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青花菜轉(zhuǎn)錄因子基因BoiWRKY8及其與抗病性的關(guān)系

2024-04-17 01:01:18何佳薇方宇潔尹龍飛張慧娟
核農(nóng)學(xué)報 2024年4期
關(guān)鍵詞:盤菌青花菜抗病

蔣 明 何佳薇 方宇潔 尹龍飛 張慧娟

(臺州學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院,浙江 椒江 318000)

青花菜(Brassicaoleraceavar.italica)又名西蘭花、木立花椰菜和綠菜花等,為十字花科(Cruciferae)蕓薹屬一、二年生蔬菜,以花球和花莖為主要食用部位,富含維生素A、維生素C、維生素K、蘿卜硫苷(sulforaphane glucosinolate)、抗氧化物質(zhì)和膳食纖維等,是一種深受消費者喜愛的保健蔬菜[1-4]。青花菜原產(chǎn)地中海中部地區(qū),目前很多國家都有栽培,我國已成為世界最大的青花菜種植國和出口國之一,年栽培面積超過8.6 萬公頃,年產(chǎn)量約400 萬噸,年出口量約13 萬噸[5-6]。菌核病和灰霉病是青花菜的兩種重要病害,分別由核盤菌(Sclerotiniasclerotiorum)和灰霉菌(Botrytiscinerea)引起,它們危害葉片、莖和花球,導(dǎo)致青花菜產(chǎn)量和品質(zhì)下降,每年造成的經(jīng)濟(jì)損失十分巨大[7-8]。青花菜引入我國的時間較短,雖然引進(jìn)或育成的品種數(shù)量眾多,但主栽品種之間的親緣關(guān)系較近,遺傳多樣性程度較低,優(yōu)質(zhì)種質(zhì)資源十分匱乏[6];青花菜抗病材料更為稀缺,通過挖掘抗病相關(guān)基因開展分子育種,是解決這一問題的重要手段。

轉(zhuǎn)錄因子在調(diào)控基因表達(dá)方面起著重要作用,其不僅參與細(xì)胞分化、生長、發(fā)育等生物學(xué)過程,還參與生物脅迫和非生物脅迫響應(yīng)[9-12]。AP2/EREBP、MYB、WRKY、NAC、bHLH 和bZIP 等是植物的重要轉(zhuǎn)錄因子,能夠參與多種脅迫反應(yīng),明確上述轉(zhuǎn)錄因子的生物學(xué)功能,可為后續(xù)的抗逆分子育種提供優(yōu)良的靶標(biāo)基因[13-14]。WRKY 轉(zhuǎn)錄因子廣泛參與干旱、鹽堿、重金屬、蟲害等逆境響應(yīng),近年來有不少研究和報道[15-16]。WRKY 在抗病反應(yīng)中的研究也有相關(guān)報道,擬南芥(Arabidopsisthaliana)AtWRKY33的過量表達(dá),可顯著增強(qiáng)植株對灰霉菌和甘藍(lán)鏈格孢菌(Alternariabrassicicola)的抗性[17]。將來自葡萄(Vitisvinifera)的VvWRKY1基因轉(zhuǎn)入煙草(Nicotianatabacum),轉(zhuǎn)基因植株對煙草霜霉菌(Peronosporatabacina)和二孢白粉菌(Erysiphe cichoracearum)的抗性增加[18]。小麥(Triticumaestivum)TaWRKY62的表達(dá)受條銹菌(Pucciniastriiformisf.sp.tritici)的誘導(dǎo),該基因的過量表達(dá)增強(qiáng)了對條銹病的抗病能力[19]。目前,有關(guān)WRKY 在青花菜抗病反應(yīng)中的研究較少,因此本研究在克隆BoiWRKY8基因的基礎(chǔ)上,開展序列分析和表達(dá)分析,以期初步明確該基因在菌核病和灰霉病抗病反應(yīng)中的功能,為后續(xù)開展抗病機(jī)理研究和分子育種奠定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 試驗材料

