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TOX和SMAD3基因多態(tài)性與中國漢族人群2型糖尿病患者微血管病變的易感性相關

2013-10-22 02:37:54蔡春友魏鳳江林靜娜韓鴻玲陳莉明李衛(wèi)東
天津醫(yī)科大學學報 2013年1期
關鍵詞:天津醫(yī)科大學微血管分型

呂 佳,蔡春友,魏鳳江,張 紅,林靜娜,韓鴻玲,陳莉明,李衛(wèi)東

(1.天津醫(yī)科大學基礎醫(yī)學研究中心,天津300070;2.天津醫(yī)科大學眼科醫(yī)院,天津300384;3.天津市人民醫(yī)院,天津300121;4.天津醫(yī)科大學總醫(yī)院,天津300052;5.天津醫(yī)科大學代謝病醫(yī)院,天津300070)

糖尿病微血管病變(microvascular complications of diabetes,MVCD)主要包括糖尿病腎?。╠iabetic nephropathy,DN)和糖尿病視網(wǎng)膜病變(diabetic retinopathy,DR),是糖尿病最常見的并發(fā)癥,其致死率和致盲率呈逐年上升的趨勢。先前的研究證實,糖尿病病程的長短和血糖的控制情況是MVCD發(fā)病的危險因素[1-2],然而,有些患者MVCD的發(fā)生與血糖控制的程度并不相關[3]。另外有大量的研究表明MVCD在不同種族中患病率具有明顯的差異,而且其家族聚集現(xiàn)象也很明顯,這些都提示遺傳因素在MVCD的發(fā)生發(fā)展中起重要作用[4]。本研究以1 090名久居于天津地區(qū)的中國漢族2型糖尿病患者為研究對象,選取MVCD候選基因的SNP位點進行基因分型,旨在探討在中國漢族人群2型糖尿病患者中MVCD的遺傳背景和風險基因。

1 資料與方法

1.1 研究對象 本研究共收集了1 090名天津地區(qū)的2型糖尿病患者,均為漢族,相互之間沒有血緣關系,其中男性571人,女性519人,年齡在23~87歲之間,平均為(60.75±11.11)歲,患者均參照2010年美國糖尿病協(xié)會公布的糖尿病診斷標準確診[5]。其中DN患者共615人(DN診斷標準為:有糖尿病史且微白蛋白/肌酐>300mg/g,除外原發(fā)腎小球病和其他繼發(fā)腎小球疾病)。非DN糖尿病患者475人;非增殖性糖尿病視網(wǎng)膜病變患者(DR)共290人,增殖性糖尿病視網(wǎng)膜病變(PDR)患者共87人,非DR糖尿病患者713人;同時罹患DN和DR的糖尿病患者共157人;糖尿病病程超過10年,非DN非DR患者共165人。糖尿病視網(wǎng)膜病變患者均經(jīng)眼底鏡或眼底照相檢查,經(jīng)天津醫(yī)科大學眼科醫(yī)院兩名專家確診。調查和取樣均征得受試者本人同意并簽署了知情同意書。

1.2 方法

1.2.1 DNA提取 采用高鹽法(原平皓公司試劑盒)用來提取外周血白細胞基因組DNA,應用Nanodrop 2000/2000c分光光度計測定樣品濃度及其在230 nm、260 nm及280 nm波長處的光密度(OD)值,記錄樣品濃度(μg/μL)和純度后置于-80℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2.2 候選基因及SNP的選擇 此次研究的候選基因一部分來自于2007年對2型糖尿病全基因組關聯(lián)研究(genome-wide association study,GWAS)的結果[6-7],以及先前本實驗室對糖尿病、肥胖候選基因SNP位點基因分型(genotyping)的結果(李衛(wèi)東等,待發(fā)表資料),另一部分來自于以往的相關報道和MVCD發(fā)生有關的生物學途徑。依據(jù)SNP數(shù)據(jù)庫(The Single Nucleotide Polymorphism Database,db-SNP)中每個基因SNP位點的連鎖不平衡狀態(tài)和中國漢族人群的等位基因頻率,選擇了與糖尿病微血管病變有關的14個基因的23個SNP位點,并對這些SNP位點進行基因分型(表1)。

1.2.3 基因分型 1 090例2型糖尿病患者基因分型由IlluminaSNP芯片技術平臺進行。在進行基因分型時設重復對照,以便對基因分型結果進行監(jiān)測和質量控制?;蚍中偷慕Y果錄入Filemaker Pro數(shù)據(jù)庫中。

1.3 數(shù)據(jù)分析 數(shù)據(jù)分析應用PLINK軟件對病例對照樣品進行二分變量的關聯(lián)分析,PLINK比較病例和對照組等位基因頻率,進行Chi方檢驗。在對照組的選擇上,我們采取兩種方案:(1)采用某種疾病(DN,DR,PDR和MVCD)的所有非患病個體作為對照;(2)以2型糖尿病病程超過10年,非DN非DR者作為對照 (n=165)。因為此次進行基因分型的SNP位點較少,并且相同基因SNP位點間存在連鎖不平衡,所以未對二分變量關聯(lián)分析進行多重檢驗的調整。

