金 戔,陳耀武,李陽坤,葉賽卿,錢昕曄,朱皓宇,徐雯軒,包曉紅
(臺(tái)州學(xué)院醫(yī)學(xué)院,浙江 臺(tái)州 318000)
食管癌(Esophageal cancer)為常見的最具侵襲性的消化道惡性腫瘤之一,它有兩種組織學(xué)亞型,即食管鱗癌(Esophageal Squamous Cell Carcinoma,ESCC)和食管腺癌(Esophageal Adenocarcinoma,EAC)。在全球癌癥統(tǒng)計(jì)報(bào)告中,食管癌發(fā)生率排第六位,死亡率排第七位,且其5 年生存率低于20%[1-2]。中國(guó)的食管癌病例占全球的50%以上[3]。目前食管癌的主要臨床治療手段為手術(shù)切除、放化療,但常規(guī)治療的療效有限且發(fā)生嚴(yán)重的不良反應(yīng)[4]。西妥昔單抗(靶向表皮生長(zhǎng)因子受體,EGFR)和貝伐珠單抗(靶向血管內(nèi)皮細(xì)胞生長(zhǎng)因子,VEGF)為代表的靶向治療已被證實(shí)在食管癌的治療中發(fā)揮著重要作用[4]。然而,食管癌的異質(zhì)性,迫使研究者們尋求更多的潛在治療靶點(diǎn)。ESCC 因缺乏其有效靶點(diǎn),靶向治療效果欠佳;微小RNA(microRNA,miRNA)是一種非編碼小RNA,它參與包括食管癌在內(nèi)的多種癌癥的各個(gè)階段[5],在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的作用顯著,有望成為腫瘤治療的有效靶點(diǎn)。已有研究報(bào)道,miR-431-5p 的異常表達(dá)在腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中發(fā)揮了重要作用[6],但其在食管癌中的作用尚不明確。本文通過檢測(cè)miR-431-5p在食管癌中的異常表達(dá),證實(shí)了miR-431-5p 參與ESCC 的細(xì)胞增殖、侵襲和遷移過程,并探索了其作用機(jī)制,為食管鱗癌的分子靶向治療提供新的方向。
人食管鱗癌細(xì)胞(ESCC)株TE-1 和TE-11 購自江陰齊氏生物科技有限公司;KYSE30、KYSE70 和KYSE450 購自南京科佰生物科技有限公司;ESCC 組織cDNA 芯片(癌/癌旁各15),上海芯超生物科技有限公司;miR-431-5p 模擬物和抑制劑,北京鼎國(guó)昌盛生物技術(shù)有限責(zé)任公司;RPMI1640 培養(yǎng)基,美國(guó)Hyclone 公司;標(biāo)準(zhǔn)胎牛血清,美國(guó)Gemini Bio;CCK-8 試劑,美國(guó)APExBio 公司;BCA 定量試劑盒,美國(guó)Thermo Scientific 公司;兔抗人p-ERK(1/2)單克隆抗體(#4370)和兔抗人ERK 抗體(#9102),美國(guó)Cell Signaling Technology 公司;小鼠抗人β-actin 單克隆抗體(sc-69879),美國(guó)Santa Cruz 公司;HRP 標(biāo)記山羊抗兔IgG(ab6789)多克隆抗體、HRP 標(biāo)記山羊抗小鼠IgG(ab6721)多克隆抗體,英國(guó)abcam 公司;ECL發(fā)光液,上海碧云天生物技公司;transwell 板、Matrigel 基質(zhì)膠,美國(guó)康寧公司;Thermo CO2細(xì)胞培養(yǎng)箱,美國(guó)Thermo 公司;BioTek Synergy H1 酶標(biāo)儀,美國(guó)BioTek 公司;GE Amersham Imager 600 超靈敏多功能成像儀,美國(guó)GE 公司。
1.2.1 TCGA(The Cancer Genome Atlas)數(shù)據(jù)庫分析miR-431-5p 表達(dá)
