国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

不同破眠處理對陽光玫瑰葡萄冬芽萌發(fā)的影響

2024-06-15 08:47饒余倩黃亞倩夏龍騰楊國順王美軍劉昆玉許延帥
果樹學(xué)報 2024年5期
關(guān)鍵詞:轉(zhuǎn)錄組葡萄

饒余倩 黃亞倩 夏龍騰 楊國順 王美軍 劉昆玉 許延帥

DOI:10.13925/j.cnki.gsxb.20230456

摘??? 要:【目的】尋找陽光玫瑰葡萄理想安全的破眠方法以及探究其破眠機制?!痉椒ā恳躁柟饷倒迤咸讯繛樵嚥?,通過研究類休眠階段和生理休眠階段不同破眠處理對葡萄萌芽率、成花率和花穗質(zhì)量的影響,并通過轉(zhuǎn)錄組測序篩選可能影響葡萄冬芽萌發(fā)的關(guān)鍵基因?!窘Y(jié)果】在萌芽前1個月對陽光玫瑰葡萄冬芽進行單氰胺處理、石硫合劑+1-氨基環(huán)丙烷羧酸(ACC)處理,均能使萌芽提前,顯著提高萌芽率,不影響成花率及花穗質(zhì)量。通過分析轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),篩選了PYL4、PP2C24、PP2C8、PP2C37、PP2C25、SAPK2等差異表達基因,這些基因可能通過參與激素信號傳導(dǎo)、氧化應(yīng)激等途徑影響葡萄芽的萌發(fā)?!窘Y(jié)論】5 °Bé石硫合劑+0.25 mg·mL-1ACC是陽光玫瑰葡萄打破休眠的一種安全、有效的處理方法。

關(guān)鍵詞:葡萄;休眠;萌芽;轉(zhuǎn)錄組

中圖分類號:S663.1?????????? 文獻標(biāo)志碼:A??????????? 文章編號:1009-9980(2024)05-0897-14

收稿日期:2023-11-02??????? 接受日期:2024-02-17

基金項目:國家自然科學(xué)基金項目(32172519);湖南省自然科學(xué)區(qū)域聯(lián)合基金(2023JJ50063)

作者簡介:饒余倩,女,在讀碩士研究生,研究方向為果樹生理與栽培。E-mail:1248780906@qq.com

*通信作者 Author for correspondence. E-mail:yx56@hunau.edu.cn

果 樹 學(xué) 報 2024,41(5): 897-910

Journal of Fruit Science

Effects of different bud dormancy breaking treatments on winter bud germination in Shine Muscat grapevines

RAO Yuqian1, HUANG Yaqian1, XIA Longteng2, YANG Guoshun1, WANG Meijun1, LIU Kunyu1*, XU Yanshuai1*

(1College of Horticulture, Hunan Agricultural University/Hunan Engineering and Technology Research Center for Grapes, Changsha 410128, Hunan, China; 2Yongzhou Citrus Scientific Research Institute, Yongzhou 425045, Hunan, China)

Abstract: 【Objective】 This study aimed to find an ideal and effective bud dormancy break method for Shine Muscat grapevines and to explore the gene expression level of bud dormancy break by using H2CN2 and “l(fā)ime sulfur mixture+ACC”. 【Methods】 By using the winter buds on Shine Muscat grapevines as materials, we studied the effects of different bud dormancy breaking treatments in the endodormancy stage and paradormancy stage on germination rate, flowering rate and inflorescence quality, and examined the possible effects on grape winter buds through transcriptome sequencing, and the key genes that may affect grape winter bud germination were screened through transcriptome sequencing. 【Results】 The winter buds on the isolated canes of the Shine Muscat grape at the endodormancy stage were treated with cyanamide (T1) and “l(fā)ime sulfur mixture+ACC” (T2) at one month before germination stage. The results showed that with T1 treatment grapevines sprouted earliest, followed by T2 treatment, and finally was the control (CK). The overall germination speed of each treatment showed a trend of “first-slow-and-then-fast”. In terms of germination rate, the germination rate with T2 treatment was the highest at 85.80%, followed by T1 treatment and CK, with germination rates being 81.48% and 66.05%, respectively. And the germination rates after T1 treatment and T2 treatment were significantly higher than those of the CK. The growth and development dynamics of winter buds on isolated canes were observed, and it was found that the winter buds treated with T1 and T2 all grew 2 to 3 new leaves on March 21, 2022. T1 treatment sprouted the earliest, and T1 and T2 sprouted more neatly; In the Control group, 2 to 3 new leaves grew on April 2, 2022, and the growth was relatively slow and the sprouts were irregular. In August 2022, cyanamide treatment (H2CN2, T1) and “l(fā)ime sulfur mixture+ACC” treatment (T2) was carried out on the winter buds of Shine Muscat grapevines at the paradormancy stage, and the results showed that with T1 treatment, grapevines sprouted earliest, followed by the CK and T2 treatment. The germination speed with each treatment showed a trend of “first-slow-and-then-fast” as well. The germination rate of T2 treatment was the highest, which was 69.70%, followed by T1 treatment and CK group, with germination rates being 65.66% and 41.41%, respectively. The germination rate of T1 and T2 treatment was significantly higher than that of the CK group. In February 2023, by treating the winter buds of Shine Muscat grapevines at the endodormancy stage with cyanamide (T1) and “l(fā)ime sulfur mixture+ACC” (T2), the results showed that the T2 treatment had the highest germination rate of 97.22%, followed by T1 treatment and CK group, with the germination rates being 96.43% and 76.19%, respectively. From 25 days after treatment to the end of counts, the germination rate of T1 and T2 treatments showed significantly higher level than the CK. There was no significant difference in the inflorescence rate between T1 and T2 treatments, and CK. Simultaneously, the length of inflorescence was not influenced as well. The growth status of the canes was observed, and the results showed that, compared with the CK, the leaves grew fastest after the T1 treatment on April 3, 2023, followed by T2 treatment. On April 29, 2023, the leaf growth rate, leaf size, and internode length after T1 and T2 treatments had no significant impact compared with the CK. Six samples at the endodormancy stage (winter buds were collected at 24 h and 72 h after CK, T1 treatment and T2 treatment) and six samples at the paradormancy stage (CK, T1 treatment and T2 treatment were collected at 24 h and 72 h after winter bud) for transcriptome analysis, a total of 4399 differentially expressed genes were obtained by using |log2fold changes|≥1, FDR<0.01 as the filtering parameters, and 4399 significantly different genes (DEGs) can be divided into 8 clustering groups. Among all the DEGs, in W-CK-72 samples and W-HC-72 samples at the endodormancy stage, 10 genes were annotated as transcription factor coding genes, which were all related to bud germination. The transcription factors of them were up-regulated and 7 transcription factors were up-regulated. In addition, 10 genes were annotated as being involved in the biosynthesis or signal transduction processes of hormones such as auxin, gibberellins, abscisic acid and brassinosteroids. Five genes were related to the ABA signaling pathway, and among them, PYL4 and PP2C25 genes showed up-regulated expression, while PP2C24, PP2C8 and PP2C37 genes had down-regulated expression. The SAPK2 gene that related to the Snrk2 family was down regulated. The remaining differential genes screened were related to oxidative stress, glutathione S-transferase, etc. These candidate genes may affect grape bud germination by participating in hormone signaling, oxidative stress and other pathways. 【Conclusion】 The mixed solution of “l(fā)ime sulfur mixture+ACC” is a safe and effective agent for breaking the bud dormancy of Shine Muscat grapevines. Genes involved in hormone signaling and oxidative stress may respond to the dormancy release process.

