魏偉,楊波,唐翎
(中南大學(xué)湘雅醫(yī)院 1.普通外科 3.藥劑科,湖南 長沙 410008;2.湖南省常德市第四人民醫(yī)院 普通外科,湖南 常德415000)
胰腺癌是我國最常見的惡性腫瘤之一,其病因和發(fā)病的分子機(jī)制尚不明確[1-4]。近年來,癌基因或抑癌基因變異引起的相關(guān)功能因子的表達(dá)紊亂而導(dǎo)致胰腺癌發(fā)生發(fā)展的基因功能研究是胰腺癌病因和發(fā)病分子機(jī)制研究的重要方向[5-8]。
長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一類本身不編碼蛋白、轉(zhuǎn)錄本長度超過200 nt的長鏈非編碼RNA分子,它可在多層面上,包括表觀遺傳調(diào)控、轉(zhuǎn)錄調(diào)控以及轉(zhuǎn)錄后調(diào)控等多個(gè)方面調(diào)控基因的表達(dá)[9]。近年來有研究[10-15]表明,lncRNA亦可作為原癌基因或抑癌基因參與腫瘤的增殖與侵襲轉(zhuǎn)移過程,如MALAT1、HOTAIR、HNF1A-AS及XIST等。據(jù)報(bào)道[16],X染色體失活特異轉(zhuǎn)錄本(X-inactive specific transcript,XIST)在多種癌癥中均呈高表達(dá),且XIST的高表達(dá)往往與癌癥預(yù)后不良有密切關(guān)系。Fang等[17]研究表明,在非小細(xì)胞肺癌中,XIST扮演了癌基因的角色。
本研究將檢測(cè)胰腺癌組織和胰腺癌細(xì)胞系中XIST的表達(dá)水平,并通過siRNA干擾胰腺癌細(xì)胞中XIST表達(dá)后檢測(cè)其增殖的變化情況。
人正常胰腺導(dǎo)管上皮細(xì)胞系HPDE、人胰腺癌細(xì)胞系A(chǔ)sPC-3、BxPC-3、Capan-1、CFPAC-1、Hs766T、Panc-1及SW1990購自中國科學(xué)院典型培養(yǎng)物保藏委員會(huì)細(xì)胞庫。XIST siRNA套裝購自上海吉瑪生物;MTT檢測(cè)試劑盒和BrdU檢測(cè)試劑盒購自贏潤生物技術(shù)有限公司;0.25%胰蛋白酶、胎牛血清購自Gibco公司;細(xì)胞轉(zhuǎn)染試劑lipo-2000購自美國Life Technology公司;總RNA提取試劑(RNA Lyz01)購自依科賽生物公司;反轉(zhuǎn)錄試劑盒(RT reagent Kit)購自TaKaRa公司;熒光定量PCR試劑購自Bio-Rad公司;改良Eagle培養(yǎng)基高糖培養(yǎng)基購自Hyclone公司;Ki-67、PCNA抗體購自Abcam公司;其它常用試劑均為國產(chǎn)分析純。實(shí)時(shí)熒光定量PCR(real-time PCR,RT-PCR)儀為美國Bio-Rad公司產(chǎn)品。
56對(duì)正常胰腺組織和胰腺癌組織標(biāo)本由本科室2013—2015年收集,所有病例術(shù)前均未行放療、化療。
HDPE、Capan-1、Hs766T、Panc-1在含10%胎牛血清的DMEM(Gibco,Carlsbad,CA)培養(yǎng)基中培養(yǎng);AsPC-1、BxPC-3、SW1990細(xì)胞系在含10%胎牛血清的RPMI1640培養(yǎng)基中培養(yǎng);CFPAC-1在含10%胎牛血清的IMDM培養(yǎng)基中培養(yǎng)。所有細(xì)胞均置于37 ℃、5%CO2、飽和濕度培養(yǎng)箱內(nèi)常規(guī)傳代培養(yǎng)。實(shí)驗(yàn)用細(xì)胞均為對(duì)數(shù)生長期細(xì)胞。
制備終濃度為80 nmol/L的XIST siRNA脂質(zhì)體復(fù)合物,實(shí)驗(yàn)組加入XIST siRNA,同時(shí)設(shè)置對(duì)照組。將人胰腺癌 SW1990細(xì)胞以每孔2×105個(gè)接種于6孔板,待細(xì)胞增殖至70%~80%時(shí),更換無血清培養(yǎng)基,采用Lipo-2000 將XIST siRNA1、siRNA2、siRNA3分別轉(zhuǎn)染細(xì)胞。
