王海燕，李 揚(yáng)，陳梅紅，張 烜

1中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院 北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 北京協(xié)和醫(yī)院風(fēng)濕免疫科，北京 1007302中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院 北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所生物化學(xué)系， 北京 100005

·論著·

系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者外周血單個(gè)核細(xì)胞中微小RNA-146a的表達(dá)

王海燕1，李 揚(yáng)1，陳梅紅2，張 烜1

1中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院 北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 北京協(xié)和醫(yī)院風(fēng)濕免疫科，北京 100730
2中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院 北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所生物化學(xué)系， 北京 100005

目的采用生物信息學(xué)和分子生物學(xué)技術(shù)相結(jié)合，尋找在系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE)中特異性表達(dá)的微小RNA，為進(jìn)一步研究微小RNA在SLE發(fā)病機(jī)制中的作用打下基礎(chǔ)。方法查找與SLE發(fā)病相關(guān)的基因，采用微小RNA靶基因預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)庫預(yù)測(cè)SLE相關(guān)基因上的可能微小RNA靶位點(diǎn)，選擇其相對(duì)應(yīng)的微小RNA-146a,即hsa-miR-146a，采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法檢測(cè)SLE患者與正常人外周血單個(gè)核細(xì)胞(PBMCs)中微小RNA的表達(dá)差異。結(jié)果SLE患者外周血PBMCs中hsa-miR-146a的循環(huán)閾值的差值高于正常對(duì)照組(4.52±1.18 比2.76±1.38，P=0.02)，hsa-miR-146a的表達(dá)量顯著低于正常對(duì)照組。結(jié)論SLE患者PBMCs中hsa-miR-146a的表達(dá)水平降低，表明hsa-miR-146a在SLE發(fā)病機(jī)制中可能發(fā)揮一定的作用。

微小RNA；系統(tǒng)性紅斑狼瘡；外周血單個(gè)核細(xì)胞

系統(tǒng)性紅斑狼瘡(systemic lupus erythematosus, SLE)發(fā)病機(jī)制復(fù)雜，被認(rèn)為是自身免疫病的原型。大量研究證實(shí)，基因水平的免疫調(diào)節(jié)障礙及細(xì)胞因子代謝紊亂在SLE 中表現(xiàn)突出，直接或間接地參與了疾病的形成和發(fā)生發(fā)展過程。微小RNA在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控基因的表達(dá)，在如凋亡[1]、分化[2]和細(xì)胞周期[3]中均發(fā)揮重要的作用并調(diào)節(jié)多種生物學(xué)信號(hào)通路。本研究利用生物信息學(xué)方法，借助于哺乳動(dòng)物微小RNA靶基因預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)庫miRBase和TargetScan，預(yù)測(cè)出SLE相關(guān)基因上的可能微小RNA靶位點(diǎn)，選擇其相對(duì)應(yīng)的微小RNA，采用TaqMan探針實(shí)時(shí)定量PCR(quantitative real-time polymerase chain reaction，qRT-PCR)技術(shù)檢測(cè)其在SLE患者外周血單個(gè)核細(xì)胞(peripheral blood mononuclear cells，PBMCs)中的表達(dá)，為進(jìn)一步研究微小RNA在SLE發(fā)病機(jī)制中的作用打下基礎(chǔ)。

對(duì)象和方法

對(duì)象收集我院風(fēng)濕免疫科門診8例女性系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者，年齡15～42歲，病情較為一致。所有患者的診斷均符合美國風(fēng)濕病學(xué)會(huì)1997年修訂的SLE診斷標(biāo)準(zhǔn)。入組的SLE患者按SLE疾病活動(dòng)指數(shù)評(píng)分≥10，臨床表現(xiàn)均具有血尿、蛋白尿、低補(bǔ)體、抗雙鏈DNA增高。8例正常對(duì)照皆來自年齡25～30歲的北京協(xié)和醫(yī)院健康志愿獻(xiàn)血者，年齡和性別匹配。

