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醫(yī)學(xué)圖像分割方法綜述

2013-08-15 00:52黃文博1楊1王云吉2
關(guān)鍵詞:像素點(diǎn)遺傳算法灰度

黃文博1,2,燕 楊1,2,王云吉2

(1.長(zhǎng)春師范學(xué)院計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,吉林長(zhǎng)春 130032;2.吉林大學(xué)通信工程學(xué)院,吉林長(zhǎng)春 130022)

醫(yī)學(xué)圖像分割是醫(yī)學(xué)圖像處理與分析領(lǐng)域的復(fù)雜而關(guān)鍵的步驟,其目的是將醫(yī)學(xué)圖像中具有某些特殊含義的部分分割出來(lái),并提取相關(guān)特征,為臨床診療和病理學(xué)研究提供可靠的依據(jù),輔助醫(yī)生作出更為準(zhǔn)確的診斷。由于醫(yī)學(xué)圖像自身的復(fù)雜性,在分割過(guò)程中需要解決不均勻及個(gè)體差異等一系列問(wèn)題,所以一般的圖像分割方法難以直接應(yīng)用于醫(yī)學(xué)圖像分割。當(dāng)前,醫(yī)學(xué)圖像分割仍在從手動(dòng)分割或半自動(dòng)分割向全自動(dòng)分割發(fā)展。本文在對(duì)國(guó)內(nèi)外醫(yī)學(xué)圖像分割技術(shù)文獻(xiàn)研習(xí)的基礎(chǔ)上,對(duì)幾種常用的醫(yī)學(xué)圖像分割方法進(jìn)行了深入的研究和比較,總結(jié)了各種方法的優(yōu)缺點(diǎn)及其在國(guó)內(nèi)外醫(yī)學(xué)圖像分割領(lǐng)域的應(yīng)用。

1 國(guó)內(nèi)外常用的醫(yī)學(xué)圖像分割方法

1.1 閾值法

閾值法是一種簡(jiǎn)單而有效的方法,特別是對(duì)于背景與目標(biāo)區(qū)域?qū)Ρ榷容^大的圖像,分割結(jié)果更為理想。算法中的閾值需要在分割過(guò)程中不斷地手動(dòng)調(diào)整和改進(jìn),所以大多是交互式的,是在用戶視覺(jué)估計(jì)的基礎(chǔ)之上進(jìn)行判斷的。閾值法的基本思想是通過(guò)設(shè)置不同的閾值將像素點(diǎn)分類(lèi)。該方法假設(shè)灰度圖像在同一背景或目標(biāo)區(qū)域內(nèi)相鄰像素的灰度值是近似的,在不同背景或目標(biāo)區(qū)域內(nèi)相鄰像素在灰度上有差異。在圖像直方圖中可以看出,不同背景和目標(biāo)區(qū)域?qū)?yīng)著不同的波峰。

閾值法在實(shí)際應(yīng)用中主要存在兩個(gè)問(wèn)題:(1)該方法只考慮到圖像中像素點(diǎn)本身的灰度值,沒(méi)有考慮到圖像中像素點(diǎn)的空間分布,容易對(duì)噪聲敏感。(2)該方法對(duì)于背景與目標(biāo)區(qū)域灰度差異較小的圖像分割效果不好。醫(yī)學(xué)圖像因個(gè)體差異而復(fù)雜多樣,如:不均勻的人體組織器官常導(dǎo)致圖像灰度不均勻;人體組織的蠕動(dòng)及成像設(shè)備的局限性常導(dǎo)致圖像中存在偽影和噪聲;局部體效應(yīng)常導(dǎo)致組織邊緣模糊;病變組織的病變邊緣不明確等。閾值法在醫(yī)學(xué)圖像分割中具有一定的局限性。

