張環(huán)宇 ,王文秀 ,高晗 ,譚偉 ,余小磊 ,李振國 ,田曉軒
(1.天津中醫(yī)藥大學,天津 301617;2.天津中醫(yī)藥大學中醫(yī)藥研究院,天津 301617;3.牡丹江友搏藥業(yè)有限責任公司,牡丹江 157000)
水蛭為螞蟥(Whitmania Pigra Whitman)、水蛭(Hirudo nipponica Whitman)或柳葉螞蟥(Whitmania acranutata Whitman)的干燥全體[1]。目前中藥材市場中主要流通品種為螞蝗,又名寬體金線蛭,為藥用優(yōu)良品種[2-3]。近年來,水蛭作為原料藥被大量用于中藥制劑的開發(fā),導致水蛭中藥材價格上漲,常有不法藥材銷售商對水蛭中藥材摻假出售[3]。因此,對水蛭的質(zhì)量鑒別尤為重要。
傳統(tǒng)水蛭鑒定方法主要包括性狀鑒別及理化鑒別[4-5],這些技術在水蛭鑒定和質(zhì)量控制中發(fā)揮了關鍵作用。隨著分子生物學的發(fā)展,分子鑒別技術在中藥材鑒定中得到了廣泛的應用,與傳統(tǒng)的形態(tài)和化學檢測方法相比,分子技術具有更高的準確度。環(huán)介導等溫擴增技術(LAMP)是一種新型的等溫核酸擴增技術,因其操作簡便、儀器費用低廉、結果分析簡單、快速等優(yōu)點成為目前常用的核酸檢測技術之一[6-7]。因此,本研究針對水蛭線粒體細胞色素氧化酶I(COI)基因序列設計LAMP引物,結合熒光染料法對寬體金線蛭及其常見混偽品進行快速鑒別。
1.1 藥品 取采自中藥材市場的4份水蛭樣品進行特異性實驗,見表1。實際樣品檢測材料共9份水蛭樣品,見表2。樣品經(jīng)牡丹江友搏藥業(yè)有限責任公司張孝晨根據(jù)樣品形態(tài)等特征進行性狀鑒定。
表1 實驗材料
表2 實際樣品檢測材料
1.2 儀器 凝膠成像分析儀(Cuene Genins);DYY-8C型核酸電泳儀(北京六一生物科技有限公司);ZHJH-C1112B型超凈工作臺(上海智城分析儀器制造有限公司);聚合酶鏈式反應(PCR)儀(Eppendorf);ZF-6型紫外分析儀(上海嘉鵬科技有限公司);JA3003型電子精密天平(天津天馬衡基儀器有限公司)。
1.3 試劑 Bst 2.0 WarmStart DNA聚合酶(紐英倫生物技術有限公司);Tks Gflex DNA聚合酶(寶日醫(yī)生物技術有限公司);瓊脂糖(Lonza);無水乙醇(天津市大茂化學試劑廠);6×上樣緩沖液(Loading buffer,寶日醫(yī)生物技術有限公司);10 000×SYBR Green I核酸染料(北京索萊寶科技有限公司);DuRed核酸染料(北京泛博生物化學有限公司);D2000 DNA Marker(北京天根生化科技有限公司);50×TAE(合肥志宏生物技術有限公司);無酶水(Biosharp);DNA提取試劑盒(北京天根生化科技有限公司);Tks Gflex DNA聚合酶(寶日醫(yī)生物技術有限公司);等溫擴增反應緩沖液(紐英倫生物技術有限公司);MgSO4(100 mmol/L,紐英倫生物技術有限公司)。
2.1 引物特異性檢測實驗 剪取4份特異性實驗樣品(2條寬體金線蛭、1條光潤金線蛭、1條日本醫(yī)蛭)肌肉組織約30 mg,將其放入潔凈的1.5 mL離心管中,另取一離心管以無酶水代替DNA模板作為陰性對照。按照動物組織基因組DNA提取試劑盒說明書提取總DNA,取5 μL提取產(chǎn)物,加入1 μL的6×Loading buffer混勻后于DuRed染色的1%瓊脂糖凝膠電泳,觀察DNA提取質(zhì)量及長度。使用紫外分光光度計測量所提取的DNA濃度及A260/A280,儲存于-20°C。選擇通用引物COI(見表3)對提取的DNA 進行擴增,25 μL 反應體系包括 12.5 μL 2×反應緩沖液、0.5 μL 10 μmol/L LCO1490(10 μmol/L)、0.5 μL 10 μmol/L HCO2198(10 μmol/L)、0.5 μL DNA模板、1.25 U Tks Gflex DNA 聚合酶、10.5 μL 無酶水。引物序列見表3。PCR檢測在PCR儀上進行,擴增程序為:98℃預變性1 min,98℃變性10 s,52℃退火15 s,68℃延伸30 s,40個循環(huán),68℃再延伸5 min。擴增結束后取5 μL擴增產(chǎn)物,加入1 μL 6×Loading buffer混勻后于DuRed染色的1%瓊脂糖凝膠進行電泳,選擇陽性PCR產(chǎn)物樣品進行一代雙端測序。一代測序結果見表1。
