燕瑋,胡文旭,楊威
(中國醫(yī)科大學附屬盛京醫(yī)院血液病治療中心,沈陽 1 1 0 0 0 4)
Expression and Methylation Study ofPRDX2Gene in Acute Myeloid Leukemia
抑癌基因的失活機制有突變、缺失及表觀遺傳[1]。一些抑癌基因突變、缺失發(fā)生率低,而基因啟動子區(qū)胞嘧啶-磷酸 -鳥苷(c y t o s i n e p h o s p h a t e g u a n o s i n e,C p G)島中的甲基化修飾引起人們極大的興趣。越來越多的證據(jù)顯示D N A甲基化是一個早期的分子事件,有可能加速腫瘤的發(fā)展[2]。
過氧化氧化還原蛋白2(p e r o x i r e d o x i n 2,P R D X 2)作為一種抗氧化蛋白,通過清除活性氧(r e a c t i v e o x y g e ns p e c i e s,R O S)保護D N A、脂質(zhì)、蛋白免受氧化應激損傷,調(diào)節(jié)信號傳導通路,預防、抑制腫瘤發(fā)生。但有關該基因在急性髓細胞白血病(a c u t e m y e l o g e n o u s l e u k e m i a,A M L)患者中的表達情況國內(nèi)報道尚少。本研究采用實時熒光定量P C R(r e a l-t i m e P C R)及甲基化特異性聚合酶鏈反應(M S P方法),探討P R D X 2基因表達及P R D X 2基因啟動子區(qū)甲基化狀態(tài)與基因表達缺失之間的關系,為A M L的早期診斷、預后評估及治療開辟新的道路。
收集2 0 1 0年6月至2 0 1 1年6月中國醫(yī)科大學附屬盛京醫(yī)院血液科住院患者9 5例,分為A M L組和對照組。A M L組5 5例,男3 1例,女2 4例,中位年齡3 2(1 7~7 8)歲,白血病的診斷均經(jīng)臨床、血常規(guī)檢查、骨髓象及組織化學染色、免疫分型、染色體檢查確診,符合白血病形態(tài)學、免疫學、細胞遺傳學(M I C)分型。其中M 1 4例,M 2 1 4例,M 3 2 1例,M 4 1 0例,M 5 6例。對照組4 0例,為同期就診非白血病(過敏性紫癜、巨幼細胞貧血)患者,男1 6例,女2 4例,中位年齡3 6(1 9~6 2)歲。
2×T a q聚合酶鏈反應(P C R)M a s t e r M i x(上海T i a n g e n公司)、S Y B RG r e e n實時定量試劑盒(美國A B I公司)、D N A甲基化試劑盒E ZD N AM e t h y l a t i o n-G o l d K i tTM(美國Z y m o R e s e a r c h公司)、A B I P R I S M7 0 0 0 H T熒光定量P C R儀(美國A B I公司);紫外分光光度儀(日本島津U V-1 6 0 1)。
1.3 骨髓單個核細胞(m o n o n u c l e a r c e l l,M N C)分離 A M L組與對照組均取肝素抗凝新鮮骨髓5 m L,經(jīng)等量P B S稀釋混勻后,緩慢加入5 m L淋巴細胞分離液中,置于自動平衡離心機中,以3 0 0 0 r/m i n離心2 0 m i n,吸取界面層M N C,P B S洗滌2次,所得M N C用于提取總R N A和總蛋白。
按照反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明將已提取的R N A反轉(zhuǎn)錄成互補D N A(c D N A)。進行熒光定量P C R擴增,引物序列見表1。總反應體系為 2 0 μ L:c D N A模板 1 μ L,上下游引物各 0.5 μ L,S Y B RG R E E NM a s t e r-m i x 1 0 μ L,用 d d H2O補至 2 0 μ L。反應條件為:9 5℃預變性1 0 m i n后,9 5℃變性1 0 s,6 0℃退火2 0 s,7 2℃延伸3 0 s,共4 0個循環(huán),最后7 2℃再延伸5 m i n。由P C R曲線得到到達閾值時的循環(huán)數(shù)(c y c l e t h r e s h o l d,C t)值,以G A P D H為內(nèi)參,采用2-△△Ct方法進行相對定量分析。
