唐 蓮,江叔芳,唐 歡
(湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院,湖南長(zhǎng)沙410128)
狼源和羊源長(zhǎng)角血蜱體內(nèi)菌群分析
唐 蓮,江叔芳,唐 歡※
(湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院,湖南長(zhǎng)沙410128)
采用PC R-D G G E技術(shù)分析狼、羊長(zhǎng)角血蜱體內(nèi)攜帶菌群情況。無(wú)菌條件下將樣品用液氮研磨成粉,試劑盒提取細(xì)菌總D N A;通用引物擴(kuò)增細(xì)菌16S rD N A V3區(qū)并進(jìn)行D G G E電泳,分析、選取7條優(yōu)勢(shì)條帶,回收克隆測(cè)序。結(jié)果顯示,狼、羊長(zhǎng)角血蜱體內(nèi)共攜帶7種優(yōu)勢(shì)菌,其中蘭斯格軍團(tuán)桿菌(Legionella lansingensis)、皮可克立克次氏體(Rickettsia peacockii)、R SV70AB1-2細(xì)菌(Bact eri um SV70AB1-2)、J N C ZJ b F1細(xì)菌(Bact eri um J N C ZJ b F1)為二者共有;不動(dòng)桿菌屬(Acinetobacter sp)和一種不可培養(yǎng)的細(xì)菌存在于狼源長(zhǎng)角血蜱體內(nèi);拉烏爾特立克次氏體(Rickettsia raoultii)存在羊源長(zhǎng)角血蜱體內(nèi)。長(zhǎng)角血蜱寄生在不同宿主體內(nèi)所攜帶優(yōu)勢(shì)菌群存在一定差異。
PC R-D G G E;長(zhǎng)角血蜱;微生物菌群
蜱(Ti ck)是一類依靠吸食動(dòng)物血液為生的體外寄生蟲(chóng),隸屬節(jié)肢動(dòng)物門、蛛形綱、蜱螨目,蜱總科,蜱總科分為軟蜱科、硬蜱科、納蜱科三種。全世界已知蜱類有3科18屬897種,中國(guó)有2科10屬119種[1]。長(zhǎng)角血蜱分孤雌生殖[2]和兩性生殖2個(gè)種群,是我國(guó)的優(yōu)勢(shì)蜱種之一,廣泛分布于我國(guó)17個(gè)省市區(qū)[3]。它侵襲人和黃牛、馬、綿羊、山羊、犬、鹿、刺猬等多種動(dòng)物,是伊氏埃立克體[4]、嗜吞噬細(xì)胞無(wú)形體[5]、發(fā)熱伴血小板減少綜合征病毒[6]、瑟氏泰勒蟲(chóng)等多種病原體的傳播媒介,具有重要的流行病學(xué)意義。目前,長(zhǎng)角血蜱寄生在不同宿主攜帶菌群情況報(bào)道較少。本文采用PCR-DGGE技術(shù),旨在揭示狼、羊長(zhǎng)角血蜱體內(nèi)攜帶菌群結(jié)構(gòu),為防治蜱及蜱傳染病提供科學(xué)依據(jù)。
1.1 材料
1.1.1 長(zhǎng)角血蜱
樣品分別采自湖南省長(zhǎng)沙市生態(tài)動(dòng)物園狼體表和河南省信陽(yáng)市家羊體表,經(jīng)體視顯微鏡和分子生物學(xué)鑒定為長(zhǎng)角血蜱,樣品液氮中保存。
1.1.2 主要試劑及儀器
2×EasyTaq PCR SuperM i x,由北京全式金生物技術(shù)有限公司出品;細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒、DNA片段快速純化/回收試劑盒,由天根生化科技(北京)有限公司出品;變性梯度凝膠電泳儀系統(tǒng)(DGGEK-2001),由美國(guó)CBS公司;凝膠成像系統(tǒng)(Quant um ST5),由法國(guó)Vi l berl ourm at公司出品。
