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長鏈非編碼RNA與冠狀動脈粥樣硬化性心臟病

2017-03-06 21:21:14黃光楠楊毅寧
嶺南心血管病雜志 2017年3期
關(guān)鍵詞:長鏈硬化性心血管

黃光楠,楊毅寧

(新疆醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院心臟中心,烏魯木齊,830054)

長鏈非編碼RNA與冠狀動脈粥樣硬化性心臟病

黃光楠,楊毅寧

(新疆醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院心臟中心,烏魯木齊,830054)

近年有研究表明,有大量基因序列通過非編碼RNA形式對生命活動進行調(diào)控。目前對非編碼RNA的研究主要集中在微RNA(miRNA)和長鏈非編碼(long non-coding RNA,lncRNA)。其中,lncRNA是由長度超過200個核苷酸組成的不具有蛋白質(zhì)編碼功能的RNA,它們參與基因組印跡、X染色體沉默以及染色質(zhì)修飾、轉(zhuǎn)錄激活、核內(nèi)運輸、轉(zhuǎn)錄干擾等多種重要的調(diào)控作用。雖然目前l(fā)ncRNAs的作用機制和功能尚未完全清楚,但是近年的研究表明,lncRNAs是參與心血管疾病發(fā)生、發(fā)展的重要調(diào)節(jié)因子,與冠狀動脈粥樣硬化性心臟病密切相關(guān)。

冠狀動脈疾??;長鏈非編碼RNA;分子機制

人類基因組的測序結(jié)果表明,哺乳動物基因中超過98%轉(zhuǎn)錄為非編碼RNA(non-coding RNA,ncRNA),只有不到2%的RNA編碼蛋白質(zhì)[1],非編碼RNA又根據(jù)核苷酸長度分為核苷酸長度小于200 nt的短鏈非編碼微RNA(microRNA,miRNA)和核苷酸長度大于200 nt的長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)[2]。在過去對非編碼RNA的研究中,主要集中在miRNA上,揭示了其在癌癥、代謝、神經(jīng)元、心血管疾病等方面的重要作用。至今為止,通過研究發(fā)現(xiàn)的lncRNA已達上千種,但人們對它的研究和認識僅為冰山一角;目前研究表明,lncRNA參與了基因組印跡、X染色體沉默以及染色質(zhì)修飾、轉(zhuǎn)錄激活、轉(zhuǎn)錄干擾、核內(nèi)運輸?shù)榷喾N重要的調(diào)控過程[3]。最近新的研究揭示,lncRNA的異常表達與心血管疾病的發(fā)生和發(fā)展密切相關(guān)[4]。本文就lncRNA在冠狀動脈粥樣硬化性心臟?。ü谛牟。┑陌l(fā)生和發(fā)展中的機制作一介紹。

1 長鏈非編碼RNA

1.1 分類及特性

lncRNA是由超過200個核苷酸組成,但不具有蛋白編碼功能的RNA轉(zhuǎn)錄序列。長時間以來一直被認為是基因轉(zhuǎn)錄的“噪音”,不具有任何生物學功能。但隨著人類基因組研究的進展,越來越多的證據(jù)表明,lncRNA在轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后調(diào)控及表觀遺傳修飾等水平調(diào)控基因的表達并且在正常生理過程中也發(fā)揮重要作用;lncRNA有多種不同的來源,目前認為主要有以下5個方面[5]:(1)蛋白編碼基因結(jié)構(gòu)中斷轉(zhuǎn)變?yōu)閘ncRNA;(2)染色質(zhì)重新排列導致兩個未轉(zhuǎn)錄的基因與另外獨立的基因合并產(chǎn)生一個有多個外顯子的lncRNA;(3)由非編碼基因轉(zhuǎn)錄過程中產(chǎn)生;(4)由串聯(lián)復制產(chǎn)生鄰近的非編碼RNA;(5)插入一個轉(zhuǎn)座子而產(chǎn)生有功能的非編碼RNA。目前l(fā)ncRNA的分類標準尚未統(tǒng)一,Kung等[6]認為lncRNA分為5類:(1)獨立lncRNA(standalone lncRNA);(2)自然反義轉(zhuǎn)錄體(natural antisense transcripts,NAT);(3)假 基 因(pseudogenes);(4)長鏈固有ncRNA(long intronic ncRNA);(5)其他lncRNA(增強子RNA等)。并且,由于lncRNA的結(jié)構(gòu)缺乏5’端的帽子和3’端的多聚A尾,lncRNA的兩端必須通過核仁 小 RNA(small nucleolar RNA,snoRNA)維 持LncRNA的結(jié)構(gòu)穩(wěn)定及不被降解[7]。

lncRNA具有兩大重要特性:(1)重復序列較少,一旦轉(zhuǎn)錄終止,lncRNA會迅速降解;如Tsix的半衰期通常只有30~60 min;Kcnq1ot1半衰期也只有1 h左右,這種特點造成其只能在特定部位發(fā)揮作用。(2)lncRNA結(jié)合位點單一。例如:Tsix和RepA/Xist均只有單一的靶點。lncRNA只有一個內(nèi)含子,轉(zhuǎn)錄活性較弱,而且在進化上保守性較差[8]。

