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豬場蚊子中乙型腦炎病毒的RT-PCR檢測

2012-04-29 23:47:52魏燕鳴
湖北農(nóng)業(yè)科學 2012年14期
關鍵詞:蚊子豬場

魏燕鳴

摘要:收集湖北省與安徽省部分豬場的蚊子樣本,用RT-PCR檢測蚊子樣本是否攜帶有乙型腦炎病毒,并對豬群乙型腦炎病毒抗體進行了檢測。結果表明,53份蚊子樣品中乙型腦炎病毒陽性樣品為44份,表明這些豬場的蚊子廣泛攜帶有乙型腦炎病毒。從陽性PCR產(chǎn)物中隨機選出8個,并將其克隆到pEASY-T1載體中,得到5個陽性重組質粒,進行序列測定和進化樹分析,結果表明陽性蚊子樣本攜帶的都是基因Ⅲ型乙型腦炎病毒。豬場的1 401份血清樣品的乙型腦炎病毒抗體陽性率為57.7%,說明這些豬場豬群的乙型腦炎病毒感染率較高。

關鍵詞:豬場;蚊子;乙型腦炎病毒;RT-PCR

中圖分類號:S852.65+9.6文獻標識碼:A文章編號:0439-8114(2012)14-3104-03

Detection of Encephalitis Virus in Mosquitoes from Pig Farms by RT-PCR

WEI Yan-ming

(College of Veterinary Medicine, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China)

Abstract: Mosquito samples were collected from pig farms in Hubei and Anhui province to test the existence of Japanese encephalitis virus(JEV) by RT-PCR. The results showed that 44 out of 53 samples were positive, illustrating that JEV was widely carried by mosquitoes in these pig farms. 8 of the 44 positive PCR products were randomly selected and cloned into pEASY-T1 vector for sequencing and phylogenetic tree analysis; the results revealed that these samples were all genotype Ⅲ JEV. The positive rate of JEV in 1 401 serum samples in the pig farms was 57.7%, indicating a high infection rate of JEV in these farms.

Key words: pig farms; mosquito; Japanese encephalitis virus; RT-PCR

乙型腦炎病毒(Encephalitis virus,EV)屬于黃病毒科黃病毒屬,是一種危害嚴重的人獸共患蟲媒性傳染病病原。該病毒具有很強的神經(jīng)毒力,感染人后可以引起乙型腦炎。據(jù)估計,乙型腦炎全球每年平均發(fā)?。等f例,死亡1.5萬人,57%~68%的治愈者留有神經(jīng)學后遺癥[1],其中嚴重者占18%,約50%病人有記憶缺損,3/4病人有運動失調(diào)和智力機能受損[2,3]。近年來,隨著人類活動及全球氣候的變化,乙型腦炎的流行在世界范圍內(nèi)呈上升趨勢。同時,乙型腦炎也是危害中國養(yǎng)豬業(yè)的重大疫病之一。

豬是乙型腦炎病毒的重要儲存宿主和擴增宿主,也是乙型腦炎的主要傳染源[4]。一般情況下乙型腦炎病毒的感染呈豬—蚊—人鏈狀[5]。因此,通過監(jiān)測湖北省與安徽省部分豬場蚊子中乙型腦炎病毒的流行與分布情況,為豬場乙型腦炎臨床防控提供參考。

1材料與方法

1.1材料

1.1.1蚊子樣品蚊子樣品于2009年6月至8月采自湖北省和安徽省部分豬場。

1.1.2菌種與試劑菌株E. coli DH5α、pEASY-T1載體購自北京全式金生物技術有限公司、所用限制性內(nèi)切酶、Taq DNA聚合酶、dNTPs、相應的緩沖液、DNA分子質量標準DL 5 000購自寶生物工程(大連)有限公司;DNA純化回收試劑盒Cycle-Pure Kit、質粒小提試劑盒Plasmid Mini KitⅠ購自美國Omega生物技術公司,反轉錄試劑盒ReverTra Ace α TM購自東洋紡(上海)生物科技有限公司,乙型腦炎乳膠凝集抗體檢測試劑盒購自武漢科前動物生物制品有限責任公司。

1.1.3引物根據(jù)乙型腦炎病毒E蛋白基因序列設計并合成RT-PCR所用的引物:P1:5′-GCT CTG AAA GGC ACA ACC-3′;P2;5′-CTG AAG GCA TCA CCA AAC-3′。擴增的靶序列為467 bp。

