王東方
(濰坊學(xué)院山東省高校生物化學(xué)與分子生物學(xué)重點實驗室,山東濰坊261061)
細胞程序性死亡(Programed cell death,PCD)是動植物由自身基因調(diào)控的細胞自主、有序的死亡方式[1]。PCD不僅是一類特殊的細胞死亡方式,而且對動植物本身來說具有獨特的意義。隨著分子生物學(xué)的發(fā)展以及生物技術(shù)的進步,細胞凋亡的有關(guān)研究不僅在動物和醫(yī)學(xué)中深入開展,而且PCD研究也在植物學(xué)中廣泛展開,成為植物學(xué)研究的熱門領(lǐng)域。有關(guān)研究表明,在眾多的環(huán)境脅迫如干旱、高低溫及鹽堿脅迫下合成半胱氨酸蛋白酶的mRNA會逐漸積累且增多[2-3],在植物發(fā)生PCD的過程中半胱氨酸蛋白酶mRNA也會增加。這說明半胱氨酸蛋白酶(Caspase)與植物發(fā)生PCD有密切關(guān)系[4]。
半胱氨酸蛋白酶(Cysteinyl aspartate specific proteinase)是一類與生物細胞因子成熟和細胞凋亡有關(guān)的蛋白酶,是富含半胱氨酸的一類蛋白酶家族。它們的活性位點均含半胱氨酸殘基,能夠在特異天冬氨酸殘基肽鍵部位進行切割,造成細胞凋亡。半胱氨酸蛋白酶家族系列是細胞進行死亡機制的主要“調(diào)控者”。Caspase蛋白酶組被刺激激活后,啟動細胞死亡程序,導(dǎo)致細胞進入死亡調(diào)控的執(zhí)行階段[5]。Caspas是由兩個前體合成的,前體是由兩個亞單位組成的異二聚體,每個功能性Caspase都是由兩個前體的結(jié)合形成,然后形成異四聚體。Caspase的激活經(jīng)過兩次在天冬氨酸羥基端的肽鍵部位裂解,經(jīng)裂解后蛋白酶前體被切割成三部分,其中第一部分稱為抑制區(qū)域,即斷裂后的H2N-端,當(dāng)被切斷后丟失,另外兩部分是死亡區(qū)域,即COOH-端斷裂后分成大小兩個亞單位,斷裂的大小亞單位嵌合組成一個以p片層構(gòu)成的核心,d螺旋在其兩側(cè),由兩大兩小亞單位進一步結(jié)合成活化酶。該四聚體在所對應(yīng)的兩端有兩個活性位點,可作用于其本身及其他Caspase酶原,依照一定次序依次激活Caspase,形成酶級聯(lián)反應(yīng)[6-7]。
Caspase家族包括許多種,多數(shù)與細胞程序凋亡有關(guān),有些與炎癥反應(yīng)相關(guān)聯(lián)[8]。根據(jù)功能、位置,可將Caspase家族大致分為兩種類型:I型Caspase,又稱為啟動型Caspase(Initiator Caspase),包括 Caspase-2、Caspase-8、Caspase-9、Caspase-10等,存在于Caspase級聯(lián)反應(yīng)的最上端,在輔助蛋白因子的輔助下進行活化并激活下端的Caspase;Ⅱ型Caspase,又稱為執(zhí)行型 Caspase(Executioner Caspase),包括 Caspase-3、Caspase-6、Caspase-7等,其功能是特異性地使底物裂解,使細胞發(fā)生形態(tài)以及生理生化變化,致使細胞凋亡。此外,還有一類 Caspase(包括 Caspase-1、Caspase-4、Caspase-5、Caspase-13、Caspase-14等),主要功能是與細胞因子介導(dǎo)的炎癥反應(yīng)有關(guān),同時在細胞程序性死亡過程中起輔助作用[9]。
Caspase的研究最早開始于線蟲(C.elegans)細胞程序化死亡的相關(guān)研究。Caspase是動物程序死亡進行啟動及執(zhí)行階段的關(guān)鍵調(diào)控因子,在植物中雖然沒有分離得到Caspase基因,但是在植物細胞死亡過程中檢測到Caspase活性的提高。已有研究表明,植物細胞凋亡過程中Caspase活化,推測其分子結(jié)構(gòu)與動物不同,在PCD中執(zhí)行的功能也可能不同[10]。用動物Caspase活性分析試劑盒檢測湖北海棠根系,發(fā)現(xiàn)存在Caspase-3或Caspase-7活性[11]。在研究平邑甜茶及新疆野蘋果的細胞程序性死亡時,免疫印跡試驗表明在干旱脅迫條件下兩種砧木葉中都含有類Caspase-3蛋白酶,而根中不存在,通過Western bolt檢測出類Caspase-3的分子量約40 kD,比動物高8 kD左右[12]。