近幾年,有許多閾值法的改進(jìn)算法被提了出來(lái),如Tang,Xu-Dong等人[1]提出了一種新的基于閾值的快速圖像分割算法,在傳統(tǒng)閾值方法的基礎(chǔ)上通過(guò)簡(jiǎn)化隸屬函數(shù),同時(shí)結(jié)合一個(gè)新的遞歸策略,從而降低了計(jì)算的復(fù)雜性,加快了運(yùn)算速度,較傳統(tǒng)算法相比其具備較好的實(shí)時(shí)時(shí)序和噪聲抑制性能。

1.2 區(qū)域生長(zhǎng)法

這種方法要求先選取種子像素點(diǎn),隨后將與其相似的像素合并到它所在的區(qū)域,其基本原理就是將相似像素集合成區(qū)域。區(qū)域生長(zhǎng)法的3個(gè)步驟:(1)選出合適的種子點(diǎn)。(2)確定在生長(zhǎng)過(guò)程中能將像素合并進(jìn)來(lái)的準(zhǔn)則。(3)制定出能讓生長(zhǎng)停止的條件。

區(qū)域生長(zhǎng)法對(duì)噪聲敏感,如果種子像素點(diǎn)選取不當(dāng),分割結(jié)果就會(huì)出現(xiàn)錯(cuò)誤,并且對(duì)于圖像中灰度值相近但不相鄰的多個(gè)區(qū)域不能一次全部分割出來(lái)。在醫(yī)學(xué)圖像分割中進(jìn)行病灶分割時(shí),如果種子點(diǎn)選取得當(dāng),這種方法可以自動(dòng)找到病灶的邊界,能為醫(yī)生的診斷提供定量及定性的依據(jù)。在醫(yī)學(xué)圖像分割中,區(qū)域生長(zhǎng)法與閾值法一樣,一般不單獨(dú)使用,多與其他分割方法相結(jié)合。如Jiang,Hui-Yan等人[2]將區(qū)域生長(zhǎng)算法和OSTU算法相結(jié)合對(duì)30個(gè)邊緣模糊的腹部MRI圖像進(jìn)行了有效分割;Wu,Hai-Shan和Gil,Joan等人[3]使用一個(gè)迭代的區(qū)域生長(zhǎng)算法對(duì)卵巢細(xì)胞內(nèi)染色質(zhì)進(jìn)行了有效分割;Angelina,S.等人[4]在2012年提出了一種新的區(qū)域生長(zhǎng)及合并算法與遺傳算法相結(jié)合的醫(yī)學(xué)圖像分割算法,用于對(duì)惡性黑色素瘤等皮膚癌進(jìn)行早期診斷,和其他常規(guī)算法相比提高了分割效率,解決了利用非侵入性診斷工具皮膚鏡對(duì)皮膚癌進(jìn)行早期診斷耗時(shí)長(zhǎng)等問(wèn)題。

1.3 邊緣檢測(cè)法

邊緣檢測(cè)法通過(guò)對(duì)目標(biāo)區(qū)域邊界的檢測(cè)來(lái)進(jìn)行分割,先找到圖像中灰度值不連續(xù)的部分,通過(guò)對(duì)不均勻的區(qū)域間交集的檢測(cè)實(shí)現(xiàn)對(duì)圖像的分割。它包括串行和并行兩種方法:(1)串行方法:該方法首先檢測(cè)出起始點(diǎn),設(shè)置相似性準(zhǔn)則,然后根據(jù)它來(lái)尋找與上一點(diǎn)歸屬于同一類(lèi)別的下個(gè)輪廓點(diǎn),即確定后繼相似點(diǎn)。使用該方法進(jìn)行分割可得到連續(xù)的邊緣,但分割結(jié)果比較依賴初始邊緣點(diǎn),不合適的初始邊緣點(diǎn)可能導(dǎo)致錯(cuò)誤的邊緣。(2)并行方法:該方法通常利用空域微分算子,將相應(yīng)模板與圖像進(jìn)行卷積最后完成圖像的分割。該方法可同時(shí)在各個(gè)像素上進(jìn)行卷積,所以大大減少了運(yùn)行時(shí)間。常用的并行方法有Canny算子、Sobel算子、Laplacian算子、Prewitt算子、LOG算子等。并行方法對(duì)噪聲敏感,且當(dāng)邊緣的像素值變化較小時(shí),可能會(huì)得到不連續(xù)或虛假邊界。在實(shí)際應(yīng)用中。由于并行方法比串行方法分割時(shí)間短,所以并行邊緣檢測(cè)法在醫(yī)學(xué)圖像分割中更為常用。如2012年P(guān)ark,J.等人[5]使用并行邊界與區(qū)域相結(jié)合的方法對(duì)不同醫(yī)學(xué)圖像進(jìn)行分割,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,該方法能可靠準(zhǔn)確地分割低對(duì)比度的復(fù)雜醫(yī)學(xué)圖像。