試劑和儀器淋巴細(xì)胞分離液購自國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司；Trizol購自美國Invitrogen公司； hsa-miR-146a TaqMan?MicroRNA Assays和RUN6 TaqMan?MicroRNA Assays及TaqMan?MicroRNA Reverse Transcription Kit 及 TaqMan 2× Universal PCR Master Mix購自ABI公司，ABI PRISM7500 Real-Time PCR 擴(kuò)增儀(美國應(yīng)用生物技術(shù)系統(tǒng)公司)，熒光定量 96 孔板(美國應(yīng)用生物技術(shù)系統(tǒng)公司)。

采用微小RNA靶基因預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)庫預(yù)測(cè)SLE相關(guān)基因上的可能微小RNA靶位點(diǎn)結(jié)合目前的文獻(xiàn)報(bào)道，查找并總結(jié)出與SLE發(fā)病相關(guān)的基因。在miRBase 13.0(http://microrna.sanger.ac.uk)和TargetScan 5.2(http://www.targetscan.org)數(shù)據(jù)庫中分別查找這些基因上的可能微小RNA靶位點(diǎn)。分別統(tǒng)計(jì)每個(gè)微小RNA靶位點(diǎn)的出現(xiàn)頻率、每個(gè)微小RNA靶位點(diǎn)在不同的SLE相關(guān)基因上的出現(xiàn)頻率(作用靶基因數(shù))。在靶位點(diǎn)出現(xiàn)頻率較高的微小RNA、靶位點(diǎn)在不同的SLE相關(guān)基因上出現(xiàn)頻率較高的微小RNA、以及miRBase 13.0和TargetScan 5.2兩大數(shù)據(jù)庫預(yù)測(cè)結(jié)果較一致的微小RNA中隨機(jī)選擇hsa-miR-146a，對(duì)其在SLE患者PBMCs中的表達(dá)量做進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。

外周血單個(gè)核細(xì)胞的提取抽取SLE患者及正常對(duì)照人群外周靜脈血4 ml，抗凝。用常規(guī)淋巴細(xì)胞分離液密度梯度離心法分離PBMCs。分離出的乳白色PBMCs層用1倍體積的PBS洗滌兩次。洗滌后用PBS定容至1 ml，吹打混勻；用細(xì)胞計(jì)數(shù)板計(jì)數(shù)。

PBMCs中總RNA的提取及質(zhì)量檢測(cè)將患者及健康對(duì)照者PBMCs懸液轉(zhuǎn)移至1.5 ml 無RNA酶的EP管中，Trizol法提取總RNA，提取的總RNA加入35 μl 無RNA酶的水，于55～60℃水浴5～10 min,使RNA充分溶解。用核酸紫外分析儀檢測(cè)RNA濃度，保證OD260/280位于1.8～2.0，并電泳檢測(cè)RNA質(zhì)量，剩余的RNA凍存于-80℃?zhèn)溆谩?/p>

反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)將SLE患者及正常人PBMCs中提取的總RNA用RNase-free水稀釋成濃度為2 ng/μl。應(yīng)用ABI公司的TaqMan?微RNA反轉(zhuǎn)錄試劑盒，反應(yīng)體系為15 μl。每個(gè)0.2 ml RNase-free的EP管中分別加入10×RT酶(50 U/μl)1.00 μl，10×RT緩沖液1.5 μl，RNA酶抑制劑(20 U/μl)0.19 μl，無RNA酶水 4.16 μl，dNTP (10 mmol/L)0.15 μl,Total RNA 5 μl，5×RT引物3 μl。均于冰上加樣。反應(yīng)參數(shù)為：16℃ 30 min；42℃ 30 min；85℃ 5 min；4℃無限延伸。選用RUN6為內(nèi)參。

實(shí)時(shí)定量PCR反應(yīng)采用ABI公司的TaqMan?2×通用PCR混合液，20 μl PCR反應(yīng)體系(μl)：Taqman 探針1.00 μl；cDNA 3.00 μl；PCR 混合液10.00 μl；ddH2O 6.00 μl。PCR循環(huán)條件：95℃ 10 min(95℃ 15 s→60℃ 60 s)40個(gè)循環(huán)。

統(tǒng)計(jì)學(xué)處理采用SPSS 16.0 軟件包。用循環(huán)閾值的差值(△Ct)(目標(biāo)基因的Ct 值減去內(nèi)參基因的Ct 值)對(duì)實(shí)時(shí)定量PCR 的結(jié)果進(jìn)行相對(duì)定量分析，數(shù)據(jù)以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示，均值的比較采用t檢驗(yàn)進(jìn)行分析，P<0.05為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

