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福安地方茶樹種質(zhì)親緣關(guān)系與遺傳多樣性

2022-11-15 08:53陳林海鐘吉茂何燕燕傅雯霏溫鈴光
茶葉通訊 2022年2期
關(guān)鍵詞:福安親緣類群

陳林海,鐘吉茂,何燕燕,傅雯霏,楊 軍,溫鈴光

1.福安市茶葉質(zhì)量檢測中心/福建省茶產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系福安綜合試驗站,福建 福安 355000;2.福建省茗旗茶業(yè)有限公司,福建 福安 355000;3.福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院 茶葉研究所,福建 福州 350012;4.福安市茶產(chǎn)業(yè)發(fā)展中心,福建 福安 355000

福安大白茶原產(chǎn)于穆云鎮(zhèn)高嶺村,又名高嶺大白茶,1985年經(jīng)全國農(nóng)作物品種審定委員會認定為國家白茶茶樹良種,編號GS 13003—1985,具有芽期早、產(chǎn)量高、抗逆性強等優(yōu)點[1],在近年茶業(yè)發(fā)展中因品種性狀優(yōu)異得到較好的種植和推廣,是福安白茶、綠茶的重要原料之一。目前在高嶺村及福安白云山脈周邊地區(qū)還有野生茶樹品種植株,其中可能有優(yōu)異的種質(zhì)資源待選育。隨著市場需求升級,福安白茶等茶類消費增加,如何挖掘和開發(fā)更多的傳統(tǒng)種質(zhì)資源成為一個新的工作任務(wù)。

分子標記技術(shù)是種質(zhì)資源鑒定的重要手段,其中微衛(wèi)星標記具有在基因組中廣泛分布、共顯性、多態(tài)性高、重復(fù)性好等特點[2-6],被應(yīng)用于對茶樹地方種質(zhì)資源的品種鑒定、遺傳多樣性、親緣關(guān)系、物種進化、等位基因發(fā)掘、群體結(jié)構(gòu)分析等。黃丹娟等[7]對湖北省13個優(yōu)良茶樹品種進行鑒定,表明基于SSR熒光標記的茶樹品種MCID鑒定方法具有快速、準確、高效的特點,可用于茶樹良種知識產(chǎn)權(quán)保護、苗期鑒定及品種區(qū)分;彭靖茹[8]對24份廣西德??h和隆林縣的野生古茶樹與栽培種茶樹種質(zhì)進行聚類分析,表明廣西德??h和隆林縣的野生古茶樹種質(zhì)起源相近。姜曉輝等[9]研究結(jié)果表明,云南白鶯山茶樹種質(zhì)資源各亞群間存在著基因交流,且分為5個亞群;劉冠群等[10]研究認為四川移栽野生大茶樹具有豐富的遺傳多樣性,建議篩選具有當?shù)靥厣牟糠忠吧蟛铇溥M行馴化栽培,并對其進行合理科學(xué)利用與保護。郭燕等[11]研究表明,遺傳因素和地理位置不同引起貴州古茶樹資源有較高的遺傳多樣性。本試驗對來自于福安市穆云鄉(xiāng)高嶺村地方茶樹種質(zhì)資源進行親緣關(guān)系與遺傳多樣性研究,旨在為今后福安茶樹育種、雜交親本選配等提供初步依據(jù),為福安茶產(chǎn)品開發(fā)提供參考。

1 材料與方法

1.1 試驗材料

參試材料采樣于福建省福安市穆云鄉(xiāng)高嶺村與福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所,共73個茶樹種質(zhì)資源(表1),采集各資源一芽二葉鮮葉后用液氮迅速冷凍處理,保存在-70℃冰箱中備用。

表1 73份供試材料與來源Table 1 Name and origin of 73 plant materials used in this study

1.2 試驗方法

1.2.1 基因組DNA的提取

采用改進的CTAB法[12]提取茶樹基因組DNA。采用1.0%的瓊脂糖凝膠電泳進行基因組分子量大小檢測,采用NanoDrop 2000型紫外分光光度計測定茶樹基因組DNA的純度與濃度。

