huán)境,較耐寒[1]。
大連位于遼寧省遼東半島南端,氣候適宜,植物資源豐富。玉竹在我國(guó)分布較廣,屬于歐亞大陸溫帶地區(qū)廣布種,在大連地區(qū)的分布范圍也比較廣泛,在采樣過(guò)程中發(fā)現(xiàn)北至莊河仙人洞國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)南至旅順蛇島均有玉竹種群的分布。國(guó)內(nèi)外關(guān)于玉竹方面的研究很多,主要集中于易混種鑒定[2]、化學(xué)成分[3]、藥理作用[4]、栽培技術(shù)及應(yīng)用開(kāi)發(fā)等方面。
簡(jiǎn)單重復(fù)序列間擴(kuò)增即ISSR(inter-simple sequence repeat)是自加拿大蒙特利爾大學(xué)的Zietkiewicz等[5]于1994年創(chuàng)建的,它是一種建立在PCR反應(yīng)基礎(chǔ)上的新型的分子標(biāo)記,具有操作簡(jiǎn)單、多態(tài)性豐富、試驗(yàn)重復(fù)性好的特點(diǎn)。國(guó)外關(guān)于玉竹遺傳多樣性方面的研究還未見(jiàn)報(bào)道。國(guó)內(nèi)有對(duì)玉竹遺傳多樣性方面的研究,但全部集中于大陸間的不同省份之間或不同栽培品種間的玉竹遺傳多樣性比較,路放[6]利用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)吉林地區(qū)8個(gè)品系的栽培玉竹品種進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)不同品系玉竹種間存在較高的多態(tài)性,遺傳多樣性較為豐富;卜靜等[7]通過(guò)對(duì)我國(guó)5個(gè)省份共11個(gè)種群的野生玉竹和1個(gè)種群的栽培玉竹進(jìn)行了ISSR分析,發(fā)現(xiàn)不同產(chǎn)地野生玉竹種間遺傳多樣性較為豐富,對(duì)環(huán)境變化的適應(yīng)能力強(qiáng),野生玉竹的遺傳多樣性高于栽培居群的遺傳多樣性。對(duì)于玉竹在海島隔離生境的遺傳多樣性研究還沒(méi)有報(bào)道,也沒(méi)有相關(guān)學(xué)者對(duì)遼寧省地區(qū)內(nèi)野生玉竹遺傳多樣性進(jìn)行研究。雖然我國(guó)玉竹分布廣泛,但是隨著人們不斷的采挖野生玉竹根莖進(jìn)行栽培,野生玉竹的資源也在減少,遺傳多樣性會(huì)逐漸喪失。
本實(shí)驗(yàn)采用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)遼寧省大連市的6個(gè)縣市(區(qū))共9個(gè)玉竹天然種群(其中5個(gè)為海島種群,4個(gè)為大陸種群)的遺傳多樣性進(jìn)行了比較和分析,獲取9個(gè)種群的遺傳學(xué)數(shù)據(jù),在物種水平和種群水平上揭示玉竹種群遺傳多樣性的高低,揭示玉竹種群的遺傳結(jié)構(gòu)并探討其形成的原因。同時(shí),比較研究海島和大陸玉竹種群的遺傳結(jié)構(gòu)、遺傳多樣性水平、遺傳分化的特點(diǎn),其結(jié)果將為探討隔離生境中天然植物種群遺傳進(jìn)化規(guī)律提供證據(jù)。
實(shí)驗(yàn)材料于2016年5~6月分別采自于大連地區(qū)9個(gè)不同的地點(diǎn),分單株采集,樣品間距離不少于20 m,采樣時(shí)記錄周邊環(huán)境,折斷莖部整株采集,采集后帶回實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行二次鑒定,確保采集樣品的準(zhǔn)確性,然后將材料的嫩葉采集后用封口帶單株封裝,保存于實(shí)驗(yàn)室-20℃冰柜中備用,詳細(xì)的采集信息見(jiàn)表1。
表1玉竹樣品數(shù)量及采集地
Table1ThesamplesizeandlocationofP.odoratumpopulation