1.4 基于活動(dòng)輪廓模型的方法

活動(dòng)輪廓模型,又稱(chēng)Snake模型,由Kass在1987年提出。由于Snake模型有著高效的數(shù)值方案以及嚴(yán)謹(jǐn)?shù)臄?shù)學(xué)基礎(chǔ),且應(yīng)用廣泛,提出后即成為圖像分割領(lǐng)域所研究的熱點(diǎn)。原始的Snake模型其基本思想是通過(guò)能量最小化,將一條帶有能量函數(shù)的初始曲線朝著待檢測(cè)的目標(biāo)輪廓方向逐步變形與運(yùn)動(dòng),最終收斂到目標(biāo)邊界,得到一個(gè)光滑并且連續(xù)的輪廓。

原始Snake模型首先在目標(biāo)區(qū)域附近手動(dòng)設(shè)置一條閉合曲線作為Snake模型的初始輪廓線,初始輪廓線隨時(shí)間不斷演化,越來(lái)越逼近目標(biāo)邊界,當(dāng)演化停止時(shí)即獲得最終結(jié)果。Snake算法的3個(gè)主要步驟為:(1)讀取數(shù)據(jù);(2)數(shù)據(jù)的預(yù)處理,如圖像的去噪、求梯度,求外力場(chǎng)等;(3)確定模型的參數(shù)與迭代次數(shù),然后開(kāi)始迭代。

原始的Snake模型存在難以捕捉目標(biāo)凹陷邊界及對(duì)初始輪廓線敏感等不足,針對(duì)這些不足,學(xué)者們進(jìn)行了相應(yīng)的改進(jìn),如氣球Snake模型、GVF Snake模型等與其他理論相結(jié)合的Snake模型。Qian Zhang等人[6]對(duì)Snake原始算法進(jìn)行了改進(jìn),對(duì)肝臟MRI進(jìn)行識(shí)別,通過(guò)對(duì)曲率的求取及對(duì)輪廓線的設(shè)置、收斂及校正,提高了識(shí)別效率,并減少了后處理成本;MatsakouA.I等人[7]提出了一種基于梯度向量流GVF Snake模型的自動(dòng)分割方法,用于檢測(cè)B超圖像中的縱向頸動(dòng)脈壁,準(zhǔn)確率達(dá)到98%;Hui-Yan Jiang等人[8]提出了一種改進(jìn)的基于GVF Snake模型的半自動(dòng)肝臟分割方法,通過(guò)與閾值法和形態(tài)學(xué)運(yùn)算相結(jié)合,獲取肝臟的初始輪廓,繼而創(chuàng)建外力場(chǎng),在GVF場(chǎng)的影響下,初始輪廓線收斂到精確的目標(biāo)輪廓位置。

