周曉潮,王春梅
(北京中醫(yī)藥大學(xué)中藥學(xué)院,北京 100102)
隨著越來(lái)越多的原核生物基因組測(cè)序工作的完成,一些有趣的信息引起了科學(xué)界的關(guān)注,如原核中竟然存在大量絲氨酸/蘇氨酸激酶,它們是否與真核生物中的激酶一樣可作為細(xì)胞生長(zhǎng)分裂與分化的信號(hào)調(diào)控系統(tǒng)的組成部分?在已研究的21個(gè)藍(lán)藻菌株基因組中,發(fā)現(xiàn)了286個(gè)基因編碼絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶(serine/threonine protein kinase,STPK),其中,魚(yú)腥藻 7120(Anabaena sp.PCC 7120)含有52個(gè)基因編碼 STPK[1]。盡管這些STPK的功能大多還不明確,但如此大量的基因表明,其編碼的蛋白在藍(lán)藻細(xì)胞生命中一定起到了重要的作用。真核細(xì)胞中,細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶(cyclin-dependent kinase,CDK)屬于絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶家族[2],與細(xì)胞周期蛋白(cyclin)結(jié)合后被激活,可催化底物磷酸化[3]。CDKs在細(xì)胞周期循環(huán)過(guò)程中發(fā)揮重要作用,依序完成DNA合成和有絲分裂,引起細(xì)胞的生長(zhǎng)和增殖[4]。Roscovitine 是 CDC2/cyclin B、CDK2/cyclin A、CDK2/cyclin E、CDK5/p35的選擇性抑制劑??筛?jìng)爭(zhēng)性地與CDKs的腺嘌呤位點(diǎn)結(jié)合,從而將細(xì)胞阻止于G1/S期和G2/M期,使細(xì)胞在G2期積累,最終導(dǎo)致死亡[5]。藍(lán)藻中也存在與CDKs基因序列同源性較高的激酶基因,這些藍(lán)藻中的激酶是否也與細(xì)胞分裂調(diào)控相關(guān),本文考察了CDKs的抑制劑roscovitine對(duì)絲狀多細(xì)胞藍(lán)藻魚(yú)腥藻7120、單細(xì)胞藍(lán)藻集胞藻6803(Synechocystis sp.PCC 6803)和聚球藻 7002(Synechococcus sp.PCC 7002)生長(zhǎng)的影響,將為進(jìn)一步揭示STPK在藍(lán)藻細(xì)胞分裂過(guò)程中的作用奠定基礎(chǔ)。
1.1.1 材料與試劑 絲狀藍(lán)藻魚(yú)腥藻7120(Anabaena sp.PCC 7120)由中國(guó)科學(xué)院植物研究所施定基博士贈(zèng)送,單細(xì)胞藍(lán)藻集胞藻6803(Synechocystis sp.PCC 6803)、單細(xì)胞藍(lán)藻聚球藻7002(Synechococcus sp.PCC 7002)由中國(guó)科學(xué)院植物研究所黃芳博士贈(zèng)送;實(shí)驗(yàn)用試劑Roscovitine和二甲基亞砜(DMSO)為Sigma公司產(chǎn)品,MTT(3-(4,5-Dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide)為Amresco公司產(chǎn)品。
1.1.2 培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件 魚(yú)腥藻7120和集胞藻6803采用BG-11(加氮)培養(yǎng)基[6],置于轉(zhuǎn)速為120 r/min,培養(yǎng)溫度(28±1)℃,光照強(qiáng)度約為80 μmol/m2/s的HPG-280BX光照控溫旋轉(zhuǎn)培養(yǎng)箱(哈爾濱市東聯(lián)電子技術(shù)開(kāi)發(fā)有限公司)中培養(yǎng)。聚球藻7002采用Medium A培養(yǎng)基,置于轉(zhuǎn)速為120 r/min,培養(yǎng)溫度(30±1)℃,光照強(qiáng)度約為80 μmol/m2/s的光照控溫旋轉(zhuǎn)培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。
1.2.1 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì) 選取3種藻對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的細(xì)胞培養(yǎng)物,接種于相應(yīng)的新鮮培養(yǎng)基中,起始OD750達(dá)0.3左右。將上述每種藻培養(yǎng)液分別加置A、B兩塊24孔板上,每孔培養(yǎng)體積1 mL。每塊板分別設(shè)置空白組、對(duì)照組、加藥組,每組3個(gè)平行??瞻捉M分別為BG-11(加氮)或Medium A培養(yǎng)基,對(duì)照組為不加roscovitine的藻培養(yǎng)液,加藥組中 roscovitine的濃度分別為50、100、200和300 μmol/L。A板培養(yǎng)至4 h,B板培養(yǎng)至 4 d取樣。