種群編號(hào)Code樣品數(shù)No.ofsamples緯度Latitude(N)經(jīng)度Longitude(E)地理位置LocationSD3038°57.083′120°58.937′旅順,蛇島(海島)Lvshun,Snakeisland(Island)XS2638°55.513′121°29.283′甘井子,西山(大陸)Ganjingzi,Westmount(Land)XRD3439°59.020′122°57.450′莊河,仙人洞(大陸)Zhuanghe,Xianrendong(Land)GLD2939°38.752′123°02.032′莊河,蛤蜊島(海島)Zhuanghe,Clamsisland(Island)WJD2839°26.753′123°05.243′莊河,王家島(海島)Zhuanghe,Wangjiaisland(Island)SCD3039°31.175′122°59.561′莊河,石城島(海島)Zhuanghe,Shichengisland(Island)XHS2539°18.276′121°54.449′金州,小黑山(大陸)Jinzhou,Xiaoheishan(Land)XPD2938°50.640′121°28.920′高新區(qū),小平島(大陸)High?techzone,Xiaopingisland(Island)DCS3139°15.051′122°34.925′長(zhǎng)海,大長(zhǎng)山島(海島)Changhai,Dachangshanisland(Island)
2.1 DNA的提取
玉竹DNA的提取采取張恒慶等[8]改良的CTAB法。粗提DNA樣品進(jìn)一步純化處理后,進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,用美國(guó)冷泉港P41G型凝膠成像系統(tǒng)照相。采用Gel Pro1.1軟件對(duì)比樣品條帶與DL15000分子量標(biāo)準(zhǔn)的含量,確定DNA的含量和分子量,用雙蒸水稀釋成統(tǒng)一濃度后作為PCR反應(yīng)的模板。
2.2 引物的篩選
ISSR引物為上海生工生物工程公司合成,稀釋成10 μmol·L-1備用。在合成的27個(gè)引物中進(jìn)行了篩選,選取擴(kuò)增條帶穩(wěn)定、清晰、數(shù)量適中的10個(gè)引物作為本研究的引物,對(duì)全部樣品進(jìn)行擴(kuò)增。具體引物名稱(chēng)及退火溫度見(jiàn)表2。
表2引物名稱(chēng)、擴(kuò)增位點(diǎn)數(shù)及最佳退火溫度
Table2NumberofpolymorphiclociandoptimalannealingtemperatureofISSRprimer
引物Primer序列Sequence擴(kuò)增位點(diǎn)數(shù)Locus退火溫度Annealingtemperature(℃)UBC817(CA)8A1152.0UBC818(CA)8G1451.3UBC841(GA)8YC1252.5UBC843(CT)8RA1150.3UBC844(CT)8RC1252.0UBC845(CT)8RG948.5UBC853(TC)8RT1152.5UBC855(AC)8YT1353.0UBC856(AC)8YA1253.0UBC857(AC)8YG1550.8
2.3 ISSR反應(yīng)體系及PCR擴(kuò)增
本實(shí)驗(yàn)參考陳玉秀等[9]的優(yōu)化結(jié)果,并通過(guò)各組成成分的梯度實(shí)驗(yàn),最終確定反應(yīng)體系如下:總體積25 μL,包括10 ng模板DNA,0.4 μmol·L-1ISSR引物,10×PCR buffer 2.5 μL,0.2 mmol·L-1dNTP混合物,2.0 mmol·L-1MgCl2,1.0 UTaqDNA聚合酶,最后加ddH2O補(bǔ)齊至25 μL。
使用英國(guó)TECHNE TC-512型PCR循環(huán)儀進(jìn)行PCR擴(kuò)增,玉竹的ISSR-PCR反應(yīng)程序?yàn)?94℃ 5 min進(jìn)行預(yù)變性,35個(gè)循環(huán),條件為94℃變性45 s,48.5~53.0℃退火45 s(退火溫度因引物不同),72℃延伸90 s,最后在72℃保持7 min使擴(kuò)增的片段充分延伸。
2.4 擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)及數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析方法
