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日本百脈根LjbHLH34基因克隆及耐旱功能鑒定

2023-02-07 02:22:46劉福陳誠(chéng)張凱旋周美亮張新全
草業(yè)學(xué)報(bào) 2023年1期
關(guān)鍵詞:百脈株系擬南芥

劉福,陳誠(chéng),張凱旋,周美亮*,張新全

(1.四川農(nóng)業(yè)大學(xué)草業(yè)科技學(xué)院,四川 成都 611130;2.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所,北京 100081)

日本百脈根(Lotus japonicus)是一種百脈根屬豆科牧草,與百脈根(Lotus corniculatus)、細(xì)葉百脈根(Lotus tenuis)和濕地百脈根(Lotus uliginosus)等百脈根屬植物親緣關(guān)系很近[1]。日本百脈根完整的遺傳圖譜、EST序列和參考基因組已經(jīng)建立,在其響應(yīng)不同環(huán)境變化、與微生物共生方面有較深入的研究[2-4]。百脈根屬的牧草品種在土壤貧瘠地區(qū)具有較好的適應(yīng)性,耐熱性強(qiáng),是溫涼濕潤(rùn)地區(qū)的優(yōu)良豆科牧草[5]。干旱脅迫嚴(yán)重影響植物生產(chǎn),引起牧草生產(chǎn)力和品質(zhì)的顯著下降。因此,挖掘日本百脈根抗旱耐旱的關(guān)鍵基因,從分子水平上揭示日本百脈根抗旱機(jī)制,對(duì)培育百脈根屬抗逆品種,促進(jìn)我國(guó)畜牧業(yè)健康可持續(xù)發(fā)展具有重要意義。

干旱脅迫會(huì)對(duì)植物的生長(zhǎng)、發(fā)育和生產(chǎn)力產(chǎn)生不利影響,當(dāng)植物受到其脅迫時(shí),會(huì)產(chǎn)生相應(yīng)的應(yīng)答機(jī)制來(lái)消除或減弱干旱造成的傷害;而這些應(yīng)答反應(yīng)的產(chǎn)生涉及多個(gè)基因、多種信號(hào)途徑及不同的代謝產(chǎn)物,其中轉(zhuǎn)錄調(diào)控在這個(gè)過(guò)程中起承上啟下的作用[6-8]。一些被廣泛研究的轉(zhuǎn)錄因子AP2、bZIP、NAC、NF-Y和bHLH在遭受干旱脅迫時(shí)都會(huì)顯著上調(diào)[9]。其中bHLH類轉(zhuǎn)錄因子是存在于所有真核生物中的一類轉(zhuǎn)錄因子,因其表達(dá)蛋白序列含有堿性螺旋-環(huán)-螺旋結(jié)構(gòu)域而得名,該結(jié)構(gòu)域高度保守,大約包含60個(gè)氨基酸,一般由兩個(gè)在功能上完全不同的區(qū)域組成:堿性區(qū)域和螺旋-環(huán)-螺旋結(jié)構(gòu)域,常以二聚體的形式行使功能;除了存在bHLH結(jié)構(gòu)域之外,bHLH家族蛋白往往還包含了其他的功能結(jié)構(gòu)域如ZIP結(jié)構(gòu)域,這些結(jié)構(gòu)域在蛋白與蛋白相互作用、蛋白二聚化中發(fā)揮作用[10-12]。

研究表明,bHLH類轉(zhuǎn)錄因子參與調(diào)節(jié)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、植物的生長(zhǎng)發(fā)育及逆境脅迫,例如蘋果(Malus pumila)MdCIB1(cryptochrome-interacting bHLH 1)與MdCRY2互作,參與藍(lán)光響應(yīng)和開(kāi)花時(shí)間調(diào)控,該基因也受聚乙二醇(polyethylene glycol,PEG)誘導(dǎo),過(guò)表達(dá)MdCIB1的蘋果愈傷組織對(duì)PEG處理的耐受性增強(qiáng),同時(shí)在擬南芥中(Arabidopsis thaliana)異位表達(dá)MdCIB1提高其抗旱性,表現(xiàn)為在干旱脅迫下根系較長(zhǎng)、抗氧化酶活性增強(qiáng)等[13-14]。對(duì)bHLH類轉(zhuǎn)錄因子參與植物非生物逆境脅迫調(diào)控研究發(fā)現(xiàn)bHLH轉(zhuǎn)錄因子可能從氣孔發(fā)育、根毛形成及對(duì)脫落酸(abscisic acid,ABA)的敏感性等方面參與植物對(duì)干旱脅迫的響應(yīng)[15-17]。擬南芥bHLH122轉(zhuǎn)錄因子在干旱脅迫下的表達(dá)量呈現(xiàn)顯著上調(diào),通過(guò)GUS(β-glucuronidase)分析顯示其表達(dá)部位主要在維管組織及保衛(wèi)細(xì)胞;在干旱條件下,過(guò)量表達(dá)bHLH122會(huì)使植物體內(nèi)的ABA含量升高,同時(shí)bHLH122過(guò)表達(dá)擬南芥相比野生型擬南芥對(duì)干旱脅迫有更好的耐受性[18]。在擬南芥中,bHLH轉(zhuǎn)錄因子RD22和AtAIB的表達(dá)量受ABA和PEG誘導(dǎo),同時(shí)與野生型擬南芥相比,過(guò)表達(dá)RD22和AtAIB植株對(duì)干旱脅迫的耐受性更強(qiáng)[17,19]。擬南芥AtbHLH34受非生物脅迫調(diào)控,在甘露醇和ABA處理下上調(diào);同時(shí)過(guò)表達(dá)AtbHLH34能增加擬南芥對(duì)滲透脅迫的耐受性,對(duì)外源ABA的敏感性低于野生型和RNA沉默株系[20]。水稻(Oryza sativa)OsbHLH148基因的表達(dá)量受茉莉酸、ABA、極端溫度和干旱脅迫的誘導(dǎo),在水稻中過(guò)表達(dá)可提高轉(zhuǎn)化植株對(duì)干旱的抗性[21]。

