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高侵襲性膠質(zhì)瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)移相關(guān)miRNA的芯片分析

2012-12-03 08:09:10李少一高蕓劉宏宇王國棟李曉東馬維寧劉云會
關(guān)鍵詞:小室瓊脂亞群

李少一,高蕓,劉宏宇,王國棟,李曉東,馬維寧,劉云會

(中國醫(yī)科大學(xué)1.附屬盛京醫(yī)院神經(jīng)外科,沈陽110004;2.附屬第一醫(yī)院內(nèi)分泌研究所,沈陽110001)

膠質(zhì)瘤是人腦最常見的惡性腫瘤,約占40.49%,膠質(zhì)瘤的特點是侵襲性強(qiáng)且容易復(fù)發(fā)。微小RNA(microRNA或miRNA)是指長度約21~25 nt的某些特殊的小型非編碼RNA組成的家族,這些miRNA能夠識別特定的目標(biāo)mRNA,并在轉(zhuǎn)錄后水平通過促進(jìn)靶mRNA的降解和(或)抑制翻譯過程而發(fā)揮負(fù)調(diào)控基因表達(dá)的作用[1]。近年來,其研究已經(jīng)從基礎(chǔ)研究迅速上升到臨床研究,研究證實miRNA參與諸多基因激活和失活的調(diào)節(jié),逐漸成為腫瘤、心血管、免疫、炎癥等疾病發(fā)生發(fā)展過程中的重要分子標(biāo)志[2~4]。miRNA作為腫瘤標(biāo)志物,對預(yù)測人膠質(zhì)瘤的侵襲轉(zhuǎn)移和臨床預(yù)后的相關(guān)研究還需要深入解析。腫瘤侵襲和轉(zhuǎn)移是主動過程,該過程可以概括為3個步驟:(1)腫瘤細(xì)胞與細(xì)胞外基質(zhì)成分黏附;(2)腫瘤細(xì)胞釋放或誘導(dǎo)釋放蛋白水解酶,降解細(xì)胞外基質(zhì);(3)降解區(qū)域腫瘤細(xì)胞在趨化因子引導(dǎo)下遷移。腫瘤細(xì)胞必須啟動并成功地完成所有這些步驟才能進(jìn)入循環(huán)系統(tǒng)和淋巴系統(tǒng),形成遠(yuǎn)隔轉(zhuǎn)移[5,6]。為了深入研究侵襲轉(zhuǎn)移步驟的機(jī)制,研究者建立了一些體外侵襲模型用于評估不同腫瘤細(xì)胞的侵襲活性[7,8]。為了深入了解轉(zhuǎn)移相關(guān)性miRNA表達(dá)的改變對人膠質(zhì)瘤淋巴轉(zhuǎn)移的影響,我們從人類膠質(zhì)瘤細(xì)胞系T98G中用Transwell侵襲小室技術(shù)通過體外篩選,建立了高侵襲性的膠質(zhì)瘤細(xì)胞亞群(命名為T98G-4M-1、T98G-4M-2和T98G-4M-3)。通過分析其在軟瓊脂中集落形成情況,比較幾種細(xì)胞亞群的體外集落形成能力,并采用miRNA芯片技術(shù)分析膠質(zhì)瘤中與轉(zhuǎn)移密切相關(guān)的miRNA表達(dá)譜,旨在篩選與膠質(zhì)瘤侵襲轉(zhuǎn)移密切相關(guān)的miRNA。

1 材料與方法

1.1 細(xì)胞培養(yǎng)

人膠質(zhì)瘤細(xì)胞系T98G購自ATCC,細(xì)胞培養(yǎng)在含10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)液中,放置37℃、5%CO2的細(xì)胞培養(yǎng)箱中。

1.2 Transwell體外侵襲實驗篩選高侵襲性的細(xì)胞亞群

用Transwell侵襲小室根據(jù)T98G細(xì)胞的侵襲性差異把他們分成不同細(xì)胞亞群。即用一種重新溶解配成原來濃度的基膜凝膠涂鋪Transwell有小插孔的聚碳酸酯膜(含8 μm孔)。將T98G細(xì)胞(5×104/孔)接種于Transwell小室上室,高侵襲性細(xì)胞消化基質(zhì)膠后穿過Transwell小室聚碳酸酯膜上8 μm小孔進(jìn)入小室下室,于37°C放置48 h后,收集高侵襲性細(xì)胞群。分別選出3個細(xì)胞亞群T98G-4M-1、T98G-4M-2和T98G-4M-3。那些沒有移行至Transwell小室下室,停留在上室的細(xì)胞群,作為對照細(xì)胞命名為T98G-4C-1、T98G-4C-2和T98G-4C-3。

1.3 軟瓊脂集落形成實驗

1×103個對數(shù)生長期T98G細(xì)胞懸浮于含0.3%軟瓊脂的完全培養(yǎng)液中,播種于1%底層軟瓊脂上(100 mm組織培養(yǎng)皿),放置37℃、5%CO2的細(xì)胞培養(yǎng)箱中2周后,計數(shù)可見集落。