PCR反應(yīng)結(jié)束后,采用水平板瓊脂糖凝膠電泳來(lái)檢測(cè)擴(kuò)增結(jié)果。具體操作為:1×TBE電泳緩沖液,凝膠濃度為1.2%,以DL2000作為分子量標(biāo)準(zhǔn),80 V穩(wěn)壓電泳2.5 h。電泳結(jié)束后用凝膠成像系統(tǒng)照相,記錄電泳結(jié)果。
根據(jù)電泳結(jié)果,選取多個(gè)位點(diǎn)記錄不同物種的同一位點(diǎn)上的條帶分布情況。記錄時(shí)只記錄那些電泳條帶清晰,并能在重復(fù)實(shí)驗(yàn)中穩(wěn)定出現(xiàn)的位點(diǎn),有帶的記為“1”,無(wú)帶的記為“0”,不確定的記為“.”,最后形成數(shù)據(jù)庫(kù),經(jīng)POPGENE1.32軟件[10]進(jìn)行遺傳多樣性分析,得出多態(tài)性條帶百分率(PPB)、Nei’s基因多樣性指數(shù)(h)、Shannon信息指數(shù)(I)、群體總基因多樣性(Ht)、群體內(nèi)基因多樣性(Hs)、遺傳分化系數(shù)(Gst)和基因流(Nm)等,同時(shí)利用軟件對(duì)玉竹種群進(jìn)行聚類(lèi)分析。
3.1 玉竹ISSR-PCR擴(kuò)增結(jié)果及遺傳多樣性分析
本實(shí)驗(yàn)用篩選出的10個(gè)引物對(duì)大連地區(qū)的9個(gè)玉竹天然種群共262個(gè)個(gè)體進(jìn)行了PCR擴(kuò)增,選出的10個(gè)引物共檢測(cè)到120個(gè)位點(diǎn),每個(gè)引物檢測(cè)到的位點(diǎn)數(shù)介于9~15個(gè),擴(kuò)增的DNA片段長(zhǎng)度在150~2 000 bp,平均每個(gè)引物檢測(cè)到12個(gè)位點(diǎn)。在檢測(cè)到的120個(gè)位點(diǎn)中多態(tài)位點(diǎn)為110個(gè),其種內(nèi)多態(tài)位點(diǎn)比率為91.67%,9個(gè)種群內(nèi)多態(tài)位點(diǎn)比率在69.17%~87.50%,其中多態(tài)位點(diǎn)比率最高的是SCD(石城島)種群,最低的是XHS(小黑山)種群(表3),引物UBC845的部分?jǐn)U增結(jié)果見(jiàn)圖1。
表3在種群和物種水平上玉竹遺傳多樣性ISSR分析結(jié)果
Table3GeneticdiversityinP.odoratumdeterminedbyISSRmarkersatpopulationandspecieslevel
種群名稱(chēng)Population擴(kuò)增位點(diǎn)數(shù)Locus多態(tài)位點(diǎn)比率PercentageofpolymorphismlociNei’s指數(shù)Nei’sgenediversity(h)Shannon指數(shù)Shannon’sinformationindex(I)WJD9680.000.3163(0.1853)0.4625(0.2583)XHS8369.170.2524(0.1987)0.3746(0.2809)XS8974.170.2771(0.1972)0.4085(0.2765)SCD10587.500.3308(0.1673)0.4880(0.2270)SD9579.170.3011(0.1814)0.4448(0.2546)XPD10184.170.3215(0.1748)0.4737(0.2402)GLD9982.500.3103(0.1767)0.4585(0.2463)DCS9780.830.3120(0.1816)0.4589(0.2525)XRD10184.170.3206(0.1754)0.4718(0.2427)Specieslevel11091.670.3460(0.1532)0.5108(0.2039)
圖1 部分玉竹種群ISSR電泳圖譜 M. DL2000Fig.1 ISSR electrophorogram of P.odoratum populations M. DL2000
3.2 玉竹種群間的遺傳分化
根據(jù)POPGENE1.32軟件計(jì)算,9個(gè)玉竹種群的遺傳分化計(jì)算結(jié)果為玉竹種群的Ht為0.345 2,Hs為0.304 7,遺傳分化系數(shù)Gst=0.117 4,說(shuō)明有11.74%的遺傳變異發(fā)生在種群間,玉竹的遺傳變異主要發(fā)生在種群內(nèi),占總的遺傳變異的88.26%?;蛄?Nm)較大為3.758 5,說(shuō)明種群間基因交流比較頻繁。
