尹鮮思,王少嶺,崔益平,陳秋紅,王國(guó)梁,2,王志龍*
(1.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,湖南 長(zhǎng)沙 410128;2.美國(guó)俄亥俄州立大學(xué)植物病理系,俄亥俄 哥倫布 43210)
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抗水稻黑條矮縮病轉(zhuǎn)基因材料的鑒定分析
尹鮮思1,王少嶺1,崔益平1,陳秋紅1,王國(guó)梁1,2,王志龍1*
(1.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,湖南 長(zhǎng)沙 410128;2.美國(guó)俄亥俄州立大學(xué)植物病理系,俄亥俄 哥倫布 43210)
針對(duì)水稻黑條矮縮病毒(RBSDV)的核心粒子外殼蛋白基因(S8)、毒質(zhì)與非結(jié)構(gòu)蛋白基因(S9)及其嵌合基因(S8&S9)構(gòu)建了6個(gè)RNAi載體,經(jīng)農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化武陵粳1號(hào)獲得轉(zhuǎn)基因植株。通過(guò)潮霉素溶液浸泡法對(duì)轉(zhuǎn)基因植株進(jìn)行初步篩選,剔除假陽(yáng)性植株;再通過(guò)PCR從DNA水平進(jìn)行轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性鑒定;進(jìn)一步通過(guò)qRT–PCR 從RNA水平進(jìn)行轉(zhuǎn)基因表達(dá)量分析。選取qRT–PCR表達(dá)量高的單拷貝純系S8后代進(jìn)行灰飛虱傳毒試驗(yàn),結(jié)果表明,含有S8 RNAi片段的轉(zhuǎn)基因水稻材料對(duì)RBSDV具有一定抗性。
水稻;水稻黑條矮縮??;轉(zhuǎn)基因株系;RNA干擾;熒光定量PCR
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水稻黑條矮縮病是由水稻黑條矮縮病毒(RBSDV)引起的一種病毒性病害,發(fā)病植株表現(xiàn)為矮化、分蘗增多,葉片短闊、僵直,葉色濃綠,葉脈和莖稈呈蠟白色,漸變?yōu)楹稚虠l瘤狀隆起,穗小或不抽穗結(jié)實(shí)[1–3]。RBSDV的宿主主要有水稻、玉米、小麥等禾本科植株,其傳播媒介為灰飛虱和白背飛虱[4–6]。水稻黑條矮縮病20世紀(jì)50年代在日本被首次報(bào)道[7],并于1968年大規(guī)模暴發(fā),導(dǎo)致糧食減產(chǎn)絕收[8]。20世紀(jì) 60年代在中國(guó)首次被報(bào)道[9–10]。20世紀(jì)90年代末以來(lái),在中國(guó)南方稻區(qū)再次暴發(fā)流行,造成水稻大面積減產(chǎn)[11]。
水稻黑條矮縮病毒屬呼腸孤病毒科斐濟(jì)病毒屬,其病毒粒子為直徑75~80 nm的二十面體,包含雙層衣殼[12–13],具有外層衣殼上的 A–突起和核心粒子表面的 B–突起[14]。RBSDV全基因組由 10條雙鏈RNA(dsRNA)組成[15],分別命名為S1~S10,其對(duì)應(yīng)編碼蛋白分別為P1~P10,其中,S8具有1 927 bp,P8的相對(duì)分子質(zhì)量為65 000,屬小核衣殼結(jié)構(gòu)蛋白,在RBSDV侵染過(guò)程中抑制轉(zhuǎn)錄[16]。S9具有1 900 bp,含2個(gè)非重疊ORFs,分別編碼P9–1和P9–2,P9–1為聚集在侵染細(xì)胞的病毒基質(zhì),參與病毒復(fù)制和聚集,P9–2為非結(jié)構(gòu)蛋白[17]。
Jia等[18]針對(duì)P7–1基因進(jìn)行RNA干擾,有效抑制了病毒在昆蟲(chóng)媒介的傳播;Shimizu等[10]對(duì)P9–1進(jìn)行干擾,發(fā)現(xiàn)可以達(dá)到抗病效果。筆者針對(duì)水稻黑條矮縮病毒核心粒子外殼蛋白基因(S8)、毒質(zhì)與非結(jié)構(gòu)蛋白基因(S9)及 S8&S9嵌合片段,利用兩步法快速高效構(gòu)建了6個(gè)RNAi載體,經(jīng)農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化武陵粳 1號(hào),獲得陽(yáng)性轉(zhuǎn)基因植株,并通過(guò)qRT–PCR選擇雙鏈RNA表達(dá)量高的單拷貝純系進(jìn)行了灰飛虱傳毒試驗(yàn)與抗性評(píng)估,現(xiàn)將結(jié)果報(bào)道如下。
1.1材料
水稻武陵粳1號(hào)(高感RBSDV);已感染RBSDV水稻病株及葉片(貯藏于–80 ℃冰箱,揚(yáng)州大學(xué)左示敏教授惠贈(zèng));灰飛虱(湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)飼養(yǎng))。
