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長(zhǎng)春地區(qū)部分醫(yī)院革蘭陰性桿菌氨基糖苷類修飾酶基因的檢測(cè)

2013-08-11 15:54周佳琦盧佳睿孫延波
關(guān)鍵詞:糖苷埃希菌氨基

周佳琦,盧佳睿,徐 花,韓 放,孫延波

(吉林大學(xué)白求恩醫(yī)學(xué)院病原生物學(xué)系,吉林 長(zhǎng)春 130021)

*吉林大學(xué)白求恩醫(yī)學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)七年制2008級(jí)

自抗菌素問世以來,各種感染性疾病所造成的多種急重癥的治療已不再是難題,然而,抗生素的不合理使用所引起的細(xì)菌耐藥性問題日益突出。細(xì)菌對(duì)氨基糖苷類抗菌素的耐藥是由于細(xì)菌產(chǎn)生氨基糖苷類修飾酶(aminoglycoside modifying enzyme,AME)以及氨基糖苷類藥物的作用靶位16SrRNA的基因突變[1]。2006年初,美國(guó)學(xué)者 Robicsek等[2]發(fā)現(xiàn)了不僅對(duì)氨基糖苷類藥物有修飾作用,而且對(duì)喹諾酮類藥物也有修飾作用的新氨基糖苷類修飾酶aac(6′)-Ⅰb-Cr型。國(guó)內(nèi)雖有對(duì) AME基因的研究[3-4],但未見有關(guān)長(zhǎng)春地區(qū)的文獻(xiàn)報(bào)道。腸桿菌科細(xì)菌和某些非發(fā)酵革蘭陰性桿菌是造成醫(yī)院感染重要的致病菌[5-6],因此,為了解本地區(qū)革蘭陰性桿菌中AME基因存在狀況,本文作者對(duì)從臨床分離的69株革蘭陰性桿菌進(jìn)行了藥敏試驗(yàn),并檢測(cè)了6種 AME 基因,即aac(3)-Ⅰ、aac(3)-Ⅱ、aac(6′)-Ⅰ b、aac(6′)-Ⅱ、ant(3")-Ⅰ 和ant(2")-Ⅰ。

1 材料與方法

1.1 菌株和藥品 69株革蘭陰性桿菌來自長(zhǎng)春地區(qū)部分醫(yī)院檢驗(yàn)科,包括大腸埃希菌(Escherichia coli)31株,鮑曼不動(dòng)桿菌(Acinetobacter baumannii)15株,肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)11株,陰溝腸桿菌(Enterobacter cloacae)12株。上述菌株經(jīng)法國(guó)生物梅里埃公司VITEK-32全自動(dòng)微生物分析系統(tǒng)鑒定。阿米卡星由中國(guó)藥品生物制品檢定所提供,批號(hào):130335-200204。慶大霉素由北京鼎國(guó)昌盛生物技術(shù)有限公司提供,批號(hào):1B310330。

1.2 藥敏試驗(yàn) 采用瓊脂稀釋法測(cè)定69株革蘭陰性桿菌對(duì)阿米卡星和慶大霉素的敏感性,在藥物濃度超過16mg·L-1時(shí),細(xì)菌仍生長(zhǎng)判定為耐藥,介于2~8mg·L-1為中介,低于2mg·L-1為敏感。

1.3 細(xì)菌處理 取菌液1mL置于1.5mL離心管,10000r·min-1離心1min,棄上清加入100μL TE Buffer(1mol·L-1Tris-HCl pH 8.0,500mmol·L-1EDTA pH 8.0),加入等體積酚/氯仿/異戊醇(25∶24∶1),渦旋震蕩 30s,10000r·min-1離心5min,上清液即為基因檢測(cè)的模板,-20℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

