問榮榮,王步勇,馬玲
(東北林業(yè)大學(xué)林學(xué)院,黑龍江 哈爾濱 150040)
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舞毒蛾LdGSTe1基因的克隆及表達(dá)
問榮榮,王步勇,馬玲*
(東北林業(yè)大學(xué)林學(xué)院,黑龍江 哈爾濱 150040)
從舞毒蛾(Lymantria dispar)3齡幼蟲轉(zhuǎn)錄組文庫中鑒定獲得舞毒蛾谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶基因全長cDNA,命名為 LdGSTe1。該基因全長 651 bp,編碼 216個氨基酸。序列分析顯示,LdGSTe1蛋白氨基酸序列含有GST_C_Delta_Epsilon與GST_N_Delta_Epsilon 2個保守結(jié)構(gòu)域,屬于類硫氧還蛋白和谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶2個超家族。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明,舞毒蛾LdGST蛋白屬于GST Epsilon家族。蛋白結(jié)構(gòu)顯示,LdGSTe1蛋白包含一個N端和一個C端結(jié)構(gòu),α-螺旋與β-折疊為主要結(jié)構(gòu)元件。實(shí)時熒光定量PCR結(jié)果表明,在4.0、10.0 mg/L魚藤酮藥劑處理下,舞毒蛾3齡幼蟲LdGSTe1基因表達(dá)先下降后上升,推測該基因參與舞毒蛾解毒應(yīng)答。
舞毒蛾;谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶(GST)基因;克??;基因表達(dá)
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谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶(glutathione S-transferase,GST)是由多個基因編碼的具有轉(zhuǎn)運(yùn)、信號傳導(dǎo)、解毒功能的超家族酶系,廣泛存在于動物、植物和微生物體內(nèi)[1-2]。依據(jù)細(xì)胞定位,GSTs可分為微粒體型、線粒體型和胞質(zhì)型?;诜植紡V泛和功能重要的特點(diǎn),胞質(zhì)GSTs成為研究最為廣泛和深入的類型。昆蟲胞質(zhì)GSTs 的主要功能是催化谷胱甘肽的巰基和一些毒親電子類物質(zhì)(如殺蟲劑、醌類化合物、α,β-不飽和羰基化合物及過氧化物等)進(jìn)行軛合反應(yīng),以及作為配體結(jié)合蛋白以俘獲有毒物質(zhì),行使解毒功能,參與殺蟲劑抗藥性的形成[3]。Chelvanayagam 等[4]將昆蟲胞質(zhì) GSTs 分為3類:第Ⅰ類為 Delta 亞族;第Ⅱ類分別為 Sigma、Omega、Theta 和 Zeta 4 個亞族;第Ⅲ類為 Epsilon亞族,其中Delta和Epsilon為昆蟲所特有,且 Delta亞族存在于所有昆蟲中,而 Epsilon 亞族僅在雙翅目、鞘翅目、鱗翅目昆蟲中出現(xiàn)。Robert[5]認(rèn)為Epsilon 亞族是從 Delta 亞族進(jìn)化來的,而不是由于基因丟失造成的。已有研究表明,Delta和Epsilon 類GSTs能夠催化谷胱甘肽化合物與外源的多種有害物質(zhì)進(jìn)行氧化還原反應(yīng),從而保護(hù)蛋白質(zhì)和核酸免受損傷[6],參與昆蟲抗藥性形成過程[7]。該兩類GSTs在殺蟲劑抗性中起到的重要作用得到廣泛關(guān)注[8-10]。
舞毒蛾(Lymantria dispar Linnaeus)是分布范圍較廣、周期性發(fā)生的農(nóng)林食葉害蟲,可取食數(shù)百種植物[11],嚴(yán)重危害農(nóng)林業(yè)生產(chǎn)。對舞毒蛾的防治以化學(xué)防治為主。隨著分子生物學(xué)的發(fā)展,利用基因工程技術(shù)防治農(nóng)林害蟲成為研究的熱點(diǎn)。通過調(diào)節(jié)參與機(jī)體至關(guān)重要功能的基因表達(dá)來干擾害蟲正常的生理功能已成為防治害蟲的新策略[12],因此,對昆蟲抗藥性形成相關(guān)的 GST基因進(jìn)行研究具有重要意義。谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶基因已在黑腹果蠅[13]、大劣按蚊[14]、小菜蛾[15]、紅火蟻[16]中被報(bào)道。筆者對舞毒蛾3齡幼蟲轉(zhuǎn)錄本文庫進(jìn)行分析,獲得舞毒蛾谷胱甘肽 S-轉(zhuǎn)移酶 Epsilon類基因(LdGSTe1)cDNA全長,并通過RT-PCR技術(shù)克隆驗(yàn)證。通過生物信息學(xué)分析,初步了解其結(jié)構(gòu)與功能。進(jìn)一步利用實(shí)時熒光定量PCR技術(shù)分析該基因?qū)χ参镌礆⑾x劑魚藤酮的脅迫響應(yīng)模式,現(xiàn)將結(jié)果報(bào)道如下。
1.1供試?yán)ハx
于小興安嶺涼水自然保護(hù)區(qū)(黑龍江省伊春市帶嶺區(qū)境內(nèi),地理坐標(biāo)為128°53′20″E,47°10′50″N)采集舞毒蛾卵塊。卵塊于(25±1) ℃、相對濕度75%、每天光照14 h、黑暗10 h條件下進(jìn)行孵化。幼蟲以相同條件進(jìn)行培養(yǎng)。人工飼料由中國林業(yè)科學(xué)研究院森林生態(tài)環(huán)境與保護(hù)研究所提供。收集長勢健康一致的舞毒蛾 3齡幼蟲,經(jīng) 0.1%焦碳酸二乙酯(DEPC)溶液沖洗后,-80 ℃冰箱存儲,備用。
1.2方法
1.2.1舞毒蛾LdGSTe1基因的克隆
采用Invitrogen Trizol Reagent RNA提取試劑盒,提取舞毒蛾 3齡幼蟲總 RNA。經(jīng) DNase I(Promega)消化去除DNA,紫外分光光度計(jì)和1.0%凝膠電泳檢測RNA質(zhì)量。取10 μg 總RNA用于合成第一鏈cDNA(TaKara反轉(zhuǎn)錄試劑盒),-20 ℃冰箱存儲,用于PCR擴(kuò)增模板。從轉(zhuǎn)錄組文庫中獲得編號為Unigene 27032的序列,對其進(jìn)行BLAST分析,根據(jù)功能注釋結(jié)果查找獲得LdGSTe1基因。
利用Primer 5.0設(shè)計(jì)引物L(fēng)dGSTe1-F (5'-CGGT GTATAAATTGAATGCTAGTC-3')和LdGSTe1-R(5'-ATAGAGAAACGAATGAACCAGG-3'),以舞毒蛾3齡幼蟲總RNA合成的第一鏈cDNA為模板進(jìn)行基因RT-PCR擴(kuò)增,測序驗(yàn)證LdGSTe1基因序列。25 μL RT-PCR擴(kuò)增體系:cDNA 0.5 μL、dNTP Mix 2 μL、10×Buffer 2.5 μL、LdGSTe1-F 1 μL、LdGSTe1-R 1 μL、rTaq 0.5 μL、ddH2O 17.5 μL。反應(yīng)條件:94 ℃預(yù)變性2 min,94 ℃變性30 s,56 ℃退火30 s,72 ℃延伸2 min,30個循環(huán);72 ℃延伸10 min。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng) 1.0%凝膠檢測后,采用切膠回收試劑盒(Omega公司產(chǎn)品)回收目的片段,經(jīng)pMD18-T連接、DH5α轉(zhuǎn)化,挑取陽性單克隆菌落測序。
1.2.2舞毒蛾LdGSTe1基因的生物信息學(xué)分析
利用 NCBI ORF-Finder翻譯編碼蛋白氨基酸序列,并對開放閱讀框進(jìn)行分析。利用 ExPASy ProtParam對編碼蛋白的相對分子質(zhì)量、等電點(diǎn)進(jìn)行分析[17]。采用SignalP 4.1分析編碼蛋白信號肽。用在線工具NetPhos 2.0 Server對蛋白潛在磷酸化位點(diǎn)進(jìn)行分析[18]。用Conserved Domains在線工具對蛋白保守區(qū)域進(jìn)行預(yù)測。用 Bioedit進(jìn)行多序列比對分析,用MEGA 6.0進(jìn)行發(fā)育樹構(gòu)建分析。利用 SWISS-MODEL自動建模方式構(gòu)建三維模型[19-21]。
1.2.3舞毒蛾LdGSTe1基因的表達(dá)