干旱是影響環(huán)境和農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的重要因素,盡管bHLH轉(zhuǎn)錄因子在調(diào)控植物耐旱性方面的研究報(bào)道很多,但針對(duì)該轉(zhuǎn)錄因子家族在日本百脈根抗旱方面的研究報(bào)道較少。在本研究中,克隆到日本百脈根LjbHLH34,揭示了其序列特征,明確了該基因在日本百脈根中的組織表達(dá)特異性以及在ABA及干旱脅迫條件下的表達(dá)特征,確定LjbHLH34蛋白的亞細(xì)胞定位和轉(zhuǎn)錄激活活性;此外,本研究將LjbHLH34轉(zhuǎn)入野生型擬南芥中,并對(duì)其陽(yáng)性轉(zhuǎn)基因植株進(jìn)行干旱處理,進(jìn)而初步分析該基因在干旱脅迫過(guò)程中的功能,為將來(lái)百脈根屬抗旱育種提供理論支撐。

1 材料與方法

1.1 試驗(yàn)材料

試驗(yàn)所用的材料日本百脈根(MG-20)、擬南芥(WT)、大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞DH5α、農(nóng)桿菌菌株GV3101、酵母菌株P(guān)J69-4A和所有使用到的載體均由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物科學(xué)研究所蕎麥(Fagopyrum esculentum)基因創(chuàng)新研究組保存提供,植物材料于2021年種植于實(shí)驗(yàn)室的溫室內(nèi),培養(yǎng)條件為22℃、16 h光照/8 h黑暗、濕度75%~80%。

1.2 試驗(yàn)方法

1.2.1 日本百脈根LjbHLH34的克隆 以擬南芥AtbHLH34蛋白序列為參考,在日本百脈根參考基因組網(wǎng)站(http://www.kazusa.or.jp/lotus/index.html)中找到一個(gè)同源基因LjbHLH34(Lj3g3v1545570.1),根據(jù)該基因序列設(shè)計(jì)特異性引物T-LjbHLH34-F/R(表1),以日本百脈根的cDNA為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)得到目的條帶,切膠回收,將回收產(chǎn)物連接到pTOPO-Blunt Simple載體(北京金百特生物技術(shù)有限公司),得到pLjbHLH34-T載體,轉(zhuǎn)化大腸感受態(tài)細(xì)胞DH5α,挑取單克隆用引物M13-F/T-LjbHLH34-R(表1)進(jìn)行菌液PCR鑒定后測(cè)序,通過(guò)序列比對(duì)得到正確的pLjbHLH34-T載體質(zhì)粒。

表1 引物序列Table 1 Primer list

1.2.2LjbHLH34生物信息學(xué)分析 對(duì)測(cè)序得到的正確序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析,首先通過(guò)ExPASy網(wǎng)站(http://web.expasy.org/protparam/)預(yù)測(cè)LjbHLH34基因編碼氨基酸的數(shù)目、蛋白相對(duì)分子質(zhì)量和等電點(diǎn),利用在線網(wǎng)站NCBI:Conserved Domain Search(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/)分析LjbHLH34基因編碼的氨基酸序列的保守結(jié)構(gòu)域;用MEGA 7.0軟件使用鄰接法(neighbor-joining,NJ)將LjbHLH34蛋白與擬南芥中的bHLH蛋白進(jìn)行進(jìn)化樹(shù)分析,采用DNAMAN 8.0軟件進(jìn)行同源蛋白序列分析。