1.4 AME基因的引物設(shè)計(jì)及檢測(cè) 根據(jù)GenBank發(fā)布的各型AME基因序列自行設(shè)計(jì)引物,6種靶基因引物序列和產(chǎn)物長(zhǎng)度見表1。聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴(kuò)增體系:P1、P2引物各1μL(0.4μmol·L-1),Premix Taq 13μL(Taq DNA poL 1.25U·25μL-1,dNTPs 0.4mmol·L-1,PCR buffer),ddH2O 9μL,模板1μL,反應(yīng)體系25μL。PCR產(chǎn)物長(zhǎng)度>500bp的PCR反應(yīng)條件:93℃ 初始變性2min;93℃ 變性1min,55℃退火1min,72℃延伸1min;35個(gè)循環(huán),72℃最后延伸5min。PCR產(chǎn)物長(zhǎng)度<500bp的PCR反應(yīng)條件:93℃初始變性5min;93℃變性30s,55℃退火30s,72℃延伸1min;35個(gè)循環(huán),72℃最后延伸5min。PCR產(chǎn)物經(jīng)2% 瓊脂糖凝膠電泳后,用凝膠成像儀觀察結(jié)果。

1.5 PCR產(chǎn)物測(cè)序 PCR產(chǎn)物送至北京六合華大基因科技股份有限公司測(cè)序,利用Chromas讀序軟件將測(cè)得序列與GenBank發(fā)布的序列進(jìn)行比對(duì)。

2 結(jié) 果

2.1 藥敏試驗(yàn)結(jié)果 69株革蘭陰性桿菌中有16株大腸埃希菌、1株肺炎克雷伯菌、3株陰溝腸桿菌和11株鮑曼不動(dòng)桿菌對(duì)阿米卡星呈現(xiàn)耐藥,即最低抑菌濃度超過16mg·L-1(表2)。慶大霉素的耐藥試驗(yàn)顯示:26株大腸埃希菌、11株肺炎克雷伯菌、8株陰溝腸桿菌和15株鮑曼不動(dòng)桿菌呈現(xiàn)耐藥(表3)。

2.2 AME基因檢測(cè)結(jié)果 在69株革蘭陰性桿菌中檢 出 aac(3)-Ⅰ、aac(3)-Ⅱ、aac(6′)-Ⅰb、ant(3")-Ⅰ和ant(2")-Ⅰ基因,其陽性株數(shù)分別為3(4.3%)、56(81.2%)、30(43.5%)、23(33.3%)和9(13.0%),而aac(6′)-Ⅱ基因?yàn)殛幮裕ū?)。經(jīng)分析發(fā)現(xiàn):1株鮑曼不動(dòng)桿菌同時(shí)攜帶4種AME基因,15株細(xì)菌(5株鮑曼不動(dòng)桿菌、3株陰溝腸桿菌、5株大腸埃希菌和2株肺炎克雷伯菌)同時(shí)攜帶3種基因,25株(5株鮑曼不動(dòng)桿菌、3株陰溝腸桿菌、11株大腸埃希菌和6株肺炎克雷伯菌)同時(shí)攜帶2種基因(表5)。22株細(xì)菌僅1種基因陽性,其余6株未檢出任何1種基因。5種AME基因的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳結(jié)果見圖1。

表3 革蘭陰性桿菌對(duì)慶大霉素的藥敏率Tab.3 The susceptibilities of gram-negative bacilli to gentamicin [n(η/%)]

2.3 AME基因序列分析 5種AME基因測(cè)序結(jié)果見圖2~6。測(cè)序結(jié)果與GenBank數(shù)據(jù)庫比對(duì),序列完全一致。

表4 AME基因檢測(cè)結(jié)果Tab.4 The detection results of AME gene [n(η/%)]

表5 AME基因組合形式Tab.5 The combination form of AME gene

3 討 論

氨基糖苷類抗生素(aminoglycosides)是由氨基糖與氨基環(huán)醇連接而成的氨基糖苷類抗生素,可來自鏈霉菌的鏈霉素和小單孢菌的慶大霉素等天然氨基糖苷類。氨基糖苷類抗生素通過與細(xì)菌核糖體30S亞基的16SrRNA的A位解碼區(qū)核苷酸形成氫鍵,干擾細(xì)菌蛋白質(zhì)的合成,從而發(fā)揮抗菌作用。

