王喜軍,堵 芳,馬 君,王 挺,盛曉楓,劉 毅,劉 偉
(1.湖南省長(zhǎng)沙市動(dòng)物衛(wèi)生監(jiān)督所,長(zhǎng)沙 410013;2.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院,長(zhǎng)沙 410128)
·簡(jiǎn)報(bào)·
長(zhǎng)沙市野生態(tài)動(dòng)物園斑馬蜱pcox1基因擴(kuò)增及序列分析
王喜軍1,2,堵 芳1,馬 君1,王 挺1,盛曉楓1,劉 毅1,劉 偉1
(1.湖南省長(zhǎng)沙市動(dòng)物衛(wèi)生監(jiān)督所,長(zhǎng)沙 410013;2.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院,長(zhǎng)沙 410128)
為研究長(zhǎng)沙市生態(tài)動(dòng)物園引進(jìn)的非洲肯尼亞斑馬蜱的線(xiàn)粒體DNA的部分細(xì)胞色素C氧化酶第Ⅰ亞基(cytochrome coxidase subunit l,pcox1)基因序列的遺傳變異情況,本研究對(duì)其線(xiàn)粒體pcox1基因序列進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并使用DNAStar(V5.01)、Clustalx2.0及Phylip3.67進(jìn)行分析。結(jié)果顯示,幾種斑馬蜱為消色牛蜱、麗色扇頭蜱和璃眼蜱屬,種間差異為0.7%~20.2%,種內(nèi)相似度較高,表明pcox1基因可作為蜱種間遺傳變異研究的標(biāo)記,研究結(jié)果為蜱的分類(lèi)鑒定以及進(jìn)一步的分子流行病學(xué)調(diào)查奠定了基礎(chǔ)。
斑馬;蜱;pcox1;序列分析
蜱屬節(jié)肢動(dòng)物門(mén)(Arthropoda)、蛛形綱(Arachnida)、蜱螨亞綱(Acari)、寄螨目(Parasitiformes)、蜱總科(Ixodoidea),為專(zhuān)性體外吸血的節(jié)肢動(dòng)物,是一類(lèi)陸生脊椎動(dòng)物非永久性體外寄生蟲(chóng),在昆蟲(chóng)學(xué)、寄生蟲(chóng)學(xué)、醫(yī)學(xué)上具有重要的地位[1]。據(jù)統(tǒng)計(jì),全世界蜱總共約899種,其中約有700多種屬于硬蜱科,約150種為軟蜱[2]。蜱以吸食血液為生,除卵外,每個(gè)發(fā)育時(shí)期的進(jìn)一步發(fā)育都必須先吸飽血[3]。蜱在自然界廣泛分布于各類(lèi)森林、草原、農(nóng)田和灌叢,種群數(shù)量取決于宿主的數(shù)量及生態(tài)環(huán)境條件[4]。蜱是許多人畜共患疾病的病原體傳播媒介和宿主。蜱所攜帶的病原體不僅能夠傳播疾病,多數(shù)情況下還能經(jīng)卵遺傳給后代。同時(shí),蜱在動(dòng)物界普遍寄生,經(jīng)常更換宿主。因此,蜱可以在許多動(dòng)物中傳染疾病,并將野生動(dòng)物或家畜體內(nèi)的病原體經(jīng)血、淋巴道傳染給人類(lèi)[5]。在所有能夠傳染疾病的媒介生物類(lèi)型中,蜱傳播疾病的能力僅次于蚊類(lèi)[6]。
目前已報(bào)道我國(guó)的蜱可傳播14種細(xì)菌、32種原蟲(chóng)、126種病毒、18種螺旋體、18種立克次體和一些支原體、衣原體,并分泌毒素[7]。世界上約10%的蜱攜帶病原體,被這種蜱叮咬后,在特定環(huán)境下將引起人、動(dòng)物疾病和地方性人畜共患?。ㄈ绯鲅獰?、萊姆病、無(wú)形體病、森林腦炎、蜱媒斑疹熱、Q熱、巴貝西蟲(chóng)病、豬瘟及蜱癱等)。國(guó)內(nèi)外已有幾例蜱傳播疾病感染導(dǎo)致神經(jīng)損害的病例[8]。2010年我國(guó)河南省商城縣爆發(fā)多起蜱叮咬人致死事件,引起人們對(duì)蜱的廣泛關(guān)注,深入研究蜱的基因序列對(duì)控制和消滅蜱傳播的多種疾病具有重要的意義。
線(xiàn)粒體DNA部分細(xì)胞色素C氧化酶第Ⅰ亞基(cytochrome c oxidase subunit 1,pcox1)基因是核基因組以外的線(xiàn)粒體基因組基因,不帶重組遺傳,因而每一個(gè)序列都是一個(gè)單模標(biāo)本[9]。pcox1以母系遺傳為主,進(jìn)化速度快,無(wú)雙親遺傳的遺傳差異,且不受基因重組、易位等畸變影響,也無(wú)核基因中那種功能不清的片段。與核基因相比,線(xiàn)粒體基因的進(jìn)化方式相對(duì)簡(jiǎn)捷,是研究分子進(jìn)化的有價(jià)值的基因[10]。本研究通過(guò)對(duì)斑馬蜱線(xiàn)粒體DNA pcox1進(jìn)行序列分析,為種群遺傳變異及進(jìn)一步分子遺傳學(xué)和診斷學(xué)提供參考。
