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PCR技術(shù)在食品微生物檢測中的應(yīng)用

2022-12-06 10:04周振杰
現(xiàn)代食品 2022年11期
關(guān)鍵詞:沙門氏菌引物模板

◎ 周振杰

(甘肅省莊浪縣市場監(jiān)督管理局(甘肅省莊浪縣食品藥品稽查局),甘肅 莊浪 744699)

在食品微生物檢測工作中采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Reaction,PCR)技術(shù)時,應(yīng)形成正確的技術(shù)應(yīng)用認(rèn)知,制定完善的技術(shù)方案,通過有效的措施提高食品微生物檢測工作的效率,發(fā)揮現(xiàn)代化技術(shù)的作用,確保能及時發(fā)現(xiàn)食品微生物問題,并有效解決和應(yīng)對,為保證食品質(zhì)量、維護(hù)人們的身體健康和生命安全夯實(shí)基礎(chǔ)。

1 PCR技術(shù)在食品微生物檢測中的應(yīng)用

1.1 大腸桿菌的準(zhǔn)確檢測

傳統(tǒng)的食品微生物檢測技術(shù)能對大腸桿菌進(jìn)行檢測,但檢測范圍狹窄,而采用PCR技術(shù)能在檢測常規(guī)大腸桿菌的基礎(chǔ)上,準(zhǔn)確檢測出引起人們腸出血的大腸桿菌類別,為食品質(zhì)量和安全管理提供一定的保障。

1.2 沙門氏菌的有效檢測

沙門氏菌具有一定的傳染性,且對人體的危害非常嚴(yán)重,甚至有致死性的危害,因此對其進(jìn)行有效檢測非常重要。而多重類型的PCR技術(shù)在應(yīng)用過程中,可確保檢測結(jié)果的精確度和精準(zhǔn)性,增強(qiáng)整體檢測工作的有效性和可靠性。

1.3 非致病菌的合理檢測

非致病菌主要涉及乳酸菌,是在自然界廣泛存在且具有一定學(xué)術(shù)研究價值的菌類,與人們的日常生活、生產(chǎn)、食品和醫(yī)療等有密切關(guān)聯(lián)。采用PCR技術(shù)開展乳酸菌的檢測工作,不僅能準(zhǔn)確歸納分析其具體規(guī)律,還能提升整體檢測工作的效率和效果。

此外,在食品檢測過程中采用先進(jìn)的PCR技術(shù),還能提升各項(xiàng)檢測工作的便利性、改善目前的工作現(xiàn)狀、增強(qiáng)檢測工作的精確性和科學(xué)性,在滿足衛(wèi)生檢測工作標(biāo)準(zhǔn)的同時,還能促使食品安全管理工作的有效落實(shí)和全面開展。

2 PCR技術(shù)分析

2.1 常規(guī)PCR技術(shù)

常規(guī)的PCR技術(shù)在實(shí)際應(yīng)用的過程中,主要是設(shè)置DNA模板和引物,制備緩沖液材料和MgCl2溶液,將各類材料有機(jī)整合成為反應(yīng)混合物,通過熱穩(wěn)定DNA聚合酶進(jìn)行催化處理,對寡核苷酸引物界定出來的DNA片段進(jìn)行擴(kuò)增處理。此類擴(kuò)增操作是將模板DNA作為基礎(chǔ)部分,進(jìn)行引物的變性反應(yīng)、退火反應(yīng)和延伸反應(yīng)。在循環(huán)操作的情況下,使目標(biāo)DNA片段出現(xiàn)擴(kuò)增的現(xiàn)象。通常情況下,各個反應(yīng)周期出現(xiàn)的DNA片段都可作為下個循環(huán)的模板,所以PCR技術(shù)在應(yīng)用期間所產(chǎn)生的產(chǎn)物是以指數(shù)形式增加。例如,在食品微生物檢測過程中使用常規(guī)PCR技術(shù),可有效檢測沙門氏菌,按照沙門氏菌基因設(shè)置引物,可有效檢測沙門氏菌、多種血清型與菌屬的非沙門氏菌,檢測的準(zhǔn)確性較高。

2.2 多重PCR技術(shù)