1.2.3LjbHLH34基因的亞細(xì)胞定位 根據(jù)基因序列設(shè)計(jì)含有酶切位點(diǎn)XbaI和PstI亞細(xì)胞定位載體pAN580-LjbHLH34-F/R引物(表1),以pLjbHLH34-T質(zhì)粒為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,將擴(kuò)增產(chǎn)物連接到pAN580載體上,獲得pAN580-LjbHLH34重組質(zhì)粒,并轉(zhuǎn)化到大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞DH5α中,挑取單克隆用引物pAN580-F/pAN580-LjbHLH34-R(表1)進(jìn)行菌液PCR鑒定后測(cè)序,將測(cè)序正確的菌液用于質(zhì)粒提取,轉(zhuǎn)化擬南芥葉片原生質(zhì)體進(jìn)行瞬時(shí)表達(dá),然后通過(guò)激光共聚焦顯微鏡(LSM 980,德國(guó))觀察,使用AtH2B-Mcherry載體作為核定位Marker。擬南芥葉片原生質(zhì)體轉(zhuǎn)化方法和試劑配制參考Chen等[22]:將培養(yǎng)1月齡左右未開(kāi)花的擬南芥葉片放入配制好的酶解液中進(jìn)行酶解,然后加W5溶液[2 mmol·L-1pH=5.7的嗎啉乙磺酸(morpholine ethyl sulfonic acid,MES),154 mmol·L-1NaCl,125 mmol·L-1CaCl2和5 mmol·L-1KCl]用細(xì)胞篩(70 mm)過(guò)濾,334 r·min-1進(jìn)行離心,吸去上清液,用W5溶液洗滌2次,吸去上清液,根據(jù)需要加入MMG溶液[4 mmol·L-1pH=5.7的MES,0.4 mol·L-1D-甘露醇(D-Mannitol)和15 mmol·L-1MgCl2]懸浮制成原生質(zhì)體。在2.0 mL離心管依次加入重組質(zhì)粒(10 μg)、核定位Marker(10 μg)、原生質(zhì)體(100 μL)和PEG-calcium溶液(體積為:重組質(zhì)粒+定位Marker+100 μL原生質(zhì)體;配方為20% PEG 4000,0.2 mol·L-1D-Mannitol和100 mmol·L-1MgCl2),靜置10 min,加入1 mL W5溶 液清洗1~2次,最后加入1 mL W1(20 mmol·L-1pH=5.7的MES,0.4 mol·L-1D-Mannitol和20 mmol·L-1KCl)溶液,室溫暗培養(yǎng)過(guò)夜,在激光共聚焦顯微鏡下觀察。

1.2.4 轉(zhuǎn)錄激活活性分析 為了研究LjbHLH34的轉(zhuǎn)錄激活能力,設(shè)計(jì)含有pGBKT7載體上的NdeI和PstI酶切位點(diǎn)的pGBKT7-LjbHLH34-F/R引物(表1),以pLjbHLH34-T質(zhì)粒為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,將擴(kuò)增產(chǎn)物連接到pGBKT7載體上,獲得pGBKT7-LjbHLH34重組質(zhì)粒,并轉(zhuǎn)化到大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞DH5α中,用T7-F/pGBKT7-LjbHLH34-R(表1)進(jìn)行菌液PCR鑒定,測(cè)序正確之后提取質(zhì)粒。將重組質(zhì)粒pGBKT7-LjbHLH34+pGADT7空載和pGADT7+pGBKT7空載轉(zhuǎn)入酵母PJ69-4A感受態(tài)細(xì)胞中,涂布至SD-Leu/-Trp缺陷篩選培養(yǎng)基上,28℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)2~3 d,挑取單克隆進(jìn)行PCR鑒定,將陽(yáng)性菌液稀釋至10-1、10-2和10-33個(gè)濃度梯度,各取10 μL分別點(diǎn)在SD-Leu/-Trp和SD-Trp/-His/-Ade缺陷篩選培養(yǎng)基上,28℃培養(yǎng)箱中倒置培養(yǎng)。pGADT7+pGBKT7作為陰性對(duì)照。

1.2.5 表達(dá)分析 取5周齡的日本百脈根的根、莖、葉和整株,3個(gè)重復(fù)。提取總RNA并反轉(zhuǎn)錄成cDNA,對(duì)LjbHLH34基因在日本百脈根各個(gè)組織的表達(dá)量進(jìn)行分析。將5周齡生長(zhǎng)良好、大小一致的日本百脈根無(wú)菌苗放入加有100 μmol·L-1ABA和20% PEG-6000的MS液體培養(yǎng)基中,室溫振蕩處理0、6、12和24 h后取材,分析在ABA和PEG處理下LjbHLH34基因表達(dá)量變化。以日本百脈根的qLj-actin3-F/R(表1)作為內(nèi)參基因,根據(jù)基因序列設(shè)計(jì)熒光定量引物qPCR-F/R(表1),應(yīng)用Taq Pro Universal SYBR qPCR Master Mix熒光定量試劑盒(南京諾唯贊生物技術(shù)有限公司)進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR,采用RQ=2-ΔΔT的算法,計(jì)算目標(biāo)基因的相對(duì)表達(dá)量。

1.2.6 過(guò)表達(dá)載體的構(gòu)建及擬南芥遺傳轉(zhuǎn)化 設(shè)計(jì)含有XbaI和PstI酶切位點(diǎn)的pCAMBIA1307-LjbHLH34-F/R引物(表1),以pLjbHLH34-T質(zhì)粒為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增。將擴(kuò)增產(chǎn)物連接到pCAMBIA1307表達(dá)載體上,轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細(xì)胞,挑取單克隆用引物pCAMBIA1307-F/pCAMBIA1307-LjbHLH34-R(表1)進(jìn)行菌液PCR檢測(cè)及測(cè)序比對(duì)后,得到過(guò)表達(dá)載體pCAMBIA1307-LjbHLH34質(zhì)粒用于轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌GV3101侵染野生型擬南芥(WT)花序。