結(jié) 果

與SLE發(fā)病相關(guān)的基因與SLE發(fā)病相關(guān)基因可分為細(xì)胞凋亡相關(guān)因子、細(xì)胞因子相關(guān)、轉(zhuǎn)錄活化因子及信號(hào)相關(guān)因子、干擾素相關(guān)因子等幾類(表1)。

與SLE發(fā)病相關(guān)基因在微小RNA靶基因預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)庫中的查詢結(jié)果在兩大微小RNA靶基因預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)庫miRBase 13.0和TargetScan 5.2中查找出與SLE發(fā)病相關(guān)基因上的可能微小RNA靶位點(diǎn)(表2)。

qRT-PCR方法檢測(cè)hsa-miR-146a在SLE患者及正常人PBMCs中的表達(dá)SLE患者外周血PBMCs中hsa-miR-146a的△Ct值高于正常對(duì)照組(4.52±1.18 比2.76±1.38，P=0.02)。

討 論

繼小干擾RNA后，人們發(fā)現(xiàn)微小RNA也是一種對(duì)基因表達(dá)調(diào)控發(fā)揮重要作用的非編碼小RNA。人的微小RNA-146家族有兩個(gè)成員：146a和146b，分別位于5和10號(hào)染色體上。有報(bào)道hsa-miR-146a與免疫性疾病及免疫反應(yīng)相關(guān)[4-5]。Hsa-miR-146a還可在人類肺泡上皮細(xì)胞中調(diào)節(jié)急性炎癥反應(yīng)，其表達(dá)的快速增高為固有免疫反應(yīng)提供了一個(gè)新的負(fù)向調(diào)節(jié)機(jī)制[6]。

表 1 與SLE發(fā)病相關(guān)的基因

SLE：系統(tǒng)性紅斑狼瘡；TNF：腫瘤壞死因子；TFAR：TF-1細(xì)胞凋亡相關(guān)基因；IL：白細(xì)胞介素；IFN：干擾素；TGF：轉(zhuǎn)化生長因子；MMP：基質(zhì)金屬蛋白酶；CIS：細(xì)胞因子信號(hào)傳導(dǎo)抑制蛋白；TNFSF：腫瘤壞死因子配體超家族成員；TRAF：腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子；ATG：自噬相關(guān)基因； TRAIL：腫瘤壞死因子凋亡相關(guān)配體； GATA：結(jié)合蛋白；STAT：信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)及活化轉(zhuǎn)錄因子；SOCS：細(xì)胞因子信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)抑制因子；BLK： B淋巴細(xì)胞激酶；SLAMF：淋巴細(xì)胞信號(hào)激活分子；IRF：干擾素調(diào)節(jié)因子；IFIT：應(yīng)激相關(guān)蛋白；GIMAP5：免疫相關(guān)蛋白5核苷酸結(jié)合GTP酶；CD40LG： CD40配體基因；PDCD：程序性凋亡細(xì)胞；MERTK：突變受體酪氨酸激酶基因；KIR：殺傷細(xì)胞免疫球蛋白樣受體；TLR：toll 樣受體；MECP：甲基結(jié)合蛋白；PRF：穿孔素；ITGAL：增殖誘導(dǎo)配體(TNF家族)；CTLA：細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞抗原；CRP：C反應(yīng)蛋白

SLE: systemic lupus erythematosus; TNF: tumor necrosis factor；TFAR: TF-1 cell apoptosis-related gene；IL: interleukin；IFN: interferon；TGF: transforming growth factor；MMP: matrix metallopeptidase；CIS: cytokine-inducible SH2 protein；TNFSF: tumor necrosis factor superfamily；TRAF: TNF receptor-associated factor；ATG: autophagy gene；TRAIL: tumor necrosis factor-related apoptosis-including ligand；GATA: binding protein；STAT: signal transducer and activator of transcription；SOCS: suppressor of cytokine signaling；BLK: B lymphocyte kinase；SLAMF: signaling lymphocyte activation molecule F；IRF: interferon regulatory factor；IFIT: interferon-induced with tetratricopetide；GIMAP: GTPase of immunity-associated nucleotide binding protein；CD40LG: CD40 ligand gene；PDCD: programmed cell death； MERTK: MER receptor tyrosine kinase gene；KIR: killer cell immunoglobulin-like receptor；TLR: toll-like receptor；MECP: methyl-CpG-binding protein；PRF: perforin；ITGAL: proliferation-inducing ligand (TNF family)；CTLA: cytotoxic T lymphocyte antigen；CRP: C-reactive protein

