付宇姣,鄭學(xué)禮
登革病毒(DENV)屬于黃病毒科黃病毒屬,是最常見(jiàn)的通過(guò)節(jié)肢動(dòng)物(伊蚊)傳播的病毒性疾病病原體,分布于全球100多個(gè)國(guó)家,特別是熱帶和亞熱帶地區(qū)[1]。全球大約有25億人受登革病毒感染的威脅,每年大約有5 000萬(wàn)人感染登革熱,其中大約有210萬(wàn)的嚴(yán)重病例,50萬(wàn)例登革出血熱,20 000例死亡病例。登革病毒感染引起的病變范圍很廣,從自限性疾病到嚴(yán)重危及生命的登革熱、登革出血熱以及登革休克綜合征[2-4]。登革熱/登革出血熱已成為熱帶地區(qū)最為重要的蚊-傳播病毒性疾病,是重要的公共衛(wèi)生問(wèn)題[5]。
登革病毒是一個(gè)正義單鏈RNA病毒。登革病毒基因組RNA編碼3個(gè)結(jié)構(gòu)蛋白(C、E、prM/M)和7個(gè)非結(jié)構(gòu)蛋白(NS1、NS2a、NS2b、NS3、NS4a、NS4b、NS5),分為4個(gè)典型的血清型(DENV1-4)。包膜糖蛋白E是主要的病毒顆粒包膜糖蛋白,以同源三聚體形式存在于成熟病毒顆粒表面。結(jié)晶學(xué)的研究表明,登革病毒的包膜糖蛋白E與其他黃病毒類(lèi)似,分為3個(gè)結(jié)構(gòu)域(Ⅰ-Ⅲ)[6-9]。在三個(gè)結(jié)構(gòu)中,β鏈形成的二級(jí)結(jié)構(gòu)是其主要結(jié)構(gòu)。結(jié)構(gòu)域I位于E蛋白單體中央,E蛋白II區(qū)折疊成長(zhǎng)的指樣結(jié)構(gòu),E蛋白C端的氨基酸殘基構(gòu)成了結(jié)構(gòu)域Ⅲ。因?yàn)樵谒谐墒炀哂懈腥拘缘狞S病毒中E蛋白均是由與病毒融合有關(guān)的同源二聚體形成,推斷E蛋白的所有結(jié)構(gòu)都可能和病毒與細(xì)胞的融合過(guò)程有關(guān)[10]。其中E蛋白II區(qū)中第98~111位氨基酸殘基組成的cd環(huán),富含甘氨酸且具有很強(qiáng)的疏水性,序列組成在幾乎所有的蟲(chóng)媒黃病毒中高度保守。最近研究發(fā)現(xiàn),cd環(huán)可在E蛋白由二聚體向三聚體的轉(zhuǎn)變過(guò)程中插入胞膜,參與病毒與宿主細(xì)胞膜的融合,被認(rèn)為是病毒融合靶點(diǎn),或認(rèn)為是潛在的病毒融合肽[11-12]。推斷第一、第二結(jié)構(gòu)域可能與登革病毒發(fā)病機(jī)制相關(guān)。本研究旨在從大腸桿菌中表達(dá)登革II型病毒包膜糖蛋白(E)的第一、二結(jié)構(gòu)域(DI,DII),并通過(guò)免疫印跡驗(yàn)證重組蛋白的免疫原性,為后續(xù)的功能研究奠定工作基礎(chǔ)。
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1.1 病毒株、菌株和質(zhì)粒 登革Ⅱ型病毒NGC株、大腸桿菌DH5ɑ、表達(dá)菌BL21(DE3)、表達(dá)載體質(zhì)粒pET-28a(+)為本實(shí)驗(yàn)室保存。
1.1.2 主要試劑、耗材 RT-PCR試劑盒、DNAMarker、限制性內(nèi)切酶等購(gòu)自大連寶生物工程有限公司;質(zhì)粒提取試劑盒和凝膠回收試劑盒購(gòu)自美國(guó)O-mega公司;PVDF膜購(gòu)自millipore公司;Trizol試劑、His·Tag單抗、增強(qiáng)型HRP-DAB底物顯色試劑盒購(gòu)自英韋創(chuàng)津公司;HRP標(biāo)記的羊抗小鼠IgG購(gòu)自武漢博士德生物工程有限公司;登革病毒單抗(D1-11)購(gòu)自美國(guó)Santa Cruz生物技術(shù)公司;預(yù)染雙色蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)購(gòu)自美國(guó)Bio-Rad公司。
1.1.3 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物 實(shí)驗(yàn)用1~3日齡昆明乳鼠購(gòu)自南方醫(yī)科大學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心。
1.2 方法
1.2.1 引物的合成 引物用Premier 5.0軟件設(shè)計(jì)引物并由生工生物工程(上海)有限公司合成。RT-PCR擴(kuò)增E蛋白第一,二結(jié)構(gòu)域(DⅠ,Ⅱ)基因片 段 的 引 物:DV2-E-F:5′-CGTCCATATGATGCGTTGCATAG-3′(下劃線部分為NdeⅠ酶切位點(diǎn) ),DV2-E-R:5′-TCGCCTCGAGTTATCCTTTAGAGC-3′(下劃線部分為XhoⅠ酶切位點(diǎn))。