3.3 玉竹的種群遺傳距離和聚類(lèi)分析
遺傳距離(D)和遺傳一致度(I)是衡量玉竹種群間的遺傳差異和遺傳相似性的重要指標(biāo),本研究運(yùn)用POPGENE1.32軟件進(jìn)行計(jì)算,得到9個(gè)玉竹種群間的遺傳距離(D)和遺傳一致度(I),如表4所示,我們可以看到,GLD與XRD的遺傳一致度最高,為0.978 2;XHS與SD的遺傳一致度最低,為0.887 0。
根據(jù)所得到的Nei’s遺傳距離(D)的數(shù)據(jù),利用POPGENE1.32軟件,采用非加權(quán)組平均法(unweighted pair-group method with arithmetic means,UPGMA),對(duì)9個(gè)玉竹種群的進(jìn)行聚類(lèi)分析,從而得到種群間的遺傳關(guān)系聚類(lèi)圖(圖2)。從圖2中可以看出,9個(gè)玉竹種群被分為4個(gè)主要集群,其中SD和XHS種群為獨(dú)立的兩個(gè)集群,XS和XPD聚為一個(gè)集群,其他種群構(gòu)成一個(gè)集群。
圖2 玉竹種群的UPGMA聚類(lèi)圖Fig.2 Dendrogram obtained by UPGMA cluster analysis based on Nei’s genetic distance(D) among P.odoratum populations
表4玉竹種群的遺傳距離(斜線(xiàn)下)與遺傳一致度(斜線(xiàn)上)
Table4Geneticdistance(undertheobliqueline)andgeneticidentity(ontheobliqueline)amongP.odoratumpopulations
WJDXHSXSSCDSDXPDGLDDCSXRDWJD????0.91340.93290.97310.91410.94980.95880.95330.9549XHS0.0906????0.93170.91680.88700.93270.91910.92470.9327XS0.06950.0707????0.93990.88760.96950.94560.95560.9474SCD0.02720.08690.0620????0.93770.95870.97030.95410.9662SD0.08980.11990.11920.0643????0.93030.92460.91680.9343XPD0.05150.06970.03100.04210.0723????0.96680.96390.9718GLD0.04210.08440.05590.03020.07840.0337????0.97020.9782DCS0.04780.07820.04540.04700.08690.03680.0303????0.9664XRD0.04620.06960.05400.03430.06790.02860.02200.0342????
4.1 玉竹種群遺傳多樣性水平
遺傳變異的程度直接表達(dá)了遺傳多樣性水平的高低,高水平的遺傳多樣性是維持物種長(zhǎng)期生存和進(jìn)化的基礎(chǔ)條件。遺傳多樣性越高或遺傳變異越豐富,植物適應(yīng)生存環(huán)境變化的能力就越強(qiáng),而遺傳多樣性的降低將會(huì)導(dǎo)致植物的適應(yīng)能力下降,甚至?xí)袦缃^的風(fēng)險(xiǎn)。本研究利用ISSR分子標(biāo)記揭示了大連地區(qū)9個(gè)野生玉竹種群的在物種水平上的多態(tài)性條帶比率(PPB)為91.67%,Nei’s基因多樣性指數(shù)(h)為0.346 0,Shannon信息指數(shù)(I)為0.510 8。說(shuō)明了玉竹種群的遺傳多樣性較為豐富,這與卜靜等[6]通過(guò)對(duì)我國(guó)5個(gè)省份共11個(gè)種群的野生玉竹和1個(gè)種群的栽培玉竹進(jìn)行ISSR分析(PPB=94.13%,h=0.432 1,I=0.619 7)所得到的結(jié)論基本一致。
