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AIF1 在急性髓系白血病中的表達(dá)及生物信息學(xué)分析

2024-04-24 12:41:24高婭婭李妙雨孫文瑞賈雙雙肖婉婷張春燕高廣勛
關(guān)鍵詞:通路數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)

高婭婭,李妙雨,孫文瑞,賈雙雙,田 彪,肖婉婷,張春燕,馮 娟,高廣勛

(1.陜西中醫(yī)藥大學(xué)第二臨床醫(yī)學(xué)院,陜西 咸陽(yáng) 712000;2.解放軍空軍軍醫(yī)大學(xué)西京醫(yī)院血液內(nèi)科,陜西 西安 710000)

急性髓系白血?。╝cute myeloid leukemia ,AML) 可由基因突變、染色體易位或分子水平的變化引起,是一種生存具有高度異質(zhì)性的疾病,預(yù)后不一。AML 是成年人中最常見(jiàn)的白血病,約占所有疾病的80%[1]。隨著診療技術(shù)的進(jìn)展,AML 患者的生存較前有所改善,但老年人群的預(yù)后仍然較差[2]。新的生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)可能有助于更好地理解AML 的分子基礎(chǔ),并在AML 的診斷、療效預(yù)測(cè)、預(yù)后判斷中發(fā)揮重要作用,甚至為未來(lái)的靶向藥物開(kāi)發(fā)和治療提供新的靶點(diǎn)。

同種異體移植炎癥因子-1(allograft inflammatory factor 1,AIF1)是一種 17 kDa 的鈣結(jié)合蛋白,由單核細(xì)胞、巨噬細(xì)胞和淋巴細(xì)胞產(chǎn)生,它的合成是由 INF-γ 誘導(dǎo)的[3]。AIF1 基因位于染色體 6p21.3上的主要組織相容性復(fù)合體 Ⅲ類(lèi)區(qū)域。既往在多種不同的疾病中觀察到 AIF1 表達(dá)增加,包括子宮內(nèi)膜異位癥,動(dòng)脈粥樣硬化,類(lèi)風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎和纖維化[4,5]。既往研究報(bào)道AIF1 在神經(jīng)系統(tǒng)退行性疾病和代謝紊亂(如代謝綜合征和糖尿病)中促進(jìn)疾病發(fā)生發(fā)展的作用[5,6],在糖尿病腎病中 AIF1 通過(guò)miR-34a/ATG4B 通路調(diào)節(jié)人腎小球內(nèi)皮細(xì)胞的炎癥、氧化應(yīng)激和自噬水平,通過(guò)體內(nèi)體外實(shí)驗(yàn)研究發(fā)現(xiàn) AIF1 表達(dá)升高時(shí),miR-34a、活性氧和炎癥因子水平明顯升高,而自噬相關(guān)蛋白下降,而 AIF1 基因下調(diào)效果相反[7]。也發(fā)現(xiàn) AIF1 參與多種不同的腫瘤疾病中,包括乳腺癌,肝細(xì)胞癌,非小細(xì)胞肺癌等。在乳腺癌中,AIF1 通過(guò)激活 NF-κB/細(xì)胞周期蛋白 D1 通路促進(jìn)乳腺癌增殖,促進(jìn)腫瘤生長(zhǎng)[8]。在肝細(xì)胞癌中 AIF1 表達(dá)升高與門(mén)靜脈腫瘤血栓形成顯著相關(guān),沉默 AIF1 表達(dá)可抑制肝細(xì)胞癌細(xì)胞增殖和遷移[9]。在結(jié)直腸癌中 AIF1 通過(guò)激活 p38 MAPK 信號(hào)通路抑制結(jié)直腸癌細(xì)胞增殖和遷移,誘導(dǎo)細(xì)胞發(fā)生凋亡從而發(fā)揮抗腫瘤作用[10]。在非小細(xì)胞肺癌中,AIF1 通過(guò)激活 p38 MAPK 和 JAK/STAT 信號(hào)通路來(lái)促進(jìn)非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞系的增殖、遷移、IL-6 分泌和 VEGF 分泌[11]。非小細(xì)胞肺癌中高 AIF1 表達(dá)還與轉(zhuǎn)移、較高的 TNM 分期和較差的生存率有關(guān)。在血液腫瘤中,課題組通過(guò)GEO 骨髓瘤數(shù)據(jù)集分析發(fā)現(xiàn)AIF1 在多發(fā)性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)中低表達(dá),且與MM 進(jìn)展、治療反應(yīng)、ISS 分期及無(wú)進(jìn)展生存期呈負(fù)相關(guān)。體外細(xì)胞水平驗(yàn)證了過(guò)表達(dá)AIF1 后增加了骨髓瘤H929、U266 細(xì)胞的凋亡比例,降低了自噬水平,初步機(jī)制探索認(rèn)為AIF1 可能是通過(guò) PI3K/AKT 通路影響 MM 細(xì)胞自噬和凋亡,綜上表明 AIF1 可能在MM 發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮著重要的作用。