1.2 lncRNA的功能

最近研究表明,lncRNAs在調(diào)控基因的表達中起著非常重要的作用,lncRNA可通過表觀遺傳、轉(zhuǎn)錄調(diào)控以及轉(zhuǎn)錄后調(diào)控等多種機制調(diào)控DNA甲基化、組蛋白修飾或染色質(zhì)重構(gòu),使基因沉默或激活[9-10];其主要通過以下4種作用方式發(fā)揮其生物學功能[11]:(1)lncRNA可扮演信號分子角色,當細胞受到某種刺激后,可以表現(xiàn)出特定的組織特異性。例如,被稱為Braveheart(Bvht)的lncRNA可以在心臟發(fā)育過程中,引起相關(guān)基因的激活或抑制從而刺激干細胞分化[12]。(2)lncRNA可通過與特定的DNA或者蛋白質(zhì)結(jié)合,并將其引導到正確的染色體位置上[13]。(3)lncRNA還可作為“分子誘餌”來誘導特定蛋白(如轉(zhuǎn)錄因子)與之結(jié)合。例如:另一個lncRNA心肌肥厚相關(guān)因子(CHRF)被證明通過隔離mir-489基因,抑制骨髓分化的主要應答基因88(MyD88),從而通過核因子-κBκ(NF-κBκ)系統(tǒng)誘導心肌肥大[11]。(4)lncRNA可以作為蛋白質(zhì)復合物的骨架把2個表觀修飾的酶連接在一起。

2 lncRNA與冠狀動脈粥樣硬化性心臟病

2.1 ANRIL

人類染色體9p21.3區(qū)域是與心血管疾病聯(lián)系最緊密的區(qū)域之一,其中包括ANRIL、CDKN2A、CDKN2B等;ANRIL是一種INK4基因座中反義非編碼RNA(antisense non coding RNA in the INK4 loucus),目前被驗證與冠心病、顱內(nèi)動脈瘤和2型糖尿病有關(guān);ANRIL是為數(shù)不多的,在染色體9p21區(qū)域被發(fā)現(xiàn)的與動脈粥樣硬化性血管?。╝therosclerotic vascular disease,ASVD)敏感性有關(guān)的轉(zhuǎn)錄物[14]。有研究表明,位于染色體9p21.3靠近INK4/ARF(CDKN2a/b)位點的單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)與動脈粥樣硬化的發(fā)生具有相關(guān)性,并且血液中ANRIL的相關(guān)分解產(chǎn)物的含量與動脈粥樣硬化呈明顯相關(guān)性,機制可能為該SNP可調(diào)節(jié)ANRIL的表達[17-18]。

Jarinova等[15]的研究發(fā)現(xiàn),ANRIL的轉(zhuǎn)錄物與P15INK4b有相關(guān)性,并且認為在全血中的ANRIL能夠直接影響P15INK4b的表達。P15INK4b是一種周期依賴性激酶抑制劑,可促進血管重建,延緩動脈粥樣硬化的形成;ANRIL能夠通過PcG復合物(Polycombgroup,PcG)定位到P15INK4b基因位點,從而抑制P15INK4b表達,減少它的心血管保護作用。另外,Johnson等[16]的研究發(fā)現(xiàn),通過測定急性心肌梗死患者和穩(wěn)定型心絞痛患者9p21.3區(qū)域的序列,發(fā)現(xiàn)ANRIL、SNP與急性心肌梗死具有顯著相關(guān)性。Ahmed等[17]的研究報道稱,在對巴基斯坦北部人群的研究中,ANRIL(rs1333049:C>G)的一個SNP位點與急性心肌梗死顯著相關(guān)。

Harismendy等[18-19]也發(fā)現(xiàn),9p21染色體上的SNP與腹主動脈瘤和冠心病的發(fā)生和發(fā)展呈相關(guān)性。綜上所述,ANRIL在動脈粥樣硬化患者中表達水平的改變,使其有可能成為一種新的生物學標記物或治療靶點。

2.2 尿路上皮癌相關(guān)1基因

長鏈非編碼RNA尿路上皮癌相關(guān)1(urothelial carcino?ma associated 1,UCA1)基因最初是在人膀胱移行細胞癌中被發(fā)現(xiàn),并在膀胱癌患者的尿液中檢出[20]。在正常狀態(tài)下,UCA1只有在胚胎、胎盤和大多數(shù)的胎兒組織中高表達,但其表達在出生后大多數(shù)組織中均被關(guān)閉[20];在成人組織中,UCA1在絕大多數(shù)組織不表達,僅在心臟及脾臟中表達,且在心臟表達水平較高[21]。

