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代謝組學在子癇前期中的應用進展

2015-02-22 11:18洪綜述徐紅兵審校
現(xiàn)代醫(yī)藥衛(wèi)生 2015年13期
關(guān)鍵詞:代謝物組學子癇

陳 洪綜述,徐紅兵審校

(重慶醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院,重慶400016)

代謝組學在子癇前期中的應用進展

陳 洪綜述,徐紅兵審校

(重慶醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院,重慶400016)

先兆子癇;妊娠并發(fā)癥;代謝組學;子癇前期;生物標志物;綜述

代謝組學是繼基因組學、轉(zhuǎn)錄組學、蛋白質(zhì)組學之后發(fā)展起來的一門組學技術(shù),也是系統(tǒng)生物學的重要組成部分。代謝組學可以高通量識別、測定生物體受刺激和基因修飾后小分子代謝物的變化[1],從而幫助人們更好地了解疾病的病理機制,診斷、預后和發(fā)現(xiàn)疾病的標志物[2-4],目前代謝組學技術(shù)廣泛應用于毒理學研究、藥物研發(fā)、疾病診斷和治療等領域[5-6],成為近幾年的研究熱點之一。本文就代謝組學的概念及其在子癇前期的應用和進展作一綜述。

1 代謝組學的概念

1999年,英國Nicholson等[7]在核磁共振(NMR)基礎上提出了代謝組學的概念,其從代謝物層面探索生命活動,分析基因表達、轉(zhuǎn)錄、翻譯、蛋白質(zhì)(酶)修飾后的下游產(chǎn)物,真實反應系統(tǒng)(細胞、組織或器官)的生理狀態(tài)或表型,關(guān)注對象是相對分子質(zhì)量小于1×103的小分子代謝物。

2 代謝組學的研究領域和技術(shù)

2.1 代謝組學的研究領域 根據(jù)研究對象和目的不同,F(xiàn)iehn[8]將代謝組學分為4個層次∶(1)代謝物靶標分析,定量測定機體受擾動后某一特定代謝物的變化,分析物較局限;(2)代謝物輪廓分析,對某一類特定代謝物測定,如糖類、氨基酸等,分析其特定代謝途徑,是一種半定量的方法;(3)代謝物指紋分析,對所有代謝物進行定性分析,不針對具體某一組分;(4)代謝物組學分析,在特定條件下對生物樣品中所有代謝物進行定性和定量分析。

2.2 代謝組學分析技術(shù) 代謝組學分析流程[9-10]包括∶實驗設計、樣品采集和預處理、代謝物分離和檢測、數(shù)據(jù)分析及模型建立、分析代謝變化機制。代謝組學研究的常見樣品是血清或血漿、尿液,除此之外,羊水、膽汁、唾液、精液、腦脊液和部分組織也可作為研究樣本。代謝組學常用的技術(shù)平臺有NMR光譜技術(shù)和色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)。一個精密的實驗設計必須有良好的重復性、穩(wěn)定的樣本回收率和完善的分離分析平臺用于檢測代謝物[11]。常用的NMR有氫離子磁共振(1H-NMR)、碳譜磁共振和磷譜磁共振,其中以1H-NMR應用最為廣泛。應用 NMR技術(shù)[12-13]進行代謝組學研究時,其優(yōu)點是無需樣品進行預處理,實現(xiàn)樣品快速檢測,并且不破壞樣品,可以應用于活體研究;由于NMR光譜復雜,其靈敏度較低。色譜可以對物質(zhì)定性,而質(zhì)譜可以定量,因此聯(lián)合應用色譜-質(zhì)譜技術(shù)對樣品進行檢測具有高敏感度、高分辨率、高特異性的特點[1,14],較常用的有氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(GC-MS)、液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(LC-MS)和毛細管電泳-質(zhì)譜聯(lián)用(CE-MS)等[15]。GC-MS分析時,需要對樣品進行衍生化,靈敏度高于NMR,但同時也增加了時間成本。LC-MS檢測時樣品無需衍生化,可以實現(xiàn)多樣本同時檢測,相對NMR費時較多。CE-MS具有高分離能力,需要的樣品量少,檢測快速,但是商業(yè)成本較高,保留時間重復性較差。隨著色譜技術(shù)的不斷發(fā)展,高效液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用和超高效液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(UPLC-MS)技術(shù)得到廣泛應用,大大提高了分離效率、峰容量及靈敏度[16]。對代謝組學技術(shù)檢測到的數(shù)據(jù)進行預處理(除噪、數(shù)據(jù)標準化、缺失值處理),將質(zhì)譜圖轉(zhuǎn)換成數(shù)據(jù)矩陣,最后運用模式識別方法對數(shù)據(jù)進行多變量分析,并建立可視化模型[10,17]。無師監(jiān)督的模式識別方法包括主成分分析、聚類分析等;有師監(jiān)督的模式識別方法包括判別分析、偏最小二乘法分析、偏最小二乘法判別分析、正交校正的偏最小二乘法分析等[1,17-19]。運用模式識別方法尋找差異性代謝物,通過查閱文獻、數(shù)據(jù)庫檢索、比對二級質(zhì)譜、用標準品驗證等手段,對潛在標志物進行定性,從而鑒定出差異性化合物[10,20]。