采用點(diǎn)滴觸殺法對舞毒蛾3齡幼蟲進(jìn)行致毒處理:用DMSO溶液將魚藤酮母液分別配制成4、10 mg/L的藥液,用微量點(diǎn)滴儀將稀釋液滴于舞毒蛾3齡幼蟲的前胸背板,每頭試蟲點(diǎn)滴3 μL藥液,每組處理30頭試蟲,對照組點(diǎn)滴DMSO溶液,分別于處理后12、24、36、48、60 h隨機(jī)收集5頭活潑試蟲,提取總RNA,DNase I消去DNA,采用TaKara反轉(zhuǎn)錄試劑盒合成cDNA,-20 ℃冰箱保存。實(shí)時熒光定量 PCR試劑盒為 KOD SYBR qPCR Mix (TOYOBO)。根據(jù)LdGSTe1基因序列設(shè)計(jì)熒光定量PCR引物L(fēng)dGSTe1-qF(5'-TTGGGACAGTCACGCA ATAG-3')和 LdGSTe1-qR(5'-CCAGCCATGGAGAT GTGAATAA-3');以舞毒蛾Actin基因?yàn)閮?nèi)參基因,引物為Action-qF(ATGTTAGTATGATCGAGCGTAT CG)和Action-qR(GCATGATCTGAGGAGCATCTT))。實(shí)時熒光定量PCR反應(yīng)程序:95 ℃預(yù)變性2 min;95 ℃變性15 s,58 ℃退火15 s,72 ℃延伸45 s,40循環(huán);95 ℃變性15 s,60 ℃延伸1 min,95 ℃變性15 s,進(jìn)行溶解曲線反應(yīng)。設(shè)置3個重復(fù),采用文獻(xiàn)[22]的方法計(jì)算目的基因的相對表達(dá)量。
2.1舞毒蛾LdGSTe1基因的克隆結(jié)果
對舞毒蛾3齡幼蟲轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,獲得了 1個舞毒蛾 GST基因(轉(zhuǎn)錄組文庫中編號為Unigene 27032)的全長cDNA序列。以舞毒蛾3齡幼蟲的cDNA為模板,通過RT-PCR擴(kuò)增,電泳檢測為單一條帶,經(jīng)測序驗(yàn)證,所得序列與預(yù)期基因的全長cDNA序列大小一致。BLAST分析顯示其屬于GST家族Epsilon類基因,故命名為LdGSTe1。LdGSTe1基因開放閱讀框(ORF)長為651 bp,編碼216個氨基酸(圖1)。
2.2舞毒蛾LdGSTe1基因的生物信息學(xué)
圖2 舞毒蛾LdGSTe1蛋白保守區(qū)預(yù)測Fig.2 Conserved domains of LdGSTe1 protein in L. dispar
ProtParam預(yù)測編碼蛋白基本理化特性,推測LdGSTe1分子式為C1101H1735N285O318S9,相對分子質(zhì)量為24 340,理論等電點(diǎn)為6.90,不穩(wěn)定系數(shù)(II)為28.10,為穩(wěn)定性蛋白,總平均疏水指數(shù)為-0.156,為親水性蛋白。TMpred和SignalP 4.1預(yù)測顯示該蛋白無信號肽和跨膜區(qū)。PSORT Prediction預(yù)測該蛋白位于細(xì)胞核內(nèi)。NetPhos 2.0 Server顯示,LdGSTe1蛋白含有4個絲氨酸磷酸化位點(diǎn)和2個蘇氨酸磷酸化位點(diǎn)及 4個絡(luò)氨酸磷酸化位點(diǎn)。NCBI 的CDD對LdGSTe1蛋白保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測顯示,LdGSTe1蛋白屬于GST家族蛋白(圖2),在第3~77位為保守的N端結(jié)構(gòu)域GST_N_Delta_Epsilon,在第91~207位為C端結(jié)構(gòu)域GST_C_Delta_Epsilon。
通過NCBI BLASTP對舞毒蛾LdGSTe1蛋白進(jìn)行在線比對,選出與其同源性較高(52%~58%)的其他昆蟲的14種GST蛋白,并利用Bioedit進(jìn)行多序列比對分析。結(jié)果(圖3)顯示,LdGSTe1蛋白在進(jìn)化上高度保守,屬于GST家族 Epsilon蛋白,預(yù)測這些物種間存在共同起源。
圖3 舞毒蛾LdGSTe1蛋白與其他昆蟲GST Epsilon蛋白的多序列比對Fig.3 Multiple sequence alignment of LdGSTe1 with GST Epsilon proteins in other inserts
應(yīng)用SWISS-MODEL軟件,于PBD庫中尋找LdGSTe1蛋白的同源蛋白,構(gòu)建三維模型(圖4)。結(jié)果顯示,舞毒蛾LdGSTe1蛋白包含1個N端結(jié)構(gòu)域和1個C端結(jié)構(gòu)域。N端結(jié)構(gòu)域?yàn)楣入赘孰牡慕Y(jié)合區(qū)域,含有7個α-螺旋和4個β-折疊;C端為識別并結(jié)合底物區(qū)域,含有9個α-螺旋和4個β-折疊。α-螺旋和β-折疊是其主要結(jié)構(gòu)元件。
