劉中美, 杜 坤, 周哲敏
(江南大學(xué) 生物工程學(xué)院,江蘇 無錫 214122)
谷氨酰胺轉(zhuǎn)胺酶(Transglutaminase,TGase,EC 2.3.2.13)是一種能夠催化酰基轉(zhuǎn)移反應(yīng)的酶。它可以催化谷氨酰胺殘基的γ-羧酰胺基與各種?;荏w發(fā)生反應(yīng),實現(xiàn)蛋白質(zhì)分子內(nèi)、分子間交聯(lián),從而極大地改變蛋白質(zhì)的性質(zhì)[1]。TGase廣泛應(yīng)用于食品行業(yè)、生物醫(yī)藥、組織工程、紡織和皮革處理等多個領(lǐng)域[2-3]。由于TGase的卓越催化功能而倍受越來越多的研究者的青睞,它被譽為 “21世紀(jì)超級粘合劑”。
對TGase的研究可以追溯到50年前,美國生物化學(xué)家Heinrich Waelsch在人腦和肝臟提取物中首次發(fā)現(xiàn)具有酰胺基轉(zhuǎn)移催化功能的TGase酶[3]。微生物來源的 TGases (Microbial TGase,MTG)是1989年日本味之素公司首次發(fā)現(xiàn)的,由土壤中分離出的茂原鏈霉菌(Streptomyces mobaraense)產(chǎn)生[4]。與其它來源的TGase相比,MTG具有非Ca2+依賴性、溫度和pH穩(wěn)定性高等特點[5-6]。此外,MTG生產(chǎn)周期短、產(chǎn)量高、成本低,易于工業(yè)化生產(chǎn)。S.mobaraense來源的MTG一級氨基酸序列于1993年被測定[7],由331個氨基酸組成,與動物來源的TGase相比,二者序列相似度低。S.mobaraense MTG的晶體結(jié)構(gòu)于2002年被解析,二級結(jié)構(gòu)屬于α+β型,含11個α-螺旋及8個β-折疊;催化活性基團(tuán)Cys64、Asp255和His274均位于分子裂縫底部[8]。
目前,微生物來源的MTG已經(jīng)實現(xiàn)了商品化(ActivaTM),ActivaTM中每克粉末中含有100個單位的酶活,但是其中只有體積分?jǐn)?shù)1%的蛋白,體積分?jǐn)?shù)99%的是麥芽糖糊精。麥芽糖糊精的作用是增強(qiáng)MTG的穩(wěn)定性和使產(chǎn)品易于操作[9],因為酶的熱穩(wěn)定性越好,在應(yīng)用過程中可耐受的操作溫度越高,反應(yīng)速率越快,成本也就越低。德國馬丁路德大學(xué)的Pietzsch研究組利用隨機(jī)突變和飽和突變等技術(shù),提高了S.mobaraense來源的MTG的熱穩(wěn)定性。研究結(jié)果表明,影響MTG熱穩(wěn)定性的突變點大都集中在MTG的N端區(qū)域[10]。
作者參考Pietzsch研究組的實驗結(jié)果,采用理性設(shè)計手段,通過分子生物學(xué)技術(shù)、結(jié)構(gòu)分析軟件、分子模擬等手段對Streptomyces hygroscopicus來源的MTG進(jìn)行分子改造。通過結(jié)構(gòu)比對和序列分析,并借助二硫鍵預(yù)測軟件Disulfide by design,在MTG的N端區(qū)域引入二硫鍵,使MTG的熱穩(wěn)定性得到提高,進(jìn)一步促進(jìn)其工業(yè)化應(yīng)用。
1.1.1 菌株與質(zhì)粒 質(zhì)粒pET22b-pro-MTG、E.coli BL21(DE3)和E.coli JM109為本實驗室保存。
1.1.2 試劑與儀器 N-carboxybenzoyl-L-glutaminyl-glycine (N-CBZ-Gln-GLy)、L-谷氨酸-γ-單羥胺酸購自Sigma公司;中性蛋白酶Dispase:購自Worthington公司,PCR引物:生工生物工程(上海)股份有限公司合成。
