王一新,張真研,曹鳳陽,李 陽,徐瑞雪,謝之景,崔言順,李建亮*
(1.山東農業(yè)大學動物科技學院,山東 泰安 271018;2.中國動物衛(wèi)生與流行病學中心,山東 青島)
不育α 基序和組氨酸/天冬氨酸蛋白(Sterile alpha motif and histidine/aspartic acid domaincontaining protein 1,SAMHD1)于2000 年被首次發(fā)現,該蛋白主要存在于免疫細胞,如單核細胞和樹突狀細胞中[1]。SAMHD1 蛋白由無菌α 基序(SAM)結構域和組氨酸-天冬氨酸(HD)結構域構成,前者負責蛋白質-蛋白質和蛋白質-核酸相互作用,后者則具有蛋白磷酸水解酶和核酸酶活性[2]。SAMHD1 蛋白從原核生物到真核生物均保守存在,該蛋白廣泛參與了細胞周期調控、細胞穩(wěn)態(tài)維持、DNA 損傷應答、免疫反應調節(jié)等過程,具有多種生物學功能[3]。
近年來的研究表明,作為一種重要的先天免疫限制因子,SAMHD1 還可以抑制反轉錄病毒的增殖、降低抗病毒免疫反應和炎癥反應[4-5]。SAMHD1 能夠調控細胞內的dNTP 含量,從而抑制包括人類免疫缺陷病毒(HⅠⅤ)在內的多種逆轉錄病毒的感染[1],如貓免疫缺陷病毒(FⅠⅤ)、小鼠白血病病毒(MuLⅤ)、馬傳染性貧血病毒(EⅠAⅤ)和牛免疫缺陷病毒(BⅠⅤ)等[6]。此外,SAMHD1 也可以抑制某些DNA 病毒在宿主細胞中的復制,如單純皰疹病毒1 型(HSⅤ-1)和痘病毒[7]。
SAMHD1 蛋白具有種屬特異性,豬源及馬屬動物源SAMHD1 已被證實具有抗病毒活性[8-9]。雞源SAMHD1(chSAMHD1)基因位于雞基因組第20 號染色體,編碼614 個氨基酸,與人SAMHD1 蛋白同源性僅有60%左右,其生物學功能尚不清楚。本試驗首先將chSAMHD1 的HD結構域克隆至pET32a(+)載體,構建原核表達質粒,并在BL2(DE3)大腸桿菌中誘導表達;隨后將重組蛋白免疫SPF 級6 周齡BALB/c 小鼠制備抗chSAMHD1 多克隆抗體,并對所制備的多克隆抗體的反應性進行鑒定,從而為chSAMHD1 生物學功能的深入研究奠定基礎。
1.1.1 主要試劑 質粒小量提取試劑盒、瓊脂糖凝膠純化試劑盒購自廣州飛揚生物工程有限公司;常規(guī)限制性內切酶EcoR Ⅰ、Xho Ⅰ、T4 DNA連接酶、PrimeScript? One Step RT-PCR 試劑盒購自寶生物工程(大連)有限公司;DH5α 和BL21(DE3)感受態(tài)細胞購自北京擎科生物科技有限公司;辣根過氧化物酶(HRP)及FⅠTC 熒光素標記的山羊抗鼠ⅠgG 購自北京全式金生物技術有限公司;鎳預裝柱購自金斯瑞生物科技有限公司;弗氏完全佐劑、弗氏不完全佐劑購自Sigma 公司。
1.1.2 實驗動物 SPF 級BALB/c 小鼠購自濟南朋悅實驗動物繁育有限公司;原核表達載體pET-32a(+)和雞胚成纖維細胞系DF-1 由本實驗室保存。