1.2.2 乳鼠腦內(nèi)接種病毒傳代 取-70℃保存的登革Ⅱ型病毒,加入DMEM培養(yǎng)基稀釋作為病毒液。用微量注身器每只30μL顱內(nèi)接種1~3d齡昆明乳鼠。接種后5~9d期間的發(fā)病瀕死乳鼠拉頸處死,無(wú)菌取腦組織備總RNA的提取。
1.2.3 目的基因的獲得 發(fā)病乳鼠腦組織的總RNA提取參見(jiàn)Invitrogen公司的Trizol說(shuō)明書(shū)。E蛋白第一、二結(jié)構(gòu)域基因片段的擴(kuò)增參見(jiàn)TaKa-Ra公司的RT-PCR試劑盒說(shuō)明書(shū)。反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性5min,94℃變性45s,58.1℃退火60 s,72℃延伸120s,30個(gè)循環(huán);72℃延伸8min。反應(yīng)后擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定,檢測(cè)擴(kuò)增片段的長(zhǎng)度。
1.2.4 目的基因的克隆及重組表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建將目的基因的PCR產(chǎn)物經(jīng)切膠回收純化后與經(jīng)XhoⅠ及NdeⅠ酶切純化的表達(dá)載體pET28a(+),按照TaKaRa公司T4DNA ligase試劑盒說(shuō)明書(shū)連接目的片斷與表達(dá)載體,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細(xì)胞,置37℃培養(yǎng)12~16h挑取單菌落,采取菌落PCR法初篩陽(yáng)性克隆質(zhì)粒,提取質(zhì)粒并進(jìn)行雙酶切鑒定,將陽(yáng)性克隆質(zhì)粒送上海英俊生物工程有限公司測(cè)序,檢查連入的片段有無(wú)堿基突變及開(kāi)放讀碼框是否正確。測(cè)序正確的質(zhì)粒命名為pET28a-DV2-E-D1&2。
1.2.5 重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞及誘導(dǎo)表達(dá)的SDS-PAGE分析 測(cè)序正確的pET-28a(+ )-DV2-E-D1&2,pET-28a(+ ),轉(zhuǎn) 化 BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞,挑取單菌落于終濃度為50mg/L卡那霉素的LB培養(yǎng)基中,37℃振蕩培養(yǎng)至OD600為0.5,取部分菌液作為誘導(dǎo)前對(duì)照,剩余菌液加入IPTG至終濃度為1mmol/L,37℃振蕩培養(yǎng)3h后收集菌液,沉淀,經(jīng)12%分離膠的SDS-PAGE分析重組菌的誘導(dǎo)表達(dá)。
1.2.6 重組蛋白的可溶性分析及純化 菌體沉淀重懸于裂解緩沖液中冰浴超聲裂解至澄清,裂解菌液離心后,回收上清及沉淀并加入等體積的裂解緩沖液重懸沉淀,分別取等體積的上清與重懸沉淀經(jīng)12%分離膠的SDS-PAGE分析重組蛋白的可溶性,重組蛋白的純化步驟參見(jiàn)德國(guó)Novagen公司的Ni-NTA His·Bind樹(shù)脂說(shuō)明書(shū)。
1.2.7 Western blot鑒定重組蛋白誘導(dǎo)前后的重組菌全菌蛋白 重組蛋白經(jīng)12%SDS-PAGE分離后,半干轉(zhuǎn)印于 PVDF 膜上,0.3%Tween-20,1%BSA封閉1h后,分別加入1∶3 000稀釋的His·Tag單抗和1∶500稀釋的登革病毒單抗于37℃孵育1.5h,PBST洗膜3次,加入1∶500稀釋的HRP標(biāo)記的羊抗小鼠IgG于37℃孵育1h,PBST充分洗膜后按照增強(qiáng)型HRP-DAB底物顯色試劑盒說(shuō)明書(shū)顯色。
2.1 以提取的乳鼠總RNA經(jīng)過(guò)RT-PCR擴(kuò)增得到約900bp的E蛋白第一、二結(jié)構(gòu)域基因片段,見(jiàn)圖1。
圖1 E蛋白第一,二結(jié)構(gòu)域基因片段的PCR擴(kuò)增Fig.1 PCR amplification of the envelop protein DNA fragmentLane 1:Products of PCR amplification M:DL-5000marker
2.2 pET28a-DV2-E-D1&2載體的構(gòu)建 重組質(zhì)粒pET28a-DV2-E-D1&2經(jīng)XhoⅠ和 NdeⅠ雙酶切后,可見(jiàn)約900bp的酶切片段,與預(yù)期大小相符,見(jiàn)圖2。測(cè)序分析表明,插入序列正確且開(kāi)放讀碼框正確。
2.3 重組菌誘導(dǎo)表達(dá)的SDS-PAGE分析 重組菌BL21(DE3)/pET-28a(+)-DV2-E-D1&2經(jīng)IPTG誘導(dǎo)后在37kD位置有明顯的誘導(dǎo)后表達(dá)帶,其大小與預(yù)測(cè)值一致。超聲裂解重組菌后,分別取上清與沉淀經(jīng)12%SDS-PAGE分析,顯示重組蛋白主要以包涵體形式存在于沉淀中,見(jiàn)圖3。
