黃至誠,葉 柳,杜 宇,古宏峰,高凡云,朱啟華,徐云根
(中國藥科大學(xué)藥物化學(xué)系,南京 210009)
聚腺苷酸二磷酸核糖聚合酶-1(poly ADPribose polymerase-1,PARP-1)抑制劑通過其特殊的合成致死機制發(fā)揮抗腫瘤作用[1],但在臨床上主要用于治療乳腺癌易感基因1/2(breast cancer susceptibility gene 1/2,BRCA1/2)突變或缺失的腫瘤,適應(yīng)證有限;此外,臨床研究證明,由于BRCA1/2 的二次突變導(dǎo)致同源重組修復(fù)途徑恢復(fù)[2-4],從而對PARP-1 抑制劑產(chǎn)生耐藥性,這進一步限制了PARP-1 抑制劑的臨床應(yīng)用。因此,拓展PARP-1抑制劑的適應(yīng)證以及克服耐藥性問題迫在眉睫[5]。PI3K 信號通路在多種腫瘤細胞中均被激活,廣泛參與細胞的生長、存活、遷移等生命周期活動[6-8]。研究表明,抑制PI3K 信號通路會導(dǎo)致細胞內(nèi)單鏈損傷增加,同時還會下調(diào)BRCA1/2 的表達,進而抑制同源重組修復(fù)途徑,使腫瘤細胞對PARP-1 抑制劑的敏感性增加[9-10]。目前已經(jīng)展開了數(shù)項PARP-1 抑制劑和PI3K 抑制劑聯(lián)合用于治療腫瘤的試驗且已經(jīng)取得較好的進展[11-12]。
雖然藥物聯(lián)用可以達到協(xié)同增效的目的,但藥物聯(lián)用存在自身的局限性,比如更加復(fù)雜的藥物代謝特性、更強的不良反應(yīng)等[13-14]。與之相比,雙靶點抑制劑不但可以作用于多個病理環(huán)節(jié)而發(fā)揮協(xié)同作用,還可以避免藥物與藥物之間相互作用引發(fā)的安全性問題。因此,開發(fā)PARP-1/PI3K雙靶點抑制劑對于克服PARP-1 抑制劑的耐藥性、擴展PARP-1 抑制劑的適應(yīng)證以及降低由于藥物聯(lián)用產(chǎn)生的不確定性具有重大的現(xiàn)實意義。課題組前期得到了多個對PARP-1/PI3K 抑制活性優(yōu)異的化合物[15-17],但存在水溶性較差的問題。本研究在課題組已有的研究基礎(chǔ)上,以成藥性為導(dǎo)向,以化合物XW-1 和WZ-1 為先導(dǎo)化合物,通過引入脲基團,構(gòu)造成鹽位點以提高化合物的水溶性,設(shè)計并合成了11 個目標(biāo)化合物,并對其進行PAPR-1 和PI3K 酶抑制活性和多種腫瘤細胞抗增殖活性測試,具體的設(shè)計策略見圖1。
Figure 1 Design strategy of target compounds
以化合物1[15]和2[15]為原料,通過縮合反應(yīng)得到中間體3,再分別與4-氨基苯硼酸頻哪醇酯(4a)、2-氨基吡啶-5-硼酸頻哪醇酯(4b)或2-氨基-4-三氟甲基吡啶-5-硼酸頻哪醇酯(4c)發(fā)生Suzuki反應(yīng)得到關(guān)鍵中間體5a ~ 5c。再與氯甲酸苯酯反應(yīng)生成中間體6a ~ 6c,最后與不同的胺(7a ~ 7d)反應(yīng)生成目標(biāo)化合物8a ~ 8f。合成路線見圖2。
Figure 2 Synthetic routes of compounds 8a-8f
以化合物2 和9 為原料,通過縮合反應(yīng)得到中間體10,再分別與4-氨基苯硼酸頻哪醇酯(4a)、2-氨基吡啶-5-硼酸頻哪醇酯(4b)或2-氨基-4-三氟甲基吡啶-5-硼酸頻哪醇酯(4c)發(fā)生Suzuki 反應(yīng)得到關(guān)鍵中間體11a ~ 11c。再與氯甲酸苯酯反應(yīng)生成中間體12a ~ 12c,最后與不同的胺(7a、7b 和7d)反應(yīng)生成目標(biāo)化合物13a ~ 13e。合成路線見圖3。
Micros Q-TOF 型高分辨分析儀器(美國Waters公司);Avance NEO 400 MHz 核磁共振儀(美國Bruker 公司);RY-1 型熔點儀(天津市分析儀器廠);200 ~ 300 目硅膠(山西諾泰生物科技有限公司);HSG F254 型號TLC 硅膠板(山東青島海洋化工有限公司);常用試劑均為市售分析純試劑。PARP-1蛋白和TMB顯色液(義翹神州公司);pADPr抗體(美國Santa Cruz公司);抗鼠IgG-HRP(美國CST 公司);HCT116、HCC1937、MDA-MB-231 和MDA-MB-468(中科院上海細胞庫);HCT116R(中國藥科大學(xué)郝海平課題組,中科院上海細胞庫);胎牛血清(美國Sciencell 公司);McCOY’s 5A 培養(yǎng)基、RPMI 1640 培養(yǎng)基和L-15 培養(yǎng)基(江蘇凱基生物技術(shù)股份有限公司);MTT 試劑(美國My Bio-Science 公司);96 孔細胞培養(yǎng)板(美國Thermo 公司);其他的測定緩沖溶液為實驗室內(nèi)部配制。
Figure 3 Synthetic routes of compounds 13a-13e