1.2.2 顯微鏡下觀察藻細(xì)胞形態(tài) 取各組藻細(xì)胞液20 μL于玻片上,使用TE2000-S倒置顯微鏡(日本,Nikon),在10倍目鏡、40倍物鏡下進(jìn)行觀察,照相。
1.2.3 不同濃度roscovitine對(duì)3種藻生長(zhǎng)的影響使用UV2100紫外分光光度計(jì)(美國(guó),UNICO)測(cè)取波長(zhǎng)750 nm下,3種藻各組藻培養(yǎng)液的吸光度值[7]。
1.2.4 MTT法測(cè)3種藻的活力變化[8-9]從上述各板中每孔分別取300 μL藻培養(yǎng)液至1.5 mL EP管中,向培養(yǎng)液中加入100 μL濃度為0.5 mg/mL的MTT溶液,轉(zhuǎn)速為120 r/min,培養(yǎng)溫度(35±1)℃,光照強(qiáng)度約為 80 μmol/m2/s,孵育 2.5 h。12000 r/min離心10 min,棄上清,向沉淀中加DMSO(A 板:150 μL;B 板:750 μL),充分溶解。12000 r/min離心10 min,取上清100 μL 至96 孔板,使用ELx800酶標(biāo)儀(美國(guó),BioTek)測(cè)取波長(zhǎng)490 nm下的吸光度值。
圖1 roscovitine作用4 d對(duì)3種藍(lán)藻生長(zhǎng)的影響Fig.1 The effects of roscovitine on the growth of three species of cyanobacterial strains after treated 4 days
圖2 不同濃度roscovitine作用4 h和4 d對(duì)魚(yú)腥藻7120生長(zhǎng)的影響Fig.2 The effects of roscovitine on the growth of Anabaena sp.PCC 7120 after treated 4 hour or 4 days
如圖1所示,魚(yú)腥藻7120加藥組藻絲狀體較短,所含藻細(xì)胞數(shù)較少;對(duì)照組絲狀體較長(zhǎng),所含藻細(xì)胞數(shù)較多。集胞藻6803和聚球藻7002加藥組與對(duì)照組比較,藻細(xì)胞在形態(tài)上無(wú)差別。
研究了短期(4 h)和較長(zhǎng)期(4 d)roscovitine對(duì)3種藻的作用效果。藻液吸光度OD750數(shù)值反映了roscovitine對(duì)細(xì)胞數(shù)的影響。MTT檢測(cè)結(jié)果OD490數(shù)值反映了細(xì)胞的活性。如圖2A所示,加藥4 h,不同濃度roscovitine對(duì)魚(yú)腥藻7120的細(xì)胞數(shù)沒(méi)有影響,加藥4 d,濃度大于100 μmol/L的roscovitine對(duì)魚(yú)腥藻7120的細(xì)胞數(shù)具有明顯的降低作用(P<0.05),且 roscovitine濃度越高細(xì)胞數(shù)越少。圖2B顯示加藥4 h,濃度大于100 μmol/L的roscovitine對(duì)魚(yú)腥藻7120細(xì)胞活性有極顯著的抑制作用(P<0.01),且這種抑制作用呈劑量依賴性;加藥4 d 200 μmol/L的roscovitine對(duì)細(xì)胞活性有顯著的抑制作用(P<0.05),300 μmol/L的roscovitine對(duì)細(xì)胞活性有極顯著的抑制作用(P <0.01)。
圖3 不同濃度roscovitine作用4 h和4 d對(duì)集胞藻6803生長(zhǎng)的影響Fig.3 The effects of roscovitine on the growth of Synechocystis sp .PCC 6803 after treated 4 hour or 4 days
如圖 3A 所示,加藥 4 h,300 μmol/L 的roscovitine對(duì)集胞藻6803有輕微的刺激作用,短時(shí)間內(nèi)增加了細(xì)胞數(shù)(P<0.05);加藥4 d,不同濃度的roscovitine均對(duì)集胞藻6803的細(xì)胞數(shù)具有極顯著的降低作用(P<0.01),且roscovitine濃度越高細(xì)胞數(shù)越少。圖3B顯示加藥4 h,不同濃度roscovitine對(duì)集胞藻6803細(xì)胞活性無(wú)顯著的抑制作用(P>0.05);圖3C顯示加藥4 d,只有50 μmol/L的roscovitine對(duì)細(xì)胞活性促進(jìn)作用(P<0.05),其他濃度無(wú)影響。
如圖4A所示,加藥4 h,不同濃度的roscovitine均對(duì)聚球藻7002細(xì)胞數(shù)具有極顯著的增多作用 (P<0.01),且roscovitine濃度越高細(xì)胞數(shù)越多;加藥4 d,不同濃度roscovitine對(duì)聚球藻7002的細(xì)胞數(shù)無(wú)影響 (P>0.05)。圖4B顯示加藥4 h,不同濃度 roscovitine對(duì)聚球藻7002細(xì)胞活性有顯著的增強(qiáng)作用 (P<0.05),且roscovitine濃度越高細(xì)胞活性越強(qiáng);圖4C顯示加藥4 d,不同濃度roscovitine對(duì)細(xì)胞活性無(wú)影響 (P>0.05)。