Key words: Grape; Dormancy; Bud break; Transcriptome

葡萄(Vitis vinifera spp.)是多年生落葉藤本植物,栽培歷史悠久。中國是葡萄生產(chǎn)大國,2020年我國葡萄產(chǎn)量為1 431.4萬t,居世界前列[1]。休眠是落葉果樹的典型特征,是植物應(yīng)對外界環(huán)境變化和季節(jié)變化的一種生物適應(yīng)性,是植物生長發(fā)育過程中的一個周期性時期[2]。葡萄作為一種典型的落葉果樹,萌芽整齊度與產(chǎn)量密切相關(guān)[3]。南方地區(qū)是近年來發(fā)展最快的葡萄產(chǎn)區(qū)之一,但在南方地區(qū),由于樹形培養(yǎng)管理(1年生枝條的培養(yǎng))不當(dāng)和需冷量積累不足,導(dǎo)致萌芽不整齊,造成在后期冬季修剪和盛花期花果管理上更加費時費工等問題。目前,單氰胺雖廣泛應(yīng)用于打破葡萄休眠,但其本身具有很強的毒性,使用過程中需要戴口罩、手套等,操作不便。因此,尋找一種可以有效打破休眠且理想安全的破眠方法尤為重要。

多年生落葉植物芽休眠是一種十分復(fù)雜的過程,受到多個通路基因的綜合調(diào)控[4]。當(dāng)植物芽開始進入休眠階段時,可以抵御外界不良的環(huán)境條件,暫時停止生長,當(dāng)外界環(huán)境適宜時,植物可恢復(fù)正常生長,是一種對植物有利的生物學(xué)特征。1987年,Lang[2]等根據(jù)休眠的誘因把芽休眠分為內(nèi)休眠、類休眠和生態(tài)休眠三大類,并將休眠的整個過程分為五個階段:類休眠、類休眠-內(nèi)休眠、內(nèi)休眠、內(nèi)休眠-生態(tài)休眠和生態(tài)休眠。內(nèi)休眠(生理休眠,endodormancy)發(fā)生在冬季,是由植物內(nèi)部原發(fā)性反應(yīng)引起的生長停滯現(xiàn)象,這種原發(fā)性反應(yīng)由休眠組織內(nèi)部信號獨自誘導(dǎo)引發(fā)[5]。處于內(nèi)休眠階段的芽,即使在有利的環(huán)境條件下,且沒有附近器官的限制,也不能萌動,只有達到一定的低溫積累后才能解除休眠。類休眠(paradormancy)是由分生組織外的因子引起的植物生長暫?,F(xiàn)象,本質(zhì)上是一個器官對另一個器官的影響,如芽的頂端優(yōu)勢[6]。處于類休眠階段的芽,即使在環(huán)境條件有利時仍保持休眠,但若除去相鄰器官的限制,則休眠結(jié)構(gòu)會迅速恢復(fù)生長。生態(tài)休眠(ecodormancy)是指冬芽從生理休眠中釋放后,由于環(huán)境因子限制暫未萌發(fā),環(huán)境條件適宜時即可迅速恢復(fù)生長的現(xiàn)象[5]。

休眠和萌發(fā)是兩個連續(xù)的生物學(xué)過程,芽休眠是溫帶落葉果樹的一種適應(yīng)機制[5]。葡萄的內(nèi)休眠需要在經(jīng)歷一定的低溫積累后才能自然打破,這種特性稱為“需冷量”(chilling requirement),葡萄的需冷量一般需要0~7.2 ℃的低溫積累600~1000 h。為使落葉果樹能夠在低緯度地區(qū)正常生長發(fā)育,人們通常通過使用氰氨類、硝酸鹽類、植物生長調(diào)節(jié)劑(GA3、6-BA、TDZ等)、大蒜汁、乙烯、破眠劑1號等化學(xué)物質(zhì)來代替部分低溫的作用,提早打破休眠,使休眠芽提前萌發(fā)。