1.2方法
1.2.1RNA干擾載體的構(gòu)建
使用pENTR載體和pANDA載體,參照兩步法[19],構(gòu)建RBSDV S8、S9及S8&S9的RNA干擾載體(PCR引物見(jiàn)表1)。
表1 PCR和qRT–PCR引物信息Table 1 Sequence information for PCR and qRT–PCR primers
S8的RNAi干擾載體的構(gòu)建:以含有RBSDV的水稻葉片cDNA為模板,擴(kuò)增 S8干擾片段,將其連接到入門(mén)載體pENTR上,經(jīng)BamHI、XhoI雙酶切和測(cè)序驗(yàn)證后,再與目的載體pANDA進(jìn)行重組反應(yīng),陽(yáng)性重組子經(jīng)菌落PCR及KpnI、SacI雙酶切驗(yàn)證后,用于轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌。S9的RNAi干擾載體構(gòu)建與S8的相同。
S8–1&S9–2嵌合片段載體的構(gòu)建:以已構(gòu)建的pENTR–S8–1為模板,S8–1–F與A引物擴(kuò)增嵌合片段中的S8–1部分;以pENTR–S9–2為模板,B引物與S9–2–R引物擴(kuò)增嵌合片段中的S9–2部分,A引物與B引物為反向互補(bǔ)序列(表1),將2個(gè)片段分別切膠回收,共同作為模板,S8–1–F與S9–2–R引物擴(kuò)增整個(gè)嵌合片段,再連接到入門(mén)載體pENTR上,BamH I、XhoI雙酶切驗(yàn)證,測(cè)序正確后,與pANDA進(jìn)行重組反應(yīng),重組子采用菌落PCR和質(zhì)粒KpnI、SacI雙酶切驗(yàn)證,正確重組子用于轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌。S8–2&S9–1的 RNAi干擾載體構(gòu)建與S8–1&S9–2的相同。
1.2.2根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)的水稻遺傳轉(zhuǎn)化
運(yùn)用電擊法,將構(gòu)建的 RNAi載體 pANDA–S8/S9/S8&S9轉(zhuǎn)入根癌農(nóng)桿菌EHA105中,挑取陽(yáng)性克隆進(jìn)行PCR驗(yàn)證和雙酶切(KpnI和SacI)驗(yàn)證。采用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的水稻轉(zhuǎn)化法轉(zhuǎn)化水稻黑條矮縮病高感品種武陵粳1號(hào),采用潮霉素篩選法,獲得轉(zhuǎn)基因植株。
1.2.3轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性植株的鑒定與表達(dá)分析
將得到的轉(zhuǎn)基因 T1代植株從生根培養(yǎng)基上取出,洗凈根部培養(yǎng)基,移植到大田,待植株健壯后,剪取少許葉片置于含有潮霉素溶液(質(zhì)量分?jǐn)?shù)0.1%)的管子中浸泡5~7 d;選取潮霉素溶液鑒定陽(yáng)性(葉片仍為綠色)的植株,提取其葉片基因組 DNA,使用目的引物(表1)進(jìn)行轉(zhuǎn)基因PCR陽(yáng)性鑒定。再對(duì)PCR鑒定為陽(yáng)性的植株進(jìn)行qRT–PCR表達(dá)量分析,確定插入片段的轉(zhuǎn)錄水平,以鑒定轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性表達(dá)效率。進(jìn)一步選取轉(zhuǎn)基因T2代及T3代陽(yáng)性植株,進(jìn)行潮霉素溶液鑒定,PCR及qRT–PCR分析,篩選高表達(dá)目的片段的T3代單拷貝轉(zhuǎn)基因純系。
1.2.4灰飛虱室內(nèi)傳毒與轉(zhuǎn)基因植株的抗性鑒定
將挑選的T3代單拷貝轉(zhuǎn)基因純系浸種發(fā)芽,水稻幼苗在溫室采用長(zhǎng)日照培養(yǎng)(光照 14 h,溫度26 ℃,相對(duì)濕度80%;黑暗10 h,溫度20 ℃,相對(duì)濕度保持不變)。在人工氣候模擬培養(yǎng)箱中飼養(yǎng)灰飛虱,恒溫27 ℃,相對(duì)濕度70%,光照16 h。用感染RBSDV的水稻葉片飼養(yǎng)灰飛虱。待T3植株長(zhǎng)到四葉期進(jìn)行灰飛虱傳毒,持續(xù)20 d,期間不定時(shí)驅(qū)趕灰飛虱取食待傳毒水稻葉片,保證傳毒效率最大化。傳毒完成后,隨機(jī)抓取一定量傳毒灰飛虱,提取RNA,RT–PCR檢測(cè)其帶毒率。將完成傳毒的水稻幼苗移栽到大田中,觀察水稻抽穗期表型,確定水稻是否發(fā)病。
2.1RNAi載體的構(gòu)建與驗(yàn)證