本研究旨在通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘分析確定AIF1 的表達(dá)量與AML 預(yù)后之間的關(guān)系:首先,獲得癌癥基因組圖譜(TCGA)和基因型-組織表達(dá)(GTEx)的初治AML 樣本RNA-seq 數(shù)據(jù),分析核心基因AIF1的差異表達(dá)[12]。其次,通過(guò)GO、KEGG 對(duì)AIF1 進(jìn)行功能富集和通路富集分析,選擇與AIF1 相關(guān)的顯著改變的基因和通路。最后, 應(yīng)用GEO 數(shù)據(jù)庫(kù)的生存數(shù)據(jù)集進(jìn)行Kaplan-Meier 生存曲線繪制、采用Cox 回歸和諾莫圖預(yù)測(cè)模型,分析AIF1 在AML中的臨床意義。

1 材料與方法

1.1 RNA-seq 數(shù)據(jù)和生物信息學(xué)分析

通過(guò)UCSC Xena (https://xenabrowser.net/datapages/)網(wǎng)站獲得癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫(kù)和基因型-組織表達(dá)(GTEx)數(shù)據(jù)庫(kù)的33 種腫瘤類(lèi)型和正常組織的RNA-seq 數(shù)據(jù)及相關(guān)臨床數(shù)據(jù)[13]。從TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)(https://portal.gdc.cancer.gov/repository) 獲 取 初 治 AML 樣 本 的HTSeq-FPKM 和HTSeq-Count 數(shù)據(jù)進(jìn)一步分析。本研究實(shí)施的所有程序均符合《赫爾辛基宣言》(2013 年修訂)。

1.2 人類(lèi)蛋白質(zhì)圖譜(HPA)數(shù)據(jù)庫(kù)分析

HPA(https://www.proteinatlas.org/)數(shù)據(jù)庫(kù)包含蛋白組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)以及系統(tǒng)生物學(xué)數(shù)據(jù),可以繪制組織、細(xì)胞、器官等圖譜,不僅收錄了腫瘤組織以及正常組織的蛋白表達(dá)情況,還可以繪制腫瘤患者的生存曲線[14]。本研究以“AIF1”為關(guān)鍵詞分析了AIF1 在各種細(xì)胞系如白血病細(xì)胞系、肺細(xì)胞系、乳腺細(xì)胞系和腦細(xì)胞系中的表達(dá)。

1.3 差異表達(dá)基因(DEGs)分析

使用R 軟件中的“l(fā)imma”包對(duì)合并后的數(shù)據(jù)集進(jìn)行差異基因分析,以P<0.05(P:校正P)與|log2FC|>1.5 為過(guò)濾條件篩選DEGs。通過(guò)分析不同AIF1 表達(dá)組之間的差異表達(dá)基因(低表達(dá)組:0%~50%; 高表達(dá)組:50%~100%),利用pheatmap 包繪制熱圖,并標(biāo)注上調(diào)與下調(diào)最顯著的前10個(gè)DEGs。

1.4 富集分析

運(yùn)用R 軟件中“clusterProfiler”包,以P<0.05為過(guò)濾條件,對(duì)DEGs 進(jìn)行基因本體 (gene ontology,GO)、京都基因和基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)和疾病本體(disease on-tology,DO)富集分析。

