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食品微生物DNA能力驗(yàn)證樣品的均勻性和穩(wěn)定性研究

2016-07-30 07:48侯大海劉云國徐云峰劉凌霄
農(nóng)產(chǎn)品加工 2016年12期
關(guān)鍵詞:沙門氏菌定量熒光

侯大海,劉云國,張 亮,徐云峰,劉凌霄

(1.新疆大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,新疆烏魯木齊 830046;2.廣東產(chǎn)品質(zhì)量檢驗(yàn)監(jiān)督研究院,廣東廣州 510330;3.青州榮美爾生物科技有限公司,山東青州 262500;4.黃島出入境檢驗(yàn)檢疫局,山東青島 266000)

食品微生物DNA能力驗(yàn)證樣品的均勻性和穩(wěn)定性研究

侯大海1,2,*劉云國1,3,張亮3,徐云峰4,劉凌霄3

(1.新疆大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,新疆烏魯木齊830046;2.廣東產(chǎn)品質(zhì)量檢驗(yàn)監(jiān)督研究院,廣東廣州510330;3.青州榮美爾生物科技有限公司,山東青州262500;4.黃島出入境檢驗(yàn)檢疫局,山東青島266000)

食品微生物DNA能力驗(yàn)證,是利用DNA檢測方法,通過實(shí)驗(yàn)室間微生物檢測結(jié)果的比對來確定實(shí)驗(yàn)室檢測能力的活動(dòng)。以沙門氏菌(Salmonella)基因組DNA為測試目標(biāo),開展了實(shí)驗(yàn)室間食品微生物DNA檢測能力驗(yàn)證樣品的制備,研究了DNA檢測能力驗(yàn)證中樣品的均勻性和穩(wěn)定性,以期為食品微生物DNA能力驗(yàn)證的運(yùn)作提供指導(dǎo)。

食品微生物;DNA能力驗(yàn)證;均勻性;穩(wěn)定性

實(shí)驗(yàn)室能力驗(yàn)證,是通過實(shí)驗(yàn)室間檢測結(jié)果的比對來確定實(shí)驗(yàn)室能力的活動(dòng)。通過持續(xù)地開展實(shí)驗(yàn)室能力驗(yàn)證活動(dòng),可以有效地提高實(shí)驗(yàn)室的品質(zhì)控制能力和檢測水平,并提高檢測結(jié)果的可靠性和權(quán)威性[1]。同時(shí),為科研工作以及政府管理工作提供科學(xué)、客觀的信息。常規(guī)微生物能力驗(yàn)證,通常指寄送含或不含目標(biāo)測試菌盲樣時(shí)的驗(yàn)證能力。由于可能存在致病微生物,常規(guī)微生物能力驗(yàn)證方式在檢測樣品的運(yùn)輸、儲(chǔ)存、檢測時(shí),存在較大的生物安全隱患。實(shí)驗(yàn)室能力驗(yàn)證活動(dòng)中采用滅活的微生物,通過提取DNA進(jìn)行檢測的方法可消除這種危險(xiǎn)。因而研究食源性致病微生物時(shí),DNA檢測能力驗(yàn)證的運(yùn)作極其重要。能力驗(yàn)證計(jì)劃中的樣品制備不同于一般檢測樣品的制備,除保證樣品具有代表性和可靠性外,還應(yīng)考慮樣品的均一性和穩(wěn)定性[2]?;谝陨夏芰︱?yàn)證規(guī)則的要求,本文研究了沙門氏菌(Salmonella)DNA樣品能力驗(yàn)證中的均勻性和穩(wěn)定性試驗(yàn)。

1 材料與方法

1.1沙門氏菌的培養(yǎng)和制備

沙門氏菌菌株,來源于美國典型微生物菌種保藏中心(ATCC)。沙門氏菌標(biāo)準(zhǔn)菌株(ATCC 49416)經(jīng)活化后,挑取單菌落接種到含有200 mL的TSBYE三角瓶中大量培養(yǎng),以轉(zhuǎn)速10 000 r/min離心5 min收集沉淀,加入雙蒸水重新懸浮,水浴滅活后,分裝到Eppendorf管中凍干制樣[3]。