1.1 蟲(chóng)體樣品樣品采自于長(zhǎng)沙市生態(tài)動(dòng)物園2010年7月從非洲肯尼亞引進(jìn)的斑馬(表1),各蜱樣品外觀形態(tài)見(jiàn)圖1。
表1 本研究中蜱樣品代碼Table 1 Sample code of ticks in this study
圖1 蜱樣品外觀形態(tài)Fig.1 The ventral and dorsal view of ticks
A: 消色牛蜱(BMP2); B: 麗色扇頭蜱(BMP5); C: 麗色扇頭蜱(BMP6); D: 璃眼蜱(BMP8)
A: Boophilus decoloratus (BMP2); B: Rhipicephalus pulchellu (BMP5); C: Rhipicephalus pulchellu (BMP6); D: Hyalomma(BMP8)
1.2 主要試劑WizardTM DNA Clean-Up System為Promega公司產(chǎn)品;Ex Taq酶、PCR試劑、DNA
Marker DL 2000為T(mén)aKaRa寶生物工程(大連)有限公司產(chǎn)品;蛋白酶K為Merck公司產(chǎn)品。
1.3 方法
1.3.1 蟲(chóng)體DNA的提取 取滅菌且經(jīng)過(guò)紫外燈照射過(guò)的眼科剪將蜱組織剪碎,加入Nucleic Lysis Solution裂解緩沖液200 μL,混勻;然后加入30 μL蛋白酶K (50 μg/μL),對(duì)于飽血蜱蟲(chóng)蛋白酶K使用量加倍,可達(dá)50 μL;蓋緊蓋子于震蕩儀上混勻, 56℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)16~18 h,其間數(shù)次不定時(shí)的搖動(dòng),使蜱組織與裂解液、蛋白酶K充分接觸并裂解。消化好的蟲(chóng)體懸液按Genomic DNA mini kit使用說(shuō)明提取蟲(chóng)體DNA,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.3.2 PCR擴(kuò)增 采用Chitimia等[11]報(bào)道的引物:pcox1F: 5′-GGAACAATATATTTAATTTTTG-3′(23bp),pcox1R: 5′-ATCTATCCCTACTGT AAATATATG-3′(24bp)。引物由上海生工生物技術(shù)有限公司進(jìn)行合成。擴(kuò)增體系為25 μL:滅菌水l4.25 μL、10×PCR Buffer(Mg2+free)2.5 μL、MgC12(25 mmol/L)4 μL、dNTPs(2.5 mmol/L)2 μL、上游引物(100 pmol/L)0.5 μL、下游引物(100 pmol/L)0.5 μL、Taqpolymerase(5 U/L)0.25 μL、DNA模板l μL。擴(kuò)增條件:94℃預(yù)變性5 min;94℃變性30 s,57℃退火30 s,72℃延伸45 s,共35個(gè)循環(huán);最后72℃延伸5 min。
1.3.3 pcox1序列測(cè)定及其在種系發(fā)育分析中的應(yīng)用 將純化后的PCR產(chǎn)物送華大基因生物有限公司測(cè)序,測(cè)序結(jié)果用DNAStar 5.0軟件進(jìn)行分析。從GenBankTM檢索代表性的蜱pcox1序列,然后與之進(jìn)行相似性比對(duì)和蜱種系發(fā)育分析,以豬蛔蟲(chóng)WQ為外群。利用Clustalx2.0及Phylip3.67軟件對(duì)獲得蜱pcox1序列進(jìn)行比對(duì)及計(jì)算遺傳距離。采用Mega 4.1程序中的鄰接法(Neighbor-joining method,NJ)繪制系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。
2.1 PCR擴(kuò)增結(jié)果4個(gè)樣品均成功地?cái)U(kuò)增出約800 bp的片段,與預(yù)期pcox1目的片段長(zhǎng)度相符(圖2)且無(wú)非特異性條帶。