1.2.7 轉(zhuǎn)基因擬南芥的篩選及轉(zhuǎn)基因植株的檢測(cè) 將收獲到的擬南芥T0代種子消毒后播種在含有潮霉素(40 mg·L-1)抗性的MS培養(yǎng)基上,篩選出轉(zhuǎn)基因擬南芥株系并用引物pCAMBIA1307-F/pCAMBIA1307-LjbHLH34-R(表1)對(duì)這些株系進(jìn)行PCR鑒定,同時(shí)提取RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)。將陽(yáng)性轉(zhuǎn)基因株系OE-1、OE-2和OE-3進(jìn)行繁種,獲得T2代種子用于后續(xù)試驗(yàn)。

1.2.8 轉(zhuǎn)基因擬南芥株系耐旱性鑒定 將擬南芥過(guò)表達(dá)株系和野生型擬南芥經(jīng)消毒吹干鋪在MS培養(yǎng)基上,4℃暗培養(yǎng)3 d,轉(zhuǎn)入溫室豎直培養(yǎng)3 d后,選取生長(zhǎng)一致的幼苗移入含有200 mmol·L-1的MS培養(yǎng)基和對(duì)照MS培養(yǎng)基上豎直培養(yǎng)10 d后統(tǒng)計(jì)根長(zhǎng),每個(gè)處理設(shè)置3個(gè)重復(fù)。將50顆左右的過(guò)表達(dá)株系種子和WT撒在含有蛭石∶營(yíng)養(yǎng)土=1∶1的培養(yǎng)盆中,每個(gè)處理設(shè)置3個(gè)重復(fù)。正常生長(zhǎng)兩周后,分為兩組,一組正常澆水作為對(duì)照,另一組不澆水進(jìn)行干旱處理,15 d后觀察其表型變化并取樣。測(cè)定對(duì)照組和處理組的相對(duì)含水量、超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)活性和丙二醛(malondialdehyde,MDA)含量。相對(duì)含水量的測(cè)定方法是稱取葉片0.2 g,記為Wf,之后將葉片浸入水中8 h,稱其飽和鮮重Wt,再于105℃烘箱中殺青15 min,75℃條件下烘干至恒重,稱干重,記為Wd,按照公式計(jì)算相對(duì)含水量:相對(duì)含水量(%)=(Wf-Wd)/(Wt-Wd)×100[23];SOD和MDA采用超氧化物歧化酶活性檢測(cè)試劑盒(BC0170)和丙二醛活性檢測(cè)試劑盒(BC0025)檢測(cè)。同時(shí)對(duì)干旱處理后的擬南芥進(jìn)行復(fù)水3 d觀察其表型變化。

1.2.9 轉(zhuǎn)基因擬南芥相關(guān)基因的表達(dá)分析 對(duì)正常生長(zhǎng)和干旱處理15 d后的野生型和轉(zhuǎn)基因擬南芥取樣提取總RNA并反轉(zhuǎn)錄為cDNA。通過(guò)qRT-PCR技術(shù)檢測(cè)幾個(gè)逆境相關(guān)基因的表達(dá)量。

1.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析

采用Excel和GraphPad Prism 8對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析并制圖。

2 結(jié)果與分析

2.1 日本百脈根LjbHLH34的生物信息學(xué)分析

對(duì)獲得的LjbHLH34基因序列(GenBank:Lj3g3v1545570.1)進(jìn)行生物信息學(xué)分析,該基因包含一個(gè)711 bp的堿基序列,可編碼236個(gè)氨基酸,蛋白質(zhì)的分子量為25777.16 Da,理論等電點(diǎn)6.19,含有兩個(gè)結(jié)構(gòu)域:bHLH_AtILR3_like(79-154)和BRLZ(139-172)(圖1A)。進(jìn)化樹(shù)分析結(jié)果表明,LjbHLH34與擬南芥bHLHⅣ亞家族聚為一類,并與擬南芥中的AtbHLH34和AtbHLH104親緣關(guān)系較近(圖1B)。多重序列比對(duì)結(jié)果表明,LjbHLH34與其他植物中的同源蛋白都具有保守的bHLH結(jié)構(gòu)域(圖1C)。

圖1 LjbHLH34蛋白序列分析Fig.1 Sequence analysis of LjbHLH34

2.2 日本百脈根LjbHLH34基因的亞細(xì)胞定位

將融合表達(dá)載體pAN589-LjbHLH34-GFP和核定位MarkerAtH2B-Mcherry共轉(zhuǎn)化擬南芥葉片原生質(zhì)體進(jìn)行瞬時(shí)表達(dá)。通過(guò)激光共聚焦顯微鏡觀察,結(jié)果顯示融合表達(dá)載體pAN589-LjbHLH34-GFP僅在細(xì)胞核中存在綠色熒光(green fluorescent protein,GFP),與核標(biāo)記Marker重疊。綜上可知LjbHLH34定位于細(xì)胞核中(圖2)。

