王曉天,宋永勝,崔軍
(中國醫(yī)科大學(xué)附屬盛京醫(yī)院第二泌尿外科,沈陽 1 1 0 0 0 4)
近年來對于膀胱癌的病因和發(fā)病機制進行了多項研究,遺傳學(xué)和表觀遺傳學(xué)的改變被認(rèn)為是主要的分子機制,其中表觀遺傳學(xué)的改變尤其是DNA甲基化近來研究的熱點。相關(guān)研究表明[1],膀胱尿路上皮細(xì)胞癌組織中有多種相關(guān)基因的啟動子區(qū)存在高甲基化改變,其中某些抑癌基因啟動子區(qū)甲基化對膀胱癌發(fā)生發(fā)展起重要作用,而基因啟動子區(qū)胞嘧啶-磷酸-鳥苷(cytosine phosphate guanosine,CpG)島甲基化是抑癌基因失活的重要機制。
包含氧化還原酶的WW結(jié)構(gòu)域(WW domain containing oxidoreductase,WWOX)是一個新的抑癌基因,其表達缺失與多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)[2]。目前國內(nèi)外關(guān)于膀胱癌組織中WWOX基因啟動子區(qū)的甲基化檢測還少見報道。本研究采用MSP檢測了膀胱癌組織中WWOX基因啟動子區(qū)的甲基化狀態(tài),并檢測WWOXmRNA的表達情況,了解WWOX基因啟動子區(qū)甲基化狀態(tài)與基因表達缺失之間的關(guān)系,探討WWOX基因啟動子區(qū)甲基化在膀胱癌發(fā)生發(fā)展過程中的作用,為確定膀胱癌的發(fā)病機制和早期生物學(xué)診斷指標(biāo)提供理論依據(jù),為基因治療尋找新的靶點奠定理論基礎(chǔ)。
1.1.1 標(biāo)本收集:收集2009年1月至2011年1月本院泌尿外科手術(shù)切除的54例膀胱癌患者的癌組織(病理證實均為膀胱移行細(xì)胞癌)及相應(yīng)的癌旁正常組織(距腫瘤切緣≥5 cm)。其中男38例,女16例;年齡 37~76歲,平均年齡(58.75±10.12)歲。膀胱癌組織標(biāo)本按WHO 2004年病理分級標(biāo)準(zhǔn):低度惡性傾向尿路上皮乳頭狀瘤18例,尿路上皮癌低級別25例,尿路上皮癌高級別11例;按UICC-TNM臨床分期標(biāo)準(zhǔn):非浸潤性膀胱癌(Ta~T1)36例,浸潤性膀胱癌(T2~T3)18例。組織標(biāo)本切除后立即于液氮中速凍,2 h后轉(zhuǎn)置于-80℃冰箱中保存。所有膀胱癌患者均為初發(fā),術(shù)前均未行放療、化療及免疫治療。所有組織標(biāo)本均經(jīng)我院病理科有經(jīng)驗的病理醫(yī)師證實并有完整的臨床資料,所有研究對象均簽署知情同意書。
1.1.2 主要試劑與儀器:DNA提取試劑盒(Gentra公司,美國),RNA提取試劑盒及Trizol(Sigma公司,美國),TIANScript RT Kit反轉(zhuǎn)錄試劑盒(TIANGEN公司,北京),Real Master Mix(TIANGEN公司,北京),EZ DNA甲基化試劑盒(ZYMO RESEARCH公司,北京),Taq PCR Master Mix(TIANGEN 公司,北京)。NANO 2000紫外分光光度計(Thermo公司,美國),Exicycler 96熒光定量PCR儀(BIONEER公司,韓國),Life Express PCR儀(BIOER公司,杭州),DYY-7C電泳儀(六一公司,北京),WD-9413B凝膠成像分析儀(六一公司,北京)。MSP引物及realtime RT-PCR引物均由生工生物工程(上海)有限公司鑒定合成。
1.2.1 DNA和RNA提取按提取試劑盒操作說明書進行,分別對膀胱癌組織和癌旁正常組織提取總DNA和RNA,提取核酸用紫外分光光度計檢測純度,符合純度要求的核酸立即進行試驗或置于-20℃保存待用。