選取編碼RBSDV結(jié)構(gòu)蛋白基因S8以及S9作為構(gòu)建RNAi干擾載體的候選基因,利用入門(mén)載體及LR重組反應(yīng)[19],構(gòu)建2個(gè)S8片段S8–1和S8–2以及2個(gè)S9片段S9–1和S9–2的干擾載體(圖1)。
圖1 RBSDV S8 RNAi載體的構(gòu)建Fig. 1 The construction of RNAi vector for RBSDV S8
為了增強(qiáng)干擾效果,將S8基因和S9基因利用Overlapping PCR方法拼接到一起構(gòu)成一個(gè)較大的RNA干擾片段,共構(gòu)建2個(gè)嵌合片段 S8–1&S9–2 和S8–2&S9–1的RNAi載體,pANDA–S8&S9的構(gòu)建如圖2所示。
圖2 RBSDV S8&S9 RNAi載體構(gòu)建Fig.2 The construction of RNAi vector for RBSDV S8&S9
2.2轉(zhuǎn)基因水稻植株的陽(yáng)性鑒定
對(duì)經(jīng)農(nóng)桿菌介導(dǎo)法轉(zhuǎn)化獲得的轉(zhuǎn)基因水稻植株,采取了潮霉素溶液浸泡法、PCR擴(kuò)增以及qRT–PCR表達(dá)量分析3個(gè)步驟進(jìn)行鑒定。
圖3 RBSDV S8–1轉(zhuǎn)基因植株的潮霉素浸泡鑒定結(jié)果Fig.3 The identification of transgenic plants with RBSDV S8–1 by hygromycin detection
將得到的轉(zhuǎn)基因 T1代植株采用潮霉素浸泡法進(jìn)行初步篩選。S8–1的RNAi轉(zhuǎn)基因株系,陽(yáng)性植株具有潮霉素抗性,葉片表現(xiàn)為綠色(如 CK+,已確定的轉(zhuǎn)基因植株),未轉(zhuǎn)基因的 CK–葉片呈黃色(圖3),由此初步鑒定1~8號(hào)、11~15號(hào)為轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性,9號(hào)和10號(hào)為轉(zhuǎn)基因陰性植株。將初步鑒定的轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性植株(1~8號(hào)、11~15號(hào))提取DNA,以未轉(zhuǎn)基因植株為陰性對(duì)照,載體pANDA–8–1為陽(yáng)性對(duì)照,使用目的片段引物進(jìn)行 PCR擴(kuò)增,如圖4–A所示。1~8號(hào)及11~15號(hào)的擴(kuò)增片段與陽(yáng)性對(duì)照大小一致,確定這13株植株中插入了目的基因片段。從中選取 7株(1、2、3、5、6、14、15號(hào))進(jìn)行qRT–PCR表達(dá)量分析,如圖4–B,以武陵粳1號(hào)為對(duì)照組(WT),RBSDV基因與水稻基因組無(wú)同源性,測(cè)量S8與水稻泛素基因(Ubiquitin,UBQ)的表達(dá)量比值(S8/UBQ),與對(duì)照組相比,7株轉(zhuǎn)基因材料相對(duì)表達(dá)量均有一定程度的增加,其中在8號(hào)植株中增加約60倍,在2號(hào)和14號(hào)植株中分別增加約36、41倍,進(jìn)一步表明RBSDV外源片段已導(dǎo)入水稻中,并且可以在水稻中轉(zhuǎn)錄,為轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性植株。對(duì)轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性植株的T2代,繼續(xù)采用上述3個(gè)步驟篩選,以獲得目的基因單拷貝插入的高表達(dá)株系,并篩選其T3代純系用于病毒傳毒鑒定。
圖4 RBSDV S8–1轉(zhuǎn)基因植株鑒定結(jié)果Fig.4 The identification of transgenic plants with RBSDV S8–1
按照以上篩選方式,對(duì)pANDA–S9–1轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性植株進(jìn)行鑒定,如圖 5–A所示。PCR鑒定顯示14株T1轉(zhuǎn)基因植株中,有12株(1~6號(hào)、9~14號(hào))為陽(yáng)性植株,2株(7、8號(hào))為陰性植株。選取2號(hào)和5號(hào)植株的T2代高表達(dá)株系進(jìn)行qRT–PCR表達(dá)量分析,結(jié)果(圖5–B)顯示,T2轉(zhuǎn)基因植株2–4的相對(duì)表達(dá)量高達(dá)約800倍,T2轉(zhuǎn)基因植株2–1和5–1的相對(duì)表達(dá)量約600倍,其余植株的相對(duì)表達(dá)量約200~400倍,這些高表達(dá)株系將用于篩選單拷貝的T3代純系。