2.1 植物Caspase的種類 基因序列分析研究證明,在擬南芥基因組中沒有檢測到編碼Caspase酶類的基因,但是在正在死亡的植物細胞中可以檢測到Caspase活性的升高,表明植物細胞程序性死亡進程并非是Caspase,而是與Caspase有類似酶活性的其他類型的蛋白酶有關(guān)?;蚪M序列比對證明,在植物的某些序列編碼的蛋白酶中與Caspase在空間結(jié)構(gòu)上具有一定的相類似的特性,并且可被Caspase酶類抑制劑抑制其活性。煙草原生質(zhì)體用menadione誘導(dǎo)細胞程序性死亡的研究表明,抑制劑Ac-DEVD-CHO和Ac-YVADCHO能抑制Caspase活性,阻止DNA的斷裂和PARP(poly-(ADP-ribose)polymerase)的降解[13]。目前,植物中已鑒定出的半胱氨酸蛋白酶可以分為三類,其中豆類中天冬氨酸蛋白酶(1egumain)家族的液泡加工酶(vacuolar processing enzymes,VPEs)和metacaspase屬于半胱氨酸內(nèi)肽酶,與Caspase具有類似的氨基酸序列及空間結(jié)構(gòu),是Caspase的同系物;絲氨酸內(nèi)肽酶(saspases)是枯草芽孢桿菌絲氨酸蛋白酶,能分解人工合成的Caspase底物。最新的研究表明,saspases、VPEs、metacaspase在植物細胞程序性死亡過程中均起類似Caspase酶類的重要調(diào)控作用,參與調(diào)節(jié)、控制與執(zhí)行植物細胞程序性死亡。
2.2 動植物Caspase的異同 植物半胱氨酸蛋白酶與動物細胞凋亡過程中Caspase蛋白酶類似,也介入植物細胞程序性死亡的調(diào)控過程及環(huán)節(jié)。Poly(ADP-ribose)polymerase(PARP)參與H2O2誘導(dǎo)的植物PCD,而植物PARP的降解依賴于細胞色素C釋放到胞質(zhì)中,可被特異地Caspase-3抑制劑所抑制[14]。
動物和植物細胞中的半胱氨酸蛋白酶的區(qū)別主要有以下兩點。①存在部位不同。植物Caspase存在于細胞壁和液泡,而且葉綠體中的半胱氨酸蛋白酶可以降解糖1,5-二磷酸核酮羧化酶(Rubisco),而有酶活性的動物Caspase蛋白只存在于細胞質(zhì)中,液泡中不存在。②同源性較低。研究表明,植物細胞中的半胱氨酸蛋白酶包括基因序列和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)及功能同源性均比較低,而動物Caspase蛋白家族相比就高得多。所以,相關(guān)學(xué)者對植物中是否真正存在由半胱氨酸蛋酶參與的PCD調(diào)控機制還持有不同觀點。
2.3 植物Caspase及其編碼基因 雖然半胱氨酸蛋白酶家族被外界有關(guān)信號激活機制以及參與調(diào)控細胞死亡的具體調(diào)控進程還不明確,但關(guān)于Caspase的研究,已經(jīng)從許多植物中成功地得到其編碼基因。根據(jù)植物半胱氨酸蛋白酶的基因表達特點,可將其分為以下三類。
一是存在于植物正常發(fā)育階段中或存在植物某些特殊時期所表達的半胱氨酸蛋白酶。Carne等[15]從中華獼猴桃(Actinidia chinensis)中獲得一種半胱氨酸蛋白酶,測定其氨基酸序列,即actinidain。Ryan等[16]在研究杏樹果實成熟時發(fā)現(xiàn)一個編碼半胱氨酸蛋白酶基因的高度表達,成功提取其mRNA。這為今后的研究提供基礎(chǔ)。Lee等[17]試驗獲得水稻半胱氨酸蛋白酶基因OsCP1,發(fā)現(xiàn)OsCP1基因在水稻未成熟的花藥中表達,通過T-DNA插入突變體分析表明Caspase基因OsCP1主要參與水稻花粉的生長發(fā)育過程。嚴(yán)秀蕊等[18]在水稻發(fā)育過程中發(fā)現(xiàn)Caspase酶相關(guān)基因OsCP2,結(jié)果表明它也在水稻未成熟的花藥中及花藥絨氈層,且只在花粉發(fā)育的空泡花粉時期到成熟時期進行表達。張紅巖等[19]采用SSH(Suppression subtractive hybridization)和Race-PCR(Rapid-amplification of cDNA ends)技術(shù)克隆得到來自油菜(Brassica napus L.)