2.2.1 中間體3 的合成 向100 mL 三頸瓶中加入化合物1(0.20 g,0.89 mmol)、化合物2(0.29 g,0.89 mmol)、PyBOP(0.56 g,1.07 mmol)、DIEA(0.44 mL,2.69 mmol)和DMF(5 mL),加畢,25 ℃攪拌反應(yīng)2 h,TLC(二氯甲烷-甲醇,6∶1)監(jiān)測反應(yīng)完全。加水(40 mL)和乙酸乙酯(30 mL),分取有機層,水層再用乙酸乙酯(25 mL×2)萃取,合并有機層,依次用水和飽和氯化鈉溶液各洗一次,無水硫酸鈉干燥,抽濾,濾液減壓濃縮,硅膠柱色譜純化(二氯甲烷-甲醇,200∶1 ~ 20∶1),得白色固體(0.35 g,79.0%)。mp:144 ~ 146 ℃;1H NMR (400MHz,DMSO-d6)δ∶7.97(s,1H,12-NH2),7.89(s,1H,12-NH2),7.78(dd,J= 8.4,2.7 Hz,1H,Ar-H),7.63(dd,J= 9.9,2.7 Hz,1H,Ar-H),7.55(s,1H,Ar-H),4.00 ~ 3.60 (m,16H,17、18、20、21、30、31、33、34-CH2);MS(ESI):m/z[M+H]+Calcd.:490.1,F(xiàn)ound:490.3。
2.2.2 中間體5a ~ 5c 的合成 向100 mL 三頸瓶中加入中間體3(0.20 g,0.41 mmol)、原料4a ~ 4c(0.45 mmol)、碳酸鉀(0.16 g,1.14 mmol)的水溶液(1.5 mL),四三苯基膦鈀(0.05 g,0.04 mmol)和1,4-二氧六環(huán)(15 mL),加畢,氮氣保護,轉(zhuǎn)移至100 ℃反應(yīng)8 h,TLC(二氯甲烷-甲醇,6∶1)監(jiān)測反應(yīng)完全。冷卻至室溫,硅藻土抽濾,濾餅用乙酸乙酯洗滌,濾液減壓濃縮,硅膠柱色譜純化(二氯甲烷-甲醇,200∶1 ~ 10∶1),得白色固體。
2.2.3 中間體6a ~ 6c 的合成 向100 mL 三頸瓶中加入原料5a ~ 5c(0.31 mmol)、氯甲酸苯酯(1.53 mmol)、DIEA(2.48 mmol)和DCM(20 mL),加畢,25 ℃攪拌反應(yīng)4 h,TLC(二氯甲烷-甲醇,10∶1)監(jiān)測反應(yīng)完全;反應(yīng)液依次用飽和碳酸氫鈉溶液、水、飽和氯化鈉溶液洗1次,合并有機相,無水硫酸鈉干燥,抽濾,濾液減壓濃縮,得透明油狀物,不經(jīng)純化直接投下一步。
2.2.4 中間體10 的合成 向100 mL 三頸瓶中加入化合物9(0.50 g,1.68 mmol)、化合物2(0.54 g,1.68 mmol)、PyBOP(1.06 g,2.02 mmol)、DIEA(1.11 mL,6.71 mmol)和DMF(20 mL),加畢,25 ℃攪拌反應(yīng)2 h,TLC(二氯甲烷-甲醇,6∶1)監(jiān)測反應(yīng)完全。加水(80 mL)和加乙酸乙酯(50 mL),分取有機層,水層再用乙酸乙酯(40 mL×2)萃取,合并有機層,依次用水和飽和氯化鈉溶液各洗一次,無水硫酸鈉干燥,抽濾,濾液減壓濃縮,硅膠柱色譜純化(二氯甲烷-甲醇,200∶1 ~ 20∶1),得黃色固體(0.83 g,87.0%)。mp:148 ~ 150 ℃;1H NMR (400MHz,DMSO-d6)δ∶12.57(s,1H,9-NH),8.27 (d,J= 7.8 Hz,1H,Ar-H),7.99 ~ 7.81(m,3H,Ar-H),7.48 ~ 7.43(m,1H,Ar-H),7.38(d,J= 6.5 Hz,1H,Ar-H),7.25(t,J= 9.0 Hz,1H,Ar-H),4.35(s,2H,12-CH2),3.80 ~ 3.63(m,14H,23、24、26、27、36、37、39-CH2),3.27 ~ 3.20(m,2H,40-CH2);MS(ESI):m/z[M+H]+Calcd.:565.1,F(xiàn)ound:565.3。
2.2.5 中間體11a ~ 11c 的合成 向100 mL 三頸瓶中加入中間體10(0.20 g,0.29 mmol)、原料4a ~4c(0.32 mmol)、碳酸鉀(0.11 g,0.81 mmol)的水溶液(1.5 mL),四三苯基膦鈀(0.04 g,0.03 mmol)和1,4-二氧六環(huán)(15 mL),加畢,氮氣保護,轉(zhuǎn)移至100 ℃反應(yīng)8 h,TLC(二氯甲烷-甲醇,6∶1)監(jiān)測反應(yīng)完全。冷卻至室溫,硅藻土抽濾,濾餅用乙酸乙酯洗滌,濾液減壓濃縮,硅膠柱色譜純化(二氯甲烷-甲醇,200∶1 ~ 10∶1),得白色固體。
2.2.6 中間體12a ~ 12c 的合成 向100 mL 三頸瓶中加入原料11a ~ 11c(0.24 mmol)、氯甲酸苯酯(1.20 mmol)、DIEA(1.93 mmol)和DCM(20 mL),加畢,25 ℃攪拌反應(yīng)4 h,TLC(二氯甲烷-甲醇,10∶1)監(jiān)測反應(yīng)完全;反應(yīng)液依次用飽和碳酸氫鈉溶液、水、飽和氯化鈉溶液洗一次,合并有機相,無水硫酸鈉干燥,抽濾,濾液減壓濃縮,得透明油狀物,不經(jīng)純化直接投下一步。
2.2.7 目標(biāo)化合物8a ~ 8f 的合成 向100 mL 三頸瓶中加入中間體6a ~ 6c(0.31 mmol)、原料7a ~7d(0.62 mmol)、DIEA(0.93 mmol)和四氫呋喃(25 mL),加畢轉(zhuǎn)移至70 ℃反應(yīng)4 h,TLC(二氯甲烷-甲醇,6∶1)監(jiān)測反應(yīng)完全。濾液減壓濃縮,硅膠柱色譜純化(二氯甲烷-甲醇,100∶1 ~ 10∶1),得白色固體。
