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檢測動物產(chǎn)品中水貂阿留申病毒和犬細(xì)小病毒復(fù)合PCR方法的建立和應(yīng)用

2012-05-18 08:42杜雄偉胡傳偉
中國動物檢疫 2012年8期
關(guān)鍵詞:水貂條帶特異性

杜雄偉,李 葉,胡傳偉

(1.大連民族學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院,大連 16600;2.遼寧出入境檢驗檢疫局,大連 116001)

近幾年隨著國內(nèi)外市場對裘皮需求的增長以及國外相關(guān)行業(yè)向國內(nèi)的轉(zhuǎn)移,國內(nèi)水貂、狐貍、狍子等毛皮動物的養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展極為迅速,據(jù)報道,目前我國水貂的飼養(yǎng)量達(dá)到800萬頭,從國外引進(jìn)水貂良種的貿(mào)易也越來越頻繁。由于經(jīng)濟(jì)動物養(yǎng)殖的高度集約化、規(guī)?;c小規(guī)模散養(yǎng)以及作伴侶動物并存特點。水貂阿留申?。ˋD)和犬細(xì)小病毒?。–P)是危害皮毛經(jīng)濟(jì)動物的兩種重要疫病。傳染性疾病的暴發(fā)流行,造成很大的經(jīng)濟(jì)損失;同時這幾種經(jīng)濟(jì)動物傳染病也是犬、貓和水貂、狐貍、狍子等多種經(jīng)濟(jì)動物進(jìn)出境時的主要檢疫對象,開展這些傳染病病原的快速診斷方法的研究,對經(jīng)濟(jì)動物疫情的快速診斷與控制、加強(qiáng)經(jīng)濟(jì)動物及其產(chǎn)品進(jìn)出境的檢驗檢疫工作,御疫情于國門之外有重要的意義[1-2]。

1 材料和方法

1.1 材料

1.1.1 毒株 水貂阿留申病毒(ADV)、犬細(xì)小病毒(CPV)本實驗室自行保存。

1.2 方法

1.2.1 引物的設(shè)計

通過DNAStar5.0軟件對基因庫中ADV、CPV的保守區(qū)域序列進(jìn)行分析,應(yīng)用Primer premier5.0軟件設(shè)計特異性引物,均由寶生物(大連)有限公司合成,序列如下:

ADV s 5' AAGCCATTACTGGAGGTGGTGAT 3';ADV x 5' CATGCCGAGGTCTCTTGTGC 3' 預(yù)計擴(kuò)增產(chǎn)物536 bp。

CPVs: 5' ATTGGGCTTACCGCCATTTC 3’;CPVx: 5' TATCTTCCCGTATCTTGATGTGCT 3’預(yù)計擴(kuò)增產(chǎn)物375 bp。

1.2.2 病毒RNA/DNA的提取

照寶生物MiniBEST Viral RNA/DNA Extraction Kit Ver.2.0試劑盒說明書進(jìn)行。

1.2.3 復(fù)合PCR檢測方法的擴(kuò)增

取上述抽提病毒DNA液10 μL加入10×PCRbuffer 2.5 μL,各對引物分別0.5 μL,DNA Taq酶0.5 μL,dNTP(2.5mm)1.0 μL,水9 μL。94 ℃ 3 min,一個循環(huán);94 ℃ 30 s,58 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,30個循環(huán);12 ℃保存。

由于駕駛艙發(fā)生破孔瞬間,從孔口流出的氣體速度非??欤^程進(jìn)行的時間很短,可以將氣流從孔口流出視為一維等熵流動,其伯努利方程為:

1.2.4 PCR反應(yīng)條件的優(yōu)化

1.2.4.1 MgC12濃度的調(diào)整 采用5個濃度梯度對MgC12濃度進(jìn)行調(diào)整,即1 μmol/L、2 μmol/L、3 μmol/L、4 μmol/L、5 μmol/L。

1.2.4.2 退火溫度的調(diào)整 根據(jù)設(shè)計的引物,運用公式T一2(A4-T)4-4(G4-C)計算退火溫度 ,再按照實際情況,確定PCR反應(yīng)中的限溫度為58 ℃,然后進(jìn)行一個梯度PCR反應(yīng)(梯度為55 ℃、56 ℃、57 ℃、58 ℃、59 ℃、60 ℃、61 ℃、62 ℃、63 ℃、64 ℃、65 ℃)。