圖2 LjbHLH34的亞細(xì)胞定位Fig.2 Subcellular localization of LjbHLH34

2.3 LjbHLH34基因的表達(dá)特性

通過(guò)檢測(cè)LjbHLH34在日本百脈根不同組織中的表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)該基因在日本百脈根幼苗的根系、莖和葉片中均有不同程度的表達(dá),其在根中的表達(dá)量最高,其次是葉,在莖中表達(dá)量最少(圖3A)。對(duì)ABA和PEG處理0、6、12和24 h之后的日 本 百脈根的 總RNA進(jìn)行qRT-PCR分 析 的結(jié)果顯 示:LjbHLH34基因 隨 著ABA和PEG處理時(shí)間的增加呈現(xiàn)先上調(diào)后下調(diào)的表達(dá)趨勢(shì),且均在12 h表達(dá)量最高(圖3B,C)。

圖3 LjbHLH34在日本百脈根中的表達(dá)模式Fig.3 Expression pattern of LjbHLH34 in L.japonicus

2.4 LjbHLH34轉(zhuǎn)錄激活活性分析

為了研究LjbHLH34是否有轉(zhuǎn)錄激活活性,將構(gòu)建好的重組質(zhì)粒pGBKT7-LjbHLH34+pGADT7空載、pGADT7+pGBKT7空載轉(zhuǎn)入酵母PJ69-4A感受態(tài)中,在SD-Leu/-Trp和SD-Trp/-His/-Ade缺陷篩選培養(yǎng)基上觀察酵母菌株的生長(zhǎng)情況。結(jié)果顯示,在SD-Leu/-Trp培養(yǎng)基上轉(zhuǎn)入重組質(zhì)粒pGBKT7-LjbHLH34+pGADT7空載質(zhì)粒、pGADT7+pGBKT7空載質(zhì)粒的酵母菌株都能夠正常生長(zhǎng),而轉(zhuǎn)入重組質(zhì)粒pGBKT7-LjbHLH34+pGADT7空載質(zhì)粒的酵母菌株在SD-Trp/-His/-Ade缺陷篩選培養(yǎng)基正常生長(zhǎng),轉(zhuǎn)入pGADT7+pGBKT7空載質(zhì)粒的酵母菌株不能生長(zhǎng)(圖4),表明LjbHLH34轉(zhuǎn)錄因子具有轉(zhuǎn)錄激活活性。

圖4 LjbHLH34轉(zhuǎn)錄因子轉(zhuǎn)錄激活活性Fig.4 Transcriptional activation activity of LjbHLH34 transcription factor

2.5 轉(zhuǎn)LjbHLH34基因擬南芥的鑒定

采取花序浸染法轉(zhuǎn)化野生型擬南芥(WT),通過(guò)篩選獲得4個(gè)轉(zhuǎn)基因株系,并對(duì)這幾個(gè)轉(zhuǎn)基因株系的DNA進(jìn)行PCR檢測(cè),結(jié)果顯示野生型擬南芥沒(méi)有擴(kuò)增出目的條帶,而轉(zhuǎn)基因株系均擴(kuò)增出目的條帶(圖5A);利用qRTPCR對(duì)過(guò)表達(dá)植株進(jìn)行表達(dá)量檢測(cè),得到3個(gè)過(guò)表達(dá)OE-1、OE-2和OE-3轉(zhuǎn)基因擬南芥株系(圖5B)。

圖5 轉(zhuǎn)LjbHLH34基因擬南芥的鑒定Fig.5 Identification of transgenic A.thaliana with LjbHLH34

續(xù)圖1 LjbHLH34蛋白序列分析Continued Fig.1 Sequence analysis of LjbHLH34

2.6 干旱脅迫下轉(zhuǎn)LjbHLH34基因擬南芥的耐旱性表型

根是植物吸收水分和營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的主要器官,也是植物最早對(duì)干旱脅迫信號(hào)作出反應(yīng)的部分。本研究通過(guò)甘露醇(D-Mannitol)模擬干旱條件對(duì)LjbHLH34轉(zhuǎn)基因擬南芥株系的根長(zhǎng)進(jìn)行檢測(cè)。將轉(zhuǎn)基因擬南芥株系和野生型擬南芥在普通MS和含有200 mmol·L-1D-Mannitol的MS固體培養(yǎng)基上豎直培養(yǎng)10 d,發(fā)現(xiàn)在普通MS培養(yǎng)基中,轉(zhuǎn)基因株系與對(duì)照的根長(zhǎng)沒(méi)有明顯區(qū)別(圖6A);而在200 mmol·L-1D-Mannitol處理下,3個(gè)轉(zhuǎn)基因株系的根長(zhǎng)明顯長(zhǎng)于野生型,分別是野生型的1.41、1.50和1.52倍(圖6A,B)。

