蔣建春,張海添
(廣西醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院,南寧530021)
EMSY基因定位于染色體11q13.5,其編碼一種抑制性蛋白?,F(xiàn)已證實(shí),基因啟動(dòng)子CpG島區(qū)DNA發(fā)生異常甲基化可能引起腫瘤相關(guān)基因的表達(dá)[1]。李云青等[2]發(fā)現(xiàn),散發(fā)性乳腺癌患者BRCA1基因出現(xiàn)異常甲基化。本研究采用甲基化特異性PCR(MSP)方法檢測(cè)散發(fā)性乳腺癌組織中EMSY基因啟動(dòng)子甲基化狀態(tài),進(jìn)一步探討異常甲基化狀態(tài)與散發(fā)性乳腺癌發(fā)生的關(guān)系。
1.1 臨床資料 2009年3月~2010年6月廣西醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院收治的散發(fā)性乳腺癌66例,均為女性,年齡30~72歲;無(wú)乳腺癌家族史。均行手術(shù)治療,留取腫瘤組織,同時(shí)留取距腫瘤邊緣>5cm的良性乳腺組織32例。收集標(biāo)本快速置入液氮過(guò)夜后,轉(zhuǎn)入-80℃低溫冰箱儲(chǔ)存。
1.2 受檢標(biāo)本DNA提取與修飾 取冰凍的乳腺組織標(biāo)本,解凍后取約0.5 g,剪碎研磨置1.5 ml離心管中,加 0.5 ml的 TES,50 μl的 SDS(10%),5.5 μl的蛋白酶K(20 mg/ml),充分混勻后置56℃水浴中5 h。用酚—氯仿法抽提DNA,用2.5倍的冰無(wú)水乙醇沉淀DNA,75%乙醇洗滌后溶于100 μl滅菌水中,用紫外分光光度計(jì)測(cè)其純度及濃度,-20℃儲(chǔ)存。參照Herman方法修飾DNA。取3 μg的DNA加入總體積 50 ml的滅菌水中,加入 5.5 μl的NaOH(3 mol/L),37℃水浴 20min,加入新鮮配制的氫醌30 μl(10 mmol/L)與 520 μl的亞硫酸氫鈉(pH 5.0),混勻后加200 μl礦物油,50 ℃避光水浴16 h,用Wizard DNA clen-up system試劑盒回收純化 DNA,加入 5.5 μl的 NaOH(3 mol/L)室溫 15min,33 μl的乙酸銨(10 mol/L)中和 NaOH 后,用并無(wú)水乙醇沉淀DNA。將修飾后的DNA溶于30 μl滅菌水中,-20℃保存。
1.3 EMSY基因啟動(dòng)子甲基化狀態(tài)檢測(cè) EMSY基因啟動(dòng)子甲基化與非甲基化引物由PCR引物設(shè)計(jì)軟件 MethPrimer在線設(shè)計(jì),甲基化引物 5'-ATTTCGTAATTCGTAAATCGGTTAC-3'(上游),5'-ACTTTATTCCTAAAATACCGTCGAA-3'(下游),目的片段長(zhǎng)度173 bp;非甲基化引物5'-TTTTGTAATTTGTAAATTGGTTATGG-3'(上 游),5'-ACTTTATTCCTAAAATACCATCAAA-3'(下游),目的片段長(zhǎng)度為172 bp。PCR體系為25 μl,含有修飾后的 DNA 3 μl、10 × buffer 2.5 μl、2.5 mmol/L 的 dNTP 2 μl、hotstartaq酶 1 U、上下游引物各 0.5 μl,去離子水補(bǔ)齊至25 μl。PCR反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性5min,95℃ 30 s,63 ℃(M)或 59 ℃(U)45 s,72 ℃ 45 s,40個(gè)循環(huán),72℃延伸10min。PCR產(chǎn)物用2%瓊脂糖凝膠90 V電壓電泳40min,用凝膠成像儀觀察結(jié)果。
1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPSS13.0統(tǒng)計(jì)軟件。數(shù)據(jù)比較用四格表資料的χ2檢驗(yàn)。P≤0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