青花菜純合材料Bo0113 由臺州學(xué)院分子生物學(xué)創(chuàng)新實驗室構(gòu)建,栽植于人工氣候箱,培養(yǎng)條件為16 h光照/8 h黑暗。核盤菌菌株HP-22和灰霉菌菌株HM-18 均采自臨海青花菜基地,經(jīng)分離、純化、鑒定后備用。大腸桿菌(Escherichiacoli)DH5α 菌株和根癌農(nóng)桿菌(Agrobacteriumtumefaciens)菌株LBA4404 均由實驗室保藏。病原菌的接種在三葉一心期進(jìn)行,分別于0、12、24、48 和72 h 時收集葉片,用液氮速凍后置于-80 ℃的超低溫冰箱中保存。

1.2 試驗方法

1.2.1 DNA與RNA的提取、cDNA 的合成 葉片用液氮冷凍,再用研棒磨成粉末,DNA 的提取采用十六烷基三甲基溴化銨(cetyltriethylammnonium bromide,CTAB)法。分別以對照及病原菌處理的葉片為材料,經(jīng)液氮冷凍后研成粉末,RNA 提取采用TRIzol 法,操作在超凈工作臺上進(jìn)行;cDNA 的合成采用cDNA 合成試劑盒(TaKaRa,日本),根據(jù)其提供的說明書進(jìn)行。

1.2.2 基因的克隆 根據(jù)NCBI 數(shù)據(jù)庫(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/)野甘藍(lán)(B.oleraceavar.oleracea)(登錄號:XP_013596685.1)WRKY8基因序列設(shè)計引物,上游/下游引物分別引入SmaI 和BamH I 酶切位點,引物序列分別為5′-CATCCCGGGATGTCTAATG AAACCAAAGATCTT-3′和5′-TACGGATCCTCAAGGT TCTTGCTTGAGGA-3′。以葉片DNA 和cDNA 為模板進(jìn)行聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)擴(kuò)增,反應(yīng)體系共20 μL:2 μL 10×緩沖液,20 μmol·L-1引物各0.35 μL,基因組DNA 或cDNA 30 ng,10 mmol·L-1dNTPs 0.4 μL,2 U·μL-1TaqDNA 聚合酶1.2 U,加ddH2O 至終體積。反應(yīng)程序為:94 ℃ 預(yù)變性5 min;94 ℃變性30 s,56 ℃ 退火45 s,72 ℃ 延伸2.5 min,33個循環(huán);72 ℃終延伸10 min。PCR 產(chǎn)物經(jīng)回收、純化,與T-easy 載體(Promega,美國)連接,反應(yīng)參考說明書進(jìn)行。陽性克隆經(jīng)PCR 檢測后測序,PCR 反應(yīng)體系、程序與基因克隆相同,模板改為菌液。

1.2.3 序列分析 BoiWRKY8 的同源序列下載自NCBI,分別為野甘藍(lán)、蕪菁(B.rapa)(XP_009101520.1)、甘藍(lán)型油菜(B.napus)(XP_013698158.1)、蘿卜(Raphanussativus)(XP_018456683.1)、鹽芥(Eutrema salsugineum)(ESQ39783.1)、擬南芥(Arabidopsisthaliana)(OAO90538.1)、琴葉擬南芥(A.lyratasubsp.lyrata)(EFH39665.1)、亞麻薺(Camelinasativa)(XP_010441593.1)、薺菜(Capsellarubella)(EOA13673.1)和高山南芥(Arabisalpina)(KFK31474.1)。利用在線工具ProtParam(http://web.expasy.org/protparam/)預(yù)測分子量和等電點;SMART在線工具(http://smart.emblheidelberg.de)用于預(yù)測編碼蛋白的結(jié)構(gòu)域;Clustal X 1.81 軟件用于BoiWRKY8 及同源蛋白序列的多重比對;采用Mega 3.1 構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,建樹方法為鄰接法(Neighbor-Joining),自舉檢測值為1 000。