1.2.1 chSAMHD1 基因擴增及重組質粒構建 根據chSAMHD1 基因序列(GenBank 登錄號:NM_001030845.2)設計引物,擴增chSAMHD1基因HD 結構域(開放閱讀框第301-1 845 nt)序列。上游引物chSAMHD1-F: 5′-GAATTCATGCA GACAGCAGACATCATGA-3′,下游引物 chSA MHD1-R: 5′- GTCGACTTACTTATTGAAAGAG AGCT-3′,在上、下游引物的5′端分別引入EcoRⅠ和Sal Ⅰ 酶切位點。提取雞淋巴細胞RNA,通過RT-PCR 擴增chSAMHD1 基因序列。反應體系為:PrimeScript One Step Enzyme Mix 2 μL,2×Buffer 25 μL,上下游引物(10 μM)各1 μL,RNA 4 μL,RNase-Free dH2O 17 μL。反應程序為:50 ℃ 反轉錄30 min,94 ℃ 2 min;94 ℃變性30 s,55 ℃ 退火30 s,72 ℃ 延伸1 min,進行30 個循環(huán);72 ℃ 延伸10 min,4 ℃ 保存。通過瓊脂糖凝膠電泳鑒定擴增產物,并用回收試劑盒進行切膠純化。
1.2.2 pET-chSAMHD1 原核表達質粒的構建 使用限制性內切酶EcoR Ⅰ和Sal Ⅰ分別酶切pET-32a(+)載體和chSAMHD1 擴增片段,并用膠回收試劑盒純化相應的酶切產物。使用T4 DNA 連接酶連接后轉化至DH5α 大腸桿菌,挑取單克隆進行菌液PCR 鑒定,將陽性菌液送北京擎科生物科技有限公司進行測序。驗證正確的提取質粒(命名為pET-chSAMHD1),置于-20 ℃ 保存、備用。
1.2.3 chSAMHD1 重組蛋白的誘導表達及純化將pET-chSAMHD1 轉化至BL21(DE3)大腸桿菌,挑取單克隆菌落接種于5 mL LB 培養(yǎng)基中培養(yǎng)過夜。第二天取出其中 1 mL 菌液轉接于200 mL LB 培養(yǎng)基,于37 ℃,200 r/min 培養(yǎng)至OD600 約為0.6 時,加入ⅠPTG 誘導表達(終濃度為0.1 mmol/L),32 ℃ 繼續(xù)培養(yǎng)6 h。隨后12 000 r/min 離心10 min 收集菌體,使用10 mL PBS 重懸后超聲破碎,分別將上清和沉淀進行SDS-PAGE 電泳,分析重組蛋白的表達形式。使用鎳柱進行蛋白純化,分別用6、4、2 mol/L 濃度的尿素和PBS 緩沖液透析。BCA 法定量后分裝,置于-80 ℃ 保存。
1.2.4 chSAMHD1 重組蛋白的Western blot 鑒定將純化的chSAMHD1 重組蛋白經SDS-PAGE 電泳后轉移至PⅤDF 膜,加入1%的BSA 封閉1 h;棄封閉液,加入1:500 倍稀釋的鼠抗His 抗體,4 ℃ 孵育過夜,TBST 緩沖液洗膜;然后加入1:1 000 倍稀釋的HRP 標記的山羊抗鼠ⅠgG 二抗,室溫孵育1 h,TBST 緩沖液洗膜;最后加入顯影液,通過成像系統(tǒng)測定chSAMHD1 重組蛋白與抗His 抗體的反應性。
1.2.5 chSAMHD1 蛋白多克隆抗體的制備 將純化的chSAMHD1 重組蛋白與弗式完全佐劑乳化后(體積比1:1),采用背部皮下注射的方式免疫5 只SPF 級6 周齡BALB/c 小鼠,每只免疫100 μg。2 周后,用chSAMHD1 重組蛋白與弗式不完全佐劑乳化后加強免疫(體積比1:1);2 周后,以同樣的方式進行三免。三免10 d 后斷尾采血并分離收集血清,分裝后置于 -20 ℃ 保存。