收集各組細(xì)胞,每孔不少于1×106個(gè)細(xì)胞制備總RNA并定量;取5 μg總RNA進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)合成cDNA,然后以cDNA為模板、GAPDH作為內(nèi)參照,進(jìn)行RT-PCR反應(yīng)。PCR擴(kuò)增的反應(yīng)條件為:95 ℃ 30 s 預(yù)變性;95 ℃ 5 s,60 ℃ 20 s,40個(gè)循環(huán)。反應(yīng)結(jié)束后,使用BIO-RAD real-time PCR儀自帶軟件分析PCR過程中樣本的循環(huán)閾值(cycle threshold,CT),采用2-AACT計(jì)算各組細(xì)胞中目的基因相對(duì)反應(yīng)起始拷貝數(shù)。GAPDH引物序列正向:5'-TGC ACC ACC AAC TGC TTA GC-3';反向:5'-GGC ATG GAC TGT GGT CAT GAG-3'。XIST引物序列為正向:5'-ACG CTG CAT GTG TCC TTA G-3';反向:5'-GAG CCT CTT ATA GCT GTT TG-3'。
收集各組處于對(duì)數(shù)生長期的胰腺癌SW1990細(xì)胞,把細(xì)胞懸液濃度調(diào)節(jié)為1×105/mL。將100 μL(含1×104個(gè)細(xì)胞)的細(xì)胞懸液種入每孔中,每組設(shè)5個(gè)復(fù)孔,種5塊96孔板。置于37 ℃,5%CO2培養(yǎng)箱孵育,把種板時(shí)間作為起始時(shí)間點(diǎn)0 h,在1 h取出一塊96孔細(xì)胞培養(yǎng)板,每孔加入10 μL 0.5%MTT溶液,繼續(xù)培養(yǎng)4 h。1 000 r/min離心10 min,小心吸掉孔內(nèi)上清液,每孔均加入100 μL二甲基亞砜,將9 6孔板置搖床上,低速振蕩10 min,充分溶解結(jié)晶物。在酶聯(lián)免疫檢測(cè)儀上波長490 nm處分別測(cè)量各孔的吸光度(A)。同時(shí)設(shè)置調(diào)零孔(MTT、培養(yǎng)基、二甲基亞砜)。此后每隔12 h取1塊培養(yǎng)板檢測(cè)490 nm的OD值,一共檢測(cè)72 h。
細(xì)胞以2×103/mL細(xì)胞數(shù)接種于96孔板中,培養(yǎng)1 d,用含0.4%FCS培養(yǎng)液同步化2 d,使絕大多數(shù)細(xì)胞處于G0期。終止細(xì)胞培養(yǎng)前,加入BrdU(終濃度為10 μmol/L),37 ℃,孵育24 h。去除培養(yǎng)基,細(xì)胞被固定30 min,過氧化物酶孵育耦合抗BrdU抗體(Sigma-Aldrich公司)孵育60 min,用PBS洗3次,加過氧化物酶底物(四甲基聯(lián)苯胺)染色30 min,在490 nm處測(cè)定各組的OD值。
收集各組細(xì)胞,每孔不少于1×106個(gè)細(xì)胞制備總蛋白,定量后按相同總量和濃度進(jìn)行SDSPAGE垂直電泳(1.5~2.5 h);然后用半干轉(zhuǎn)膜法將蛋白轉(zhuǎn)移到PVC膜上(90 V,45~90 min),用5%的脫脂牛奶封閉;洗膜后分別孵育一抗,4 ℃孵育過夜后洗膜3次;孵育二抗,1~2 h后洗膜3次;制備化學(xué)發(fā)光試劑并滴加到含目的蛋白的膜上,暗室顯影或用成像系統(tǒng)直接采集圖像。
采用SPSS 17.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行分析,數(shù)據(jù)用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,兩兩比較采用兩獨(dú)立樣本t檢驗(yàn),P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
應(yīng)用RT-PCR技術(shù)分別檢測(cè)56對(duì)胰腺癌組織及正常組織中XIST的表達(dá)情況,結(jié)果顯示:胰腺癌組織XIST的表達(dá)量明顯高于癌旁正常胰腺組織[(2.452±0.134)vs.(0.9729±0.035),P<0.001](圖1)。結(jié)合臨床指標(biāo)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析得出:XIST的高表達(dá)與胰腺癌腫瘤分期(P=0.016)、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移(P=0.032)有關(guān)(表1)。
圖1 XIST在胰腺癌組織及癌旁正常組織的表達(dá)Figure 1 XIST expression in pancreatic cancer and normal tissues
表1 XIST的表達(dá)與胰腺癌患者臨床病理的關(guān)系[n(%)]Table 1 Relations of XIST expression with clinicopathologic variables of pancreatic cancer patients [n (%)]
