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PLCL2基因多態(tài)性觀察及其與大動脈粥樣硬化型腦梗死發(fā)病關(guān)系分析

2023-10-18 06:37王曉蓓謝孟岐劉梽潁吳勤奮張明洋楊新玲
山東醫(yī)藥 2023年27期
關(guān)鍵詞:頻數(shù)多態(tài)性基因型

王曉蓓,謝孟岐,劉梽潁,吳勤奮,張明洋,楊新玲

1 新疆醫(yī)科大學(xué)第二附屬醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科 新疆神經(jīng)系統(tǒng)疾病研究重點實驗室,烏魯木齊 830063;2 新疆醫(yī)科大學(xué)

缺血性腦卒中是由于腦血管動脈粥樣硬化和腦血栓、腦栓塞等導(dǎo)致腦動脈狹窄或堵塞,引起腦血流減少,最終引發(fā)供血部位腦組織缺血、缺氧的急性腦功能障礙的疾病[1]。大動脈粥樣硬化(LAA)型腦梗死是缺血性腦卒中常見的發(fā)病類型,病情嚴重,預(yù)后較差,約有3/4 患者不同程度喪失勞動力或生活不能自理,給社會及家庭造成沉重的經(jīng)濟負擔[2]。LAA 型腦梗死是多種因素共同作用的結(jié)果,動脈粥樣硬化是其主要病理過程,目前發(fā)病機制尚未完全明確[3]。磷脂酰肌醇特異的磷酸酯酶2(PLCL2)是一種蛋白質(zhì)編碼基因,可以增強γ-氨基丁酸的受體結(jié)合活性,參與B 細胞激活、γ-氨基丁酸信號通路和B 細胞受體信號通路的負調(diào)控[4-5]。PLCL2可間接引起CRP、IL-6 分泌水平升高,促進炎癥反應(yīng)并加速血管動脈粥樣硬化,在 LAA 型腦梗死的發(fā)生發(fā)展中可能起作用[6]。既往研究發(fā)現(xiàn),PLCL2基因多態(tài)性與心肌梗死、缺血性腦卒中、代謝綜合征的發(fā)生有關(guān)系,但其與LAA 型腦梗死的關(guān)系仍未明確。本研究收集新疆地區(qū)LAA 型腦梗死患者及體檢健康人群的血液樣本分析PLCL2基因4個SNPs 位點(依據(jù)目的基因位點要有潛在功能,并且位于內(nèi)含子、啟動子、5'UTR 區(qū)域的標簽位點,最后通過綜合考慮SNP 位點所在的功能區(qū)、功能預(yù)測結(jié)合已有研究文獻),即PLCL2 rs2014490、rs9824172、rs4685423、rs4618210 的基因多態(tài)性,并進一步探討PLCL2基因多態(tài)性與LAA型腦梗死的關(guān)系。

1 資料與方法

1.1 臨床資料 選取2021 年7 月—2022 年7 月就診于新疆醫(yī)科大學(xué)第二附屬醫(yī)院診斷為LAA 型腦梗死患者105 例(病例組),均符合腦梗死的診斷標準,均經(jīng)臨床、頭部CT及頭部MRI掃描證實,且經(jīng)頸動脈B超 + 頭顱磁共振血管造影、頭 + 頸部CT血管造影或腦數(shù)字剪影血管造影等證實腦血管的主干或分支>50%以上的狹窄或閉塞,推測源于動脈硬化,在供血區(qū)內(nèi)發(fā)生急性腦梗死,直徑大于1.5 cm,TOAST 分型為 LAA 型;排除多臟器功能不全、風濕免疫性疾病、感染性疾病。病例組中男65 例、女40例,年齡 40~75(63.18 ± 12.97)歲;神經(jīng)功能缺損評分(NIHSS評分) 4~40分,其中合并有吸煙史36例、飲酒史26 例、糖尿病史46例、高血壓史86例。對照組為本院同一時期年齡、性別、族別與病例組相匹配體檢健康人群103例, 排除腦血管病、風濕免疫性疾病以及近2 周內(nèi)發(fā)生過炎性病變的人群,其中男52例、女51 例,年齡45~72(61.24 ± 11.04)歲,其中合并吸煙史23 例、飲酒史20 例、糖尿病史26 例、高血壓史66 例。本研究獲得新疆醫(yī)科大學(xué)第二附屬醫(yī)院倫理委員會批準,受試者均對多態(tài)性位點基因型檢測知情同意。