1.2.4 表達(dá)分析 實時熒光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)在LightCycler?96 熒光定量PCR 儀(Roche,瑞士)上進(jìn)行,引物序列根據(jù)測序結(jié)果設(shè)計,上下游引物分別為5′-CATCGTATGATCATTACA ACAGCATCAAC-3′和5′-GACACGAGTGTAGATCAGAA CCG-3′;內(nèi)標(biāo)為肌動蛋白基因,引物分別為5′-ACGTG GACATCAGGAAGGAC-3′和5′-GAACCACCGATCCAG ACACT-3′。反應(yīng)體系為20 μL:Master Mix 10 μL,20 μmol·L-1上下游引物各0.2 μL,cDNA 4 μL,ddH2O 5.6 μL。反應(yīng)程序為:95 ℃ 預(yù)變性10 min;95 ℃ 變性15 s,55 ℃ 退火15 s,72 ℃ 延伸30 s,40 個循環(huán)。所有試驗重復(fù)3 次,相對表達(dá)量的計算采用2-△△Ct方法[20]。

1.2.5 遺傳轉(zhuǎn)化 PCR 產(chǎn)物、pBI121 載體用SmaI 和BamH I 雙酶切,經(jīng)純化后用T4連接酶連接,經(jīng)測序驗證后獲得重組載體pBI121-BoiWRKY8。利用熱激法將pBI121-BoiWRKY8轉(zhuǎn)入根癌農(nóng)桿菌(Agrobacterium tumefaciens),菌株為LBA4404,遺傳轉(zhuǎn)化植株的創(chuàng)制采用Jiang等[21]的方法。篩選至T3代,其中的WK02-07-24和WK22-21-04用于后續(xù)試驗。轉(zhuǎn)基因植株的驗證采用PCR法,以重組質(zhì)粒、對照植株、2個株系的DNA為模板,引物分別為5′-CTCCTCGGATTCCATTGCCCAG-3′和5′-TACGGCGACTGGTCGGGATC-3′,程序和體系同1.2.2。標(biāo)志基因的表達(dá)采用qRT-PCR 法,PR1引物為5′-AAAGCTACGCCGACCGACTACGAG-3′和5′-CC AGAAAAGTCGGCGCTACTCCA-3′,而PDF1.2引物為5′-TCCATCATCACCCTTCTCTTCGC-3′和5′-CCATGTT GTGCTCCTTCAAGTCG-3′,程序與反應(yīng)體系同1.2.4。

1.2.6 抗病性鑒定及統(tǒng)計分析 核盤菌和灰霉菌接種于馬鈴薯葡萄糖瓊脂(potato dextrose agar,PDA)培養(yǎng)基,培養(yǎng)溫度為(22±2) ℃。待菌絲長至培養(yǎng)基邊緣時,用打孔器切割菌餅,把長有菌絲的一側(cè)貼于葉片背面,培養(yǎng)3 d 時測量病斑直徑,試驗重復(fù)3 次。數(shù)據(jù)處理采用DPS 9.01 軟件,多重比對利用鄧肯氏新復(fù)極差測驗法。

2 結(jié)果與分析

2.1 BoiWRKY8的序列特征

分別以基因組DNA 和cDNA 為模板,擴(kuò)增到各自的全長序列。測序結(jié)果表明,BoiWRKY8的基因組全長為3 170 bp,具2個內(nèi)含子,長度分別為776和1 422 bp,內(nèi)含子遵循GU-AG 規(guī)則,3 個外顯子的長度分別為455、144 和373 bp(圖1)。BoiWRKY8的編碼區(qū)全長為972 bp,編碼323個氨基酸,蛋白質(zhì)的分子量為36 kDa,等電點為6.70。蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果表明,在+179 和+238 之間含1 個長度為60 個氨基酸的WRKY結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)域具1 個WRKYGQK 和1 個C2H2鋅指結(jié)構(gòu),C2H2可用通式C-X4-C-X23-H-X1-H 表示,其中的X指任何氨基酸(圖2)。

圖1 BoiWRKY8的基因結(jié)構(gòu)Fig.1 Gene structure of BoiWRKY8

圖2 BoiWRKY8的編碼區(qū)及推導(dǎo)的氨基酸序列Fig.2 Complete coding sequence of BoiWRKY8 and its deduced amino acids