2.2.8 目標(biāo)化合物13a ~ 13e 的合成 向100 mL三頸瓶中加入中間體12a ~ 12c(0.24 mmol)、原料7a、7b 或7d(0.48 mmol)、DIEA(0.72 mmol)和四氫呋喃(25 mL),加畢轉(zhuǎn)移至70 ℃反應(yīng)4 h,TLC(二氯甲烷-甲醇,6∶1)監(jiān)測反應(yīng)完全。濾液減壓濃縮,硅膠柱色譜純化(二氯甲烷-甲醇,100∶1 ~ 10∶1),得白色固體。
以奧拉帕尼為陽性對照。96 孔板每孔加入組蛋白的PBS 溶液[20 μg(0.14 μmol)/mL] 100 μL,冰箱4 ℃孵育過夜。倒出PBS 溶液,PBST 洗板2 次。每孔加入封閉液200 μL,室溫孵育2 h 后,倒出封閉液,PBST 洗板2 次,PARP1 緩沖液洗板1 次。每孔依次加入含或不含有化合物的反應(yīng)緩沖液50 μL 和PARP 蛋白(0.2 μg/mL,溶于PARP 緩沖液)50 μL,室溫反應(yīng)45 min。倒出反應(yīng)緩沖液,PBST 洗板2 次。每孔加入pADPr 抗體(1∶1 500)100 μL,室溫孵育1 h。倒出溶液,PBST 洗板2 次。每孔加入抗鼠IgG-HRP(1∶2 000)100 μL,室溫孵育30 min。倒出溶液,PBST 洗板4 次。每孔加入TMB 顯色液100 μL,避光反應(yīng)約15 min(觀察顏色),每孔加入2 mol/L H2SO450 μL 以終止反應(yīng)。使用多功能酶標(biāo)儀在450 nm 波長下測量吸收度,通過吸收度計算出PARP-1 抑制活性,以半數(shù)抑制濃度IC50表達。
PI3K 酶抑制活性測試委托上海睿智生物醫(yī)藥有限公司完成。以BKM120 為陽性藥,采用ADPGlo 方法測定PI3K 抑制活性。用Echo 轉(zhuǎn)移的1 ×激酶緩沖液50 nL 到384 孔板的化合物孔,陰性對照孔和陽性對照孔中分別轉(zhuǎn)移50 nL的DMSO。用1 × 激酶緩沖液配制2倍終濃度的激酶溶液。在化合物孔和陽性對照孔分別加2 倍終濃度的激酶溶液2.5 μL,在陰性對照孔中加2.5 μL 的1 × 激酶緩沖液,振蕩混勻后室溫孵育10 min。再用1 × 激酶緩沖液配制2 倍終濃度的ATP 和底物P1P2 的混合溶液,每孔加入2 倍終濃度的ATP 和底物的混合溶液2.5 μL 以起始反應(yīng),振蕩混勻后室溫反應(yīng)60 min,再加入ADP-Glo 試劑5 μL,振蕩混勻后室溫孵育180 min。最后每孔加入激酶檢測試劑10 μL,振蕩混勻后室溫孵育30 min。使用酶標(biāo)儀讀取吸收度,并計算各化合物的抑制率。
以奧拉帕尼和BKM120為陽性對照,采用MTT法測試目標(biāo)化合物對人乳腺癌細胞MDA-MB-231和MDA-MB-468,BRCA1 突變的人結(jié)直腸癌細胞HCC1937、BRCA2 突變的人結(jié)直腸癌細胞HCT116以及對奧拉帕尼耐藥的BRCA2突變的人結(jié)直腸癌細胞HCT116R的體外抗細胞增殖活性。分別將處于對數(shù)生長期的細胞以每孔1 500 ~ 4 000 個細胞的密度接種在96 孔板上。培養(yǎng)18 h 后,棄去培養(yǎng)基,施藥區(qū)最大藥物濃度孔加入2倍終濃度的藥液(100 μL),設(shè)置3 個復(fù)孔,兩倍梯度稀釋得8 個濃度,最終體系為200 μL。孵育7 d 后,每孔加入MTT 試劑20 μL,孵育4 h 后,棄去培養(yǎng)基和MTT,每孔加入DMSO 150 μL 以溶解甲瓚,搖床上振蕩10 min,使用多功能酶標(biāo)儀在570 nm 波長下測量吸收度,通過吸收度計算出細胞增殖抑制率,以半數(shù)抑制濃度IC50表達。
N-(4-(4-(4-(7-氨基甲酰基-5-氟苯并呋喃-2-羰基)哌嗪-1-基)-6-嗎啉-1,3,5-三嗪-2-基)苯基)-4-甲基哌嗪-1-甲酰胺(8a)
白色固體,收率62.8%。mp:204 ~ 206 ℃;1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ:8.84(s,1H,40-NH),8.26(d,J= 8.4 Hz,2H,Ar-H),7.97(s,1H,12-NH2),7.89(s,1H,12-NH2),7.77(dd,J= 8.2,2.7 Hz,1H,Ar-H),7.65 ~ 7.58(m,3H,Ar-H),7.55(s,1H,Ar-H),4.10 ~ 3.82(m,12H,17、18、20、21、30、34-CH2),3.72 ~ 3.66(m,4H,31、33-CH2),3.54 ~ 3.49(m,4H,44、48-CH2),2.44 ~2.35(m,4H,45、47-CH2),2.24(s,3H,49-CH3);13C NMR(101 MHz,DMSO-d6)δ∶169.64,165.04(d,J= 5.05 Hz),164.47,159.88,158.87,157.51,155.06,150.97,147.83,144.48,130.01,129.37(d,J= 11.1 Hz),129.07(2C),121.67(d,J= 8.08 Hz),118.82(2C),114.56,114.29,111.56,111.52,111.30,111.05,66.52(2C),54.96(2C),46.19(2C),44.14(2C),43.75(2C);HRMS(ESI):m/z[M+H]+Calcd. for C33H37FN10O5:673.293 2,F(xiàn)ound: 673.293 8。
