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一例5p部分單體合并17q部分三體的分析

2016-01-23 22:46鄒志勇羅艷敏
關(guān)鍵詞:核型小腦三體

鄒志勇 羅艷敏

(中山大學附屬第一醫(yī)院,廣東 廣州 510080)

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一例5p部分單體合并17q部分三體的分析

鄒志勇 羅艷敏

(中山大學附屬第一醫(yī)院,廣東 廣州 510080)

SNP-發(fā)現(xiàn)的微缺失微重復以及單親二倍體、染色體雜合性缺失等拷貝數(shù)正常的染色體異常,能夠檢測非整倍體和多倍體,但無法檢測平衡易位。在本研究中,我們結(jié)合高分辨G顯帶核型分析,應用全基因組芯片技術(shù)檢測了1例小腦發(fā)育不全的胎兒攜帶的5p部分單體合并17q部分三體,分析其可能發(fā)生小腦發(fā)育不全的原因,報告如下。

1 對象和方法

1.1 患者臨床資料 胎兒父母親年齡分別為33歲和39歲,雙方否認近親婚配,無不良家族遺傳病史及不良生育史,G2P1A0,2011年足月剖宮產(chǎn)一女嬰,現(xiàn)體健。此次懷孕為自然妊娠,停經(jīng)11周外院B超顯示宮內(nèi)妊娠10+周,就此糾正預產(chǎn)期。在外院建檔產(chǎn)檢,早孕期唐氏篩查未做,其他檢查未見明顯異常。停經(jīng)20周三維排畸B超未見明顯異常。停經(jīng)28周外院B超提示胎兒如孕28+周,右側(cè)側(cè)腦室增寬為11mm,小腦偏小,形態(tài)未見異常,臍動脈血流頻譜未見異常。停經(jīng)28+1周本院復查B超顯示胎兒發(fā)育相當于27+3周,胎兒肱骨和小腦發(fā)育相當于26周,大腦中動脈血流頻譜舒張期消失,胎盤子面血池聲像。孕婦在中山大學附屬第一醫(yī)院胎兒醫(yī)學中心進行遺傳咨詢并簽署知情同意書后,行臍帶血穿刺查胎兒染色體和基因芯片,胎兒染色體核型結(jié)果未見異常,高密度SNP-Array芯片檢測顯示胎兒存在5p末端4.516Mb的缺失合并17q區(qū)域8.520Mb的重復。解釋相應的結(jié)果后,家屬最終選擇終止妊娠,在停經(jīng)35+4周時于當?shù)蒯t(yī)院引產(chǎn),隨訪得知胎兒為男性,外觀未見明顯異常,未行尸解。父母雙方拒絕抽外周血行全基因組基因芯片分析和染色體核型檢查。

1.2 方法根據(jù) Qiagen試劑盒(QIAamp DNA Blood Mini Kit)操作說明書提取樣品DNA。按照AffyCytoScanHDmetrix公司的芯片標準操作說明,DNA樣本分別進行消化、連接、擴增、純化、片段化、標記、雜交、洗滌及掃描。掃描信號圖經(jīng)Affymetrix的Chas軟件分析、計算產(chǎn)生每個位點的基因型或信號相對強度,包括拷貝數(shù)變異(copy number variation,CNV)和單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)。CytoScan HD芯片含有2700000個探針,具備CNV探針和SNP探針,其中SNP檢測探針750000個、CNV檢測探針為1950000個,這些探針平均覆蓋全基因組范圍,可同時檢查染色體拷貝數(shù)異常及長片段雜合性缺失(>10Mb)。查閱文獻及檢索DGV(DGV, http://projects.tcag.ca/variation/), DECIPHER (http://decipher.sanger.ac.uk/),Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM,http://www.Omim.org),UCSC (http://genome.ucsc.edu/,hg19),PubMed (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed),和ClinGen Dosage Sensitivity Map等數(shù)據(jù)庫之后,根據(jù)參照文獻對SNP微陣列分析的臨床數(shù)據(jù)進行分析[1]。

2 結(jié)果

胎兒染色體核型分析結(jié)果未見異常,為46,XY?;蚪M高分辨率染色體微陣列分析結(jié)果顯示胎兒在5p15.33p15.32區(qū)域存在4.516Mb的缺失,該區(qū)域缺失與貓叫綜合征相關(guān),該區(qū)域包含2個可能與小腦發(fā)育不全相關(guān)的OMIM基因:TERT和SLC6A3。同時在17q25.1q25.3區(qū)存在8.520Mb重復,與DECIPHER數(shù)據(jù)庫個別病例報道重疊,這些患者臨床表型為智力低下,生長發(fā)育遲緩,語言發(fā)育障礙等。

3 討論

本例胎兒包含5p15.33p15.32微缺失,該區(qū)域與貓叫綜合征相關(guān),其已報道的癥狀包括:貓叫樣啼哭,小頭畸形,圓臉,眼距寬,外眥下斜,耳位低,小下頜,腭弓高,牙錯位咬合,生長發(fā)育遲緩和智力低下等。本研究認為該區(qū)域的微缺失可能是導致胎兒小腦發(fā)育不全的遺傳學病因之一,該區(qū)域內(nèi)包含了2個可能導致小腦發(fā)育不全的OMIM基因:TERT(*187270)和SLC6A3(*126455)。文獻報道典型的貓叫綜合征與小頭畸形缺失的區(qū)域為5p15.31,5p15.3末端缺失與特殊的啼哭和語言發(fā)育落后相關(guān)[6]。已有相關(guān)的病例報道和相關(guān)研究提示,貓叫綜合征的患兒中有小腦發(fā)育不全的癥狀[2]。

