劉 琳,郝曉明,董 會(huì),歐 元,趙興春,葉 健
(1.中國(guó)人民公安大學(xué),北京100038;2.重慶市公安局巴南區(qū)分局,重慶401320;3.法庭科學(xué)生物芯片工程實(shí)驗(yàn)室,北京 100038;4.公安部物證鑒定中心,北京 100038)
自20世紀(jì)90年代以來,以PCR-STR技術(shù)為代表的第二代法醫(yī)DNA分型技術(shù)在司法實(shí)踐中的應(yīng)用日益廣泛,整個(gè)DNA分型過程包括DNA提取、定量、PCR擴(kuò)增和電泳檢測(cè)與分析,其中DNA提取與PCR擴(kuò)增是兩個(gè)重要的限速步驟,常規(guī)方法難以滿足DNA數(shù)據(jù)庫(kù)規(guī)模不斷擴(kuò)大和緊急案件檢驗(yàn)的需求。本文選用AmpF?STRIdentifilerPlus試劑盒與TaKaRa公司的快速PCR試劑盒聯(lián)合建立快速直接PCR(Rapid Direct PCR[1])反應(yīng)體系,采用免提取的方式,以FTA血卡為模板,采用經(jīng)優(yōu)化的熱循環(huán)參數(shù)在快速PCR儀上完成擴(kuò)增,對(duì)如何縮短DNA分型檢測(cè)的時(shí)間進(jìn)行了初步探討。
FTA血卡樣本(公安部物證鑒定中心提供)
1.3.1 快速直接PCR擴(kuò)增
實(shí)驗(yàn)分為四組,第一組:10 μL反應(yīng)體系,直徑0.5 mm FTA血卡為模板;第二組:10 μL反應(yīng)體系,直徑1.0mm FTA血卡為模板;第三組:20 μL反應(yīng)體系,直徑0.5 mm FTA血卡為模板;第四組:20 μL反應(yīng)體系,直徑1.0mm FTA血卡為模板。
四組所用熱循環(huán)參數(shù):95℃ 3 min;95℃ 10 s,59℃ 15 s,72℃ 20 s,29 個(gè)循環(huán);72℃ 3 min;25℃保存。擴(kuò)增總用時(shí)55min。
1.3.2 常規(guī)直接PCR擴(kuò)增
取上述各PCR擴(kuò)增產(chǎn)物1μL分別與10μL上樣混合物(20μL GeneScan LIZ500內(nèi)標(biāo) +1000μL去離子甲酰胺)混合,用3130XL遺傳分析儀,按標(biāo)準(zhǔn)流程進(jìn)行電泳分離,采用GeneMapper ID V 3.2軟件進(jìn)行基因分型。
圖1 10μL反應(yīng)體系,直徑0.5mm FTA血卡為模板
如何縮短DNA分型檢測(cè)時(shí)間一直是法醫(yī)界學(xué)者們研究的焦點(diǎn)之一,例如,Verheij[2]等在 2012年將Thermo快速PCR試劑盒與AmpF?STRSGM PlusTM、AmpF?STRIdentifiler、AmpF?STRSEfilerPlusTM、AmpF?STRNGMTM分別組合,探索快速直接PCR擴(kuò)增在法庭科學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用。
圖2 10μL反應(yīng)體系,直徑1.0mm FTA血卡為模板
圖3 20μL反應(yīng)體系,直徑0.5mm FTA血卡為模板
參考文獻(xiàn):
[1]Aboud M,Oh HH,McCord B.Rapid Direct PCR for Forensic genotyping in under 25 minutes[J].Electrophoresis,2013,34(11):1539-1547.
[2]Verheij S, Harteveld J, Sijen T.A protocol for direct and rapid multiplex PCR amplification on forensically relevant samples[J].Forensic Science International: Genetics, 2012,6(2):167-75.