1.5 蛋白質(zhì)互作(PPI)網(wǎng)絡(luò)

利用Metascape (https://metascape.org/gp/index.htm)進(jìn)行通路和過(guò)程富集分析。使用STRING數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)DEGs 的PPI 網(wǎng)絡(luò)。用Cytoscape(版本3.9.0)繪制PPI 網(wǎng)絡(luò),并使用MCODE(版本1.6.1)識(shí)別PPI 網(wǎng)絡(luò)中最重要的模塊。根據(jù)PPI 的中心節(jié)點(diǎn)及聚類(lèi)情況,篩選在顯著性富集結(jié)果中出現(xiàn)的基因?yàn)殛P(guān)鍵基因[15]。

1.6 預(yù)后模型生成和預(yù)測(cè)

使用RMSR 軟件(版本6.2.0)生成諾莫圖,繪制諾莫圖預(yù)測(cè)概率和觀測(cè)率。并通過(guò)1 000 個(gè)自舉樣本的校準(zhǔn)曲線來(lái)驗(yàn)證預(yù)測(cè)模型的準(zhǔn)確性,當(dāng)曲線與45°對(duì)角線吻合時(shí),預(yù)測(cè)概率與實(shí)際結(jié)果頻率一致性較好。P<0.05 為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

1.7 分離收集CD34+細(xì)胞

收集西京醫(yī)院血液科20 例初診AML 患者的骨髓標(biāo)本,10 例健康受試者的骨髓標(biāo)本。健康受試者均接受病毒感染和骨髓異常的篩查,這些受試者沒(méi)有使用過(guò)免疫調(diào)節(jié)藥物,也沒(méi)有已知的影響免疫系統(tǒng)的疾病。采用密度梯度離心法分離骨髓單個(gè)核細(xì)胞,CD34+磁珠分選CD34+細(xì)胞。冷凍CD34+細(xì)胞用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。

1.8 免疫印跡

根據(jù)上述方法收集患者骨髓樣本,并收集單個(gè)核細(xì)胞裂解物。使用RIPA 緩沖液低溫下提取蛋白樣品,并在4 ℃離心30 min 去除不溶物。電泳分離蛋白質(zhì)后,PVDF 膜進(jìn)行蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移,室溫下牛奶封閉 1 h。在 4 ℃ 冰箱中與AIF1 一抗孵育過(guò)夜。次日用TBST 洗滌 PVDF 膜,并在室溫下與二抗孵育1 h。TBST 去除過(guò)量的抗體后使用發(fā)光試劑盒進(jìn)行曝光。選擇 GAPDH 作為內(nèi)參,通過(guò) Image Lab分析蛋白表達(dá)量。

1.9 qRT-PCR

用TRIzol 法提取單個(gè)核細(xì)胞的總RNA。根據(jù)mRNA qPCR RT Master Mix 試劑盒合成cDNA,使用SYBR?Green Realtime PCR Master Mix 進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR。以GAPDH 作為內(nèi)參。AIF1的特異性引物如下:正向,5′-ACGTTCAGCTACCCTGACTTTCT-3′;反向,5′-CCTGTTGGCTTTTCCTTTTCTCT-3′。GAPDH 的特異性引物如下:正向,5′-GGAGCGAGATCCCTCCAAAAT-3′;反向,5′- GGCTGTTGTCATACT TCTCATGG -3′。

1.10 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

所有的統(tǒng)計(jì)分析都基于R 軟件(版本:3.6.3)或者SPSS(版本:23.0)。

2 結(jié)果

2.1 AIF1 在泛癌和AML 中的表達(dá)

從 UCSC XENA (https://xenabrowser.net/datapages/)下載TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)中腫瘤和GTEx 數(shù)據(jù)庫(kù)中正常人的RNA-seq 數(shù)據(jù)。通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)化分析,本研究發(fā)現(xiàn)AIF1 在25 種腫瘤中存在顯著表達(dá)差異(圖1A),在初治AML 患者樣本中表達(dá)高于正常組織(圖1B)。隨后,根據(jù)HPA 數(shù)據(jù)庫(kù)中RNA-Seq 數(shù)據(jù)分析AIF1 在初治AML 中的相對(duì)表達(dá)水平,可發(fā)現(xiàn)AIF1 mRNA 在AML 細(xì)胞系如HMC-1、NB-4、HEL、THP-1 和U937 中的表達(dá)高于淋巴細(xì)胞系。同時(shí),AIF1 mRNA 在其他如腦、胰腺、肺等的細(xì)胞系中幾乎不表達(dá)(圖1C)。