植物激素在芽休眠的形成與解除過程中發(fā)揮重要的調(diào)節(jié)作用,不同的植物激素以不同的作用方式來誘導(dǎo)和解除芽休眠。ABA對萌芽有顯著的抑制作用。在梨[7]、藍莓[8]等多年生落葉果樹中,外源ABA可以促進芽的休眠而抑制芽的萌發(fā)。在桃花芽的休眠過程中,ABA含量在生態(tài)休眠期逐漸降低并達到最低水平[9]。楊博等[10]研究表明,由PpyERF060、PpyABF3和PpyMADS71構(gòu)成的互作網(wǎng)絡(luò)可整合乙烯與脫落酸的信號通路進而調(diào)控梨芽休眠進程。玉米分蘗芽發(fā)生過程中,葉片與基部莖節(jié)中ABA含量較低且呈下降的趨勢,當(dāng)生長停止時,ABA含量上升[11]。在楊樹上,轉(zhuǎn)錄因子SVL可以通過促進CALS1(胼胝質(zhì)合酶基因)的表達,抑制赤霉素的合成,控制自然休眠[12]。在桃中,外施GA可以促進桃葉內(nèi)休眠的解除[13]。梨花芽可能通過下調(diào)miR159表達,提高GA含量,促進花芽冬季休眠解除[14]。乙烯對葡萄芽休眠解除起一定的促進作用。在葡萄的研究中發(fā)現(xiàn),外源乙烯處理使葡萄芽的萌發(fā)率顯著提高,而抑制乙烯合成和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)后,葡萄芽的萌發(fā)受到抑制,推測乙烯可以作為刺激信號,促進葡萄芽休眠提前解除[15]。Khalil-Ur-Rehman等[16]的研究結(jié)果表明,ABA、乙烯、赤霉素、生長素和細(xì)胞分裂素均參與了葡萄芽類休眠和內(nèi)休眠的調(diào)控。

筆者對處于兩種冬芽休眠階段(類休眠階段和內(nèi)休眠階段)的陽光玫瑰葡萄冬芽進行不同破眠處理,以未處理作為對照,進行單氰胺涂芽處理和石硫合劑+1-氨基環(huán)丙烷羧酸(ACC)涂芽處理。記錄和觀察處理后陽光玫瑰葡萄冬芽的生長發(fā)育動態(tài),并統(tǒng)計其萌芽率、成花率及花穗質(zhì)量?;赗NA-seq分析,篩選不同休眠階段陽光玫瑰葡萄冬芽破眠的相關(guān)基因,通過對差異表達基因進行KEGG代謝通路分析,探索不同休眠階段陽光玫瑰葡萄冬芽休眠解除的關(guān)鍵影響基因。

1 材料和方法

1.1 試驗材料

試驗于2022—2023年在湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)教學(xué)基地內(nèi)進行,供試品種為4年生陽光玫瑰葡萄。栽培方式為起高壟式根域限制栽培,噴灌方式為微噴。試驗所用試劑:石硫合劑(有效成分含量29%,山東東信生物農(nóng)藥有限公司);單氰胺(有效成分含量50%,寧夏大榮化工冶金有限公司);1-氨基環(huán)丙烷羧酸(ACC,純度98%,上海源葉生物科技有限公司)。

1.2 試驗方法

1.2.1 冬季(內(nèi)休眠階段)冬芽破眠處理與樣品采集 2022年1月16日,對陽光玫瑰基部留2芽修剪,收集基部起第3節(jié)位以上的枝條78根在室外進行埋沙貯藏。于2022年2月28日選取3~11節(jié)位(9個冬芽)的枝條在自然條件下進行涂芽處理(表1),每個處理26根枝條。分別在0 h、處理后24 h和72 h收集冬芽。樣品收集標(biāo)準(zhǔn):每個處理隨機取4根枝條,收集每根枝條全部的冬芽,并迅速放入液氮中速凍,隨后保存在-80 ℃超低溫冰箱備用。

2023年2月16日,在6年生“飛鳥”架活體陽光玫瑰葡萄樹上重復(fù)上述試驗,驗證結(jié)果。

1.2.2 夏季(類休眠階段)冬芽破眠處理與樣品采集 2022年8月13日,將平棚架“一”字形陽光玫瑰采收后的1年生主梢進行摘葉處理,將主梢進行第7節(jié)位短截后對其第5~7節(jié)位上的冬芽進行不同破眠劑處理(處理方法同表1),每個處理53根枝條。分別在0 h、處理后24 h和72 h收集冬芽。樣品收集標(biāo)準(zhǔn):每個處理隨機取10根枝條,每根枝條上取5~7節(jié)位上的3個芽,并迅速放入液氮中速凍,隨后保存在-80 ℃超低溫冰箱備用。

1.2.3 觀測指標(biāo)與方法 以花芽出現(xiàn)明顯膨大、鱗片松動、露綠較多作為萌發(fā)指標(biāo),進行冬芽萌芽率的統(tǒng)計?;ㄋ腴L度分級標(biāo)準(zhǔn):一級花穗長度≤3 cm;二級花穗長度為3~10 cm;三級花穗長度≥10 cm。

萌芽率/%=已萌動的冬芽數(shù)/調(diào)查的冬芽數(shù)×100。

成花率/%=有花穗新梢數(shù)/已萌動冬芽數(shù)×100。

1.2.4 RNA提取、文庫構(gòu)建和轉(zhuǎn)錄組測序 將2022年2月28日、3月1日、3月3日和8月13日、8月14日、8月16日收集的冬芽樣品(表2)的RNA提取以及轉(zhuǎn)錄組測序委托百邁客生物科技有限公司(北京)完成。使用Nanodrop2000(賽默飛,Nanodrop2000)對提取的RNA進行濃度檢測,并使用Agient2100,LabChip GX(廠家鉑,型號鉑金埃爾默LabChip GX)對完整性進行檢測。樣品檢測合格后,進行文庫構(gòu)建:用帶有Oligo(dT)的磁珠富集真核生物mRNA,加入Fragmentation Buffer將mRNA進行隨機打斷;以mRNA為模板,進行逆轉(zhuǎn)錄合成第一條cDNA鏈及其互補鏈,并經(jīng)過純化步驟去除;純化的雙鏈cDNA再進行末端修復(fù)、加A尾并連接測序接頭,然后用AMPure XP beads進行片段大小選擇;最后通過PCR富集得到cDNA文庫。經(jīng)庫檢合格后,使用Illumina NovaSeq6000測序平臺進行PE150模式測序。