1.2方法

1.2.1樣品總RNA的提取將采集的豬場蚊蟲樣本用勻漿器研磨,制成懸液,反復凍融3次,以

3 000 r/min離心15 min,取200 μL上清勻漿液,加入800 μL的Trizol細胞裂解液,振搖混勻,于室溫放置10 min;加入200 μL氯仿,混合均勻,于室溫放置10 min后,以12 000 r/min離心15 min;將上層溶液轉入新的離心管中,加入等體積的異丙醇,于室溫放置10 min,以12 000 r/min離心10 min;棄去上清液,加入1 mL體積分數(shù)為75%的乙醇,洗滌沉淀,以8 000 r/min離心5 min;棄去上清,于室溫干燥5~10 min;加入20~30 μL DEPC水,溶解RNA,直接用于反轉錄或保存于-80 ℃冰箱備用。

1.2.2E蛋白基因的RT-PCR擴增20.0 μL的反轉錄反應體系如下:總RNA模板10.0 μL,5×RT Buffer 4.0 μL,10 mmol/L dNTPs 2.0 μL,Random Primer 0.5μL,ACE-α 0.5 μL,Inhibitor 0.5 μL,滅菌水2.5 μL。反應條件:30 ℃反應10 min,42 ℃反應30 min,99 ℃反應5 min。所得的cDNA保存于-80 ℃冰箱備用。

25.0 μL的PCR擴增體系如下:cDNA 3.0 μL,Taq DNA聚合酶 0.5 μL,10×PCR Buffer 2.5 μL,上游引物0.5 μL,下游引物0.5 μL,10 mmol/L dNTPs 0.5 μL,ddH2O 17.5 μL。將上述反應體系混勻后進行PCR擴增,反應條件:95 ℃預變性5 min;95 ℃變性45 s,55 ℃退火45 s,72 ℃延伸1 min,35個循環(huán);72 ℃延伸10 min。反應結束后,?。场?μL PCR產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳檢測。

1.2.3重組質粒的構建PCR產(chǎn)物經(jīng)0.8%瓊脂糖凝膠電泳分離后,用DNA片段膠回收試劑盒回收。回收的PCR產(chǎn)物連接到pEASY-T1載體中,轉化,然后篩選陽性克隆,提取重組質粒進行雙酶切鑒定。

1.2.4重組質粒插入片段的序列分析將篩選出的陽性重組質粒送生工生物工程(上海)有限公司測序,測序結果用DNAStar軟件分析,并與GenBank中登錄的其他乙型腦炎病毒的E蛋白基因的核苷酸序列及推導的氨基酸序列進行同源性比較和分析。

1.2.5豬群乙型腦炎病毒抗體的檢測從采集上述蚊子樣品的豬場中隨機采集豬血清1 401份,然后利用乙型腦炎乳膠凝集抗體檢測試劑盒對被檢血清進行乙型腦炎病毒抗體的檢測。

2結果與分析

2.1蚊子樣品的RT-PCR檢測結果

提取樣品的總RNA后進行RT-PCR反應,檢測結果如圖1。結果表明,從樣品中擴增出了與預期片段大小相符的特異性片段,長度為467 bp。53份樣品中陽性樣品有44份,陽性率達83%,表明豬場蚊子攜帶乙型腦炎病毒的比例很高,豬感染乙型腦炎病毒的風險也很高。

2.2重組質粒的雙酶切鑒定

純化回收隨機選取的8個陽性樣本的PCR產(chǎn)物,連接到pEASY-T1載體上,轉化后篩選獲得陽性重組質粒,用Hin dIII和Eco RⅤ雙酶切鑒定,分別得到了與預期目標大小相符的2個片段,結果表明,目的片段連接、轉化正確。其中2個陽性樣本的雙酶切結果見圖2。

2.3E蛋白基因片段的序列分析

將上述8個陽性重組質粒測序后,利用DNAstar軟件對序列進行分析。結果表明,從命名為HB3C、HB22B、HB33A、HB41B、HB48B的陽性重組質粒擴增得到的5個插入序列的大小均為467 bp。同時,從網(wǎng)上下載了11株乙型腦炎病毒的E蛋白基因序列。用DNAstar生物學分析軟件對這16個乙型腦炎病毒E蛋白基因序列進行同源性比較,繪制遺傳進化樹(圖3)。結果表明,16個乙型腦炎病毒E蛋白基因序列分別存在于兩個分支上,其中HB22B與HB48B的來源一致,與AY376461的遺傳距離較近。而樣本HB3C與HB33A的來源一致,HB41B與網(wǎng)上選取的11株乙型腦炎病毒的遺傳距離較近。進一步分析發(fā)現(xiàn),5個陽性蚊子樣本攜帶的均為基因Ⅲ型乙型腦炎病毒。