圖1 AIF1 在泛癌和AML 中的表達(dá)Fig 1 The expression of AIF1 in AML compared with normal samples

2.2 AIF1 高表達(dá)和低表達(dá)的AML 樣本的DEGs鑒定

分析高、低表達(dá)組間基因表達(dá)譜mRNA 中位表達(dá)量的差異,鑒定出具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(|logFC| >1.5,P<0.05) 的DEGs 共1 275 個(gè),其中有444 個(gè)上調(diào)基因和831 個(gè)下調(diào)基因(圖2A)。AIF1 高表達(dá)組差異最顯著的前5 個(gè)DEGs 和低表達(dá)組差異最顯著的前5 個(gè)DEGs(圖2B)。

圖2 AIF1 高表達(dá)和低表達(dá)的AML 樣本的DEGs 鑒定Fig 2 Identification of DEGs in AML samples with high and low expression of AIF1

2.3 DEGs 功能富集分析

為探索AML 中AIF1 高表達(dá)和低表達(dá)之間的DEGs 的功能意義,本研究使用cluster profile 包進(jìn)行GO 分析和KEGG 通路富集分析(補(bǔ)充表1,圖3)。GO 分析結(jié)果顯示DEGs 與生物過(guò)程(BP)相關(guān)的功能包括白細(xì)胞遷移、細(xì)胞外結(jié)構(gòu)組織和細(xì)胞外基質(zhì)組織;與細(xì)胞成分(CC)相關(guān)的包括含膠原的細(xì)胞外基質(zhì)、神經(jīng)元胞體和質(zhì)膜外側(cè)面;與分子功能(MF)相關(guān)的包括受體配體活性、細(xì)胞外基質(zhì)結(jié)構(gòu)成分、貨物受體活性。KEGG 分析發(fā)現(xiàn)DEGs 功能涉及神經(jīng)活性配體-受體相互作用、細(xì)胞因子-細(xì)胞因子受體相互作用和金黃色葡萄球菌感染。

表1 TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)AML 樣本中AIF1 表達(dá)與臨床病理特征之間的關(guān)系[n(%)]Tab 1 Association between AIF1 expression and clinicopathologic features in AML samples from the TCGA database[n(%)]

圖3 TCGA-LAML 患者AIF1 高表達(dá)和低表達(dá)DEGs 的GO/KEGG 富集分析Fig 3 GO/KEGG enrichment analysis of DEGs between high and low AIF1 expression in TCGA-LAML patients

圖4 富集圖來(lái)自基因集富集分析(GSEA)Fig 4 Enrichment plots from the gene set enrichment analysis (GSEA)

在AIF1 高表達(dá)和低表達(dá)的數(shù)據(jù)集之間進(jìn)行GSEA 分析,以識(shí)別參與AML 的關(guān)鍵信號(hào)通路。在這些通路的數(shù)據(jù)庫(kù)MSigDB 中觀察到顯著的差異 (FDR<0.25, 校正P<0.05)(補(bǔ)充表2 和圖4)。在AIF1 高表達(dá)組中,AML 中的基因突變或融合基因如CBFB-MYH11 融合、NPM1 突變和MLL 融合顯著富集(校正P<0.05,F(xiàn)DR<0.05)(圖4A~4C)。相反,在AIF1 低表達(dá)組中,AML 中預(yù)后較好的因子如PML-RARA 融合基因和AML1-ETO 融合基因表現(xiàn)出顯著富集(圖4D~4F)。AIF1 涉及NFκB、P53 和MAPK 通路參與AML 及其他腫瘤的發(fā)生(圖4G~4I)。

