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實(shí)時(shí)定量RT-PCR檢測(cè)PML-RARα融合基因診斷APL的臨床價(jià)值

2011-04-13 09:42:06丁潤(rùn)生
山東醫(yī)藥 2011年33期
關(guān)鍵詞:中位骨髓陰性

陸 偉,秦 燕,丁潤(rùn)生,尹 紅

(南通大學(xué)附屬醫(yī)院,江蘇 南通 226001)

急性早幼粒細(xì)胞白血病(APL)是急性髓系白血病(AML)的一個(gè)特殊類型,95%以上APL存在 t(15;17)(q22;q21)染色體易位,產(chǎn)生PML-RARα融合基因,是APL診斷和微小殘留病(MRD)的重要分子標(biāo)志[1]。根據(jù) PML基因的斷裂位點(diǎn)不同,PML-RARα融合基因可分為3種,分別為L(zhǎng)型、V型S型,在PML-RARα融合基因中所占比例分別為50%、5%、45%[2]。我們應(yīng)用一步法實(shí)時(shí)熒光定量逆轉(zhuǎn)錄PCR(RQ-RT-PCR)針對(duì)上述最特異、最常見的惡性克隆基因片段,檢測(cè)APL患者初診及緩解后融合基因轉(zhuǎn)錄本mRNA的表達(dá),探討其在APL患者診斷及MRD檢測(cè)中的臨床意義。

1 資料與方法

1.1 臨床資料 2008年6月~2011年4月在南通大學(xué)附屬醫(yī)院血液內(nèi)科就診的初發(fā)APL患者42例,男27例、女15例,年齡18~64歲、中位年齡36歲;均根據(jù)形態(tài)學(xué)、組織化學(xué)、流式細(xì)胞術(shù)和遺傳學(xué)檢查確診。選擇其中經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)誘導(dǎo)治療(全反式維甲酸和三氧化二砷的聯(lián)合化療)獲得完全緩解(CR)、有完整臨床和實(shí)驗(yàn)室資料的30例患者進(jìn)行MRD檢測(cè),自獲得CR起2年內(nèi)每3個(gè)月、2年后每6個(gè)月收集標(biāo)本1次,共112份(42份治療前APL骨髓標(biāo)本,70份APL-CR骨髓標(biāo)本)骨髓標(biāo)本。

1.2 方法

1.2.1 標(biāo)本處理及核酸制備 抽取患者骨髓液EDTA 抗凝,取 100 μl加入 300 μl Trizol,-80 ℃以下保存?zhèn)溆?。總RNA采用Trizol-氯仿—異丙醇—乙醇提取,將抽提好的RNA加至60 μl RNAase-free水混勻溶解,立即進(jìn)行檢測(cè)或-80℃以下保存?zhèn)溆谩V饕噭┖蛢x器為白血病融合基因檢測(cè)試劑盒(上海源奇生物醫(yī)藥科技有限公司)、ABI Prism熒光定量PCR檢測(cè)系統(tǒng)(美國(guó))、FACSCalibur流式細(xì)胞儀及主要單克隆抗體HLA-DR-FITC、CD117-PE、CD123-Percpcy5.5、CD34APC(美國(guó) BD 公司)。

1.2.2 RQ-RT-PCR方法 每份標(biāo)本利用 Taqman探針在ABI Prism熒光定量PCR檢測(cè)系統(tǒng)上同時(shí)檢測(cè)PML-RARα和ABL基因的表達(dá)。以內(nèi)參基因ABL檢測(cè) PML-RARα擴(kuò)增的模板質(zhì)量,用 PMLRARα融合基因兩對(duì)引物分別擴(kuò)增L型和S型2個(gè)不同的轉(zhuǎn)錄本。反應(yīng)體系為25 μl(反應(yīng)液8 μl加混合酶液2 μl和15 μl已抽提的 RNA),擴(kuò)增條件:42 ℃ 30 min,94 ℃ 5 min;94 ℃ 15 s,60 ℃ 60 s,40個(gè)循環(huán)。在PCR循環(huán)第2步60℃時(shí)收集熒光信號(hào),檢測(cè)通道為:FAM-TAMRA,參比熒光定為none。每組均設(shè)置陰性對(duì)照和陽(yáng)性對(duì)照,最低檢出限為1×102copies。每批標(biāo)本均以陽(yáng)性標(biāo)準(zhǔn)品質(zhì)粒ABL 1×103~1×106個(gè)數(shù)量級(jí)范圍作標(biāo)準(zhǔn)曲線。結(jié)果均以標(biāo)準(zhǔn)拷貝數(shù)(NCN)表示,即將同一份標(biāo)本PMLRARα拷貝數(shù)/ABL拷貝數(shù)來(lái)計(jì)算PML-RARα轉(zhuǎn)錄本的相對(duì)表達(dá)量,單位為%。采用7500軟件V2.0.1版本分析結(jié)果。