此外,本研究還對(duì)轉(zhuǎn)基因擬南芥進(jìn)行了土壤干旱試驗(yàn),進(jìn)一步了解其抗旱能力。將正常生長(zhǎng)的擬南芥幼苗進(jìn)行干旱處理15 d后,3個(gè)轉(zhuǎn)基因株系(OE-1,OE-2和OE-3)和野生型擬南芥在正常澆水的情況下生長(zhǎng)無(wú)明顯差異;在干旱脅迫下,野生型擬南芥地上部分的萎蔫程度比轉(zhuǎn)基因株系嚴(yán)重;復(fù)水后,野生型和轉(zhuǎn)基因株系慢慢轉(zhuǎn)綠,但轉(zhuǎn)基因株系的葉片明顯比野生型綠(圖7)。從LjbHLH34轉(zhuǎn)基因株系在干旱脅迫下的表型可以得出LjbHLH34能提高植物的耐旱性。

圖7 干旱脅迫后擬南芥表型Fig.7 Phenotypic of A.thaliana under drought stress

2.7 在干旱脅迫下LjbHLH34轉(zhuǎn)基因擬南芥的生理指標(biāo)變化

相對(duì)含水量可以反映植物體內(nèi)水分情況,SOD是植物細(xì)胞內(nèi)重要的抗氧化酶,而MDA作為氧化脅迫的主要產(chǎn)物會(huì)破壞生物膜的結(jié)構(gòu)和功能。為了進(jìn)一步研究轉(zhuǎn)基因擬南芥株系的耐旱性,測(cè)定了經(jīng)過(guò)15 d干旱處理的轉(zhuǎn)基因株系和野生型擬南芥的相對(duì)含水量、SOD活性和MDA含量。結(jié)果顯示,干旱處理后,轉(zhuǎn)基因擬南芥株系中的相對(duì)含水量和SOD活性顯著高于野生型擬南芥,而MDA含量顯著低于野生型擬南芥(圖8)。干旱脅迫下LjbHLH34轉(zhuǎn)基因擬南芥中含水量、SOD和丙二醛的變化,表明過(guò)表達(dá)LjbHLH34可以通過(guò)提高細(xì)胞內(nèi)的防御成分和減少傷害物質(zhì)的形成來(lái)抵抗干旱脅迫給植物帶來(lái)的氧化傷害。

圖8 干旱脅迫下轉(zhuǎn)基因擬南芥的生理指標(biāo)Fig.8 Physiological indexes of transgenic A.thaliana under drought stress

2.8 干旱處理下LjbHLH34轉(zhuǎn)基因擬南芥中抗性相關(guān)基因的表達(dá)分析

為了研究在干旱條件下LjbHLH34轉(zhuǎn)基因擬南芥株系對(duì)其他調(diào)節(jié)抗逆相關(guān)基因的影響,本研究分析了AtCAT1、AtCAT3和AtRD22這3個(gè) 基 因 的 表 達(dá) 水 平。結(jié) 果 顯 示,在 干 旱 處 理15 d后AtCAT1、AtCAT3和AtRD22在LjbHLH34轉(zhuǎn)基因擬南芥株系中的表達(dá)水平明顯高于野生型(圖9)。在過(guò)表達(dá)LjbHLH34轉(zhuǎn)基因植株中,逆境相關(guān)基因的表達(dá)水平受到相當(dāng)程度的誘導(dǎo),推測(cè)過(guò)表達(dá)LjbHLH34可以通過(guò)調(diào)節(jié)脅迫應(yīng)答基因的表達(dá)來(lái)提高植物的抗旱性。

圖9 干旱處理下抗性相關(guān)基因的表達(dá)Fig.9 Expression of resistance related genes under drought treatment

3 討論

bHLH蛋白最初是在小鼠中發(fā)現(xiàn)并分離鑒定出來(lái)的,隨后在酵母和植物中也相繼被發(fā)現(xiàn)和研究[24-25]。在擬南芥中發(fā)現(xiàn)了至少162種bHLH蛋白,分為bHLHⅠ~bHLHⅫ共12個(gè)不同的亞家族[11]。擬南芥bHLHⅣ亞家族的成員有一個(gè)與第二個(gè)bHLH螺旋基序相鄰的高度保守的亮氨酸拉鏈基序[leucine zipper(ZIP)motif],預(yù)測(cè)該結(jié)構(gòu)域可以使蛋白質(zhì)二聚化[11,26]。在本研究中,系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析結(jié)果表明,LjbHLH34與擬南芥bHLH蛋白第Ⅳ亞家族聚為一類,且與擬南芥中的AtbHLH34和AtbHLH104親緣關(guān)系較近,對(duì)三者氨基酸序列進(jìn)行比對(duì),結(jié)果表明LjbHLH34與AtbHLH34和AtbHLH104都具有bHLH家族特有的bHLH結(jié)構(gòu)域,同時(shí)各同源蛋白在N末端和C末端表現(xiàn)出明顯的差異;其中LjbHLH34與AtbHLH34同源性最高,預(yù)示LjbHLH34蛋白在植物生長(zhǎng)過(guò)程中與AtbHLH34發(fā)揮著相似或相近的生物學(xué)功能。同時(shí)使用NCBI在線分析LjbHLH34氨基酸的保守域,發(fā)現(xiàn)該基因除了具備bHLH_AtILR3_like結(jié)構(gòu)域外,還存在bHLHⅣ亞家族成員中的一個(gè)ZIP基序(basic region leucin zipper),推測(cè)該基序可能在LjbHLH34基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控方面行使某種特定的功能。LjbHLH34定位在細(xì)胞核中,暗示LjbHLH34與其他轉(zhuǎn)錄因子一樣在細(xì)胞核中行使功能。