本研究得到的玉竹遺傳多樣性較高的原因可能與玉竹自身的繁育系統(tǒng)有關(guān),植物的繁育系統(tǒng)是決定植物遺傳多樣性的最主要的因素[11]。玉竹的繁殖方式為有性繁殖和無(wú)性繁殖兩種方式并存。有性繁殖的遺傳信息來(lái)源于親本雙方,這樣更有利于基因的重組和突變,從而加大遺傳變異幾率,人們也普遍接受這一觀點(diǎn),但近年來(lái)研究[12]表明無(wú)性繁殖的種群也可以保持較高水平的遺傳多樣性。因而玉竹的兩種繁殖方式使得其遺傳多樣性水平較高。通過(guò)結(jié)果我們也可以看到XHS種群的多態(tài)性條帶比率(PPB)最低,為69.17%。這可能與強(qiáng)烈的人為干擾有關(guān),XHS種群采集地位于森林公園的人行道旁,經(jīng)常會(huì)有人在其種群分布范圍內(nèi)活動(dòng),強(qiáng)烈的人為干擾可能會(huì)導(dǎo)致其遺傳多樣性下降。人為干擾等外部因素通過(guò)某種間接方式(如影響植物的交配系統(tǒng)、瓶頸效應(yīng)等)使等位基因數(shù)目或頻率發(fā)生改變,最終使植物群體的遺傳多樣性水平和遺傳結(jié)構(gòu)發(fā)生變化[13]。
4.2 玉竹種群的遺傳結(jié)構(gòu)
本研究得到玉竹種群總體的遺傳分化系數(shù)為0.117 4,基因流為3.758 5。表明了玉竹種群間基因交流較為頻繁,種群間的分化程度較低?;蛄髦饕ㄟ^(guò)花粉擴(kuò)散和種子傳播兩種形式來(lái)實(shí)現(xiàn),玉竹種群之所以基因流較大,這可能與玉竹種群在大連地區(qū)分布較廣以及大陸種群及個(gè)別海島種群間地理距離較近有關(guān),XS與XPD種群地理距離較近,XRD和GLD之間,GLD與SCD、WJD之間的地理距離也較近,各島嶼間的人員流動(dòng)增大了基因交流的可能性,島嶼一般在玉竹的開(kāi)花期風(fēng)比較大,加速了花粉的傳播,間接的促進(jìn)了基因的交流,島嶼的片段化生境并沒(méi)有完全阻止基因流。同時(shí)玉竹又是歐亞地區(qū)廣布種,在大連地區(qū)分布也較廣,也是導(dǎo)致玉竹具有較大基因流的原因。
通過(guò)對(duì)遺傳距離和UPGMA聚類(lèi)分析的對(duì)比可以發(fā)現(xiàn),XRD和GLD的遺傳距離為0.022 0,說(shuō)明二者的親緣關(guān)系最近,而這兩個(gè)種群的地理距離較近,可以進(jìn)行基因交流,GLD雖然是一個(gè)島嶼,但其離岸距離很近,且有一條大壩與大陸相連,海水的隔離并不會(huì)對(duì)基因交流產(chǎn)生影響。SD與XHS的遺傳距離最大,為0.119 9,說(shuō)明了二者的親緣關(guān)系最遠(yuǎn),有較大的遺傳背景差異,SD種群位于渤海海域,其它島嶼種群均來(lái)自黃海海域,較遠(yuǎn)的地理距離以及海水的阻隔阻止了與其他種群的基因交流,從而導(dǎo)致SD與其他種群的遺傳差異較大。
UPGMA聚類(lèi)圖可以直接反映出各種群的親緣關(guān)系,聚類(lèi)結(jié)果與地理分布上具有一定的相關(guān)性,DCS種群與XRD、GLD的地理距離較遠(yuǎn),但也聚為一類(lèi),表明地理距離在玉竹天然種群的遺傳分化中可能并非唯一的主導(dǎo)因素,可能還受到周邊生境及人為干擾等影響,具體原因還有待于更多島嶼種群并結(jié)合玉竹的生殖生物學(xué)與生態(tài)學(xué)方面的研究作出科學(xué)的評(píng)價(jià)。
4.3 玉竹海島種群與大陸種群遺傳多樣性的比較
一般來(lái)說(shuō),一個(gè)物種的海島種群遺傳多樣性由于奠基者效應(yīng)或自然選擇等原因會(huì)低于大陸種群的遺傳多樣性[14]。分析本研究所得結(jié)果,發(fā)現(xiàn)在玉竹的9個(gè)種群中,從總體上看海島種群的遺傳多樣性略高于大陸種群。李麗等[15]利用SSR標(biāo)記技術(shù)對(duì)來(lái)自海南、廣東、廣西的19個(gè)美麗雞血藤野生種群的遺傳多樣性進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)海南種質(zhì)較內(nèi)陸種質(zhì)擁有更高的遺傳變異,推測(cè)可能由于美麗雞血藤在島嶼生存面臨較之大陸更為復(fù)雜的環(huán)境,而進(jìn)化了較高的遺傳多樣性。分析玉竹形成海島種群的遺傳多樣性略高于大陸種群的原因,一方面可能與種群規(guī)模和人為干擾有關(guān),大陸種群中XRD種群采集地建有國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū),XPD種群位于密林深處,很少受到人為干擾,玉竹的棲息地也保存的較好,使得這兩個(gè)種群的遺傳多樣性相對(duì)較高;XHS種群受到人為干擾程度較大,在野外調(diào)查時(shí)還發(fā)現(xiàn)有人直接采挖玉竹根莖,對(duì)種群的破壞較大;XS種群規(guī)模較小。