圖2 aac(3)-Ⅰ基因測(cè)序圖Fig.2 Sequencing diagram of aac(3)-Ⅰ gene

圖3 aac(3)-Ⅱ基因測(cè)序圖Fig.3 Sequencing diagram of aac(3)-Ⅱ gene

自1944年首次發(fā)現(xiàn)鏈霉素以來,因此類藥物抗菌譜廣、療效卓越,在醫(yī)學(xué)臨床和畜牧獸醫(yī)業(yè)得到廣泛應(yīng)用。但由于逐年泛用和過度使用,各種細(xì)菌對(duì)氨基糖苷類抗菌素耐藥問題也日益嚴(yán)重,細(xì)菌對(duì)該類抗生素耐藥可通過酶修飾、細(xì)胞膜滲透性改變、外排泵活性、phoP-phoQ系統(tǒng)和16SrRNA甲基化酶等機(jī)制[5-7]來實(shí)現(xiàn)。在所有機(jī)制中,質(zhì)?;蛉旧w介導(dǎo)的AME是最普遍的。AME由質(zhì)粒或染色體編碼,通常由可移動(dòng)DNA片段攜帶,質(zhì)粒的交換和轉(zhuǎn)座子作用均有利于耐藥基因滲入到敏感菌株[8]。這些修飾酶包括乙酰轉(zhuǎn)移酶(AAC)、磷酸轉(zhuǎn)移酶(APH)和核苷轉(zhuǎn)移酶(ANT)3類[9-11]。目前已發(fā)現(xiàn)的編碼AME的基因已有30余種,在革蘭陰性桿菌中常見的有10種,除本文作者檢測(cè)的6種外,還有aac(3)-Ⅲ、aac(3)-Ⅳ、aac(6′)-Ⅰ和aph(3′)-Ⅵ[12]。這些耐藥基因經(jīng)常借助可移動(dòng)性元件如質(zhì)粒、轉(zhuǎn)座子和整合子等在同種或不同種細(xì)菌間傳播[13-14]。

圖4 aac(6′)-Ⅰ b基因測(cè)序圖Fig.4 Sequencing diagram of aac(6′)-Ⅰ b gene

圖5 ant(3")-Ⅰ基因測(cè)序圖Fig.5 Sequencing diagram of ant(3")-Ⅰ gene

圖6 ant(2")-Ⅰ基因測(cè)序圖Fig.6 Sequencing diagram of ant(2")-Ⅰ gene

本研究分離的革蘭陰性桿菌對(duì)阿米卡星與慶大霉素的耐藥率分別為44.9%和87.0%,除肺炎克雷伯菌與陰溝桿菌對(duì)阿米卡星耐藥率稍低(9.1%、25.0%),余者對(duì)這2種抗生素的耐藥率均高于50%,說明革蘭陰性桿菌對(duì)氨基糖苷類抗生素耐藥率已經(jīng)很高。在69株細(xì)菌中有63株檢測(cè)出AME基因,占91.3%,說明革蘭陰性桿菌攜帶氨基糖苷類耐藥基因較為嚴(yán)重,與耐藥表型相符。本研究中AME基因陽性率較高并居前3位的分別為aac(3)-Ⅱ(81.2%)、aac(6′)-Ⅰ b(43.5%)和ant(3")-Ⅰ(33.3%);有41 株 (59.4%)的菌株攜帶2種及以上的修飾酶基因,多種耐藥基因的組合在細(xì)菌對(duì)氨基糖苷類抗生素耐藥機(jī)制中發(fā)揮了重要作用。攜帶2種及以上的修飾酶基因中也是aac(3)-Ⅱ比例最高,這種修飾酶基因的存在顯然與菌株對(duì)氨基糖苷類抗生素的高水平耐藥密切相關(guān)。9株敏感菌株中2株檢測(cè)出ant(2")-Ⅰ,1株檢測(cè)出aac(3)-Ⅱ,原因可能是與AME基因表達(dá)強(qiáng)弱或者無表達(dá)有關(guān),耐藥基因盒的表達(dá)不僅依賴于啟動(dòng)子的強(qiáng)弱,而且與啟動(dòng)子的距離遠(yuǎn)近有關(guān);上游基因表達(dá)強(qiáng),下游基因表達(dá)弱甚至可能不表達(dá)[15],有待進(jìn)一步研究。同時(shí),攜帶aac基因盒和碳青霉烯酶的整合子將會(huì)使細(xì)菌耐藥問題越來越嚴(yán)重[16-17],本研究中檢出率最高的是aac(3)-Ⅱ基因,值得高度關(guān)注??股胤河煤蜑E用是導(dǎo)致相關(guān)耐藥基因傳播的重要原因,因此臨床上要注意合理使用抗生素。

[1]糜祖煌,陸亞華 .氨基糖苷類修飾酶及其基因檢測(cè) [J].現(xiàn)代實(shí)用醫(yī)學(xué),2004,1(6):13-16.