2.4乙型腦炎病毒抗體檢測結果

乳膠凝集試驗檢測結果顯示,在1 401份臨床血清樣品中,乙型腦炎抗體陽性樣品為808份,陽性率為57.7%。

3小結與討論

通過RT-PCR檢測方法檢測了2009年在湖北省與安徽省兩省部分豬場采集的蚊蟲樣本中的乙型腦炎病毒E蛋白基因片段,陽性檢出率達到了83%。結果顯示,所選豬場蚊子普遍攜帶乙型腦炎病毒,鑒于蚊子在乙型腦炎病毒傳播中的中間宿主作用,所選豬場的豬群感染乙型腦炎病毒的風險較大。同時,為了進一步查明這些豬場豬群的乙型腦炎病毒血清流行病學情況,還利用乳膠凝集試驗對這些豬場的1 401份血清樣品進行了檢測,結果表明乙型腦炎病毒抗體陽性率為57.7%,說明這些豬場豬群的乙型腦炎病毒感染率較高。

有資料報道,乙型腦炎病毒分為4型,來自于泰國北部及柬埔寨地區(qū)的毒株屬于基因Ⅰ型;來自于泰國南部、馬來西亞、印度尼西亞的毒株屬于基因Ⅱ型;來自于日本、中國等地區(qū)的毒株屬于基因Ⅲ型;部分來自印度尼西亞的JKT6468毒株獨自形成了基因Ⅳ型[6]。但是近十多年來,乙型腦炎病毒基因型的地域有了新的變化。如韓國和日本已經(jīng)報道發(fā)現(xiàn)基因Ⅰ型乙型腦炎病毒[7]。研究在進行乙型腦炎病毒檢測的同時,隨機選取了8個陽性樣本,通過RT-PCR擴增出了乙型腦炎病毒E蛋白基因片段,并將E蛋白基因片段連接到pEASY-T1載體上,對得到的陽性重組質粒進行測序,最后得到5個正確質粒。用生物學分析軟件DNAstar對從GenBank上下載的11株其他乙型腦炎病毒的E蛋白基因序列以及5個正確的陽性重組質粒測序結果進行了同源性比較和分析,并繪制了遺傳進化樹。結果表明,檢測的蚊子攜帶的乙型腦炎病毒均屬于基因Ⅲ型,說明在中國湖北、安徽兩省的基因Ⅲ型乙型腦炎病毒可能屬于主要基因型。

綜上所述,利用RT-PCR方法對湖北、安徽兩省部分豬場蚊子攜帶乙型腦炎病毒的情況進行了檢測,并利用乳膠凝集試驗對這些地區(qū)豬群乙型腦炎病毒抗體進行了評價,初步證實了湖北、安徽兩省豬場蚊子乙型腦炎病毒的攜帶率較高,豬群乙型腦炎病毒感染率也較高,從而為更深入闡明華中地區(qū)豬群乙型腦炎病毒的分子流行學與血清流行學規(guī)律打下了基礎。

參考文獻:

[1] KAUR R,RAUTHAN M,VRATI S. Immunogenicity in mice of a cationic microparticle-adsorbed plasmid DNA encoding Japanese encephalitis virus envelope protein[J]. Vaccine,2004, 22(21-22):2776-2782.

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[3] 馬士恒,陳宇萍,王占國. 乙型腦炎研究進展[J]. 中國人獸共患病雜志,2001,17(1):95-97.

[4] 殷震,劉景華. 動物病毒學[M]. 第二版.北京:科學出版社,1997. 631-640.

[5] 張中,楊厚安,段小衛(wèi),等. 流行性乙型腦炎的防控[J]. 畜牧與飼料科學,2010,31(11-12):151-152.

[6] SOLOMON T,NI H,BEASLEY D W,et al. Origin and evolution of Japanese encephalitis virus in Southeast Asia[J]. J Virol,2003,77(5):3091-3098.

[7] NGA P T,PARQUET M D,CUONG V D,et al. Shift in Japanese encephalitis virus(JEV) genotype circulating in Northern Vietnam:implications for frequent introductions of JEV from Southeast Asia to East Asia[J]. J Gen Virol,2004,85(6):1625-1631.

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