1.2.2 MSP檢測膀胱癌組織及癌旁正常組織WWOX基因啟動子區(qū)DNA甲基化情況按照EZ DNA甲基化試劑盒說明書處理已提取的DNA樣品,對轉(zhuǎn)化后的樣本進行PCR擴增,引物序列見表1。PCR反應(yīng)體系為20 μL:修飾后的DNA模板1 μL,上下游引物各 1 μL,2×Taq PCR Master-mix 10 μL,用ddH2O補至20 μL。反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性10 min后,95℃變性 1 min,58℃退火 60 s,72℃延伸60 s,共35個循環(huán),最后72℃再延伸10 min。擴增后產(chǎn)物經(jīng)含有溴化乙啶1.5%瓊脂糖凝膠電泳,電泳結(jié)果經(jīng)凝膠成像分析儀進行分析。DNA甲基化狀況的判斷:根據(jù)瓊脂糖凝膠電泳分為(1)甲基化陽性:只要是甲基化特異性引物擴增為陽性的即為甲基化陽性;(2)非甲基化陽性:非甲基化特異性引物擴增陽性的即為非甲基化陽性。
1.2.3 實時熒光定量RT-PCR檢測WWOX基因在膀胱癌組織及癌旁正常組織mRNA的表達:按照反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明將已提取的RNA反轉(zhuǎn)錄成互補DNA(cDNA)。進行熒光定量PCR擴增,引物序列見表 1。總反應(yīng)體系為 20 μL:cDNA 模板 1 μL,上下游引物各 0.5 μL,SYBR GREEN Master-mix 10 μL,用ddH2O補至20 μL。反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性10 min后,95℃變性 10 s,60℃退火 20 s,72℃延伸 30 s,共40個循環(huán),最后4℃再延伸5 min。由PCR曲線得到到達閾值時的循環(huán)數(shù)(cycle threshold,Ct)值,以 β-肌動蛋白(β-actin)為內(nèi)參,采用 2-△△Ct方法進行相對定量分析。
表1 引物序列及產(chǎn)物片段長度T a b.1 MS Pa n d r e a l-t i me P C Rp r i me r s f o r WWO X
采用SPSS 17.0統(tǒng)計軟件分析。計量資料以x±s表示,比較采用t檢驗;組間計數(shù)資料率的比較采用χ2檢驗或Fisher精確概率法;相關(guān)關(guān)系分析采用Spearman相關(guān)分析。P<0.05認(rèn)為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
經(jīng)MSP法對WWOX基因啟動子區(qū)CpG島甲基化進行檢測,電泳結(jié)果見圖1。結(jié)果顯示54例膀胱癌組織中19例存在WWOX基因啟動子區(qū)甲基化(35.2%),54例癌旁正常組織中僅發(fā)現(xiàn)4例存在WWOX基因啟動子區(qū)異常甲基化(7.4%),二者差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=12.43,P<0.05)。部分電泳結(jié)果見圖1。1號及2號標(biāo)本:癌組織(1C、2C)甲基化特異性引物擴增為陽性,對應(yīng)的癌旁正常組織(1N、2N)非甲基化特異性引物擴增為陽性;3號標(biāo)本:癌組織(3C)甲基化特異性引物擴增及非甲基化特異性引物擴增均為陽性,對應(yīng)的癌旁正常組織(3N)非甲基化特異性引標(biāo)增為陽性;4號標(biāo)本:癌組織(4C)非甲基化特異性引物擴增為陽性,對應(yīng)的癌旁正常組織(4N)非甲基化特異性引物擴增為陽性。
54例膀胱癌組織中WWOX基因啟動子區(qū)甲基化狀態(tài)根據(jù)臨床病例特征分組,發(fā)現(xiàn)基因WWOX隨著癌組織分級的增加,啟動子區(qū)甲基化陽性率逐漸升高(5.6%、36.0%、81.8%),組間比較差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P均<0.05);而與臨床分期、性別、年齡、腫瘤直徑等臨床特征均無明顯相關(guān)性(P均>0.05)。統(tǒng)計結(jié)果見表2。