在本例病例報道中胎兒雖然缺失的片段并不是經(jīng)典小頭畸形相關(guān)區(qū)域,但是該區(qū)域包含的TERT基因與維持端粒長度和細胞增殖相關(guān),已有文獻報道貓叫綜合征的患兒因TERT基因表達單倍劑量不足,其端粒短于同齡兒[3]。TERT基因?qū)τ谂咛ピ缙诎l(fā)育中維持端粒長度和器官發(fā)育所需的高度細胞增殖狀態(tài)具有重要作用[4]。因此,我們認為TERT單倍劑量不足有可能會影響胎兒生長發(fā)育,也包括胎兒小腦發(fā)育,單倍劑量不足可能會進一步導致胎兒小腦發(fā)育不全。SLC6A3是編碼多巴胺受體的基因,其在大腦中高度表達,該基因缺失會影響大腦神經(jīng)遞質(zhì)的再攝取,也與嬰幼兒帕金森綜合征相關(guān)[5,6],本研究猜想該基因的雜合性缺失也有可能影響胎兒顱腦發(fā)育,這也可能是造成這例胎兒小腦發(fā)育不全的原因之一。

Elmakky[7]對一個家系三代均存在區(qū)域5p15.33-32的5.5 Mb 微缺失的患者進行研究,發(fā)現(xiàn)這些患者存在小頭畸形、生長發(fā)育遲緩和特殊面容。作者認為5p15.33-32區(qū)域雖然不是經(jīng)典區(qū)域,但也和貓叫綜合征胎兒小頭畸形相關(guān),這和我們的猜想是一致的,在5p15.33p15.32內(nèi)可能包含了影響胎兒顱腦發(fā)育的基因,由于我們報道的胎兒數(shù)不多,已有相關(guān)的病例報道過少,因此需要進一步的研究證實和完善我們的猜想。

已有相關(guān)文獻報道17q部分三體與小頭畸形相關(guān),本例胎兒還存在17q25.1q25.3區(qū)域存在8.520Mb重復,其與DECIPHER數(shù)據(jù)庫個別病例報道重疊,這些患者臨床表型為智力低下,生長發(fā)育遲緩,語言發(fā)育障礙等。Cordier等[8]報道了一例5p部分缺失和17q部分三體的患兒,其B超檢查等影像學提示患兒有小腦發(fā)育不全,其核型為 46,XX,der(5)t(5;17)(p15.1;q21.3) [17]/46,XX,del(5)(p15.1),該報道的缺失和重復的區(qū)域為 5p15.2和 17q21.3-qter,和我們報道的區(qū)域不完全一致,但我們猜想5p部分單體和17q部分三體共同作用可能會導致胎兒小腦發(fā)育不良,可以解釋我們這例患兒的小腦發(fā)育不全的表現(xiàn),因此,在我們這例病例中,胎兒染色體核型分析雖未發(fā)現(xiàn)異常,但是全基因組微陣列分析卻發(fā)現(xiàn)胎兒更多染色體的細微異常,在對于B超發(fā)現(xiàn)結(jié)構(gòu)異常且核型分析正常的胎兒建議同時做染色體微陣列分析,這樣可以在產(chǎn)前發(fā)現(xiàn)更多異常的胎兒。

[1] Gijsbers AC, Schoumans J, Ruivenkamp CA. Interpretationofarraycomparativegenomehybridizationdata: a major challenge[J]. Cytogenet Genome Res,2011,135:222-227.

[2] NinchojiT, Takanashi,J. Pontine hypoplasia in 5p-syndrome: A key MRI finding for a diagnosis[J]. Brain Dev,2010,32:571-573.

[3] Du HY, Idol R, Robledo S, et al. Telomerase reverse transcriptase haploinsufficiency and telomere length in individuals with 5p- syndrome[J]. Aging Cell,2007,6:689-697.

[4] Zhang A, Zheng C, Hou M ,et al. Deletion of the telomerase reverse transcriptase gene and haploinsufficiency of telomere maintenance in Cri du chat syndrome [J]. Am J Hum Genet,2003,72:940-948.

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[7] Elmakky A, Carli D, Lugli L, et al. A three-generation family with terminal microdeletion involving 5p15.33-32 due to a whole-arm 5;15 chromosomal translocation with a steady phenotype of atypical cri du chat syndrome[J]. Eur J Med Genet ,2014,57:145-150.

[8] Cordier AG, Braidy C, Levaillant JM, et al. Correlation between ultrasound and pathological examination in a prenatal diagnosis of Cri du Chat syndrome associated with partial trisomy 17q[J]. Prenat Diagn,2008,28:463-465.

編輯:宋文穎

10.13470/j.cnki.cjpd.2016.03.015

R714.55

B

2016-04-30)

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