1.2 PLCL2 基因多態(tài)性分析 采集兩組入院外周靜脈血2.0 mL,以EDTA 抗凝,用磁珠法全血 DNA提取試劑盒 (中科拜爾)抽取DNA放置于–80 °C保存。基于飛行質(zhì)譜的分型技術(shù)(massarray SNP)針對PLCL2 rs2014490、rs9824172 rs4685423、rs4618210 SNP 位點多態(tài)性進行分析,采用Agena 公司的Assay Designer4.0 軟件進行多重SNP 位點的引物設(shè)計評估,引物序列見表1,由北京博淼生物科技有限公司設(shè)計。

表1 PLCL2基因多態(tài)性位點引物和PCR序列

PCR 擴增反應(yīng)步驟:取1.5 mL EP 管中配制PCR master mix,并振蕩低速離心;每個加樣孔中加入4 μL PCR master mix,最后加入1 μL 模板DNA(20 ng/μL)混勻,1 000 r/min 離心1 min。PCR 循環(huán):94 ℃ 5 min(1 個循環(huán)),94 ℃ 20 s,56 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min(45 個循環(huán)),72 ℃ 3 min(1 個循環(huán)),4 ℃∝,在PCR 反應(yīng)結(jié)束后,將PCR 產(chǎn)物用蝦堿性磷酸酶 (SAP)處理,以去除體系中游離的dNTPs。在新1.5 mL EP 管中配制堿性磷酸酶處理反應(yīng)液,將SAP mix 加入384 孔PCR 反應(yīng)板,反應(yīng)總體積為7 μL,其中PCR 產(chǎn)物5 μL,SAP mix 2 μL。瞬時離心后進行如下反應(yīng)程序:37 ℃、20 min, 85 ℃、5 min,4 ℃∝,并將384 孔反應(yīng)板放置于PCR 儀上進行單堿基延伸反應(yīng)。待檢測SNP基因型互補的單堿基延伸產(chǎn)物進行樹脂純化,樹脂純化后的延伸產(chǎn)物移至點樣儀上進行質(zhì)譜檢測及數(shù)據(jù)輸出。將點樣后的SpectroCHIP 芯片使用MALDI-TOF 質(zhì)譜儀分析,檢測結(jié)果使用TYPER4.0軟件獲取原始數(shù)據(jù)及基因分型圖,檢查數(shù)據(jù)文件的完整性和正確性,將結(jié)果保存并分析數(shù)據(jù)。

對病例組、對照組PLCL2 基因分布進行Hardy-Weinberg 遺傳平衡檢驗,采用頻數(shù)計數(shù)法統(tǒng)計受檢人 群 PLCL2 rs2014490、rs9824172 rs4685423、rs4618210 位點上的基因型頻率;根據(jù)基因型頻率推算等位基因頻率,并將推算得到的等位基因頻率與對照組基因頻率的分布進行比較。

1.3 統(tǒng)計學(xué)方法 采用SPSS23.0 統(tǒng)計軟件。計數(shù)資料以例(%)表示,比較采用χ2檢驗,若超過1/4 單元格的理論頻數(shù)均<5,則采用Fisher's 精確概率法?;谶z傳模型(共顯性模型、顯性模型、隱性模型、超顯性模型),使用非條件 Logistics 回歸模型分析PLCL2 基 因 rs2014490、rs9824172、rs4685423、rs4618210位點多態(tài)性與疾病的關(guān)聯(lián),其關(guān)聯(lián)強度以比值比(OR)及95%置信區(qū)間(CI) 表示。P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

2 結(jié)果

Hardy-Weinberg 遺傳平衡檢驗結(jié)果顯示,PLCL2 rs2014490 位點GG、AG、AA 基因型在受檢人群中的實際頻數(shù)為52、97、56 例,計算得到3 種基因型 理 論 頻 數(shù) 為53.32、102.24、49.22 例,PLCL2 rs2014490 位點上各基因型的實際頻數(shù)和理論頻數(shù)的分布差異無統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=0.599,P=0.741>0.05)。PLCL2 rs9824172 位點GG、GT、TT基因型在受檢人群中的實際頻數(shù)為53、94、61 例,計算得到3種基因型理論頻數(shù)為52、93.6、60.32 例,PLCL2 rs9824172 位點上各基因型的實際頻數(shù)和理論頻數(shù)的分布差異無統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=0.008,P=0.996>0.05)。PLCL2 rs4685423位點AA、CA、CC基因型在研究對象中的實際頻數(shù)為54、89、62 例,計算得到3種 基因型 理論頻 數(shù)為47.97、102.34、55.43 例,PLCL2 rs4685423 位點上各基因型的實際頻數(shù)和理論頻數(shù)的分布差異無統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=1.657,P=0.437>0.05)。PLCL2 rs4618210 位點AA、GA、GG基因型在研究對象中實際頻數(shù)為39、94、66例,計算得到3 種基因型理論頻數(shù)為36.80、97.55、64.66 例,PLCL2 rs4618210 位點上各基因型的實際頻數(shù)和理論頻數(shù)的分布差異無統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=0.141,P=0.932>0.05) 。 說 明 PLCL2 rs2014490、rs9824172、rs4685423、rs4618210位點達到遺傳平衡,本研究中選取的樣本群體對LAA型腦梗死患者具有群體代表性。