紫外分光光度計(UV-1800):上海美譜達(dá)有限公司產(chǎn)品;HiTrap Q HP和HiTrap SP HP:GE公司產(chǎn)品;AKTA avant:GE 公司產(chǎn)品;Millipore 超濾離心管 Ultra-15 3K,默克公司產(chǎn)品。
1.1.3 主要培養(yǎng)基 LB培養(yǎng)基:10 g/L蛋白胨,5 g/L 酵母提取物,10 g/L NaCl,pH 7.0。 TB 培養(yǎng)基:12 g/L蛋白胨,24 g/L酵母提取物,體積分?jǐn)?shù)0.4%甘油,17 mmol/L KH2PO4,72 mmol/L K2HPO4,pH 7.0。
1.2.1 構(gòu)建分泌表達(dá)載體 pET22b-pro-MTG(4-284)以載體pET22b-pro-MTG[11]為模板,D4C-up和D4C-down為引物,進(jìn)行全質(zhì)粒PCR,得到重組質(zhì)粒pET-pro-MTG (D4C)。 以載體pET-pro-MTG(D4C)為模板,G284C-up和G284C-down為引物,進(jìn)行全質(zhì)粒PCR,獲得重組質(zhì)粒pET-pro-MTG(4-284)。引物序列見表1,質(zhì)粒均經(jīng)過測序驗證。
表1 研究所用引物Table 1 Primers used in this study
1.2.2 重組蛋白酶的誘導(dǎo)表達(dá) 將轉(zhuǎn)化子接于含有50 mg/L氨芐青霉素的LB培養(yǎng)基中,37℃過夜培養(yǎng)后轉(zhuǎn)接至TB培養(yǎng)基中 (含有4 g/L葡萄糖和50 mg/L氨芐青霉素),37℃條件下培養(yǎng)至OD600為0.5~0.6,加入IPTG至終濃度為0.4 mmol/L,20℃條件下誘導(dǎo)40 h。
1.2.3 酶原活化與蛋白質(zhì)純化 參照報道[12],收集發(fā)酵液,并在發(fā)酵液中加入終質(zhì)量濃度為5 mg/L的中性蛋白酶Dispase,37℃保溫1 h,活化pro-MTG和 pro-MTG(4-284)?;罨瓿珊螅蜾@沉淀法(硫酸銨濃度55%~75%)收集目標(biāo)蛋白,復(fù)溶于10 mmol/L磷酸鉀緩沖液(pH 6.0)。
將復(fù)溶液經(jīng)過層析柱HiTrap SP HP分離純化,用含0.5 mmol/L NaCl的磷酸鉀緩沖液(pH 6.0)進(jìn)行線性洗脫。收集含有目標(biāo)蛋白的峰,并將收集的樣品于25 mmol/L Tris-HCl(pH 8.0)中透析過夜。將透析樣品離心取上清,注入HiTrap Q HP離子柱,并用含有0.5 mmol/L NaCl的25 mmol/L Tris-HCl(pH 8.0)溶液進(jìn)行線性洗脫,收集目標(biāo)蛋白。用SDS-PAGE凝膠電泳來檢測目標(biāo)蛋白純度,Brandford法檢測蛋白質(zhì)濃度。
1.2.4 檢測蛋白的二硫鍵含量 參照文獻(xiàn)[13],將蛋白MTG和MTG(4-284),分別稀釋在含有和不含有還原劑(10 mmol/L DTT)的溶液 A(80 mmol/L磷酸鉀緩沖液,質(zhì)量分?jǐn)?shù)2%SDS,pH 8.0)中,在沸水中煮10 min使蛋白變性。用超濾離心管(Millipore Ultra-15 3K)濃縮蛋白,同時用溶液A洗去DTT,然后取樣測蛋白質(zhì)濃度。測定各樣品的吸光度值,計算各樣品在有DTT和無DTT存在時,半胱氨酸含量的變化,進(jìn)而算出二硫鍵的含量。