表2 logistic 回歸分析AML 臨床病理因素與AIF1 表達(dá)的關(guān)系Tab 2 The relationship between the clinicopathological factors of AML and AIF1 expression by using logistic analysis

2.4 AML 的PPI 富集分析

通過(guò)STRING 構(gòu)建AIF1 及其相關(guān)基因的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),共篩選出1 275 個(gè)DEGs(| logFC | >1.5,P<0.05)并導(dǎo)入PPI 網(wǎng)絡(luò)。利用Cytoscape-MCODE顯示PPI 網(wǎng)絡(luò)。最顯著的模塊MCODE 得分為20.267,包含31 個(gè)節(jié)點(diǎn)和608 條邊(圖5)。

圖5 AIF1 相關(guān)DEGs 的PPI 網(wǎng)絡(luò)Fig 5 The PPI network of AIF1-related DEGs

2.5 AIF1 表達(dá)與AML 臨床特征的關(guān)系

表1 是TCGA 中AML 患者的主要臨床特征。共納入151 例患者,其中男性83 例,女性68 例,平均年齡65.5 歲。其中,AIF1 在75 例(49.7%)AML 患者中低表達(dá),其余76 例(49.3%)患者中高表達(dá)。相關(guān)性分析提示AIF1 高表達(dá)與細(xì)胞遺傳學(xué)風(fēng)險(xiǎn)、FAB 分型、NPM1 突變、白細(xì)胞(WBC)計(jì)數(shù)(×109/L)顯著正相關(guān)(P<0.001)。此外,AIF1 表達(dá)與總生存期(overall survival , OS)顯著相關(guān)(P=0.009),高表達(dá)患者生存期則較短。

采用Logistic 回歸分析進(jìn)一步驗(yàn)證AML 患者臨床病理因素與AIF1 表達(dá)的關(guān)系。結(jié)果顯示AIF1高表達(dá)與高WBC 計(jì)數(shù)(×109/L) (OR=4.264;P<0.001)、高細(xì)胞遺傳學(xué)風(fēng)險(xiǎn)(OR=7.322;P<0.001)和NPM1 高突變(OR=6.245;P<0.001)呈顯著正相關(guān)(表2)。ROC 曲線分析AIF1 在AML中的潛在診斷價(jià)值,AUC 值為0.985,提示AIF1 可能是診斷AML 的潛在生物標(biāo)志物(圖6A)。采用Wilcoxon 秩和檢驗(yàn)比較AIF1 在不同臨床病理特征患者中的表達(dá)情況。結(jié)果顯示,在RAS 突變陽(yáng)性、WBC 計(jì)數(shù)>20×109/L、非M3 型、細(xì)胞遺傳學(xué)風(fēng)險(xiǎn)為中/差和NPM1 突變陽(yáng)性的患者中AIF1 顯著高表達(dá)(圖6B~6F),這些臨床病理特征多數(shù)與不良預(yù)后相關(guān)。

圖6 AIF1 表達(dá)與臨床特征之間的關(guān)系Fig 6 Association between AIF1 expression and clinical features

2.6 AIF1 高表達(dá)對(duì)不同臨床病理狀態(tài)AML 患者預(yù)后的影響

采用Kaplan-Meier 法分析AIF1 表達(dá)與AML患者預(yù)后的關(guān)系。如圖7A 所示,AIF1 高表達(dá)患者的預(yù)后明顯差于AIF1 低表達(dá)患者(OR=1.86(1.22-2.86);P=0.004)。Kaplan-Meier 分析顯示,在年齡≤60 歲(P=0.035)、年齡> 60 歲(P=0.041)、WBC 計(jì)數(shù)(≤20×109/L)(P< 0.001)、骨髓原始細(xì)胞 ≥ 20% (P= 0.04)、外周血原始細(xì)胞≤70% (P= 0.034)、IDH1 R132 突變陰性(P=0.007) 、R140 突變陰性(P= 0.034) 、R172 突變陰性(P=0.014)的亞組中,AIF1 高表達(dá)與不良預(yù)后相關(guān)(圖7B~7I)。

圖7 AIF1 高表達(dá)與AML 患者較差的OS 相關(guān)Fig 7 High expression of AIF1 was associated with poor OS in AML patients