圖4 舞毒蛾LdGSTe1蛋白的三維結(jié)構(gòu)模擬Fig.4 Protein three-dimensional structure of LdGSTe1
利用MEGA 6.0軟件進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹分析,來研究昆蟲間GST蛋白的進(jìn)化關(guān)系。圖5結(jié)果表明,Delta和Epsilon家族處于同一分支,再與Theta家族聚為一族;Omega和Zeta家族聚類在一起,再與Delta、Epsilon及Theta家族聚為一族。Sigma家族與其他5個家族距離較遠(yuǎn),獨(dú)立成族,這與張學(xué)堯等[23]對飛蝗 LmGST的進(jìn)化樹分析結(jié)果一致。LdGSTe1與家蠶、稻縱卷葉螟中Epsilon家族GST聚為一族,因此推測該基因?qū)儆谖瓒径闓ST Epsilon家族。
圖5 舞毒蛾LdGSTe1蛋白系統(tǒng)進(jìn)化樹Fig.5 Phylogenetic tree analysis of LdGSTe1 protein in L. dispar
2.3魚藤酮脅迫對舞毒蛾LdGSTe1基因表達(dá)的影響
為研究植物源殺蟲劑魚藤酮對舞毒蛾3齡幼蟲LdGSTe1基因表達(dá)的影響,采用實(shí)時熒光定量PCR法,分析LdGSTe1基因在質(zhì)量濃度分別為4.0、10.0 mg/L的魚藤酮處理不同時間后的表達(dá)差異,結(jié)果表明,在4.0 mg/L和10.0 mg/L的魚藤酮處理下,舞毒蛾3齡幼蟲LdGSTe1基因表達(dá)均先下降后上升。4.0 mg/L魚藤酮處理12、24、36、48 h,LdGSTe1基因表達(dá)量均下降,處理12 h基因表達(dá)量最低,為對照的11%;處理60 h,LdGSTe1基因表達(dá)量上升,為對照的3.81倍。10.0 mg/L的魚藤酮處理12、24、36 h,LdGSTe1基因表達(dá)量均下降,處理24 h時基因表達(dá)量最低,為對照的 9%;處理 48、60 h,LdGSTe1基因表達(dá)量上升,處理 60 h時LdGSTe1基因表達(dá)量最大,為對照的3.6倍。
圖6 魚藤酮處理的舞毒蛾3齡幼蟲LdGSTe1基因的相對表達(dá)量Fig.6 LdGSTe1 gene expression in 3rdinstar larvae of L. dispar under rotenone stress
本研究通過轉(zhuǎn)錄組分析和RT-PCR擴(kuò)增,獲得1個舞毒蛾GST Epsilon家族基因,命名為LdGSTe1,該基因編碼一個由216個氨基酸組成的多肽,這與已報(bào)道的鱗翅目昆蟲煙夜蛾(Helicoverpa assulta)HaGSTe1編碼區(qū)推導(dǎo)表達(dá)217個氨基酸殘基[24]較為一致。煙夜蛾 HaGST 與其他物種 Epsilon 家族GSTs 結(jié)構(gòu)一樣,在 N端由 β-α-β-α-β-β-α的結(jié)構(gòu)基序組成,C端主要有5個α螺旋構(gòu)成,而舞毒蛾LdGSTe1蛋白N端結(jié)構(gòu)域含有4個β-折疊和7 個α-螺旋,C端含有9個α-螺旋和4個β-折疊,推測其結(jié)合的底物存在特異性。NCBI對LdGST蛋白保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測顯示,第3~77位為保守的N端結(jié)構(gòu)域GST_N_Delta_Epsilon,在第91~207位為C端結(jié)構(gòu)域GST_C_Delta_ Epsilon,同源氨基酸比對和系統(tǒng)發(fā)育分析顯示,舞毒蛾GST屬于Epsilon家族,這可能是由于Epsilon 亞族是從Delta 亞族進(jìn)化而來的緣故[5]。