多重PCR技術(shù)在實(shí)際應(yīng)用過程中和常規(guī)技術(shù)的應(yīng)用原理相同,不同之處是在相同反應(yīng)體系內(nèi)設(shè)置一對或以上的特異類型引物,構(gòu)建和各個引物特異性進(jìn)行互補(bǔ)的模板,即可在相同反應(yīng)管內(nèi)擴(kuò)增多條目標(biāo)DNA片段。此技術(shù)不僅能保留常規(guī)技術(shù)的特異性和敏感性優(yōu)勢,還能簡化檢測工作的步驟、減少試劑的使用劑量、一次性同時擴(kuò)增多種需要檢測的微生物,因此在食品微生物檢測期間采用多重PCR技術(shù),能同時檢測多種微生物基因,減少工作人員的工作量。但是,多重PCR技術(shù)在應(yīng)用過程中存在不足之處,如擴(kuò)增處理的效率較低、缺乏一定的敏感性。在擴(kuò)增過程中需要摸索反應(yīng)條件,可能會發(fā)生不同引物之間相互干擾的問題,因此需要結(jié)合具體情況探索多重PCR技術(shù)的應(yīng)用措施和方法。例如,在食品中大腸菌群的檢測過程中采用多重PCR技術(shù),可利用點(diǎn)對點(diǎn)的方式設(shè)置固定性多聚dT尾捕捉探針,配合使用生物素進(jìn)行擴(kuò)增DNA標(biāo)記處理,達(dá)到準(zhǔn)確檢測食品微生物的目的。

2.3 RT-PCR技術(shù)

逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)技術(shù)的原理是提取食品組織,或提取食品細(xì)胞內(nèi)的總RNA,將其中所存在的mRNA作為模板,利用dT或隨機(jī)引物,借助逆轉(zhuǎn)錄酶將提取的物質(zhì)轉(zhuǎn)錄成為cDNA,再將其作為模板實(shí)現(xiàn)PCR擴(kuò)增的目的,明確目標(biāo)檢測基因的情況。在食品微生物檢測過程中采用此技術(shù)能提升RNA檢測的靈敏度,甚至能提升多個數(shù)量級,準(zhǔn)確分析微量RNA樣本。例如,在食品微生物檢測的過程中可通過RTPCR技術(shù)進(jìn)行大腸桿菌噬菌體的檢測分析,將F-RNA平板作為陽性結(jié)果數(shù)據(jù)值的依據(jù),在SC(Somatic Coliphage)噬菌體和F-RNA(F-specific RNA)噬菌體混合液內(nèi),可準(zhǔn)確、有效檢測F-RNA噬菌體[1]。

2.4 免疫PCR技術(shù)

免疫PCR技術(shù)是將DNA分子作為主要標(biāo)記物,在進(jìn)行一般免疫反應(yīng)的基礎(chǔ)上,還可有效完成PCR擴(kuò)增操作、電泳分析操作,整體的免疫試驗(yàn)效果較高。在食品微生物檢測過程中采用免疫PCR技術(shù),可提升系統(tǒng)的擴(kuò)增性能,改善抗原抗體反應(yīng)的特異性,最大程度地增強(qiáng)檢測抗原應(yīng)用的靈敏度,且由于所有DNA分子都屬于可選擇性的固定分子,合成一對引物即可完成操作,可避免在更換檢測對象過程中還需更換引物的問題,簡化了操作流程和操作模式。免疫PCR檢測技術(shù)的應(yīng)用,通??蓪⑸锼禺?dāng)作連接分子,而生物素在應(yīng)用過程中具備獨(dú)立性的結(jié)合點(diǎn)位,其中一個點(diǎn)位能和DNA分子結(jié)合,另外一個點(diǎn)位能和抗原-抗體復(fù)合物中的親和素之間相互結(jié)合,使DNA分子與抗原-抗體親和素相互整合,最終生成抗原、抗體、親和素、生物素和DNA之間相互融合的復(fù)合物,再進(jìn)行PCR擴(kuò)增處理,對DNA進(jìn)行合理地標(biāo)記即可。

2.5 巢式PCR技術(shù)