圖4 不同濃度roscovitine作用4 h和4 d對(duì)聚球藻7002生長(zhǎng)的影響Fig.4 The effects of roscovitine on the growth of Synechococcus sp .PCC 7002 after treated 4 hour or 4 days
本研究結(jié)果顯示,roscovitine抑制絲狀多細(xì)胞魚(yú)腥藻7120的活性,從而抑制藻的生長(zhǎng)。從形態(tài)上,長(zhǎng)時(shí)間作用后的魚(yú)腥藻7120藻絲體較短。roscovitine短時(shí)間作用對(duì)聚球藻7002的活性和生長(zhǎng)有刺激作用,但長(zhǎng)時(shí)間作用不顯著。對(duì)于單細(xì)胞集胞藻6803,雖然roscovitine并沒(méi)顯示出對(duì)其活性的抑制,但長(zhǎng)時(shí)間作用后藻的生長(zhǎng)受到抑制。從以上結(jié)果來(lái)看,roscovitine影響了藍(lán)藻的生長(zhǎng)。roscovitine對(duì)不同的藍(lán)藻表現(xiàn)出不同的影響,可能對(duì)于不同藍(lán)藻其作用靶點(diǎn)不同,表現(xiàn)出不同程度的效應(yīng)。roscovitine影響了每種藍(lán)藻細(xì)胞中的哪些激酶還有待深入研究。
對(duì)藍(lán)藻中激酶的功能研究已經(jīng)引起多個(gè)實(shí)驗(yàn)室的注意。魚(yú)腥藻7120的PknA(Alr4366)是第一個(gè)被發(fā)現(xiàn)的在絲氨酸/蘇氨酸位點(diǎn)上磷酸化的蛋白激酶,是藍(lán)藻正常生長(zhǎng)和分化所必需的[10]。pkn41(alr0709)和 pkn42(alr0710)參與氮代謝調(diào)控[11],PknD(Alr4368)是固氮條件下正常生長(zhǎng)所必需的,可能參與異形胞與營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞間氮代謝產(chǎn)物的運(yùn)輸[12]。Pkn30和Pkn44用于合成異形胞特定糖脂 HGL2[13],HepS(All2760)在異形胞多糖層的形成過(guò)程中起調(diào)節(jié)作用[14]。pknE(alr3732)參與異形胞被膜的形成,并間接控制固氮作用[15]。pknH(alr1336)只在異形胞中表達(dá),用于穩(wěn)定地連接異形胞與營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞[16]。目前對(duì)于魚(yú)腥藻STPK的研究主要集中在細(xì)胞分化過(guò)程,異形胞形成和氮代謝調(diào)控三方面,關(guān)于STPK在細(xì)胞分裂過(guò)程中的作用未見(jiàn)報(bào)道,但細(xì)胞分裂過(guò)程與藍(lán)藻的生長(zhǎng)密切相關(guān)。在真核生物中STPK參與調(diào)控細(xì)胞分裂,那么在原核生物中STPK是否還具有這一作用呢?roscovitine是真核細(xì)胞分裂的抑制劑,在本研究中顯示能抑制魚(yú)腥藻7120的生長(zhǎng),推測(cè)roscovitine可能抑制了藍(lán)藻細(xì)胞的分裂。roscovitine對(duì)魚(yú)腥藻7120生長(zhǎng)和活性的影響是通過(guò)抑制某一種或某一類(lèi)蛋白起作用的,其結(jié)構(gòu)和功能與真核細(xì)胞中的CDKs類(lèi)似,參與調(diào)控細(xì)胞的生長(zhǎng)與增殖。因其與roscovitine結(jié)合活性受到影響,從而抑制了魚(yú)腥藻7120的生長(zhǎng)和活性。在 NCBI(National Center for Biotechnology Information)中對(duì)魚(yú)腥藻7120的總蛋白進(jìn)行序列比對(duì),尋找與人CDK1(NCBI登錄號(hào):P06493)、CDK2(NCBI登錄號(hào):CAA43985)和CDK5(NCBI登錄號(hào):CAG33322)類(lèi)似的蛋白激酶。檢索結(jié)果顯示,與人的CDK1進(jìn)行比對(duì),有一個(gè)蛋白總分值最高,為82.0,相似度為30%;總分值在50~80的蛋白有20個(gè),相似度在23% ~29%之間,其中包含已知的蛋白激酶PknE。與CDK2和CDK5進(jìn)行序列比對(duì),總分值在50~80的蛋白分別有33和24個(gè),相似度分別在24% ~31%和23% ~35%之間,其中已知的蛋白激酶有PknA、PknD和PknE。另外還有許多蛋白與CDK1、CDK2和CDK5有相對(duì)更低的相似性,分值小于50。上述所有蛋白均為絲氨酸/蘇氨酸激酶,而roscovitine很可能作用于這些蛋白中的某一個(gè)或幾個(gè),從而抑制了魚(yú)腥藻7120的活性和分裂。此推測(cè)還有待進(jìn)一步深入研究確定。
[1]Zorina,A.A.Eukaryotic protein kinases in cyanobacteria[J].Russian Journal of Plant Physiology ,2013,60(5):589-596.