1.2.5 差異表達基因的篩選和分析 首先對樣品中Mapped Reads的數(shù)目和轉(zhuǎn)錄本長度進行歸一化處理,根據(jù)FPKM值判定基因的相對表達量。不同樣本中表達水平存在顯著差異的基因稱之為差異表達基因(DEGs)。根據(jù)不同樣品之間表達水平的相對高低,差異表達基因可以分為上調(diào)基因(up-regulated gene)和下調(diào)基因(down-regulated gene)。使用edgeR軟件進行差異分析,將|log2Fold Change|≥1且FDR<0.01作為差異表達基因的篩選標(biāo)準(zhǔn)。使用百邁客分析平臺,導(dǎo)出基因在不同樣品中的功能注釋和相關(guān)代謝通路等信息,差異表達基因基于GO數(shù)據(jù)庫和KEGG數(shù)據(jù)庫進行功能注釋并按照生物學(xué)過程、細(xì)胞組分和分子功能對其富集分析,找出差異基因顯著富集的GO term和KEGG term。

1.2.6 數(shù)據(jù)分析 所有數(shù)據(jù)的采集和計算均設(shè)3個生物學(xué)重復(fù)。采用Excel整理數(shù)據(jù),采用GraphPad Prism8和R語言聚類程序作圖;采用SPSS26.0進行單因素ANOVA分析,多重比較采用LSD法。

2 結(jié)果與分析

2.1 不同破眠處理對不同休眠階段葡萄萌芽和開花的影響

不同破眠處理對不同休眠階段的陽光玫瑰葡萄芽的萌芽率、萌芽速度均會產(chǎn)生一定影響。內(nèi)休眠階段進行不同破眠處理后的葡萄離體枝條冬芽萌芽率結(jié)果(圖1-A)表明,T1處理萌芽最早,其次是T2處理,最后是CK,各處理萌芽整體速度呈先慢后快的趨勢。2022年4月10日,T1、T2處理后的萌芽率與CK相比開始出現(xiàn)顯著差異,其中T2處理的萌芽率最高。2022年4月15日,T1處理與T2處理的萌芽率分別為81.48%和85.80%,均顯著高于CK(66.05%)。類休眠階段進行不同破眠處理后的葡萄冬芽萌芽率結(jié)果(圖1-B)表明,T1處理萌芽最早,2022年9月3日,T1、T2處理后的萌芽率與CK相比開始出現(xiàn)顯著差異,其中T2處理的萌芽率最高。2022年9月9日,T1與T2處理的萌芽率分別為65.66%和69.70%,均顯著高于CK(41.41%)。內(nèi)休眠階段進行不同破眠處理后的葡萄冬芽萌芽率結(jié)果(圖1-C)表明,處理后25 d,T1、T2處理的萌芽率與CK相比開始出現(xiàn)顯著差異,2023年4月3日,T1與T2處理的萌芽率分別為96.43%和97.22%,均顯著高于CK(76.19%)。

破眠處理后離體枝條上葡萄芽的生長發(fā)育動態(tài)如圖2所示,T1、T2處理的葡萄芽提早解除休眠,均在2022年3月21日出現(xiàn)2~3枚新葉。T1處理在2022年3月15日已經(jīng)開始萌芽,萌芽開始時間最早,萌芽較為整齊;T2處理的葡萄芽在3月21日左右開始萌芽,萌芽較為整齊。CK的葡萄芽在2022年4月2日出現(xiàn)2~3枚新葉,生長相對緩慢,萌芽不整齊。

破眠處理后葡萄枝條生長狀態(tài)如圖3所示,與CK相比,2023年4月3日,T1處理后的葉片生長速度最快,其次是T2處理。2023年4月29日,T1、T2處理后的葉片生長速度、葉片大小、節(jié)間長度與CK相比無顯著差異。

為了解不同破眠處理對葡萄花穗的影響,筆者統(tǒng)計了不同破眠處理后所有1年生枝條的成花情況。如圖4所示,T1、T2處理對葡萄1年生枝條的成花率相比于CK沒有出現(xiàn)顯著差異,同時也不影響花序長度。

2.2 轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)質(zhì)量分析及序列比對

利用Illuminate平臺,完成14個樣本的轉(zhuǎn)錄組測序。為保證后續(xù)分析的準(zhǔn)確性,筆者通過對原始數(shù)據(jù)進行一系列嚴(yán)格的質(zhì)量控制后得到高質(zhì)量的Clean Data。經(jīng)過測序質(zhì)量控制后,共得到92.92 Gb Clean Data,各樣品Clean Data均達到5.89 Gb,Q30堿基百分比在94.21%以上,GC含量為45.72%~47.50%。以上結(jié)果表明測序質(zhì)量較好,可以用于后續(xù)的比對分析。通過使用HISAT2將Clean Reads與參考基因組進行比對后發(fā)現(xiàn),各樣本的Reads與指定的參考基因組的比對率在85.18%~90.91%(表3)。

2.3 差異表達基因的篩選

以|log2fold changes|≥1、FDR<0.01為標(biāo)準(zhǔn)篩選差異表達基因。通過差異表達基因韋恩圖(圖5)分析發(fā)現(xiàn),在內(nèi)休眠階段,6個處理中全部共有的差異基因為177個,W-CK-72-vs-W-ACC-72與W-CK-72-vs-W-HC-72有大量相同的差異基因,為3598個;W-CK-24-vs-W-ACC-24和W-CK-72-vs-W-ACC-72共有差異基因536個;W-CK-24-vs-W-HC-24和W-CK-72-vs-W-HC-72共有差異基因2678個;W-CK-24-vs-W-ACC-24和W-CK-24-vs-W-HC-24共有差異基因較少,僅554個。在類休眠階段,6個處理組中全部共有的差異基因為86個,S-CK-24-vs-S-HC-24和S-CK-72-vs-S-HC-72有大量相同的差異基因,為5796個;S-CK-72-vs-S-ACC-72和S-CK-72-vs-S-HC-72共有差異基因985個;S-CK-24-vs-S-ACC-24和S-CK-24-vs-S-HC-24共有差異基因724個;S-CK-24-vs-S-ACC-24和S-CK-72-vs-S-ACC-72共有差異基因較少,僅283個。