從TCGA 數(shù)據(jù)庫(https://portal.gdc.cancer.gov)下載并整理TCGA-ESCA(食管癌)項(xiàng)目BCGSC 流程的miRNA-seq 數(shù)據(jù)并提取RPM 格式的數(shù)據(jù)。利用R(4.2.1)軟件分析miR-431-5p 表達(dá),采用ggplot2[3.3.6]包對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行可視化。
1.2.2 組織cDNA 芯片PCR 及細(xì)胞RT-qPCR
根據(jù)天根miRcute miRNA 熒光定量檢測(cè)試劑盒的操作步驟進(jìn)行操作。配置20 μL qPCR MasterMix體系:2×miRcute Plus miRNA Premix 10 μL,正向引物終濃度200 nmol/L,反向引物(10 μmol/L)0.4 μL,ddH2O 補(bǔ)水至20 μL。將cDNA 芯片置于冰上靜置15 min,振蕩30 s,以3 000 r/min 轉(zhuǎn)速離心3 min,上機(jī)實(shí)驗(yàn)。PCR 程序?yàn)椋阂浑A段95 ℃30 s;二階段95 ℃5 s,60 ℃30 s,循環(huán)40 次;三階段95 ℃5 s,60 ℃1 min。
細(xì)胞培養(yǎng)至對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期時(shí)trizol 法提取其總RNA,測(cè)定RNA 濃度及純度,進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄。具體反應(yīng)如下:配置反應(yīng)液去除DNA(5×gDNA Wiper Mix 2 μL、Total RNA 500 ng、無酶水補(bǔ)足至10 μL,40 ℃反應(yīng)2 min);在RNase-free 離心管中按說明書配置反應(yīng)液,反應(yīng)體系:上一步反應(yīng)液10 μL、5XPrimmeScript RT Master Mix 2 μL、step-loop primer 0.2 μL、無酶水補(bǔ)足至20 μL。反應(yīng)條件:25 ℃,5 min;50 ℃,15 min;85 ℃,5 min。PCR 反應(yīng)體系:cDNA 0.5 μL,mQ primer R 0.4 μL,2×SYBR PCR Master mix 5 μL,上、下游引物0.2 μL,無酶水3.9 μL。反應(yīng)條件:一階段95 ℃,5 min;二階段95 ℃,10 s、60 ℃,30 s 循環(huán)40 次;三階段95 ℃,15 s、60 ℃,1 min、95 ℃,15 s。利用2^-(ΔΔCt)法分析數(shù)據(jù)。
1.2.3 細(xì)胞培養(yǎng)
將KYSE30、KYSE70、KYSE450、TE-1、TE-11 細(xì)胞培養(yǎng)于含體積分?jǐn)?shù)為10%胎牛血清和青-鏈霉素各100 units/mL 的RPMI1640 培養(yǎng)基,置于37 ℃、體積分?jǐn)?shù)為5% CO2的培養(yǎng)箱中;倒置顯微鏡觀察細(xì)胞形態(tài)及生長(zhǎng)情況,待細(xì)胞匯合度80%~90%時(shí),胰酶消化,用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。
1.2.4 細(xì)胞轉(zhuǎn)染
以每孔5×104個(gè)細(xì)胞接種到24 孔板中,過夜培養(yǎng)后進(jìn)行細(xì)胞轉(zhuǎn)染。50 μL Opti-MEM 稀釋miR-431-5p模擬物和抑制劑(終濃度為50 nmol/L),混勻。再與50 μL Opti-MEM 稀釋的LipofectamineTM 2000 混合,室溫下靜置20 min。將100 μL 轉(zhuǎn)染復(fù)合物加入到未含血清的24 孔細(xì)胞板中,輕搖細(xì)胞板混合均勻,培養(yǎng)48 h。轉(zhuǎn)染6 h 后換新鮮完全培養(yǎng)基。分組如下:①KYSE30+模擬物對(duì)照組(以下簡(jiǎn)稱KYSE30-MNC);②KYSE30+模擬物組(以下簡(jiǎn)稱KYSE30-M);③TE-11+抑制劑對(duì)照組(以下簡(jiǎn)稱TE-11-I); ④TE-11+抑制劑組(以下簡(jiǎn)稱TE-11-I)。