1.2均勻性試驗(yàn)

若F<自由度為(v1,v2) 及給定顯著性水平α(通常α=0.05)的臨界值 Fα(v1,v2),則表明樣品內(nèi)和樣品間無顯著性差異,因而樣品是均勻的。

1.3穩(wěn)定性試驗(yàn)

采用室溫條件下的儲(chǔ)存溫度(20℃),進(jìn)行穩(wěn)定性試驗(yàn)。樣品制備完畢后間隔15 d,從沙門氏菌陽性樣品中各隨機(jī)抽取6份樣品,進(jìn)行熒光定量PCR檢測。采用2個(gè)樣本均數(shù)顯著性檢驗(yàn)-t檢驗(yàn)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。

自由度df=2(n-1)

若|t|<自由度為2(n-1)給定顯著性水平α(α= 0.05)的臨界值t0.05[2(n-1)],則表明2次檢測結(jié)果無顯著性差異,因而樣品是穩(wěn)定的。

2 結(jié)果與分析

2.1均勻性試驗(yàn)

(1)樣品A為沙門氏菌陽性樣品。隨機(jī)選取A樣品6個(gè),進(jìn)行熒光定量PCR檢測,結(jié)果與已知本底結(jié)果相吻合,說明均為陽性。CT值的平均值為14.75。

(2)樣品B為沙門氏菌陰性樣品。經(jīng)隨機(jī)選取B樣品6個(gè),進(jìn)行熒光定量PCR檢測,結(jié)果與已知本底結(jié)果相吻合,說明結(jié)果均為陰性。

沙門氏菌陽性樣品的均勻性試驗(yàn)結(jié)果(熒光定量PCR CT值)見表1,沙門氏菌樣品均勻性試驗(yàn)方差分析結(jié)果見表2。

表1 沙門氏菌陽性樣品的均勻性試驗(yàn)結(jié)果(熒光定量PCR CT值)

表2 沙門氏菌樣品均勻性試驗(yàn)方差分析結(jié)果

F臨界值F0.05(5,6)=4.387,計(jì)算的F值為0.106 4,該值<F臨界值,無顯著性差異,這表明樣品中沙門氏菌含量均勻。

沙門氏菌均勻性試驗(yàn)熒光定量PCR擴(kuò)增曲線見圖1。

圖1 沙門氏菌均勻性試驗(yàn)熒光定量PCR擴(kuò)增曲線

2.2穩(wěn)定性試驗(yàn)

沙門氏菌陽性樣品穩(wěn)定性試驗(yàn)結(jié)果(熒光定量PCR CT值)見表3。

表3 沙門氏菌陽性樣品穩(wěn)定性試驗(yàn)結(jié)果(熒光定量PCR CT值)