2.1 兩組PLCL2 rs2014490、rs9824172、rs4685423、rs4618210 基因型頻率、等位基因頻率比較 PLCL2 rs2014490位點基因型為GG、AG、AA,在病例組中占比分別為29.1%、42.7%、28.2%,對照組中分別為21.5%、52%、26.5%;病例組等位基因G、A 基因頻率占比分別為50.5%、49.5%,對照組分別為47.5%、52.5%;兩組基因型頻率及等位基因頻率比較,χ2分 別 為2.13、0.35,P均>0.05。 PLCL2 rs9824172位點基因型為GG、GT、TT,在病例組中占比分別為26.7%、40%、33.3%,對照組中分別為24.3%、50.5%、25.2%;病例組中等位基因G、T頻率占比分別為46.7%、53.3%,對照組分別為49.5%、50.5%;兩組基因型頻率及等位基因頻率比較,χ2值分別為2.54、0.34,P均>0.05。PLCL2 rs4685423 位點基因型為AA、CA、CC,在病例組中占比分別為28.8%、35.6%、35.6%,對照組中分別為23.8%、51.5%、24.7%;病例組等位基因A、C 頻率占比分別為46.6%、53.4%,對照組分別為49.5%、50.5%;兩組基因型頻率及等位基因頻率比較,χ2分別為5.48、0.34,P均>0.05。PLCL2 rs4618210位點基因型為AA、GA、GG,在病例組中占比分別為16.7%、49%、34.3%,對照組分別為22.68%、45.36%、31.96%;病例組等位基因A、G 頻率占比分別為41.2%、58.8%,對照組分別為45.4%、54.6%;兩組基因型頻率及等位基因頻率比較,χ2值分別為1.14、0.70,P均>0.05。

2.2 PLCL2 基因的 4 個 SNPs 與LAA 型腦梗死的關(guān)系 PLCL2 基因rs2014490 位點,A 是野生型基因、G 是突變型基因,共顯性模型: GG vs.AA 和GT vs.AA;顯性模型:AG + GG vs.AA,隱性模型:AA +AG vs.GG;超顯性模型:AA + GG vs.AG?;诠诧@性模型、顯性模型、隱性模型、超顯性模型的分析結(jié)果顯示,PLCL2 基因rs2014490 位點與LAA 型腦梗死發(fā)生風險無相關(guān)性(P均>0.05)。

PLCL2 基因rs9824172位點,T是野生型基因、G是突變型基因,共顯性模型:GG vs.TT 和GT vs.TT;顯性模型:GT + GG vs.TT;隱性模型:TT + TG vs.GG;超顯性模型:TT + GG vs.TG?;诠诧@性模型、顯性模型、隱性模型、超顯性模型的分析結(jié)果顯示,PLCL2 基因rs9824172 位點與LAA 型腦梗死發(fā)生風險無相關(guān)性(P均>0.05)。

PLCL2 基因rs4685423位點,C是野生型基因、A是突變型基因,共顯性模型:AA vs.CC 和CA vs.CC;顯性模型:CA + AA vs.CC;隱性模型:CC + CA vs.AA;超顯性模型:CC + AA vs.AC?;诔@性模型的分析結(jié)果顯示,PLCL2 基因rs4685423 位點與LAA 型腦梗死發(fā)生風險具有相關(guān)性(OR=0.52,95%CI0.30~0.91,P<0.05);基于其他遺傳模型的分析結(jié)果顯示,rs4685423位點與LAA型腦梗死發(fā)生風險無相關(guān)性(P均>0.05)。

PLCL2 基因rs4618210位點,G是野生型基因、A是突變型基因,共顯性模型:AA vs.GG 和GA vs.GG;顯性模型:GA + AA vs.GG;隱性模型:GA +GG vs.AA;超顯性模型:GG + AA vs.GA?;诠诧@性模型、顯性模型、隱性模型、超顯性模型的分析結(jié)果顯示,PLCL2 基因rs4618210 位點與LAA 型腦梗死發(fā)生風險無相關(guān)性(P均>0.05)。