[2]Robicsek A,Strahilevitz J,Jacobk GA,et al.Fluoroquinolone modifying enzyme:a new adaptation of a common aminoglycoside acetyltransferase [J].Nature Med,2006,12(1):83-88.

[3]糜祖煌,秦 玲.泛耐藥銅綠假單胞菌16SrRNA甲基化酶、氨基糖苷類修飾酶基因研究[J].中華醫(yī)院感染學(xué)雜志,2008,18(12):1656-1658.

[4]陳 杰,王衛(wèi)華,汪 麗,等﹒大腸埃希菌中同時(shí)發(fā)現(xiàn)攜帶aac(6′)-Ⅰb及aac(6′)-Ⅰb-Cr氨基糖苷類修飾酶基因[J].中華醫(yī)院感染學(xué)雜志,2011,21(6):1064-1067.

[5]呂增春,何連德,霍云燕.醫(yī)院外感染抗生素合理應(yīng)用臨床分析[J].藥物流行病學(xué)雜志,1997,6(2):91-93.

[6]李蓓涵,張學(xué)英,李菁華,等.長(zhǎng)春地區(qū)部分醫(yī)院革蘭陰性桿菌超廣譜β-內(nèi)酰胺酶的基因類型及分布 [J].吉林大學(xué)學(xué)報(bào):醫(yī)學(xué)版,2010,36(1):205-209.

[7]Islam S,Oh H,Jalal S,et al.Chromosomal mechanisms of aminoglycoside resistance in Pseudomonas aeruginosa isolates from cystic fibrosis patients[J].Clin Microbiol Infect,2009,15(1):60-66.

[8]Macfarlan E,Kwasnicka A,Hancock R. Role of Pseudomonas aeruginosa PhoP-PhoQ in resistance to antimicrobial cationic peptides and aminoglycosides [J].Microbiology,2000,146(10):2543-2554.

[9]Doi Y,Ghilardi AC,Adams J,et al.High prevalence of metallo-β-lactamase and 16SrRNA methylase coproduction among imipenem-resistant Pseudomonas aeruginosa isolates in Brazil[J].Antimicrob Agents Chemother,2007,51(9):3388-3390.

[10]Wachino J,Arakawa Y.Exogenously acquired 16SrRNA methyltransferases found in aminoglycoside-resistant pathogenic gram-negative bacteria:an update[J].Drug Resist Update,2012,15(3):133-148.

[11]Shaw KJ,Rather PN,Hare RS,et al.Molecular genetics of aminoglycoside resistance genes and familial relationship of the aminoglycoside modifying enzymes[J].Microbiol Rev,1993,57(1):138-163.

[12]Smith CA,Baker EN.Aminoglycoside antibiotic resistance by enzymatic deactivation[J].Curr Drug Targets-Infect Disord,2002,2(2):143-160.

[13]Yamane K,Wachino J,Doi Y,et al.Global spread of multiple aminoglycoside resistance genes [J].Emerg Infect Dis,2005,11(6):951-953.

[14]李智山,周樂翔,趙建忠.大腸埃希菌新的氨基糖苷類修飾酶基因研究[J].中華醫(yī)院感染學(xué)雜志,2007,17(8):914-916.

[15]黃支密,糜祖煌,秦 玲.20株陰溝腸桿菌耐藥性及氨基糖苷類修飾酶基因分析[J].中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志,2005,25(5):428-431.

[16]Park YJ. Aminoglycoside resistance in gram-negative bacilli[J].Korean J Clin Microbiol,2009,12(2):57-61.

[17]Poirel L,Le Thomas I,Naas T,et al.Biochemical sequence analyses of GES-1,a novel class A extended-spectrumβlactamase,and the class 1integron In52from Klebsiella pneumoniae[J].Antimicro Agents Chemother,2000,44(3):622-632.

[18]Strateva T,Yordanov D. Pseudomonas aeruginosa - a phenomenon of bacterial resistance [J].J Med Microbiol,2009,58(9):1133-1148.

[19]Ramirez MS,Tolmasky ME. Aminoglycoside modifying enzymes[J].Drug Resist,2010,13(3):151-171.

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