1.2.5 酶學(xué)性質(zhì)與熱穩(wěn)定性測定 將重組MTG和MTG(4-284)分別在 37、45、50、55、65 ℃下處理 10 min,然后在冰上冷卻30 min。以N-CBZ-Gln-GLy(30 mmol/L)為底物,用比色法測定MTG酶活[11]。一個單位谷氨酰胺轉(zhuǎn)胺酶酶活的定義為:37℃時每分鐘催化形成1 μmol L-谷氨酸-γ-單羥基肟酸的酶量。
1.2.6 圓二色譜 用10 mmol/L磷酸鉀緩沖液稀釋至蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度為0.2 mg/mL,通過MOS-450/AF-CD分光偏振計分別測定重組MTG和MTG(4-284)的T50值。吸收池寬10 mm,檢測波長為222 nm,溫度范圍為40~80℃。
1.2.7 抗胰蛋白酶降解測試 將純化后的蛋白樣品稀釋至0.5 mg/mL并分別加入終濃度為0.1 U/mL的胰蛋白酶。37℃保溫3 h,每隔0.5 h取樣一次,用SDS-PAGE凝膠電泳檢測蛋白的降解程度。
1.2.8 同 源 建 模 通 過 Swiss-Model(http://swissmodel.expasy.org/)對來源于 S.hygroscopicus的MTG進(jìn)行同源建模,具體方法參見網(wǎng)站上的說明。模板為來源于Streptomyces mobaranesis的MTG(1IU4),兩者之間的氨基酸序列同源性為79.2%。利用 PROCHECK (http://nihserver.mbi.ucla.edu/SAVES/)對模型空間結(jié)構(gòu)的準(zhǔn)確性進(jìn)行評估,結(jié)果顯示所有的氨基酸都是在合理的位置,表明構(gòu)建的模型準(zhǔn)確性較高。
S.mobaraense來源的MTG的N端區(qū)域?qū)τ贛TG的熱穩(wěn)定性起著很關(guān)鍵的作用[10]。S.hygroscopicus和S.mobaraense來源的MTG的序列同源性高達(dá)79.2%,因此推斷S.hygroscopicus來源的MTG的N端區(qū)域?qū)ζ錈岱€(wěn)定性同樣重要,在該區(qū)域設(shè)計二硫鍵預(yù)期可以提高其穩(wěn)定性。
通過同源建模獲得S.hygroscopicus來源的MTG的三維結(jié)構(gòu)圖(圖1)。選定N端的Loop區(qū)作為改造的目標(biāo),利用Disulfide by Design軟件在目標(biāo)區(qū)域預(yù)測二硫鍵的氨基酸位點,結(jié)果顯示在D4和G284之間可能形成二硫鍵。構(gòu)建突變體質(zhì)粒pET-pro-MTG(4-284),以檢測二硫鍵對MTG熱穩(wěn)定性的影響。
圖1 三維結(jié)構(gòu)圖Fig.1 3D structure comparison of MTG
MTG和MTG(4-284)進(jìn)行胞外表達(dá),經(jīng)過中性蛋白酶Dispase活化、硫酸銨分級沉淀 (質(zhì)量分?jǐn)?shù)55%~75%)、陽離子層析和陰離子層析后,獲得了純度較高的MTG和MTG(4-284),SDS-PAGE結(jié)果如圖2所示。
二硫鍵的數(shù)量是通過對比MTG和MTG(4-284)在還原性環(huán)境(經(jīng)DTT處理)和非還原性環(huán)境(未經(jīng)DTT處理)下的巰基含量來確定的[13]。結(jié)果如表2所示,MTG在經(jīng)DTT處理前后,其巰基含量基本沒有變化。每個MTG內(nèi)只含有1個巰基,這和已知的蛋白序列只含一個半胱氨酸相一致。MTG(4-284)在經(jīng)DTT處理后,檢測到的巰基含量約是DTT處理前的3倍,這說明經(jīng)DTT處理后,一個二硫鍵被打開了,進(jìn)而釋放出了兩個巰基。實驗結(jié)果表明MTG(4-284)內(nèi)形成了一個二硫鍵。
