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ABI 7500與TL 988實(shí)時(shí)熒光PCR儀的性能評(píng)價(jià)

2015-04-09 00:17:42潘強(qiáng)龍周成林楊先知謝國(guó)良崔大偉
中國(guó)現(xiàn)代醫(yī)生 2015年2期
關(guān)鍵詞:精密度靈敏度一致性

潘強(qiáng)龍 周成林 楊先知 謝國(guó)良 崔大偉

[摘要] 目的 探討ABI 7500與TL 988熒光定量PCR儀之間的性能差異。 方法 參照EP9-A2文件中的評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn),兩臺(tái)儀器分別對(duì)5種不同濃度的甲型流感病毒陽(yáng)性質(zhì)控品進(jìn)行檢測(cè),每個(gè)濃度測(cè)量20次,比對(duì)兩種儀器的精密度、靈敏度,并評(píng)價(jià)兩臺(tái)儀器結(jié)果一致性。 結(jié)果 精密度:TL 988的變異系數(shù)(CV)從0.68%到1.52%,ABI 7500的CV從1.93%到2.69%。兩臺(tái)儀器在檢測(cè)高濃度的甲型流感病毒DNA時(shí)(107、106、105 copies/mL)差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),檢測(cè)低濃度的病毒DNA時(shí)(104、103 copies/mL)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。靈敏度:兩種儀器檢測(cè)濃度103 copies/mL時(shí),TL 988陽(yáng)性檢出率為100%,ABI 7500檢出率為0。兩種儀器檢測(cè)數(shù)據(jù)相關(guān)性良好(r=0.998)。結(jié)論 熒光定量TL 988 PCR儀器的性能(精密度和靈敏度)比ABI 7500好。

[關(guān)鍵詞] 熒光定量PCR儀;比對(duì);精密度;靈敏度;一致性

[中圖分類號(hào)] R446.1 [文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼] B [文章編號(hào)] 1673-9701(2015)02-0155-02

根據(jù)ISO 15189要求,實(shí)驗(yàn)室需要定期對(duì)使用的儀器進(jìn)行性能評(píng)估,當(dāng)實(shí)驗(yàn)室使用兩套及以上檢測(cè)系統(tǒng)檢測(cè)同一項(xiàng)目時(shí),應(yīng)比對(duì)數(shù)據(jù)表明其檢測(cè)結(jié)果一致性?,F(xiàn)筆者按EP9-A2文件要求[1-5],對(duì)美國(guó)ABI 7500和國(guó)產(chǎn)TL 988的主要性能指標(biāo)進(jìn)行評(píng)估,以了解結(jié)果差異性與一致性,從而尋找國(guó)產(chǎn)儀器可替代國(guó)外產(chǎn)品的可能性。

1材料與方法

1.1材料

(1)主要儀器:ABI 7500和TL 988熒光定量PCR儀、生物安全柜、低溫高速離心機(jī)、超凈工作臺(tái)等。

(2)試劑:上海之江生物科技有限公司提供的甲型流感病毒熒光定量PCR檢測(cè)試劑盒。檢測(cè)標(biāo)本:陽(yáng)性定量質(zhì)控品(含甲型流感病毒DNA的濃度為107 copies/mL),用free H2O準(zhǔn)確10倍比稀釋成106、105、104、103 copies/mL,充分混勻,分裝250 μL到1.5 mL的eppendorf管中備用。

1.2 方法

1.2.1 精密度測(cè)定 按NCCLS標(biāo)準(zhǔn),分別在ABI 7500和TL 988熒光定量PCR儀上同時(shí)檢測(cè)107、106、105、104 copies/mL四種濃度的陽(yáng)性質(zhì)控品。各濃度均測(cè)定20次,計(jì)算其均值、標(biāo)準(zhǔn)差和變異系數(shù)。

1.2.2 靈敏度測(cè)定 分別取107、106、105、104、103 copies/mL五個(gè)濃度標(biāo)本在兩臺(tái)PCR儀上進(jìn)行檢測(cè),根據(jù)陽(yáng)性檢測(cè)率分析其靈敏度。

1.2.3相關(guān)性檢測(cè) 通過(guò)重復(fù)性試驗(yàn)中的數(shù)據(jù),分別取107、106、105、104 copies/mL濃度的檢測(cè)結(jié)果的平均值,分析兩臺(tái)儀器的數(shù)據(jù)相關(guān)性。

1.3統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

應(yīng)用SPSS 17.0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件對(duì)數(shù)據(jù)分析處理。檢查是否有離群值,對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行初步檢查,兩變量間線性關(guān)系分析采用直線相關(guān)及回歸分析。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1兩臺(tái)儀器精密度結(jié)果比較