1.2.5 CCK-8 細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn)
接種于6 孔板的細(xì)胞培養(yǎng)過夜后,轉(zhuǎn)染miR-431-5p 模擬物和抑制劑24 h。經(jīng)胰酶消化、離心重懸后,等體積接種于96 孔板。采用CCK-8 法檢測(cè)轉(zhuǎn)染24 h,48 h,72 h 時(shí)的細(xì)胞增殖情況。方法簡(jiǎn)述如下:10 μL CCK-8 加入每孔中,培養(yǎng)板置于37 ℃培養(yǎng)箱孵育2 h,用酶標(biāo)儀測(cè)其吸光度值(A450nm),分析其數(shù)據(jù)。
1.2.6 細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)
5×105個(gè)細(xì)胞接種于6 孔板,培養(yǎng)過夜。轉(zhuǎn)染miR-431-5p 模擬物和抑制劑24 h 后,用移液器吸頭劃痕,以PBS 清洗細(xì)胞3 次,加入無血清培養(yǎng)基,0 h、48 h 時(shí)分別在顯微鏡下拍照紀(jì)錄。用Image J 計(jì)算劃痕面積。遷移率(%)=[(0 h 劃痕面積-48 h 劃痕面積)/0 h 劃痕面積]×100%。
1.2.7 Transwell 實(shí)驗(yàn)
將4 ℃融化的轉(zhuǎn)染基質(zhì)膠用OPTI-MEM 培養(yǎng)基稀釋(1∶20),加入Transwell 小室內(nèi),37 ℃固化1~2 h;再將0.2 mL、含5×104個(gè)轉(zhuǎn)染48 h 的細(xì)胞的OPTI-MEM 培養(yǎng)液加入到Transwell 上室。Transwell 下室中加入0.6 mL 含有體積分?jǐn)?shù)為20% FBS的OPTI-MEM 培養(yǎng)基。將Transwell 小室細(xì)胞置于37 ℃、體積分?jǐn)?shù)為5% CO2的培養(yǎng)箱24 h,取出小室,固定、結(jié)晶紫染色、拍照。用Image J 計(jì)算細(xì)胞數(shù)量,計(jì)算細(xì)胞侵襲率。重復(fù)實(shí)驗(yàn)3 次。
1.2.8 Western blot 實(shí)驗(yàn)
3×105個(gè)細(xì)胞接種于6 孔板,培養(yǎng)過夜,轉(zhuǎn)染miR-431-5p 模擬物和抑制劑48 h 后,提取其總蛋白,測(cè)其蛋白濃度。在質(zhì)量濃度為4%~10%的不連續(xù)SDS-聚丙烯酰胺凝膠點(diǎn)樣孔內(nèi)加入等量蛋白樣品,再電泳,轉(zhuǎn)膜,封閉1 h 后,加入一抗(1∶1 000)稀釋液4 ℃孵育過夜。TBST 清洗3 次,每次10 min。再加二抗(1∶10 000)室溫孵育1 h,TBST 清洗3 次,每次10 min;最后用ECL 顯色液進(jìn)行顯色、拍照。使用Image J軟件分析條帶灰度值。
1.2.9 數(shù)據(jù)處理
轉(zhuǎn)錄組公共數(shù)據(jù)庫采用R(4.2.1)語言,ggplot2[3.3.6]包用于數(shù)據(jù)可視化,GraphPad Prism 8.0 軟件用于實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的可視化。兩組間比較采用t檢驗(yàn),P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