2-(4-(4-(6-(3-(2-(二甲基氨基)乙基)脲基)吡啶-3-基)-6-嗎啉-1,3,5-三嗪-2-基)哌嗪-1-羰基)-5-氟苯并呋喃-7-甲酰胺(8b)
白色固體,收率82.3%。mp:178 ~ 180 ℃;1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ∶9.51(s,1H,Ar-H),9.06(s,1H,40-NH),8.45(dd,J= 8.7,2.3 Hz,1H,12-NH2),7.98 ~ 7.86(m,2H,12-NH2,ArH),7.81(s,1H,Ar-H),7.70(dd,J= 8.2,2.7 Hz,1H,Ar-H),7.57(dd,J= 9.7,2.7 Hz,1H,Ar-H),7.51 ~7.46(m,2H,42-NH,Ar-H),4.01 ~ 3.93(m,2H,17-CH2),3.89 ~ 3.73(m,10H,18、20、21、30、34-CH2),3.65 ~ 3.59(m,4H,31、33-CH2),3.25 ~3.20(m,2H,45-CH),2.32(t,J= 6.4 Hz,2H,44-CH2),2.14(s,6H,47、48-CH3);13C NMR(101MHz,DMSO-d6)δ∶168.38,164.79(d,J= 5.05 Hz),164.47,158.87,159.69(d,J =239 Hz),156.08,154.94,150.96,148.28,147.84,138.02,129.42,129.31,125.73,121.70,121.62,114.57,114.30,111.57(d,J= 4.04 Hz),111.31,111.07(d,J= 3.03 Hz),66.49(2C),58.69(2C),45.26(2C),43.76(2C),37.21(2C);HRMS(ESI):m/z[M+H]+Calcd. for C31H36FN11O5:662.288 5,F(xiàn)ound:662.289 1。
N-(5-(4-(4-(7-氨基甲?;?5-氟苯并呋喃-2-羰基)哌嗪-1-基)-6-嗎啉-1,3,5-三嗪-2-基)-4-(三氟甲基)吡啶-2-基)4-甲基哌嗪-1-甲酰胺(8c)
白色固體,收率79.5%。mp:184 ~ 186 ℃;1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ∶9.97(s,1H,Ar-H),8.81(s,1H,40-NH),8.28(s,1H,12-NH2),7.95(s,1H,12-NH2),7.89(s,1H,Ar-H),7.77(dd,J= 8.2,2.7 Hz,1H,Ar-H),7.62(dd,J= 9.8,2.7Hz,1H,Ar-H),7.54(s,1H,Ar-H),3.96 ~ 3.90(m,6H,17、18、21-CH2),3.83 ~ 3.75(m,8H,20、30、31、34-CH2),3.69 ~ 3.61(m,6H,33、44、48-CH2),2.37 ~ 2.31(m,4H,45、47-CH2),2.21(s,3H,49-CH3);13C NMR(101 MHz,DMSO-d6)δ∶169.61,164.50,164.47,159.87,158.92,157.49,156.27,154.53,153.96,151.20,150.87,147.84,136.43,129.37(d,J= 10.1 Hz),125.53,124.35(d,J=275 Hz),121.66(d,J= 8.08 Hz),114.40(d,J=27.2 Hz),111.52,111.17(d,J= 25.2 Hz),109.84,66.41(2C),54.55(2C),45.67(2C),43.95(2C),43.14(2C),28.42(2C);HRMS(ESI):m/z[M+H]+Calcd. for C33H35F4N11O5:742.275 9,F(xiàn)ound:742.276 6。
N-(5-(4-(4-(7-氨基甲?;?5-氟苯并呋喃-2-羰基)哌嗪-1-基)-6-嗎啉-1,3,5-三嗪-2-基)-4-(三氟甲基)吡啶-2-基)哌嗪-1-甲酰胺(8d)
白色固體,收率70.4%。