圖2 斑馬蜱pcox1基因PCR擴(kuò)增結(jié)果Fig. 2 Amplifi cation of pcox1 of ticks from zebra by PCRM:DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)(DL2000);1~4:BMP2、BMP5、BMP6、BMP8;5:陰性對(duì)照M: DNA Marker(DL2000);1-4: BMP2, BMP5, BMP6, BMP8; 5: Negative control
2.2 基因序列測(cè)定結(jié)果及同源分析根據(jù)測(cè)序結(jié)果,蜱pcox1序列總長(zhǎng)為732 bp。通過(guò)DNAStar(V5.01)、Clustalx2.0及Phylip3.67軟件分析,各樣品的pcox1種間差異明顯,雖然,也存在種內(nèi)差異,但大部分種內(nèi)相似度很高,麗色扇頭蜱BMP5與BMP6之間相似度為99%(圖3)。用軟件PAUP構(gòu)建的MP系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)顯示,消色牛蜱BMP2、麗色扇頭蜱BMP5和BMP6、璃眼蜱BMP8的相似性高,其中BMP5與BMP6處于同一分支上,而與豬蛔蟲(chóng)相隔較遠(yuǎn),這一結(jié)果與序列分析結(jié)果具有一致性(圖4)。本研究首次報(bào)道了消色牛蜱和麗色扇頭蜱pcox1序列。
圖3 蜱pcox1基因序列差異性比較Fig. 3 Comparison of pcox1 sequence of ticks
圖4 pcox1基因序列以臨接法構(gòu)建的進(jìn)化樹(shù)Fig. 4 Phylogenic tree construction based pcox1 gene using Neighbour Joining (NJ)
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GENE MANIPULATION AND SEQUENCE ANALYSIS OF PCOX1 OF TICKS FROM A ZEBRA IN CHANGSHA ZOO
WANG Xi-jun1,2DU Fang1, MA Jun1, WANG Ting1, SHENG Xiao-feng1, LIU Yi1, LIU Wei1
(1. Hunan Animal Health Supervision Institute, Changsha 410013, China; 2. College of Veterinary Medicine, Hunan Agricultural University, Changsha 410128, China)
In order to illustrate sequence variation in cytochrome c oxidase subunit l (pcox1) mtDNA of ticks collected from a Kenya zebra in Changsha Ecological Zoo, pcox1 mtDNA are amplified and analyzed using softwares DNAStar (V5.01), Clustalx2.0 and Phylip3.67. The ticks collected from a zebra were Boophilus decoloratus, Rhipicephalus pulchellu and Hyalomma with inter-species difference at 0.7%-20.2%. The pcox1 gene might be used as a marker for genetic variability.
Zebra; tick; pcox1; sequence analysis
S852.746
B
:1674-6422(2014)04-0063-04
2013-06-18
湖南省教育廳一般項(xiàng)目(11C0669);湖南省畜牧水產(chǎn)局一般項(xiàng)目;湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)生創(chuàng)新項(xiàng)目(DFCXY201231);國(guó)家自然基金項(xiàng)目(30771616)
王喜軍,女,碩士研究生,獸醫(yī)學(xué)專(zhuān)業(yè)
劉偉,E-mail:weiliupro@163.com