1.2.4.3 Taq酶、循環(huán)次數(shù)、變性溫度、變性時間、延伸溫度、延伸時間等諸項進(jìn)行調(diào)整。

1.2.5 擴(kuò)增的特異性試驗

分別用上述引物對對水貂阿留申病毒、犬細(xì)小病毒、犬肝炎病毒、犬冠狀病毒分離株做PCR進(jìn)行特異性試驗。

1.2.6 PCR擴(kuò)增的敏感性試驗

以10倍系列稀釋法對CDV、CPV、ADV提取的RNA/DNA液進(jìn)行稀釋,分別作為PCR模板,用上述試驗確定的最佳PCR反應(yīng)條件進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增,取5 μL PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳,檢測該方法的敏感性。

2 結(jié)果

2.1 復(fù)合PCR檢測方法的建立

復(fù)合PCR擴(kuò)增(圖1)結(jié)果,有明顯目的條帶的出現(xiàn),即ADV為536 bp,CPV為375 bp。后經(jīng)測序證實該序列為目的序列,表明該方法可同時區(qū)分這兩種病毒。

2.2 反應(yīng)條件的優(yōu)化

MgC12在3 μmol/L或4 μmol/L時有特異性條帶產(chǎn)生。當(dāng)退火溫度低于56 ℃時,有非特異性條帶產(chǎn)生,當(dāng)高于65 ℃時無條帶產(chǎn)生,在55 ℃時條帶最亮。只要遵循PCR反應(yīng)基本條件,其他因素對PCR反應(yīng)的敏感性和特異性影響不大。

2.3 特異性和敏感性

各對引物均能擴(kuò)增出對應(yīng)目的條帶,沒有產(chǎn)生雜帶,表明該引物比較特異。用紫外分光光度計測得提取的CPV和ADV的DNA的濃度為86 ng/μL和95 ng/μL。將模板DNA作10倍系列稀釋,取不同稀釋度的模板DNA各5 μL分別進(jìn)行PCR擴(kuò)增,結(jié)果105稀釋的模板仍能擴(kuò)增出目的條帶,106稀釋的模板僅能擴(kuò)增出375 bp的單帶,不能擴(kuò)增出536 bp條帶,表明復(fù)合PCR擴(kuò)增檢測到4.3 Pg的ADV模板DNA及0.475 Pg的CPV模板DNA。

3 討論

水貂阿留申病(Aleutian disease of mink,AD)是由水貂阿留申病毒(ADV)感染水貂引起的以終生毒血癥、全身淋巴細(xì)胞增殖、血清γ-球蛋白增多、腎小球腎炎、動脈血管炎和肝炎為特征的一種慢性病毒病。本病在世界各養(yǎng)貂國家均有發(fā)生,所有品系的水貂均能感染,具有阿留申基因型的水貂死亡率可達(dá)30%。本病還能使母貂空懷率和仔貂死亡率顯著升高,公貂的交配能力下降,還能影響發(fā)育而使毛皮品質(zhì)低下,造成經(jīng)濟(jì)損失,是世界上公認(rèn)的養(yǎng)貂的重大疫病之一[3-7]。犬細(xì)小病毒感染是1978年由美國首先發(fā)現(xiàn),我國也有發(fā)生。本病只見于犬科動物,幼犬特別易感,引起腸炎和心肌炎,發(fā)病率20%~100%,致死率10%~50%,4 周齡以內(nèi)死亡率最高[9-14]。

在建立復(fù)合PCR的檢測方法時,引物設(shè)計至關(guān)重要,引物長度、G+C含量、Tm值應(yīng)盡量一致,且各擴(kuò)增片段大小要適宜,既要避免電泳不能分辨,又不能相差過大。本研究設(shè)計的3對引物GC含量相近,Tm值相近,這就保證了在相同的退火溫度下,CDV、CPV和ADV都能得到很好擴(kuò)增。其擴(kuò)增片段分別為375 bp、536 bp,這使得在檢測時能在同一個電泳膠上進(jìn)行鑒定,為復(fù)合PCR方法的成功建立奠定了基礎(chǔ)[15-17]。

CPV傳統(tǒng)上主要依靠病毒的分離鑒定,而ADV主要通過免疫電泳進(jìn)行鑒定,這些方法費時費力。而PCR技術(shù)具有簡便、快速、靈敏度高等優(yōu)點。本研究建立的PCR方法顯示,無論是單一PCR還是多重PCR,均能擴(kuò)增出CPV和 ADV特異性條帶,其最小檢測濃度為0.5 ng,且對犬肝炎病毒、犬冠狀病毒分離株均不起反應(yīng),表明建立的方法具有很強(qiáng)的特異性和高度的敏感性。我們用建立的方法對CPV和ADV的混合樣品進(jìn)行檢測,結(jié)果與預(yù)期相符,能夠特異性的檢測到這2種病毒,表明建立的方法可以用于CPV和 ADV的診斷和流行病學(xué)調(diào)查。

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