經(jīng)瓊脂糖電泳PCR產(chǎn)物,得到EMSY啟動(dòng)子甲基化產(chǎn)物(173 bp)和非甲基化產(chǎn)物(172 bp)。66例散發(fā)性乳腺癌組織中有11例(16.7%)出現(xiàn)甲基化(包括完全甲基化不完全甲基化)產(chǎn)物條帶,32例癌旁良性組織中有12例(37.5%)出現(xiàn)甲基化產(chǎn)物條帶;兩者相比,P <0.05。
DNA甲基化是最早發(fā)現(xiàn)的基因表觀修飾方式之一。甲基化是指在DNA甲基化酶的作用下將甲基轉(zhuǎn)移到特定堿基上。DNA甲基化在細(xì)胞功能、基因的表達(dá)和染色體的穩(wěn)定中起重要作用[3]。DNA甲基化不是改變基因的序列而是影響基因的表達(dá),所以異常的甲基化狀態(tài)可能會(huì)導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生。已有研究[4]發(fā)現(xiàn),在癌組織基因中常會(huì)出現(xiàn)高甲基化或低甲基化狀態(tài),異常的甲基化可能會(huì)引起相關(guān)基因表達(dá)異常。高甲基化可引起抑癌基因的表達(dá)缺失,導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生[5],可能與甲基化抑制某些非必需基因的表達(dá)使其處于沉默狀態(tài)有關(guān),如RASSF1A在乳腺癌中呈高甲基化[2]。但也有研究[6]表明,DNA低甲基化比高甲基化在腫瘤中更為常見(jiàn),低甲基化使基因突變率升高,基因的雜合丟失還與低甲基化致使基因激活有關(guān)。這些變化可能改變了基因的穩(wěn)定性,引起基因表達(dá)異常,進(jìn)而導(dǎo)致細(xì)胞表型的改變和腫瘤的發(fā)生。DNA甲基化異常多發(fā)生在腫瘤的早期階段,所以,對(duì)相關(guān)基因甲基化狀態(tài)的檢測(cè)可能為腫瘤的早期診斷提供依據(jù)。
EMSY基因被公認(rèn)為是一種致癌基因[7],其過(guò)表達(dá)可引起B(yǎng)RCA2基因3號(hào)外顯子表達(dá)缺陷而引發(fā)腫瘤[8]。已有研究發(fā)現(xiàn),EMSY基因在13%散發(fā)性乳腺腫瘤中過(guò)表達(dá)。本研究發(fā)現(xiàn),散發(fā)性乳腺癌中EMSY基因啟動(dòng)子呈低甲基化狀態(tài),這可能為散發(fā)性乳腺癌早期診斷提供了一個(gè)新依據(jù),也有助于推動(dòng)乳腺癌基因治療和預(yù)后判斷的研究,而 EMSY基因啟動(dòng)子低甲基化與其基因過(guò)表達(dá)是否有關(guān)聯(lián)還需進(jìn)一步研究證實(shí)。
[1]李士諤.DNA甲基化、基因表達(dá)與腫瘤[J].基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床,1996,16(5):321-337.
[2]李云青,張恩仲,肖翠英.乳腺癌患者BRCA1基因啟動(dòng)子去甲基化模式的初步研究[J].癌癥,2001,20(10):1057-1060.
[3]黃慶,郭穎,府偉靈.人類表觀基因組計(jì)劃[J].生命的化學(xué),2004,24(2):101-102.
[4]董玉瑋,侯進(jìn)惠,朱必才,等.表觀遺傳學(xué)的相關(guān)概念和研究進(jìn)展[J].生命的化學(xué),2005,22(1):1-3.
[5]黃瓊曉,金帆,黃荷鳳.DNA甲基化的研究方法學(xué)[J].國(guó)外醫(yī)學(xué):遺傳學(xué)分冊(cè),2004,27(6):354-358.
[6]管仁珍.DNA低甲基化與腫瘤的關(guān)系[J].國(guó)際內(nèi)科學(xué)雜志,2007,34(10):618-620.
[7]Hughes-Davies L,Huntsman D,Ruas M,et al.EMSY links the BRCA2 pathyway to sporadic breast and overian cancer[J].Cell,2003,115(5):523-535.
[8]任婕,魏敏杰,金鋒,等.散發(fā)性乳腺癌組織中BRCA1基因啟動(dòng)子甲基化與蛋白表達(dá)的相關(guān)性[J].中華腫瘤防治雜志,2007,14(3):161-164.