mp:218 ~ 220 ℃;1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ∶10.03(s,1H,Ar-H),8.81(s,1H,40-NH),8.26(s,1H,12-NH2),7.91(s,1H,12-NH2),7.85(s,1H,Ar-H),7.75(dd,J= 8.2,2.7 Hz,1H,Ar-H),7.61(dd,J= 9.7,2.7Hz,1H,Ar-H),7.53(s,1H,Ar-H),3.95 ~ 3.89(m,6H,17、18、21-CH2),3.80 ~ 3.75(m,6H,20、30、34-CH2),3.69 ~ 3.62(m,4H,31、33-CH2),3.61 ~3.55(m,4H,44、48-CH2),2.97 ~ 2.92(m,4H,45、47-CH2);13C NMR(101 MHz,DMSO-d6)δ∶169.59,164.50,159.87,158.93,157.49,156.23,154.53,151.22,150.87,147.84,136.77,136.45,129.37(d,J= 10.1 Hz),125.60,123.34(d,J= 275 Hz),121.65(d,J= 8.08 Hz),114.40(d,J= 27.2 Hz),111.52,111.17(d,J= 25.2 Hz),109.82,66.41(2C),44.37(4C),43.74(4C),43.44(2C);HRMS(ESI):m/z[M+H]+Calcd. for C32H33F4N11O5:728.260 2,F(xiàn)ound:728.260 8。
2-(4-(4-(6-(3-環(huán)丙基脲基)-4-(三氟甲基)吡啶-3-基)-6-嗎啉-1,3,5-三嗪-2-基)哌嗪-1-羰基)-5-氟苯并呋喃-7-甲酰胺(8e)
白色固體,收率83.4%。mp:208 ~ 210 ℃;1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ∶9.76(s,1H,Ar-H),8.78(s,1H,40-NH),8.20(s,1H,12-NH2),7.91(s,1H,12-NH2),7.86(s,1H,Ar-H),7.82(s,1H,Ar-H),7.75(dd,J= 8.1,2.7 Hz,1H,Ar-H),7.61(dd,J= 9.7,2.7 Hz,1H,Ar-H),7.53(s,1H,42-NH),3.98 ~ 3.86(m,6H,17、18、21-CH2),3.82 ~3.74(m,6H,20、30、34-CH2),3.66 ~ 3.61(m,4H,31、33-CH2),2.63 ~ 2.58(m,1H,44-CH),0.70 ~0.64(m,2H,45-CH2),0.49 ~ 0.43(m,2H,46-CH2);13C NMR(101 MHz,DMSO-d6)δ∶169.45,164.50,164.47,159.87,158.90,157.50,155.43,155.38,151.42,150.89,147.84,137.20,136.88,129.35(d,J= 9.09 Hz),124.92,123.22(d,J=274 Hz),121.65(d,J= 8.08 Hz),114.41(d,J=27.2 Hz),111.55,111.17(d,J= 25.2 Hz),108.41,66.41(2C),43.74(4C),22.78(2C),6.75(2C);HRMS(ESI):m/z[M+H]+Calcd.for C31H30F4N10O5:699.2337,F(xiàn)ound:699.234 2。
2-(4-(4-(6-(3-(2-(二甲基氨基)乙基)脲基)-4-(三氟甲基)吡啶-3-基)-6-嗎啉-1,3,5-三嗪-2-基)哌嗪-1-羰基)-5-氟苯并呋喃-7-甲酰胺(8f)
白色固體,收率85.8%。mp:222 ~ 224 ℃;1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ∶9.81(s,1H,Ar-H),8.79(s,1H,40-NH),8.17(s,1H,12-NH2),7.91(s,1H,12-NH2),7.85(s,1H,Ar-H),7.75(dd,J= 8.2,2.7 Hz,1H,Ar-H),7.61(dd,J= 9.8,2.7Hz,1H,Ar-H),7.53(s,1H,Ar-H,),7.46(s,1H,42-NH),4.01 ~ 3.86(m,6H,17、18、21-CH2),3.85 ~3.75(m,6H,20、30、34-CH2),3.69 ~ 3.61(m,4H,31、33-CH2),3.29 ~ 3.24(m,2H,45-CH2),2.41(t,J= 6.3 Hz,2H,44-CH2),2.26(s,6H,47、48-CH3);13C NMR(101 MHz,DMSO-d6)δ∶169.49,164.50,164.46,159.87,158.90,157.50,155.58,154.66,151.42,150.88,147.84,137.47(d,J= 68.6 Hz),136.50,129.35(d,J= 9.09 Hz),124.82,123.25(d,J= 275 Hz),121.65(d,J= 8.08 Hz),114.41(d,J= 27.2 Hz),111.54,111.17(d,J= 25.2 Hz),108.41,108.35,66.41(2C),58.67(2C),45.45(2C),43.73(2C),37.43(2C);HRMS(ESI):m/z[M+H]+Calcd. for C32H35F4N11O5:730.275 9,F(xiàn)ound:730.276 6。
N-(4-(4-(4-(2-氟-5-((4-氧代-3,4-二氫酞嗪-1-基)甲基)苯甲?;┻哙?1-基)-6-嗎啉-1,3,5-三嗪-2-基)苯基)-4-甲基哌嗪-1-甲酰胺(13a)