1.5 模糊聚類(lèi)法

大多數(shù)的醫(yī)學(xué)圖像具有模糊性,圖像質(zhì)量低、噪聲大。模糊聚類(lèi)法將模糊集理論與聚類(lèi)算法相結(jié)合,模糊集理論對(duì)圖像的不確定性具備較好描述能力,將此特點(diǎn)結(jié)合到分類(lèi)中,應(yīng)用到醫(yī)學(xué)圖像分割領(lǐng)域。該方法不是以“一刀切”的方式將像素點(diǎn)硬性分到某一區(qū)域,而是引入模糊理論中“隸屬度”的概念,將像素點(diǎn)分到隸屬程度高的區(qū)域中去,提高了分割的準(zhǔn)確率。目前最常用的是模糊C-均值算法(FCM),該算法通過(guò)兩次迭代得到最優(yōu)邊界。

模糊C-均值算法(FCM)是一種無(wú)監(jiān)督算法,易于應(yīng)用,但其中各像素點(diǎn)的數(shù)據(jù)是相互獨(dú)立的,沒(méi)有利用圖像的空間信息,所以可以將空間信息引入算法當(dāng)中以提高分割算法的準(zhǔn)確率。近年來(lái),基于模糊聚類(lèi)的圖像分割方法及其改進(jìn)算法在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域得到了廣泛應(yīng)用,如Kaur,P.等人[9]在2012年提出了一種自動(dòng)的直觀模糊聚類(lèi)方法,在模擬和真實(shí)的腦部MRI圖像中進(jìn)行實(shí)驗(yàn),對(duì)比傳統(tǒng)的模糊C-均值、噪聲聚類(lèi)、核化模糊C-均值等方法,實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示Kaur,P.等人提出的方法更為可靠有效;Liu,Y.等人[10]提出一種帶有雙邊濾波的模糊C-均值(FCM)聚類(lèi)方法進(jìn)行醫(yī)學(xué)圖像分割,通過(guò)實(shí)驗(yàn)結(jié)果和定量分析表明,與傳統(tǒng)的FCM相比,該方法具備更高標(biāo)準(zhǔn)的抑制噪聲能力和細(xì)節(jié)保護(hù);Christ,M.C.J.等人[11]提出根據(jù)不同類(lèi)型的模糊C-均值算法改進(jìn)的醫(yī)學(xué)圖像分割技術(shù),并將模糊C-均值和其他聚類(lèi)算法如KM、EM和KNN相比較,實(shí)驗(yàn)證明模糊C-均值可提供更好的結(jié)果。

1.6 基于遺傳算法的方法

遺傳算法依據(jù)“物競(jìng)天擇,適者生存”這一自然界規(guī)則,模擬生物在自然環(huán)境中的遺傳和進(jìn)化過(guò)程,從而形成一種遵循自然選擇機(jī)制的隨機(jī)化搜索方法。求解過(guò)程大致為:從一個(gè)初始變量群開(kāi)始,通過(guò)對(duì)染色體中的基因進(jìn)行操作來(lái)完成逐代尋優(yōu),直到算法收斂找到最佳分割閾值,最終完成不同區(qū)域的分割。該算法善于全局搜索,局部搜索能力不足,無(wú)需給出所求問(wèn)題的任何信息,只需要目標(biāo)函數(shù)的信息即可,大大縮短了算法的運(yùn)行時(shí)間。有時(shí)在進(jìn)化過(guò)程中會(huì)產(chǎn)生一些異常的個(gè)體,尤其是噪聲干擾較大的時(shí)候,這些個(gè)體因競(jìng)爭(zhēng)力太強(qiáng)會(huì)對(duì)算法的選擇運(yùn)算過(guò)程產(chǎn)生負(fù)面影響,導(dǎo)致算法得到某個(gè)局部最優(yōu)解。這些不足可從編碼方式、遺傳算子、控制參數(shù)、執(zhí)行策略等方面得到改進(jìn)。