miR-431-5p 在食管癌中高表達(dá)情況如圖1 所示。非配對(duì)樣本(正常組∶食管癌組=13∶187)和配對(duì)樣本(正常組∶食管癌組=13∶13)中,腫瘤組中miR-431-5p 的表達(dá)量均高于正常組(圖1A 和圖1B),且具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01)。根據(jù)受試者工作特征曲線(ROC 曲線,圖1C),ROC 曲線下與坐標(biāo)軸圍成的面積(AUC)值為0.870(CI:0.773~0.968),具有較好的診斷價(jià)值,說明miR-431-5p 的表達(dá)水平可能是ESCC 的潛在生物標(biāo)志物。為了驗(yàn)證miR-431-5p 在ESCC 中的表達(dá),我們?cè)贓SCC 組織和細(xì)胞中檢測(cè)其表達(dá)情況。RT-qPCR 結(jié)果顯示:與癌旁組織相比較,miR-431-5p 相對(duì)表達(dá)量高于1 的組織有5/15(30%,圖1D),而在5 種ESCC 細(xì)胞系中表達(dá)量從高到低分別是TE-11、TE-1、KYSE450、KYSE70、KYSE30 細(xì)胞(圖1E)。在后續(xù)的實(shí)驗(yàn)中,分別挑選表達(dá)量最低的KYSE30 和表達(dá)量最高的TE-11 細(xì)胞作為實(shí)驗(yàn)細(xì)胞。
圖1 miR-431-5p 在食管癌中的高表達(dá)
采用RT-qPCR 方法驗(yàn)證轉(zhuǎn)染miR-431-5p 模擬物后的KYSE30 細(xì)胞和轉(zhuǎn)染抑制劑后的TE-11 細(xì)胞中miR-431-5p 的表達(dá)情況,結(jié)果如圖2 所示。經(jīng)miR-431-5p 模擬物轉(zhuǎn)染,KYSE30 細(xì)胞miR-431-5p 相對(duì)表達(dá)量顯著增加(圖2A,P<0.05),而經(jīng)miR-431-5p 抑制劑轉(zhuǎn)染,TE-11 細(xì)胞miR-431-5p 相對(duì)表達(dá)量顯著降低(圖2B,P<0.001),說明miR-431-5p 模擬物和抑制劑有效。為了檢測(cè)miR-431-5p 對(duì)ESCC細(xì)胞增殖的影響,KYSE30 和TE-11 細(xì)胞轉(zhuǎn)染miR-431-5p 模擬物和抑制劑,檢測(cè)其細(xì)胞增殖情況。轉(zhuǎn)染72 h 時(shí),與KYSE30-MNC 比較,KYSE30-M 組細(xì)胞吸光度值增加了24.19%(圖2C);與TE-11-INC 組比較,TE-11-I 組的細(xì)胞吸光度值降低了21.43%(圖2D),表明miR-431-5p 促進(jìn)ESCC 細(xì)胞增殖。
圖2 miR-431-5p 促進(jìn)ESCC 細(xì)胞增殖
miR-431-5p 模擬物和抑制劑分別轉(zhuǎn)染于KYSE30 和TE-11 細(xì)胞后,細(xì)胞遷移率變化如圖3 所示。KYSE30-MNC 組遷移率為15.93%,而KYSE30-M 組遷移率增加至46.79%(P<0.001),TE-11-INC 組遷移率為27.37%,而TE-11-I 組遷移率降至17.85%(P<0.05),這說明miR-431-5p 與ESCC 細(xì)胞遷移呈正相關(guān),在其發(fā)展過程中可能發(fā)揮重要的作用。
圖3 miR-431-5p 促進(jìn)ESCC 細(xì)胞遷移
Transwell 實(shí)驗(yàn)用于檢測(cè)miR-431-5p 對(duì)ESCC 細(xì)胞侵襲的影響。KYSE30-MNC 組只有小部分侵襲過膜,而KYSE30-M 組侵襲過膜細(xì)胞明顯增加(如圖4 所示,P<0.001),侵襲率增加了50.29%,這說明miR-431-5p 與ESCC 細(xì)胞侵襲呈正相關(guān),在食管鱗癌發(fā)展過程中必不可少。
圖4 miR-431-5p 促進(jìn)ESCC 細(xì)胞侵襲