有研究結(jié)果表明,膀胱癌細胞中UCA1水平下調(diào)能夠降低膀胱癌細胞的增殖、促進細胞凋亡[23]。Yan等[21]的研究表明,UCA1在大部分急性心肌梗死患者的血漿中表達水平降低,且心肌梗死患者體內(nèi)UCA1水平與發(fā)病時間有關(guān),另外研究結(jié)果提示miRNA-1和UCA1水平在急性心肌梗死患者的血漿中呈反比例表達。在急性心肌梗死大鼠及急性心肌梗死患者的血漿中,miRNA-1的水平顯著升高[24],miRNA-1通過影響患者體內(nèi)有心肌保護作用的蛋白,如Bcl-2、HSP60、胰島素樣生長因子 1(IGF-1)的表達而加劇心肌組織的損傷[25]。在體外實驗中,可以刺激miRNA-1的表達,而過表達的miR-1促進誘導的心肌細胞凋亡[22]。

這提示我們,在心肌組織中的UCA1表達下調(diào)可能抑制心肌細胞增殖,促進心肌細胞凋亡,而急性心肌梗死患者中,由于心肌壞死所導致的UCA1的釋放有助于心肌細胞修復和再生。目前,UCA1的功能尚未完全清楚,目前研究提示,UCA1有可能可以作為診斷急性心肌梗死的生物標志物,并可能成為潛在的心肌梗死治療靶點。

2.3 心肌梗死相關(guān)轉(zhuǎn)錄本

心肌梗死相關(guān)轉(zhuǎn)錄本(myocardial infarction associated transcript,MIAT)在2000年首次被報道[26]。在這之前,MI?AT也被稱為RNCR2、AK028326或GOMAFU。2006年,Ishii等[27]通過對52 608個SNP標記,進行了大規(guī)模的病例對照關(guān)聯(lián)研究,發(fā)現(xiàn)了一個心肌梗死的基因敏感位點SNP(rs2301523),該SNP定位于染色體22q12.1,F(xiàn)LJ25967 ene,稱為MIAT,再次通過體外蛋白質(zhì)翻譯分析發(fā)現(xiàn),MIAT不編碼任何蛋白質(zhì),很可能是一個功能性的RNA。MIAT有5個外顯子,在外顯子5上的SNP變異增加了MIAT的轉(zhuǎn)錄,這項研究指出,SNP引起的MIAT表達水平的改變參與了冠心病的發(fā)病機制。

另一項對成年雄性C57/BL6小鼠的研究[28],發(fā)現(xiàn)手術(shù)結(jié)扎冠狀動脈造成急性心肌梗死24 h后,微陣列分析顯示,急性心肌梗死小鼠的心臟中有20個lncRNA表達上調(diào),并且有l(wèi)0個lncRNA表達下調(diào)(變化程度>2倍),其中有2種lncRNA,MIAT1和MIAT2升高最為顯著,分別為5倍和13倍。進一步分析后發(fā)現(xiàn),這兩種lncRNA的表達在急性心肌梗死后24 h達到高峰,在2 d后恢復至基線;通過原位雜交后發(fā)現(xiàn),MIAT1在急性心肌梗死小鼠左心室表達上調(diào);MIAT1和MIAT2與多個已知參與左心室重構(gòu)的蛋白質(zhì)編碼基因相關(guān),且小鼠MIAT1和MIAT2表達水平越高,其殘留射血分數(shù)越高。

在2014年的另一個臨床試驗中[29],納入了414例急性心肌梗死患者和86名健康人群,通過定量聚合酶鏈(PCR)方法測定并比較外周血細胞的5種lncRNA(包括MIAT)的表達水平,實驗結(jié)果顯示,在急性心肌梗死組和健康對照間,MIAT的表達水平基本相同;但是進一步的亞組分析顯示,急性ST段抬高型心肌梗死組中的MIAT表達水平低于非ST段抬高型心肌梗死組MIAT表達水平;在心血管危險因素分析中,MIAT與吸煙呈相關(guān)性;此外,MIAT與血液中淋巴細胞計數(shù)呈正相關(guān),與中性粒細胞計數(shù)、血小板計數(shù)呈負相關(guān);最后根據(jù)對入組患者4個月后的隨訪顯示,MIAT是預測左心室功能障礙的一個重要指標。

目前,MIAT的功能仍在進一步探究中,需要進一步的研究闡明該基因是通過何種方式參與心肌梗死發(fā)病機制的,將有助于急性心肌梗死的診斷和治療。

目前對lncRNA的研究存在的困難是:lncRNA的表達水平較低且模式多樣化,且許多l(xiāng)ncRNA的敲除并不會引起明顯的生物學改變。我們相信隨著人類對表觀遺傳學、lncRNA研究以及醫(yī)學信息學發(fā)展的深入,在不久的將來,會有更多的lncRNAs被證明參與心血管疾病的發(fā)生和發(fā)展,并為心血管疾病提供新的治療靶點。

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R541.4

A

1007-9688(2017)03-0355-03

10.3969/j.issn.1007-9688.2017.03.030

2016-07-22)

黃光楠(1992-),男,在讀碩士研究生,研究方向為冠心病介入與臨床。

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