在對(duì)bHLH蛋白研究中,發(fā)現(xiàn)部分家族成員可以通過(guò)結(jié)合上游基因啟動(dòng)子元件激活下游相關(guān)基因來(lái)調(diào)控生長(zhǎng)發(fā)育或?qū)δ婢趁{迫的響應(yīng),例如Inducer of CBF Expression(ICE1,bHLH116)轉(zhuǎn)錄因子直接結(jié)合CBF/DREB1基因的啟動(dòng)子,通過(guò)獨(dú)立ABA途徑激活其轉(zhuǎn)錄以提高植物的耐寒性[27]。擬南芥AtbHLH34在體外與AtPGR基因啟動(dòng)子5′-GAGA-3′元件相互作用并激活A(yù)tPGR的轉(zhuǎn)錄,作為連接葡萄糖和非生物脅迫的調(diào)節(jié)因子來(lái)發(fā)揮作用[20]。本研究通過(guò)酵母試驗(yàn)發(fā)現(xiàn)LjbHLH34轉(zhuǎn)錄因子具有轉(zhuǎn)錄激活活性,推測(cè)該基因可能具有結(jié)合上游基因的啟動(dòng)子的功能并能激活下游基因的表達(dá)來(lái)調(diào)控相關(guān)功能。

有報(bào)道顯示bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族基因的表達(dá)受外界因素的影響,如干旱、滲透脅迫和外源植物激素等,如擬南芥AtbHLH34、AtbHLH104和AtbHLH112基因的表達(dá)受ABA的誘導(dǎo),同時(shí)AtbHLH34和AtbHLH112也受干旱的誘導(dǎo)[20,28-29],且它們?cè)诓煌幚頃r(shí)間下表達(dá)量不同。在本試驗(yàn)中,LjbHLH34基因隨著ABA和PEG處理時(shí)間的增加呈現(xiàn)先上調(diào)后下調(diào)的表達(dá)趨勢(shì),推測(cè)該基因受PEG和ABA誘導(dǎo),對(duì)脅迫響應(yīng)存在時(shí)間的特異性。

過(guò)表達(dá)AtbHLH92能適當(dāng)提高擬南芥對(duì)NaCl和滲透脅迫的耐性,耐性表型主要表現(xiàn)在與野生型擬南芥相比,轉(zhuǎn)基因植株的根長(zhǎng)在NaCl和甘露醇脅迫下顯著增加[30]。蘋果MdbHLH130通過(guò)調(diào)節(jié)煙草(Nicotiana tabacum)氣孔關(guān)閉和活性氧清除作為水分脅迫反應(yīng)的積極調(diào)節(jié)因子[31],玉米(Zea mays)ZmPTF1通過(guò)促進(jìn)根系發(fā)育和ABA的合成來(lái)調(diào)節(jié)耐旱性[32]。過(guò)表達(dá)AtAIB植株在干旱脅迫10 d后,轉(zhuǎn)基因的葉片萎蔫程度比對(duì)照野生型擬南芥小,更能耐受干旱脅迫[19]。所以為了更好地了解LjbHLH34基因的功能和轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制,本研究從日本百脈根中克隆到該基因,利用花序浸染法進(jìn)行轉(zhuǎn)化,獲得了轉(zhuǎn)基因擬南芥株系。在200 mmol·L-1D-Mannitol模擬干旱脅迫下,LjbHLH34轉(zhuǎn)基因擬南芥株系的根長(zhǎng)顯著長(zhǎng)于野生型擬南芥的根長(zhǎng);同時(shí)在干旱處理15 d后,轉(zhuǎn)基因株系的葉片萎蔫程度明顯比野生型小,這與AtbHLH92和AtAIB調(diào)控植物耐旱類似。通過(guò)對(duì)轉(zhuǎn)基因擬南芥的耐旱表型鑒定,認(rèn)為過(guò)表達(dá)LjbHLH34可以適當(dāng)提高擬南芥對(duì)干旱脅迫的耐受性。

