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測序N6—甲基腺嘌呤標(biāo)示衣藻的轉(zhuǎn)錄起始位置

2015-05-30 10:55楊智
科學(xué) 2015年4期
關(guān)鍵詞:衣藻腺嘌呤真核

楊智

據(jù)美國Cell,2025,161:879報道,美國芝加哥大學(xué)的華人科學(xué)家何川等人對萊茵衣藻(Chlamydomonas rein-hardtii)DNA上N6-甲基腺嘌呤之分布位置及相關(guān)生物學(xué)功能進行實驗分析,拓展了人們對真核生物DNA甲基化途徑的認識。

DNA甲基化是指給DNA上某些堿基成分添加甲基,從而影響DNA功能和基因表達的現(xiàn)象,是對DNA做表觀遺傳修飾的一種重要方式。DNA甲基化的異常與某些生殖和遺傳疾病以及腫瘤的發(fā)生密切相關(guān)。常見的甲基化發(fā)生在胞嘧啶和腺嘌呤上,生成5-甲基胞嘧啶(5mC)和N6-甲基腺嘌呤(6mA),其中5mC多見于真核生物,6mA多見于原核生物。關(guān)于在真核生物基因組中6mA的生物學(xué)特性及意義尚未被充分研究。

萊茵衣藻是一種真核的單細胞綠藻,已有的研究表明其富含5mC和6mA兩種甲基化修飾成分,其中6mA激發(fā)了何川等人研究興趣。他們采用降解與測序等多種技術(shù)做檢測分析發(fā)現(xiàn),6mA為衣藻84%基因的標(biāo)志物,在衣藻細胞分裂中可以穩(wěn)定地進行表觀遺傳。它在轉(zhuǎn)錄起始位置的周圍近旁十分豐富,卻不存在于這個位置之中。甲基化發(fā)生于腺嘌呤-磷酸-胸腺嘧啶(ApT)核苷酸序列處。而且在轉(zhuǎn)錄起始位置附近,6mA主要位于核小體之間的接頭DNA中,對核小體定位起作用。研究數(shù)據(jù)還顯示,6mA是存在活躍轉(zhuǎn)錄與表達的基因的一個鮮明標(biāo)志。與萊茵衣藻基因組內(nèi)的6mA相比,5mC存在的位置及相關(guān)的功能均有很大不同。6mA促進基因轉(zhuǎn)錄的啟動,5mC則對基因表達起遏制作用。

在近期Cell雜志中還報道了何川研究組與美國哈佛醫(yī)學(xué)院施揚課題組合作,發(fā)現(xiàn)線蟲生殖能力隨6mA水平升高而逐代下降;何川研究組與中國科學(xué)院陳大華和汪海林等人合作,發(fā)現(xiàn)果蠅早期胚胎尤其卵巢中一些轉(zhuǎn)座子及附近有高水平6mA,并確定了去除6mA的去甲基化酶DMAD。這些研究拓寬了人們對真核生物中6mA類型表觀遺傳修飾的具體認識。

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