3 討論

LAA 型腦梗死是多個基因與環(huán)境因素共同作用的復(fù)雜疾病,越來越多的研究表明,危險因素與基因多態(tài)性的交互作用對疾病的發(fā)生具有協(xié)同效應(yīng)[7-10]。SNP分析已經(jīng)被廣泛用于篩查腦梗死疾病易感基因位點。近年發(fā)現(xiàn)許多腦梗死的易感基因,如ZNF260 基因 rs34550124 多態(tài)性可能影響缺血性腦卒發(fā)生過程,并可能通過影響缺血性腦卒中患者的血壓、血糖及凝血功能而導(dǎo)致臨床癥狀不同[11]。LPL rs264 位點基因多態(tài)性可能與老年高血壓患者LAA型腦梗死的發(fā)病相關(guān)[12]。PLCL2基因是一種新的磷脂酶C樣蛋白,位于染色體3p24.3上,缺乏磷脂酶催化活性,是B細胞受體信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和免疫應(yīng)答的負調(diào)控因子[6,13],可能在免疫系統(tǒng)中發(fā)揮重要作用,參與的疾病有急性心肌梗死、急性腦梗死、代謝綜合征、類風濕關(guān)節(jié)炎、新型冠狀病毒肺炎,并與中國人群COVID-19嚴重程度密切相關(guān)[14-15]。PLCL2缺陷小鼠的實驗數(shù)據(jù)表明,PLCL2是B細胞受體信號傳導(dǎo)和免疫應(yīng)答的負調(diào)節(jié)劑,被證明間接調(diào)節(jié)成熟B細胞,從而通過FAS介導(dǎo)細胞凋亡,影響免疫炎癥應(yīng)答。PLCL2基因可使免疫系統(tǒng)失調(diào),促進血管動脈粥樣硬化,參與心肌梗死的慢性炎癥過程。

一項全基因組關(guān)聯(lián)研究[5]發(fā)現(xiàn),PLCL2 是日本人心肌梗死的新易感基因。后來有伊朗的一項病例對照研究[4]發(fā)現(xiàn),PLCL2,從而基因中的rs4618210 A>G 多態(tài)性有助于心肌梗死的病因?qū)W診斷。本研究發(fā)現(xiàn),PLCL2 rs2014490、rs9824172、rs4685423、rs4618210基因型頻率、等位基因頻率在兩組間比較差異無統(tǒng)計學(xué)意義,PLCL2 基因多態(tài)性位點與疾病發(fā)生的結(jié)論不一致,考慮與LAA 型腦梗死的發(fā)生是個復(fù)雜的過程,是環(huán)境和基因相互作用的結(jié)果有關(guān)。HUANG 等[8]研究發(fā)現(xiàn),PLCL2 基因rs4685423和rs4618210 SNP 可能與中國漢族人LAA 型腦梗死的危險性有關(guān)。SNP-SNP 相互作用分析顯示,rs4685423 是LAA 卒 中 風險影 響因素[8]。與 攜帶PLCL2 rs4685423 位點CC 基因型人群相比,攜帶AA基因型、CA 基因型的人群LAA 卒中發(fā)生風險降低。本研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),PLCL2 rs4685423 位點攜帶純合子(CC + AA 型)人群與攜帶雜合子(CA)人群相比患LAA 型腦梗死的可能性大。本研究與前人的研究中均發(fā)現(xiàn)PLCL2 rs4685423 位點CA 雜合子型患LAA 型腦梗死風險較其余基因型小,但是AA 純合子型研究結(jié)果不一致,考慮可能與不同人群遺傳因素和生活環(huán)境不同導(dǎo)致的遺傳表型發(fā)生變化有關(guān)。 HUANG 等[6,8]研 究 發(fā) 現(xiàn),與 攜 帶PLCL2 rs 4618210 位點GG 基因型人群相比,攜帶AA 基因型、GA 基因型人群LAA 卒中的發(fā)病風險降低。本研究發(fā)現(xiàn),基于共顯性模型、顯性模型、隱性模型、超顯性模型的分析結(jié)果顯示,PLCL2 rs2014490、rs9824172、rs4618210 位點與LAA 型腦梗死發(fā)病風險不存在統(tǒng)計學(xué)意義上的關(guān)聯(lián),與文獻研究結(jié)果不一致,未來需進一步擴大樣本量再次驗證。

總之, LAA 型腦梗死及正常健康人群PLCL2 rs2014490、rs9824172、rs4685423、rs4618210 位點均以突變雜合子所占比例為最多。攜帶PLCL2 rs4685423 位點純合子(CC + AA 型)人群與攜帶雜合子(CA)人群相比患LAA 型腦梗死的可能性大。本研究也有一定的局限性,如研究對象均為新疆地區(qū)人群,由于遺傳影響與種族背景密切相關(guān),可能不符合其他種族;研究樣本量小,對混雜因素調(diào)整不充分;采用了病例—對照研究設(shè)計,只能揭示相關(guān)因素與LAA 型缺血性腦卒中之間的潛在關(guān)聯(lián),而無法確定因果關(guān)系。

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