巢式PCR技術(shù)需構(gòu)建兩套引物達(dá)到PCR擴(kuò)增處理的目的,通過內(nèi)部和外部兩對引物前后進(jìn)行靶基因片段的擴(kuò)增處理,先使用其中一套引物擴(kuò)增20個左右的循環(huán),再利用已經(jīng)完成擴(kuò)增的DNA片段,進(jìn)入另外一套引物的擴(kuò)增循環(huán),循環(huán)20個左右。在此期間第二套引物的設(shè)計(jì)片段位置是在第一套引物的擴(kuò)增片段內(nèi),因此可將第一套引物稱作外引物,第二套引物稱作內(nèi)引物。此外,巢式PCR技術(shù)的應(yīng)用不僅能提升整體反應(yīng)的特異性,還能獲得非常豐富的特異靶序列,提高整體檢測的敏感度,在食品微生物檢測的過程中,能有效進(jìn)行基因靶DNA的單拷貝擴(kuò)增處理,提升整體檢測效率和準(zhǔn)確性[2]。

采用巢式PCR技術(shù)可在首次擴(kuò)增反應(yīng)完成后開啟反應(yīng)管,去除前一套引物,再設(shè)置另一套引物,整個操作流程較為煩瑣,很容易出現(xiàn)反應(yīng)系統(tǒng)污染的問題,所以目前部分技術(shù)人員在食品微生物檢測過程中對巢式PCR技術(shù)進(jìn)行了改進(jìn),通過引物的改進(jìn)使外引物退火溫度比內(nèi)引物高,從最開始的反應(yīng)階段就將兩套引物同時設(shè)置在反應(yīng)系統(tǒng)內(nèi),外引物在退火溫度的影響下形成雙溫循環(huán)擴(kuò)增,而內(nèi)引物不能和模板之間形成較為穩(wěn)定的雙鏈,所以不會起到相應(yīng)的作用。在外引物擴(kuò)增反應(yīng)完成后,再設(shè)置低火溫的循環(huán)處理,在退火溫度較低的情況下,內(nèi)引物開始發(fā)生反應(yīng),多次循環(huán)逐漸減小變性溫度,這樣能預(yù)防在整體反應(yīng)過程中PCR最開始的循環(huán)出現(xiàn)原始樣本模板序列產(chǎn)物解鏈的問題,以免內(nèi)引物成為外引物的模板,增強(qiáng)檢測效果的同時彌補(bǔ)了常規(guī)技術(shù)的不足,提升食品微生物檢測工作的質(zhì)量和水平[3]。

3 PCR技術(shù)在食品微生物檢測中應(yīng)用的基礎(chǔ)保障

3.1 合理選擇儀器設(shè)備

在進(jìn)行食品微生物檢測前,應(yīng)結(jié)合PCR技術(shù)的應(yīng)用特點(diǎn)和情況,科學(xué)選擇儀器設(shè)備,確保所選用的儀器設(shè)備可進(jìn)行食品微生物的快速檢測,精確檢驗(yàn)菌落的總體數(shù)量,精確度控制在合理范圍內(nèi),重復(fù)性維持在5%以內(nèi),同時還需結(jié)合食品的特點(diǎn)進(jìn)行檢測儀器設(shè)備的選擇。例如,牛奶、面包、豆?jié){和果汁等可采用微生物分子檢測儀設(shè)備;食品中的沙門氏菌、大腸埃希菌、蠟樣芽孢桿菌等檢測可采用多孔板儀器設(shè)備進(jìn)行多次試驗(yàn)分析。同時,在應(yīng)用該技術(shù)過程中還可構(gòu)建多重串聯(lián)類型的實(shí)時性熒光定量檢測設(shè)備,如聯(lián)合使用試驗(yàn)試劑盒、冰箱、滅菌器、梯度儀和核酸電泳儀等,并且在全封閉的環(huán)境下檢測,避免發(fā)生檢測結(jié)果假陽性或假陰性的問題,提升整體檢測分析的精確度[4]。