單獨(dú)使用遺傳算法對(duì)醫(yī)學(xué)圖像進(jìn)行分割的效果并不理想,它常與神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和形態(tài)學(xué)理論等其他智能計(jì)算方法相互結(jié)合使用。如Guan,X.-W.等人[12]在2011年提出一種遺傳算法,用全局搜索能力和類(lèi)間最大變化作為適應(yīng)度函數(shù),算法結(jié)合形態(tài)學(xué)理論提取圖像邊緣,實(shí)現(xiàn)分割。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,這種遺傳算法性能穩(wěn)定,融合結(jié)果理想;Jaffar,M.A.等人[13]在2009年提出一種結(jié)合支持向量機(jī)的遺傳算法,在肺部CT圖像中對(duì)肺結(jié)節(jié)進(jìn)行檢測(cè),分割效果理想;Liu,J.等人[14]提出了一種遺傳神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法來(lái)分割皮膚癌圖像,執(zhí)行基于遺傳算法的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的權(quán)重和閾值優(yōu)化來(lái)改進(jìn)BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的收斂速度,由該方法分割的皮膚癌圖像可得到連續(xù)的邊緣和清晰的輪廓,可以用于皮膚癌的定量分析和鑒定。

1.7 基于小波變換的方法

小波變換是對(duì)Fourier分析的繼承與發(fā)展,利用小波變換進(jìn)行醫(yī)學(xué)圖像分割的基本方法是通過(guò)小波變換將圖像直方圖分解成不同級(jí)別的系數(shù),用尺度控制并依照小波系數(shù)和給定的分割準(zhǔn)則來(lái)選擇閾值。小波變換在較大尺度上由噪音引起的細(xì)小突變較少,容易描述醫(yī)學(xué)圖像信號(hào)的整體行為,可檢測(cè)出醫(yī)學(xué)圖像灰度值變化較大的輪廓,因此可以通過(guò)在不同尺度下逐步確定閾值來(lái)處理醫(yī)學(xué)圖像。Bindu,Ch.Hima1等人[15]在2011年提出了一種基于小波變換的全自動(dòng)醫(yī)學(xué)圖像分割方案。整個(gè)計(jì)劃分為3個(gè)階段。在第一階段中,計(jì)算圖像的小波變換,隨后融合LH,HL和HH系數(shù);在第二階段中,通過(guò)計(jì)算全局閾值來(lái)確定初始點(diǎn);在第三階段中,從每個(gè)初始點(diǎn)開(kāi)始進(jìn)行搜索程序,得到閉環(huán)輪廓;Alzubi,S.等人[16]在2011年使用小波、脊波和曲波變換的多分辨率分析建立了一個(gè)醫(yī)學(xué)圖像分割系統(tǒng)。在不同的醫(yī)學(xué)圖像如PET,CT或MRI圖像進(jìn)行實(shí)驗(yàn)研究,對(duì)曲波變換的醫(yī)療數(shù)據(jù)集進(jìn)行了測(cè)試,并與從其他變換所得到的結(jié)果進(jìn)行了比較。試驗(yàn)表明,使用曲波掃描顯著提高了異常組織分類(lèi),并減少了噪聲。

2 結(jié)語(yǔ)

隨著醫(yī)學(xué)成像和計(jì)算機(jī)輔助技術(shù)的發(fā)展,圖像分割技術(shù)已經(jīng)成為醫(yī)學(xué)圖像處理的研究熱點(diǎn)。研究人員一邊致力于新的醫(yī)學(xué)圖像分割算法研究,一邊又不斷嘗試著將不同的方法進(jìn)行巧妙的結(jié)合,以達(dá)到對(duì)醫(yī)學(xué)圖像更有效的分割。一些全新的醫(yī)學(xué)圖像自動(dòng)分割技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生,如圖割圖論、基于知識(shí)的分割方法等,這是近幾年醫(yī)學(xué)圖像分割領(lǐng)域新成果的代表,也是未來(lái)醫(yī)學(xué)圖像分割技術(shù)的研究方向。

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