許俊杰,董 悅
(臨沂大學(xué)醫(yī)學(xué)院,山東臨沂 276000)
淡色絲孢菌隸屬于真菌界淡色絲孢菌科,是世界性廣泛分布種。在已知的全部絲孢真菌屬種中,淡色絲孢菌占40%~45%[1],其中很多屬種都是重要的植物病原菌,可以危害多種經(jīng)濟(jì)作物;除危害植物外還可以用于生物防治,也可以產(chǎn)生抗菌、抗腫瘤等次生代謝物。昆明西山風(fēng)景區(qū)位于有“高原明珠”之稱的滇池湖畔,地勢(shì)北低南高,最高峰海拔2 507.5 m。西山森林公園具有豐富的植物多樣性,是滇中地區(qū)頗具典型性的山地環(huán)境,植物多且集中,分布有167科、59屬、1 086種灌喬木和其他植物。此外,此地還生長(zhǎng)了一些珍稀樹種,如臺(tái)檜、鵝耳櫪、化香樹、八角楓、滇紫荊等四季常青的樹木。四季如春的氣候、豐富的植物資源、典型的地理環(huán)境決定了昆明西山風(fēng)景區(qū)土壤中具有豐富的真菌資源,因此,開展土壤淡色絲孢菌的研究具有重要的意義。通過昆明市西山風(fēng)景區(qū)土壤淡色絲孢菌多樣性的研究,旨在為挖掘淡色絲孢菌資源提供理論指導(dǎo)和資源支持。
1.1 樣品采集土壤、植物殘?bào)w樣品采集自云南昆明西山風(fēng)景區(qū)竹林、防護(hù)林、草坪、山坡林、菜田、農(nóng)田。按蛇形采樣法,每個(gè)樣地于0~30 cm處進(jìn)行土壤采集,各采樣點(diǎn)鏟取土樣15份,裝于密封袋中,編號(hào),同時(shí)記錄采樣時(shí)間、地點(diǎn)、生境及經(jīng)緯度。土樣帶回后置于陰涼處風(fēng)干,將編號(hào)相同的土樣混合為1份,每個(gè)采樣點(diǎn)混合好取3份土樣作為平行試驗(yàn)組,共18份土壤樣品。置于冰盒中保存24 h內(nèi)送往實(shí)驗(yàn)室,于4 ℃保存。
1.2 培養(yǎng)基分離培養(yǎng)基為水瓊脂+秸稈培養(yǎng)基;純化培養(yǎng)基為PDA培養(yǎng)基。發(fā)酵培養(yǎng)基為PDB液體培養(yǎng)基(葡萄糖20 g、馬鈴薯200 g、瓊脂15 g、水1 000 mL)[2]。
1.3 土壤真菌的分離、純化利用稀釋涂布平板法[3]進(jìn)行土壤真菌的分離,每個(gè)處理設(shè)3個(gè)重復(fù),涂布后置于25 ℃溫箱內(nèi)培養(yǎng)4~7 d后,對(duì)長(zhǎng)出的菌落進(jìn)行統(tǒng)計(jì)、編號(hào)、分離、純化、保存。將純化菌株接種PDA培養(yǎng)基平板上,每隔24 h觀察菌落形態(tài)、顏色、培養(yǎng)基顏色,用載玻片培養(yǎng)法[4]觀察其形態(tài)學(xué)特征。
1.4 土壤真菌群落數(shù)據(jù)分析方法
1.4.1物種豐富度。即群落中的物種數(shù),在此指各生境采集的土壤樣品中分離得到的淡色絲孢菌的屬級(jí)物種數(shù),以S表示。
1.4.2種群優(yōu)勢(shì)度。以Berger-Parker優(yōu)勢(shì)度指數(shù)(di)進(jìn)行計(jì)算,其公式如下:
di=Ni/N
(1)
式中,N為物種總數(shù),Ni為第i物種個(gè)體總數(shù)(該研究中以屬為單位統(tǒng)計(jì)菌落數(shù))。
1.4.3物種多樣性。以Shannon-Wiener多樣性指數(shù)公式進(jìn)行計(jì)算,其公式如下:
(2)
式中,H′為物種的多樣指數(shù),n為物種(該研究中為屬級(jí)分類單位)總數(shù),pi為第i種物種個(gè)體數(shù)占群落總個(gè)體數(shù)的比例[5]。