3 代謝組學與子癇前期

代謝組學是組學研究熱點之一,可以系統(tǒng)地研究體液或組織里代謝物的變化,代謝物的濃度及聯(lián)合多種代謝物可以應用于預測疾病的分類和病程發(fā)展[21]。子癇前期是一種妊娠期特有疾病,隨著代謝組學技術(shù)的不斷發(fā)展,越來越多的學者借助代謝組學技術(shù)對子癇前期展開研究。

3.1 尋找子癇前期的生物標志物 Kenny等[22]在2005年首次應用氣相色譜-飛行時間質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)分析87例子癇前期患者血漿樣本,應用遺傳編程方法處理數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)3個代謝峰(峰403、415、427)可以有效地區(qū)分子癇前期和健康對照,敏感度和特異度分別為100%和98%,其中峰403、415呈下降趨勢,可能是該病的保護性因子,而峰427呈上升趨勢,可能與疾病的嚴重程度相關(guān)。Austdal等[23]運用NMR技術(shù)同時對子癇前期患者血清和尿液樣本進行檢測,發(fā)現(xiàn)子癇前期患者的代謝圖譜明顯不同于健康妊娠婦女,從子癇前期患者尿液中鑒定出9個生物標志物,健康妊娠婦女與健康未孕婦女比較有15個差異性代謝物;對血清脂質(zhì)譜進行分析發(fā)現(xiàn)子癇前期患者血清低密度脂蛋白、極低密度脂蛋白濃度明顯升高,而高密度脂蛋白濃度明顯降低,與心血管疾病的危險因子一致[24]。該實驗證明可通過代謝組學方法對子癇前期進行分類,同時也揭示了妊娠和子癇前期可能介導的代謝變化。

3.2 子癇前期的診斷及探索其發(fā)病機制 目前子癇前期的診斷主要基于血壓和蛋白尿?qū)χ匾鞴俚膿p害,其病因尚不明確,可能發(fā)病機制主要有胎盤淺著床、氧化應激、免疫適應不良、炎性反應、血管內(nèi)皮細胞及血管功能障礙等[22]。Turner等[25]利用1H-NMR對子癇前期患者和健康妊娠婦女血漿進行分析,結(jié)果提示芳香族氨基酸(組氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸)可以充分區(qū)別子癇前期和健康孕婦。Dunn等[26]應用UPLC-MS分析子癇前期患者和健康妊娠孕婦胎盤絨毛培養(yǎng)基的代謝足跡,該實驗取子癇前期患者和健康妊娠婦女分娩后的胎盤絨毛,分別在1%和6%氧濃度下培養(yǎng),結(jié)果發(fā)現(xiàn)在相同氧濃度培養(yǎng)下的子癇前期患者和健康妊娠組絨毛代謝足跡不相同,而在常氧濃度(6%)下培養(yǎng)的子癇前期婦女的絨毛和低氧濃度(1%)下健康妊娠婦女的絨毛其代謝足跡相似,主要有三大類代謝物發(fā)生顯著變化,分別是谷氨酸/谷氨酰胺、色氨酸、白三烯/前列腺素,證明了胎盤缺氧在子癇前期發(fā)病機制中的重要作用。De Oliveira等[27]應用基質(zhì)輔助激光解吸電離質(zhì)譜對8例早發(fā)型子癇前期血漿脂質(zhì)代謝指紋進行分析,運用模式識別方法,鑒定出12個脂質(zhì)類差異性代謝物,結(jié)果表明對子癇前期脂質(zhì)代謝指紋分析有助于該病發(fā)病機制的研究。