昆蟲GST家族中Delta和Epsilon家族已被證實(shí)參與昆蟲抗藥性形成[7]。已有研究發(fā)現(xiàn),雙翅目昆蟲中埃及伊蚊 AaGSTe2和岡比亞按蚊 AgGSTe2 對DDT、有機(jī)磷農(nóng)藥和擬除蟲菊酯類農(nóng)藥均具有代謝作用[25];黑腹果蠅DmGSTe6和DmGSTe7基因?qū)谆鶎α蛄拙哂写x作用[26];鱗翅目昆蟲中家蠶GST Epsilon家族具有過氧化酶活性和抗氧化壓力的功能[27-28]。研究[29]表明,GSTs 參與抗藥性的機(jī)制是由于其表達(dá)量的提高。本研究通過實(shí)時熒光定量PCR檢測顯示,舞毒蛾3齡幼蟲經(jīng)魚藤酮觸殺后,LdGSTe1基因相對表達(dá)量在后期出現(xiàn)上升,推測其過量表達(dá)參與了解毒反應(yīng)。
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責(zé)任編輯:羅慧敏
英文編輯:羅 維
Cloning and functional analysis of GSTe1 gene from Lymantria dispar
Wen Rongrong, Wang Buyong, Ma Ling*
(School of Forestry, Northeast Forestry University, Harbin 150040, China)
Accroding to the transcriptome of the 3rdinstar larva of Lymantria dispar(L. dispar), a Glutathione S-transferase gene was determined and obtained, which named LdGSTe1. The open reading frame (ORF) of LdGSTe1 was 651 bp encoding a protein of 216 amino acid residues. Sequence analysis showed that the amino acid sequences of LdGSTe1 protein contained two conserved domains, namely GST_C_Delta_Epsilon and GST_N_Delta_Epsilon,belonging to the thioredoxin-like superfamily and glutathione S-transferase superfamily. Phylogenetic tree analysis indicated that the LdGST belonged to GST Epsilon family. Protein structure showed LdGSTe1 contains an N-terminal and C-terminal, and organized mainly into α-helix and β-sheet. The expression of LdGSTe1 in 3rdinstar larvae L. Dispar under 4.0, 10.0 mg/L rotenone treatment was investigated using real-time fluorescence quantitative PCR. The results showed that the expression of LdGSTe1 in L. dispar was first down-regulated and then up-regulated. Therefore, LdGSTe1 gene was speculated to participate in the detoxification response of L. dispar.
Lymantria dispar; Glutathione S-transferase gene; cloning; gene expression analysis
問榮榮(1987—),女,山西大同人,博士研究生,主要從事森林害蟲防治研究,wenrongrong87@163.com;*通信作者,馬玲,博士,教授,主要從事昆蟲生態(tài)學(xué)研究,maling63@163.com
S763.42;Q785
A
1007-1032(2016)04-0386-07
2015-12-13 修回日期:2016-04-05
國家“863”計(jì)劃項(xiàng)目(2013AA102701);黑龍江省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(ZD201404);中央高?;究蒲袠I(yè)務(wù)專項(xiàng)(2572016AA09)