使用單因素Cox 回歸來(lái)評(píng)估OS 的預(yù)后影響因素,發(fā)現(xiàn)AIF1 高表達(dá)(P=0.004)、細(xì)胞遺傳學(xué)風(fēng)險(xiǎn)為差/中等(P<0.001)、年齡>60 歲(P<0.001)均為OS 的預(yù)后不良因素(表3)。進(jìn)一步行多因素Cox 回歸分析,僅AIF1 高表達(dá)(P=0.019)和年齡> 60 歲(P<0.001)具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,表明二者為OS 的獨(dú)立預(yù)后不良因素。

表3 單因素和多因素Cox 回歸分析影響AML 患者OS 的因素Tab 3 Univariate and multivariate Cox’s regression analysis of factors associated with OS in AML

2.7 AIF1 在AML 中的預(yù)后模型

為了更好地預(yù)測(cè)AML 患者的預(yù)后,基于Cox回歸分析,使用RMS R 包構(gòu)建諾莫圖 (圖8A)。年齡、細(xì)胞遺傳學(xué)風(fēng)險(xiǎn)和AIF1 表達(dá)等3 個(gè)預(yù)后因素被納入到預(yù)測(cè)模型中。同時(shí),利用校準(zhǔn)圖評(píng)價(jià)預(yù)后模型的預(yù)測(cè)精度。構(gòu)建帶有校準(zhǔn)曲線的預(yù)后諾莫圖,預(yù)測(cè)個(gè)體1、3、5 年的OS (圖8B~D)。

圖8 AIF1 在AML 中的預(yù)后預(yù)測(cè)模型Fig 8 A prognostic predictive model of AIF1 in AML

2.8 數(shù)據(jù)驗(yàn)證

基于GEPIA 數(shù)據(jù)庫(kù)分析,本研究發(fā)現(xiàn)與正常組相比,AIF1 mRNA 表達(dá)在AML 患者中顯著增加(P< 0.01,|Log2FC| > 1)(圖9A)。進(jìn)一步收集AML患者和健康受試者的骨髓樣本,分離CD34+細(xì)胞,用于qPCR 和Western blot (圖9B、C),顯示AIF1 在AML 中的表達(dá)水平升高。

圖9 數(shù)據(jù)驗(yàn)證Fig 9 Data validation

3 討論

AIF1 是一種17 kDa 的胞質(zhì)鈣結(jié)合炎癥反應(yīng)支架蛋白,主要在免疫細(xì)胞中表達(dá)[16]。參與各種炎癥性疾病,如類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎、結(jié)腸炎、自身免疫性疾病的發(fā)生發(fā)展[17,18]。有研究表明,AIF1 通過(guò)激活NF-κB/cyclinD1 通路促進(jìn)乳腺癌增殖,通過(guò)p38 MAPK 信號(hào)通路上調(diào)TNF-α 促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞遷移。在胃癌中,AIF1 調(diào)節(jié)β-catenin 可作為保護(hù)性預(yù)后指標(biāo)[19]。然而,目前對(duì)AIF1 在AML 中的表達(dá)和預(yù)后價(jià)值知之甚少。

本研究的核心結(jié)果是AIF1 在AML 中高表達(dá),并與高細(xì)胞遺傳學(xué)風(fēng)險(xiǎn)和不良預(yù)后相關(guān)。GSEA 基因富集分析結(jié)果提示,AIF1 低表達(dá)與NPM1 突變、PML-RARa 融合、AML-ETO 融合相關(guān),是良好的預(yù)后因素。相反,AIF1 高表達(dá)與NFκB、P53 和MAPK 通路相關(guān),表明AIF1 是一個(gè)潛在的預(yù)后生物標(biāo)志物[5],而且與AML 的致癌通路相關(guān),可能成為一個(gè)有前景的治療靶點(diǎn)。更重要的是,本研究發(fā)現(xiàn)在NPM1 突變的AML 中,AIF1 高表達(dá)預(yù)示預(yù)后不良。NPM1 突變發(fā)生于約30%的初診AML,這是迄今為止在AML 中,發(fā)現(xiàn)的最常見(jiàn)的基因異常之一。一般認(rèn)為孤立的NPM1 突變對(duì)AML 有積極的預(yù)后作用[20,21]。但約30%~60%的NPM1 突變的AML 患者在5 年內(nèi)復(fù)發(fā),或許與AIF1 表達(dá)異質(zhì)性相關(guān),具體機(jī)制尚不明確有待進(jìn)一步研究。此外,NFκB、p53 和MAPK 通路也被發(fā)現(xiàn)與AIF1 的高表達(dá)密切相關(guān)[22]。NF-κB 在AML 中持續(xù)激活,使白血病細(xì)胞逃避程序性細(xì)胞死亡機(jī)制,從而增加細(xì)胞增殖[22,23]。本研究發(fā)現(xiàn)AIF1 高表達(dá)與這些通路相關(guān),可能導(dǎo)致其不良預(yù)后。