表2 膀胱癌WWO X基因啟動子區(qū)甲基化與臨床特征的關(guān)系T a b.2 T h e r e l a t i o n b e t w e e nWWO Xme t h y l a t i o n a n d c l i n i c a l c h a r a c t e r i s t i c s
Real-time RT-PCR擴增曲線及溶解曲線見圖2,圖 3。運用 2-△△Ct法計算,WWOXmRNA 在膀胱癌組織中的平均表達量為(0.93±0.09),明顯低于對應(yīng)的癌旁正常組織中的平均表達量(1.10±0.08),二者差異有統(tǒng)計學(xué)意義(t=9.73,P<0.05)。同時,啟動子區(qū)甲基化的膀胱癌組織的WWOXmRNA表達量為(0.83±0.75),啟動子區(qū)非甲基化的膀胱癌組織的WWOXmRNA 表達量為(0.99±0.47),啟動子區(qū)甲基化組對WWOXmRNA的表達下調(diào)的影響要高于啟動子區(qū)非甲基化組(t=9.46,P<0.05)。
膀胱癌組織中WWOXmRNA表達量與對應(yīng)的癌旁正常組織中表達量的比值小于0.5則定義為癌組織中WWOXmRNA低表達。統(tǒng)計結(jié)果顯示,在WWOXmRNA低表達的26例膀胱癌組織中,有53.8%(14/26)伴隨啟動子區(qū)甲基化,28例WWOX mRNA非低表達的膀胱癌組織中5例發(fā)生啟動子區(qū)甲基化,說明WWOXmRNA表達水平與WWOX基因啟動子區(qū)甲基化狀態(tài)密切相關(guān)(r=0.377,P<0.05)。統(tǒng)計結(jié)果見表3。
WWOX基因是2000年由Bednarek等[3]應(yīng)用鳥槍基因測序技術(shù)結(jié)合對感興趣區(qū)域?qū)?yīng)的轉(zhuǎn)錄子行分離并分析的方法鑒定出的一個新基因,位于常染色體16q23.3-q24.1區(qū)域,由9個外顯子和8個內(nèi)含子組成,編碼一個長為414個氨基酸、相對分子質(zhì)量46 000 Da的單鏈蛋白。Yang等[4]研究發(fā)現(xiàn),WWOX蛋白主要位于線粒體,在凋亡應(yīng)激因素的作用下,WWOX蛋白合成增加,第一個WW結(jié)構(gòu)域中的Try33發(fā)生磷酸化,線粒體通透性改變,進而WWOX蛋白從線粒體轉(zhuǎn)位至細(xì)胞核,上調(diào)促凋亡因子P53,下調(diào)抗凋亡因子Bcl-2及Bcl-X1,從而增強TNF介導(dǎo)的細(xì)胞毒性;同時增強TRADD介導(dǎo)的細(xì)胞死亡。WWOX蛋白與P53同為促凋亡蛋白,在介導(dǎo)凋亡中發(fā)揮協(xié)同作用,且WWOX基因是P53介導(dǎo)凋亡必不可少的配偶體[5]。因此認(rèn)為WWOX是一個新的抑癌基因,在多種腫瘤中的啟動和進展階段起重要作用。
細(xì)胞癌基因的激活和抑癌基因的失活是近年來腫瘤研究中的熱點,其中抑癌基因的失活被認(rèn)為是重要的致癌因素。膀胱癌的發(fā)生發(fā)展是一個多階段、多因素參與的一個復(fù)雜過程,其中涉及到許多癌基因及抑癌基因的變化,但具體調(diào)控機制尚不完全清楚。研究表明[6],DNA甲基化能引起染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、DNA構(gòu)象、DNA穩(wěn)定性及DNA與蛋白質(zhì)相互作用方式的改變,從而調(diào)控基因的表達,是表觀遺傳學(xué)重要的修飾方式,而甲基化主要發(fā)生在基因啟動子區(qū)域的 CpG 島。最新多項研究指出[7,8],WWOX 基因的啟動子區(qū)甲基化與某些腫瘤的臨床分期和病理類型相關(guān),成為腫瘤分子診斷和預(yù)后評估的生物標(biāo)志物。