圖5 RBSDV S9–1轉(zhuǎn)基因植株鑒定結(jié)果Fig.5 The identification of transgenic plants with RBSDV S9–1
同樣地,對(duì)pANDA–S8&S9轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性植株進(jìn)行鑒定,如圖6–A所示。結(jié)果顯示,17株T1轉(zhuǎn)基因植株中,有16株(1~11號(hào)、 13~17號(hào))為陽(yáng)性植株,1株(12號(hào))為陰性植株。選取1、25和30號(hào)植株的T2代進(jìn)行qRT–PCR表達(dá)量分析,結(jié)果顯示(圖6–B),植株1號(hào)的3株T2代(1–2號(hào)、1–4號(hào), 1–6 號(hào))相對(duì)表達(dá)量約為20~60倍,其余植株的相對(duì)表達(dá)量均低于20倍,相對(duì)表達(dá)量高于20倍的株系被考慮用于篩選T3代的單拷貝純系。
圖6 RBSDV S8–1&S9–2轉(zhuǎn)基因植株鑒定結(jié)果Fig.6 The identification of transgenic plants with RBSDV S8–1&S9–2
2.3轉(zhuǎn)基因水稻植株的傳毒接種與鑒定
在進(jìn)行傳毒試驗(yàn)之前,提取RBSDV病毒供體水稻單株材料葉片 RNA,采用 S8基因引物進(jìn)行RT–PCR分析,以水稻Ubiquitin基因作為對(duì)照,檢測(cè)供體材料帶毒情況,如圖 7–A所示。高表達(dá)RBSDV病毒S8基因的水稻單株4號(hào)和5號(hào)可以用來(lái)作為接種RBSDV的供體。
圖7 感染RBSDV水稻病株鑒定Fig.7 The identification of infected plants with RBSDV and inoculation of RBSDV by Lalielphax striatellus
根據(jù)圖4–B的qRT–PCR表達(dá)量分析結(jié)果,選取S8–1的6號(hào)轉(zhuǎn)基因株系T3后代純系種子,于播種后植株2~3葉期,開(kāi)始采用離體葉片法,進(jìn)行灰飛虱傳毒,如圖7–B所示。傳毒完成后,通過(guò)檢測(cè)傳毒灰飛虱的帶毒率來(lái)確定傳毒效果,若帶毒率高于80%便認(rèn)定傳毒有效。
經(jīng)有效傳毒后,植株在同等生長(zhǎng)條件下,繼續(xù)生長(zhǎng)25 d,觀察表型變化。已接受傳毒的武陵粳1號(hào)與轉(zhuǎn)基因材料相比,植株生長(zhǎng)緩慢,部分植株干枯而死,葉片上出現(xiàn)條紋病斑,而攜帶有 RBSDV 的S8–1 RNAi干擾載體的轉(zhuǎn)基因植株以及未進(jìn)行傳毒的武陵粳1號(hào)則正常生長(zhǎng),植物無(wú)枯死現(xiàn)象,葉片也無(wú)明顯病斑(圖 8–A、圖 8–B)。溫室接種數(shù)據(jù)初步表明,含有 S8–1 RNAi片段的轉(zhuǎn)基因材料對(duì)RBSDV具有一定抗性。
圖8 S8–1轉(zhuǎn)基因植株傳毒后的表型Fig.8 The phenotypes of S8–1 transgenic plants after RBSDV inoculation
水稻黑條矮縮病具暴發(fā)性、間歇性和遷移性,其防控難度極大。針對(duì)RBSDV的S8、S9及S8&S9嵌合基因,通過(guò)兩步法構(gòu)建了6個(gè)RNAi載體,轉(zhuǎn)化高感水稻品種武陵粳1號(hào),獲得了S8、S9及S8&S9 的RNAi轉(zhuǎn)基因材料。由于獲得的轉(zhuǎn)基因材料較多,因而先采用潮霉素浸泡法(較簡(jiǎn)便有效)對(duì)轉(zhuǎn)基因材料進(jìn)行初步篩選,排除假陽(yáng)性,以降低后續(xù)工作量。接著利用PCR鑒定目的基因是否整合到陽(yáng)性植株基因組中,再通過(guò)qRT–PCR測(cè)量目的基因在轉(zhuǎn)基因植株的相對(duì)表達(dá)量。通過(guò)上述對(duì)水稻轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性植株的層層遞進(jìn)鑒定,成功篩選到了 S8、S9及 S8&S9嵌合基因的RNAi轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性植株,為RBSDV室內(nèi)接種及田間抗性鑒定提供了材料基礎(chǔ)。
在進(jìn)行RBSDV室內(nèi)接種前,先確定田間采集的水稻矮化病株是否帶毒。在接種過(guò)程中,檢測(cè)了新鮮的及凍存的水稻帶毒葉片,發(fā)現(xiàn)二者均能使灰飛虱有效傳毒,特別是凍存的水稻帶毒葉片,能夠全年安排灰飛虱傳毒試驗(yàn),進(jìn)行田間抗性鑒定。