2.4 Western blot鑒定重組蛋白 Western blot結(jié)果顯示,重組菌誘導(dǎo)前的全菌蛋白沒(méi)有與His·Tag單抗反應(yīng)的條帶,而誘導(dǎo)后的全菌蛋白和在相對(duì)分子質(zhì)量為37000的位置均有與His·Tag單抗反應(yīng)的特異條帶,見(jiàn)圖4。登革病毒單抗(D1-11)與重組誘導(dǎo)前的全菌蛋白無(wú)反應(yīng),只在誘導(dǎo)后的全菌蛋白中有特異的條帶出現(xiàn),且與預(yù)測(cè)的相對(duì)分子質(zhì)量為37000的位置相符合,見(jiàn)圖5。上述結(jié)果說(shuō)明,重組蛋白具有良好的免疫反應(yīng)性。
圖2 重組質(zhì)粒pET-28a-DV2-E-D1&2的酶切鑒定Fig.2 Identification of the recombinant plasmid pET-28a(+)-DV2-E-D1&2by restriction enzymes digestionLane 1,3:Recombinant plasmid pET-28a(+)-DV2-E-D1&2;Lane 2,4:Recombinant plasmid pET-28a(+)-DV2-E-D1&2digested by the restriction enzymes XhoⅠ/NdeⅠ;M :DL-5000Marker
圖3 BL21(DE3)/pET-28a(+)-DV2-E-D1&2重組菌表達(dá)的 SDS-PAGE 分析Fig.3 SDS-PAGE analysis the expression of BL21(DE3)/pET-28a(+)-DV2-E-D1&2Lane 1:BL21(DE3)/pET-28a(+)before induction;Lane 2:BL21(DE3)/pET-28a(+)after induction;Lane 3:BL21(DE3)/pET-28a(+)-DV2-E-D1&2 before induction;Lane 4:BL21(DE3)/pET-28a(+)-DV2-E-D1&2 after induction;Lane 5:Supernatant of BL21(DE3)/pET-28a(+)-DV2-E-D1&2after sonication;Lane 6:Pellet of BL21(DE3)/pET-28a(+)-DV2-E-D1&2after sonication;Lane 7:Purification of the recombinant protein DV2-E-D1&2with Ni-NTAHis·Bind Resin;M:Protein marker
圖4 His·tag單克隆抗體鑒定重組DENV-2-E-D1&2蛋白Fig.4 Western Blot identification of recombinant protein with His·Tag McAbLane 1:BL21(DE3)/pET-28a(+)-DV2-E-D1&2 after induction;Lane 2:BL21(DE3)/pET-28a(+)-DV2-E-D1&2 before induction;M:Prestained Protein marker
圖5 Dengue Virus(D1-11)的單克隆抗體鑒定重組DENV-2-E-D1&2蛋白Fig.5 Western blot identification of recombinant protein with DENV(I-IV)McAbLane 1:BL21(DE3)/pET-28a(+)-DV2-E-D1&2 after induction;Lane 2:BL21(DE3)/pET-28a(+)-DV2-E-D1&2 before induction;M:Prestained Protein marker
登革病毒包膜蛋白E是由494~501個(gè)氨基酸殘基組成、分子質(zhì)量約為55~60kDa的糖蛋白。E蛋白可形成3個(gè)不同的結(jié)構(gòu)域,即呈β桶狀的I區(qū),參與二聚體形成的II區(qū)和具有免疫球蛋白樣結(jié)構(gòu)的III區(qū)。硫酸乙酰肝素(HS)是廣泛存在于細(xì)胞表面的一類(lèi)由二糖重復(fù)單位組成的多糖,表面具有大量負(fù)電荷,具有包括介導(dǎo)病原體吸附等在內(nèi)的多種生物學(xué)功能。研究表明,登革2型病毒中含高度保守的堿性氨基酸Lys89,Lys122,Lys123,其中I區(qū)和II區(qū)中帶有大量的正電荷Arg和Lys可能有助于病毒與硫酸乙酰肝素結(jié)合。研究也發(fā)現(xiàn),將細(xì)胞表面的硫酸乙酰肝素脫硫或經(jīng)酶消化去除后,登革病毒和黃熱病毒與細(xì)胞的結(jié)合能力顯著降低[13]。推斷第一、第二結(jié)構(gòu)域可能與登革病毒發(fā)病機(jī)制相關(guān)。