3.3 應用生物標志物實現(xiàn)子癇前期的早期預測 生物體接受刺激后大量的代謝信息改變出現(xiàn)在臨床癥狀以前,越來越多學者利用代謝組學致力于疾病早期標志物的研究[28]。Kenny等[29]利用UPLC-MS技術(shù)實現(xiàn)對子癇前期的早期預測,通過對子癇前期患者早期(15±1)周血漿的研究,應用多元統(tǒng)計學分析篩選出生物標志物,并應用14個生物標志物對另一地區(qū)孕婦早期(15±1)周血漿進行子癇前期的預測,其結(jié)果顯示預測率可達92%。該實驗為子癇前期提供了一種全新的早期篩查手段。實現(xiàn)對子癇前期的早期預測可為早期臨床干預提供依據(jù),具有重要的臨床意義,吸引了大量學者對子癇前期早期預測的研究。Bahado-Singh等[30-31]先后實現(xiàn)了應用早孕期血漿代謝物對早發(fā)型子癇前期、晚發(fā)型子癇前期的預測。2012年,該研究小組用NMR技術(shù)對子癇前期患者早孕期間的血漿進行代謝物分析,結(jié)果找到20種差異性代謝物,應用其中4種代謝產(chǎn)物檸檬酸、甘油、羥基甲基丁酸鈣和蛋氨酸對早發(fā)型子癇前期進行預測,其預測率可達75.9%,假陽性率為4.9%,結(jié)合早孕期多普勒超聲子宮動脈的搏動指數(shù)和胎兒頭臀長,可將預測率提高至82.6%,假陽性率降低至1.6%。2013年,該研究小組以NMR技術(shù)通過對30例晚發(fā)型子癇前期患者的早孕期血清進行分析,結(jié)果找到17種有統(tǒng)計學意義的代謝物,其中14種代謝物濃度升高,3種代謝物濃度降低。應用多種差異性代謝物和孕婦基礎信息對晚發(fā)型子癇前期進行預測,靈敏度和特異度分別為76.6%和100.0%。這些研究表明,運用代謝組學技術(shù)早期預測子癇前期是可行的,同時結(jié)合多種手段可提高對該病的預測率,實現(xiàn)對不同類型子癇前期的早期篩查,具有重要的臨床意義。

4 小結(jié)與展望

代謝組學是一種研究生物體低分子代謝物的有效手段,技術(shù)平臺和數(shù)據(jù)處理方法也日趨成熟,許多研究證實了應用代謝組學對子癇前期研究的可行性,為子癇前期提供了分子生物學依據(jù)。由于子癇前期的病因和病理機制不明確,應用代謝組學對子癇前期的研究有著廣闊的前景。代謝組學是基因組學、轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學的最終方向,能提供全面的代謝信息,結(jié)合目前的研究成果來看,代謝組學在對子癇前期的早期診斷和鑒別診斷中起著重要作用,探索子癇前期的發(fā)病機制,有重要的研究價值。以代謝組學為基礎聯(lián)合多種組學技術(shù),從基因和蛋白質(zhì)層面挖掘差異性代謝物的代謝途徑,從分子水平闡述其發(fā)病機制可能成為子癇前期的研究重點。

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10.3969/j.issn.1009-5519.2015.13.019

:A

:1009-5519(2015)13-1978-04

∶2015-03-14)

∶陳洪(1988-),女,重慶榮昌人,碩士研究生,主要從事婦產(chǎn)科臨床工作;E-mail∶747226912@qq.com。

∶徐紅兵(E-mail∶xhbyhr2008@sina.com)。

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