2.4 休眠期間差異表達基因模式變化

筆者研究了不同休眠階段不同破眠處理后葡萄芽在2個時期的基因表達模式,鑒定的不同時期樣本之間的DEGs數(shù)量如圖6所示。結(jié)果表明,在類休眠階段,T1處理后24 h有3662個基因顯著上調(diào),2935個基因顯著下調(diào);T1處理后72 h有4375個基因顯著上調(diào),3486個基因顯著下調(diào);T2處理后24 h有1636個基因顯著上調(diào),1301個基因顯著下調(diào);T2處理后72 h有1559個基因顯著上調(diào),1464個基因顯著下調(diào)。在內(nèi)休眠階段,T1處理后24 h有2780個基因顯著上調(diào),1842個基因顯著下調(diào);T1處理后72 h有3230個基因顯著上調(diào),2071個基因顯著下調(diào);T2處理后24 h有661個基因顯著上調(diào),1137個基因顯著下調(diào);T2處理后72 h有3279個基因顯著上調(diào),2218個基因顯著下調(diào)。

2.5 休眠期間差異基因的聚類分析

表達模式相似的基因通常具有相似的功能,為了解不同休眠階段不同破眠處理后不同時期芽的差異表達基因的表達模式,筆者利用R語言中的聚類程序?qū)?2組樣本的顯著差異基因進行等級聚類分析(圖7)。結(jié)果表明,4399個基因被分成8組,最多的一組(Class 8)包含了1161個DEGs,DEGs的表達模式呈現(xiàn)為在W-HC-24樣本、W-HC-72樣本上調(diào)表達,其他樣本基本下調(diào)表達,這些基因顯著富集在轉(zhuǎn)移酶活性,轉(zhuǎn)移氨基?;酝獾孽;?、生物合成進程、UPD-糖基轉(zhuǎn)移酶活性、苯丙氨酸解氨酶活性、解氨酶活性等途徑。

第二大組(Class 7)包含821個基因,DEGs的表達模式呈現(xiàn)為在S-HC-72樣本上調(diào)表達,其他樣本基本下調(diào)表達,這些基因主要富集在光系統(tǒng)Ⅱ、葉綠體類囊體膜、光合作用,光系統(tǒng)Ⅰ的捕光天線復(fù)合體、膜的錨固成分、絲氨酸型羧肽酶活性等途徑。

第三大組(Class 2)包含633個基因,DEGs的表達模式呈現(xiàn)為在S-CK-24樣本、S-CK-72樣本、S-ACC-24樣本、S-ACC-72樣本上調(diào)表達,其他樣本基本下調(diào)表達,這些基因主要富集在響應(yīng)熱休克、響應(yīng)過氧化氫、響應(yīng)活性氧、蛋白質(zhì)復(fù)合物寡聚化、蛋白質(zhì)自聚集等途徑。

第四大組(Class 4)包含480個基因,DEGs的表達模式呈現(xiàn)為在W-CK-24樣本、W-CK-72樣本、W-ACC-24樣本上調(diào)表達,其他樣本基本下調(diào)表達,這些基因主要富集在嘌呤核苷跨膜轉(zhuǎn)運蛋白活性、纖維素合酶(UDP?forming)活性、磷脂代謝過程、纖維素生物合成過程、轉(zhuǎn)氨酶活性等途徑。

在Class 6中,373個基因在S-HC-72樣本、W-ACC-72樣本中上調(diào)表達,其他樣本基本下調(diào)表達,這些基因主要富集在通過斷裂誘導(dǎo)復(fù)制進行DNA雙鏈斷裂修復(fù)、微小染色體維持蛋白復(fù)合物、DNA復(fù)制起點結(jié)合、單鏈DNA結(jié)合、序列特異性DNA結(jié)合等途徑。

在Class 3中,350個基因在S-CK-24樣本、S-CK-72樣本、S-ACC-24樣本、S-ACC-72樣本、W-CK-24樣本、W-CK-72樣本、W-ACC-24樣本上調(diào)表達,其他樣本基本下調(diào)表達,這些基因主要富集在序列特異性DNA結(jié)合、細(xì)胞氧化還原穩(wěn)態(tài)、脂質(zhì)轉(zhuǎn)運、抗氧化活性、氧化還原酶活性、作用于硫基供體等途徑。

在Class 5中,309個基因在S-HC-24樣本、S-HC-72樣本、W-ACC-72樣本、W-HC-72樣本上調(diào)表達,其余樣本基本下調(diào)表達,這些基因主要富集在呼吸鏈、分枝酸生物合成過程、鋅離子依賴的乙醇脫氫酶活性、S-羥甲基谷胱甘肽脫氫酶活性、甲醛分解代謝過程等途徑。

在Class 1中,272個基因在S-HC-24樣本中上調(diào)表達,其余樣本基本下調(diào)表達,這些基因主要富集在未折疊蛋白反應(yīng)、谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶活性、谷胱甘肽代謝過程、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)未折疊蛋白反應(yīng)、蛋白質(zhì)折疊等途徑。

2.6 與休眠相關(guān)的差異表達基因篩選

在使用不同破眠劑打破葡萄芽休眠的過程中會引起植物體內(nèi)一系列生理生化變化,同時會誘導(dǎo)破眠相關(guān)基因的表達。在內(nèi)休眠階段W-CK-72樣本與W-HC-72樣本相比的差異表達基因中(表4)有10個被注釋為轉(zhuǎn)錄因子編碼基因,其中上調(diào)的轉(zhuǎn)錄因子有3個,包括MYB4、ERF073、HSF A-4a;下調(diào)的轉(zhuǎn)錄因子有7個,包括ERF023-like、ERF011-like、TT2、MYB44、HSF C-1、Nuclear transcription factor Y、HSF30。另外,有10個被注釋為參與生長素(auxin,AUX)、赤霉素(gibberelli acid,GA)、脫落酸(abscisic acid,ABA)、油菜素甾醇(brassinosteroids,BR)等激素的生物合成或介導(dǎo)的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程。在ABA信號通路中,PYL4基因上調(diào)表達;4個與蛋白磷酸酶2C(PP2C)家族相關(guān)的基因被注釋,PP2C24、PP2C8、PP2C37均下調(diào)表達,PP2C25上調(diào)表達;與Snrk2家族相關(guān)的SAPK2基因下調(diào)表達。其他差異基因與氧化應(yīng)激、谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶等有關(guān)。