圖2 純化蛋白電泳圖Fig.2 SDS-PAGE analysis of the purified proteins
表2 MTG和MTG(4-284)的二硫鍵數(shù)量Table 2 Disulfide numbers of MTG and MTG(4-284)
將 MTG 和 MTG(4-284)在 37、45、50、55、60 ℃分別下處理10 min,再冰浴30 min,進(jìn)行酶活檢測。如圖 3所示,MTG和 MTG(4-284)在 45℃處理 10 min后,酶活基本沒有降低,表明在該溫度下MTG的熱穩(wěn)定性較好。MTG在50~60℃的環(huán)境下酶活隨著溫度的升高而迅速降低,而MTG(4-284)在55℃下處理10 min后,仍然保留95%的酶活,表明MTG(4-284)的熱穩(wěn)性有了很大的提高。
圓二色譜技術(shù)測定MTG和MTG(4-284)的T50分別為 58 和 65℃(圖 4),表明 MTG(4-284)的蛋白質(zhì)在變性和解折疊過程中所需的溫度均有所提高,反映出其熱穩(wěn)定性提高了。這與熱處理后檢測酶活的結(jié)果一致。以上結(jié)果表明在S.hygroscopicus來源的MTG的N端區(qū)域引入二硫鍵可以提高其熱穩(wěn)定性。
圖3 MTG和MTG(4-284)的熱穩(wěn)定性Fig.3 Thermostability of MTG and MTG (4-284)at different temperature
圖4 MTG 和 MTG(4-284)的 T50Fig.4 The T50of MTG and MTG(4-284)
胰蛋白酶經(jīng)常被用來檢測蛋白酶的抗降解能力。從圖5中可以看出,MTG在經(jīng)過3 h的胰蛋白酶處理后,目標(biāo)條帶基本消失,在27 000左右出現(xiàn)一個明顯條帶。而MTG(4-284)在處理3 h后,依然有著比較明顯的條帶,下方也沒有出現(xiàn)降解的蛋白條帶。以上結(jié)果顯示MTG(4-284)抗胰蛋白酶降解的能力明顯增強(qiáng)。
MTG(4-284)熱穩(wěn)性和抗蛋白酶降解的能力都有所提高,進(jìn)一步表明在N端引入二硫鍵有效的提高了MTG(4-284)的穩(wěn)定性。
MTG(4-284)的比酶活略低于MTG;Km和kcat的結(jié)果顯示,引入的二硫鍵使得kcat變化略大,Km值變化很小,表明二硫鍵的引入基本沒有影響酶與底物的結(jié)合,而是底物進(jìn)入活性中心后,酶分子完成催化所需的時間受到了一定的影響;MTG(4-284)在熱穩(wěn)定性提高的同時,最適反應(yīng)溫度也有所提高。
作者通過在MTG的N端區(qū)域人工設(shè)計并引入二硫鍵,有效提高了其穩(wěn)定性。圓二色譜檢測結(jié)果表明二硫鍵的引入使得其T50由58提高至65℃;酶活力檢測結(jié)果表明二硫鍵的引入導(dǎo)致比酶活略有所下降,由13.3 U/mg下降為12.5 U/mg;酶動力學(xué)參數(shù)表明二硫鍵的引入沒有影響酶與底物的結(jié)合過程,而是影響了底物進(jìn)入活性中心后的催化過程。作者研究結(jié)果表明S.hygroscopicus來源的MTG的N端區(qū)域?qū)τ谄浞€(wěn)定性重要影響,而該區(qū)域相對遠(yuǎn)離活性中心,也比較適合進(jìn)行分子改造。
圖5 MTG(a)和MTG(4-284)(b)抗胰蛋白酶降解比較Fig.5 Trypsin-resistance of MTG(a)and MTG(4-284)(b)
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