為了確定XIST在胰腺癌中的表達(dá)情況,實(shí)驗(yàn)中選取人胰腺導(dǎo)管上皮細(xì)胞HPDE作為對(duì)照,同時(shí)選擇7個(gè)胰腺癌細(xì)胞系A(chǔ)sPC-3、BxPC-3、Capan-1、CFPAC-1、Hs766T、Panc-1和SW1990為研究對(duì)象。應(yīng)用RT-PCR技術(shù)分別檢測(cè)8組細(xì)胞中XIST的表達(dá)水平,結(jié)果顯示:與HPDE細(xì)胞比較,XIST在7個(gè)胰腺癌細(xì)胞系中均呈高表達(dá)(均P<0.05);其中SW1990相比較于HPDE,XIST表達(dá)水平升高(2.510±0.170)倍(圖2)。
圖2 XIST在胰腺導(dǎo)管上皮細(xì)胞與不同胰腺癌細(xì)胞系中的表達(dá)Figure 2 XIST expressions in pancreatic duct epithelial cells and diあerent pancreatic cancer cell lines
實(shí)驗(yàn)選擇XIST高表達(dá)的SW1990細(xì)胞為后續(xù)研究工具細(xì)胞,并設(shè)計(jì)在SW1990細(xì)胞中沉默XIST。將合成的3個(gè)XIST siRNA序列分別轉(zhuǎn)染至SW1990細(xì)胞,根據(jù)siRNA產(chǎn)品使用手冊(cè)推薦,在轉(zhuǎn)染后48 h收集細(xì)胞,應(yīng)用RT-PCR技術(shù)分別檢測(cè)4組細(xì)胞中XIST mRNA的表達(dá)水平,結(jié)果顯示:siRNA2對(duì)XIST的RNA表達(dá)水平抑制最明顯,表達(dá)水平為0.247±0.021,抑制率達(dá)到75.3%(P<0.01)(圖3),滿足后續(xù)實(shí)驗(yàn)需求。
圖3 XIST siRNA序列篩選結(jié)果Figure 3 Results of XIST siRNA screening
研究應(yīng)用MTT法和BrdU法測(cè)定了XIST siRNA2轉(zhuǎn)染胰腺癌細(xì)胞系SW1990后細(xì)胞的活力和增殖水平的變化。MTT法檢測(cè)結(jié)果顯示:48 h對(duì)照組及沉默組OD(490nm)分別為1.215±0.048、0.812±0.024,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001)(圖4)。BrdU法檢測(cè)結(jié)果顯示:48 h對(duì)照組及沉默組OD(450 nm)分別為1.007±0.065、0.708±0.085,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001)(圖5)。
圖4 MTT檢測(cè)XIST沉默對(duì)胰腺癌細(xì)胞活力的影響Figure 4 In fluence of XIST silencing on viability of pancreatic cancer cells detected by MTT assay
圖5 BrdU法檢測(cè)XIST沉默對(duì)胰腺癌細(xì)胞增殖的影響Figure 5 Influence of XIST silencing on proliferation of pancreatic cancer cells detected by BrdU assay
為進(jìn)一步驗(yàn)證XIST抑制胰腺癌細(xì)胞增殖的分子機(jī)制,實(shí)驗(yàn)在SW1990細(xì)胞中轉(zhuǎn)染XIST siRNA2,48 h后收集細(xì)胞應(yīng)用Western blot檢測(cè)細(xì)胞中與增殖相關(guān)基因Ki-67、PCNA的蛋白表達(dá)變化。結(jié)果顯示:在48 h對(duì)照組與XIST沉默組Ki-67的表達(dá)水平分別為1.027±0.074、0.467±0.055,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001);在48 h對(duì)照組與XIST沉默組PCNA的表達(dá)水平分別為0.997±0.105、0.600±0.082,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001)(圖6)。結(jié)果從分子層面證明:在胰腺癌細(xì)胞中,沉默XIST后細(xì)胞增殖促進(jìn)因子Ki-67、PCNA表達(dá)被抑制,從而實(shí)現(xiàn)抑制癌細(xì)胞的增殖。
