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高效木質(zhì)素降解菌的復(fù)合誘變選育

2012-04-29 21:49:24嚴(yán)平李江
湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2012年14期

嚴(yán)平 李江

摘要:從實(shí)驗(yàn)室保存的9株白腐真菌中篩選出1株降解玉米秸稈木質(zhì)素性能優(yōu)良的菌株YJ-9-1,在第14天時(shí),其木質(zhì)素降解率為41.74%。經(jīng)ITS-5.8S rDNA序列同源性及系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析,初步鑒定該菌為變色栓菌(Trametes versicolor)。對(duì)YJ-9-1進(jìn)行紫外微波復(fù)合誘變,獲得1株高效木質(zhì)素降解菌株3-8,并利用其對(duì)玉米秸稈中的木質(zhì)素進(jìn)行降解。結(jié)果表明,在第14天時(shí),菌株3-8對(duì)玉米秸稈木質(zhì)素的降解率為48.43%,比出發(fā)菌株提高了16.03%。

關(guān)鍵詞:白腐真菌;木質(zhì)素降解;復(fù)合誘變

中圖分類號(hào):Q933文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A文章編號(hào):0439-8114(2012)14-2983-05

Screening of High Efficient Lignin-Degrading Strains by Complex Mutagenesis

YAN Ping1,LI Jiang2

(1. College of Chemistry and Environmental Protection Engineering, Southwest University for Nationalities, Chengdu 610041, China;

2. Chengdu Institute of Biology, Chinese Academy of Sciences, Chengdu 610041, China)

Abstract: One white-rot fungus YJ-9-1 with strong ability of degrading ligin was obtained from 9 strains through solid state fermentation (SSF). After 14 days of SSF, the degrading rate of this strain on lignin was 41.74%. Based on its sequence alignment and phylogenetic analysis, YJ-9-1 was identified as a strain of Trametes versicolor. Using YJ-9-1 as starting strain, a strain 3-8 with high efficient lignin degrading ability was obtained through UV and microwave mutagenesis. Then strain 3-8 was used to degrade lignin in corn straw through SSF. The results showed that its degrading rate on lignin reached 48.43% on the 14th day, higher than 16.03% of YJ-9-1.

Key words: white-rot fungus; lignin-degrading; complex mutagenesis

生物質(zhì)是一種可再生并能轉(zhuǎn)化為乙醇、生物柴油等燃料的能源物質(zhì),其中木質(zhì)纖維素作為全球儲(chǔ)存量最大的生物質(zhì),是最具前景的能源物質(zhì)之一[1]。秸稈作為一種農(nóng)業(yè)廢棄物,是木質(zhì)纖維素的重要來(lái)源,在世界各地都有著豐富的儲(chǔ)量,僅在中國(guó)每年就有大約2億t的秸稈產(chǎn)出,但大部分都被直接焚燒或者丟棄,這不僅浪費(fèi)資源而且造成環(huán)境污染[2]。

木質(zhì)纖維素主要組分包括纖維素(30%~50%),半纖維素(15%~35%)和木質(zhì)素(10%~30%)[3]。由于這些大分子物質(zhì)的相互纏繞,木質(zhì)纖維素在自然條件下很難被降解,將它轉(zhuǎn)化為生物質(zhì)能源則需要經(jīng)過(guò)多步的處理。首先是前處理,主要去除木質(zhì)素和半纖維素,目前的處理方法有物理、化學(xué)、生物以及綜合處理法,其中,生物法由于環(huán)境友好、反應(yīng)溫和、成本低廉等優(yōu)點(diǎn)而備受關(guān)注。

生物法中白腐真菌是目前已知的降解木質(zhì)素性能最好的微生物[4]。國(guó)內(nèi)外學(xué)者已在這方面進(jìn)行了大量的研究,但篩選出的菌株普遍存在木質(zhì)素降解率低、降解周期長(zhǎng)等問(wèn)題。如張杰等[5]篩選出1株秸稈降解白腐真菌P5,15 d后木質(zhì)素降解率為11.47%;Zhang等[6]篩選出1株竹基質(zhì)選擇性降解菌Perenniporia sp.,木質(zhì)素降解率只有8.66%,而且發(fā)酵時(shí)間為4周;杜海萍[7]分離出1株糙皮側(cè)耳菌,木質(zhì)素降解率僅有16.41%。從實(shí)驗(yàn)室已有的木質(zhì)素降解菌出發(fā),通過(guò)紫外微波復(fù)合誘變篩選得到1株木質(zhì)素降解率較高的白腐真菌“3-8”,在發(fā)酵14 d時(shí)木質(zhì)素降解率提高到48.43%,該研究可為生物制漿和飼料等行業(yè)提供參考。