表 2 兩個(gè)微小RNA靶基因預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)庫檢索結(jié)果

研究表明，長度為20～25個(gè)核苷酸的微小RNA通過與靶mRNA的3’非翻譯區(qū)(UTR)不完全互補(bǔ)結(jié)合，引起相應(yīng)靶mRNA的降解或翻譯抑制效應(yīng)從而下調(diào)靶基因表達(dá)[7-8]。本研究顯示SLE患者外周血PBMCs中hsa-miR-146a的表達(dá)量顯著低于正常人，因而可以初步推測(cè)hsa-miR-146a的表達(dá)異常在SLE發(fā)病中可能發(fā)揮一定的作用。兩大數(shù)據(jù)庫預(yù)測(cè)的hsa-miR-146a可能作用的與SLE相關(guān)的靶基因有CD40LG、IRF5、PRF1。

綜上，本研究探討了微小RNA在SLE患者外周血PBMCs中的特征性表達(dá)，發(fā)現(xiàn)SLE患者外周血PBMCs中hsa-miR-146a的表達(dá)量顯著低于正常人，為進(jìn)一步研究微小RNA在SLE發(fā)病機(jī)制中的作用提供了有益的線索。

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ExpressionofMicroRNA-146ainPeripheralBloodMononuclearCellsin
PatientswithSystemicLupusErythematosus

WANG Hai-yan1, LI Yang1, CHEN Mei-hong2，ZHANG Xuan1

1Department of Rheumatology, PUMC Hospital, CAMS and PUMC, Beijing 100730, China
2Department of Biochemistry,Institute of Basic Medical Sciences, CAMS and PUMC, Beijing 100005, China

ZHANG Xuan Tel:010-88068177, E-mail:zxpumch2003@yahoo.com.cn;

ObjectiveTo explore the expression pattern of microRNAs in the peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) of patients with systemic lupus erythematosus (SLE), with an attempt to identify the role of microRNA in the pathogenesis of SLE.MethodsSLE-related genes were searched from the published literatures. Using the microRNA target gene prediction databases, we predicted the putative microRNA targets in these SLE-related genes. For some of the corresponding microRNAs (hsa-miR-146a), quantitative real-time polymerase chain reaction was performed to determine the expression levels of these microRNAs in PBMCs of SLE patients (SLE group) and healthy controls (control group).ResultThe discrepancy of cycle threshold of hsa-miR-146a in PBMCs was significantly higher in SLE group (4.52±1.18) than in control group (2.76±1.38) (P=0.02), and the expression level of hsa-miR-146a was significantly lower in SLE group.ConclusionThe expression of hsa-miR-146a decreases in SLE patients, indicating that hsa-miR-146a may play a role in the pathogenesis of SLE.

microRNA;systemic lupus erythematosus; peripheral blood mononuclear cells

ActaAcadMedSin，2011,33(2)：185-188

張 烜 電話：010-88068177，電子郵件：zxpumch2003@yahoo.com.cn；
陳梅紅 電話：010-67884240，電子郵件：chenmhxc@gmail.com

R593.24+1

A

1000-503X(2011)02-0185-04

10.3881/j.issn.1000-503X.2011.02.017

教育部新世紀(jì)優(yōu)秀人才計(jì)劃(NCET-04-0191)，國家自然科學(xué)基金(30400410)，北京自然科學(xué)基金(7052052)和國家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃項(xiàng)目子課題(2007CB512405)Supported by the Ministry of Education’s New Century Excellent Talents Scheme (NCET-04-0191), the National Natural Sciences Foundation of China(30400410), the Natural Sciences Foundation of Beijing(7052052), and the National Basic Research Program Sub-topics of China(2007CB512405)

CHEN Mei-hong Tel: 010-67884240,E-mail: chenmhxc@gmail.com

2010-05-04)