圖6 XIST沉默對(duì)胰腺癌細(xì)胞Ki-67、PCNA蛋白表達(dá)的影響Figure 6 In fluence of XIST silencing on Ki-67 and PCNA expressions in pancreatic cancer cells
據(jù)2014年最新統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)顯示,發(fā)達(dá)國家(美國)胰腺癌新發(fā)估計(jì)病例數(shù),男性列第10位,女性列第9位,占惡性腫瘤病死率的第4位。據(jù)《2013年中國腫瘤登記年報(bào)》統(tǒng)計(jì),胰腺癌位列我國男性惡性腫瘤發(fā)病率的第8位,人群惡性腫瘤病死率的第7位,全球范圍內(nèi)均呈快速上升趨勢(shì)。胰腺的腫瘤大多是外分泌型腫瘤,80%是胰腺導(dǎo)管腺瘤,只有2%的胰腺外分泌腫瘤為良性[18-20]。胰腺癌以高侵襲性和早期轉(zhuǎn)移為特點(diǎn),臨床癥狀出現(xiàn)晚,發(fā)現(xiàn)時(shí)已為晚期,很難施行治愈性的手術(shù)治療,預(yù)后較差。近幾年在我國發(fā)病率逐年上升,并且有年輕化的趨勢(shì)。雖然放療和化療對(duì)延長患者生存期起到了一定的作用,但是患者中位生存期仍小于2年[21]。由于胰腺癌的這些特性,尋找參與胰腺癌發(fā)生發(fā)展,尤其是與胰腺癌早期診斷及預(yù)后相關(guān)的新的生物學(xué)指標(biāo),對(duì)于早期發(fā)現(xiàn)胰腺癌并改善胰腺癌患者的預(yù)后具有重要意義。
XIST是雌性哺乳動(dòng)物X染色體的轉(zhuǎn)錄沉默所需的一個(gè)長非編碼RNA,它在X染色體失活過程中發(fā)揮重要作用。近年來,越來越多的證據(jù)[22-25]顯示XIST與腫瘤的發(fā)生、進(jìn)展密切相關(guān)。在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中,XIST敲除通過減少細(xì)胞增殖、遷移和侵襲以及誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡而表現(xiàn)出抑制腫瘤發(fā)展的作用[22]。據(jù)Ma等[14-15]報(bào)道,在胃癌患者中,XIST高表達(dá)同更大的腫瘤體積、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移和TNM分期密切相關(guān)。
RT-PCR檢測(cè)分析本科室2013—2015年收集的56對(duì)正常胰腺組織和胰腺癌組織、人胰腺導(dǎo)管上皮細(xì)胞及7個(gè)胰腺癌細(xì)胞系中XIST的表達(dá)情況。結(jié)果顯示在胰腺癌組織和7個(gè)胰腺癌細(xì)胞系中,XIST均呈現(xiàn)高表達(dá),在SW1990細(xì)胞系中表達(dá)升高尤其明顯;結(jié)合臨床資料分析顯示XIST的高表達(dá)可能與更差的胰腺癌分期及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān),與其他學(xué)者[14,26]研究結(jié)果一致。
利用RNA干擾技術(shù)在SW1990細(xì)胞中成功實(shí)現(xiàn)細(xì)胞內(nèi)XIST沉默,胰腺癌細(xì)胞的細(xì)胞活力和增殖均被顯著抑制,說明XIST在胰腺癌組織和胰腺癌細(xì)胞系中的高表達(dá)可能與胰腺癌生長及胰腺癌細(xì)胞增殖相關(guān)。XIST沉默后,胰腺癌細(xì)胞中Ki-67、PCNA的蛋白表達(dá)被顯著抑制,說明XIST可能通過調(diào)控胰腺癌細(xì)胞中Ki-67、PCNA的蛋白表達(dá)來影響胰腺癌細(xì)胞增殖。Yue等[27]研究報(bào)道,胰腺癌組織及細(xì)胞系中,PCNA蛋白過表達(dá)可能有助于胰腺癌的發(fā)生或進(jìn)展;本研究結(jié)果表明XIST沉默可抑制PCNA蛋白表達(dá),并可能通過抑制PCNA蛋白表達(dá)而影響胰腺癌細(xì)胞活力和增殖。以上結(jié)果表明XIST可能是胰腺癌惡性程度高,增殖快的原因之一。
綜上所述,深入了解XIST促進(jìn)胰腺癌細(xì)胞的增殖及相關(guān)機(jī)制,可能為胰腺癌的診斷、病情監(jiān)測(cè)提供實(shí)驗(yàn)依據(jù),有可能將其作為胰腺癌治療的新的作用靶點(diǎn),對(duì)于指導(dǎo)治療、提高術(shù)后生存率有重要的意義。
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