1.2.2 引物合成

參照文獻[13]引物序列,序列由上海Sangon公司合成,引物信息見表2。

表2 20對SSR引物及其序列Table 2 Nucleotide sequences of the 20 primer pairs

1.2.3 PCR擴增和產(chǎn)物鑒定

PCR反應(yīng)體系為:ddH2O 18.8 μL,10×Buffer 2.5 μL(Mg2+),dNTP(10 mmol·L-1)0.5 μL, 上、 下 游 primer(10 μmol·L-1) 各0.5 μL,Taq polymerase 0.2 μL(0.5 U),模板DNA1 μL。PCR反應(yīng)于美國ABI-9600型擴增儀上進行,熱循環(huán)程序為:94℃預(yù)變性4 min,使模板DNA充分變性,然后進入下列溫度循環(huán):94℃變性 45 s,不同溫度條件退火 60 s,72℃延伸 75 s,重復(fù) 35 個熱循環(huán);72℃延伸 10 min,最后4℃保存。

1.2.4 數(shù)據(jù)處理

采用ABI公司的GeneMapper 4.0軟件,選擇GeneScan? 500 ROX?作為分子量標準,對每一個擴增出的條帶記錄大小。使用Cervus 3.0軟件計算多態(tài)信息含量(PIC)、等位基因頻率、期望雜合度、觀測雜合度等。運用NTSYSpc 2.1中的Tree plot程序進行聚類分析。運用PopGen 3.1軟件計算Shannon信息指數(shù)(I)和Nei's基因多樣性指數(shù)(H)等參數(shù)。

2 結(jié)果與分析

2.1 遺傳多樣性

共擴增出162條多態(tài)性條帶,每個位點4 ~18個,其中TM345標記到18個等位基因,等位基因數(shù)最少的是TM442、TM499、TM502與TM581,僅檢測到4個,平均等位基因數(shù)為8.1。多態(tài)性信息量(PIC)變化為 0.284 ~ 0.867,平均值為0.608,20對SSR引物具有較高的多態(tài)信息(PIC > 0.5)。觀測雜合度(Ho)和期望雜合度(He)的數(shù)值范圍分別為0.2329(M447)~ 0.8082 (TM345)和 0.3105(TM514)~ 0.8856(TM262),均值分別為0.5656和0.6520。多樣性指數(shù)的數(shù)值范圍為0.6508(TM514)~ 2.3402(TM262),平均值1.4027(表3)。

表3 20對引物對73份材料DNA的擴增結(jié)果Table 3 Amplification results of the 73 DNA samples with 20 pairs of primers

2.2 親緣關(guān)系

利用20對SSR標記計算參試材料的相似系數(shù),并根據(jù)遺傳相似系數(shù)進行UPGMA聚類分析,繪制聚類樹狀圖(圖1)。根據(jù)聚類圖,參試材料分為6個類群。A類群為福安地方茶樹種質(zhì)資源與福安大白茶,B類群內(nèi)主要為福安地方茶樹種質(zhì)資源與福建省綠茶、烏龍茶種質(zhì)資源,C類群主要為福建烏龍茶品種,D類群主要為福建綠茶品種,E類群也主要為福建省品種,F(xiàn)類群為福安地方茶樹種質(zhì)資源。福安地方茶樹種質(zhì)資源主要分為3個類型,第一個類型主要在A類群內(nèi),主要與福安大白茶母樹親緣關(guān)系較近,且分為4個亞群;第二個類型主要在B類群內(nèi),主要與霞浦春波綠親緣關(guān)系比較近;第三個類型主要在E類群,且與福建省主要茶樹品種資源都沒有聚類在一起,遺傳信息具有一定的獨特性。