3 討 論

生長期和休眠期是葡萄生長發(fā)育過程中較為明顯的兩個時期。在內(nèi)休眠階段,通過對葡萄冬芽采取物理或化學(xué)等破眠措施可使冬芽提前萌發(fā)[6]。前人在不同品種葡萄上均已試驗證明單氰胺可以提前打破葡萄休眠[17],在我國南方地區(qū),萌芽前一個月對葡萄冬芽進行單氰胺處理破眠效果最佳,可明顯提高萌芽率,從而在一定程度上能夠提高葡萄產(chǎn)量。乙烯是五大植物激素之一,廣泛參與到植物生長發(fā)育的各個進程中。前人研究表明,植物器官本身能生成乙烯,并提出了乙烯具有促進植物成熟衰老的作用[18]。乙烯是氣體,在實際生產(chǎn)中主要使用乙烯利對香蕉[19]、菠蘿蜜[20]等進行催熟;浙江、上海地區(qū)常用乙烯利對葡萄進行催熟。ACC是乙烯合成的前體,在1-氨基環(huán)丙烷-1-羧酸氧化酶(ACC氧化酶,ACO)的氧化作用下生成乙烯[21]。因此,筆者推測ACC可能對芽的萌發(fā)有一定的促進作用。

Keilin等[22]在構(gòu)建單氰胺(HC)誘導(dǎo)表達的EST文庫后,利用比較基因組學(xué)發(fā)現(xiàn)氧化應(yīng)激、鈣信號傳導(dǎo)等生化過程中的功能基因可能參與休眠解除過程。Halaly等[23]研究表明,HC和熱擊(heaat shock,HS)兩種方式均可解除生理休眠,觸發(fā)細(xì)胞生化水平暫時性呼吸和氧化應(yīng)激,誘導(dǎo)CAT、ADH和PDC等相關(guān)基因瞬時上調(diào)表達,破眠處理還誘導(dǎo)抗壞血酸過氧化物酶、谷胱甘肽還原酶、硫氧還蛋白h、谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶和蔗糖合成酶編碼基因表達。單氰胺處理休眠芽后,通過釋放氰化物抑制有氧呼吸和過氧化氫酶活性,導(dǎo)致細(xì)胞缺氧的同時誘導(dǎo)過氧化氫產(chǎn)生,進而導(dǎo)致植物體內(nèi)活性氧含量升高[24]。Pacey-Miller等[25]報道了葡萄休眠芽中活性氧相關(guān)的Cu/Zn超氧化物歧化酶、谷胱甘肽過氧化物酶、谷胱甘肽硫轉(zhuǎn)移酶、谷胱甘肽還原酶和過氧化氫酶基因表達量升高。在本研究中,MYB、ERF、MADS-box等轉(zhuǎn)錄因子都與芽萌發(fā)有關(guān),這些轉(zhuǎn)錄因子通過共同調(diào)控多種途徑從而影響葡萄萌芽,其中一些與氧化應(yīng)激有關(guān),鈣信號傳導(dǎo)等基因也對葡萄活性氧代謝進行調(diào)控。

植物激素與芽休眠密切相關(guān),尤其是ABA和GA在調(diào)控芽休眠和萌發(fā)的過程中發(fā)揮著重要作用。Khalil-Ur-Rehman等[16]認(rèn)為ABA和GA信號通路作為開關(guān)調(diào)節(jié)葡萄芽休眠。ABA可以促進楊樹SVL基因的表達[12],而內(nèi)源ABA可通過激活PpyABF3調(diào)控梨PpyDAM3的轉(zhuǎn)錄,從而調(diào)控休眠進程[26]。在梨芽內(nèi)休眠解除后觀察到較低水平的NCEDs表達,PpyCYB8和Ppy707A3的表達上調(diào),同時ABA含量降低[26]。李可等[27]研究表明,外源ABA可抑制藍莓花芽萌芽。在本研究中,鑒定出與激素合成相關(guān)的基因,如GABA轉(zhuǎn)運蛋白1、生長素反應(yīng)蛋白、生長素抑制蛋白、脫落酸受體、BRI1激酶抑制劑1、蛋白磷酸酶、絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶等可能參與了植物激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)。

本試驗對不同休眠階段的陽光玫瑰葡萄冬芽進行破眠試驗,用萌芽率、成花率及花穗質(zhì)量作為衡量葡萄破眠效果優(yōu)劣的三個指標(biāo)。試驗結(jié)果表明,在類休眠階段和內(nèi)休眠階段,單氰胺處理、石硫合劑+ACC處理均對陽光玫瑰葡萄萌芽產(chǎn)生積極影響,石硫合劑+ACC處理后的萌芽率略高于單氰胺處理,兩種處理均能使陽光玫瑰葡萄冬芽萌發(fā)時間提前,顯著提升植株萌芽率,對后續(xù)成花率及花穗長度均無影響,且不會引起藥害。在本研究中,還有一些與環(huán)境響應(yīng)相關(guān)的差異基因,如熱擊蛋白(Heat shock protein,HSP)基因、光敏色素(phytochrome)基因、水孔蛋白(aquaporin,AQP)等水分代謝相關(guān)的基因、蔗糖合酶(sucrose synthase)等能量與物質(zhì)代謝相關(guān)的基因、細(xì)胞周期蛋白(cyclin,CYC)基因、細(xì)胞周期蛋白依賴激酶(cyclin-dependent protein kinase,CDK)等細(xì)胞發(fā)育相關(guān)的基因,可能也參與了葡萄芽休眠解除的調(diào)控。