1材料與方法

1.1材料

1.1.1菌種來(lái)源實(shí)驗(yàn)室保存的9株白腐真菌。

1.1.2玉米秸稈取自成都市雙流縣,經(jīng)粉碎過(guò)40目篩,備用。

1.1.3培養(yǎng)基PDA固體培養(yǎng)基:去皮土豆200.0 g,葡萄糖20.0 g,KH2PO4 3.0 g,MgSO4·7H2O 1.5 g,去離子水1 000 mL,瓊脂18.0 g。初篩培養(yǎng)基:PDA固體培養(yǎng)基+0.01%愈創(chuàng)木酚、PDA固體培養(yǎng)基+0.01%苯胺藍(lán)、氯化錳篩選平板(MnCl2·4H2O 0.115 g, 瓊脂18.0 g, 去離子水1 000 mL)。復(fù)篩培養(yǎng)基:準(zhǔn)確稱取玉米秸稈粉5.0 g,裝入250 mL的三角瓶,再加入9 mL去離子水。

1.2研究方法

1.2.1實(shí)驗(yàn)室木質(zhì)素降解菌的篩選不同菌株經(jīng)PDA固體培養(yǎng)基活化后,用無(wú)菌打孔器制成直徑為1 cm菌塊,接入固態(tài)發(fā)酵培養(yǎng)基,每瓶接入兩個(gè)菌塊,30 ℃恒溫培養(yǎng)14 d后,剝?nèi)セ|(zhì)上菌皮,抽濾烘干后測(cè)定失重率和木質(zhì)素含量,計(jì)算不同菌株對(duì)玉米秸稈木質(zhì)素的降解率。

1.2.2紫外微波復(fù)合誘變

1)誘變程序。出發(fā)菌株→單孢子懸浮液的制備→紫外誘變→初篩→微波誘變→初篩→復(fù)篩→穩(wěn)定性檢驗(yàn)。

2)誘變。單孢子懸浮液的制備:用無(wú)菌水洗下斜面培養(yǎng)的孢子于三角瓶中,用玻璃珠充分振蕩至孢子均勻分散,制成1×106個(gè)/mL的單孢子懸浮液。紫外誘變致死率曲線的制作:?。保?mL濃度為1×106個(gè)/mL的單孢子懸浮液于直徑為 9 cm的平皿內(nèi),置于紫外燈下(30 W,距離30 cm)分別照射2、4、6、8 min。照射結(jié)束后,取不同照射時(shí)間處理的菌液各0.1 mL, 適當(dāng)稀釋后分別涂布于初篩培養(yǎng)基上,30 ℃培養(yǎng)7 d,計(jì)數(shù)活菌,然后以照射時(shí)間為橫坐標(biāo), 致死率為縱坐標(biāo)繪制致死率曲線。微波誘變致死率曲線的制作:取經(jīng)紫外誘變篩選出的正突變菌株重新培養(yǎng)長(zhǎng)出的孢子,制成1×106個(gè)/mL單孢子懸浮液,置于20 mL厭氧管中,每管5 mL,用600 W微波輻射1、2、3 min。輻射結(jié)束后,取不同輻射時(shí)間處理的菌液各0.1 mL,適當(dāng)稀釋后分別涂布于初篩培養(yǎng)基上,30 ℃培養(yǎng)7 d,計(jì)數(shù)活菌,然后以輻射時(shí)間為橫坐標(biāo),致死率為縱坐標(biāo)繪制致死率曲線。

1.2.3誘變菌株篩選經(jīng)過(guò)誘變后,從初篩培養(yǎng)基上挑取變色圈直徑與菌落直徑的比值大及顯色圈色澤深的菌落,然后于復(fù)篩培養(yǎng)基中進(jìn)行固態(tài)發(fā)酵,測(cè)定木質(zhì)素降解率。

1.3測(cè)定方法

1.3.1DNA提取及測(cè)序DNA提取方法參考《分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)指南》[8]。DNA提取成功后,以ITS-1(5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3′)和ITS-4(5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′)為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增(反應(yīng)條件:預(yù)變性94 ℃、5.0 min;變性94 ℃、1.0 min,復(fù)性55 ℃、1.0 min,延伸72 ℃、1.5 min,35個(gè)循環(huán);最終72 ℃延伸10.0 min),回收純化后的PCR產(chǎn)物并連接到PMD19-T載體上,然后轉(zhuǎn)化入大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞內(nèi)培養(yǎng),經(jīng)細(xì)胞裂解確定目標(biāo)片段已連接在載體上后,交由華大基因研究中心進(jìn)行測(cè)序。