1.2.6 chSAMHD1 多克隆抗體效價的測定 通過間接ELⅠSA 測定chSAMHD1 多克隆抗體效價。將重組chSAMHD1 蛋白包被ELⅠSA 板(0.1 μg/孔),4 ℃ 孵育過夜;加入5%脫脂奶粉封閉1 h;將制備的 chSAMHD1 多克隆抗體以1:1 000 ~1:512 000 稀釋,加入到反應板中(100 μL/孔),37 ℃ 孵育1 h,PBST 洗滌3次;加入1:2 000 稀釋的HRP 標記的羊抗鼠ⅠgG(100 μL/孔),37 ℃ 孵育1 h,PBST 洗滌3 次;加入100 μL TMB 底物顯色液(100 μL/孔),37 ℃ 反應5 min 后加入2 mol/L H2SO4(100 μL/孔)終止反應;使用酶標儀測定OD450 值,以OD 值≥0.21 為臨界值,計算效價。
1.2.7 間接免疫熒光試驗(ⅠFA)檢測多克隆抗體反應性 將chSAMHD1 真核表達質粒pcDNAchSAMHD1 轉染至DF-1;36 h 后,用4%多聚甲醛室溫固定10 min,PBS 洗5 次;加入1:100 倍稀釋的鼠抗chSAMHD1 多克隆抗體,4 ℃ 孵育過夜,PBS 洗5 次;加入FⅠTC 標記的山羊抗鼠ⅠgG 二抗,37 ℃ 孵育1 h,PBS 洗5 次,通過熒光顯微鏡進行觀察。
提取雞淋巴細胞RNA,RT-PCR 擴增部分chSAMHD1 基因序列,通過瓊脂糖凝膠電泳進行分析,結果表明成功擴增到與預期大小接近的目的片段(圖 1)。將目的片段克隆至 pET-32a(+)載體,對構建的pET-chSAMHD1 質粒進行雙酶切鑒定,結果可見1 545 bp(目的基因)和6 000 bp(載體)兩個條帶(圖2)。挑取陽性克隆進行測序驗證,結果顯示所擴增的序列與理論序列同源性為100%,無點突變發(fā)生。
圖1 部分chSAMHD1 基因的擴增
圖2 pET-SAMHD1 質粒的雙酶切驗證
將 pET-chSAMHD1 質粒轉化至 BL21(DE3)大腸桿菌,加入終濃度為0.1 mmol/L 的ⅠPTG 進行誘導表達并分析蛋白可溶性。SDSPAGE 電泳結果顯示,chSAMHD1 重組蛋白約75.0 kDa,與預期大小一致,且目的蛋白主要以包涵體形式表達(圖3)。經Ni 柱純化后,可見單一目的條帶(圖 4 ), 表明所制備的chSAMHD1 重組蛋白純度較高。
圖3 chSAMHD1 蛋白的表達分析
圖4 chSAMHD1 蛋白的純化分析
將純化的 chSAMHD1 重組蛋白經 SDSPAGE 電泳后轉印至PⅤDF 膜,通過Western blot分析蛋白的反應原性。結果表明,重組chSAMHD1蛋白可以與抗His 抗體發(fā)生特異性反應(圖5)。
圖5 純化蛋白的Western blot 鑒定
將純化的重組chSAMHD1 蛋白用弗氏佐劑乳化后免疫6 周齡BALB/c 小鼠,三免后收集血清,采用間接ELⅠSA 測定多克隆抗體效價。結果表明,本試驗所制備的抗chSAMHD1 多克隆抗體的抗體效價可達1:256 000,可滿足后續(xù)試驗需求。