表3WWO X基因啟動子區(qū)甲基化與WWO XmR N A表達的相關(guān)性T a b.3 T h e r e l e v a n c e b e t w e e nWWO Xme t h y l a t i o n a n d t h e mR N Ae x p r e s s i o n
本研究采用MSP和real-time RT-PCR方法檢測了54例膀胱癌組織和對應(yīng)的癌旁正常組織中WWOX啟動子區(qū)甲基化狀態(tài)和mRNA的表達情況。結(jié)果顯示膀胱癌組織中啟動子區(qū)甲基化率顯著高于對應(yīng)的癌旁組織,說明WWOX基因啟動子區(qū)的甲基化可能參與了膀胱癌的發(fā)生、發(fā)展。進一步研究發(fā)現(xiàn),WWOXmRNA在膀胱癌組織中的平均表達量明顯低于對應(yīng)的癌旁正常組織,而且在54例膀胱癌組織中,發(fā)生啟動子區(qū)甲基化的19例癌組織WWOXmRNA表達量低于啟動子區(qū)未發(fā)生甲基化的35例膀胱癌組織,差異有統(tǒng)計學(xué)意義,提示W(wǎng)WOX基因的表達缺失與膀胱癌的發(fā)生有密切的關(guān)聯(lián),WWOX啟動子區(qū)的異常甲基化是導(dǎo)致膀胱癌組織WWOXmRNA轉(zhuǎn)錄受阻的原因之一。在分析WWOX基因啟動子區(qū)甲基化與WWOXmRNA表達的關(guān)系時,發(fā)現(xiàn)其中73.7%(14/19)的基因啟動子區(qū)發(fā)生甲基化的膀胱癌組織中,同時也存在WWOX mRNA表達下調(diào);而在26例WWOXmRNA表達下調(diào)的癌組織中,有12例未發(fā)現(xiàn)WWOX基因啟動子區(qū)甲基化,表明膀胱癌組織中WWOX基因啟動子區(qū)甲基化并不是使基因表達改變的唯一原因,同時還可能存在WWOX基因突變、雜合性缺失等機制引起該基因表達下調(diào)或缺失,還有可能是由于在本實驗檢測的啟動子區(qū)域以外的其他CpG島也存在甲基化現(xiàn)象,同樣引起該基因表達下調(diào)或缺失。本研究中WWOX基因啟動子區(qū)甲基化與患者性別、年齡、腫瘤直徑、臨床分期等無明顯相關(guān)性(P>0.05),而與膀胱腫瘤的病理學(xué)分級有明顯關(guān)聯(lián)(P<0.05)。高級別尿路上皮癌組織中基因啟動子區(qū)甲基化發(fā)生率(81.8%)高于低級別尿路上皮癌組織(36.0%),后者又高于低度惡性傾向尿路上皮乳頭狀瘤組織(5.6%),結(jié)果提示:WWOX基因啟動子區(qū)的甲基化改變可以提示膀胱腫瘤細(xì)胞的潛在侵襲性,在膀胱移行細(xì)胞癌的早期發(fā)生及發(fā)展中有重要作用,并且可能成為診斷膀胱移行細(xì)胞癌的早期診斷指標(biāo)。
Chung等[9]研究表明,膀胱癌患者血液、尿液中的基因甲基化水平和其對應(yīng)的膀胱癌組織中的基因甲基化水平具有很好的相關(guān)性,另外,膀胱癌的發(fā)病是一個多基因決定的綜合事件。因此,可以將WWOX與其他多種在膀胱癌中高頻甲基化的基因組合為膀胱癌的DNA甲基化譜,進行血液、尿液樣本的DNA甲基化譜檢測,將為膀胱癌的早期診斷及預(yù)后判斷提供一種新的、無創(chuàng)性的手段[10]。
DNA甲基化是一種可逆性變化,因此逆轉(zhuǎn)抑癌基因的甲基化狀態(tài),恢復(fù)其正常表達及功能可能成為膀胱癌基因治療的新方法。目前已有研究[11]采用甲基化抑制劑5-氮雜-2’-脫氧胞苷或其衍生物體外處理抑癌基因甲基化而失活的腫瘤細(xì)胞,可以使啟動子區(qū)DNA去甲基化,恢復(fù)腫瘤細(xì)胞抑癌基因的表達。因此,更深入地研究腫瘤表觀遺傳學(xué)有望在基因表達調(diào)控和膀胱癌發(fā)生發(fā)展上獲得新的突破,并可能提出新的治療靶點。
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