圖1 遺傳相似系數(shù)聚類圖Figure 1 the dendrogram of genetic similarity

2.3 群體間遺傳多樣性

從表4看出,參試材料的Shannon信息指數(shù)變化范圍為 0.7481 ~ 1.4027。Shannon 信息指數(shù)反映的不同類群遺傳多樣性的順序為:類群A > 類群 B > 類群 E > 類群 C > 類群 D > 類群F;觀察雜合度和期望雜合度的變化范圍分別為0.4333 ~ 0.6583 和 0.5633 ~ 0.7090。其中,類群A的Ho(觀測雜合度)與He(期望雜合度)相當,屬于基因型的分布就越接近于平衡狀態(tài);類群D的Ho大于He,說明存在雜合子過剩;其它類群類群D的Ho小于He,說明存在雜合子缺失現(xiàn)象。福安地方種質(zhì)資源(類群A)屬于平衡,說明正常;類群D的雜合子過剩,可能是由于類群D中的試驗材料主要為來自于福云系列茶樹品種。福安地方茶樹種質(zhì)資源Shannon信息指數(shù)與福建參照品種相當,說明福安地方茶樹種質(zhì)資源遺傳多樣性高。

表4 對比6個群體遺傳多樣性Table 4 Contrasting the genetic diversity of 6 groups

2.4 群體間基因流與親緣關(guān)系

Fst常用來表示群體之間的分化程度,可以用來推斷群體結(jié)構(gòu)、遷移及擴張等[14-15]。6 個茶樹群體兩兩之間的Fst值見表5。Wright建議,實際研究中,F(xiàn)ST為0 ~ 0.05;群體間遺傳分化很小,可以不考慮;FST為0.05 ~ 0.15,群體間存在中等程度的遺傳分化;FST為0.15 ~ 0.25,群體間遺傳分化較大;FST為0.25以上,群體間有很大的遺傳分化。本試驗中FST值為3個類型。第一個類型為FST小于0.5,類群A與類群B間的群體間遺傳分化很小,群體A與群體B中主要為福安地方茶樹種質(zhì)資源;第二個類型為FST值在0.05 ~ 0.15,群體間存在中等程度的遺傳分化;第三個類型為FST小于0.5,類群F與其它群體間FST值都在0.15 ~ 0.25,群體間遺傳分化較大,說明類群F中的福安地方茶樹種質(zhì)資源與其它群體資源遺傳差異較大(表5)?;蛄鳎∟m)的變動范圍為1.0673~ 5.0255,群體間基因流最大的是群體A與群體B,說明群體A與群體B基因流動程度相對較高;其次群體B與群體C間基因流較高為4.2398,且群體C內(nèi)主要為福建烏龍茶品種,推測群體B的資源材料帶有烏龍茶屬性(表5)。

表5 不同茶樹群體間的FST值與基因流值Table 5 Fst statistics and gene flow among tea populations

使用軟件POPGEN按照Nei(1978)計算群體間Nei遺傳相似度和遺傳距離分析,結(jié)果表明(表6),6個群體中主要來自福安地方茶樹種質(zhì)資源的類群A與類群B間遺傳相似度最大(0.8832), 遺傳距離最?。?.1242),說明這2個群體間親緣關(guān)系最近;類群C與類群F間遺傳相似度最?。?.5017), 遺傳距離最大(0.6898),說明這2個群體間親緣關(guān)系最遠。根據(jù)Nei遺傳距離,采用UPGMA方法構(gòu)建聚類圖(圖2),類群A與類群B聚類在一起,然后與類群C、類群D、類群E形成一個大分支,類群F則獨立被聚成一支。

表6 群體間 Nei 遺傳相似度(對角線以上)和遺傳距離( 對角線以下)Table 6 Nei’s genetic identity (above diagonal) and genetic distance (below diagonal) of nine populations