而海島種群雖然會(huì)受到地理隔離和生境片段化的影響,但是其種群規(guī)模較大,同時(shí)海島種群受到的人為干擾程度適中。導(dǎo)致大陸種群的遺傳多樣性差異較大且略低于海島種群。另一方面,海島種群也面臨著海島上更為復(fù)雜多樣的氣候及生存環(huán)境,多變的環(huán)境和孤立的生境使玉竹面臨更為復(fù)雜的選擇壓力,可能會(huì)影響玉竹進(jìn)化,導(dǎo)致海島玉竹種群可能會(huì)積累更多的遺傳變異從而形成較高的遺傳多樣性水平,用以適應(yīng)復(fù)雜的生態(tài)環(huán)境。
1.中國(guó)科學(xué)院中國(guó)植物志編輯委員會(huì).中國(guó)植物志:第15卷[M].北京:科學(xué)出版社,1978.
Editorial Committee Flora of China Chinese Academy of Sciences.Flora of China:vol.15[M].Beijing:Science Press,1978.
2.潘清平,周日寶,陳玉秀,等.玉竹不同品種的ISSR分子鑒定[J].中國(guó)現(xiàn)代中藥,2008,10(10):28-30.
Pan Q P,Zhou R B,Chen Y X,et al.Identification ofPolygonatumodoratumby ISSR[J].Modern Chinese Medicine,2008,10(10):28-30.
3.竺平暉,陳愛(ài)萍.GC-MS法對(duì)湖南產(chǎn)玉竹揮發(fā)油成分的分析研究[J].中草藥,2010,41(8):1264-1265.
Zhu P H,Chen A P.Analysis of volatile oils of PolygonatumOdoratumfrom Hunan by GC/MS[J].Chinese Traditional and Herbal Drugs,2010,41(8):1264-1265.
4.Choi S B,Park S.A steroidal glycoside fromPolygonatumodoratum(Mill.) Druce.improves insulin resistance but does not alter insulin secretion in 90% pancreatectomized rats[J].Bioscience,Biotechnology,and Biochemistry,2002,66(10):2036-2043.
5.Zietkiewicz E,Rafalski A,Labuda D.Genome fingerprinting by simple sequence repeat(SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification[J].Genomics,1994,20(2):176-183.
6.路放.玉竹種質(zhì)資源評(píng)價(jià)研究[D].長(zhǎng)春:吉林農(nóng)業(yè)大學(xué),2014.
Lu F.Study on assessment of germplasm resources ofPolygonatumodoratum[D].Changchun:Jilin Agricultural University,2014.
7.卜靜,王冬梅,李登武.不同產(chǎn)地野生玉竹種質(zhì)資源多樣性與親緣關(guān)系的ISSR分析[J].中草藥,2012,43(9):1824-1828.
Bu J,Wang D M,Li D W.ISSR analysis on diversity and genetic relationship in germplasm resources of wildPo1ygonatumodoratumfrom different habitats[J].Chinese Traditional and Herbal Drugs,2012,43(9):1824-1828.
8.張恒慶,安利佳,祖元?jiǎng)?涼水國(guó)家自然保護(hù)區(qū)天然紅松林遺傳變異的RAPD分析[J].植物研究,2000,20(2):201-206.