表1 糖尿病微血管病變候選基因SNP位點選擇Tab1 SNP selection ofMVCD candidategenes

2 結果

在1 090例糖尿病患者中,針對DN、DR、PDR和MVCD,對候選基因SNP位點進行了病例-對照的二分變量關聯(lián)分析,結果見表2、表3。

以病程大于10年,無DN無DR糖尿病患者為對照,得到的關聯(lián)更加顯著:發(fā)現(xiàn)TOX基因的rs1526167位 點 與 DN(P=0.002,OR=0.60)、DR(P=0.011,OR=0.635)、PDR(P=0.044,OR=0.587)和MVCD(P=0.001,OR=0.596) 均存在顯著關聯(lián),SMAD3基因的 rs12102171位點與 DN(P=0.042,OR=1.453)、DR(P=0.010,OR=1.656)、PDR(P=0.017,OR=1.947)和 MVCD(P=0.024,OR=1.507)均存在顯著關聯(lián)。而另一些基因(IGF2BP2、CDKAL1、ESR1)SNP位點則與DN或PDR有關聯(lián)(表2)。

表2 候選基因SNP位點與糖尿病微血管病變的關聯(lián)分析(P值)Tab2 Association analyses for candidategene SNPs and diabeticm icrovascular complications(P values)

表3 TOX和SMAD3基因SNP位點與糖尿病微血管病變的關聯(lián)分析Tab3 Associationsam ong TOX,SMAD3 gene SNPsand diabeticm icrovascu lar comp lications

3 討論

MVCD是糖尿病最常見的并發(fā)癥,是導致慢性腎功能不全和非外傷性致盲的主要原因,嚴重危害著糖尿病患者的健康。由于MVCD在不同人種中的患病率差異和明顯的家族聚集現(xiàn)象,人們對基因在MVCD發(fā)病中的作用日益重視。目前已有許多關于MVCD易感基因的研究報道,這些基因可以分為7類,分別是 VEGF[8]、EPO[9]、ACE[10]、IL1RN、PON1[11]、SOD2[12]和HFE,這些基因及其作用與糖尿病相關基因并不完全相同,表明MVCD遺傳性可能獨立于糖尿病自身的遺傳性。

此次研究采用大樣本、多基因的研究方法,探討MVCD在2型糖尿病患者中的易感基因,以揭示MVCD的遺傳背景。本實驗共收集了1 090名2型糖尿病患者,按照MVCD患病情況進行分組(DN、DR、PDR、MVCD),采用病例對照的方法進行二分變量的關聯(lián)分析。以往的MVCD遺傳學研究,均以健康人群為對照,忽略了血糖、病程等因素對實驗的影響。因此本次研究對照組選取165名病程大于10年非DR非DN的糖尿病患者,盡量避免上述因素對實驗造成的影響。從結果可以看出,如果以病程大于10年非DR非DN的糖尿病患者作為對照,盡管對照組人數(shù)較少(n=165),但SMAD3、TOX基因SNP位點與DN、DR、PDR、MVCD的關聯(lián)更加顯著,提示SMAD3、TOX基因是MVCD的易感基因,且MVCD的遺傳背景與糖尿的遺傳背景不同。應當指出,有些2型糖尿病患者雖未發(fā)現(xiàn)微血管病變,但其已具備發(fā)生MVCD的遺傳學基礎,只是病程較短尚未發(fā)病,以這部分人作為對照來尋找MVCD的易感基因顯然值得商榷。我們采用病程>10年非DN非DR的T2D患者作為對照,可有效地檢出與MVCD相關(而不是與T2D有關)的基因,誠然,本實驗這部分對照的人數(shù)尚少,在一定程度上影響了檢驗效能(power)。

目前對MVCD發(fā)病機制的研究已經(jīng)深入到了細胞因子信號轉導通路的層面,其中TGF-β/Smad信號轉導通路在MVCD發(fā)生和發(fā)展中的作用(特別是與器官纖維化的關系)已經(jīng)得到了肯定[13]。SMAD3作為細胞膜受體和靶基因之間的關鍵橋梁,在TGF-β信號通路中發(fā)揮了核心作用,是TGF-β信號轉導通路中不可或缺的重要介質[14]。SMAD3基因具有多個SNP位點,這次我們選取rs1498506和rs12102171兩個位點。從本研究的PLINK結果中可以看出,SMAD3基因的 rs12102171與 DN、DR、PDR、MVCD均相關,與以往的研究結果相一致。

大量的研究表明,肥胖(尤其是內臟型肥胖)是產(chǎn)生胰島素抵抗的重要因素,而胰島素抵抗又是2型糖尿病發(fā)生的基礎。在先前的研究中發(fā)現(xiàn)TOX基因與肥胖相關,這就提示我們TOX基因可能是MVCD的易感基因。TOX基因是位于人類第8號染色體上的蛋白質編碼基因。在此次研究中發(fā)現(xiàn),該基因的 rs1526167位點與 DN、DR、PDR、MVCD均有相關性。本研究為進一步了解和探討MVCD的遺傳背景提供了有意義的線索,但由于MVCD的發(fā)生發(fā)展是多種遺傳因素和環(huán)境因素的共同作用所決定的,所以還需進一步進行更大樣本量的、全基因組水平的研究。

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