1.3.2系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建將測(cè)序結(jié)果提交到美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心(NCBI)GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行Nucleotide blast比對(duì),選取同源性較高的14株菌株ITS-5.8S rDNA序列用Bioedit軟件進(jìn)行Clustalw比對(duì),用MEGA軟件采取鄰位相鄰法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。

1.3.3秸稈失重率、木質(zhì)素降解率的計(jì)算及木質(zhì)素含量的測(cè)定

木質(zhì)素降解率=

失重率=

木質(zhì)素含量的測(cè)定參考文獻(xiàn)[9]采用Van Soest方法測(cè)定。

2結(jié)果與分析

2.1菌種篩選結(jié)果

經(jīng)過(guò)14 d的固態(tài)發(fā)酵,各菌株對(duì)玉米秸稈木質(zhì)素的降解情況見(jiàn)表1。其中YJ-9-1和YJ-68B-1的木質(zhì)素降解率超過(guò)40.00%,分別為41.74%和40.33%,YJ-9-1最高,且其于秸稈上生長(zhǎng)時(shí),長(zhǎng)勢(shì)較好。因此,綜合來(lái)看,YJ-9-1是9株菌株中降解木質(zhì)素性能最優(yōu)良的菌株,故選取其為目標(biāo)菌株進(jìn)行下一步的誘變選育。

2.2YJ-9-1菌株的ITS-5.8S rDNA序列分析

經(jīng)測(cè)序,YJ-9-1的ITS-5.8S rDNA序列片段長(zhǎng)度為652 bp,序列提交GenBank進(jìn)行核酸序列Blast比對(duì)。選取14株同源性較高的菌株進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建,結(jié)果如圖1所示。由圖1可知,YJ-9-1與Trametes versicolor T3遺傳距離最近,由此初步判定YJ-9-1為變色栓菌(Trametes versicolor)。

2.3紫外誘變時(shí)間的確定結(jié)果

按照試驗(yàn)方法建立的紫外誘變致死率曲線如圖2所示。一般誘變時(shí)間長(zhǎng)正突變率較高,同時(shí)負(fù)突變率也較高。因此,選擇存活率為20%左右的時(shí)間即8 min作為后續(xù)紫外誘變時(shí)間。將8 min誘變處理的菌液涂布于含愈創(chuàng)木酚的初篩培養(yǎng)基上,表現(xiàn)好的菌株接入含苯胺藍(lán)的初篩培養(yǎng)基以及氯化錳篩選平板中再篩選,于3種初篩平板中都表現(xiàn)好的菌株,最終進(jìn)入下一步的微波誘變。初篩培養(yǎng)基中愈創(chuàng)木酚的變色(變紅棕色)與漆酶的產(chǎn)生有關(guān),漆酶產(chǎn)生越多顏色越深。苯胺藍(lán)的脫色與木質(zhì)素過(guò)氧化物酶及錳過(guò)氧化物酶的產(chǎn)生有關(guān),木質(zhì)素過(guò)氧化物酶和錳過(guò)氧化物酶越多脫色越快,脫色圈也就越大。氯化錳的變色(變紅棕色)與錳過(guò)氧化物酶的產(chǎn)生有關(guān),錳過(guò)氧化物酶產(chǎn)生越多顏色越深。漆酶、木質(zhì)素過(guò)氧化物酶及錳過(guò)氧化物酶被公認(rèn)為是木質(zhì)素降解的關(guān)鍵酶,白腐真菌就是靠分泌這些酶來(lái)降解木質(zhì)纖維素從而獲得生存所需的碳源和能源[10]。

誘變菌在初篩培養(yǎng)基上的表現(xiàn)好壞是通過(guò)測(cè)定變色圈直徑與菌落直徑的比值大小及觀察變色圈的深淺來(lái)判定的。2批紫外誘變后,在初篩菌株中發(fā)現(xiàn)3株菌株的變色圈直徑與菌落直徑的比值和變色圈色澤均優(yōu)于出發(fā)菌株。因此,這3株菌進(jìn)入接下來(lái)的微波誘變。