2.2 序列比對和系統(tǒng)發(fā)育分析

利用Clustal X 1.81 對BoiWRKY8 及10 條十字花科同源蛋白序列進(jìn)行多重比對,結(jié)果表明,BoiWRKY8與野甘藍(lán)的同源序列最為相似,僅有2 個氨基酸殘基的差異,分別位于+279 和+283 位;與高山南芥的相似性最低,為81%。11 條蛋白序列的WRKY 結(jié)構(gòu)域十分保守,除高山南芥外,其余10 個結(jié)構(gòu)域的序列完全一致,高山南芥與其他WRKY 結(jié)構(gòu)域之間存在1 個氨基酸殘基的差異(圖3)。

圖3 BoiWRKY8及同源序列的多重比對Fig.3 Multiple alignments of BoiWRKY8 and its homologous sequences

利用鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果如圖4 所示。11條WRKY序列在系統(tǒng)發(fā)育樹上可分為5組,用Ⅰ~Ⅴ表示。4種蕓薹屬植物聚于組I,支持率為100%,該組分為2個亞組,BoiWRKY8與野甘藍(lán)聚于一個亞組,蕪菁與甘藍(lán)型油菜聚于另一個亞組,支持率分別為94%和99%。蘿卜、鹽芥和高山南芥各自單獨成組,即組Ⅱ、Ⅲ和Ⅴ,亞麻薺、薺菜、擬南芥和琴葉南芥聚于組Ⅳ,支持率達(dá)99%(圖4)。

圖4 基于鄰接法構(gòu)建的BoiWRKY8及同源序列的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.4 The phylogenetic tree of BoiWRKY8 and its homologous sequences using Neighbor-Joining method

2.3 BoiWRKY8的表達(dá)

利用qRT-PCR檢測BoiWRKY8在核盤菌和灰霉菌侵染下的表達(dá),結(jié)果表明,該基因的表達(dá)受這兩種病原真菌的誘導(dǎo),表達(dá)量隨侵染時間呈先上升后下降的趨勢(圖5)。在核盤菌誘導(dǎo)下,BoiWRKY8的表達(dá)量在6和12 h 時達(dá)到最大值,分別為對照的3.18 和3.22 倍,之后逐漸下降,48 和72 h 時仍顯著高于對照,表達(dá)量分別為對照的1.49 和1.35 倍。在灰霉菌誘導(dǎo)下的表達(dá)量變化與核盤菌相似,BoiWRKY8的表達(dá)量在6 和12 h 達(dá)到最大值,分別為對照的2.68 和2.90 倍,之后逐漸下降,48 h 時的表達(dá)量為對照的1.46 倍,差異達(dá)顯著標(biāo)準(zhǔn),但72 h時的表達(dá)量與對照沒有顯著差異。

圖5 BoiWRKY8在核盤菌和灰霉菌侵染下的表達(dá)Fig.5 Expression of BoiWRKY8 in response to Sclerotinia sclerotiorum and Botrytis cinerea

2.4 遺傳轉(zhuǎn)化結(jié)果

以T3 株系WK02-07-24 和WK22-21-04 為試驗材料,利用PCR進(jìn)行檢測,結(jié)果均為陽性植株(圖6-A)。利用qRT-PCR檢測BoiWRKY8的表達(dá)量,結(jié)果顯示,在35S啟動子的驅(qū)動下,該基因的表達(dá)量在兩個過表達(dá)轉(zhuǎn)基因株系中顯著提高,分別為對照的8.77和13.84倍(圖6-B)。

圖6 PCR檢測及BoiWRKY8在過量表達(dá)株系中的表達(dá)Fig.6 PCR detection and expression analysis of BoiWRKY8 over-expressing lines