1.1.3 擴(kuò)增引物
以341f和907r為引物擴(kuò)增16SrDNA,其序列為:341f(5’-CCTACGGAGGCAGCAG-3’)/907f(5’-CC CCGTCAATTCATTTGAGTTT-3’);以341f-GC/518R為引物,擴(kuò)增16SrDNA V3其序列為:341f-GC(5’-CGCCCGCCGCGCGCGGCGGGCGGGGCGGGGGC ACGGGGGG CCTACGGAGCAGCAG-3’)/518R(5’-ATTACCGCGGCTGCTGG-3’)。
1.2 方法
1.2.1 細(xì)菌DNA的提取
分別采自狼、羊體表長(zhǎng)角血蜱飽血、半飽血雌成蜱若干,用75%乙醇清洗消毒,將樣品于液氮研磨成粉。參照細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒提取DNA。
1.2.2 細(xì)菌16S rDNA V3區(qū)的擴(kuò)增與純化
以341f和907r為引物,分別擴(kuò)增狼、羊長(zhǎng)角血蜱體內(nèi)細(xì)菌DNA。反應(yīng)體系(50μL):細(xì)菌DNA 2.0 μL,上、下游引物各1.0 μL,2×EasyTaq PCR SuperM i x25.0 μL,ddH2O 21.0 μL。反應(yīng)參數(shù):94℃預(yù)變性5m i n;94℃預(yù)變性30s,61.5℃退火30s,72℃延伸34s;34個(gè)循環(huán);72℃延伸7m i n。取5.0 μL產(chǎn)物用于1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。
以第一次PCR產(chǎn)物為模板,341f-GC和518R為引物擴(kuò)增狼、羊長(zhǎng)角血蜱體內(nèi)細(xì)菌16S rDNA V3區(qū)。反應(yīng)體系(50μL)為:第一次PCR產(chǎn)物1.0 μL,上、下游引物各1.0 μL,2×TransH i FiSuperM i x 25.0 μL,ddH2O 22.0 μL。擴(kuò)增條件:95℃預(yù)變性5m i n;95℃預(yù)變性30s,66℃退火30s,72℃延伸12s;32個(gè)循環(huán);72℃延伸7m i n。取5.0 μL產(chǎn)物用于1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。PCR產(chǎn)物用DNA片段快速純化/回收試劑盒回收。
1.2.3 變性梯度凝膠電泳(DGGE)
制備6%(w/v)的聚丙烯酰胺凝膠,取純化擴(kuò)增產(chǎn)物10μL加入凝膠樣品孔進(jìn)行電泳。電泳條件:60℃、200V,1×TAE電泳10h。EB染色20m i n后,用Quant um ST5凝膠成像系統(tǒng)儀拍照。
1.2.4 切膠回收與測(cè)序
從DGGE凝膠切下優(yōu)勢(shì)條帶,用ddH2O清洗3次后搗碎,再加入50μL無(wú)菌水,置于4℃條件過(guò)夜。將過(guò)夜產(chǎn)物于12 000×g離心5m i n,收集上清液。以此為模板,用引物341f和518R進(jìn)行16S rDNA V3區(qū)PCR擴(kuò)增。擴(kuò)增參數(shù):95℃預(yù)變性5m i n;95℃預(yù)變性30s,53℃退火30s,72℃延伸12s;32個(gè)循環(huán);72℃延伸7m i n。取5.0 μL產(chǎn)物用于瓊脂糖凝膠電泳檢查,以DNA片段快速純化/回收試劑盒回收PCR產(chǎn)物,純化產(chǎn)物送華大基因公司測(cè)序。
1.2.5 數(shù)據(jù)處理