TL 988 和ABI 7500兩臺(tái)熒光PCR儀器的精密度結(jié)果比較,見(jiàn)表1??梢钥闯鯰L 988測(cè)得各濃度數(shù)據(jù)的變異系數(shù)(CV)從0.68%到1.52%,ABI 7500測(cè)得各濃度數(shù)據(jù)的變異系數(shù)(CV)是從1.93%到2.69%,變異系數(shù)(CV)均在要求范圍內(nèi)(<10%),數(shù)據(jù)表明ABI 7500的精密度略低于TL 988(P>0.05)。此外,關(guān)于相同濃度的標(biāo)準(zhǔn)品檢測(cè)結(jié)果的Ct值和標(biāo)準(zhǔn)差分析,顯示兩臺(tái)PCR儀的批內(nèi)重復(fù)性均良好。

表1 兩臺(tái)儀器精密度結(jié)果比較

2.2兩臺(tái)儀器靈敏度結(jié)果比較

甲型流感病毒DNA的濃度在107、106、105、104 copies/mL時(shí),兩臺(tái)儀器的陽(yáng)性檢出率均為100%,當(dāng)濃度為103 copies/mL時(shí),TL 988檢出率依然為100%,但ABI 7500的檢出率為0。靈敏度方面,TL988要比ABI 7500能檢測(cè)到更低濃度,即靈敏度相對(duì)較高(P<0.05)。

2.3 相關(guān)性比較

兩臺(tái)儀器對(duì)各標(biāo)本的甲型流感病毒DNA的含量進(jìn)行測(cè)定,結(jié)果表明,兩臺(tái)儀器測(cè)定值的回歸直線方程為:y=1.2364x-5.2097(r=0.998),具有良好的直線相關(guān)和回歸關(guān)系。

3 討論

在2013年全球高科技產(chǎn)業(yè)值中,精密儀器醫(yī)療設(shè)備約為3萬(wàn)億美金,占13%。而精密醫(yī)療設(shè)備基本上被國(guó)外所壟斷。醫(yī)療設(shè)備是現(xiàn)代醫(yī)療業(yè)發(fā)展的必備手段,所以需要加快精密儀器的國(guó)有化進(jìn)程,降低成本,推動(dòng)民族品牌企業(yè)不斷發(fā)展,降低老百姓就醫(yī)費(fèi)用成本。

熒光定量PCR技術(shù)是通過(guò)熒光染料或熒光標(biāo)記的特異性探針對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行標(biāo)記跟蹤,實(shí)時(shí)監(jiān)控反應(yīng)過(guò)程。與傳統(tǒng)的PCR技術(shù)相比,實(shí)時(shí)熒光定量技術(shù)具有特異性高等優(yōu)點(diǎn)[6-8],在檢測(cè)甲型流感病毒上具有很好的準(zhǔn)確性。

另外實(shí)驗(yàn)室中不應(yīng)使用同一種檢測(cè)系統(tǒng)進(jìn)行臨床檢驗(yàn),以避免儀器出現(xiàn)系統(tǒng)性的檢測(cè)錯(cuò)誤[9-12]。對(duì)樣本進(jìn)行檢測(cè)時(shí),一般只做一次檢驗(yàn)便要發(fā)出報(bào)告,這便要求儀器檢測(cè)系統(tǒng)具有良好的可重復(fù)性,因此對(duì)儀器的精密度具有很高的要求[12-14]。實(shí)驗(yàn)室中,當(dāng)樣本在低拷貝狀態(tài)下也要求有很高的檢出率。

兩臺(tái)儀器在試驗(yàn)前,室內(nèi)質(zhì)控品的檢測(cè)結(jié)果均可靠,具有較好的重復(fù)性,此次試驗(yàn)中,兩臺(tái)儀器未出現(xiàn)故障,穩(wěn)定性良好,操作方便,檢測(cè)快速。對(duì) ABI 7500熒光定量PCR儀在重復(fù)性、線性、靈敏度上與TL 988進(jìn)行比較,結(jié)果顯示兩臺(tái) PCR儀的批內(nèi)批間重復(fù)性好, CV均在要求范圍內(nèi),線性良好。ABI 7500在精密度和靈敏度上明顯略遜于TL 988,可能與本次試驗(yàn)中所用試劑與國(guó)產(chǎn)TL 988更配套,致使TL 988在本次試驗(yàn)中表現(xiàn)優(yōu)異。兩臺(tái)儀器測(cè)定值比較,r=0.998,表明兩臺(tái)儀器具有良好的直線相關(guān)和回歸關(guān)系。說(shuō)明ABI 7500與TL988測(cè)定甲型流感病毒的結(jié)果具有可比性,而國(guó)產(chǎn)TL 988 PCR儀能較好地服務(wù)于臨床。

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(收稿日期:2014-07-17)

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