2.5 抗病性鑒定

對照植株、過量表達(dá)株系WK02-07-24 和WK22-21-04 接種病原菌后,均出現(xiàn)病斑,但大小存在一定的差異(圖7-A、B)。在核盤菌侵染下,對照病斑的平均直徑為2.03 cm,而兩個過量表達(dá)株系的病斑大小分別為1.50和1.10 cm,均顯著小于對照(圖7-C);在灰霉菌侵染下,對照植株的病斑直徑為2.20 cm,而兩個過量表達(dá)株系的病斑大小分別為1.60和1.37 cm,均顯著小于對照(圖7-D)。抗病性鑒定結(jié)果表明,BoiWRKY8的過量表達(dá)可顯著增加青花菜對核盤菌和灰霉菌的抗性。

圖7 BoiWRKY8過量表達(dá)對抗病性的影響Fig.7 BoiWRKY8 overexpression on resistance to diseases

利用qRT-PCR 檢測水楊酸(salicylic acid,SA)途徑標(biāo)志基因PR1和茉莉酸/乙烯(jasmonic acid/ethylene,JA/ET)途徑標(biāo)志基因PDF1.2的表達(dá),結(jié)果表明,PR1基因表達(dá)量在對照和兩個過量表達(dá)株系間沒有顯著差異,但PDF1.2的表達(dá)量在3 個株系間存在顯著差異(圖8)。在核盤菌侵染下,PDF1.2在WK02-07-24 和WK22-21-04 的表達(dá)量顯著提高,分別為對照的2.30和3.59 倍;在灰霉菌誘導(dǎo)下,WK02-07-24 和WK22-21-04 的表達(dá)量分別為對照的2.11 與2.96 倍,均達(dá)到顯著水平。

圖8 病程相關(guān)蛋白基因的表達(dá)Fig.8 Expression of pathogenesis-related protein genes

3 討論

WRKY 轉(zhuǎn)錄因子參與植物生長和發(fā)育,涉及種子萌發(fā)、形態(tài)發(fā)生、根系生長、開花時間等的調(diào)控,此外,該類轉(zhuǎn)錄因子在生物脅迫和非生物脅迫方面有諸多報道[16-17,22]。WRKY 因蛋白質(zhì)的N 端含保守的WRKYGQK序列而得名,以家族形式存在,在擬南芥和水稻中分別有72 和100 個成員[23]。根據(jù)WRKY 結(jié)構(gòu)域的數(shù)量及N 端鋅指結(jié)構(gòu)的類型,WRKY 可分為三大類,第一類含2 個WRKY 結(jié)構(gòu)域,鋅指結(jié)構(gòu)類型為C2H2,第二類和第三類均只含1 個WRKY 結(jié)構(gòu)域,鋅指結(jié)構(gòu)分別為C2H2和C2HC[23-24]。本研究以青花菜為材料,克隆到BoiWRKY8基因,推導(dǎo)的氨基酸序列含1 個WRKY 結(jié)構(gòu)域,其N 端的鋅指結(jié)構(gòu)為C2H2,因此BoiWRKY8 屬于第二類。WRKY 結(jié)構(gòu)域通常十分保守,該結(jié)構(gòu)域可特異識別啟動子區(qū)域的TTGACC/T 序列并與之結(jié)合,從而精確調(diào)控基因的表達(dá)[25]。本研究中,BoiWRKY8 與9 條同源序列的WRKY 結(jié)構(gòu)域完全一致,而與高山南芥僅存在一個氨基酸殘基的差異,結(jié)構(gòu)域的保守性與功能穩(wěn)定性密切相關(guān),以確保WRKY結(jié)構(gòu)域與特定的DNA 序列結(jié)合,從而實現(xiàn)特定的調(diào)控功能。WRKY 轉(zhuǎn)錄因子參與多種脅迫,在擬南芥中,49 個WRKY成員受丁香假單胞桿菌(Pseudomonas syringae)或水楊酸的誘導(dǎo)[26]。雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii)的12 個WRKY基因受鹽脅迫的誘導(dǎo),同時,這些基因的表達(dá)量在大麗輪枝菌(Verticilliumdahliae)的侵染下顯著提高[27]。陸地棉(G.hirsutum)GhWRKY15的表達(dá)受棉刺盤孢菌(Colletotrichumgossypii)、棉花枯萎病菌(Fusariumoxysporumf.sp.vasinfectum)和立枯絲核菌(Rhizoctoniasolani)的誘導(dǎo)[28]。本研究中,BoiWRKY8的表達(dá)受核盤菌和灰霉菌的誘導(dǎo),表達(dá)量呈現(xiàn)先上升后下降的趨勢,且兩種病原菌誘導(dǎo)下的表達(dá)模式相似,推測該基因在抗病反應(yīng)中起著一定的作用。