為了進(jìn)一步探究在干旱脅迫下LjbHLH34過(guò)表達(dá)引起的生理生化變化,測(cè)定了在干旱脅迫后轉(zhuǎn)基因株系的相對(duì)含水量、SOD活性和丙二醛含量。相對(duì)含水量是衡量植物體內(nèi)水分狀況的重要生理指標(biāo)[33],與對(duì)照相比野生型和LjbHLH34轉(zhuǎn)基因擬南芥的相對(duì)含水量在干旱處理后均降低,但轉(zhuǎn)基因擬南芥的相對(duì)含水量高于野生型。在植物受到干旱脅迫時(shí),會(huì)打破作為逆境脅迫響應(yīng)的重要介質(zhì)活性氧(reactive oxygen species,ROS)的產(chǎn)生和清除的動(dòng)態(tài)平衡,導(dǎo)致ROS在細(xì)胞內(nèi)過(guò)度積累,使細(xì)胞膜受到傷害[34]。SOD是植物重要的抗氧化酶,其活性的升高與植物抗旱能力相關(guān)[35];丙二醛含量作為檢測(cè)膜脂過(guò)氧化的生理指標(biāo),在相同脅迫條件下,其含量越低,植物的抗旱性越強(qiáng)。在干旱處理后,SOD活性明顯升高,與野生型相比,LjbHLH34轉(zhuǎn)基因擬南芥積累了更多的SOD,說(shuō)明LjbHLH34過(guò)表達(dá)株系具有更高的活性氧清除能力。丙二醛含量也在干旱處理后明顯增加,但轉(zhuǎn)基因株系的含量顯著低于野生型擬南芥,說(shuō)明轉(zhuǎn)基因擬南芥植株中的細(xì)胞膜損害程度低于野生型。

在干旱脅迫刺激下轉(zhuǎn)錄因子會(huì)不斷合成,將響應(yīng)的干旱脅迫信號(hào)傳遞和放大,最終誘導(dǎo)響應(yīng)干旱基因的表達(dá),從而引起植物生理生化的改變,使植物產(chǎn)生抗旱性[36]。為了進(jìn)一步探討LjbHLH34提高轉(zhuǎn)基因擬南芥的抗旱性的機(jī)制,比較了轉(zhuǎn)基因擬南芥和野生型中幾個(gè)關(guān)于氧化防御主要酶基因和其他抗旱相關(guān)的基因。CAT1和CAT3編碼過(guò)氧化氫酶蛋白,過(guò)氧化氫酶(catalase,CAT)、SOD和過(guò)氧化物酶(peroxidase,POD)一起構(gòu)成清除超氧自由基和過(guò)氧化氫的防御系統(tǒng)[37]。NmIG1過(guò)表達(dá)植株在干旱脅迫時(shí)SOD1、CAT1、CAT2和APX1的表達(dá)水平上升,從而增加抗氧化防御成分來(lái)更好地保護(hù)和防止ROS的損害[38];過(guò)表達(dá)AtCAT3可以顯著提高擬南芥的抗旱性,而act3突變體表現(xiàn)出與過(guò)表達(dá)植株相反的表型[39]。干旱處理后LjbHLH34轉(zhuǎn)基因擬南芥植株中CAT1和CAT3的表達(dá)水平比WT高,反映出過(guò)表達(dá)株系中抗氧化防御成分增多,ROS清除能力增強(qiáng)。ABA作為脅迫信號(hào)在調(diào)節(jié)植物的干旱反應(yīng)中起重要作用,RD22轉(zhuǎn)錄因子在內(nèi)源ABA積累過(guò)程中被轉(zhuǎn)錄,作為逆境條件下ABA信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的轉(zhuǎn)錄激活因子,過(guò)表達(dá)RD22可以提高植株對(duì)干旱的耐受性[40]。在干旱脅迫后3個(gè)LjbHLH34轉(zhuǎn)基因植株中RD22的表達(dá)水平顯著高于WT。綜上所述,在過(guò)表達(dá)LjbHLH34轉(zhuǎn)基因植株中,抗氧化酶編碼基因和其他逆境相關(guān)基因的表達(dá)水平受到相當(dāng)程度的誘導(dǎo),推測(cè)過(guò)表達(dá)LjbHLH34可以通過(guò)調(diào)節(jié)脅迫應(yīng)答基因的表達(dá),在抗旱方面發(fā)揮積極作用。

4 結(jié)論

生物信息學(xué)分析表明,LjbHLH34轉(zhuǎn)錄因子與擬南芥bHLHⅣ亞家族聚為一類,并與擬南芥中的AtbHLH34和AtBHLH104親緣關(guān)系較近;該基因受PEG和ABA誘導(dǎo),定位于細(xì)胞核中且有轉(zhuǎn)錄激活活性。在甘露醇處理下,過(guò)表達(dá)LjbHLH34轉(zhuǎn)基因擬南芥的根長(zhǎng)明顯長(zhǎng)于野生型;同時(shí)在土壤干旱處理15 d后,過(guò)表達(dá)LjbHLH34轉(zhuǎn)基因株系的生長(zhǎng)情況明顯比野生型的好,轉(zhuǎn)基因擬南芥的相對(duì)含水量和SOD活性顯著高于野生型擬南芥,丙二醛積累顯著低于野生型。此外,在土壤干旱處理后,3個(gè)與抗逆相關(guān)基因AtCAT1、AtCAT3和AtRD22在轉(zhuǎn)基因中的表達(dá)量顯著升高。綜上所述,在干旱脅迫條件下,LjbHLH34轉(zhuǎn)錄因子在植物中可能起到了正調(diào)控的作用。

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