將 chSAMHD1 真核表達質粒 pcDNAchSAMHD1 轉染DF-1 細胞,以1:100 稀釋的chSAMHD1 多克隆抗體作為一抗進行ⅠFA 試驗。結果顯示,抗chSAMHD1 多克隆抗體能夠與轉染真核表達質粒的DF-1 發(fā)生特異性反應,表明該抗體具有良好的反應性(圖6)。
圖6 多克隆抗體對真核表達chSAMHD1 蛋白的ⅠFA 檢測
SAMHD1 是一種在多種物種中廣泛表達的脫氧核苷酸三磷酸水解酶(dNTPase),該蛋白由無菌α 基序(SAM)結構域和組氨酸-天冬氨酸(HD)結構域組成。一般認為,SAM 結構域介導蛋白質與蛋白質或蛋白質與核酸的相互作用,而HD 結構域則發(fā)揮dNTPase 活性[3]。SAMHD1可形成四聚體,這種寡聚作用是其催化dNTPase活性所必需的。SAMHD1 可將dNTP 轉化為脫氧核苷和三磷酸鹽,從而抵消dNTP 的從頭合成[6]。
近年來的研究表明,SAMHD1 是一種可對抗多種病毒的宿主限制因子。研究人員最早在非增殖性髓系細胞如巨噬細胞和樹突狀細胞中發(fā)現SAMHD1 可抑制HⅠⅤ-1 的復制[1-3]。由于HⅠⅤ-1等反轉錄病毒需要以前病毒cDNA 的形式將其整合到宿主基因組中,因此反轉錄病毒需要較高的細胞內dNTP 水平進行逆轉錄。在非分裂細胞中,SAMHD1 通過下調細胞內dNTP 的濃度來限制病毒的復制[10]。除了HⅠⅤ-1,SAMHD1 也可以抑制乙型肝炎病毒(HBⅤ)、人巨細胞病毒(Human cytomegalovirus, HCMⅤ)、痘病毒等DNA 病毒的復制。對于不同病毒,SAMHD1 可通過不同的機制發(fā)揮抗病毒功能。HBⅤ 通過RNA 中間體和逆轉錄步驟復制其病毒DNA 基因組,因此SAMHD1 的dNTPase 活性可以有效地限制細胞中 HBⅤ DNA 的復制[11]。此外,SAMHD1 可直接結合NF-κB,阻斷NF-κB 與病毒啟動子的結合,從而抑制HCMⅤ早期基因的表達,進而抑制病毒復制[12]。
在不同物種中,SAMHD1 也具有一定的抗病毒作用。如豬源SAMHD1 可以通過抑制RNA 的合成來抑制豬繁殖和呼吸綜合征病毒(PRRSⅤ)。但是,關于雞源SAMHD1 蛋白的功能、作用及調控機制的報道較少。研究發(fā)現,chSAMHD1 與人 SAMHD1 蛋白同源性約 62%,具有與人SAMHD1 蛋白類似的結構組成,并且chSAMHD1同樣具有dNTP 水解酶和核酸酶活性[13],由此推測chSAMHD1 可能具有抗病毒作用。然而,目前缺乏商業(yè)化的chSAMHD1 抗體,這限制了對chSAMHD1 功能的研究。因此制備chSAMHD1多克隆抗體對于研究chSAMHD1 蛋白抗病毒功能和機制具有重要意義。
經蛋白理化性質預測,chSAMHD1 的SAM結構域不適于大腸桿菌原核表達系統(tǒng)的表達。因此,本試驗選擇chSAMHD1 的HD 結構域進行原核表達,并將其作為免疫原免疫BALB/c 小鼠以制備多克隆抗體。本試驗首先構建了 pETchSAMHD1 原核表達質粒,可溶性分析表明chSAMHD1 蛋白以包涵體的形式表達。將純化蛋白免疫BALB/c 小鼠制備抗chSAMHD1 蛋白的多克隆抗體,間接ELⅠSA 方法測定本研究制備的多抗效價可以達到1:256 000 以上,可以滿足后續(xù)試驗的需求。本試驗所制備的chSAMHD1 多克隆抗體為后期蛋白抗病毒功能的研究奠定了基礎。