為了探索miR-431-5p 對(duì)ESCC 細(xì)胞增殖、侵襲和遷移的作用機(jī)制,我們檢測(cè)了p-ERK 蛋白表達(dá)(如圖5 所示)。
圖5 miR-431-5p 促進(jìn)MAPK/ERK 信號(hào)通路
與KYSE30-MNC 組比較,KYSE30-M 組p-ERK 表達(dá)量增加11.68%(P<0.01);而與TE-11-INC 組比較,TE-11-I 組p-ERK 表達(dá)量減少45.73%(P<0.01)。以上實(shí)驗(yàn)表明:miR-431-5p 通過上調(diào)MAPK/ERK 信號(hào)通路,促進(jìn)了ESCC 細(xì)胞腫瘤的發(fā)生發(fā)展。
miRNA 大小約為22 個(gè)核苷酸,其表達(dá)失調(diào)在腫瘤發(fā)展過程當(dāng)中發(fā)揮重要作用。隨著miRNA 研究的深入,許多潛在的癌癥生物標(biāo)志物被提出可用于診斷和預(yù)后,這為癌癥篩查提供了新的視角[7]。本文研究發(fā)現(xiàn):miR-431-5p 在食管癌中高表達(dá),具有較高的診斷價(jià)值,因此,它可作為潛在的診斷性生物標(biāo)志物;并且miR-431-5p 對(duì)ESCC 細(xì)胞增殖、侵襲和遷移具有明顯的促進(jìn)作用。
食管癌組織RNA 公共數(shù)據(jù)庫分析結(jié)果顯示,食管癌中的miR-431-5p 表達(dá)顯著高于癌旁組織。為了驗(yàn)證數(shù)據(jù)庫分析結(jié)果的準(zhǔn)確性,我們檢測(cè)了ESCC 組織cDNA 芯片上miR-431-5p 表達(dá),結(jié)果顯示,1/3(5/15)組織高表達(dá)miR-431-5p。Xu 等[8]也通過RT-qPCR 的方法檢測(cè)子宮頸腺癌中miR-431-5p 表達(dá),其結(jié)果也顯示了miR-431-5p 的高表達(dá)。然而,因樣本數(shù)量較少,我們未能獲得統(tǒng)計(jì)學(xué)上的顯著差異。后續(xù)的研究擬擴(kuò)大樣本量,進(jìn)一步表達(dá)其驗(yàn)證,以便更準(zhǔn)確地分析miR-431-5p 表達(dá)量和評(píng)估其診斷價(jià)值。miR-431-5p 在ESCC 中的高表達(dá)是我們以miR-431-5p 作為靶點(diǎn)研究的重要依據(jù)。
為了驗(yàn)證miR-431-5p 的功能,我們首先選擇miR-431-5p 表達(dá)量最高的TE-11 細(xì)胞和表達(dá)量最低的KYSE30 細(xì)胞,再通過功能缺失和獲得進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)miR-431-5p 能促進(jìn)ESCC 細(xì)胞增殖、侵襲和遷移。miR-431-5p 在宮頸腺癌中的研究結(jié)果也顯示miR-431-5p 促進(jìn)宮頸鱗癌細(xì)胞生長(zhǎng)。然而,miR-431-5p 在結(jié)直腸癌中的研究發(fā)現(xiàn):miR-431-5p 的上調(diào)抑制了SW620 和HCT116 細(xì)胞的增殖和侵襲[9];miR-431-5p在骨肉瘤組織中的過表達(dá)抑制了U2OS 和HOS 細(xì)胞的侵襲和遷移[10];舌鱗狀細(xì)胞癌組織中miR-431-5p受到競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA circ_0001742 的調(diào)控而表達(dá)下調(diào),導(dǎo)致ATF3癌基因的高表達(dá),在舌鱗狀細(xì)胞癌中發(fā)揮抑癌作用[11]。