白色固體,收率81.5%。mp:188 ~ 190 ℃;1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ∶12.61(s,1H,9-NH),8.78(s,1H,46-NH),8.28 ~ 8.25(d,J= 8.0 Hz,1H,Ar-H),8.24 ~ 8.21(d,J= 8.0 Hz,2H,Ar-H),7.98(d,J= 8.0 Hz,1H,Ar-H),7.93 ~ 7.88(t,J= 8.0 Hz,1H,Ar-H),7.87 ~ 7.82(t,J= 8.0 Hz,1H,Ar-H),7.59(d,J= 8.6 Hz,2H,Ar-H),7.46(m,1H,Ar-H),7.39(dd,J= 6.5,2.3 Hz,1H,Ar-H),7.26(t,J= 9.0 Hz,1H,Ar-H),4.35(s,2H,12-CH2),3.99 ~ 3.63(m,14H,23、24、26、27、36、37、40-CH2),3.49 ~ 3.43(m,4H,39、50-CH2),3.28 ~3.24(m,2H,54-CH2),2.36 ~ 3.30(m,4H,51、53-CH2),2.21(s,3H,55-CH3);13C NMR(101 MHz,DMSO-d6)δ∶169.62,165.05,164.50,159.85,158.11,155.68,155.03,145.34,144.46,135.31,135.28(d,J= 6.06 Hz),133.96,132.20(d,J =8.08 Hz),132.00,130.01,129.57(2C),129.41(d,J= 4.04 Hz),129.09,128.40,126.55,125.96,124.22,124.04,118.80(2C),116.54,116.32,66.51(2C),54.84(2C),46.01(2C),44.00(2C),43.75,36.94(2C);HRMS(ESI):m/z[M+H]+Calcd. for C39H42FN11O4:748.340 5,F(xiàn)ound:748.340 8。
1-(2-(二甲基氨基)乙基)-3-(4-(4-(2-氟-5-((4-氧代-3,4-二氫酞嗪-1-基)甲基)苯甲?;┻哙?1-基)-6-嗎啉-1,3,5-三嗪-2-基)苯基)脲(13b)
白色固體,收率85.4%。mp:192 ~ 194 ℃;1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ∶12.61(s,1H,9-NH),9.01(s,1H,46-NH),8.30 ~ 8.21(m,3H,Ar-H),7.98(d,J= 8.1 Hz,1H,Ar-H),7.94 ~ 7.88(m,1H,Ar-H),7.86 ~ 7.80(m,1H,Ar-H),7.53 ~7.43(m,3H,Ar-H),7.38(d,J= 8.6 Hz,1H,Ar-H),7.26(t,J= 9.0 Hz,1H,Ar-H),6.22(t,J= 5.4Hz,1H,48-NH),4.35(s,2H,12-CH2),3.99 ~ 3.58(m,14H,23、24、26、27、36、37、40-CH2),3.28 ~3.16(m,4H,39、50-CH2),2.36(t,J= 6.2 Hz,2H,51-CH2),2.20(s,6H,53、54-CH3);13C NMR(101MHz,DMSO-d6)δ∶169.61,165.04,164.50,161.52,159.85,158.12,155.68,155.31,145.33,144.42,135.29(d,J= 4.04 Hz),133.95,132.24(d,J= 6.06 Hz),132.16,131.99,129.57,129.51(d,J= 4.04 Hz),129.35(2C),128.39,126.55,125.95,124.23,124.04,116.95(2C),116.53,116.32,66.51(2C),58.85(2C),45.51,45.43(2C),43.74,37.35,36.94;HRMS(ESI):m/z[M+H]+Calcd. for C38H42FN11O4:736.340 5,F(xiàn)ound:736.341 2。
1-(2-(二甲基氨基)乙基)-3-(5-(4-(4-(2-氟-5-((4-氧代-3,4-二氫酞嗪-1-基)甲基)苯甲?;┻哙?1-基)-6-嗎啉-1,3,5-三嗪-2-基)吡啶-2-基)脲(13c)
白色固體,收率81.4%。mp:180 ~ 182 ℃;1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ∶12.60(s,1H,9-NH),9.57(s,1H,Ar-H),9.10(s,1H,46-NH),8.49(s,1H,Ar-H),8.27(d,J= 7.8 Hz,1H,Ar-H),8.04 ~ 7.95(m,2H,Ar-H),7.91(t,J= 7.6 Hz,1H,Ar-H),7.84(t,J= 7.5 Hz,1H,Ar-H),7.54(d,J=8.8 Hz,1H,Ar-H),7.50 ~ 7.44(m,1H,Ar-H),7.39(dd,J= 6.5,2.3 Hz,1H,Ar-H),7.26(t,J=9.0 Hz,1H,48-NH),4.35(s,2H,12-CH2),3.97 ~3.63(m,16H,23、24、26、27、36、37、39、40-CH2),3.29 ~ 3.24(m,2H,50-CH2),2.43(s,2H,51-CH2),2.24(s,6H,53、54-CH3);13C NMR(101 