WRKY轉(zhuǎn)錄因子基因在植物抗病反應(yīng)中起著重要作用,利用病毒誘導(dǎo)的基因沉默(virus-induced gene silencing,VIGS)抑制芍藥(Paeonialactiflora)PlWRKY65基因的表達(dá),結(jié)果表明,葉片對極細(xì)鏈格孢(Alternaria tenuissima)的感病性增加[29]。陸地棉GhWRKY15的過量表達(dá),顯著增強(qiáng)了煙草對煙草花葉病毒(tobacco mosaic virus,TMV)、黃瓜花葉病毒(cucumber mosaic virus,CMV)、棉刺盤孢菌和寄生疫霉(Phytophthora parasitica)的抵抗能力[28]。水稻OsWRKY4和OsWRKY80受立枯絲核菌的快速誘導(dǎo),在水稻中過量表達(dá),能顯著增強(qiáng)其對該病原真菌的抗性[30]。本研究中,BoiWRKY8在青花菜中的過量表達(dá),可顯著提高核盤菌和灰霉菌的抵御能力。在抗病反應(yīng)中,激素物質(zhì)JA、SA和ET起著十分重要的作用,SA 信號途徑通常與活體寄生的病原菌抗性相關(guān),而JA、ET 途徑則參與死體寄生病原菌的響應(yīng)[31-33]。PR1和PDF1.2分別為SA 途徑與JA/ET信號途徑的關(guān)鍵基因,可作為兩個抗病途徑的標(biāo)志基因[30]。GhWRKY15在煙草中過量表達(dá),顯著增強(qiáng)了標(biāo)志基因PR1的表達(dá)[28];擬南芥WRKY33的突變導(dǎo)致植株對灰霉菌和甘藍(lán)鏈格孢菌這兩種死體營養(yǎng)型真菌的抗性減弱,同時標(biāo)志基因PDF1.2的表達(dá)量顯著降低[17]。將小麥(Triticumaestivum)TaWRKY142基因?qū)霐M南芥,其對希金斯炭疽菌(C.higginsianum)的抗性增加,同時,標(biāo)志基因AtPDF1.2的表達(dá)量顯著提高[34]。核盤菌和灰霉菌均為死體營養(yǎng)型,本研究中,BoiWRKY8的過量表達(dá)對兩種病原真菌的抗性顯著增強(qiáng),PR1的表達(dá)量與對照沒有顯著差異,而PDF1.2的表達(dá)量顯著提高。JA/ET 標(biāo)志基因PDF1.2編碼一種抗菌肽,被廣泛認(rèn)為是植物對抗病原菌的重要防御因子之一,BoiWRKY8的過量表達(dá)引起B(yǎng)oiPDF1.2表達(dá)量的顯著提高,使植物產(chǎn)生更多的抗菌肽,從而有效抑制核盤菌和灰霉菌的生長和侵染。

4 結(jié)論

本研究以青花菜為材料,在克隆BoiWRKY8基因的基礎(chǔ)上,明確了基因的序列特點和表達(dá)特征,并初步明確了該基因在抗病反應(yīng)中的功能。BoiWRKY8的編碼區(qū)全長為972 bp,編碼323 個氨基酸,WRKY 結(jié)構(gòu)域具一個WRKYGQK 序列和一個C2H2鋅指結(jié)構(gòu),與來自蕓薹屬植物的同源序列聚為一組。BoiWRKY8的表達(dá)受核盤菌和灰霉菌的誘導(dǎo),該基因的過量表達(dá)植株對核盤菌、灰霉菌的抗性顯著增強(qiáng),JA/ET 通路標(biāo)志基因BoPDF1.2的表達(dá)量顯著提高。

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