應用M e t h P r i m e r軟件設計引物,見表2。D N A甲基化修飾參考文獻[3],對修飾后的樣本進行P C R擴增。P C R反應體系為 2 0 μ L,修飾后的 D N A模板 1 μ L,上下游引物各 1 μ L,2×T a q P C RM a s t e r-m i x 1 0 μ L,用 d d H2O補至 2 0 μ L。反應條件為:9 5℃預變性1 0 m i n后,9 5℃變性1 0 s,6 0℃退火2 0 s,7 2℃延伸3 0 s,共3 0個循環(huán),最后7 2℃再延伸1 0 m i n。擴增后產(chǎn)物經(jīng)含有溴化乙錠1.5%瓊脂糖凝膠電泳,電泳結(jié)果經(jīng)凝膠成像分析儀進行分析。
計量資料用x±s表示,應用S P S S 1 7.0軟件分析,各組間P R D X 2m R N A表達結(jié)果采用單因素方差分析,率的比較采用χ2檢驗(F i s h e r精確概率法)。P<0.0 5認為差異有統(tǒng)計學意義。
表1 R e a l-t i me P C R引物序列
表2 MS P引物序列
對照組患者均無P R D X 2基因甲基化,A M L組患者1 7例(3 1.0%)骨髓細胞中出現(xiàn)P R D X 2基因表達甲基化,2組甲基化表達率差異有統(tǒng)計學意義(χ2=1 5.0 6,P<0.0 5),見圖1。P R D X 2基因甲基化與患者年齡、性別、分型等臨床特征無關,與診斷分期有關(P<0.0 5,表 3)。
運用2-△△Ct法計算得出A M L組P R D X 2m R N A表達量明顯下降,為 3.5 6±1.5 7,與對照組(5.9 9±1.6 9)比較,差異有統(tǒng)計學意義(t=-7.2 2,P<0.0 5)。同時,A M L甲基化患者骨髓中P R D X 2m R N A表達量為2.2 0±1.1 8,非甲基化患者骨髓中P R D X 2m R N A表達量為4.1 7±1.3 2,2者差異有統(tǒng)計學意義(t=-5.2 5,P<0.0 5)。
P R D X 2作為一種抗氧化蛋白,最早是作為一種能增強自然殺傷細胞活性的因子而被發(fā)現(xiàn)的[4]。近年來研究證實P R D X 2可參與調(diào)節(jié)信號傳導通路等過程,預防、抑制腫瘤發(fā)生。H o l e等[5]證實這種新的抑癌基因在黑色素瘤、膀胱癌等多種腫瘤中表達缺失,其表達缺失與啟動子甲基化有關。P R D X 2表達缺失后加重氧化應激的產(chǎn)生,升高細胞內(nèi)p H,破壞細胞染色質(zhì),導致腫瘤發(fā)生。同時還導致調(diào)節(jié)蛋白激酶的活性下降,將無法有效阻斷促腫瘤因子介導的多條細胞信號傳導通路,如P D G F途徑、M A P K/J N K途徑等,從而失去抑制細胞生長、轉(zhuǎn)化、遷移,促進細胞凋亡的負調(diào)控作用,最終導致與腫瘤發(fā)生、發(fā)展相關的一系列生物學行為改變[6~9]。
表3P R D X 2基因甲基化與A ML患者臨床特征的關系
D N A甲基化能引起染色質(zhì)結(jié)構、D N A構象、D N A穩(wěn)定性及D N A與蛋白質(zhì)相互作用方式的改變,從而調(diào)控基因的表達,是表觀遺傳學重要的修飾方式[10]。F u r u t a等[11]最近研究表明在黑色素瘤細胞中P R D X 2表達下降,并與其啟動子區(qū)甲基化關系密切。A g r a w a l-S i n g h等[12]實驗結(jié)果中1 8%的A M L患者表達P R D X 2啟動子區(qū)甲基化,并證明其與P R D X 2基因表達的缺失有明顯關系。本實驗發(fā)現(xiàn)5 5例A M L患者中1 7例(3 1%)骨髓細胞存在甲基化,同時也都存在P R D X 2m R N A表達下調(diào),在不同分期患者中甲基化的發(fā)生率有著明顯差異,完全緩解期的患者要明顯低于初診及難治復發(fā)的患者,與國外研究結(jié)果相符[12],因此我們推測P R D X 2基因甲基化模式的改變在A M L的發(fā)生及發(fā)展中可能起著非常重要的作用。本研究在對照組患者中未發(fā)現(xiàn)P R D X 2基因啟動子區(qū)甲基化,但P R D X 2m R N A表達水平仍下降,表明P R D X 2基因啟動子甲基化并不是使基因表達改變的唯一原因,同時還可能存在基因突變、雜合性缺失等機制引起該基因表達下調(diào)或缺失,還有可能是由于在本實驗檢測的啟動子區(qū)域以外的其他C p G島也存在甲基化現(xiàn)象,同樣引起該基因表達下調(diào)或缺失。
綜上所述,本研究結(jié)果初步證實P R D X 2作為一種新興的抑癌基因在A M L的發(fā)生、發(fā)展過程中起著重要作用,而且其啟動子的甲基化在A M L中廣泛存在。而P R D X 2啟動子的甲基化后是否再次表達,以及與患者的預后關系如何仍需進一步研究。
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