將公司所測(cè)序列用DNAm an比對(duì)、分析,全長(zhǎng)序列上傳至GeneBank數(shù)據(jù)庫(kù),Bl ast n搜索同源性和相似性最高的序列。
2.1 細(xì)菌16S rD N A PC R結(jié)果
以341f和907r為引物擴(kuò)增采自狼、羊長(zhǎng)角血蜱體內(nèi)細(xì)菌總DNA,其片段大小約為600bp,與預(yù)測(cè)大小一致(圖1)。
圖1 長(zhǎng)角血蜱體內(nèi)細(xì)菌16S rD N A PC R擴(kuò)增結(jié)果(M:M arker;1:羊源長(zhǎng)角血蜱;2:狼源長(zhǎng)角血蜱;N:陰性對(duì)照)
2.2 細(xì)菌16S rD N A V3區(qū)PC R擴(kuò)增結(jié)果
以341f-GC和518R為引物擴(kuò)增細(xì)菌16SrDNA V3區(qū),其片段大小約為250bp,與預(yù)測(cè)大小相符(圖2)。
圖2 長(zhǎng)角血蜱體內(nèi)細(xì)菌16SrD N A V3區(qū)PC R擴(kuò)增結(jié)果(M:M arker;1:羊源長(zhǎng)角血蜱;2:狼源長(zhǎng)角血蜱)
2.3 細(xì)菌16S rD N A V3區(qū)D G G E電泳圖譜分析
狼、羊長(zhǎng)角血蜱體內(nèi)細(xì)菌16S rDNA V3區(qū)DGGE電泳如圖3。由圖可知,狼、羊長(zhǎng)角血蜱體內(nèi)共攜帶7條優(yōu)勢(shì)菌,其中條帶2、條帶3、條帶5、條帶6為二者共有,條帶1、條帶7僅存在狼源長(zhǎng)角血蜱體內(nèi),條帶4僅存在羊源長(zhǎng)角血蜱體內(nèi)。詳細(xì)見(jiàn)表1。
圖3 狼、羊長(zhǎng)角血蜱體內(nèi)細(xì)菌D G G E電泳圖(N:陰性對(duì)照;1:狼源長(zhǎng)角血蜱;2:羊源長(zhǎng)角血蜱)
表1 D G G E凝膠中回收條帶序列分析結(jié)果
2.4 結(jié)果分析
本實(shí)驗(yàn)采集了7個(gè)優(yōu)勢(shì)條帶,經(jīng)華大基因公司測(cè)序后,獲取的基因序列與Genbank中登錄的基因序列比對(duì)的結(jié)果如表1。從表1可以直觀看出,狼、羊長(zhǎng)角血蜱體內(nèi)的主要優(yōu)勢(shì)菌為不動(dòng)桿菌屬(Acinetobacter sp)、蘭斯格軍團(tuán)桿菌(Legionella lansingensis)、立克次氏體(Rickettsia)、SV70AB1-2細(xì)菌(Bact eri um SV70AB1-2)、JNCZJb F1細(xì)菌(Bact eri um JNCZJb F1)和一種不可培養(yǎng)的細(xì)菌,與Genbank數(shù)據(jù)庫(kù)已知序列具有高度的同源性和相似性。結(jié)果表明,狼源和羊源長(zhǎng)角血蜱體內(nèi)攜帶的優(yōu)勢(shì)菌存在一定的差異,狼源相對(duì)二者共有菌多出2種,而羊源只多出一種。
動(dòng)物胃腸道內(nèi)寄生著大量的的微生物菌群,采用傳統(tǒng)的方法無(wú)法準(zhǔn)確分析物種豐度和均勻度[7]。目前,熒光原位雜交(FISH)、變性梯度凝膠電泳(DGGE)、基因的限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RFLP)、熒光定量PCR等分子生物學(xué)技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用于動(dòng)物胃腸道微生物研究領(lǐng)域[8]。但在蜱腸道微生物研究方面,DGGE報(bào)道較少[9]。本文采用PCR-DGGE技術(shù)分析狼、羊長(zhǎng)角血蜱體內(nèi)攜帶菌群情況。
