徐州醫(yī)學院藥學實驗中心成立于2001年12月。2003年初，藥學實驗中心以優(yōu)異成績通過了江蘇省基礎教學實驗中心評估。2005年隨著我校新校區(qū)的建設完成和投入使用，藥學實驗中心的教學基礎設施獲得了極大的改善。目前，藥學實驗中心面積超過3 000 m2，儀器設備共1 400余臺套，總值達到1 500萬元。藥學實驗中心主要承擔我校藥學、臨床藥學、藥物制劑及醫(yī)學檢驗等專業(yè)的專業(yè)基礎課與專業(yè)課的實驗教學任務，每年約有2 800余名本科生進入實驗教學中心學習和開展科技創(chuàng)新實驗工作。

為了拓展發(fā)展空間，2007年藥學院與江蘇恩華藥業(yè)股份有限公司聯(lián)合建立了校企合作實驗室：醫(yī)藥生物技術校企合作實驗室。在此基礎上，進一步建成了科研實驗平臺，以滿足教師科研和學生科技創(chuàng)新能力培養(yǎng)的需求。該實驗平臺擁有實驗室約740 m2，儀器設備價值600余萬元，并于2010年被確定為校級重點實驗室：新藥與臨床應用重點實驗室。其中藥物分析研究室已成為國家藥物臨床試驗機構1期臨床研究室和徐州市科技創(chuàng)新公共服務平臺：藥物體內及體外質量控制公共服務平臺，藥物化學研究室成為徐州地區(qū)新藥創(chuàng)制與研究公共服務平臺。

藥學實驗中心現(xiàn)有專職人員52人。其中，實驗教師41人，實驗技術人員11人；教授4人，副教授21人；博士15人，碩士28人。2009年，藥學實驗中心被江蘇省教育廳批準為高等學?；A課實驗教學示范中心建設點；2011年徐州醫(yī)學院依托藥學實驗中心與江蘇恩華藥業(yè)股份有限公司達成合作協(xié)議，成立了徐州醫(yī)學院藥學實踐教育中心，藥學實踐教育中心于2013年被評為省級實驗教學與實踐教育中心建設點。