Zhang H Q,An L J,Zu Y G.RAPD analysis on genetic variation ofPinuskoraiensisin Liang Shui national natural reserve[J].Bulletin of Botanical Research,2000,20(2):201-206.
9.陳玉秀,周日寶,潘清平,等.玉竹ISSR反應(yīng)體系的優(yōu)化[J].湖南中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào),2008,28(2):37-39.
Chen Y X,Zhou R B,Pan Q P,et al.Optimization for reaction system ofPolygonatumodoratumISSR[J].Journal of TCM University of Hunan,2008,28(2):37-39.
10.Yeh F C,Yang R C,Boyle T B,et al.POPGENE Version 1.32 Microsoft Windows-based freeware for populations genetic analysis.University of Alberta,Edmonton[M].Edmonton:Molecular Biology and Biotechnology Center,University of Alberta,1999.
11.王洪新,胡志昂.植物的繁育系統(tǒng)、遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性保護(hù)[J].生物多樣性,1996,4(2):92-96.
Wang H X,Hu Z A.Plant breeding system,genetic structure and conservation of genetic diversity[J].Chinese Biodiversity,1996,4(2):92-96.
12.Burd On R D,Aimers H J.Risk management for clonal forestry withPinusradiate-analysis and review.1:Strategic issues and risk spread[J].New Zealand Journal of forestry Science,2003,33(2):156-180.
13.文亞峰,韓文軍,吳順.植物遺傳多樣性及其影響因素[J].中南林業(yè)科技大學(xué)學(xué)報(bào),2010,30(12):80-87.
Wen Y F,Han W J,Wu S.Plant genetic diversity and its influencing factors[J].Journal of Central South University of Forestry & Technology,2010,30(12):80-87.
14.Muller F,Voccia M,B? A,et al.Genetic diversity and gene flow in a Caribbean treePterocarpusofficinalisJacq:a study based on chloroplast and nuclear microsatellites[J].Genetica,2009,135(2):185-198.
15.李麗,徐立,李志英,等.不同地理來(lái)源美麗雞血藤遺傳多樣性的SSR分析[J].廣東農(nóng)業(yè)科學(xué),2013,40(22):156-160.
Li L,Xu L,LI Z Y,et al.Genetic diversity ofCalleryaspeciosafrom different geographical origins by SSR markers[J].Guangdong Agricultural Sciences,2013,40(22):156-160.
introduction:HAO Jiu-Cheng(1992—),male,Master,mainly engaged in population genetics.
date:2017-03-04
GeneticDiversitybetweenIslandandMainlandNaturalPopulationsofPolygonatumodoratuminDalianAreabyISSR
HAO Jiu-Cheng JIA Xin MU Xiao-Hong ZHANG Heng-Qing*
(College of Life Sciences,Liaoning Normal University,Dalian 116081)
WithPolygonatumodoratum, a plant on both the mainland and islands in Dalian, we studied the genetic diversity of 262P.odoratumfrom 5 islands and 4 mainland populations by ISSR molecular marker technology. Information of 120 loci was obtained by amplification of 10 ISSR primers that were screened out, where the percentage of polymorphic bands was 91.67%, the gene diversity index of Nei’s was 0.346 0, and Shannon information index was 0.510 8. Its genetic differentiation coefficient was 0.117 4, and its gene flow was 3.758 5. The genetic diversity of natural populations ofP.odoratumwas relatively rich with relatively frequent gene exchange among different populations, and its genetic distance had certain correlation with its geographic distance. By comparison between genetic diversity of populations from the mainland and islands, the genetic diversity of populations from islands was slightly higher than that from the mainland, indicating that under a more isolated ecological environment and more complicated selection pressure, populations ofP.odoratumon islands might accumulate more genetic variation to form high levels of genetic diversity. Our results would provide evidence for further discussion on laws of genetic evolution of populations of natural plants in isolated ecological environments.
ISS-PCR;Polygonatumodoratum;genetic diversity;genetic structure
郝久程(1992—),男,碩士研究生,主要從事種群遺傳學(xué)方面的研究。
* 通信作者:E-mail:hengqingzhang@163.com
2017-03-04
* Corresponding author:E-mail:hengqingzhang@163.com
Q949.71+8.23
A
10.7525/j.issn.1673-5102.2017.05.010