另外,值得注意的是AIF1 高表達(dá)與低生存率相關(guān)。多因素Cox 回歸分析顯示AIF1 高表達(dá)是除年齡(>60 歲)外的另一個(gè)獨(dú)立不良預(yù)后因素。諾莫圖預(yù)測(cè)模型的建立進(jìn)一步證實(shí)了AIF1 表達(dá)對(duì)預(yù)后的預(yù)測(cè)作用。因此,AIF1 可能是AML 患者新的不良預(yù)后因素。將AIF1、細(xì)胞遺傳學(xué)風(fēng)險(xiǎn)和年齡相結(jié)合,構(gòu)建諾莫圖模型,獲得更準(zhǔn)確的預(yù)后預(yù)測(cè)模型。校準(zhǔn)圖顯示AIF1 相關(guān)諾莫圖的預(yù)測(cè)值與1 年、3 年、5 年OS 概率的實(shí)際觀測(cè)值一致性較好。據(jù)報(bào)道,高齡(>60 歲)、高細(xì)胞遺傳學(xué)風(fēng)險(xiǎn)、高WBC 計(jì)數(shù)(>20×109/L)、FLT3 突變陽(yáng)性和NPM1 突變陰性是AML 不良預(yù)后的預(yù)測(cè)因素[24]。通過(guò)Cox 回歸分析和諾莫圖模型,發(fā)現(xiàn)AIF1 的預(yù)測(cè)能力可能優(yōu)于細(xì)胞遺傳學(xué)風(fēng)險(xiǎn)、高WBC 計(jì)數(shù)、FLT3 突變狀態(tài)。從這個(gè)角度來(lái)看,本研究模型可能為個(gè)體AML 患者提供個(gè)性化評(píng)分。

綜上所述,本研究首次揭示了AIF1 在AML 中高表達(dá),不僅是AML 預(yù)后不良的潛在生物標(biāo)志物,且可能通過(guò)調(diào)節(jié)免疫細(xì)胞的腫瘤侵襲在 AIF1 微環(huán)境中發(fā)揮重要作用,提示AIF1 可作為調(diào)節(jié)抗腫瘤免疫應(yīng)答的治療靶點(diǎn)。本研究也有一定局限性。首先,由于回溯性特征,研究可能導(dǎo)致選擇偏差,未來(lái)可進(jìn)行前瞻性研究以驗(yàn)證生物標(biāo)志物在AML 個(gè)性化管理中的臨床應(yīng)用。其次,未進(jìn)一步證實(shí)AIF1在腫瘤中作用的相關(guān)通路。再次AIF1 治療腫瘤免疫的基礎(chǔ)機(jī)制和免疫特征的預(yù)后價(jià)值應(yīng)進(jìn)一步研究。

作者貢獻(xiàn)度說(shuō)明:

高婭婭:數(shù)據(jù)分析及文章寫(xiě)作;李妙雨,孫文瑞,賈雙雙, 田彪, 肖婉婷,張春燕,馮娟:給予修改意見(jiàn);高廣勛:指導(dǎo)研究設(shè)計(jì)及文章寫(xiě)作并提供項(xiàng)目基金支持。

所有作者聲明不存在利益沖突關(guān)系。

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