由表3可知,沙門氏菌陽性樣品第1次檢測的平均值結(jié)果為14.73,室溫條件下放置15 d后第2次檢測的平均值結(jié)果為14.93。

沙門氏菌陽性樣品穩(wěn)定性試驗(yàn)結(jié)果見表4。

表4 沙門氏菌陽性樣品穩(wěn)定性試驗(yàn)結(jié)果

t臨界值t0.05(10)=2.228,計(jì)算所得|t|值<t臨界值,無顯著性差異,這表明沙門氏菌樣品的穩(wěn)定性良好。

沙門氏菌穩(wěn)定性試驗(yàn)熒光定量PCR擴(kuò)增曲線見圖2。

圖2 沙門氏菌穩(wěn)定性試驗(yàn)熒光定量PCR擴(kuò)增曲線

3 結(jié)論與討論

本次沙門氏菌DNA能力驗(yàn)證要求利用基于DNA技術(shù)的分子生物學(xué)手段進(jìn)行檢測,試驗(yàn)結(jié)果表明DNA樣品符合均勻性和穩(wěn)定性的要求。實(shí)驗(yàn)室間食源致病微生物DNA檢測能力驗(yàn)證提供的沙門氏菌檢測樣品已經(jīng)滅活,目的是消除能力驗(yàn)證活動(dòng)中食源致病微生物在運(yùn)輸、儲(chǔ)存、檢測過程中的生物安全隱患。本次能力驗(yàn)證活動(dòng)的樣品在制備、保存、運(yùn)輸、安全性等技術(shù)指標(biāo)上均能達(dá)到實(shí)驗(yàn)要求。本研究以CNAS-RL02∶2011能力驗(yàn)證規(guī)則、CNASPD21∶2011能力驗(yàn)證工作程序、CNAS-CL03∶2010能力驗(yàn)證計(jì)劃提供者認(rèn)可準(zhǔn)則、ISO/IEC導(dǎo)則43-1∶1997利用實(shí)驗(yàn)室間比對的能力驗(yàn)證-能力驗(yàn)證計(jì)劃的建立和運(yùn)作、CNAS-CL04∶2010標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)/標(biāo)準(zhǔn)樣品生產(chǎn)者能力認(rèn)可準(zhǔn)則等規(guī)則為基礎(chǔ),結(jié)合食源致病微生物檢測實(shí)驗(yàn)室的特點(diǎn),通過對樣品均勻性、穩(wěn)定性等關(guān)鍵技術(shù)的研究,旨在建立一個(gè)與國際規(guī)范接軌、操作性強(qiáng)的食品微生物能力驗(yàn)證關(guān)鍵技術(shù)規(guī)范。

[1]中國實(shí)驗(yàn)室國家認(rèn)可委員會(huì).ISO/IEC 17025∶2005檢測和校準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室能力的通用要求 [S].北京:中國標(biāo)準(zhǔn)出版社,2005.

[2]中國合格評定國家認(rèn)可委員會(huì).CNAS-GL02∶2014能力驗(yàn)證結(jié)果的統(tǒng)計(jì)處理和能力評價(jià)指南 [S].北京:中國標(biāo)準(zhǔn)出版社,2014.

[3]中華人民共和國衛(wèi)生部.GB 4789.4—2010食品安全國家標(biāo)準(zhǔn)食品微生物學(xué)檢驗(yàn)沙門氏菌檢驗(yàn) [S].北京:中國標(biāo)準(zhǔn)出版社,2010.◇

Study on Uniformity and Stability of Food Micro-organism DNA Proficiency Testing

HOU Dahai1,2,*LIU Yunguo1,3,ZHANG Liang3,XU Yunfeng4,LIU Lingxiao3
(1.College of Life Science and Technology,Xinjiang University,Urumqi,Xinjiang 830046,China;2.Guangdong Testing Institute of Product Quality Supervision,Guangzhou,Guangdong 510330,China 3.Qingzhou Ronmer Biology Technology Co.,Ltd.,Qingzhou,Shandong 262500,China;4.Huangdao Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau,Qingdao,Shandong 266000,China)

Food micro-organism DNA proficiency testing is to determine the testing capacity by inter-laboratory testing results using DNA testing method.This study organized DNA proficiency testing of food micro-organism using genomic DNA of Salmonella as the test objective.The uniformity and stability of food micro-organism DNA samples are studied in order to provide guidance for the operation of DNA proficiency testing.

food micro-organism;DNA proficiency testing;uniformity;stability

R378

A

10.16693/j.cnki.1671-9646(X).2016.06.033

1671-9646(2016)06b-0022-03

2016-05-08

新疆大學(xué)自治區(qū)天山學(xué)者科研啟動(dòng)金資金項(xiàng)目(45030);新疆自治區(qū)高層次人才引進(jìn)工程專項(xiàng)經(jīng)費(fèi)項(xiàng)目(45049)。

侯大海(1976— ),男,碩士,質(zhì)量工程師,研究方向?yàn)槭称芳庸ぁ?br/>*

劉云國(1977— ),男,博士,教授級高級工程師,碩士生導(dǎo)師,研究方向?yàn)槭称飞锛夹g(shù)。

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