4 結(jié) 論

5 °Bé石硫合劑+0.25 mg·mL-1ACC處理能提早打破葡萄休眠,且不影響后續(xù)成花率及花穗質(zhì)量,對操作人員較為安全。石硫合劑+ACC的混合溶液是陽光玫瑰葡萄打破休眠的一種安全、理想的藥劑。單氰胺處理、石硫合劑+ACC處理均誘導(dǎo)了PYL4、PP2C24、PP2C8、PP2C37、PP2C25、SAPK2等基因的表達,這些基因可能通過參與激素信號傳導(dǎo)、氧化應(yīng)激等反應(yīng)打破芽的休眠,促進萌芽。

參考文獻 References:

[1]?? 劉鳳之. 我國葡萄產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀與高質(zhì)量發(fā)展方向[J]. 農(nóng)業(yè)知識,2023(10):10-14.

LIU Fengzhi.Present situation and high-quality development direction of grape industry in China[J]. Agriculture Knowlege,2023(10):10-14.

[2]?? LANG G A. Dormancy:A new universal terminology[J]. HortScience,1987,22(5):817-820.

[3]?? 郭松濤,張亞紅,李琴,張曉麗,付玉芳,劉帥. 寧夏地區(qū)設(shè)施葡萄需冷量和需熱量研究[J]. 果樹學(xué)報,2020,37(7):997-1007.

GUO Songtao,ZHANG Yahong,LI Qin,ZHANG Xiaoli,F(xiàn)U Yufang,LIU Shuai. Chilling and heat requirements of grape cultivars under protected culture in Ningxia area[J]. Journal of Fruit Science,2020,37(7):997-1007.

[4]?? 董陽. 轉(zhuǎn)錄和蛋白質(zhì)組學(xué)聯(lián)合分析單氰胺(HC)打破葡萄芽休眠分子機制研究[D]. 南京:南京農(nóng)業(yè)大學(xué),2020.

DONG Yang. Combined transcription and proteomics analysis of molecular mechanism of hydrogen cyanamide (HC) breaking grape bud dormancy[D]. Nanjing:Nanjing Agricultural University,2020.

[5]?? 樊紹剛,吳勝,朱明濤,余俊,白描,楊國順. 葡萄冬芽生理休眠機理研究進展[J]. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報,2019,50(10):88-96.

FAN Shaogang,WU Sheng,ZHU Mingtao,YU Jun,BAI Miao,YANG Guoshun. Progress research on mechanism of grape bud dormancy[J]. Journal of Northeast Agricultural University,2019,50(10):88-96.

[6]?? LAMELA C S P,REZEMINI F,BACINO M F,MALGARIM M B,HERTER F G,DA SILVEIRA PASA M. Dormancy dynamics of ‘Tannat grapes in warm-winter climate conditions[J]. Agricultural and Forest Meteorology,2020,288/289:108016.

[7]?? 李建召. 脫落酸及相關(guān)激素調(diào)控梨芽休眠的分子機制研究[D]. 杭州:浙江大學(xué),2019.

LI Jianzhao. Studies on the molecular mechanism of ABA and related phytohormones-regulated pear bud dormancy[D]. Hangzhou:Zhejiang University,2019.

[8]?? 安爽,高玉迪,麥迪努爾·玉蘇普,潘益娜,邵婉,宗宇,陳文榮,楊莉,郭衛(wèi)東,李永強. 外源脫落酸抑制藍莓早花及相關(guān)基因表達特性研究[J]. 果樹學(xué)報,2021,38(3):325-334.

AN Shuang,GAO Yudi,Maidinuer·Yusupu,PAN Yina,SHAO Wan,ZONG Yu,CHEN Wenrong,YANG Li,GUO Weidong, LI Yonggiang. Research on application exogenous abscisic acid in inhibiting early flowering and associated genes expression characteristics in blueberry[J]. Journal of Fruit Science,2021,38(3):325-334.

[9]?? WANG Q J,XU G X,ZHAO X H,ZHANG Z J,WANG X X,LIU X,XIAO W,F(xiàn)U X L,CHEN X D,GAO D S,LI D M,LI L. Transcription factor TCP20 regulates peach bud endodormancy by inhibiting DAM5/DAM6 and interacting with ABF2[J]. Journal of Experimental Botany,2020,71(4):1585-1597.

[10] 楊博,魏佳,李坤峰,王程亮,倪雋蓓,滕元文,白松齡. PpyERF060-PpyABF3-PpyMADS71調(diào)控乙烯信號通路介導(dǎo)的梨芽休眠進程[J]. 園藝學(xué)報,2022,49(10):2249-2262.

YANG Bo,WEI Jia,LI Kunfeng,WANG Chengliang,NI Junbei,TENG Yuanwen,BAI Songling. PpyERF060-PpyABF3-PpyMADS71 regulates ethylene signaling pathway-mediated pear bud dormancy process[J]. Acta Horticulturae Sinica,2022,49(10):2249-2262.

[11] DONG Z B,XIAO Y G,GOVINDARAJULU R,F(xiàn)EIL R,SIDDOWAY M L,NIELSEN T,LUNN J E,HAWKINS J,WHIPPLE C,CHUCK G. The regulatory landscape of a core maize domestication module controlling bud dormancy and growth repression[J]. Nature Communications,2019,10:3810.

[12] SINGH R K,MAURYA J P,AZEEZ A,MISKOLCZI P,TYLEWICZ S,STOJKOVI? K,DELHOMME N,BUSOV V,BHALERAO R P. A genetic network mediating the control of bud break in hybrid aspen[J]. Nature Communications,2018,9:4173.

[13] LI S,WANG Q J,WEN B B,ZHANG R,JING X L,XIAO W,CHEN X D,TAN Q P,LI L. Endodormancy release can be modulated by the GA4-GID1c-DELLA2 module in peach leaf buds[J]. Frontiers in Plant Science,2021,12:713514.