1.4 miRNA芯片分析

用Trizol(Invitrogen公司)提取RNA,委托博奧生物公司進(jìn)行miRNA芯片分析。采用LuxScan10K激光共聚焦掃描儀掃描雜交芯片,并用LuxScan3.0軟件分析表達(dá)譜。采用Partek Genomics Suite分析表達(dá)譜結(jié)果,P<0.05、Fold Change>2為差異表達(dá)miRNA。

2 結(jié)果

2.1 T98G細(xì)胞亞群的成瘤性比較

利用Transwell小室,根據(jù)其侵襲性的差異,將人類的膠質(zhì)瘤細(xì)胞株T98G分為2個不同的細(xì)胞亞群。穿過基質(zhì)膜的細(xì)胞作為高侵襲性的細(xì)胞亞群(T98G-4M-1、T98G-4M-2和T98G-4M-3)。而那些留在小室上室的細(xì)胞亞群作為對照組(T98G-4C-1、T98G-4C-2和T98G-4C-3)。用體外集落形成實驗來檢測選定的細(xì)胞亞群的成瘤性。如圖1所示,在軟瓊脂上的T98G-4M-1、T98G-4M-2和T98G-4M-3細(xì)胞亞群,形成的集落數(shù)量分別是對照組的2.7、3.4和3.2倍。

2.2 與人膠質(zhì)瘤T98G細(xì)胞侵襲轉(zhuǎn)移密切相關(guān)的miRNA表達(dá)譜

為了解析參與調(diào)控膠質(zhì)瘤侵襲轉(zhuǎn)移的miRNA,我們分析了高侵襲性細(xì)胞亞群與對照組的表達(dá)有差異的miRNA。如表1顯示,高侵襲性細(xì)胞亞群與對照細(xì)胞亞群比較,采用Partek Genomics Suite分析表達(dá)譜結(jié)果,有11個miRNA的表達(dá)有顯著差異(P<0.05,F(xiàn)old Change>2),其中5個miRNA的表達(dá)上調(diào)(let-7b、miR-200A、miR-222、miR-106 和 miR-193)和6個miRNA的表達(dá)下調(diào)(mir-199B、mir-26A、mir-34、miR-29、mir-15A 和 mir-16)。

3 討論

至今我們對腫瘤惡性轉(zhuǎn)化及侵襲轉(zhuǎn)移演變過程的了解還很有限,本研究采用Transwell侵襲小室,從人膠質(zhì)瘤細(xì)胞株T98G中篩選出高侵襲及轉(zhuǎn)移潛能的細(xì)胞亞群。結(jié)果顯示,Transwell侵襲小室的體外篩選是一個可行的方法,能夠分離不同惡性程度的細(xì)胞亞群,這些細(xì)胞亞群可用于進(jìn)一步評估膠質(zhì)瘤侵襲和轉(zhuǎn)移相關(guān)性的研究。為了鑒別miRNA表達(dá)譜有顯著差異,我們通過微點陣分析3個不同的高侵襲性亞群和對照亞群,并獲得了與轉(zhuǎn)移相關(guān)的miRNA差異表達(dá)圖譜。本研究所用的所有細(xì)胞系均來自同一母細(xì)胞系,因此他們有相同的遺傳背景,但有不同轉(zhuǎn)移潛能。當(dāng)我們比較侵襲性亞群和對照亞群時,我們鑒別出11個差異性調(diào)節(jié)miRNA。在高轉(zhuǎn)移的細(xì)胞亞群與對照組間,已確定存在差異表達(dá)的11個 miRNA 中,有 9個 miRNA(let-7b、mir-222、mir-106、mir-193、mir-34、mir-29、mir-26a、mir-15a 和mir-200)在腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)移的進(jìn)展中及間質(zhì)上皮的轉(zhuǎn)變發(fā)揮了重要作用[9~12];而mir-199B和mir-16分別涉及腫瘤干細(xì)胞的分化及凋亡[13,14]。

miRNA在不同組織、不同發(fā)育階段中的表達(dá)水平有顯著差異,miRNA表達(dá)模式具有分化的位相性和時序性,而且miRNA作為一種廣泛存在的對基因表達(dá)進(jìn)行微調(diào)的分子,通過網(wǎng)絡(luò)式調(diào)控方式,可以從整體上調(diào)控有機(jī)體的生命活動。在本研究中我們獲得了關(guān)于轉(zhuǎn)移相關(guān)的miRNA差異表達(dá)的相關(guān)信息,提示這些miRNA可能顯著影響腫瘤轉(zhuǎn)移及惡性轉(zhuǎn)化。因此需要進(jìn)一步研究以確定miRNA差異表達(dá)的分子機(jī)制,并探究這些miRNA如何促進(jìn)腫瘤轉(zhuǎn)移。

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