[2]Pavletich N P.Mechanisms of cyclin-dependent kinase regulation:structures of cdks,their cyclin activators,and cip and INK4 inhibitors[J].Journal of molecular biology,1999,287(5):821-828.
[3]Sharma P S,Sharma R,Tyagi R.Inhibitors of cyclin dependent kinases:useful targets for cancer treatment[J].Current cancer drug targets,2008,8(1):53-75.
[4]Malumbres M,Barbacid M.Cell cycle,CDKs and cancer:a changing paradigm[J].Nature Reviews Cancer,2009,9(3):153-166.
[5]Meijer L,Borgne A,Mulner O,et al.Biochemical and cellular effects of roscovitine,a potent and selective inhibitor of the cyclin-dependent kinases cdc2,cdk2 and cdk5[J].European Journal of Biochemistry,1997,243(1-2):527-536.
[6]Castenholz R W.Culturing methods for cyanobacteria[J].Methods in enzymology,1988,167:68-93.
[7]金傳蔭,宋立榮.魚(yú)腥藻 HB1017株化能異養(yǎng)生長(zhǎng)的研究[J].水生生物學(xué)報(bào),1995,19(1):13-20.
[8]Li J,Song L.Applicability of the MTT assay for measuring viability of cyanobacteria and algae,specifically for Microcystis aeruginosa(Chroococcales,Cyanobacteria)[J].Journal Information,2007,46(5):593-599.
[9]吳窈畫(huà),談書(shū)華,范超超,等.MTT法檢測(cè)細(xì)菌細(xì)胞數(shù)的主要影響因素分析[J].微生物學(xué)雜志,2011,31(3):67-72.
[10]Zhang C C.A gene encoding a protein related to eukaryotic protein kinases from the filamentous heterocystous cyanobacterium Anabaena PCC 7120[J].Proceedings of the National A-cademy of Sciences,1993,90(24):11840-11844.
[11]Cheng Y,Li J H,Shi L,et al.A pair of iron-responsive genes encoding protein kinases with a Ser/Thr kinase domain and a His kinase domain are regulated by NtcA in the cyanobacterium Anabaena sp.strain PCC 7120[J].Journal of bacteriology,2006,188(13):4822-4829.
[12]Zhang C C,Libs L.Cloning and characterisation of the pknD gene encoding an eukaryotic-type protein kinase in the cyanobacterium Anabaena sp.PCC7120[J].Molecular and General Genetics MGG,1998,258(1-2):26-33.
[13]Shi L,Li J H,Cheng Y,et al.Two genes encoding protein kinases of the HstK family are involved in synthesis of the minor heterocyst-specific glycolipid in the cyanobacterium Anabaena sp.strain PCC 7120[J].Journal of bacteriology,2007,189(14):5075-5081.
[14]Tom S K,Callahan S M.The putative phosphatase All1758 is necessary for normal growth,cell size and synthesis of the minor heterocyst-specific glycolipid in the cyanobacterium Anabaena sp.strain PCC 7120[J].Microbiology,2012,158(2):380-389.
[15]Zhang C C,F(xiàn)riry A,Peng L.Molecular and Genetic Analysis of Two Closely Linked Genes That Encode,Respectively,a Protein Phosphatase 1/2A/2B Homolog and a Protein Kinase Homolog in the CyanobacteriumAnabaena sp.Strain PCC 7120[J].Journal of bacteriology,1998,180(10):2616-2622.
[16]Ehira S,Ohmori M.The pknH gene restrictively expressed in heterocysts is required for diazotrophic growth in the cyanobacterium Anabaena sp.strain PCC 7120[J].Microbiology,2012,158(Pt 6):1437-1443.