MHz,DMSO-d6)δ∶168.38,164.80,164.50,159.85,158.11,156.10,155.68,154.90,148.31,145.33,138.02,135.30(d,J =3.03 Hz),133.96,132.23(d,J= 9.09 Hz),132.00,129.57,129.40(d,J=4.04 Hz),128.39,126.55,125.96,125.68,124.20,124.02,116.54,116.33,111.06,66.48(2C),58.83(2C),45.43(2C),43.76,37.38(2C),36.93(2C);HRMS(ESI):m/z[M+H]+Calcd. for C37H41FN12O4:737.335 8,F(xiàn)ound:737.336 5。
1-環(huán)丙基-3-(5-(4-(4-(2-氟-5-((4-氧代-3,4-二氫酞嗪-1-基)甲基)苯甲酰基)哌嗪-1-基)-6-嗎啉-1,3,5-三嗪-2-基)吡啶-2-基)脲(13d)
白色固體,收率86.8%。mp:236 ~ 238 ℃;1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ∶12.60(s,1H,9-NH),9.43(s,1H,Ar-H),9.11(s,1H,46-NH),8.50(s,1H,Ar-H),8.27(dd,J= 7.8,1.5 Hz,1H,Ar-H),8.12(s,1H,Ar-H),7.98(d,J= 8.0 Hz,1H,Ar-H),7.93 ~ 7.87(m,1H,Ar-H),7.84(td,J= 7.5,7.1,1.3 Hz,1H,Ar-H),7.52(d,J= 8.9 Hz,1H,Ar-H),7.49 ~ 7.43(m,1H,Ar-H),7.39(dd,J=6.5,2.3 Hz,1H,Ar-H),7.26(t,J= 9.0 Hz,1H,48-NH),4.35(s,2H,12-CH2),3.92 ~ 3.66(m,14H,23、24、26、27、36、37、40-CH2),3.26(s,2H,39-CH2),2.66 ~ 2.60(m,1H,50-CH),0.70 ~ 0.62(m,2H,51-CH2),0.50 ~ 0.42(m,2H,52-CH2);13C NMR(101 MHz,DMSO-d6)δ∶168.33,164.79,164.49,159.85,158.10,155.92,155.68,155.64,148.31,145.33,138.07,135.30(d,J= 3.03 Hz),133.96,132.19(d,J= 8.08 Hz),132.00,129.57,129.41(d,J= 4.04 Hz),128.39,126.55,125.95,125.76,124.20,124.02,116.54,116.32,111.06,66.48(2C),43.75(2C),36.93(2C),22.74(2C),6.79(2C);HRMS(ESI):m/z[M+H]+Calcd. for C36H36FN11O4∶706.293 6,F(xiàn)ound:706.294 1。
1-環(huán)丙基-3-(5-(4-(4-(2-氟-5-((4-氧代-3,4-二氫酞嗪-1-基)甲基)苯甲?;┻哙?1-基)-6-嗎啉-1,3,5-三嗪-2-基)-4-(三氟甲基)吡啶-2-基)脲(13e)
白色固體,收率81.2%。mp:228 ~ 230 ℃;1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ∶12.60(s,1H,9-NH),9.61(s,1H,Ar-H),8.79(s,1H,46-NH),8.27(d,J= 7.7 Hz,1H,Ar-H),8.13(s,1H,Ar-H),7.97(d,J= 7.9 Hz,1H,Ar-H),7.89(s,1H,Ar-H),7.83(s,1H,Ar-H),7.56(s,1H,Ar-H),7.46(s,1H,Ar-H),7.39(dd,J= 6.6,2.3 Hz,1H,Ar-H),7.25(t,J= 9.0 Hz,1H,48-NH),4.35(s,2H,12-CH2),3.86 ~ 3.64(m,14H,23、24、26、27、36、37、40-CH2),3.25(s,2H,39-CH2),2.62(d,J= 7.0 Hz,1H,50-CH),0.69(d,J= 7.1 Hz,2H,51-CH2),0.48(s,2H,52-CH2);13C NMR(101 MHz,DMSOd6)δ∶169.42,164.53,164.49,159.85,158.10,155.67,155.42,155.39,151.46,145.32,137.03(q,J= 32.3 Hz),135.30(d,J= 3.03 Hz) 133.93,132.21(d,J= 8.08 Hz),131.99,129.56,129.38,128.40,126.55,125.96,124.88,124.17,123.99,121.84,116.55,116.33,108.41(d,J= 6.06 Hz),66.40(2C),43.75(2C),36.95(2C),22.78(2C),6.75(2C);HRMS(ESI):m/z[M+H]+Calcd. for C37H35F4N11O4:774.281 0,F(xiàn)ound:774.281 8。