1.2.3 流式細(xì)胞術(shù)(FCM)檢測(cè) APL-CR患者的MRD 選擇30份APL初診時(shí)免疫表型符合HLADR-/CD117+/CD123+/CD34-的CR患者骨髓在進(jìn)行RQ-RT-PCR檢測(cè)的同時(shí)進(jìn)行FCM檢測(cè)MRD。四色直標(biāo),分析5×105個(gè)細(xì)胞,篩查 HLA-DR-/CD117+/CD123+/CD34-的細(xì)胞群。

1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPSS11.5統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件,計(jì)數(shù)資料采用χ2檢驗(yàn)。P≤0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 APL患者的 RQ-RT-PCR結(jié)果 42例初診APL患者的 PML-RARα融合基因轉(zhuǎn)錄本的中位NCN為61%(13% ~284%),其中L型34例,S型8例。L型和S型異構(gòu)體中位NCN分別為56%(28%~278%)和70%(13% ~284%),L型和 S型轉(zhuǎn)錄本的表達(dá)水平無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P>0.05)。

2.2 RQ-RT-PCR檢測(cè)APL-CR患者 MRD 70份APL-CR骨髓標(biāo)本PML-RARα融合基因轉(zhuǎn)錄本中位NCN 為4.00%(0.00% ~8.26%)。其中有 26 份NCN≥0.01%,考慮有分子生物學(xué)復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)。參照試劑盒說(shuō)明書結(jié)果判斷:NCN≥0.01%為MRD陽(yáng)性,NCN<0.01%為MRD陰性。

2.3 FCM檢測(cè)APL-CR患者M(jìn)RD FCM對(duì)符合要求的30份APL-CR骨髓進(jìn)行MRD檢測(cè),其中有11例 CD34-/CD117+/CD123+/HLA-DR-細(xì)胞≥0.09%。MRD判斷標(biāo)準(zhǔn):根據(jù)實(shí)驗(yàn)室正常骨髓中此類細(xì)胞的比例在0.050% ~0.086%,確定 MRD≥0.09%為陽(yáng)性,MRD <0.09%為陰性。

2.4 RQ-RT-PCR和FCM同時(shí)檢測(cè)結(jié)果比較 30份骨髓標(biāo)本,RQ-RT-PCR法檢測(cè)MRD陽(yáng)性14例,陰性16例;FCM法檢測(cè)MRD陽(yáng)性11例,陰性19例。兩種方法均陽(yáng)性10例,均陰性15例,符合率83.3%(25/30)。顯示兩種方法有較好的一致性(χ2=0.278,P=0.598)。

3 討論

95%的APL患者有t(15;17)(q22;q21)染色體易位,形成PML-RARα融合基因,此為APL特異性細(xì)胞遺傳學(xué)標(biāo)志。但APL除了典型的t(15;17)外,少量患者存在t(11;17)和t(5;17)等其他涉及17號(hào)染色體的易位,這類患者對(duì)維甲酸治療反應(yīng)差,故早期正確檢測(cè)PML-RARα融合基因,對(duì)明確診斷、指導(dǎo)治療、提示預(yù)后具有重要的意義。