矮化突變體‘NDF-1’的一個半胱氨酸蛋白酶相關(guān)基因Bncp5;RT-PCR檢測表明,該基因具有植物組織中表達特異性。Tripathi等[20]在玫瑰花瓣脫落過程中發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄激活一個37 kD的伴隨乙烯反應(yīng)的半胱氨酸蛋白酶基因Rb-CP1。該基因與蛋白質(zhì)的降解過程密切相關(guān)。張國林等[21]在花生果種皮中發(fā)現(xiàn)一個半胱氨酸蛋白酶基因AhPSG13。RT-PCR檢測表明,該基因在果種皮中表達特異性。
二是在生物脅迫和非生物脅迫條件下產(chǎn)生的半胱氨酸蛋白酶。在對擬南芥的逆境研究中,發(fā)現(xiàn)RD(Responsive to dehydration)系列基因包括 rd19A、rd21A以及 rd29A/cor78/lit78[22]。RD系列基因已成為植物逆境研究中的關(guān)鍵點,對于逆境信號傳導(dǎo)通道的交叉研究具有重要意義。Rossano等[23]發(fā)現(xiàn)在水分脅迫下,利用RACE方法得到小麥Caspase基因TaCP(AY841792)。朱家紅[24]在橡膠樹樹膠乳中克隆獲得一個半胱氨酸蛋白酶基因HbCP1;半定量RT-PCR結(jié)果顯示,通過乙烯傷害誘導(dǎo)膠乳HbCP1基因的表達,推測膠乳中的HbCP1蛋白可能具有防御功能。曹慧等[25]在研究蘋果砧木八棱海棠中也分離得到了Caspase基因。
三是在衰老的植物組織中Caspase表達量增加或在衰老時期半胱氨酸蛋白酶特異性表達。衰老是指生物體在進行生命活動、生理代謝過程中,隨著時間的增加,生物體細胞增殖分化能力、生理功能等逐漸發(fā)生衰退的變化過程。衰老是生物內(nèi)在因子調(diào)控的結(jié)果,最終導(dǎo)致細胞逐漸死亡,有時將衰老視為程序化死亡過程[26]。在各種衰老的植物組織中分離獲得許多調(diào)控半胱氨酸蛋白酶的基因,都被稱作衰老相關(guān)基因SAG(Senescence associated genes),如擬南芥的SAG2和SAG12,玉米的 See1 和 See2,油菜的 LSC7 和 LSC790[27],番茄的Cyp23和煙草的NTCP223[28]。這些基因在衰老的葉片中均過量存在。王勇等[29]在大豆葉片衰老過程中發(fā)現(xiàn)了一個半胱氨酸蛋白酶相關(guān)基因,它在衰老的葉片中特異性表達。沈法富等[30]從棉花衰老葉片中克隆了編碼半胱氨酸蛋白酶的cDNA,被稱為Ghcysp(AY604196)。研究表明,該基因在棉花的花中、根部、下胚軸及幼葉等生長旺盛部位中不表達,而在棉花的衰老葉片中特異性表達。King等[31]研究表明,在花椰菜花瓣衰老過程中半胱氨酸蛋白酶顯著表達。朱海生等[32]在草莓中克隆取得半胱氨酸蛋白酶基因FaCP,并且發(fā)現(xiàn)FaCP基因表達量隨著衰老程度的增加而逐漸增加,尤其是在衰老后期顯著上升。
半胱氨酸蛋白酶家族介入了植物生長和發(fā)育過程中蛋白的降解,在種子萌發(fā)、果實發(fā)育及成熟、器官衰老與脫落等生理活動進程中起重要作用;介入響應(yīng)外界病菌侵入時的超敏反應(yīng);也與植物木質(zhì)部分化有關(guān),并和器官衰老引發(fā)的PCD相關(guān)聯(lián)。半胱氨酸蛋白酶系列基因不但參與植物的衰老調(diào)控,而且參與信號傳導(dǎo),并響應(yīng)外界環(huán)境中的生物和非生物脅迫[14,33],但在植物對外界非生物脅迫和生物脅迫的響應(yīng)以及器官分化和衰老的過程中,Caspase的功能、作用研究才剛開始。與動物Caspase的研究相比,在植物中的有關(guān)功能機理還需要進一步研究。有關(guān)植物細胞程序性死亡Caspase類蛋白酶的研究尚處于起始階段。隨著細胞凋亡研究的不斷深入,植物細胞Caspase功能與程序性死亡關(guān)系的研究將會進入一個新階段,從而進一步揭示植物細胞程序性死亡中Caspase酶類作用機理和機制。
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