以上研究結(jié)果與我們的研究結(jié)果不一致,分析其原因,可能與miR-431-5p 的靶基因有關(guān)。根據(jù)ENCORI(The Encyclopedia of RNA Interactomes,http://starbase.sysu.edu.cn/tutorialAPI.php)數(shù)據(jù)庫預(yù)測(cè)的miR-431-5p 的靶基因結(jié)果,LIMCH1(LIM and calponin-homology domains 1)可能為潛在作用靶點(diǎn)(數(shù)據(jù)未顯示)。LIMCH1 蛋白是一種細(xì)胞骨架相關(guān)蛋白,屬于LIM 蛋白家族。LIMCH1 為負(fù)調(diào)控因子,可能通過調(diào)控HUWE1 和p53 參與肺癌的發(fā)生發(fā)展[12]。另外一項(xiàng)基于免疫組化和生物信息學(xué)的研究發(fā)現(xiàn),LIMCH1的表達(dá)缺失可預(yù)測(cè)肺鱗癌手術(shù)切除患者的不良預(yù)后[13]。miR-431-5p 在ESCC 中的表達(dá)上調(diào),可能通過抑制LIMCH1 實(shí)現(xiàn),從而促進(jìn)ESCC 的增殖、侵襲和遷移。因此,須進(jìn)行深入的研究加以驗(yàn)證。
上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelial to mesenchymal transition,EMT)是指非運(yùn)動(dòng)性上皮細(xì)胞向具有侵襲能力的間充質(zhì)表型轉(zhuǎn)變,是腫瘤轉(zhuǎn)移的重要的生物學(xué)過程[14]。深入分析miR-431-5p 促進(jìn)ESCC 轉(zhuǎn)移EMT分子機(jī)制尤為重要。MAPK/ERK 信號(hào)通路調(diào)控腫瘤細(xì)胞的增殖和轉(zhuǎn)移,包括食管鱗癌的EMT 過程[15-16]。ERK 是MAPK 信號(hào)通路中的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子,是將信號(hào)從表面受體傳導(dǎo)至細(xì)胞核的關(guān)鍵[17]。ERK 參與調(diào)節(jié)細(xì)胞骨架組織、細(xì)胞運(yùn)輸、細(xì)胞黏附和代謝,而在癌細(xì)胞中,ERK 的磷酸化蛋白(p-ERK)的高表達(dá)常常與增殖、侵襲和耐藥性有關(guān)[18]。因此,ESCC 細(xì)胞經(jīng)miR-431-5p 模擬物/抑制劑轉(zhuǎn)染后,檢測(cè)其p-ERK 表達(dá)量。miR-431-5p 正向調(diào)節(jié)p-ERK 是我們的新發(fā)現(xiàn)。在食管鱗癌發(fā)生發(fā)展過程中,miR-431-5p 可能是一個(gè)重要的正向調(diào)節(jié)分子,通過調(diào)控MAPK/ERK 信號(hào)通路,使ESCC 細(xì)胞觸發(fā)EMT 進(jìn)程,從而參與ESCC 細(xì)胞的增殖、侵襲和遷移等過程。此外,miR-431-5p 還可能通過ROCK1/PI3K/AKT 通路調(diào)節(jié)腫瘤細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移[19]。上皮表面標(biāo)志物(最顯著的是E-鈣黏蛋白)的缺失和間質(zhì)標(biāo)志物(包括波形蛋白和N-鈣黏蛋白)的獲得是EMT 發(fā)生的標(biāo)志[14]。miR-431-5p 模擬物/抑制劑處理后,檢測(cè)以上EMT 標(biāo)志物,詳細(xì)探究miR-431-5p 通過MAPK/ERK 通路促進(jìn)EMT 的作用機(jī)制也是我們今后研究的方向。
miR-431-5p 在ESCC 中表達(dá)上調(diào),而且miR-431-5p 通過MAPK/ERK 信號(hào)通路正向調(diào)控ESCC 細(xì)胞的增殖、侵襲和遷移。深入探索miR-431-5p 的作用靶點(diǎn)以及分子機(jī)制,將為以miRNAs 為靶點(diǎn)的食管鱗癌診斷和治療提供更有效的參考依據(jù)。