2.4微波誘變時(shí)間的確定結(jié)果

按照試驗(yàn)方法建立的微波誘變致死率曲線見(jiàn)圖2。選擇致死率為80%左右的時(shí)間即1 min作為后續(xù)微波誘變時(shí)間。紫外誘變選出的3株菌株經(jīng)過(guò)3批微波誘變后初篩,發(fā)現(xiàn)其中6株菌株的變色圈直徑與菌落直徑的比值和變色圈色澤均優(yōu)于出發(fā)菌株(表2);并且,變色圈初篩結(jié)果還表明,該6株菌株的變色圈直徑/菌落直徑的比值明顯大于經(jīng)單一誘變的菌株,且變色圈顏色也比其他突變株更深,因此選擇它們進(jìn)入固態(tài)發(fā)酵的復(fù)篩試驗(yàn)。復(fù)合誘變常常具有明顯的協(xié)同誘變效果,雖然伴隨著致死率的增加(與單一誘變相比),但從中獲得某一方面遺傳特性大幅度提高的誘變菌株的可能性也大大增加。從表2中還可看出,3種初篩培養(yǎng)基中幾乎所有菌株在氯化錳篩選平板上的生長(zhǎng)狀況都很差,菌株不僅長(zhǎng)得慢,而且產(chǎn)生的變色圈也很小,但是,不同的菌株在氯化錳篩選平板上的表現(xiàn)還是有較為明顯的不同,如菌株3-1可以長(zhǎng)滿整個(gè)氯化錳篩選平板,而其他菌株的菌絲圈直徑大多不超過(guò)5.0 cm。但是菌株3-1在氯化錳篩選平板上的變色圈卻小于菌株3-8。同類研究中,一般較少使用氯化錳篩選平板,但從此次的試驗(yàn)結(jié)果可看出氯化錳篩選平板可以作為木質(zhì)素降解菌誘變的初篩培養(yǎng)基。

2.5玉米秸稈固態(tài)發(fā)酵進(jìn)行復(fù)篩的結(jié)果

將分離出的6株白腐真菌菌株以玉米秸稈為基質(zhì)進(jìn)行復(fù)篩。在30 ℃下培養(yǎng)14 d,復(fù)篩結(jié)果見(jiàn)表3。由表3可知,6株菌株中,菌株3-8的木質(zhì)素降解率最高,14 d達(dá)到48.43%,比出發(fā)菌株提高了16.03%。并且在接下來(lái)的穩(wěn)定性試驗(yàn)中(3次重復(fù)的固態(tài)發(fā)酵),其木質(zhì)素降解率都保持在48.00%左右。固態(tài)發(fā)酵全過(guò)程中,菌株3-8的菌絲生長(zhǎng)均較出發(fā)菌株快,這為其高的木質(zhì)素降解率提供了前提條件,同時(shí)也表明,快的菌絲生長(zhǎng)速度與高的木質(zhì)素降解率密切相關(guān)。其他5株菌株雖然在初篩培養(yǎng)基中表現(xiàn)較好,但在復(fù)篩時(shí),木質(zhì)素降解率卻沒(méi)有提高,這從某種程度上說(shuō)明初篩只是很粗略的篩選,不能正確體現(xiàn)誘變菌的潛力,只有當(dāng)初篩與復(fù)篩結(jié)合,才能既避免初篩的不確定性,又免去直接進(jìn)入復(fù)篩的費(fèi)時(shí)費(fèi)力。

3結(jié)論

從實(shí)驗(yàn)室保存的白腐真菌中篩選出1株木質(zhì)素降解率較高的菌株YJ-9-1,在培養(yǎng)14 d時(shí),其木質(zhì)素降解率為41.74%。經(jīng)ITS-5.8S rDNA序列分析,初步鑒定為變色栓菌(Trametes versicolor)。

對(duì)YJ-9-1進(jìn)行紫外-微波復(fù)合誘變,根據(jù)致死率曲線,紫外誘變選取致死率80%左右的時(shí)間8 min,微波誘變選取致死率80%左右的時(shí)間1 min,2批紫外誘變后初篩得到3株突變菌株,再將其進(jìn)行微波誘變,初篩后得到6株突變菌株,然后對(duì)它們進(jìn)行玉米秸稈固態(tài)發(fā)酵的復(fù)篩,得到1株木質(zhì)素降解率提高16.03%的菌株3-8,14 d的固態(tài)發(fā)酵后,其木質(zhì)素降解率達(dá)到48.43%;在3次重復(fù)的固態(tài)發(fā)酵試驗(yàn)中,穩(wěn)定性較好,木質(zhì)素降解率保持在48.00%左右。試驗(yàn)結(jié)果表明,復(fù)合誘變能將單獨(dú)誘變的效果協(xié)同起來(lái),達(dá)到更優(yōu)的誘變效果。

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