本次實(shí)驗(yàn)從狼、羊長(zhǎng)角血蜱體內(nèi)檢測(cè)到7種優(yōu)勢(shì)菌,它們分別為不動(dòng)桿菌屬、皮可克立克次氏體、RSV70AB1-2細(xì)菌、蘭斯格軍團(tuán)桿菌、JNCZJb F1細(xì)菌、拉烏爾特立克次氏體(R.raoultii)及一種不可培養(yǎng)的細(xì)菌。對(duì)于吸血的節(jié)肢動(dòng)物而言,腸道菌群在不斷變化,吸血后,中腸細(xì)菌群體會(huì)經(jīng)歷先增后減的過(guò)程[10]。李春紅[11]等采用細(xì)菌學(xué)方法從未吸血的長(zhǎng)角血蜱腸道內(nèi)分離到5個(gè)菌屬:葡萄球菌屬、考克氏菌屬、短桿菌屬、顯核菌屬和微桿菌屬;廖芷卉[9]等采用PCR-DGGE技術(shù)對(duì)羊源長(zhǎng)角血蜱吸血后中腸優(yōu)勢(shì)菌群進(jìn)行檢測(cè),分離到7個(gè)菌屬:柯克斯氏體屬、腸桿菌屬、泛菌屬、綠膿桿菌屬、克雷伯氏菌屬、假單胞菌屬、歐文氏菌屬,此二者研究證實(shí),長(zhǎng)角血蜱腸道菌群在在吸血前后存在差異。除此以外,同一種蜱在不同生長(zhǎng)發(fā)育階段、不同的地域體內(nèi)菌群結(jié)構(gòu)也有所不同。楊亞[12]等從河南信陽(yáng)、湖南岳陽(yáng)、山西太谷地區(qū)褐黃血蜱中腸內(nèi)容物中檢測(cè)發(fā)現(xiàn):半飽血雌成蜱和吸血雄成蜱中腸菌群結(jié)構(gòu)基本相同,但飽血雌成蜱3個(gè)地區(qū)間具有較大的差異。本次實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,長(zhǎng)角血蜱寄生在狼、羊宿主所攜帶菌群之間存在差異。
從長(zhǎng)角血蜱分離到的細(xì)菌,在其他蜱中也有報(bào)道。Ni ebyl ski[13]等從安氏革蜱中檢測(cè)到了皮科克立克次,W en等[14]證實(shí),從我國(guó)黑龍江地區(qū)的森林革蜱體內(nèi)含有R raoultii。唐昊等[15]從微小牛蜱中腸內(nèi)容物中分離到2株立克次氏體:斯洛伐克立克次氏體、拉烏爾特立克次氏體,其它蜱如篦子硬蜱,褐黃血蜱、鐮形扇頭蜱、中華革蜱等都是類似報(bào)道。皮科克立克次體為蜱蟲(chóng)胞內(nèi)共生菌,對(duì)蜱蟲(chóng)的生長(zhǎng)和發(fā)育有著重要作用;拉烏爾特立克次氏體屬斑點(diǎn)熱群立克次氏體,它能夠引起人和動(dòng)物發(fā)生壞死紅斑和淋巴結(jié)病[16];蘭斯格軍團(tuán)桿菌它能夠引起肺炎;不動(dòng)桿菌容易引起創(chuàng)口發(fā)炎。由此可見(jiàn),長(zhǎng)角血蜱即是保菌宿主也是傳播媒介。
綜上所述,狼、羊長(zhǎng)角血蜱體內(nèi)攜帶菌群存在差異,可為蜱及蜱傳染病的防治提供參考。
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C
1006-4907(2016)04-0036-04
10.3969/j.i ssn.1006-4907.2016.04.020
2016-05-31
湖南省教育廳項(xiàng)目(N o.14B092)。作者簡(jiǎn)介:唐蓮(1990~),女,本科,動(dòng)物醫(yī)學(xué)專業(yè),m 15974244003@163.com。
※通訊作者:唐歡(1990~),男,碩士研究生,主要從事蜱及蜱傳病研究,13975814172@163.com。