3.2 合理選擇試驗(yàn)方法

食品微生物檢測的過程中采用PCR技術(shù),應(yīng)重點(diǎn)選擇合理的試驗(yàn)檢測的方法,確保檢測工作的有效開展。例如,采用PCR技術(shù)檢測肉制品中的微生物,可分為以下步驟。①取食品樣本,放入蒸餾水中,加熱攪拌后使樣本溶解,再在高溫、高壓的環(huán)境中進(jìn)行滅菌。②使用滅菌純水稀釋試驗(yàn)材料,放置在規(guī)定的溫度環(huán)境中保存,將硼酸等物質(zhì)放置在蒸餾水內(nèi),調(diào)整pH值,確保pH值在穩(wěn)定的范圍內(nèi),然后在高壓滅菌室內(nèi)存儲。③制作瓊脂糖凝膠。稱取數(shù)量符合規(guī)定標(biāo)準(zhǔn)的瓊脂糖,加入反應(yīng)材料,通過微波爐加熱處理,等待所有瓊脂糖溶解后,注入模具內(nèi)進(jìn)行冷卻。再稱取一定數(shù)量的瓊脂糖,在蒸餾水中溶解,嚴(yán)格控制蒸餾水的含量,放置在高溫環(huán)境中進(jìn)行滅菌處理,滅菌操作時間符合標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范。④構(gòu)建完善的PCR檢測體系,對檢測靶基因擴(kuò)增處理,將需要檢測的目標(biāo)菌種制作成模板,混合溶液內(nèi)存在的多種菌種,形成多重性的PCR反應(yīng)程序和體系,結(jié)合檢測結(jié)果進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)曲線的繪制,獲得相應(yīng)的擴(kuò)增效率指標(biāo)。再按照稀釋倍數(shù)的特點(diǎn)和情況,明確菌落計(jì)算數(shù)據(jù)結(jié)果,每隔一段時間完成三重PCR檢測的任務(wù),如果變異系數(shù)能維持在合理范圍內(nèi),則證明使用的檢測措施具備較高的重復(fù)性和精確性,能滿足標(biāo)準(zhǔn)要求[5]。

在牛奶中沙門氏菌含量的測定過程中,采用PCR模板制備技術(shù)開展靈敏度試驗(yàn),檢測樣本中沙門氏菌的敏感性情況。①合理選擇樣本,科學(xué)開展純菌培養(yǎng)操作,將牛奶食品樣本放入高壓蒸汽滅菌器內(nèi)經(jīng)過處理后,存儲在冰箱內(nèi)。②對所有試驗(yàn)菌株進(jìn)行接種處理,在液體內(nèi)接種,通過振蕩方式進(jìn)行液體內(nèi)菌種的培養(yǎng),培養(yǎng)溫度和振蕩速度控制在規(guī)定范圍內(nèi)。③采用乙醇沉淀技術(shù)進(jìn)行模板的制備,提取細(xì)菌培養(yǎng)液放置在離心機(jī)設(shè)備中離心處理,合理控制設(shè)備轉(zhuǎn)速,再使用滅菌蒸餾水進(jìn)行洗滌,通過懸浮液緩沖,在相應(yīng)的環(huán)境中離心處理,隔水煮沸后加入醋酸鈉物質(zhì),添加無水乙醇,離心處理后添加緩沖劑進(jìn)行復(fù)溶,通過乙醇洗滌,放置在冰箱內(nèi)冷卻,完成模板的制作。④將濃度適中的菌液接種在試驗(yàn)樣本內(nèi),提取基因組,擴(kuò)增后繪制擴(kuò)增數(shù)據(jù)值的表格和圖片,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線進(jìn)行樣本中的微生物檢測,明確大腸埃希菌、蠟樣芽孢桿菌、金黃色葡萄球菌等檢測下限是否符合規(guī)定標(biāo)準(zhǔn)要求,如果符合規(guī)定就代表食品中微生物含量合格,如果超出規(guī)定標(biāo)準(zhǔn)就代表食品中所含微生物超標(biāo),存在質(zhì)量安全問題。

4 結(jié)語

綜上所述,食品微生物檢測的過程中PCR技術(shù)具有一定應(yīng)用價值和應(yīng)用意義,能提升檢測工作效率。因此在實(shí)際檢測工作中需結(jié)合不同類型的PCR技術(shù)特點(diǎn)和情況,有針對性地進(jìn)行食品微生物的檢測檢驗(yàn),提升PCR技術(shù)的應(yīng)用效果,確保能精準(zhǔn)、全面、快速、及時檢測食品內(nèi)的微生物,為有效維護(hù)食品質(zhì)量安全提供幫助。

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