1.4.4物種均勻度。采用 Pielou 指數(shù)測(cè)定公式[5]計(jì)算物種均勻度,其公式如下:
J=H′/lnS
(3)
式中,J為均勻度,H′為Shannon-Wiener多樣性指數(shù),S為物種總數(shù)。
1.4.5相似性分析。采用 Jaccard系數(shù)公式[5]進(jìn)行相似性分析,其公式如下:
Cj=J/(a+b-J)
(4)
式中,J為群落A與群落B共有的物種數(shù),a為群落A含有的全部物種數(shù),b為群落B含有的全部物種數(shù)。
1.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)用Excel 2003和DPS 7.5統(tǒng)計(jì)分析軟件對(duì)試驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。
2.1 土壤真菌在不同生態(tài)環(huán)境中的分布情況從表1可以看出,6種不同類型的生態(tài)環(huán)境土壤中,真菌的物種組成與分布存在明顯差異。防護(hù)林土壤中真菌屬種總數(shù)最大,為300株,淡色絲孢菌173株。其中,木霉屬真菌67株,鐮刀菌屬46株,青霉屬28株,支頂孢屬32株;草坪中真菌共有194株,淡色絲孢菌149株,其中木霉屬78株,鐮刀菌屬32株,青霉屬26株,支頂孢屬13株。山坡林土壤中真菌共有176株,淡色絲孢菌115株,其中木霉屬42株,鐮刀菌屬41株,青霉屬24株,支頂孢屬8株。竹林土壤中真菌共有170株,淡色絲孢菌85株,其中木霉屬30株,鐮刀菌屬30株,青霉屬16株,支頂孢屬9株;菜田土壤中真菌共有103株,淡色絲孢菌73株,其中木霉屬17株,鐮刀菌屬29株,青霉屬19株,支頂孢屬8株;農(nóng)田土壤中真菌共有179株,淡色絲孢菌131株,其中木霉屬79株,鐮刀菌屬23株,青霉屬27株,支頂孢屬2株。其他種類的真菌在6種生境中分布各有不同,除節(jié)菱孢屬和鏈格孢屬數(shù)量較多外,其他分布較少。淡色絲孢菌共726株,為土壤真菌菌落中的優(yōu)勢(shì)種群。
表1 不同生態(tài)環(huán)境中土壤的淡色絲孢真菌及其他物種組成和分布
2.2 昆明西山風(fēng)景區(qū)土壤淡色絲孢菌屬的組成及優(yōu)勢(shì)度從采集的18份土壤樣品中分離獲得土壤真菌18屬1 122株,其中淡色絲孢菌726株(表1)。18個(gè)屬分別為青霉屬Penicillium、鐮刀菌屬Fusarium、盾殼霉屬Trichothecium、木霉屬Trichoderma、脈孢菌屬Neurospora、節(jié)菱孢屬Arthrinium、帚霉屬Scopulariopsis、鏈格孢屬Alternaria、彎孢屬Curvularia、聚單端孢屬Trichothecium、酵母屬Pichia、支頂孢屬Acremonium、葡孢霉屬Botryosphaeria、盤多毛孢屬Neopestalotiopsis、毛色二孢屬Lasiodiplodia、黑孢霉屬Nigrospora、殼囊孢屬Cytospora、未知菌屬。其中,青霉屬、鐮刀菌屬、木霉屬和支頂孢屬為淡色絲孢菌。
參考昆蟲物種優(yōu)勢(shì)度(di)的劃分標(biāo)準(zhǔn),di>0.10為優(yōu)勢(shì)屬,0.01 表2 不同生境中土壤淡色絲孢菌及其他物種的優(yōu)勢(shì)度 2.3 昆明西山風(fēng)景區(qū)生境中土壤淡色絲孢菌群落多樣性從表3可以看出,土壤淡色絲孢菌在昆明西山風(fēng)景區(qū)6種不同生境中的物種豐富度存在較明顯差異,防護(hù)林生境中物種豐富度最高(18),它包含了18屬,其次為山坡林豐富度(16),菜田生境中物種豐富度最低(10),而農(nóng)田、菜田、草坪和竹林生境的物種豐富度較接近。