2.2 LAMP引物設計與合成 將上述一代測序所得4條水蛭序列進行LAMP引物設計,使用Geneious 8.0.4去除引物區(qū),利用MAFFT v7.271進行對齊,篩選寬體金線蛭特有的變異位點,針對其變異位點在網(wǎng)站(http://primerexplorer.jp/lampv5e/index.html)設計LAMP引物組,挑選3組引物組于Oligo 7進行引物評價,篩選引物質(zhì)量最佳的1組引物作為本次實驗所用引物組。引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成,LAMP引物序列見表3。
表3 引物及反應條件
2.3 LAMP法檢測中藥材寬體金線蛭方法的建立 配置反應體系為25 μL,包括0.2 μmol/L sz-F3(10 μmol/L)、0.2 μmol/L sz-B3(10 μmol/L)、1.6 μmol/L sz-FIP(10 μmol/L)、1.6 μmol/L sz-BIP(10 μmol/L)、1×等溫擴增反應緩沖液、8 U Bst 2.0 WarmStart DNA聚合酶、6 mmol/L MgSO4(100 mmol/L)、1.4 mmol/L三磷酸脫氧核苷酸(dNTPs)(10 mmol/L)、1 μL DNA模板,加無酶水補充總體積至25 μL。將反應液于64℃恒溫反應60 min,80℃下孵育10 min結束反應。反應結束后取5 μL擴增產(chǎn)物于含DuRed核酸染料的1%瓊脂糖凝膠上進行電泳(觀察有無梯狀條帶及條帶的明亮程度),電壓110 V,電泳30 min。在余下20 μL擴增產(chǎn)物中加入0.2 μL 10 000×SYBR GreenⅠ核酸染料,在自然燈下及254 nm紫外光下觀察顏色變化。
2.4 LAMP特異性檢測結果 擴增產(chǎn)物于含DuRed核酸染料的1%瓊脂糖凝膠上電泳,結果見圖1A,寬體金線蛭呈梯狀條帶(陽性),對照組無條帶產(chǎn)生(陰性)。在余下20 μL擴增產(chǎn)物中加入0.2 μL 10 000×SYBR GreenⅠ核酸染料,于自然燈下觀察結果見圖1B,寬體金線蛭在自然光下變?yōu)榫G色(陽性),光潤金線蛭、日本醫(yī)蛭、陰性對照均呈橙黃色(陰性)。將加入了0.2 μL 10 000×SYBR GreenⅠ核酸染料的擴增產(chǎn)物置于254 nm紫外燈下觀察顏色變化,結果見圖1C,寬體金線蛭在254 nm紫外光下呈綠色熒光(陽性),對照組無熒光產(chǎn)生(陰性)。以上結果表明,所設計的LAMP引物能對寬體金線蛭進行特異性擴增。
圖1 LAMP反應特異性檢測結果
收集市售9份水蛭樣品,按照“2.1”項所述方法進行DNA提取、PCR擴增及一代測序,對所收集樣品進行分子鑒定,一代測序結果見表2。運用所設計的LAMP引物按上述步驟進行LAMP擴增,反應時間為60 min,對水蛭實際樣品進行檢測。檢測結果見圖2。擴增產(chǎn)物于含DuRed核酸染料的1%瓊脂糖凝膠上進行電泳,結果見圖2A,編號K1、K2、K3樣品均呈梯狀條帶(陽性),對照組無條帶產(chǎn)生(陰性)。在余下20 μL擴增產(chǎn)物中加入0.2 μL 10 000×SYBRGreenⅠ核酸染料,自然燈下觀察結果見圖2B,編號K1、K2、K3樣品在自然光下變?yōu)榫G色(陽性),對照組呈橙黃色(陰性)。將加入了0.2 μL 10 000×SYBR GreenⅠ核酸染料的擴增產(chǎn)物置于254 nm紫外燈下觀察,結果見圖2C,編號K1、K2、K3樣品在254 nm紫外光下呈綠色熒光(陽性),對照組無熒光產(chǎn)生(陰性)。3種檢測方式中的陽性結果樣品與表2中分子鑒定結果為寬體金線蛭的樣品一致。以上結果表明,本研究所建立的寬體金線蛭LAMP檢測技術可實現(xiàn)對市售寬體金線蛭及其常見混偽品的快速鑒別。
圖2 LAMP實際樣品檢測結果
準確檢測寬體金線蛭對水蛭的臨床用藥安全具有重要意義。目前水蛭的鑒別方法,如高效液相色譜法、高效毛細管電泳法等通常需要大型儀器設備,不利于寬體金線蛭的現(xiàn)場快速鑒別。因此,本研究通過設計4條LAMP特異性引物,利用具有鏈置換活性的Bst 2.0 WarmStart DNA聚合酶,在64°C恒溫下保溫60 min即可結束反應,無需熱循環(huán)儀。且本研究建立了3種LAMP檢測方法,分別為瓊脂糖凝膠電泳法及在自然光、254 nm紫外光下肉眼觀察核酸染料SYBR GreenⅠ的顏色變化,以對寬體金線蛭進行準確識別。該檢測體系的結果判定只需加入核酸染料,肉眼即可觀察到顏色變化,操作簡便。因此本研究提供了寬體金線蛭的基源快速鑒定方法,具有操作簡便、儀器費用低廉、特異性良好、檢測快速等優(yōu)點。
適宜的靶標序列是DNA分子鑒定準確性的基礎保障。研究表明,以COI為靶標序列可將正品水蛭與其他混偽品明顯區(qū)分[3]。因此,本研究基于線粒體COI基因序列建立了中藥材寬體金線蛭的LAMP檢測體系。本研究的結果表明,利用LAMP技術可成功將寬體金線蛭與光潤金線蛭、日本醫(yī)蛭、歐洲醫(yī)蛭及牛蛭屬物種區(qū)分開來,且特異性良好。