圖2 群體遺傳相似系數(shù)聚類圖Figure 2 the dendrogram of population genetic similarity

3 討論

3.1 高嶺村地方茶樹種質(zhì)的遺傳多樣性

Nei’s基因多樣性指數(shù)與Shannon信息指數(shù)是衡量茶樹種質(zhì)資源遺傳多樣性的重要指標。本試驗選擇的參照品種為36個福建省主要栽培品種,來自福建省不同地區(qū),具有一定代表性,遺傳多樣性較高。37個福安地方茶樹種質(zhì)資源的Nei’s基因多樣性指數(shù)(0.6174)、Shannon信息指數(shù)(1.2890)與參照福建茶樹品種相當。同時,與其它地區(qū)種質(zhì)資源研究相比,福安37個地方茶樹種質(zhì)資源的Shannon 信息指數(shù)高于廣西部分地區(qū)野生茶樹種質(zhì)資源的Shannon 信息指數(shù)(0.97)[16]、四川茶樹種質(zhì)資源的Shannon信息指數(shù)(0.98)[17]、廣東歷史名茶群體種曲江羅坑茶Shannon多樣性指數(shù)(1.217)[18],與云南千家寨不同海拔野生茶樹種質(zhì)資源的Shannon信息指數(shù)(1.33)[19]、云南西雙版納苦茶資源的Shannon信息指數(shù)(1.30)[20]相當,略低于黔南60份野生茶樹種質(zhì)資源平均 Shannon信息指數(shù)1.464[21]、安徽省太平猴魁茶產(chǎn)區(qū)柿大茶群體種平均Shannon信息指數(shù)1.414[22]??梢姡驹囼灣醪借b定結(jié)果說明福安市穆云鄉(xiāng)高嶺村地方茶樹種質(zhì)資源群體遺傳多態(tài)性高,資源多樣性相對豐富,挖掘和開發(fā)野生茶樹品種種質(zhì)資源的前景較好。

3.2 高嶺村地方茶樹種質(zhì)資源的親緣關(guān)系

福安穆云鄉(xiāng)高嶺村37個地方茶樹種質(zhì)資源主要分為3個類型,類型1和類型2與參試對照福建審(鑒)定茶樹品種與地方品種均聚類在一起,類型1中的福安穆云鄉(xiāng)高嶺村地方茶樹種質(zhì)資源與福安大白茶親緣關(guān)系較近,為福安大白茶有性群體種,再次證明福安大白茶發(fā)源于福安穆云鄉(xiāng)高嶺村;類型2為福安穆云鄉(xiāng)高嶺村地方茶樹種質(zhì)資源與霞浦春波綠(綠茶品種)、梅占(烏龍茶品種)、福建水仙(烏龍茶品種)等福建省茶樹品種親緣關(guān)系較近,初步說明福安穆云鄉(xiāng)高嶺村地方茶樹種質(zhì)資源同時可以用來加工制作烏龍茶與綠茶,需要進一步鑒定;類型3(GL35、GL36、GL37)未與參試對照福建審(鑒)定茶樹品種與地方品種聚類在一起,初步說明類型3中資源為福安地方原產(chǎn)地資源,需要進一步考察、鑒定與開發(fā)利用,在今后的試驗中可以作為一個重點研究方向。

3.3 今后鑒定與研究方向

福安大白茶原產(chǎn)地高嶺村及周邊地區(qū)如白云山脈等地的野生茶樹種質(zhì)資源豐富,在近幾年收集和鑒定工作中可能還未全覆蓋,需進一步挖掘本地歷史上原有的知名茶樹品種,如原產(chǎn)于福安市曉洋鎮(zhèn)嶺路村的嶺路大白茶,該茶栽培歷史悠久,20世紀六十年代后開始試種,至80年代還有推廣,因為產(chǎn)量較低等原因栽培面積較小,但該茶類發(fā)芽期早、芽梢壯、茸毛多、適應(yīng)性尚強、品質(zhì)尚佳等優(yōu)點,適制紅、綠、白茶,可從茶類品質(zhì)特異性方面加強開發(fā)。此外,坦洋菜茶、孟洋菜茶、林家早茶[1]等茶種質(zhì)資源的收集和鑒定研究工作還將進一步開展。

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