我們采用一步法RQ-RT-PCR,巧妙地將RT反應(yīng)和隨后的PCR反應(yīng)融入一個(gè)體系中,大大減少了非特異性cDNA鏈的合成。整個(gè)反應(yīng)完全在一個(gè)反應(yīng)管中進(jìn)行,一次加樣后即可完成全部反應(yīng),最大限度減少實(shí)驗(yàn)操作,而且避免在加樣過(guò)程中對(duì)反應(yīng)產(chǎn)物造成污染。同時(shí)采用Taqman探針熒光定量技術(shù),比定性PCR技術(shù)具有更好的特異性和靈敏度。融合基因轉(zhuǎn)錄本拷貝數(shù)以ABL內(nèi)參基因進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理,從而校正了由于加樣、探針熒光衰退等造成的誤差,使結(jié)果更直觀、可靠。本實(shí)驗(yàn)對(duì)42例初治APL患者檢測(cè)了PML-RARα融合基因的L型和S型兩種常見異構(gòu)體類型,實(shí)驗(yàn)結(jié)果為L(zhǎng)型34例,S型8例,轉(zhuǎn)錄本的中位NCN為61%(13% ~284%)。NCN值可直觀地用來(lái)比較患者治療前后的轉(zhuǎn)錄本表達(dá)水平變化。

隨著治療方案的改進(jìn),APL患者的生存期大大延長(zhǎng),但CR患者仍存在復(fù)發(fā)的危險(xiǎn),MRD的存在是導(dǎo)致復(fù)發(fā)的主要原因。曾有研究結(jié)果顯示,MRD在0.5×10-5~5×10-5時(shí)與隨后的復(fù)發(fā)無(wú)相關(guān)性[3],即當(dāng) MRD<10-5時(shí)已不能提示臨床復(fù)發(fā)。RQ-RT-PCR技術(shù)敏感度達(dá)到10-6~10-4,可有效檢測(cè)體內(nèi)的殘留白血病細(xì)胞[4]。本文通過(guò)對(duì)30例APL-CR患者的動(dòng)態(tài)檢測(cè),70份骨髓標(biāo)本的PMLRARα融合基因中位 NCN為 4.00%(0.00% ~8.26%),明顯低于初診時(shí)。有26份PML-RARα融合基因 NCN≥0.01%,考慮有分子生物學(xué)復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)。Jurcic等[5]認(rèn)為PCR檢測(cè)MRD 2次以上陰性的患者,僅7%發(fā)生復(fù)發(fā),而2次以上陽(yáng)性者則100%復(fù)發(fā)。因而,CR患者定期行RQ-RT-PCR檢測(cè)有助于早期發(fā)現(xiàn)疾病進(jìn)展,便于在血液學(xué)復(fù)發(fā)前進(jìn)行挽救性治療。

文獻(xiàn)報(bào)道[6]與本室結(jié)果證實(shí),APL具有較特異的免疫表型:SSC較大,CD34、HLA-DR都為陰性,CD117表達(dá)率達(dá)80%左右。CD123是APL干細(xì)胞的一個(gè)獨(dú)特的標(biāo)志,正常造血干細(xì)胞極少表達(dá),因此,利用 CD34-/CD117+/CD123+/HLA-DR-抗體組合可有效地對(duì)符合該表型的APL-CR患者進(jìn)行MRD檢測(cè)。選擇其中30份初診時(shí)符合該免疫表型的骨髓標(biāo)本利用FCM檢測(cè)MRD,發(fā)現(xiàn)兩者有較好的一致性。本組有4例臨床緩解標(biāo)本FCM檢測(cè)結(jié)果為陰性,而RQ-RT-PCR檢測(cè)到PML-RARα融合基因轉(zhuǎn)錄本,可能與RT-PCR敏感性高于FCM有關(guān)。1例FCM檢測(cè)到MRD而RQ-RT-PCR結(jié)果為陰性,與其存在一定的假陰性有關(guān)。

綜上所述,以Taqman探針熒光定量技術(shù),用ABL為內(nèi)參基因的一步法RQ-RT-PCR不僅操作簡(jiǎn)便、檢測(cè)快速,而且結(jié)果直觀、可靠,具有很好的靈敏度和特異性,在APL診斷和MRD的檢測(cè)中具有重要的臨床價(jià)值。

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