在目前獲得的轉(zhuǎn)基因材料中,僅對(duì)S8的RNAi株系進(jìn)行了室內(nèi)接種鑒定及表型觀察,初步結(jié)果表明,含有S8 RNAi片段的轉(zhuǎn)基因水稻對(duì)RBSDV具有一定抗性,但還有待大量接種病毒后的田間群體表型鑒定。同樣,含有S9以及S8&S9 RNAi片段的轉(zhuǎn)基因材料也需要室內(nèi)大量接種和田間群體表型鑒定。由于使用的目的載體pANDA含有篩選標(biāo)記抗潮霉素基因,考慮到水稻為重要糧食作物,將在后續(xù)試驗(yàn)中采用無(wú)篩選標(biāo)記轉(zhuǎn)基因技術(shù)獲取抗RBSDV的轉(zhuǎn)基因材料,以便用于水稻育種與種質(zhì)創(chuàng)新。
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責(zé)任編輯:羅慧敏
英文編輯:羅 維
Identification and analysis of transgenic lines against rice black-streaked dwarf virus
Yin Xiansi1, Wang Shaoling1, Cui Yiping1, Chen Qiuhong1, Wang Guoliang1,2, Wang Zhilong1*
(1.College of Agronomy, Hunan Agricultural University, Changsha 410128, China; 2.Department of Plant Pathology, The Ohio State University, Columbus, Ohio 43210, USA)
Genome segments S8 (encoding minor core capsid protein), S9 (encoding virplasm and non-structual protein) and their chimeric sequences S8&S9 of RBSDV were used to construct six RNAi vectors and transferred into rice cultivar Wulingjing 1 to generate transgenic plants by Agrobacterium-mediated transformation. Transgenic plants were first screened by immersion with hygromycin solution to eliminate the false-positive plants, then identified by PCR genotyping analysis from the DNA level,followed by qRT–PCR analysis of candidate genes at the RNA level. Single-copy transgenic lines with high expression of S8 detected by qRT–PCR were picked up for Laodelphax striatellus-mediated virus transmission test, and the results showed that transgenic lines containing S8 RNAi vector displayed resistance to RBSDV.
rice; rice black-streaked dwarf virus (RBSDV); transgenic lines; RNA interference (RNAi); qRT–PCR
;*通信作者,王志龍,博士,教授,主要從事作物遺傳育種與水稻抗逆分子生物學(xué)研究,zhilongwang@126.com
Q786
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1007-1032(2016)04-0380-06
2016–03–24 修回日期:2016–04–08
轉(zhuǎn)基因生物新品種培育重大專項(xiàng) (2012ZX08009001);教育部創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)發(fā)展計(jì)劃項(xiàng)目(IRT1239);湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)大學(xué)生創(chuàng)新性實(shí)驗(yàn)計(jì)劃項(xiàng)目(XCX15145)
尹鮮思(1990—),男,湖南邵陽(yáng)人,碩士研究生,主要從事水稻抗逆分子生物學(xué)研究,1614974545@qq.com;王少嶺為共同