為了研究目標(biāo)化合物的抗腫瘤活性,測試了全部11 個化合物的酶抑制活性以及3 個化合物的體外抗細胞增殖活性。選取的細胞有野生型人乳腺癌細胞MDA-MB-231 和MDA-MB-468、BRCA 突變的人結(jié)直腸癌細胞HCC1937 和HCT116 以及對奧拉帕尼耐藥的BRCA 突變的人結(jié)直腸癌細胞HCT116R。實驗結(jié)果見表2和表3。
Table 2 Enzyme inhibition of 8a-8f and 13a-13e against PARP-1 and PI3K (n = 3)
Table 3 Effects of compound 8b,8e and 8f against tumor cell lines (± s, n = 4)
Table 3 Effects of compound 8b,8e and 8f against tumor cell lines (± s, n = 4)
Compd.8b 8e 8f Olaparib BKM120 IC50/(μmol/L)MDA-MB-231 3.61 ± 0.11 1.76 ± 0.16 0.54 ± 0.002 10.30 ± 0.80 1.77 ± 0.03 MDA-MB-468 1.30 ± 0.93 0.10 ± 0.10 0.19 ± 0.18 1.00 ± 0.15 2.72 ± 2.41 HCC1937 4.27 ± 1.17 1.11 ± 0.47 0.91 ± 0.27 11.22 ± 1.92 1.65 ± 0.47 HCT116 7.26 ± 0.08 0.99 ± 0.22 1.10 ± 0.13 4.60 ± 0.51 0.78 ± 0.05 HCT116R 6.92 ± 3.70 1.07 ± 0.71 1.22 ± 0.59 50.82 ± 0.66 1.30 ± 0.55
由表2 可知,化合物8a ~ 8f 的PARP-1 抑制活性稍弱于化合物13a ~ 13e,但化合物8e 和8f 顯示出稍好的PI3K 抑制活性。由13a ~ 13d 可知,當(dāng)芳香環(huán)的4 位沒有取代基時,由化合物13d 與PI3Kα蛋白的對接結(jié)果可知,三嗪環(huán)與吡啶環(huán)之間的夾角較小,吡啶環(huán)的2位氨基與PI3Kα 蛋白的氨基酸殘基之間未能形成氫鍵相互作用(圖4-A),因此PI3K 抑制活性大幅度降低。當(dāng)芳香環(huán)的4 位引入三氟甲基后,由化合物13e 與PI3Kα 蛋白的對接結(jié)果可知,三嗪環(huán)與吡啶環(huán)之間形成的夾角增大,吡啶環(huán)2 位氨基與PI3Kα 蛋白的氨基酸殘基之間形成了氫鍵作用(圖4-B),從而提高了PI3K 抑制活性。因此,相比于4 位無取代基的化合物13a ~13d,化合物13e 的PI3K 抑制活性明顯得到提升,但是會損失小部分的PARP-1 抑制活性。同時,由8c ~ 8f 可知,通過脲基團連接的末端片段體積或剛性不宜過大,否則也會對PI3K 的抑制活性產(chǎn)生不利影響,但是不會影響PARP-1 的抑制活性。甚至,如果在末端片段的位置有裸露的NH 基團,反而提高了PARP-1的抑制活性。
Figure 4 Binding model analysis of compound 13d and 13e with PI3Kα
根據(jù)酶抑制活性測定結(jié)果,選擇對兩個靶點的抑制活性均較好的化合物8b,8e和8f,測試它們的抗腫瘤細胞增殖活性。由表3 可知,3 個化合物對 MDA-MB-231、MDA-MB-468、HCC1937 和HCT116R 的增殖抑制活性強于陽性藥奧拉帕尼;其中8e 和8f 對HCT116R 的IC50達到1 μmol/L 水平。體外抗腫瘤活性實驗結(jié)果與酶抑制活性結(jié)果基本一致。
本研究選擇化合物8b和8f制成相應(yīng)的鹽酸鹽并進行水溶性測試。其中化合物8f的水溶性較好,為2.9 mg/mL,化合物8b 的水溶性為1.1 mg/mL,與先導(dǎo)化合物相比,化合物的水溶性得到了顯著的提升。
PARP-1 抑制劑對BRCA1/2 突變的腫瘤患者具有較好的療效,但存在臨床適應(yīng)證窄和易產(chǎn)生耐藥性等問題,從而限制了PARP-1 抑制劑的廣泛應(yīng)用。PI3K 抑制劑可以抑制BRCA1/2 的表達,從而使腫瘤細胞對PARP-1 抑制劑敏感。因此,開發(fā)PARP-1 和PI3K 雙靶點抑制劑有望拓展PARP-1 抑制劑的臨床使用范圍,解決PARP-1 抑制劑的耐藥性問題。
本研究中,以課題組前期研究獲得的PARP-1和PI3K 雙靶點化合物XW-1 和WZ-1 為先導(dǎo)物,以提高化合物水溶性為目標(biāo),通過連接脲基團并引入成鹽位點,設(shè)計合成了11個目標(biāo)化合物?;衔锝Y(jié)構(gòu)經(jīng)過1H NMR、13C NMR 和 HRMS 確證。通過PAPR-1和PI3K抑制活性評價和腫瘤細胞增殖抑制活性測定,發(fā)現(xiàn)化合物8f 不僅具有較強的PAPR-1和PI3K 抑制活性,同時對所選的5 種腫瘤細胞具有優(yōu)異的增殖抑制活性。與先導(dǎo)化合物相比,化合物8f 鹽酸鹽的水溶性得到顯著提升。本研究為進一步開發(fā)成藥性好、抑制活性強的PARP-1/PI3K雙靶點抑制劑提供了實驗依據(jù)。