[14] 劉瑾航,沈炳榮,李宜軒,梁沁,馮宇,林曉潔,沈茂芬,吳少華,李亮,李永裕. 砂梨miR159家族進化特性及在冬季休眠的表達模式分析[J]. 果樹學(xué)報,2022,39(11):2007-2018.

LIU Jinhang,SHEN Bingrong,LI Yixuan,LIANG Qin,F(xiàn)ENG Yu,LIN Xiaojie,SHEN Maofen,WU Shaohua,LI Liang,LI Yongyu. Molecular evolution of miR159 family and their expression profiling during dormancy of Pyrus pyrifolia in the winter[J]. Journal of Fruit Science,2022,39(11):2007-2018.

[15] 施招婉. 葡萄芽休眠解除過程中乙烯合成與信號途徑關(guān)鍵基因的篩選與功能分析[D]. 廣州:華南農(nóng)業(yè)大學(xué),2022.

SHI Zhaowan. Screening and functional analysis of key genes involved in ethylene biosynthesis and signaling pathways during grape bud dormancy release[D]. Guangzhou:South China Agricultural University,2022.

[16] KHALIL-UR-REHMAN M,DONG Y,F(xiàn)AHEEM M,ZENG J J,WANG W,TAO J M. Expression profiling of ABA and GA signaling cascades regulating bud dormancy in grape[J]. Scientia Horticulturae,2019,246:44-50.

[17] 譚一婷. 單氰胺對不同葡萄品種休眠解除生理特性及綜合品質(zhì)的影響[D]. 太谷:山西農(nóng)業(yè)大學(xué),2021.

TAN Yiting. Effects of cyanamide on physiological characteristics of dormancy release and comprehensive quality of different grape[D]. Taigu:Shanxi Agriculture University,2021.

[18] 黎家,李傳友. 新中國成立70年來植物激素研究進展[J]. 中國科學(xué):生命科學(xué),2019,49(10):1227-1281.

LI Jia,LI Chuanyou. Seventy-year major research progress in plant hormones by Chinese scholars[J]. Scientia Sinica (Vitae),2019,49(10):1227-1281.

[19] 李芬芳,李奕星,袁德保,洪克前,陳嬌. 不同乙烯利濃度及貯藏溫度對“南天黃” 香蕉果實后熟品質(zhì)的影響[J]. 中國南方果樹,2022,51(2):72-77.

LI Fenfang,LI Yixing,YUAN Debao,HONG Keqian,CHEN Jiao. Effects of different concentrations of ethrel and storage temperatures on post-ripening quality of ‘Nantianhuang banana[J]. South China Fruits,2022,51(2):72-77.

[20] 任雪巖,劉光財,李國鵬,葉春海,豐鋒,王俊寧. 乙烯利和1-MCP對菠蘿蜜果實中AheAAT和AheERF表達的影響[J]. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué),2019,52(21):3890-3902.

REN Xueyan,LIU Guangcai,LI Guopeng,YE Chunhai,F(xiàn)ENG Feng,WANG Junning. Effects of ethephon and 1-MCP on the expression of AheAAT gene and AheERF transcription factors in jackfruit fruit[J]. Scientia Agricultura Sinica,2019,52(21):3890-3902.

[21] YANG S F,HOFFMAN N E. Ethylene biosynthesis and its regulation in higher plants[J]. Annual Review of Plant Physiology,1984,35:155-189.

[22] KEILIN T,PANG X Q,VENKATESWARI J,HALALY T,CRANE O,KEREN A,OGRODOVITCH A,OPHIR R,VOLPIN H,GALBRAITH D,OR E. Digital expression profiling of a grape-bud EST collection leads to new insight into molecular events during grape-bud dormancy release[J]. Plant Science,2007,173(4):446-457.

[23] HALALY T,PANG X Q,BATIKOFF T,CRANE O,KEREN A,VENKATESWARI J,OGRODOVITCH A,SADKA A,LAVEE S,OR E. Similar mechanisms might be triggered by alternative external stimuli that induce dormancy release in grape buds[J]. Planta,2008,228(1):79-88.

[24] SUDAWAN B,CHANG C S,CHAO H F,KU M S B,YEN Y F. Hydrogen cyanamide breaks grapevine bud dormancy in the summer through transient activation of gene expression and accumulation of reactive oxygen and nitrogen species[J]. BMC Plant Biology,2016,16(1):202.

[25] PACEY-MILLER T,SCOTT K,ABLETT E,TINGEY S,CHING A,HENRY R. Genes associated with the end of dormancy in grapes[J]. Functional & Integrative Genomics,2003,3(4):144-152.

[26] YANG Q S,GAO Y H,WU X Y,MORIGUCHI T,BAI S L,TENG Y W. Bud endodormancy in deciduous fruit trees:Advances and prospects[J]. Horticulture Research,2021,8:139.

[27] 李可,申朦曉,潘煒浩,章詩渲,毛欣燁,尹亞紅,李永強,朱友銀,郭衛(wèi)東. 藍莓C2H2家族基因在花芽休眠解除中的作用初探[J]. 園藝學(xué)報,2023,50(4):737-753.

LI Ke,SHEN Mengxiao,PAN Weihao,ZHANG Shixuan,MAO Xinye,YIN Yahong,LI Yongqiang,ZHU Youyin,GUO Weidong. Preliminary investigation of C2H2 family genes in blueberry flower bud dormancy release[J]. Acta Horticulturae Sinica,2023,50(4):737-753.

猜你喜歡
轉(zhuǎn)錄組葡萄
葡萄冬季還能掛樹上
葡萄熟了
當(dāng)葡萄成熟時
葡萄
多穗柯轉(zhuǎn)錄組分析及黃酮類化合物合成相關(guān)基因的挖掘
基于轉(zhuǎn)錄組測序的山茱萸次生代謝生物合成相關(guān)基因的挖掘
金釵石斛轉(zhuǎn)錄組SSR位點信息分析
人參屬藥用植物轉(zhuǎn)錄組研究進展
大豆轉(zhuǎn)錄組測序研究進展綜述
山羊分子生物學(xué)研究進展駱美蓉