山坡林和防護(hù)林生境中土壤淡色絲孢菌的H′指數(shù)均大于2,而其他4個(gè)生境中的多樣性指數(shù)略低,但是均大于1.78。菜田的均勻度最大(0.864 5),農(nóng)田的均勻度最小(0.694 9),其他生境的均勻度非常接近。防護(hù)林土壤中多樣性指數(shù)、物種豐富度和物種數(shù)均最大,說明防護(hù)林人為干擾活動(dòng)少、土壤物種穩(wěn)定;菜田土中物種豐富度和物種數(shù)均最小,說明人為活動(dòng)和耕作方式等影響真菌的數(shù)量和種類。防護(hù)林、山坡林的H′指數(shù)均較大,說明這種生境的土壤中有機(jī)質(zhì)和腐殖質(zhì)等營(yíng)養(yǎng)較為豐富,較適合真菌的生長(zhǎng)與繁殖。草坪、竹林、農(nóng)田和菜田土真菌H′指數(shù)相對(duì)較低,說明其生境植被種類單一,可能會(huì)導(dǎo)致真菌數(shù)量和種類減少。從均勻度看出,菜田土真菌均勻度最大(0.864 5),農(nóng)田土真菌均勻度最小(0.694 9),其他類型的生境中真菌均勻度介于菜田土和農(nóng)田土之間,也較為相近。由表3可知,不同生境中淡色絲孢菌數(shù)量和物種數(shù)各不相同,說明淡色絲孢菌的數(shù)量與土壤結(jié)構(gòu)、營(yíng)養(yǎng)成分等因素密切相關(guān)。 表3 不同生態(tài)類型土壤中淡色絲孢菌及其他物種的群落特征 2.4 昆明西山風(fēng)景區(qū)土壤淡色絲孢菌不同生境類型的群落相似性根據(jù)Jaccard相似性系數(shù)原理,當(dāng)相似性系數(shù)(Cj)為0~0.25時(shí),為極不相似;當(dāng)0.25 表4 土壤淡色絲孢菌在不同生境類型的群落相似性 陸地真菌資源豐富,截至2000年,陸地真菌總數(shù)約5萬(wàn)種[7-9]。該研究首次對(duì)昆明西山風(fēng)景區(qū)土壤淡色孢菌資源及其群落結(jié)構(gòu)進(jìn)行了研究,共分離得到1 122株真菌,其中淡色絲孢菌726株,主要包含于鐮刀菌、支頂孢、青霉和木霉4個(gè)屬之中。這雖然初步揭示了該地區(qū)真菌種群的分布特征,但從數(shù)量和種類上講挖掘的遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠。目前各個(gè)領(lǐng)域針對(duì)微生物菌群多樣性的分析方法主要分為培養(yǎng)法和非培養(yǎng)法2種,其中培養(yǎng)法由于條件限制只能分離鑒定出少數(shù)微生物。自然界中只有0.1%~1.0%的微生物通過常規(guī)方法能被培養(yǎng),說明應(yīng)用傳統(tǒng)分離培養(yǎng)方法導(dǎo)致了微生物多樣性的嚴(yán)重丟失。因此,非常有必要應(yīng)用非培養(yǎng)[10-12]的分子生物學(xué)方法來研究土壤中的真菌菌落組成,以此達(dá)到較為完整地獲取土壤中真菌多樣性信息的目的,同時(shí)也期望將來能找到一套更為科學(xué)的分離培養(yǎng)方法,從土壤中挖掘出更多的淡色絲孢菌。 生態(tài)學(xué)多樣性測(cè)定的局限性在于取樣地點(diǎn)和取樣本數(shù)量的局限性,在一個(gè)生態(tài)區(qū)域取樣時(shí),只能按照統(tǒng)計(jì)學(xué)取樣要求進(jìn)行定點(diǎn)取樣,樣本數(shù)量雖然能夠反映出土壤中微生物的大部分信息,但是卻包含不了其中所有的種類。綜上所述,要想準(zhǔn)確分析土壤中淡色絲孢菌的多樣性,必須改進(jìn)真菌分離方法,采用多種手段相結(jié)合的方式對(duì)微生物多樣性進(jìn)行合理分析。3 結(jié)論與討論