本研究中重組表達(dá)的蛋白經(jīng)SDS-PAGE分析以包涵體的形式存在。分析其形成原因有以下幾方面:蛋白表達(dá)量過(guò)高;重組蛋白含巰基酸多;重組蛋白所處發(fā)酵溫度高或胞內(nèi)pH接近蛋白的等電點(diǎn),這些因素均可導(dǎo)致降低蛋白的溶解度,形成包涵體。
本研究成功地在大腸桿菌中表達(dá)登革II型病毒包膜糖蛋白(E)的第一、二結(jié)構(gòu)域(DI,DII),對(duì)其進(jìn)行免疫反應(yīng)性鑒定,鑒定結(jié)果表明其具有良好的免疫反應(yīng)性。為進(jìn)一步研究第一、二結(jié)構(gòu)域與宿主細(xì)胞的相互作用和功能及其致病性奠定了基礎(chǔ)。
[1]Henchal EA,Putnak JR.The dengue viruses[J].Clin Microbiol Rev,1990,3(4):376-96.
[2]Guzman MG,Halstead SB,Artsob H,et al.Dengue a continuing global threat[J].Nat Rev Microbiol,2010,8(12Suppl):7-16.
[3]Whitehorn J,F(xiàn)arrar J.Dengue[J].Br Med Bull,2010,95(1):161-73.
[4]Tapia-CR,Méndez-Galván JF,Gallardo-Rincón H.The growing burden of dengue in Latin America[J].Clin Virol,2009,46(2 Suppl):3-6.
[5]雷子慶,蘇裕心,鄭學(xué)禮.登革域型病毒E蛋白第三結(jié)構(gòu)域在大腸桿菌中的表達(dá)、純化及免疫反應(yīng)性鑒定[J].南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào),2010,30(7):1496-1499.
[6]Zhang W,Chipman PR,Corver J,et al.Visualization of membrane protein domains by cryo-electron microscopyof dengue virus[J].Nat Struct Biol,2003,10(11):907–912.
[7]Kuhn RJ,ZhangW,Rossmann MG,et al.Structure of dengue virus:implications for flavivirus organization,maturation,and fusion[J].Cell,2002,108(5):717-725.
[8]Modis Y,Ogata S,Clements D,et al.Structure of the dengue virus envelope protein after membrane fusion[J].Nature 2004,427(6972):313-319.
[9]Megret F,Hugnot JP,F(xiàn)alconar A,et al.Use of recombinant fusion proteins and monoclonal antibodies to define linear and discontinuous antigenic sites on the dengue virus envelope glycoprotein[J].Virology,1992,187:480-491.
[10]Kuhn RJ,Zhang W,Rossman MG,et al.Structure of dengue virus:implications for flavivirus organization,maturation,and fusion[J].Cell,2002,108(5):717-725.
[11]Zheng A,Umashankar M,Kielian M.In vitro and in Vivo studies identify important features of dengue virus pr-E protein interactions[J].PLoS Pathog,2010,6(10):e1001157.
[12]Lin SR,Zou G,Hsieh SC.The helical domains of the stem region of dengue virus envelope protein are involved in both virus assembly and entry [J].Journal 0fVirology,2011,85(10):5159-5171.
[13]秦鄂德,秦成峰,姜濤.登革病毒與登革病毒?。跰].北京:科學(xué)出版社,2008:28-34.